Changeset 3080527 in sasview for sansmodels/src/sans/models/c_models


Ignore:
Timestamp:
Mar 12, 2010 1:08:42 PM (15 years ago)
Author:
Jae Cho <jhjcho@…>
Branches:
master, ESS_GUI, ESS_GUI_Docs, ESS_GUI_batch_fitting, ESS_GUI_bumps_abstraction, ESS_GUI_iss1116, ESS_GUI_iss879, ESS_GUI_iss959, ESS_GUI_opencl, ESS_GUI_ordering, ESS_GUI_sync_sascalc, costrafo411, magnetic_scatt, release-4.1.1, release-4.1.2, release-4.2.2, release_4.0.1, ticket-1009, ticket-1094-headless, ticket-1242-2d-resolution, ticket-1243, ticket-1249, ticket885, unittest-saveload
Children:
e575db9
Parents:
7e99f5c
Message:

changed classtemplate for 2d evaluation from matrix form to 1d array form

Location:
sansmodels/src/sans/models/c_models
Files:
33 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed

  • sansmodels/src/sans/models/c_models/CBinaryHSModel.cpp

    r4cbaf35 r3080527  
    184184 { 
    185185    PyArrayObject *result; 
    186     int i,j, x_len, y_len, dims[2]; 
     186    int i,j, x_len, y_len, dims[1]; 
    187187    //check validity of input vectors 
    188     if (x->nd != 2 || x->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
    189         || y->nd != 2 || y->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
    190         || y->dimensions[1] != x->dimensions[0]){ 
     188    if (x->nd != 1 || x->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
     189        || y->nd != 1 || y->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
     190        || y->dimensions[0] != x->dimensions[0]){ 
    191191        const char * message= "evaluateTwoDimXY  expect 2 numpy arrays"; 
    192192        PyErr_SetString(PyExc_ValueError , message);  
    … …  
    196196        if (PyArray_Check(x) && PyArray_Check(y)) { 
    197197                 
    198             x_len = dims[1]= x->dimensions[1]; 
     198            x_len = dims[0]= x->dimensions[0]; 
    199199        y_len = dims[0]= y->dimensions[0]; 
    200200             
    201201            // Make a new double matrix of same dims 
    202         result=(PyArrayObject *) PyArray_FromDims(2,dims,NPY_DOUBLE); 
     202        result=(PyArrayObject *) PyArray_FromDims(1,dims,NPY_DOUBLE); 
    203203        if (result == NULL){ 
    204204            const char * message= "Could not create result "; 
    … …  
    208208        
    209209        /* Do the calculation. */ 
    210         for ( j=0; j< y_len; j++) { 
    211             for ( i=0; i< x_len; i++) { 
    212                 double x_value = *(double *)(x->data + i*x->strides[1]); 
    213                     double y_value = *(double *)(y->data + j*y->strides[0]); 
    214                         double *result_value = (double *)(result->data + 
    215                               j*result->strides[0] + i*result->strides[1]); 
    216                         *result_value = (*model)(x_value, y_value); 
    217             }            
    218         } 
     210        for ( i=0; i< x_len; i++) { 
     211            double x_value = *(double *)(x->data + i*x->strides[0]); 
     212                    double y_value = *(double *)(y->data + i*y->strides[0]); 
     213                        double *result_value = (double *)(result->data + 
     214                              i*result->strides[0]); 
     215                        *result_value = (*model)(x_value, y_value); 
     216        }            
    219217        return PyArray_Return(result);  
    220218         

  • sansmodels/src/sans/models/c_models/CBinaryHSPSF11Model.cpp

    r71e2de7 r3080527  
    184184 { 
    185185    PyArrayObject *result; 
    186     int i,j, x_len, y_len, dims[2]; 
     186    int i,j, x_len, y_len, dims[1]; 
    187187    //check validity of input vectors 
    188     if (x->nd != 2 || x->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
    189         || y->nd != 2 || y->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
    190         || y->dimensions[1] != x->dimensions[0]){ 
     188    if (x->nd != 1 || x->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
     189        || y->nd != 1 || y->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
     190        || y->dimensions[0] != x->dimensions[0]){ 
    191191        const char * message= "evaluateTwoDimXY  expect 2 numpy arrays"; 
    192192        PyErr_SetString(PyExc_ValueError , message);  
    … …  
    196196        if (PyArray_Check(x) && PyArray_Check(y)) { 
    197197                 
    198             x_len = dims[1]= x->dimensions[1]; 
     198            x_len = dims[0]= x->dimensions[0]; 
    199199        y_len = dims[0]= y->dimensions[0]; 
    200200             
    201201            // Make a new double matrix of same dims 
    202         result=(PyArrayObject *) PyArray_FromDims(2,dims,NPY_DOUBLE); 
     202        result=(PyArrayObject *) PyArray_FromDims(1,dims,NPY_DOUBLE); 
    203203        if (result == NULL){ 
    204204            const char * message= "Could not create result "; 
    … …  
    208208        
    209209        /* Do the calculation. */ 
    210         for ( j=0; j< y_len; j++) { 
    211             for ( i=0; i< x_len; i++) { 
    212                 double x_value = *(double *)(x->data + i*x->strides[1]); 
    213                     double y_value = *(double *)(y->data + j*y->strides[0]); 
    214                         double *result_value = (double *)(result->data + 
    215                               j*result->strides[0] + i*result->strides[1]); 
    216                         *result_value = (*model)(x_value, y_value); 
    217             }            
    218         } 
     210        for ( i=0; i< x_len; i++) { 
     211            double x_value = *(double *)(x->data + i*x->strides[0]); 
     212                    double y_value = *(double *)(y->data + i*y->strides[0]); 
     213                        double *result_value = (double *)(result->data + 
     214                              i*result->strides[0]); 
     215                        *result_value = (*model)(x_value, y_value); 
     216        }            
    219217        return PyArray_Return(result);  
    220218         

