Changeset ce0a245 in sasview


Ignore:
Timestamp:
Sep 20, 2017 10:13:53 AM (7 years ago)
Author:
GitHub <noreply@…>
Branches:
master, ESS_GUI, ESS_GUI_Docs, ESS_GUI_batch_fitting, ESS_GUI_bumps_abstraction, ESS_GUI_iss1116, ESS_GUI_iss879, ESS_GUI_iss959, ESS_GUI_opencl, ESS_GUI_ordering, ESS_GUI_sync_sascalc, magnetic_scatt, release-4.2.2, ticket-1009, ticket-1094-headless, ticket-1242-2d-resolution, ticket-1243, ticket-1249, ticket885, unittest-saveload
Children:
d76c43a, fca1f50
Parents:
2a399ca (diff), 13374be (diff)
Note: this is a merge changeset, the changes displayed below correspond to the merge itself.
Use the (diff) links above to see all the changes relative to each parent.
git-author:
Paul Kienzle <pkienzle@…> (09/20/17 10:13:53)
git-committer:
GitHub <noreply@…> (09/20/17 10:13:53)
Message:

Merge pull request #94 from SasView?/4_1_issues

4.1.1 updates

Files:
18 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed

  • docs/sphinx-docs/source/conf.py

    r959eb01 rce2819b  
    3939              'sphinx.ext.viewcode'] 
    4040 
     41#set mathjax path 
     42mathjax_path="https://cdnjs.cloudflare.com/ajax/libs/mathjax/2.7.1/MathJax.js?config=TeX-MML-AM_CHTML" 
     43 
    4144# Add any paths that contain templates here, relative to this directory. 
    4245templates_path = ['_templates'] 
    … …  
    6265version = '4.1' 
    6366# The full version, including alpha/beta/rc tags. 
    64 release = '4.1.0' 
     67release = '4.1.2' 
    6568 
    6669# The language for content autogenerated by Sphinx. Refer to documentation 

  • sasview/README.txt

    r9146ed9 r6394851  
    441- Features 
    55=========== 
     6    - New in Version 4.1.2 
     7      -------------------- 
     8      This point release is a bug-fix release addressing: 
     9 
     10       - Fixes #984: PDF Reports Generate Empty PDFs 
     11       - Fixes a path typo 
     12       - 64 bit and 32 bit Windows executables now available 
     13 
     14      It is recommended that all users upgrade to this version 
     15 
     16    - New in Version 4.1.1 
     17      -------------------- 
     18      This point release is a bug-fix release addressing: 
     19 
     20       - Fixes #948: Mathjax CDN is going away 
     21       - Fixes #938: Cannot read canSAS1D file output by SasView 
     22       - Fixes #960: Save project throws error if empty fit page 
     23       - Fixes #929: Problem deleting data in first fit page 
     24       - Fixes #918: Test folders not bundled with release 
     25       - Fixes an issue with the live discovery of plugin models 
     26       - Fixes an issue with the NXcanSAS data loader 
     27       - Updated tutorials for SasView 4.x.y 
     28 
    629    - New in Version 4.1.0 
    730      ------------------ 

  • sasview/__init__.py

    r463e7ffc rce2819b  
    1 __version__ = "4.1" 
     1__version__ = "4.1.2" 
    22__build__ = "GIT_COMMIT" 
    33 

  • sasview/local_config.py

    ra1b8fee rce2819b  
    4747'''This work benefited from the use of the SasView application, originally developed under NSF Award DMR-0520547. SasView also contains code developed with funding from the EU Horizon 2020 programme under the SINE2020 project Grant No 654000.''' 
    4848_acknowledgement_citation = \ 
    49 '''M. Doucet et al. SasView Version 4.1, Zenodo, 10.5281/zenodo.438138''' 
     49'''M. Doucet et al. SasView Version 4.1.2, Zenodo, 10.5281/zenodo.825675''' 
    5050 
    5151_acknowledgement =  \ 

  • sasview/sasview.spec

    re42c8e9d r945f45d  
    138138 'sasmodels.core', 
    139139 'pyopencl', 
    140  'tinycc' 
     140 'tinycc', 
     141 'xhtml2pdf' 
    141142] 
    142143 

