Changeset 2510b9b in sasview for src/sas/sascalc


Ignore:
Timestamp:
Feb 7, 2017 2:05:10 PM (7 years ago)
Author:
GitHub <noreply@…>
Branches:
master, ESS_GUI, ESS_GUI_Docs, ESS_GUI_batch_fitting, ESS_GUI_bumps_abstraction, ESS_GUI_iss1116, ESS_GUI_iss879, ESS_GUI_iss959, ESS_GUI_opencl, ESS_GUI_ordering, ESS_GUI_sync_sascalc, costrafo411, magnetic_scatt, release-4.1.1, release-4.1.2, release-4.2.2, ticket-1009, ticket-1094-headless, ticket-1242-2d-resolution, ticket-1243, ticket-1249, ticket885, unittest-saveload
Children:
a99a4045, 1a8e13f0, b61bd57, 03137f1, 18da4a8, 1e13b53
Parents:
2ab9c432 (diff), bcabf4e (diff)
Note: this is a merge changeset, the changes displayed below correspond to the merge itself.
Use the (diff) links above to see all the changes relative to each parent.
git-author:
Paul Kienzle <pkienzle@…> (02/07/17 14:05:10)
git-committer:
GitHub <noreply@…> (02/07/17 14:05:10)
Message:

Merge pull request #30 from SasView?/ticket-827

Fixes #795, #819, #827, #847

Location:
src/sas/sascalc
Files:
4 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed
  • src/sas/sascalc/dataloader/readers/cansas_reader.py

    r0639476 rbcabf4e  
    2020import inspect 
    2121# For saving individual sections of data 
    22 from sas.sascalc.dataloader.data_info import Data1D, DataInfo, plottable_1D 
    23 from sas.sascalc.dataloader.data_info import Collimation, TransmissionSpectrum, Detector, Process, Aperture 
    24 from sas.sascalc.dataloader.data_info import combine_data_info_with_plottable as combine_data 
     22from sas.sascalc.dataloader.data_info import Data1D, Data2D, DataInfo, \ 
     23    plottable_1D, plottable_2D 
     24from sas.sascalc.dataloader.data_info import Collimation, TransmissionSpectrum, \ 
     25    Detector, Process, Aperture 
     26from sas.sascalc.dataloader.data_info import \ 
     27    combine_data_info_with_plottable as combine_data 
    2528import sas.sascalc.dataloader.readers.xml_reader as xml_reader 
    2629from sas.sascalc.dataloader.readers.xml_reader import XMLreader 
     
    5659        The CanSAS reader requires PyXML 0.8.4 or later. 
    5760    """ 
    58     ## CanSAS version - defaults to version 1.0 
     61    # CanSAS version - defaults to version 1.0 
    5962    cansas_version = "1.0" 
    6063    base_ns = "{cansas1d/1.0}" 
     
    6366    invalid = True 
    6467    frm = "" 
    65     ## Log messages and errors 
     68    # Log messages and errors 
    6669    logging = None 
    6770    errors = set() 
    68     ## Namespace hierarchy for current xml_file object 
     71    # Namespace hierarchy for current xml_file object 
    6972    names = None 
    7073    ns_list = None 
    71     ## Temporary storage location for loading multiple data sets in a single file 
     74    # Temporary storage location for loading multiple data sets in a single file 
    7275    current_datainfo = None 
    7376    current_dataset = None 
    7477    current_data1d = None 
    7578    data = None 
    76     ## List of data1D objects to be sent back to SasView 
     79    # List of data1D objects to be sent back to SasView 
    7780    output = None 
    78     ## Wildcards 
     81    # Wildcards 
    7982    type = ["XML files (*.xml)|*.xml", "SasView Save Files (*.svs)|*.svs"] 
    80     ## List of allowed extensions 
     83    # List of allowed extensions 
    8184    ext = ['.xml', '.XML', '.svs', '.SVS'] 
    82     ## Flag to bypass extension check 
     85    # Flag to bypass extension check 
    8386    allow_all = True 
    8487 
     