  • sansmodels/src/sans/models/c_models/CCoreShellCylinderModel.cpp

    r71e2de7 r3080527  
    195195 { 
    196196    PyArrayObject *result; 
    197     int i,j, x_len, y_len, dims[2]; 
     197    int i,j, x_len, y_len, dims[1]; 
    198198    //check validity of input vectors 
    199     if (x->nd != 2 || x->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
    200         || y->nd != 2 || y->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
    201         || y->dimensions[1] != x->dimensions[0]){ 
     199    if (x->nd != 1 || x->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
     200        || y->nd != 1 || y->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
     201        || y->dimensions[0] != x->dimensions[0]){ 
    202202        const char * message= "evaluateTwoDimXY  expect 2 numpy arrays"; 
    203203        PyErr_SetString(PyExc_ValueError , message);  
    … …  
    207207        if (PyArray_Check(x) && PyArray_Check(y)) { 
    208208                 
    209             x_len = dims[1]= x->dimensions[1]; 
     209            x_len = dims[0]= x->dimensions[0]; 
    210210        y_len = dims[0]= y->dimensions[0]; 
    211211             
    212212            // Make a new double matrix of same dims 
    213         result=(PyArrayObject *) PyArray_FromDims(2,dims,NPY_DOUBLE); 
     213        result=(PyArrayObject *) PyArray_FromDims(1,dims,NPY_DOUBLE); 
    214214        if (result == NULL){ 
    215215            const char * message= "Could not create result "; 
    … …  
    219219        
    220220        /* Do the calculation. */ 
    221         for ( j=0; j< y_len; j++) { 
    222             for ( i=0; i< x_len; i++) { 
    223                 double x_value = *(double *)(x->data + i*x->strides[1]); 
    224                     double y_value = *(double *)(y->data + j*y->strides[0]); 
    225                         double *result_value = (double *)(result->data + 
    226                               j*result->strides[0] + i*result->strides[1]); 
    227                         *result_value = (*model)(x_value, y_value); 
    228             }            
    229         } 
     221        for ( i=0; i< x_len; i++) { 
     222            double x_value = *(double *)(x->data + i*x->strides[0]); 
     223                    double y_value = *(double *)(y->data + i*y->strides[0]); 
     224                        double *result_value = (double *)(result->data + 
     225                              i*result->strides[0]); 
     226                        *result_value = (*model)(x_value, y_value); 
     227        }            
    230228        return PyArray_Return(result);  
    231229         

  • sansmodels/src/sans/models/c_models/CCoreShellEllipsoidModel.cpp

    r71e2de7 r3080527  
    198198 { 
    199199    PyArrayObject *result; 
    200     int i,j, x_len, y_len, dims[2]; 
     200    int i,j, x_len, y_len, dims[1]; 
    201201    //check validity of input vectors 
    202     if (x->nd != 2 || x->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
    203         || y->nd != 2 || y->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
    204         || y->dimensions[1] != x->dimensions[0]){ 
     202    if (x->nd != 1 || x->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
     203        || y->nd != 1 || y->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
     204        || y->dimensions[0] != x->dimensions[0]){ 
    205205        const char * message= "evaluateTwoDimXY  expect 2 numpy arrays"; 
    206206        PyErr_SetString(PyExc_ValueError , message);  
    … …  
    210210        if (PyArray_Check(x) && PyArray_Check(y)) { 
    211211                 
    212             x_len = dims[1]= x->dimensions[1]; 
     212            x_len = dims[0]= x->dimensions[0]; 
    213213        y_len = dims[0]= y->dimensions[0]; 
    214214             
    215215            // Make a new double matrix of same dims 
    216         result=(PyArrayObject *) PyArray_FromDims(2,dims,NPY_DOUBLE); 
     216        result=(PyArrayObject *) PyArray_FromDims(1,dims,NPY_DOUBLE); 
    217217        if (result == NULL){ 
    218218            const char * message= "Could not create result "; 
    … …  
    222222        
    223223        /* Do the calculation. */ 
    224         for ( j=0; j< y_len; j++) { 
    225             for ( i=0; i< x_len; i++) { 
    226                 double x_value = *(double *)(x->data + i*x->strides[1]); 
    227                     double y_value = *(double *)(y->data + j*y->strides[0]); 
    228                         double *result_value = (double *)(result->data + 
    229                               j*result->strides[0] + i*result->strides[1]); 
    230                         *result_value = (*model)(x_value, y_value); 
    231             }            
    232         } 
     224        for ( i=0; i< x_len; i++) { 
     225            double x_value = *(double *)(x->data + i*x->strides[0]); 
     226                    double y_value = *(double *)(y->data + i*y->strides[0]); 
     227                        double *result_value = (double *)(result->data + 
     228                              i*result->strides[0]); 
     229                        *result_value = (*model)(x_value, y_value); 
     230        }            
    233231        return PyArray_Return(result);  
    234232         

  • sansmodels/src/sans/models/c_models/CCoreShellModel.cpp

    r71e2de7 r3080527  
    183183 { 
    184184    PyArrayObject *result; 
    185     int i,j, x_len, y_len, dims[2]; 
     185    int i,j, x_len, y_len, dims[1]; 
    186186    //check validity of input vectors 
    187     if (x->nd != 2 || x->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
    188         || y->nd != 2 || y->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
    189         || y->dimensions[1] != x->dimensions[0]){ 
     187    if (x->nd != 1 || x->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
     188        || y->nd != 1 || y->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
     189        || y->dimensions[0] != x->dimensions[0]){ 
    190190        const char * message= "evaluateTwoDimXY  expect 2 numpy arrays"; 
    191191        PyErr_SetString(PyExc_ValueError , message);  
    … …  
    195195        if (PyArray_Check(x) && PyArray_Check(y)) { 
    196196                 
    197             x_len = dims[1]= x->dimensions[1]; 
     197            x_len = dims[0]= x->dimensions[0]; 
    198198        y_len = dims[0]= y->dimensions[0]; 
    199199             
    200200            // Make a new double matrix of same dims 
    201         result=(PyArrayObject *) PyArray_FromDims(2,dims,NPY_DOUBLE); 
     201        result=(PyArrayObject *) PyArray_FromDims(1,dims,NPY_DOUBLE); 
    202202        if (result == NULL){ 
    203203            const char * message= "Could not create result "; 
    … …  
    207207        
    208208        /* Do the calculation. */ 
    209         for ( j=0; j< y_len; j++) { 
    210             for ( i=0; i< x_len; i++) { 
    211                 double x_value = *(double *)(x->data + i*x->strides[1]); 
    212                     double y_value = *(double *)(y->data + j*y->strides[0]); 
    213                         double *result_value = (double *)(result->data + 
    214                               j*result->strides[0] + i*result->strides[1]); 
    215                         *result_value = (*model)(x_value, y_value); 
    216             }            
    217         } 
     209        for ( i=0; i< x_len; i++) { 
     210            double x_value = *(double *)(x->data + i*x->strides[0]); 
     211                    double y_value = *(double *)(y->data + i*y->strides[0]); 
     212                        double *result_value = (double *)(result->data + 
     213                              i*result->strides[0]); 
     214                        *result_value = (*model)(x_value, y_value); 
     215        }            
    218216        return PyArray_Return(result);  
    219217         