  • sasview/setup_exe.py

    r5a8cdbb rcd57c7d4  
    179179test_1d_dir = os.path.join(path, "test\\1d_data") 
    180180test_2d_dir = os.path.join(path, "test\\2d_data") 
     181test_sesans_dir = os.path.join(path, "test\\sesans_data") 
     182test_convertible_dir = os.path.join(path, "test\\convertible_files") 
    181183test_save_dir = os.path.join(path, "test\\save_states") 
    182 test_upcoming_dir = os.path.join(path, "test\\upcoming_formats") 
     184test_coord_dir = os.path.join(path, "test\\coordinate_data") 
     185test_image_dir = os.path.join(path, "test\\image_data") 
     186test_other_dir = os.path.join(path, "test\\other_files") 
    183187 
    184188matplotlibdatadir = matplotlib.get_data_path() 
    … …  
    269273# Copying the images directory to the distribution directory. 
    270274for f in findall(images_dir): 
    271     if not ".svn" in f: 
    272         data_files.append(("images", [f])) 
     275    data_files.append(("images", [f])) 
    273276 
    274277# Copying the HTML help docs 
    275278for f in findall(media_dir): 
    276     if not ".svn" in f: 
    277         data_files.append(("media", [f])) 
     279    data_files.append(("media", [f])) 
    278280 
    279281# Copying the sample data user data 
    280282for f in findall(test_1d_dir): 
    281     if not ".svn" in f: 
    282         data_files.append(("test\\1d_data", [f])) 
    283  
    284 # Copying the sample data user data 
     283    data_files.append(("test\\1d_data", [f])) 
    285284for f in findall(test_2d_dir): 
    286     if not ".svn" in f: 
    287         data_files.append(("test\\2d_data", [f])) 
    288  
    289 # Copying the sample data user data 
     285    data_files.append(("test\\2d_data", [f])) 
    290286for f in findall(test_save_dir): 
    291     if not ".svn" in f: 
    292         data_files.append(("test\\save_states", [f])) 
    293  
    294 # Copying the sample data user data 
    295 for f in findall(test_upcoming_dir): 
    296     if not ".svn" in f: 
    297         data_files.append(("test\\upcoming_formats", [f])) 
     287    data_files.append(("test\\save_states", [f])) 
     288for f in findall(test_sesans_dir): 
     289    data_files.append(("test\\sesans_data", [f])) 
     290for f in findall(test_convertible_dir): 
     291    data_files.append(("test\\convertible_files", [f])) 
     292for f in findall(test_coord_dir): 
     293    data_files.append(("test\\coordinate_data", [f])) 
     294for f in findall(test_image_dir): 
     295    data_files.append(("test\\image_data", [f])) 
     296for f in findall(test_other_dir): 
     297    data_files.append(("test\\other_files", [f])) 
    298298 
    299299# Copying opencl include files 

  • src/sas/sascalc/dataloader/file_reader_base_class.py

    ra78a02f rae69c690  
    115115                data.y = np.asarray([data.y[i] for i in ind]).astype(np.float64) 
    116116                if data.dx is not None: 
     117                    if len(data.dx) == 0: 
     118                        data.dx = None 
     119                        continue 
    117120                    data.dx = np.asarray([data.dx[i] for i in ind]).astype(np.float64) 
    118121                if data.dxl is not None: 
    … …  
    121124                    data.dxw = np.asarray([data.dxw[i] for i in ind]).astype(np.float64) 
    122125                if data.dy is not None: 
     126                    if len(data.dy) == 0: 
     127                        data.dy = None 
     128                        continue 
    123129                    data.dy = np.asarray([data.dy[i] for i in ind]).astype(np.float64) 
    124130                if data.lam is not None: 
    … …  
    185191        self.output = [] 
    186192 
    187     def remove_empty_q_values(self, has_error_dx=False, has_error_dy=False): 
     193    def remove_empty_q_values(self, has_error_dx=False, has_error_dy=False, 
     194                              has_error_dxl=False, has_error_dxw=False): 
    188195        """ 
    189196        Remove any point where Q == 0 
    … …  
    192199        self.current_dataset.x = self.current_dataset.x[x != 0] 
    193200        self.current_dataset.y = self.current_dataset.y[x != 0] 
    194         self.current_dataset.dy = self.current_dataset.dy[x != 0] if \ 
    195             has_error_dy else np.zeros(len(self.current_dataset.y)) 
    196         self.current_dataset.dx = self.current_dataset.dx[x != 0] if \ 
    197             has_error_dx else np.zeros(len(self.current_dataset.x)) 
     201        if has_error_dy: 
     202            self.current_dataset.dy = self.current_dataset.dy[x != 0] 
     203        if has_error_dx: 
     204            self.current_dataset.dx = self.current_dataset.dx[x != 0] 
     205        if has_error_dxl: 
     206            self.current_dataset.dxl = self.current_dataset.dxl[x != 0] 
     207        if has_error_dxw: 
     208            self.current_dataset.dxw = self.current_dataset.dxw[x != 0] 
    198209 
    199210    def reset_data_list(self, no_lines=0): 
    … …  
    204215        x = np.zeros(no_lines) 
    205216        y = np.zeros(no_lines) 
     217        dx = np.zeros(no_lines) 
    206218        dy = np.zeros(no_lines) 
    207         dx = np.zeros(no_lines) 
    208219        self.current_dataset = plottable_1D(x, y, dx, dy) 
    209220 