    220223                self.parent_class = tagname_original 
    221224                if tagname == 'SASdata': 
    222                     self._initialize_new_data_set() 
    223                 ## Recursion step to access data within the group 
     225                    self._initialize_new_data_set(node) 
     226                    if isinstance(self.current_dataset, plottable_2D): 
     227                        x_bins = attr.get("x_bins", "") 
     228                        y_bins = attr.get("y_bins", "") 
     229                        if x_bins is not "" and y_bins is not "": 
     230                            self.current_dataset.shape = (x_bins, y_bins) 
     231                        else: 
     232                            self.current_dataset.shape = () 
     233                # Recursion step to access data within the group 
    224234                self._parse_entry(node, True) 
    225235                if tagname == "SASsample": 
     
    234244                self.add_intermediate() 
    235245            else: 
    236                 data_point, unit = self._get_node_value(node, tagname) 
    237  
    238                 ## If this is a dataset, store the data appropriately 
     246                if isinstance(self.current_dataset, plottable_2D): 
     247                    data_point = node.text 
     248                    unit = attr.get('unit', '') 
     249                else: 
     250                    data_point, unit = self._get_node_value(node, tagname) 
     251 
     252                # If this is a dataset, store the data appropriately 
    239253                if tagname == 'Run': 
    240254                    self.current_datainfo.run_name[data_point] = name 
     
    245259                    self.current_datainfo.notes.append(data_point) 
    246260 
    247                 ## I and Q Data 
    248                 elif tagname == 'I': 
     261                # I and Q - 1D data 
     262                elif tagname == 'I' and isinstance(self.current_dataset, plottable_1D): 
    249263                    self.current_dataset.yaxis("Intensity", unit) 
    250264                    self.current_dataset.y = np.append(self.current_dataset.y, data_point) 
    251                 elif tagname == 'Idev': 
     265                elif tagname == 'Idev' and isinstance(self.current_dataset, plottable_1D): 
    252266                    self.current_dataset.dy = np.append(self.current_dataset.dy, data_point) 
    253267                elif tagname == 'Q': 
     
    265279                    pass 
    266280 
    267                 ## Sample Information 
     281                # I and Qx, Qy - 2D data 
     282                elif tagname == 'I' and isinstance(self.current_dataset, plottable_2D): 
     283                    self.current_dataset.yaxis("Intensity", unit) 
     284                    self.current_dataset.data = np.fromstring(data_point, dtype=float, sep=",") 
     285                elif tagname == 'Idev' and isinstance(self.current_dataset, plottable_2D): 
     286                    self.current_dataset.err_data = np.fromstring(data_point, dtype=float, sep=",") 
     287                elif tagname == 'Qx': 
     288                    self.current_dataset.xaxis("Qx", unit) 
     289                    self.current_dataset.qx_data = np.fromstring(data_point, dtype=float, sep=",") 
     290                elif tagname == 'Qy': 
     291                    self.current_dataset.yaxis("Qy", unit) 
     292                    self.current_dataset.qy_data = np.fromstring(data_point, dtype=float, sep=",") 
     293                elif tagname == 'Qxdev': 
     294                    self.current_dataset.xaxis("Qxdev", unit) 
     295                    self.current_dataset.dqx_data = np.fromstring(data_point, dtype=float, sep=",") 
     296                elif tagname == 'Qydev': 
     297                    self.current_dataset.yaxis("Qydev", unit) 
     298                    self.current_dataset.dqy_data = np.fromstring(data_point, dtype=float, sep=",") 
     299                elif tagname == 'Mask': 
     300                    inter = [item == "1" for item in data_point.split(",")] 
     301                    self.current_dataset.mask = np.asarray(inter, dtype=bool) 
     302 
     303                # Sample Information 
    268304                elif tagname == 'ID' and self.parent_class == 'SASsample': 
    269305                    self.current_datainfo.sample.ID = data_point 
     
    299335                    self.current_datainfo.sample.orientation_unit = unit 
    300336 
    301                 ## Instrumental Information 
     337                # Instrumental Information 
    302338                elif tagname == 'name' and self.parent_class == 'SASinstrument': 
    303339                    self.current_datainfo.instrument = data_point 
    304                 ## Detector Information 
     340                # Detector Information 
    305341                elif tagname == 'name' and self.parent_class == 'SASdetector': 
    306342                    self.detector.name = data_point 
     