  • sansmodels/src/sans/models/c_models/CCylinderModel.cpp

    r71e2de7 r3080527  
    189189 { 
    190190    PyArrayObject *result; 
    191     int i,j, x_len, y_len, dims[2]; 
     191    int i,j, x_len, y_len, dims[1]; 
    192192    //check validity of input vectors 
    193     if (x->nd != 2 || x->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
    194         || y->nd != 2 || y->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
    195         || y->dimensions[1] != x->dimensions[0]){ 
     193    if (x->nd != 1 || x->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
     194        || y->nd != 1 || y->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
     195        || y->dimensions[0] != x->dimensions[0]){ 
    196196        const char * message= "evaluateTwoDimXY  expect 2 numpy arrays"; 
    197197        PyErr_SetString(PyExc_ValueError , message);  
    … …  
    201201        if (PyArray_Check(x) && PyArray_Check(y)) { 
    202202                 
    203             x_len = dims[1]= x->dimensions[1]; 
     203            x_len = dims[0]= x->dimensions[0]; 
    204204        y_len = dims[0]= y->dimensions[0]; 
    205205             
    206206            // Make a new double matrix of same dims 
    207         result=(PyArrayObject *) PyArray_FromDims(2,dims,NPY_DOUBLE); 
     207        result=(PyArrayObject *) PyArray_FromDims(1,dims,NPY_DOUBLE); 
    208208        if (result == NULL){ 
    209209            const char * message= "Could not create result "; 
    … …  
    213213        
    214214        /* Do the calculation. */ 
    215         for ( j=0; j< y_len; j++) { 
    216             for ( i=0; i< x_len; i++) { 
    217                 double x_value = *(double *)(x->data + i*x->strides[1]); 
    218                     double y_value = *(double *)(y->data + j*y->strides[0]); 
    219                         double *result_value = (double *)(result->data + 
    220                               j*result->strides[0] + i*result->strides[1]); 
    221                         *result_value = (*model)(x_value, y_value); 
    222             }            
    223         } 
     215        for ( i=0; i< x_len; i++) { 
     216            double x_value = *(double *)(x->data + i*x->strides[0]); 
     217                    double y_value = *(double *)(y->data + i*y->strides[0]); 
     218                        double *result_value = (double *)(result->data + 
     219                              i*result->strides[0]); 
     220                        *result_value = (*model)(x_value, y_value); 
     221        }            
    224222        return PyArray_Return(result);  
    225223         

  • sansmodels/src/sans/models/c_models/CDiamCylFunc.cpp

    r71e2de7 r3080527  
    178178 { 
    179179    PyArrayObject *result; 
    180     int i,j, x_len, y_len, dims[2]; 
     180    int i,j, x_len, y_len, dims[1]; 
    181181    //check validity of input vectors 
    182     if (x->nd != 2 || x->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
    183         || y->nd != 2 || y->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
    184         || y->dimensions[1] != x->dimensions[0]){ 
     182    if (x->nd != 1 || x->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
     183        || y->nd != 1 || y->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
     184        || y->dimensions[0] != x->dimensions[0]){ 
    185185        const char * message= "evaluateTwoDimXY  expect 2 numpy arrays"; 
    186186        PyErr_SetString(PyExc_ValueError , message);  
    … …  
    190190        if (PyArray_Check(x) && PyArray_Check(y)) { 
    191191                 
    192             x_len = dims[1]= x->dimensions[1]; 
     192            x_len = dims[0]= x->dimensions[0]; 
    193193        y_len = dims[0]= y->dimensions[0]; 
    194194             
    195195            // Make a new double matrix of same dims 
    196         result=(PyArrayObject *) PyArray_FromDims(2,dims,NPY_DOUBLE); 
     196        result=(PyArrayObject *) PyArray_FromDims(1,dims,NPY_DOUBLE); 
    197197        if (result == NULL){ 
    198198            const char * message= "Could not create result "; 
    … …  
    202202        
    203203        /* Do the calculation. */ 
    204         for ( j=0; j< y_len; j++) { 
    205             for ( i=0; i< x_len; i++) { 
    206                 double x_value = *(double *)(x->data + i*x->strides[1]); 
    207                     double y_value = *(double *)(y->data + j*y->strides[0]); 
    208                         double *result_value = (double *)(result->data + 
    209                               j*result->strides[0] + i*result->strides[1]); 
    210                         *result_value = (*model)(x_value, y_value); 
    211             }            
    212         } 
     204        for ( i=0; i< x_len; i++) { 
     205            double x_value = *(double *)(x->data + i*x->strides[0]); 
     206                    double y_value = *(double *)(y->data + i*y->strides[0]); 
     207                        double *result_value = (double *)(result->data + 
     208                              i*result->strides[0]); 
     209                        *result_value = (*model)(x_value, y_value); 
     210        }            
    213211        return PyArray_Return(result);  
    214212         

  • sansmodels/src/sans/models/c_models/CDiamEllipFunc.cpp

    r71e2de7 r3080527  
    178178 { 
    179179    PyArrayObject *result; 
    180     int i,j, x_len, y_len, dims[2]; 
     180    int i,j, x_len, y_len, dims[1]; 
    181181    //check validity of input vectors 
    182     if (x->nd != 2 || x->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
    183         || y->nd != 2 || y->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
    184         || y->dimensions[1] != x->dimensions[0]){ 
     182    if (x->nd != 1 || x->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
     183        || y->nd != 1 || y->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
     184        || y->dimensions[0] != x->dimensions[0]){ 
    185185        const char * message= "evaluateTwoDimXY  expect 2 numpy arrays"; 
    186186        PyErr_SetString(PyExc_ValueError , message);  
    … …  
    190190        if (PyArray_Check(x) && PyArray_Check(y)) { 
    191191                 
    192             x_len = dims[1]= x->dimensions[1]; 
     192            x_len = dims[0]= x->dimensions[0]; 
    193193        y_len = dims[0]= y->dimensions[0]; 
    194194             
    195195            // Make a new double matrix of same dims 
    196         result=(PyArrayObject *) PyArray_FromDims(2,dims,NPY_DOUBLE); 
     196        result=(PyArrayObject *) PyArray_FromDims(1,dims,NPY_DOUBLE); 
    197197        if (result == NULL){ 
    198198            const char * message= "Could not create result "; 
    … …  
    202202        
    203203        /* Do the calculation. */ 
    204         for ( j=0; j< y_len; j++) { 
    205             for ( i=0; i< x_len; i++) { 
    206                 double x_value = *(double *)(x->data + i*x->strides[1]); 
    207                     double y_value = *(double *)(y->data + j*y->strides[0]); 
    208                         double *result_value = (double *)(result->data + 
    209                               j*result->strides[0] + i*result->strides[1]); 
    210                         *result_value = (*model)(x_value, y_value); 
    211             }            
    212         } 
     204        for ( i=0; i< x_len; i++) { 
     205            double x_value = *(double *)(x->data + i*x->strides[0]); 
     206                    double y_value = *(double *)(y->data + i*y->strides[0]); 
     207                        double *result_value = (double *)(result->data + 
     208                              i*result->strides[0]); 
     209                        *result_value = (*model)(x_value, y_value); 
     210        }            
    213211        return PyArray_Return(result);  
    214212         