  • src/sas/sascalc/dataloader/readers/cansas_reader.py

    ra78a02f rae69c690  
    130130                self.current_datainfo.meta_data[PREPROCESS] = self.processing_instructions 
    131131                self._parse_entry(entry) 
    132                 has_error_dx = self.current_dataset.dx is not None 
    133                 has_error_dy = self.current_dataset.dy is not None 
    134                 self.remove_empty_q_values(has_error_dx=has_error_dx, 
    135                     has_error_dy=has_error_dy) 
    136                 self.send_to_output() # Combine datasets with DataInfo 
    137                 self.current_datainfo = DataInfo() # Reset DataInfo 
     132                self.data_cleanup() 
    138133        except FileContentsException as fc_exc: 
    139134            # File doesn't meet schema - try loading with a less strict schema 
    … …  
    154149                    self.load_file_and_schema(xml_file) # Reload strict schema so we can find where error are in file 
    155150                    invalid_xml = self.find_invalid_xml() 
    156                     invalid_xml = INVALID_XML.format(basename + self.extension) + invalid_xml 
    157                     raise DataReaderException(invalid_xml) # Handled by base class 
     151                    if invalid_xml != "": 
     152                        invalid_xml = INVALID_XML.format(basename + self.extension) + invalid_xml 
     153                        raise DataReaderException(invalid_xml) # Handled by base class 
    158154                except FileContentsException as fc_exc: 
    159155                    msg = "CanSAS Reader could not load the file {}".format(xml_file) 
    … …  
    279275                # I and Q points 
    280276                elif tagname == 'I' and isinstance(self.current_dataset, plottable_1D): 
    281                     unit_list = unit.split("|") 
    282                     if len(unit_list) > 1: 
    283                         self.current_dataset.yaxis(unit_list[0].strip(), 
    284                                                    unit_list[1].strip()) 
    285                     else: 
    286                         self.current_dataset.yaxis("Intensity", unit) 
     277                    self.current_dataset.yaxis("Intensity", unit) 
    287278                    self.current_dataset.y = np.append(self.current_dataset.y, data_point) 
    288279                elif tagname == 'Idev' and isinstance(self.current_dataset, plottable_1D): 
    289280                    self.current_dataset.dy = np.append(self.current_dataset.dy, data_point) 
    290281                elif tagname == 'Q': 
    291                     unit_list = unit.split("|") 
    292                     if len(unit_list) > 1: 
    293                         self.current_dataset.xaxis(unit_list[0].strip(), 
    294                                                    unit_list[1].strip()) 
    295                     else: 
    296                         self.current_dataset.xaxis("Q", unit) 
     282                    self.current_dataset.xaxis("Q", unit) 
    297283                    self.current_dataset.x = np.append(self.current_dataset.x, data_point) 
    298284                elif tagname == 'Qdev': 
    299285                    self.current_dataset.dx = np.append(self.current_dataset.dx, data_point) 
    300286                elif tagname == 'dQw': 
    301                     if self.current_dataset.dxw is None: 
    302                         self.current_dataset.dxw = np.empty(0) 
    303                     self.current_dataset.dxw = np.append(self.current_dataset.dxw, data_point) 
     287                   self.current_dataset.dxw = np.append(self.current_dataset.dxw, data_point) 
    304288                elif tagname == 'dQl': 
    305                     if self.current_dataset.dxl is None: 
