Changeset a839b22 in sasmodels


Ignore:
Timestamp:
Nov 29, 2017 10:18:30 AM (7 years ago)
Author:
Paul Kienzle <pkienzle@…>
Branches:
master, core_shell_microgels, magnetic_model, ticket-1257-vesicle-product, ticket_1156, ticket_1265_superball, ticket_822_more_unit_tests
Children:
2d81cfe
Parents:
fa79f5c
Message:

lint

File:
1 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed

  • sasmodels/data.py

    rfa79f5c ra839b22  
    3737import numpy as np  # type: ignore 
    3838 
     39# pylint: disable=unused-import 
    3940try: 
    4041    from typing import Union, Dict, List, Optional 
    … …  
    4344else: 
    4445    Data = Union["Data1D", "Data2D", "SesansData"] 
     46# pylint: enable=unused-import 
    4547 
    4648def load_data(filename, index=0): 
    … …  
    137139    *_yaxis*, *_yunit*: label and units for the *y* axis 
    138140    """ 
    139     def __init__(self, x=None, y=None, dx=None, dy=None): 
    140         # type: (Optional[np.ndarray], Optional[np.ndarray], Optional[np.ndarray], Optional[np.ndarray]) -> None 
     141    def __init__(self, 
     142                 x=None,  # type: Optional[np.ndarray] 
     143                 y=None,  # type: Optional[np.ndarray] 
     144                 dx=None, # type: Optional[np.ndarray] 
     145                 dy=None  # type: Optional[np.ndarray] 
     146                ): 
     147        # type: (...) -> None 
    141148        self.x, self.y, self.dx, self.dy = x, y, dx, dy 
    142149        self.dxl = None 
    … …  
    211218    *x_bins*, *y_bins*: grid steps in *x* and *y* directions 
    212219    """ 
    213     def __init__(self, x=None, y=None, z=None, dx=None, dy=None, dz=None): 
    214         # type: (Optional[np.ndarray], Optional[np.ndarray], Optional[np.ndarray], Optional[np.ndarray], Optional[np.ndarray], Optional[np.ndarray]) -> None 
     220    def __init__(self, 
     221                 x=None,   # type: Optional[np.ndarray] 
     222                 y=None,   # type: Optional[np.ndarray] 
     223                 z=None,   # type: Optional[np.ndarray] 
     224                 dx=None,  # type: Optional[np.ndarray] 
     225                 dy=None,  # type: Optional[np.ndarray] 
     226                 dz=None   # type: Optional[np.ndarray] 
     227                ): 
     228        # type: (...) -> None 
    215229        self.qx_data, self.dqx_data = x, dx 
    216230        self.qy_data, self.dqy_data = y, dy 
    … …  
    369383 
    370384 
    371 def plot_theory(data, theory, resid=None, view='log', 
    372                 use_data=True, limits=None, Iq_calc=None): 
    373     # type: (Data, Optional[np.ndarray], Optional[np.ndarray], str, bool, Optional[Tuple[float,float]], Optional[np.ndarray]) -> None 
     385def plot_theory(data,          # type: Data 
     386                theory,        # type: Optional[np.ndarray] 
     387                resid=None,    # type: Optional[np.ndarray] 
     388                view='log',    # type: str 
     389                use_data=True, # type: bool 
     390                limits=None,   # type: Optional[np.ndarray] 
     391                Iq_calc=None   # type: Optional[np.ndarray] 
     392               ): 
     393    # type: (...) -> None 
    374394    """ 
    375395    Plot theory calculation. 
    … …  
    417437 
    418438@protect 
    419 def _plot_result1D(data, theory, resid, view, use_data, 
    420                    limits=None, Iq_calc=None): 
    421     # type: (Data1D, Optional[np.ndarray], Optional[np.ndarray], str, bool, Optional[Tuple[float, float]], Optional[np.ndarray]) -> None 
     439def _plot_result1D(data,         # type: Data1D 
     440                   theory,       # type: Optional[np.ndarray] 
     441                   resid,        # type: Optional[np.ndarray] 
     442                   view,         # type: str 
     443                   use_data,     # type: bool 
     444                   limits=None,  # type: Optional[Tuple[float, float]] 
     445                   Iq_calc=None  # type: Optional[np.ndarray] 
     446                  ): 
     447    # type: (...) -> None 
    422448    """ 
    423449    Plot the data and residuals for 1D data. 
    … …  
    515541 
    516542@protect 
    517 def _plot_result_sesans(data, theory, resid, use_data, limits=None): 
    518     # type: (SesansData, Optional[np.ndarray], Optional[np.ndarray], bool, Optional[Tuple[float, float]]) -> None 
     543def _plot_result_sesans(data,        # type: SesansData 
     544                        theory,      # type: Optional[np.ndarray] 
     545                        resid,       # type: Optional[np.ndarray] 