    347383                    self.detector.orientation.z = data_point 
    348384                    self.detector.orientation_unit = unit 
    349                 ## Collimation and Aperture 
     385                # Collimation and Aperture 
    350386                elif tagname == 'length' and self.parent_class == 'SAScollimation': 
    351387                    self.collimation.length = data_point 
     
    366402                    self.collimation.size_unit = unit 
    367403 
    368                 ## Process Information 
     404                # Process Information 
    369405                elif tagname == 'name' and self.parent_class == 'SASprocess': 
    370406                    self.process.name = data_point 
     
    386422                    self.process.term.append(dic) 
    387423 
    388                 ## Transmission Spectrum 
     424                # Transmission Spectrum 
    389425                elif tagname == 'T' and self.parent_class == 'Tdata': 
    390426                    self.transspectrum.transmission = np.append(self.transspectrum.transmission, data_point) 
     
    397433                    self.transspectrum.wavelength_unit = unit 
    398434 
    399                 ## Source Information 
     435                # Source Information 
    400436                elif tagname == 'wavelength' and (self.parent_class == 'SASsource' or self.parent_class == 'SASData'): 
    401437                    self.current_datainfo.source.wavelength = data_point 
     
    424460                    self.current_datainfo.source.beam_shape = data_point 
    425461 
    426                 ## Everything else goes in meta_data 
     462                # Everything else goes in meta_data 
    427463                else: 
    428464                    new_key = self._create_unique_key(self.current_datainfo.meta_data, tagname) 
     
    438474            self.add_data_set() 
    439475            empty = None 
    440             if self.output[0].dx is not None: 
    441                 self.output[0].dxl = np.empty(0) 
    442                 self.output[0].dxw = np.empty(0) 
    443             else: 
    444                 self.output[0].dx = np.empty(0) 
    445476            return self.output[0], empty 
    446477 
     
    514545        self.current_datainfo = DataInfo() 
    515546 
    516     def _initialize_new_data_set(self, parent_list=None): 
     547    def _initialize_new_data_set(self, node=None): 
    517548        """ 
    518549        A private class method to generate a new 1D data object. 
    519550        Outside methods should call add_data_set() to be sure any existing data is stored properly. 
    520551 
    521         :param parent_list: List of names of parent elements 
    522         """ 
    523  
    524         if parent_list is None: 
    525             parent_list = [] 
     552        :param node: XML node to determine if 1D or 2D data 
     553        """ 
    526554        x = np.array(0) 
    527555        y = np.array(0) 
     556        for child in node: 
     557            if child.tag.replace(self.base_ns, "") == "Idata": 
     558                for i_child in child: 
     559                    if i_child.tag.replace(self.base_ns, "") == "Qx": 
     560                        self.current_dataset = plottable_2D() 
     561                        return 
    528562        self.current_dataset = plottable_1D(x, y) 
    529563 
     
    560594        """ 
    561595 
    562         ## Append errors to dataset and reset class errors 
     596        # Append errors to dataset and reset class errors 
    563597        self.current_datainfo.errors = set() 
    564598        for error in self.errors: 
     