    306                         self.current_dataset.dxl = np.empty(0) 
    307289                    self.current_dataset.dxl = np.append(self.current_dataset.dxl, data_point) 
    308290                elif tagname == 'Qmean': 
    … …  
    312294                elif tagname == 'Sesans': 
    313295                    self.current_datainfo.isSesans = bool(data_point) 
     296                    self.current_dataset.xaxis(attr.get('x_axis'), 
     297                                                attr.get('x_unit')) 
     298                    self.current_dataset.yaxis(attr.get('y_axis'), 
     299                                                attr.get('y_unit')) 
    314300                elif tagname == 'yacceptance': 
    315301                    self.current_datainfo.sample.yacceptance = (data_point, unit) 
    … …  
    512498            for error in self.errors: 
    513499                self.current_datainfo.errors.add(error) 
    514             self.errors.clear() 
    515             self.send_to_output() 
     500            self.data_cleanup() 
     501            self.sort_one_d_data() 
     502            self.sort_two_d_data() 
     503            self.reset_data_list() 
    516504            empty = None 
    517505            return self.output[0], empty 
     506 
     507    def data_cleanup(self): 
     508        """ 
     509        Clean up the data sets and refresh everything 
     510        :return: None 
     511        """ 
     512        has_error_dx = self.current_dataset.dx is not None 
     513        has_error_dxl = self.current_dataset.dxl is not None 
     514        has_error_dxw = self.current_dataset.dxw is not None 
     515        has_error_dy = self.current_dataset.dy is not None 
     516        self.remove_empty_q_values(has_error_dx=has_error_dx, 
     517                                   has_error_dxl=has_error_dxl, 
     518                                   has_error_dxw=has_error_dxw, 
     519                                   has_error_dy=has_error_dy) 
     520        self.send_to_output()  # Combine datasets with DataInfo 
     521        self.current_datainfo = DataInfo()  # Reset DataInfo 
    518522 
    519523    def _is_call_local(self): 
    … …  
    642646                    value_unit = local_unit 
    643647            except KeyError: 
    644                 err_msg = "CanSAS reader: unexpected " 
    645                 err_msg += "\"{0}\" unit [{1}]; " 
    646                 err_msg = err_msg.format(tagname, local_unit) 
    647                 err_msg += "expecting [{0}]".format(default_unit) 
     648                # Do not throw an error for loading Sesans data in cansas xml 
     649                # This is a temporary fix. 
     650                if local_unit != "A" and local_unit != 'pol': 
     651                    err_msg = "CanSAS reader: unexpected " 
     652                    err_msg += "\"{0}\" unit [{1}]; " 
     653                    err_msg = err_msg.format(tagname, local_unit) 
     654                    err_msg += "expecting [{0}]".format(default_unit) 
    648655                value_unit = local_unit 
    649656            except: 
    … …  
    675682            di_exists = True 
    676683        if dqw_exists and not dql_exists: 
    677             array_size = self.current_dataset.dxw.size - 1 
    678             self.current_dataset.dxl = np.append(self.current_dataset.dxl, 
    679                                                  np.zeros([array_size])) 
     684            array_size = self.current_dataset.dxw.size 
     685            self.current_dataset.dxl = np.zeros(array_size) 
    680686        elif dql_exists and not dqw_exists: 
    681             array_size = self.current_dataset.dxl.size - 1 
    682             self.current_dataset.dxw = np.append(self.current_dataset.dxw, 