  • sansmodels/src/sans/models/c_models/CEllipsoidModel.cpp

    r71e2de7 r3080527  
    189189 { 
    190190    PyArrayObject *result; 
    191     int i,j, x_len, y_len, dims[2]; 
     191    int i,j, x_len, y_len, dims[1]; 
    192192    //check validity of input vectors 
    193     if (x->nd != 2 || x->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
    194         || y->nd != 2 || y->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
    195         || y->dimensions[1] != x->dimensions[0]){ 
     193    if (x->nd != 1 || x->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
     194        || y->nd != 1 || y->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
     195        || y->dimensions[0] != x->dimensions[0]){ 
    196196        const char * message= "evaluateTwoDimXY  expect 2 numpy arrays"; 
    197197        PyErr_SetString(PyExc_ValueError , message);  
    … …  
    201201        if (PyArray_Check(x) && PyArray_Check(y)) { 
    202202                 
    203             x_len = dims[1]= x->dimensions[1]; 
     203            x_len = dims[0]= x->dimensions[0]; 
    204204        y_len = dims[0]= y->dimensions[0]; 
    205205             
    206206            // Make a new double matrix of same dims 
    207         result=(PyArrayObject *) PyArray_FromDims(2,dims,NPY_DOUBLE); 
     207        result=(PyArrayObject *) PyArray_FromDims(1,dims,NPY_DOUBLE); 
    208208        if (result == NULL){ 
    209209            const char * message= "Could not create result "; 
    … …  
    213213        
    214214        /* Do the calculation. */ 
    215         for ( j=0; j< y_len; j++) { 
    216             for ( i=0; i< x_len; i++) { 
    217                 double x_value = *(double *)(x->data + i*x->strides[1]); 
    218                     double y_value = *(double *)(y->data + j*y->strides[0]); 
    219                         double *result_value = (double *)(result->data + 
    220                               j*result->strides[0] + i*result->strides[1]); 
    221                         *result_value = (*model)(x_value, y_value); 
    222             }            
    223         } 
     215        for ( i=0; i< x_len; i++) { 
     216            double x_value = *(double *)(x->data + i*x->strides[0]); 
     217                    double y_value = *(double *)(y->data + i*y->strides[0]); 
     218                        double *result_value = (double *)(result->data + 
     219                              i*result->strides[0]); 
     220                        *result_value = (*model)(x_value, y_value); 
     221        }            
    224222        return PyArray_Return(result);  
    225223         

  • sansmodels/src/sans/models/c_models/CEllipticalCylinderModel.cpp

    r71e2de7 r3080527  
    197197 { 
    198198    PyArrayObject *result; 
    199     int i,j, x_len, y_len, dims[2]; 
     199    int i,j, x_len, y_len, dims[1]; 
    200200    //check validity of input vectors 
    201     if (x->nd != 2 || x->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
    202         || y->nd != 2 || y->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
    203         || y->dimensions[1] != x->dimensions[0]){ 
     201    if (x->nd != 1 || x->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
     202        || y->nd != 1 || y->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
     203        || y->dimensions[0] != x->dimensions[0]){ 
    204204        const char * message= "evaluateTwoDimXY  expect 2 numpy arrays"; 
    205205        PyErr_SetString(PyExc_ValueError , message);  
    … …  
    209209        if (PyArray_Check(x) && PyArray_Check(y)) { 
    210210                 
    211             x_len = dims[1]= x->dimensions[1]; 
     211            x_len = dims[0]= x->dimensions[0]; 
    212212        y_len = dims[0]= y->dimensions[0]; 
    213213             
    214214            // Make a new double matrix of same dims 
    215         result=(PyArrayObject *) PyArray_FromDims(2,dims,NPY_DOUBLE); 
     215        result=(PyArrayObject *) PyArray_FromDims(1,dims,NPY_DOUBLE); 
    216216        if (result == NULL){ 
    217217            const char * message= "Could not create result "; 
    … …  
    221221        
    222222        /* Do the calculation. */ 
    223         for ( j=0; j< y_len; j++) { 
    224             for ( i=0; i< x_len; i++) { 
    225                 double x_value = *(double *)(x->data + i*x->strides[1]); 
    226                     double y_value = *(double *)(y->data + j*y->strides[0]); 
    227                         double *result_value = (double *)(result->data + 
    228                               j*result->strides[0] + i*result->strides[1]); 
    229                         *result_value = (*model)(x_value, y_value); 
    230             }            
    231         } 
     223        for ( i=0; i< x_len; i++) { 
     224            double x_value = *(double *)(x->data + i*x->strides[0]); 
     225                    double y_value = *(double *)(y->data + i*y->strides[0]); 
     226                        double *result_value = (double *)(result->data + 
     227                              i*result->strides[0]); 
     228                        *result_value = (*model)(x_value, y_value); 
     229        }            
    232230        return PyArray_Return(result);  
    233231         