    566600        self.errors.clear() 
    567601 
    568         ## Combine all plottables with datainfo and append each to output 
    569         ## Type cast data arrays to float64 and find min/max as appropriate 
     602        # Combine all plottables with datainfo and append each to output 
     603        # Type cast data arrays to float64 and find min/max as appropriate 
    570604        for dataset in self.data: 
    571             if dataset.x is not None: 
    572                 dataset.x = np.delete(dataset.x, [0]) 
    573                 dataset.x = dataset.x.astype(np.float64) 
    574                 dataset.xmin = np.min(dataset.x) 
    575                 dataset.xmax = np.max(dataset.x) 
    576             if dataset.y is not None: 
    577                 dataset.y = np.delete(dataset.y, [0]) 
    578                 dataset.y = dataset.y.astype(np.float64) 
    579                 dataset.ymin = np.min(dataset.y) 
    580                 dataset.ymax = np.max(dataset.y) 
    581             if dataset.dx is not None: 
    582                 dataset.dx = np.delete(dataset.dx, [0]) 
    583                 dataset.dx = dataset.dx.astype(np.float64) 
    584             if dataset.dxl is not None: 
    585                 dataset.dxl = np.delete(dataset.dxl, [0]) 
    586                 dataset.dxl = dataset.dxl.astype(np.float64) 
    587             if dataset.dxw is not None: 
    588                 dataset.dxw = np.delete(dataset.dxw, [0]) 
    589                 dataset.dxw = dataset.dxw.astype(np.float64) 
    590             if dataset.dy is not None: 
    591                 dataset.dy = np.delete(dataset.dy, [0]) 
    592                 dataset.dy = dataset.dy.astype(np.float64) 
    593             np.trim_zeros(dataset.x) 
    594             np.trim_zeros(dataset.y) 
    595             np.trim_zeros(dataset.dy) 
     605            if isinstance(dataset, plottable_1D): 
     606                if dataset.x is not None: 
     607                    dataset.x = np.delete(dataset.x, [0]) 
     608                    dataset.x = dataset.x.astype(np.float64) 
     609                    dataset.xmin = np.min(dataset.x) 
     610                    dataset.xmax = np.max(dataset.x) 
     611                if dataset.y is not None: 
     612                    dataset.y = np.delete(dataset.y, [0]) 
     613                    dataset.y = dataset.y.astype(np.float64) 
     614                    dataset.ymin = np.min(dataset.y) 
     615                    dataset.ymax = np.max(dataset.y) 
     616                if dataset.dx is not None: 
     617                    dataset.dx = np.delete(dataset.dx, [0]) 
     618                    dataset.dx = dataset.dx.astype(np.float64) 
     619                if dataset.dxl is not None: 
     620                    dataset.dxl = np.delete(dataset.dxl, [0]) 
     621                    dataset.dxl = dataset.dxl.astype(np.float64) 
     622                if dataset.dxw is not None: 
     623                    dataset.dxw = np.delete(dataset.dxw, [0]) 
     624                    dataset.dxw = dataset.dxw.astype(np.float64) 
     625                if dataset.dy is not None: 
     626                    dataset.dy = np.delete(dataset.dy, [0]) 
     627                    dataset.dy = dataset.dy.astype(np.float64) 
     628                np.trim_zeros(dataset.x) 
     629                np.trim_zeros(dataset.y) 
     630                np.trim_zeros(dataset.dy) 
     631            elif isinstance(dataset, plottable_2D): 
     632                dataset.data = dataset.data.astype(np.float64) 
     633                dataset.qx_data = dataset.qx_data.astype(np.float64) 
     634                dataset.xmin = np.min(dataset.qx_data) 
     635                dataset.xmax = np.max(dataset.qx_data) 
     636                dataset.qy_data = dataset.qy_data.astype(np.float64) 
     637                dataset.ymin = np.min(dataset.qy_data) 
     638                dataset.ymax = np.max(dataset.qy_data) 
     639                dataset.q_data = np.sqrt(dataset.qx_data * dataset.qx_data 
     640                                         + dataset.qy_data * dataset.qy_data) 
     641                if dataset.err_data is not None: 
     642                    dataset.err_data = dataset.err_data.astype(np.float64) 
     643                if dataset.dqx_data is not None: 
     644                    dataset.dqx_data = dataset.dqx_data.astype(np.float64) 
     645                if dataset.dqy_data is not None: 
     646                    dataset.dqy_data = dataset.dqy_data.astype(np.float64) 
     647                if dataset.mask is not None: 
     648                    dataset.mask = dataset.mask.astype(dtype=bool) 
     649 
     650                if len(dataset.shape) == 2: 
     651                    n_rows, n_cols = dataset.shape 
     652                    dataset.y_bins = dataset.qy_data[0::int(n_cols)] 
     653                    dataset.x_bins = dataset.qx_data[:int(n_cols)] 
     654                    dataset.data = dataset.data.flatten() 
     655                else: 
     656                    dataset.y_bins = [] 
     657                    dataset.x_bins = [] 
     658                    dataset.data = dataset.data.flatten() 
     659 
    596660            final_dataset = combine_data(dataset, self.current_datainfo) 
    597661            self.output.append(final_dataset) 
     
    693757                        and local_unit.lower() != "none": 
    694758                    if HAS_CONVERTER == True: 
    695                         ## Check local units - bad units raise KeyError 
     759                        # Check local units - bad units raise KeyError 
    696760                        data_conv_q = Converter(local_unit) 
    697761                        value_unit = default_unit 
     