    683                                                  np.zeros([array_size])) 
     687            array_size = self.current_dataset.dxl.size 
     688            self.current_dataset.dxw = np.zeros(array_size) 
    684689        elif not dql_exists and not dqw_exists and not dq_exists: 
    685             array_size = self.current_dataset.x.size - 1 
     690            array_size = self.current_dataset.x.size 
    686691            self.current_dataset.dx = np.append(self.current_dataset.dx, 
    687692                                                np.zeros([array_size])) 
    688693        if not di_exists: 
    689             array_size = self.current_dataset.y.size - 1 
     694            array_size = self.current_dataset.y.size 
    690695            self.current_dataset.dy = np.append(self.current_dataset.dy, 
    691696                                                np.zeros([array_size])) 
    … …  
    857862            node.append(point) 
    858863            self.write_node(point, "Q", datainfo.x[i], 
    859                             {'unit': datainfo._xaxis + " | " + datainfo._xunit}) 
     864                            {'unit': datainfo.x_unit}) 
    860865            if len(datainfo.y) >= i: 
    861866                self.write_node(point, "I", datainfo.y[i], 
    862                                 {'unit': datainfo._yaxis + " | " + datainfo._yunit}) 
     867                                {'unit': datainfo.y_unit}) 
    863868            if datainfo.dy is not None and len(datainfo.dy) > i: 
    864869                self.write_node(point, "Idev", datainfo.dy[i], 
    865                                 {'unit': datainfo._yaxis + " | " + datainfo._yunit}) 
     870                                {'unit': datainfo.y_unit}) 
    866871            if datainfo.dx is not None and len(datainfo.dx) > i: 
    867872                self.write_node(point, "Qdev", datainfo.dx[i], 
    868                                 {'unit': datainfo._xaxis + " | " + datainfo._xunit}) 
     873                                {'unit': datainfo.x_unit}) 
    869874            if datainfo.dxw is not None and len(datainfo.dxw) > i: 
    870875                self.write_node(point, "dQw", datainfo.dxw[i], 
    871                                 {'unit': datainfo._xaxis + " | " + datainfo._xunit}) 
     876                                {'unit': datainfo.x_unit}) 
    872877            if datainfo.dxl is not None and len(datainfo.dxl) > i: 
    873878                self.write_node(point, "dQl", datainfo.dxl[i], 
    874                                 {'unit': datainfo._xaxis + " | " + datainfo._xunit}) 
     879                                {'unit': datainfo.x_unit}) 
    875880        if datainfo.isSesans: 
    876             sesans = self.create_element("Sesans") 
     881            sesans_attrib = {'x_axis': datainfo._xaxis, 
     882                             'y_axis': datainfo._yaxis, 
     883                             'x_unit': datainfo.x_unit, 
     884                             'y_unit': datainfo.y_unit} 
     885            sesans = self.create_element("Sesans", attrib=sesans_attrib) 
    877886            sesans.text = str(datainfo.isSesans) 
    878             node.append(sesans) 
    879             self.write_node(node, "yacceptance", datainfo.sample.yacceptance[0], 
     887            entry_node.append(sesans) 
     888            self.write_node(entry_node, "yacceptance", datainfo.sample.yacceptance[0], 
    880889                             {'unit': datainfo.sample.yacceptance[1]}) 
    881             self.write_node(node, "zacceptance", datainfo.sample.zacceptance[0], 
     890            self.write_node(entry_node, "zacceptance", datainfo.sample.zacceptance[0], 
    882891                             {'unit': datainfo.sample.zacceptance[1]}) 
    883892 

