Changeset 4acca8c in sasview


Ignore:
Timestamp:
Mar 26, 2019 9:44:01 AM (6 months ago)
Author:
awashington
Branches:
ESS_GUI, ESS_GUI_bumps_abstraction, ESS_GUI_iss1116, ESS_GUI_opencl
Children:
3beadede
Parents:
f7e6b30 (diff), 60e20d8 (diff)
Note: this is a merge changeset, the changes displayed below correspond to the merge itself.
Use the (diff) links above to see all the changes relative to each parent.
Message:

Merge branch 'ESS_GUI' into Sasview-1079

Location:
src/sas
Files:
10 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed
  • src/sas/qtgui/Perspectives/Fitting/ConstraintWidget.py

    r33c0561 r14e1ff0  
    128128        self.is_chain_fitting = False 
    129129 
     130        # Is the fit job running? 
     131        self.is_running = False 
     132        self.calc_fit = None 
     133 
    130134        # Remember previous content of modified cell 
    131135        self.current_cell = "" 
     
    257261        Perform the constrained/simultaneous fit 
    258262        """ 
     263        # Stop if we're running 
     264        if self.is_running: 
     265            self.is_running = False 
     266            #re-enable the Fit button 
     267            self.cmdFit.setStyleSheet('QPushButton {color: black;}') 
     268            self.cmdFit.setText("Fit") 
     269            # stop the fitpages 
     270            self.calc_fit.stop() 
     271            return 
     272 
    259273        # Find out all tabs to fit 
    260274        tabs_to_fit = self.getTabsForFit() 
     
    310324 
    311325        # new fit thread object 
    312         calc_fit = FitThread(handler=handler, 
     326        self.calc_fit = FitThread(handler=handler, 
    313327                             fn=sim_fitter_list, 
    314328                             batch_inputs=batch_inputs, 
     
    321335        if LocalConfig.USING_TWISTED: 
    322336            # start the trhrhread with twisted 
    323             calc_thread = threads.deferToThread(calc_fit.compute) 
    324             calc_thread.addCallback(completefn) 
    325             calc_thread.addErrback(self.onFitFailed) 
     337            self.calc_fit = threads.deferToThread(self.calc_fit.compute) 
     338            self.calc_fit.addCallback(completefn) 
     339            self.calc_fit.addErrback(self.onFitFailed) 
    326340        else: 
    327341            # Use the old python threads + Queue 
    328             calc_fit.queue() 
    329             calc_fit.ready(2.5) 
    330  
    331  
    332         #disable the Fit button 
     342            self.calc_fit.queue() 
     343            self.calc_fit.ready(2.5) 
     344 
     345        # modify the Fit button 
    333346        self.cmdFit.setStyleSheet('QPushButton {color: red;}') 
    334         self.cmdFit.setText('Running...') 
     347        self.cmdFit.setText('Stop fit') 
    335348        self.parent.communicate.statusBarUpdateSignal.emit('Fitting started...') 
    336         self.cmdFit.setEnabled(False) 
     349        self.is_running = True 
    337350 
    338351    def onHelp(self): 
     
    457470        self.cmdFit.setStyleSheet('QPushButton {color: black;}') 
    458471        self.cmdFit.setText("Fit") 
    459         self.cmdFit.setEnabled(True) 
    460472 
    461473        # Notify the parent about completed fitting 
     
    503515        self.cmdFit.setStyleSheet('QPushButton {color: black;}') 
    504516        self.cmdFit.setText("Fit") 
    505         self.cmdFit.setEnabled(True) 
    506517 
    507518        # Notify the parent about completed fitting 
     
    538549        self.cmdFit.setStyleSheet('QPushButton {color: black;}') 
    539550        self.cmdFit.setText("Fit") 
    540         self.cmdFit.setEnabled(True) 
    541551 
    542552        # Notify the parent about completed fitting 
     