    740804        A method to check all resolution data sets are the same size as I and Q 
    741805        """ 
    742         dql_exists = False 
    743         dqw_exists = False 
    744         dq_exists = False 
    745         di_exists = False 
    746         if self.current_dataset.dxl is not None: 
    747             dql_exists = True 
    748         if self.current_dataset.dxw is not None: 
    749             dqw_exists = True 
    750         if self.current_dataset.dx is not None: 
    751             dq_exists = True 
    752         if self.current_dataset.dy is not None: 
    753             di_exists = True 
    754         if dqw_exists and not dql_exists: 
    755             array_size = self.current_dataset.dxw.size - 1 
    756             self.current_dataset.dxl = np.append(self.current_dataset.dxl, np.zeros([array_size])) 
    757         elif dql_exists and not dqw_exists: 
    758             array_size = self.current_dataset.dxl.size - 1 
    759             self.current_dataset.dxw = np.append(self.current_dataset.dxw, np.zeros([array_size])) 
    760         elif not dql_exists and not dqw_exists and not dq_exists: 
    761             array_size = self.current_dataset.x.size - 1 
    762             self.current_dataset.dx = np.append(self.current_dataset.dx, np.zeros([array_size])) 
    763         if not di_exists: 
    764             array_size = self.current_dataset.y.size - 1 
    765             self.current_dataset.dy = np.append(self.current_dataset.dy, np.zeros([array_size])) 
    766  
     806        if isinstance(self.current_dataset, plottable_1D): 
     807            dql_exists = False 
     808            dqw_exists = False 
     809            dq_exists = False 
     810            di_exists = False 
     811            if self.current_dataset.dxl is not None: 
     812                dql_exists = True 
     813            if self.current_dataset.dxw is not None: 
     814                dqw_exists = True 
     815            if self.current_dataset.dx is not None: 
     816                dq_exists = True 
     817            if self.current_dataset.dy is not None: 
     818                di_exists = True 
     819            if dqw_exists and not dql_exists: 
     820                array_size = self.current_dataset.dxw.size - 1 
     821                self.current_dataset.dxl = np.append(self.current_dataset.dxl, 
     822                                                     np.zeros([array_size])) 
     823            elif dql_exists and not dqw_exists: 
     824                array_size = self.current_dataset.dxl.size - 1 
     825                self.current_dataset.dxw = np.append(self.current_dataset.dxw, 
     826                                                     np.zeros([array_size])) 
     827            elif not dql_exists and not dqw_exists and not dq_exists: 
     828                array_size = self.current_dataset.x.size - 1 
     829                self.current_dataset.dx = np.append(self.current_dataset.dx, 
     830                                                    np.zeros([array_size])) 
     831            if not di_exists: 
     832                array_size = self.current_dataset.y.size - 1 
     833                self.current_dataset.dy = np.append(self.current_dataset.dy, 
     834                                                    np.zeros([array_size])) 
     835        elif isinstance(self.current_dataset, plottable_2D): 
     836            dqx_exists = False 
     837            dqy_exists = False 
     838            di_exists = False 
     839            mask_exists = False 
     840            if self.current_dataset.dqx_data is not None: 
     841                dqx_exists = True 
     842            if self.current_dataset.dqy_data is not None: 
     843                dqy_exists = True 
     844            if self.current_dataset.err_data is not None: 
     845                di_exists = True 
     846            if self.current_dataset.mask is not None: 
     847                mask_exists = True 
     848            if not dqy_exists: 
     849                array_size = self.current_dataset.qy_data.size - 1 
     850                self.current_dataset.dqy_data = np.append( 
     851                    self.current_dataset.dqy_data, np.zeros([array_size])) 
     852            if not dqx_exists: 
     853                array_size = self.current_dataset.qx_data.size - 1 
     854                self.current_dataset.dqx_data = np.append( 
     855                    self.current_dataset.dqx_data, np.zeros([array_size])) 
     856            if not di_exists: 
     857                array_size = self.current_dataset.data.size - 1 
     858                self.current_dataset.err_data = np.append( 
     859                    self.current_dataset.err_data, np.zeros([array_size])) 
     860            if not mask_exists: 
     861                array_size = self.current_dataset.data.size - 1 
     862                self.current_dataset.mask = np.append( 
     863                    self.current_dataset.mask, 
     864                    np.ones([array_size] ,dtype=bool)) 
    767865 
    768866    ####### All methods below are for writing CanSAS XML files ####### 
    769  
    770867 
    771868    def write(self, filename, datainfo): 
     