  • src/sas/sascalc/dataloader/readers/cansas_reader_HDF5.py

    rdcb91cf rcd57c7d4  
    140140 
    141141            if isinstance(value, h5py.Group): 
     142                # Set parent class before recursion 
    142143                self.parent_class = class_name 
    143144                parent_list.append(key) 
    … …  
    150151                # Recursion step to access data within the group 
    151152                self.read_children(value, parent_list) 
     153                # Reset parent class when returning from recursive method 
     154                self.parent_class = class_name 
    152155                self.add_intermediate() 
    153156                parent_list.remove(key) 

  • src/sas/sascalc/dataloader/readers/xml_reader.py

    rfafe52a rcd57c7d4  
    134134            first_error = schema.assertValid(self.xmldoc) 
    135135        except etree.DocumentInvalid as err: 
     136            # Suppress errors for <'any'> elements 
     137            if "##other" in str(err): 
     138                return first_error 
    136139            first_error = str(err) 
    137140        return first_error 

  • src/sas/sascalc/invariant/invariant.py

    r7432acb rb1f20d1  
    610610        # Data boundaries for fitting 
    611611        qmin = self._data.x[0] 
    612         qmax = self._data.x[self._low_extrapolation_npts - 1] 
     612        qmax = self._data.x[int(self._low_extrapolation_npts - 1)] 
    613613 
    614614        # Extrapolate the low-Q data 
    … …  
    649649        # Data boundaries for fitting 
    650650        x_len = len(self._data.x) - 1 
    651         qmin = self._data.x[x_len - (self._high_extrapolation_npts - 1)] 
    652         qmax = self._data.x[x_len] 
     651        qmin = self._data.x[int(x_len - (self._high_extrapolation_npts - 1))] 
     652        qmax = self._data.x[int(x_len)] 
    653653 
    654654        # fit the data with a model to get the appropriate parameters 
    … …  
    688688        if npts_in is None: 
    689689            npts_in = self._low_extrapolation_npts 
    690         q_end = self._data.x[max(0, npts_in - 1)] 
     690        q_end = self._data.x[max(0, int(npts_in - 1))] 
    691691 
    692692        if q_start >= q_end: 
    … …  
    714714        # Get extrapolation range 
    715715        if npts_in is None: 
    716             npts_in = self._high_extrapolation_npts 
     716            npts_in = int(self._high_extrapolation_npts) 
    717717        _npts = len(self._data.x) 
    718         q_start = self._data.x[min(_npts, _npts - npts_in)] 
     718        q_start = self._data.x[min(_npts, int(_npts - npts_in))] 
    719719 
    720720        if q_start >= q_end: 

  • src/sas/sasgui/guiframe/config.py

    ra1b8fee rce2819b  
    4848'''This work benefited from the use of the SasView application, originally developed under NSF Award DMR-0520547. SasView also contains code developed with funding from the EU Horizon 2020 programme under the SINE2020 project Grant No 654000.''' 
    4949_acknowledgement_citation = \ 
    50 '''M. Doucet et al. SasView Version 4.1, Zenodo, 10.5281/zenodo.438138''' 
     50'''M. Doucet et al. SasView Version 4.1.2, Zenodo, 10.5281/zenodo.825675''' 
    5151 
    5252_acknowledgement =  \ 

  • src/sas/sasgui/guiframe/documentation_window.py

    r959eb01 r6a455cd3  
    7575            logger.error("Could not find Sphinx documentation at %s \ 
    7676            -- has it been built?", file_path) 
    77         elif WX_SUPPORTS_HTML2: 
    78             # Complete HTML/CSS support! 
    79             self.view = html.WebView.New(self) 
    80             self.view.LoadURL(url) 
    81             self.Show() 
     77        #Commenting following 5 lines, so default browser is forced 
     78        #This is due to CDN mathjax discontinuation of service, intenal help 
     79        #browser should be back with qt version 
     80        #Note added by Wojtek Potrzebowski, July 4th 2017 
     81        # elif WX_SUPPORTS_HTML2: 
     82        #     # Complete HTML/CSS support! 
     83        #     self.view = html.WebView.New(self) 
     84        #     self.view.LoadURL(url) 
     85        #     self.Show() 
    8286        else: 
    8387            logger.error("No html2 support, popping up a web browser") 

  • src/sas/sasgui/perspectives/fitting/fitpage.py

    r66acafe r13374be  
    12431243            wx.PostEvent(self.parent, new_event) 
    12441244            # update list of plugins if new plugin is available 
    1245             custom_model = CUSTOM_MODEL 
    12461245            mod_cat = self.categorybox.GetStringSelection() 
    1247             if mod_cat == custom_model: 
     1246            if mod_cat == CUSTOM_MODEL: 
     1247                temp_id = self.model.id 
    12481248                temp = self.parent.update_model_list() 
     1249                for v in self.parent.model_dictionary.values(): 
     1250                    if v.id == temp_id: 
     1251                        self.model = v() 
     1252                        break 
    12491253                if temp: 
    12501254                    self.model_list_box = temp 