  • sansmodels/src/sans/models/c_models/CFlexibleCylinderModel.cpp

    r71e2de7 r3080527  
    185185 { 
    186186    PyArrayObject *result; 
    187     int i,j, x_len, y_len, dims[2]; 
     187    int i,j, x_len, y_len, dims[1]; 
    188188    //check validity of input vectors 
    189     if (x->nd != 2 || x->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
    190         || y->nd != 2 || y->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
    191         || y->dimensions[1] != x->dimensions[0]){ 
     189    if (x->nd != 1 || x->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
     190        || y->nd != 1 || y->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
     191        || y->dimensions[0] != x->dimensions[0]){ 
    192192        const char * message= "evaluateTwoDimXY  expect 2 numpy arrays"; 
    193193        PyErr_SetString(PyExc_ValueError , message);  
    … …  
    197197        if (PyArray_Check(x) && PyArray_Check(y)) { 
    198198                 
    199             x_len = dims[1]= x->dimensions[1]; 
     199            x_len = dims[0]= x->dimensions[0]; 
    200200        y_len = dims[0]= y->dimensions[0]; 
    201201             
    202202            // Make a new double matrix of same dims 
    203         result=(PyArrayObject *) PyArray_FromDims(2,dims,NPY_DOUBLE); 
     203        result=(PyArrayObject *) PyArray_FromDims(1,dims,NPY_DOUBLE); 
    204204        if (result == NULL){ 
    205205            const char * message= "Could not create result "; 
    … …  
    209209        
    210210        /* Do the calculation. */ 
    211         for ( j=0; j< y_len; j++) { 
    212             for ( i=0; i< x_len; i++) { 
    213                 double x_value = *(double *)(x->data + i*x->strides[1]); 
    214                     double y_value = *(double *)(y->data + j*y->strides[0]); 
    215                         double *result_value = (double *)(result->data + 
    216                               j*result->strides[0] + i*result->strides[1]); 
    217                         *result_value = (*model)(x_value, y_value); 
    218             }            
    219         } 
     211        for ( i=0; i< x_len; i++) { 
     212            double x_value = *(double *)(x->data + i*x->strides[0]); 
     213                    double y_value = *(double *)(y->data + i*y->strides[0]); 
     214                        double *result_value = (double *)(result->data + 
     215                              i*result->strides[0]); 
     216                        *result_value = (*model)(x_value, y_value); 
     217        }            
    220218        return PyArray_Return(result);  
    221219         

  • sansmodels/src/sans/models/c_models/CGaussian.cpp

    r71e2de7 r3080527  
    173173 { 
    174174    PyArrayObject *result; 
    175     int i,j, x_len, y_len, dims[2]; 
     175    int i,j, x_len, y_len, dims[1]; 
    176176    //check validity of input vectors 
    177     if (x->nd != 2 || x->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
    178         || y->nd != 2 || y->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
    179         || y->dimensions[1] != x->dimensions[0]){ 
     177    if (x->nd != 1 || x->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
     178        || y->nd != 1 || y->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
     179        || y->dimensions[0] != x->dimensions[0]){ 
    180180        const char * message= "evaluateTwoDimXY  expect 2 numpy arrays"; 
    181181        PyErr_SetString(PyExc_ValueError , message);  
    … …  
    185185        if (PyArray_Check(x) && PyArray_Check(y)) { 
    186186                 
    187             x_len = dims[1]= x->dimensions[1]; 
     187            x_len = dims[0]= x->dimensions[0]; 
    188188        y_len = dims[0]= y->dimensions[0]; 
    189189             
    190190            // Make a new double matrix of same dims 
    191         result=(PyArrayObject *) PyArray_FromDims(2,dims,NPY_DOUBLE); 
     191        result=(PyArrayObject *) PyArray_FromDims(1,dims,NPY_DOUBLE); 
    192192        if (result == NULL){ 
    193193            const char * message= "Could not create result "; 
    … …  
    197197        
    198198        /* Do the calculation. */ 
    199         for ( j=0; j< y_len; j++) { 
    200             for ( i=0; i< x_len; i++) { 
    201                 double x_value = *(double *)(x->data + i*x->strides[1]); 
    202                     double y_value = *(double *)(y->data + j*y->strides[0]); 
    203                         double *result_value = (double *)(result->data + 
    204                               j*result->strides[0] + i*result->strides[1]); 
    205                         *result_value = (*model)(x_value, y_value); 
    206             }            
    207         } 
     199        for ( i=0; i< x_len; i++) { 
     200            double x_value = *(double *)(x->data + i*x->strides[0]); 
     201                    double y_value = *(double *)(y->data + i*y->strides[0]); 
     202                        double *result_value = (double *)(result->data + 
     203                              i*result->strides[0]); 
     204                        *result_value = (*model)(x_value, y_value); 
     205        }            
    208206        return PyArray_Return(result);  
    209207         

  • sansmodels/src/sans/models/c_models/CHardsphereStructure.cpp

    r71e2de7 r3080527  
    175175 { 
    176176    PyArrayObject *result; 
    177     int i,j, x_len, y_len, dims[2]; 
     177    int i,j, x_len, y_len, dims[1]; 
    178178    //check validity of input vectors 
    179     if (x->nd != 2 || x->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
    180         || y->nd != 2 || y->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
    181         || y->dimensions[1] != x->dimensions[0]){ 
     179    if (x->nd != 1 || x->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
     180        || y->nd != 1 || y->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
     181        || y->dimensions[0] != x->dimensions[0]){ 
    182182        const char * message= "evaluateTwoDimXY  expect 2 numpy arrays"; 
    183183        PyErr_SetString(PyExc_ValueError , message);  
    … …  
    187187        if (PyArray_Check(x) && PyArray_Check(y)) { 
    188188                 
    189             x_len = dims[1]= x->dimensions[1]; 
     189            x_len = dims[0]= x->dimensions[0]; 
    190190        y_len = dims[0]= y->dimensions[0]; 
    191191             
    192192            // Make a new double matrix of same dims 
    193         result=(PyArrayObject *) PyArray_FromDims(2,dims,NPY_DOUBLE); 
     193        result=(PyArrayObject *) PyArray_FromDims(1,dims,NPY_DOUBLE); 
    194194        if (result == NULL){ 
    195195            const char * message= "Could not create result "; 
    … …  
    199199        
    200200        /* Do the calculation. */ 
    201         for ( j=0; j< y_len; j++) { 
    202             for ( i=0; i< x_len; i++) { 
    203                 double x_value = *(double *)(x->data + i*x->strides[1]); 
    204                     double y_value = *(double *)(y->data + j*y->strides[0]); 
    205                         double *result_value = (double *)(result->data + 
    206                               j*result->strides[0] + i*result->strides[1]); 
    207                         *result_value = (*model)(x_value, y_value); 
    208             }            
    209         } 
     201        for ( i=0; i< x_len; i++) { 
     202            double x_value = *(double *)(x->data + i*x->strides[0]); 
     203                    double y_value = *(double *)(y->data + i*y->strides[0]); 
     204                        double *result_value = (double *)(result->data + 
     205                              i*result->strides[0]); 
     206                        *result_value = (*model)(x_value, y_value); 
     207        }            
    210208        return PyArray_Return(result);  
    211209         