     546                        use_data,    # type: bool 
     547                        limits=None  # type: Optional[Tuple[float, float]] 
     548                       ): 
     549    # type: (...) -> None 
    519550    """ 
    520551    Plot SESANS results. 
    … …  
    560591 
    561592@protect 
    562 def _plot_result2D(data, theory, resid, view, use_data, limits=None): 
    563     # type: (Data2D, Optional[np.ndarray], Optional[np.ndarray], str, bool, Optional[Tuple[float,float]]) -> None 
     593def _plot_result2D(data,         # type: Data2D 
     594                   theory,       # type: Optional[np.ndarray] 
     595                   resid,        # type: Optional[np.ndarray] 
     596                   view,         # type: str 
     597                   use_data,     # type: bool 
     598                   limits=None   # type: Optional[Tuple[float, float]] 
     599                  ): 
     600    # type: (...) -> None 
    564601    """ 
    565602    Plot the data and residuals for 2D data. 
    … …  
    596633        _plot_2d_signal(data, target, view=view, vmin=vmin, vmax=vmax) 
    597634        plt.title('data') 
    598         h = plt.colorbar() 
    599         h.set_label('$I(q)$') 
     635        handle = plt.colorbar() 
     636        handle.set_label('$I(q)$') 
    600637 
    601638    # plot theory 
    … …  
    605642        _plot_2d_signal(data, theory, view=view, vmin=vmin, vmax=vmax) 
    606643        plt.title('theory') 
    607         h = plt.colorbar() 
    608         h.set_label(r'$\log_{10}I(q)$' if view == 'log' 
    609                     else r'$q^4 I(q)$' if view == 'q4' 
    610                     else '$I(q)$') 
     644        handle = plt.colorbar() 
     645        handle.set_label(r'$\log_{10}I(q)$' if view == 'log' 
     646                         else r'$q^4 I(q)$' if view == 'q4' 
     647                         else '$I(q)$') 
    611648 
    612649    # plot resid 
    … …  
    616653        _plot_2d_signal(data, resid, view='linear') 
    617654        plt.title('residuals') 
    618         h = plt.colorbar() 
    619         h.set_label(r'$\Delta I(q)$') 
     655        handle = plt.colorbar() 
     656        handle.set_label(r'$\Delta I(q)$') 
    620657 
    621658 
    622659@protect 
    623 def _plot_2d_signal(data, signal, vmin=None, vmax=None, view='log'): 
    624     # type: (Data2D, np.ndarray, Optional[float], Optional[float], str) -> Tuple[float, float] 
     660def _plot_2d_signal(data,       # type: Data2D 
     661                    signal,     # type: np.ndarray 
     662                    vmin=None,  # type: Optional[float] 
     663                    vmax=None,  # type: Optional[float] 
     664                    view='log'  # type: str 
     665                   ): 
     666    # type: (...) -> Tuple[float, float] 
    625667    """ 
    626668    Plot the target value for the data.  This could be the data itself, 
    … …  
    637679    if view == 'log': 
    638680        valid[valid] = (image[valid] > 0) 
    639         if vmin is None: vmin = image[valid & ~data.mask].min() 
    640         if vmax is None: vmax = image[valid & ~data.mask].max() 
     681        if vmin is None: 
     682            vmin = image[valid & ~data.mask].min() 
     683        if vmax is None: 
     684            vmax = image[valid & ~data.mask].max() 
    641685        image[valid] = np.log10(image[valid]) 
    642686    elif view == 'q4': 
    643687        image[valid] *= (data.qx_data[valid]**2+data.qy_data[valid]**2)**2 
    644         if vmin is None: vmin = image[valid & ~data.mask].min() 
    645         if vmax is None: vmax = image[valid & ~data.mask].max() 
     688        if vmin is None: 
     689            vmin = image[valid & ~data.mask].min() 
     690        if vmax is None: 
     691            vmax = image[valid & ~data.mask].max() 
    646692    else: 
    647         if vmin is None: vmin = image[valid & ~data.mask].min() 
    648         if vmax is None: vmax = image[valid & ~data.mask].max() 
     693        if vmin is None: 
     694            vmin = image[valid & ~data.mask].min() 
     695        if vmax is None: 
     696            vmax = image[valid & ~data.mask].max() 
    649697 
    650698    image[~valid | data.mask] = 0 
    … …  
    655703    ymin, ymax = min(data.qy_data), max(data.qy_data) 
    656704    if view == 'log': 
    657         vmin_scaled, vmax_scaled= np.log10(vmin), np.log10(vmax) 
     705        vmin_scaled, vmax_scaled = np.log10(vmin), np.log10(vmax) 
    658706    else: 
    659707        vmin_scaled, vmax_scaled = vmin, vmax 
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.