  • src/sas/sasgui/perspectives/fitting/fitpanel.py

    r6f9abd3 r13374be  
    9292            # state must be cloned 
    9393            state = page.get_state().clone() 
    94             if data is not None or page.model is not None: 
     94            # data_list only populated with real data 
     95            # Fake object in data from page.get_data() if model is selected 
     96            if len(page.data_list) is not 0 and page.model is not None: 
    9597                new_doc = self._manager.state_reader.write_toXML(data, 
    9698                                                                 state, 
    9799                                                                 batch_state) 
     100                # Fit #2 through #n are append to first fit 
    98101                if doc is not None and hasattr(doc, "firstChild"): 
    99                     child = new_doc.firstChild.firstChild 
    100                     doc.firstChild.appendChild(child) 
     102                    # Only append if properly formed new_doc 
     103                    if new_doc is not None and hasattr(new_doc, "firstChild"): 
     104                        child = new_doc.firstChild.firstChild 
     105                        doc.firstChild.appendChild(child) 
     106                # First fit defines the main document 
    101107                else: 
    102108                    doc = new_doc 
    … …  
    395401                temp_data = page.get_data() 
    396402                if temp_data is not None and temp_data.id in data: 
    397                     self.SetSelection(pos) 
    398                     self.on_close_page(event=None) 
    399                     temp = self.GetSelection() 
    400                     self.DeletePage(temp) 
     403                    self.close_page_with_data(temp_data) 
    401404            if self.sim_page is not None: 
    402405                if len(self.sim_page.model_list) == 0: 
    … …  
    404407                    self.SetSelection(pos) 
    405408                    self.on_close_page(event=None) 
    406                     temp = self.GetSelection() 
    407                     self.DeletePage(temp) 
     409                    self.DeletePage(pos) 
    408410                    self.sim_page = None 
    409411                    self.batch_on = False 

  • src/sas/sasgui/perspectives/fitting/models.py

    r632fda9 r13374be  
    2121from sas.sasgui.guiframe.CategoryInstaller import CategoryInstaller 
    2222from sasmodels.sasview_model import load_custom_model, load_standard_models 
     23from sas.sasgui.perspectives.fitting.fitpage import CUSTOM_MODEL 
    2324 
    2425logger = logging.getLogger(__name__) 
    … …  
    266267        temp = {} 
    267268        if self.is_changed(): 
    268             return  _find_models() 
     269            temp =  _find_models() 
     270            self.last_time_dir_modified = time.time() 
     271            return temp 
    269272        logger.info("plugin model : %s" % str(temp)) 
    270273        return temp 
    … …  
    323326        if os.path.isdir(plugin_dir): 
    324327            temp = os.path.getmtime(plugin_dir) 
    325             if  self.last_time_dir_modified != temp: 
     328            if  self.last_time_dir_modified < temp: 
    326329                is_modified = True 
    327330                self.last_time_dir_modified = temp 
    … …  
    334337        new models were added else return empty dictionary 
    335338        """ 
     339        self.plugins = [] 
    336340        new_plugins = self.findModels() 
    337         if len(new_plugins) > 0: 
    338             for name, plug in  new_plugins.iteritems(): 
    339                 if name not in self.stored_plugins.keys(): 
    340                     self.stored_plugins[name] = plug 
    341                     self.plugins.append(plug) 
    342                     self.model_dictionary[name] = plug 
    343             self.model_combobox.set_list("Plugin Models", self.plugins) 
     341        if new_plugins: 
     342            for name, plug in  new_plugins.items(): 
     343                self.stored_plugins[name] = plug 
     344                self.plugins.append(plug) 
     345                self.model_dictionary[name] = plug 
     346            self.model_combobox.set_list(CUSTOM_MODEL, self.plugins) 
    344347            return self.model_combobox.get_list() 
    345348        else: 

  • src/sas/sasgui/perspectives/fitting/pagestate.py

    r959eb01 rda9b239  
    617617            value = "" 
    618618            content = line.split(":") 
     619            if line == '' or len(content) == 1: 
     620                continue 
    619621            name = content[0] 
    620622            try: 

  • test/sasdataloader/test/utest_abs_reader.py

    ra78a02f rae69c690  
    333333        self.assertEqual(self.data.x[1], 0.03) 
    334334        self.assertAlmostEquals(self.data.y[1], 1001.0) 
    335         self.assertEqual(self.data.dx[0], 0.0) 
    336335        self.assertEqual(self.data.dxl[1], 0.005) 
    337336        self.assertEqual(self.data.dxw[1], 0.001) 
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.