    792889        :param datainfo: Data1D object 
    793890        """ 
    794         if not issubclass(datainfo.__class__, Data1D): 
    795             raise RuntimeError, "The cansas writer expects a Data1D instance" 
     891        is_2d = False 
     892        if issubclass(datainfo.__class__, Data2D): 
     893            is_2d = True 
    796894 
    797895        # Get PIs and create root element 
     
    813911        self._write_run_names(datainfo, entry_node) 
    814912        # Add Data info to SASEntry 
    815         self._write_data(datainfo, entry_node) 
     913        if is_2d: 
     914            self._write_data_2d(datainfo, entry_node) 
     915        else: 
     916            self._write_data(datainfo, entry_node) 
    816917        # Transmission Spectrum Info 
    817918        self._write_trans_spectrum(datainfo, entry_node) 
     
    9071008    def _write_data(self, datainfo, entry_node): 
    9081009        """ 
    909         Writes the I and Q data to the XML file 
     1010        Writes 1D I and Q data to the XML file 
    9101011 
    9111012        :param datainfo: The Data1D object the information is coming from 
     
    9351036                self.write_node(point, "dQl", datainfo.dxl[i], 
    9361037                                {'unit': datainfo.x_unit}) 
     1038 
     1039    def _write_data_2d(self, datainfo, entry_node): 
     1040        """ 
     1041        Writes 2D data to the XML file 
     1042 
     1043        :param datainfo: The Data2D object the information is coming from 
     1044        :param entry_node: lxml node ElementTree object to be appended to 
     1045        """ 
     1046        attr = {} 
     1047        if datainfo.data.shape: 
     1048            attr["x_bins"] = str(len(datainfo.x_bins)) 
     1049            attr["y_bins"] = str(len(datainfo.y_bins)) 
     1050        node = self.create_element("SASdata", attr) 
     1051        self.append(node, entry_node) 
     1052 
     1053        point = self.create_element("Idata") 
     1054        node.append(point) 
     1055        qx = ','.join([str(datainfo.qx_data[i]) for i in xrange(len(datainfo.qx_data))]) 
     1056        qy = ','.join([str(datainfo.qy_data[i]) for i in xrange(len(datainfo.qy_data))]) 
     1057        intensity = ','.join([str(datainfo.data[i]) for i in xrange(len(datainfo.data))]) 
     1058 
     1059        self.write_node(point, "Qx", qx, 
     1060                        {'unit': datainfo._xunit}) 
     1061        self.write_node(point, "Qy", qy, 
     1062                        {'unit': datainfo._yunit}) 
     1063        self.write_node(point, "I", intensity, 
     1064                        {'unit': datainfo._zunit}) 
     1065        if datainfo.err_data is not None: 
     1066            err = ','.join([str(datainfo.err_data[i]) for i in 
     1067                            xrange(len(datainfo.err_data))]) 
     1068            self.write_node(point, "Idev", err, 
     1069                            {'unit': datainfo._zunit}) 
     1070        if datainfo.dqy_data is not None: 
     1071            dqy = ','.join([str(datainfo.dqy_data[i]) for i in 
     1072                            xrange(len(datainfo.dqy_data))]) 
     1073            self.write_node(point, "Qydev", dqy, 
     1074                            {'unit': datainfo._yunit}) 
     1075        if datainfo.dqx_data is not None: 
     1076            dqx = ','.join([str(datainfo.dqx_data[i]) for i in 
     1077                            xrange(len(datainfo.dqx_data))]) 
     1078            self.write_node(point, "Qxdev", dqx, 
     1079                            {'unit': datainfo._xunit}) 
     1080        if datainfo.mask is not None: 
     1081            mask = ','.join( 
     1082                ["1" if datainfo.mask[i] else "0" 
     1083                 for i in xrange(len(datainfo.mask))]) 
     1084            self.write_node(point, "Mask", mask) 
    9371085 
    9381086    def _write_trans_spectrum(self, datainfo, entry_node): 
  • src/sas/sascalc/dataloader/readers/schema/cansas1d_invalid_v1_0.xsd

    r250fec92 raf08e55  
    2424 
    2525        <complexType name="IdataType"> 
     26                <xsd:choice> 
    2627                <sequence> 
    2728                        <element name="Q" minOccurs="1" maxOccurs="1"    type="tns:floatUnitType" /> 
     