    958968        if isBatch: 
    959969            self.chkChain.setChecked(is_chain) 
     970 
     971    def getReport(self): 
     972        """ 
     973        Wrapper for non-existent functionality. 
     974        Tell the user to use the reporting tool 
     975        on separate fit pages. 
     976        """ 
     977        msg = "Please use Report Results directly on fit pages" 
     978        msg += " involved in the Constrained and Simultaneous fitting process." 
     979        msgbox = QtWidgets.QMessageBox(self) 
     980        msgbox.setIcon(QtWidgets.QMessageBox.Warning) 
     981        msgbox.setText(msg) 
     982        msgbox.setWindowTitle("Fit Report") 
     983        _ = msgbox.exec_() 
     984        return 
  • src/sas/qtgui/Perspectives/Fitting/FittingPerspective.py

    rfb39f28 r14e1ff0  
    406406                tab_object.enableInteractiveElements() 
    407407 
    408         pass 
    409  
    410408    def getCurrentStateAsXml(self): 
    411409        """ 
  • src/sas/qtgui/Perspectives/Fitting/FittingUtilities.py

    rcf9f39e rb38c8c8  
    729729    output_string = "sasview_parameter_values:" 
    730730    for parameter in parameters: 
     731        # recast tuples into strings 
     732        parameter = [str(p) for p in parameter] 
    731733        output_string += ",".join([p for p in parameter if p is not None]) 
    732734        output_string += ":" 
  • src/sas/qtgui/Perspectives/Fitting/FittingWidget.py

    r1d6899f rd4c9242  
    522522        self.cmdFit.setEnabled(False) 
    523523        self.cmdPlot.setEnabled(False) 
    524         self.options_widget.cmdComputePoints.setVisible(False) # probably redundant 
    525524        self.chkPolydispersity.setEnabled(True) 
    526525        self.chkPolydispersity.setCheckState(False) 
     
    28632862        self.createNewIndex(weighted_data) 
    28642863 
     2864        # Plot residuals if actual data 
     2865        if not self.data_is_loaded: 
     2866            return 
     2867 
    28652868        # Calculate difference between return_data and logic.data 
    28662869        self.chi2 = FittingUtilities.calculateChi2(weighted_data, self.data) 
     
    28682871        chi2_repr = "---" if self.chi2 is None else GuiUtils.formatNumber(self.chi2, high=True) 
    28692872        self.lblChi2Value.setText(chi2_repr) 
    2870  
    2871         # Plot residuals if actual data 
    2872         if not self.data_is_loaded: 
    2873             return 
    28742873 
    28752874        residuals_plot = FittingUtilities.plotResiduals(self.data, weighted_data) 
  • src/sas/qtgui/Perspectives/Fitting/OptionsWidget.py

    rb764ae5 r17e6a2b  
    8888        self.model.blockSignals(True) 
    8989        self.updateQRange(self.qmin, self.qmax, self.npts) 
    90         self.txtMaxRange.setText(str(self.qmax)) 
    91         self.txtMinRange.setText(str(self.qmin)) 
     90        self.txtMaxRange.setText(GuiUtils.formatNumber(self.qmax, high=True)) 
     91        self.txtMinRange.setText(GuiUtils.formatNumber(self.qmin, high=True)) 
    9292        self.txtNpts.setText(str(self.npts)) 
    9393        self.txtNptsFit.setText(str(self.npts)) 
     
    181181        Update the local model based on calculated values 
    182182        """ 
    183         self.model.item(MODEL.index('MIN_RANGE')).setText(str(q_range_min)) 
    184         self.model.item(MODEL.index('MAX_RANGE')).setText(str(q_range_max)) 
     183        qmax = GuiUtils.formatNumber(self.qmax, high=True) 
     184        qmin = GuiUtils.formatNumber(self.qmin, high=True) 
     185        self.model.item(MODEL.index('MIN_RANGE')).setText(qmin) 
     186        self.model.item(MODEL.index('MAX_RANGE')).setText(qmax) 
    185187        self.model.item(MODEL.index('NPTS')).setText(str(npts)) 
    186188        self.qmin, self.qmax, self.npts = q_range_min, q_range_max, npts 
  • src/sas/qtgui/Perspectives/Fitting/UI/OptionsWidgetUI.ui