  • sansmodels/src/sans/models/c_models/CHayterMSAStructure.cpp

    r71e2de7 r3080527  
    179179 { 
    180180    PyArrayObject *result; 
    181     int i,j, x_len, y_len, dims[2]; 
     181    int i,j, x_len, y_len, dims[1]; 
    182182    //check validity of input vectors 
    183     if (x->nd != 2 || x->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
    184         || y->nd != 2 || y->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
    185         || y->dimensions[1] != x->dimensions[0]){ 
     183    if (x->nd != 1 || x->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
     184        || y->nd != 1 || y->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
     185        || y->dimensions[0] != x->dimensions[0]){ 
    186186        const char * message= "evaluateTwoDimXY  expect 2 numpy arrays"; 
    187187        PyErr_SetString(PyExc_ValueError , message);  
    … …  
    191191        if (PyArray_Check(x) && PyArray_Check(y)) { 
    192192                 
    193             x_len = dims[1]= x->dimensions[1]; 
     193            x_len = dims[0]= x->dimensions[0]; 
    194194        y_len = dims[0]= y->dimensions[0]; 
    195195             
    196196            // Make a new double matrix of same dims 
    197         result=(PyArrayObject *) PyArray_FromDims(2,dims,NPY_DOUBLE); 
     197        result=(PyArrayObject *) PyArray_FromDims(1,dims,NPY_DOUBLE); 
    198198        if (result == NULL){ 
    199199            const char * message= "Could not create result "; 
    … …  
    203203        
    204204        /* Do the calculation. */ 
    205         for ( j=0; j< y_len; j++) { 
    206             for ( i=0; i< x_len; i++) { 
    207                 double x_value = *(double *)(x->data + i*x->strides[1]); 
    208                     double y_value = *(double *)(y->data + j*y->strides[0]); 
    209                         double *result_value = (double *)(result->data + 
    210                               j*result->strides[0] + i*result->strides[1]); 
    211                         *result_value = (*model)(x_value, y_value); 
    212             }            
    213         } 
     205        for ( i=0; i< x_len; i++) { 
     206            double x_value = *(double *)(x->data + i*x->strides[0]); 
     207                    double y_value = *(double *)(y->data + i*y->strides[0]); 
     208                        double *result_value = (double *)(result->data + 
     209                              i*result->strides[0]); 
     210                        *result_value = (*model)(x_value, y_value); 
     211        }            
    214212        return PyArray_Return(result);  
    215213         

  • sansmodels/src/sans/models/c_models/CHollowCylinderModel.cpp

    r71e2de7 r3080527  
    193193 { 
    194194    PyArrayObject *result; 
    195     int i,j, x_len, y_len, dims[2]; 
     195    int i,j, x_len, y_len, dims[1]; 
    196196    //check validity of input vectors 
    197     if (x->nd != 2 || x->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
    198         || y->nd != 2 || y->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
    199         || y->dimensions[1] != x->dimensions[0]){ 
     197    if (x->nd != 1 || x->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
     198        || y->nd != 1 || y->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
     199        || y->dimensions[0] != x->dimensions[0]){ 
    200200        const char * message= "evaluateTwoDimXY  expect 2 numpy arrays"; 
    201201        PyErr_SetString(PyExc_ValueError , message);  
    … …  
    205205        if (PyArray_Check(x) && PyArray_Check(y)) { 
    206206                 
    207             x_len = dims[1]= x->dimensions[1]; 
     207            x_len = dims[0]= x->dimensions[0]; 
    208208        y_len = dims[0]= y->dimensions[0]; 
    209209             
    210210            // Make a new double matrix of same dims 
    211         result=(PyArrayObject *) PyArray_FromDims(2,dims,NPY_DOUBLE); 
     211        result=(PyArrayObject *) PyArray_FromDims(1,dims,NPY_DOUBLE); 
    212212        if (result == NULL){ 
    213213            const char * message= "Could not create result "; 
    … …  
    217217        
    218218        /* Do the calculation. */ 
    219         for ( j=0; j< y_len; j++) { 
    220             for ( i=0; i< x_len; i++) { 
    221                 double x_value = *(double *)(x->data + i*x->strides[1]); 
    222                     double y_value = *(double *)(y->data + j*y->strides[0]); 
    223                         double *result_value = (double *)(result->data + 
    224                               j*result->strides[0] + i*result->strides[1]); 
    225                         *result_value = (*model)(x_value, y_value); 
    226             }            
    227         } 
     219        for ( i=0; i< x_len; i++) { 
     220            double x_value = *(double *)(x->data + i*x->strides[0]); 
     221                    double y_value = *(double *)(y->data + i*y->strides[0]); 
     222                        double *result_value = (double *)(result->data + 
     223                              i*result->strides[0]); 
     224                        *result_value = (*model)(x_value, y_value); 
     225        }            
    228226        return PyArray_Return(result);  
    229227         