    4041                        <xsd:any minOccurs="0" maxOccurs="unbounded" processContents="lax" namespace="##other" /> 
    4142                </sequence> 
     43                <sequence> 
     44                        <element name="Qx" minOccurs="1" maxOccurs="1"    type="tns:floatUnitType" /> 
     45                        <element name="Qy" minOccurs="1" maxOccurs="1"    type="tns:floatUnitType" /> 
     46                        <element name="I" minOccurs="1" maxOccurs="1"    type="tns:floatUnitType" /> 
     47                        <element name="Idev" minOccurs="0" maxOccurs="1" type="tns:floatUnitType" default="0" /> 
     48                        <element name="Qydev" minOccurs="0" maxOccurs="1" type="tns:floatUnitType" default="0" /> 
     49                        <element name="Qxdev" minOccurs="0" maxOccurs="1" type="tns:floatUnitType" default="0" /> 
     50                        <element name="Mask" minOccurs="0" maxOccurs="1" type="string" default="0" /> 
     51                </sequence> 
     52                </xsd:choice> 
    4253        </complexType> 
    4354         
     
    5162                <attribute name="name" type="string" use="optional" default="" /> 
    5263                <attribute name="timestamp" type="dateTime" use="optional" /> 
     64                <attribute name="x_bins" type="string" use="optional" /> 
     65                <attribute name="y_bins" type="string" use="optional" /> 
    5366        </complexType> 
    5467 
  • src/sas/sascalc/dataloader/readers/schema/cansas1d_invalid_v1_1.xsd

    r250fec92 raf08e55  
    2424 
    2525        <complexType name="IdataType"> 
     26                <xsd:choice> 
    2627                <sequence> 
    2728                        <element name="Q" minOccurs="1" maxOccurs="1"    type="tns:floatUnitType" /> 
     
    4041                        <xsd:any minOccurs="0" maxOccurs="unbounded" processContents="lax" namespace="##other" /> 
    4142                </sequence> 
     43                <sequence> 
     44                        <element name="Qx" minOccurs="1" maxOccurs="1"    type="tns:floatUnitType" /> 
     45                        <element name="Qy" minOccurs="1" maxOccurs="1"    type="tns:floatUnitType" /> 
     46                        <element name="I" minOccurs="1" maxOccurs="1"    type="tns:floatUnitType" /> 
     47                        <element name="Idev" minOccurs="0" maxOccurs="1" type="tns:floatUnitType" default="0" /> 
     48                        <element name="Qydev" minOccurs="0" maxOccurs="1" type="tns:floatUnitType" default="0" /> 
     49                        <element name="Qxdev" minOccurs="0" maxOccurs="1" type="tns:floatUnitType" default="0" /> 
     50                        <element name="Mask" minOccurs="0" maxOccurs="1" type="string" default="0" /> 
     51                </sequence> 
     52                </xsd:choice> 
    4253        </complexType> 
    4354         
     
    5162                <attribute name="name" type="string" use="optional" default="" /> 
    5263                <attribute name="timestamp" type="dateTime" use="optional" /> 
     64                <attribute name="x_bins" type="string" use="optional" /> 
     65                <attribute name="y_bins" type="string" use="optional" /> 
    5366        </complexType> 
    5467 
  • src/sas/sascalc/file_converter/c_ext/bsl_loader.c

    rdc8a553 r2ab9c432  
    11#include <Python.h> 
     2//#define NPY_NO_DEPRECATED_API NPY_1_7_API_VERSION 
    23#include <numpy/arrayobject.h> 
    34#include <stdio.h> 
     
    2122static PyObject *CLoader_init(CLoader *self, PyObject *args, PyObject *kwds) { 
    2223    const char *filename; 
    23     const int n_frames; 
    24     const int n_pixels; 
    25     const int n_rasters; 
    26     const int swap_bytes; 
     24    int n_frames; 
     25    int n_pixels; 
     26    int n_rasters; 
     27    int swap_bytes; 
    2728 
    2829    if (self != NULL) { 
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.