    r309fa1b r17e6a2b  
    122122      <item row="0" column="0"> 
    123123       <layout class="QGridLayout" name="gridLayout_15"> 
    124         <item row="0" column="0"> 
    125          <widget class="QLabel" name="label_21"> 
    126           <property name="text"> 
    127            <string>Npts</string> 
    128           </property> 
    129          </widget> 
    130         </item> 
    131         <item row="0" column="1"> 
    132          <widget class="QLineEdit" name="txtNpts"> 
    133           <property name="toolTip"> 
    134            <string>&lt;html&gt;&lt;head/&gt;&lt;body&gt;&lt;p&gt;Total number of data points.&lt;/p&gt;&lt;/body&gt;&lt;/html&gt;</string> 
    135           </property> 
    136          </widget> 
    137         </item> 
    138         <item row="0" column="2"> 
    139          <widget class="QCheckBox" name="chkLogData"> 
    140           <property name="toolTip"> 
    141            <string>&lt;html&gt;&lt;head/&gt;&lt;body&gt;&lt;p&gt;Check to use log spaced points.&lt;/p&gt;&lt;/body&gt;&lt;/html&gt;</string> 
    142           </property> 
    143           <property name="text"> 
    144            <string>Log spaced points</string> 
    145           </property> 
    146          </widget> 
    147         </item> 
    148         <item row="1" column="0"> 
    149          <widget class="QLabel" name="label_22"> 
    150           <property name="text"> 
    151            <string>Npts(Fit)</string> 
    152           </property> 
    153          </widget> 
    154         </item> 
    155         <item row="1" column="1"> 
    156          <widget class="QLineEdit" name="txtNptsFit"> 
    157           <property name="toolTip"> 
    158            <string>&lt;html&gt;&lt;head/&gt;&lt;body&gt;&lt;p&gt;Number of points selected for fitting.&lt;/p&gt;&lt;/body&gt;&lt;/html&gt;</string> 
    159           </property> 
    160           <property name="readOnly"> 
    161            <bool>true</bool> 
    162           </property> 
    163          </widget> 
    164         </item> 
    165         <item row="2" column="0"> 
    166          <widget class="QLabel" name="label_24"> 
    167           <property name="text"> 
    168            <string>&lt;html&gt;&lt;head/&gt;&lt;body&gt;&lt;p&gt;χ&lt;span style=&quot; vertical-align:super;&quot;&gt;2&lt;/span&gt;/Npts&lt;/p&gt;&lt;/body&gt;&lt;/html&gt;</string> 
    169           </property> 
    170          </widget> 
    171         </item> 
    172         <item row="2" column="1"> 
    173          <widget class="QLineEdit" name="txtChi2"> 
    174           <property name="readOnly"> 
    175            <bool>true</bool> 
    176           </property> 
    177          </widget> 
    178         </item> 
    179         <item row="2" column="3"> 
    180          <widget class="QPushButton" name="cmdComputePoints"> 
    181           <property name="text"> 
    182            <string>Compute</string> 
    183           </property> 
    184          </widget> 
    185         </item> 
    186124        <item row="1" column="2"> 
    187125         <spacer name="horizontalSpacer_9"> 
     