  • sansmodels/src/sans/models/c_models/CLamellarFFHGModel.cpp

    r71e2de7 r3080527  
    183183 { 
    184184    PyArrayObject *result; 
    185     int i,j, x_len, y_len, dims[2]; 
     185    int i,j, x_len, y_len, dims[1]; 
    186186    //check validity of input vectors 
    187     if (x->nd != 2 || x->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
    188         || y->nd != 2 || y->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
    189         || y->dimensions[1] != x->dimensions[0]){ 
     187    if (x->nd != 1 || x->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
     188        || y->nd != 1 || y->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
     189        || y->dimensions[0] != x->dimensions[0]){ 
    190190        const char * message= "evaluateTwoDimXY  expect 2 numpy arrays"; 
    191191        PyErr_SetString(PyExc_ValueError , message);  
    … …  
    195195        if (PyArray_Check(x) && PyArray_Check(y)) { 
    196196                 
    197             x_len = dims[1]= x->dimensions[1]; 
     197            x_len = dims[0]= x->dimensions[0]; 
    198198        y_len = dims[0]= y->dimensions[0]; 
    199199             
    200200            // Make a new double matrix of same dims 
    201         result=(PyArrayObject *) PyArray_FromDims(2,dims,NPY_DOUBLE); 
     201        result=(PyArrayObject *) PyArray_FromDims(1,dims,NPY_DOUBLE); 
    202202        if (result == NULL){ 
    203203            const char * message= "Could not create result "; 
    … …  
    207207        
    208208        /* Do the calculation. */ 
    209         for ( j=0; j< y_len; j++) { 
    210             for ( i=0; i< x_len; i++) { 
    211                 double x_value = *(double *)(x->data + i*x->strides[1]); 
    212                     double y_value = *(double *)(y->data + j*y->strides[0]); 
    213                         double *result_value = (double *)(result->data + 
    214                               j*result->strides[0] + i*result->strides[1]); 
    215                         *result_value = (*model)(x_value, y_value); 
    216             }            
    217         } 
     209        for ( i=0; i< x_len; i++) { 
     210            double x_value = *(double *)(x->data + i*x->strides[0]); 
     211                    double y_value = *(double *)(y->data + i*y->strides[0]); 
     212                        double *result_value = (double *)(result->data + 
     213                              i*result->strides[0]); 
     214                        *result_value = (*model)(x_value, y_value); 
     215        }            
    218216        return PyArray_Return(result);  
    219217         

  • sansmodels/src/sans/models/c_models/CLamellarModel.cpp

    r71e2de7 r3080527  
    178178 { 
    179179    PyArrayObject *result; 
    180     int i,j, x_len, y_len, dims[2]; 
     180    int i,j, x_len, y_len, dims[1]; 
    181181    //check validity of input vectors 
    182     if (x->nd != 2 || x->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
    183         || y->nd != 2 || y->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
    184         || y->dimensions[1] != x->dimensions[0]){ 
     182    if (x->nd != 1 || x->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
     183        || y->nd != 1 || y->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
     184        || y->dimensions[0] != x->dimensions[0]){ 
    185185        const char * message= "evaluateTwoDimXY  expect 2 numpy arrays"; 
    186186        PyErr_SetString(PyExc_ValueError , message);  
    … …  
    190190        if (PyArray_Check(x) && PyArray_Check(y)) { 
    191191                 
    192             x_len = dims[1]= x->dimensions[1]; 
     192            x_len = dims[0]= x->dimensions[0]; 
    193193        y_len = dims[0]= y->dimensions[0]; 
    194194             
    195195            // Make a new double matrix of same dims 
    196         result=(PyArrayObject *) PyArray_FromDims(2,dims,NPY_DOUBLE); 
     196        result=(PyArrayObject *) PyArray_FromDims(1,dims,NPY_DOUBLE); 
    197197        if (result == NULL){ 
    198198            const char * message= "Could not create result "; 
    … …  
    202202        
    203203        /* Do the calculation. */ 
    204         for ( j=0; j< y_len; j++) { 
    205             for ( i=0; i< x_len; i++) { 
    206                 double x_value = *(double *)(x->data + i*x->strides[1]); 
    207                     double y_value = *(double *)(y->data + j*y->strides[0]); 
    208                         double *result_value = (double *)(result->data + 
    209                               j*result->strides[0] + i*result->strides[1]); 
    210                         *result_value = (*model)(x_value, y_value); 
    211             }            
    212         } 
     204        for ( i=0; i< x_len; i++) { 
     205            double x_value = *(double *)(x->data + i*x->strides[0]); 
     206                    double y_value = *(double *)(y->data + i*y->strides[0]); 
     207                        double *result_value = (double *)(result->data + 
     208                              i*result->strides[0]); 
     209                        *result_value = (*model)(x_value, y_value); 
     210        }            
    213211        return PyArray_Return(result);  
    214212         

  • sansmodels/src/sans/models/c_models/CLamellarPSHGModel.cpp

    r71e2de7 r3080527  
    189189 { 
    190190    PyArrayObject *result; 
    191     int i,j, x_len, y_len, dims[2]; 
     191    int i,j, x_len, y_len, dims[1]; 
    192192    //check validity of input vectors 
    193     if (x->nd != 2 || x->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
    194         || y->nd != 2 || y->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
    195         || y->dimensions[1] != x->dimensions[0]){ 
     193    if (x->nd != 1 || x->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
     194        || y->nd != 1 || y->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
     195        || y->dimensions[0] != x->dimensions[0]){ 
    196196        const char * message= "evaluateTwoDimXY  expect 2 numpy arrays"; 
    197197        PyErr_SetString(PyExc_ValueError , message);  
    … …  
    201201        if (PyArray_Check(x) && PyArray_Check(y)) { 
    202202                 
    203             x_len = dims[1]= x->dimensions[1]; 
     203            x_len = dims[0]= x->dimensions[0]; 
    204204        y_len = dims[0]= y->dimensions[0]; 
    205205             
    206206            // Make a new double matrix of same dims 
    207         result=(PyArrayObject *) PyArray_FromDims(2,dims,NPY_DOUBLE); 
     207        result=(PyArrayObject *) PyArray_FromDims(1,dims,NPY_DOUBLE); 
    208208        if (result == NULL){ 
    209209            const char * message= "Could not create result "; 
    … …  
    213213        
    214214        /* Do the calculation. */ 
    215         for ( j=0; j< y_len; j++) { 
    216             for ( i=0; i< x_len; i++) { 
    217                 double x_value = *(double *)(x->data + i*x->strides[1]); 
    218                     double y_value = *(double *)(y->data + j*y->strides[0]); 
    219                         double *result_value = (double *)(result->data + 
    220                               j*result->strides[0] + i*result->strides[1]); 
    221                         *result_value = (*model)(x_value, y_value); 
    222             }            
    223         } 
     215        for ( i=0; i< x_len; i++) { 
     216            double x_value = *(double *)(x->data + i*x->strides[0]); 
     217                    double y_value = *(double *)(y->data + i*y->strides[0]); 
     218                        double *result_value = (double *)(result->data + 
     219                              i*result->strides[0]); 
     220                        *result_value = (*model)(x_value, y_value); 
     221        }            
    224222        return PyArray_Return(result);  
    225223         

