Ignore:
Timestamp:
Sep 30, 2016 11:07:16 AM (8 years ago)
Author:
butler
Branches:
master, core_shell_microgels, costrafo411, magnetic_model, release_v0.94, release_v0.95, ticket-1257-vesicle-product, ticket_1156, ticket_1265_superball, ticket_822_more_unit_tests
Children:
a807206
Parents:
6e5b2a7
Message:

Updating parameter names regarding #649

File:
1 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed

  • sasmodels/models/core_shell_ellipsoid.py

    r40a87fa r2222134  
    5252.. note:: 
    5353    The 2nd virial coefficient of the solid ellipsoid is calculated based on 
    54     the *radius_a* (= *polar_shell)* and *radius_b (= equat_shell)* values, 
     54    the *radius_a* (= *radius_polar_shell)* and *radius_b (= radius_equat_shell)* values, 
    5555    and used as the effective radius for *S(Q)* when $P(Q) * S(Q)$ is applied. 
    5656 
    … …  
    8282    single particle scattering amplitude. 
    8383    [Parameters]: 
    84     equat_core = equatorial radius of core, Rminor_core, 
    85     polar_core = polar radius of core, Rmajor_core, 
    86     equat_shell = equatorial radius of shell, Rminor_outer, 
    87     polar_shell = polar radius of shell, Rmajor_outer, 
     84    radius_equat_core = equatorial radius of core, Rminor_core, 
     85    radius_polar_core = polar radius of core, Rmajor_core, 
     86    radius_equat_shell = equatorial radius of shell, Rminor_outer, 
     87    radius_polar_shell = polar radius of shell, Rmajor_outer, 
    8888    sld_core = scattering length density of core, 
    8989    sld_shell = scattering length density of shell, 
    … …  
    102102#   ["name", "units", default, [lower, upper], "type", "description"], 
    103103parameters = [ 
    104     ["equat_core",  "Ang",      200,   [0, inf],    "volume",      "Equatorial radius of core, r minor core"], 
    105     ["polar_core",  "Ang",       10,   [0, inf],    "volume",      "Polar radius of core, r major core"], 
    106     ["equat_shell", "Ang",      250,   [0, inf],    "volume",      "Equatorial radius of shell, r minor outer"], 
    107     ["polar_shell", "Ang",       30,   [0, inf],    "volume",      "Polar radius of shell, r major outer"], 
     104    ["radius_equat_core",  "Ang",      200,   [0, inf],    "volume",      "Equatorial radius of core, r minor core"], 
     105    ["radius_polar_core",  "Ang",       10,   [0, inf],    "volume",      "Polar radius of core, r major core"], 
     106    ["radius_equat_shell", "Ang",      250,   [0, inf],    "volume",      "Equatorial radius of shell, r minor outer"], 
     107    ["radius_polar_shell", "Ang",       30,   [0, inf],    "volume",      "Polar radius of shell, r major outer"], 
    108108    ["sld_core",    "1e-6/Ang^2", 2,   [-inf, inf], "sld",         "Core scattering length density"], 
    109109    ["sld_shell",   "1e-6/Ang^2", 1,   [-inf, inf], "sld",         "Shell scattering length density"], 
    … …  
    116116source = ["lib/sph_j1c.c", "lib/gfn.c", "lib/gauss76.c", "core_shell_ellipsoid.c"] 
    117117 
    118 def ER(equat_core, polar_core, equat_shell, polar_shell): 
     118def ER(radius_equat_core, radius_polar_core, radius_equat_shell, radius_polar_shell): 
    119119    """ 
    120120        Returns the effective radius used in the S*P calculation 
    121121    """ 
    122122    from .ellipsoid import ER as ellipsoid_ER 
    123     return ellipsoid_ER(polar_shell, equat_shell) 
     123    return ellipsoid_ER(radius_polar_shell, radius_equat_shell) 
    124124 
    125125 
    126126demo = dict(scale=1, background=0.001, 
    127             equat_core=200.0, 
    128             polar_core=10.0, 
    129             equat_shell=250.0, 
    130             polar_shell=30.0, 
     127            radius_equat_core=200.0, 
     128            radius_polar_core=10.0, 
     129            radius_equat_shell=250.0, 
     130            radius_polar_shell=30.0, 
    131131            sld_core=2.0, 
    132132            sld_shell=1.0, 
    … …  
    142142tests = [ 
    143143    # Accuracy tests based on content in test/utest_other_models.py 
    144     [{'equat_core': 200.0, 
    145       'polar_core': 20.0, 
    146       'equat_shell': 250.0, 
    147       'polar_shell': 30.0, 
     144    [{'radius_equat_core': 200.0, 
     145      'radius_polar_core': 20.0, 
     146      'radius_equat_shell': 250.0, 
     147      'radius_polar_shell': 30.0, 
    148148      'sld_core': 2.0, 
    149149      'sld_shell': 1.0, 
    … …  
    156156    [{'background': 0.01}, 0.1, 8.86741], 
    157157 
    158     [{'equat_core': 20.0, 
    159       'polar_core': 200.0, 
    160       'equat_shell': 54.0, 
    161       'polar_shell': 3.0, 
     158    [{'radius_equat_core': 20.0, 
     159      'radius_polar_core': 200.0, 
     160      'radius_equat_shell': 54.0, 
     161      'radius_polar_shell': 3.0, 
    162162      'sld_core': 20.0, 
    163163      'sld_shell': 10.0, 
    … …  
    169169    [{'background': 0.001}, (0.4, 0.5), 0.00170471], 
    170170 
    171     [{'equat_core': 20.0, 
    172       'polar_core': 200.0, 
    173       'equat_shell': 54.0, 
    174       'polar_shell': 3.0, 
     171    [{'radius_equat_core': 20.0, 
     172      'radius_polar_core': 200.0, 
     173      'radius_equat_shell': 54.0, 
     174      'radius_polar_shell': 3.0, 
    175175      'sld_core': 20.0, 
    176176      'sld_shell': 10.0, 
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.