    197135         </spacer> 
    198136        </item> 
     137        <item row="0" column="1"> 
     138         <widget class="QLineEdit" name="txtNpts"> 
     139          <property name="toolTip"> 
     140           <string>&lt;html&gt;&lt;head/&gt;&lt;body&gt;&lt;p&gt;Total number of data points.&lt;/p&gt;&lt;/body&gt;&lt;/html&gt;</string> 
     141          </property> 
     142         </widget> 
     143        </item> 
     144        <item row="1" column="0"> 
     145         <widget class="QLabel" name="label_22"> 
     146          <property name="text"> 
     147           <string>Npts(Fit)</string> 
     148          </property> 
     149         </widget> 
     150        </item> 
     151        <item row="1" column="1"> 
     152         <widget class="QLineEdit" name="txtNptsFit"> 
     153          <property name="toolTip"> 
     154           <string>&lt;html&gt;&lt;head/&gt;&lt;body&gt;&lt;p&gt;Number of points selected for fitting.&lt;/p&gt;&lt;/body&gt;&lt;/html&gt;</string> 
     155          </property> 
     156          <property name="readOnly"> 
     157           <bool>true</bool> 
     158          </property> 
     159         </widget> 
     160        </item> 
     161        <item row="0" column="2"> 
     162         <widget class="QCheckBox" name="chkLogData"> 
     163          <property name="toolTip"> 
     164           <string>&lt;html&gt;&lt;head/&gt;&lt;body&gt;&lt;p&gt;Check to use log spaced points.&lt;/p&gt;&lt;/body&gt;&lt;/html&gt;</string> 
     165          </property> 
     166          <property name="text"> 
     167           <string>Log spaced points</string> 
     168          </property> 
     169         </widget> 
     170        </item> 
     171        <item row="0" column="0"> 
     172         <widget class="QLabel" name="label_21"> 
     173          <property name="text"> 
     174           <string>Npts</string> 
     175          </property> 
     176         </widget> 
     177        </item> 
    199178       </layout> 
    200179      </item> 
  • src/sas/qtgui/Plotting/Plotter.py

    rd9e7792 r4c11b2a  
    420420        This effectlvely refreshes the chart with changes to one of its plots 
    421421        """ 
     422 
     423        # Pull the current transform settings from the old plot 
     424        selected_plot = self.plot_dict[id] 
     425        new_plot.xtransform = selected_plot.xtransform 
     426        new_plot.ytransform = selected_plot.ytransform 
     427 
    422428        self.removePlot(id) 
    423429        self.plot(data=new_plot) 
  • src/sas/qtgui/Perspectives/Corfunc/CorfuncPerspective.py

    rdee9e5f rf7e6b30  
    77from matplotlib.backends.backend_qt5agg import FigureCanvasQTAgg \ 
    88    as FigureCanvas 
     9from matplotlib.backends.backend_qt5agg import NavigationToolbar2QT 
    910from matplotlib.figure import Figure 
    1011from numpy.linalg.linalg import LinAlgError 
     
    3536        self.data = None 
    3637        self.extrap = None 
     38        self.setMinimumSize(300, 300) 
    3739 
    3840    def draw_q_space(self): 
     
    4951        self.axes.set_xscale("log") 
    5052        self.axes.set_yscale("log") 
     53        self.axes.set_xlabel("Q [$\AA^{-1}$]") 
     54        self.axes.set_ylabel("I(Q) [cm$^{-1}$]") 
     55        self.fig.tight_layout() 
    5156 
    5257        qmin = float(self.model.item(W.W_QMIN).text()) 
     
    6166            self.axes.set_xlim(min(self.data.x) / 2, 
    6267                               max(self.data.x) * 1.5 - 0.5 * min(self.data.x)) 
     68            self.axes.set_ylim(min(self.data.y) / 2, 
     69                               max(self.data.y) * 1.5 - 0.5 * min(self.data.y)) 
    6370        if self.extrap: 
    6471            self.axes.plot(self.extrap.x, self.extrap.y) 
     
    7885        self.axes.set_xscale("linear") 
    7986        self.axes.set_yscale("linear") 
     87        self.axes.set_xlabel("Z [$\AA$]") 
     88        self.axes.set_ylabel("Correlation") 
     89        self.fig.tight_layout() 
    8090 
    8191        if self.data: 
     
    8595            self.axes.plot(data_idf.x, data_idf.y, 
    8696                           label="Interface Distribution Function") 
    87             self.axes.set_xlim(min(data1.x), max(data1.x) / 4) 
     97            self.axes.set_xlim(0, max(data1.x) / 4) 
    8898            self.axes.legend() 
    8999 
     
    115125 
    116126        self._canvas = MyMplCanvas(self.model) 
    117         self.mainVerticalLayout.insertWidget(0, self._canvas) 
     127        self.plotLayout.insertWidget(0, self._canvas) 
     128        self.plotLayout.insertWidget(1, NavigationToolbar2QT(self._canvas, self)) 
     129        self._realplot = MyMplCanvas(self.model) 
     130        self.plotLayout.insertWidget(2, self._realplot) 
     131        self.plotLayout.insertWidget(3, NavigationToolbar2QT(self._realplot, self)) 
     132 
     133        self.gridLayout_8.setColumnStretch(0, 1) 
     134        self.gridLayout_8.setColumnStretch(1, 3) 
    118135 
    119136        # Connect buttons to slots. 
     
    238255        self.model.setItem(W.W_POLY, QtGui.QStandardItem("{:.3g}".format(params['A']))) 
    239256        self.model.setItem(W.W_PERIOD, QtGui.QStandardItem("{:.3g}".format(params['max']))) 
    240         #self._realplot.data = transforms 
     257        self._realplot.data = transforms 
    241258 
    242259        self.update_real_space_plot(transforms) 
    243260 
    244         #self._realplot.draw_real_space() 
     261        self._realplot.draw_real_space() 
    245262 
    246263    def update_real_space_plot(self, datas): 
     
    358375        self.cmdTransform.setEnabled(False) 
    359376 
    360         #self._realplot.data = None 
    361         #self._realplot.draw_real_space() 
     377        self._realplot.data = None 
     378        self._realplot.draw_real_space() 
    362379 
    363380    def setClosable(self, value=True): 
  • src/sas/qtgui/Perspectives/Corfunc/UI/CorfuncPanel.ui

    rcb4d219 rf6c3f01  
    322322          </item> 
    323323          <item row="0" column="1"> 
    324            <widget class="QLineEdit" name="txtLongPeriod"/> 
     324           <widget class="QLineEdit" name="txtLongPeriod" width="50"> 
     325             <property name="minimumSize" stdset="0"> 
     326               <size> 
     327                 <width>60</width> 
     328                 <height>20</height> 
     329               </size> 
     330             </property> 
     331           </widget> 
    325332          </item> 
    326333          <item row="0" column="2"> 
     
    332339          </item> 
    333340          <item row="0" column="3"> 
    334            <widget class="QLineEdit" name="txtAvgIntThick"/> 
     341           <widget class="QLineEdit" name="txtAvgIntThick"> 
     342             <property name="minimumSize" stdset="0"> 
     343               <size> 
     344                 <width>60</width> 
     345                 <height>20</height> 
     346               </size> 
     347             </property> 
     348           </widget> 
    335349          </item> 
    336350          <item row="1" column="0"> 
     
    419433    </layout> 
    420434   </item> 
     435   <item row="0" column="1"> 
     436    <layout class="QVBoxLayout" name="plotLayout"> 
     437    </layout> 
     438   </item> 
    421439  </layout> 
    422440 </widget> 
  • src/sas/sascalc/corfunc/transform_thread.py

    ra859f99 rf7e6b30  
    4545            # gamma3(R) = 1/R int_{0}^{R} gamma1(x) dx 
    4646            # trapz uses the trapezium rule to calculate the integral 
    47             mask = xs <= 200.0 # Only calculate gamma3 up to x=200 (as this is all that's plotted) 
    4847            # gamma3 = [trapz(gamma1[:n], xs[:n])/xs[n-1] for n in range(2, len(xs[mask]) + 1)]j 
    4948            # gamma3.insert(0, 1.0) # Gamma_3(0) is defined as 1 
    50             n = len(xs[mask]) 
     49            n = len(xs) 
    5150            gamma3 = cumtrapz(gamma1[:n], xs[:n])/xs[1:n] 
    5251            gamma3 = np.hstack((1.0, gamma3)) # Gamma_3(0) is defined as 1 
     
    7978 
    8079        transform1 = Data1D(xs, gamma1) 
    81         transform3 = Data1D(xs[xs <= 200], gamma3) 
     80        transform3 = Data1D(xs, gamma3) 
    8281        idf = Data1D(xs, idf) 
    8382 
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.