  • sansmodels/src/sans/models/c_models/CLamellarPSModel.cpp

    r71e2de7 r3080527  
    183183 { 
    184184    PyArrayObject *result; 
    185     int i,j, x_len, y_len, dims[2]; 
     185    int i,j, x_len, y_len, dims[1]; 
    186186    //check validity of input vectors 
    187     if (x->nd != 2 || x->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
    188         || y->nd != 2 || y->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
    189         || y->dimensions[1] != x->dimensions[0]){ 
     187    if (x->nd != 1 || x->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
     188        || y->nd != 1 || y->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
     189        || y->dimensions[0] != x->dimensions[0]){ 
    190190        const char * message= "evaluateTwoDimXY  expect 2 numpy arrays"; 
    191191        PyErr_SetString(PyExc_ValueError , message);  
    … …  
    195195        if (PyArray_Check(x) && PyArray_Check(y)) { 
    196196                 
    197             x_len = dims[1]= x->dimensions[1]; 
     197            x_len = dims[0]= x->dimensions[0]; 
    198198        y_len = dims[0]= y->dimensions[0]; 
    199199             
    200200            // Make a new double matrix of same dims 
    201         result=(PyArrayObject *) PyArray_FromDims(2,dims,NPY_DOUBLE); 
     201        result=(PyArrayObject *) PyArray_FromDims(1,dims,NPY_DOUBLE); 
    202202        if (result == NULL){ 
    203203            const char * message= "Could not create result "; 
    … …  
    207207        
    208208        /* Do the calculation. */ 
    209         for ( j=0; j< y_len; j++) { 
    210             for ( i=0; i< x_len; i++) { 
    211                 double x_value = *(double *)(x->data + i*x->strides[1]); 
    212                     double y_value = *(double *)(y->data + j*y->strides[0]); 
    213                         double *result_value = (double *)(result->data + 
    214                               j*result->strides[0] + i*result->strides[1]); 
    215                         *result_value = (*model)(x_value, y_value); 
    216             }            
    217         } 
     209        for ( i=0; i< x_len; i++) { 
     210            double x_value = *(double *)(x->data + i*x->strides[0]); 
     211                    double y_value = *(double *)(y->data + i*y->strides[0]); 
     212                        double *result_value = (double *)(result->data + 
     213                              i*result->strides[0]); 
     214                        *result_value = (*model)(x_value, y_value); 
     215        }            
    218216        return PyArray_Return(result);  
    219217         

  • sansmodels/src/sans/models/c_models/CLogNormal.cpp

    r71e2de7 r3080527  
    173173 { 
    174174    PyArrayObject *result; 
    175     int i,j, x_len, y_len, dims[2]; 
     175    int i,j, x_len, y_len, dims[1]; 
    176176    //check validity of input vectors 
    177     if (x->nd != 2 || x->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
    178         || y->nd != 2 || y->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
    179         || y->dimensions[1] != x->dimensions[0]){ 
     177    if (x->nd != 1 || x->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
     178        || y->nd != 1 || y->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
     179        || y->dimensions[0] != x->dimensions[0]){ 
    180180        const char * message= "evaluateTwoDimXY  expect 2 numpy arrays"; 
    181181        PyErr_SetString(PyExc_ValueError , message);  
    … …  
    185185        if (PyArray_Check(x) && PyArray_Check(y)) { 
    186186                 
    187             x_len = dims[1]= x->dimensions[1]; 
     187            x_len = dims[0]= x->dimensions[0]; 
    188188        y_len = dims[0]= y->dimensions[0]; 
    189189             
    190190            // Make a new double matrix of same dims 
    191         result=(PyArrayObject *) PyArray_FromDims(2,dims,NPY_DOUBLE); 
     191        result=(PyArrayObject *) PyArray_FromDims(1,dims,NPY_DOUBLE); 
    192192        if (result == NULL){ 
    193193            const char * message= "Could not create result "; 
    … …  
    197197        
    198198        /* Do the calculation. */ 
    199         for ( j=0; j< y_len; j++) { 
    200             for ( i=0; i< x_len; i++) { 
    201                 double x_value = *(double *)(x->data + i*x->strides[1]); 
    202                     double y_value = *(double *)(y->data + j*y->strides[0]); 
    203                         double *result_value = (double *)(result->data + 
    204                               j*result->strides[0] + i*result->strides[1]); 
    205                         *result_value = (*model)(x_value, y_value); 
    206             }            
    207         } 
     199        for ( i=0; i< x_len; i++) { 
     200            double x_value = *(double *)(x->data + i*x->strides[0]); 
     201                    double y_value = *(double *)(y->data + i*y->strides[0]); 
     202                        double *result_value = (double *)(result->data + 
     203                              i*result->strides[0]); 
     204                        *result_value = (*model)(x_value, y_value); 
     205        }            
    208206        return PyArray_Return(result);  
    209207         

  • sansmodels/src/sans/models/c_models/CLorentzian.cpp

    r71e2de7 r3080527  
    173173 { 
    174174    PyArrayObject *result; 
    175     int i,j, x_len, y_len, dims[2]; 
     175    int i,j, x_len, y_len, dims[1]; 
    176176    //check validity of input vectors 
    177     if (x->nd != 2 || x->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
    178         || y->nd != 2 || y->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
    179         || y->dimensions[1] != x->dimensions[0]){ 
     177    if (x->nd != 1 || x->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
     178        || y->nd != 1 || y->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
     179        || y->dimensions[0] != x->dimensions[0]){ 
    180180        const char * message= "evaluateTwoDimXY  expect 2 numpy arrays"; 
    181181        PyErr_SetString(PyExc_ValueError , message);  
    … …  
    185185        if (PyArray_Check(x) && PyArray_Check(y)) { 
    186186                 
    187             x_len = dims[1]= x->dimensions[1]; 
     187            x_len = dims[0]= x->dimensions[0]; 
    188188        y_len = dims[0]= y->dimensions[0]; 
    189189             
    190190            // Make a new double matrix of same dims 
    191         result=(PyArrayObject *) PyArray_FromDims(2,dims,NPY_DOUBLE); 
     191        result=(PyArrayObject *) PyArray_FromDims(1,dims,NPY_DOUBLE); 
    192192        if (result == NULL){ 
    193193            const char * message= "Could not create result "; 
    … …  
    197197        
    198198        /* Do the calculation. */ 
    199         for ( j=0; j< y_len; j++) { 
    200             for ( i=0; i< x_len; i++) { 
    201                 double x_value = *(double *)(x->data + i*x->strides[1]); 
    202                     double y_value = *(double *)(y->data + j*y->strides[0]); 
    203                         double *result_value = (double *)(result->data + 
    204                               j*result->strides[0] + i*result->strides[1]); 
    205                         *result_value = (*model)(x_value, y_value); 
    206             }            
    207         } 
     199        for ( i=0; i< x_len; i++) { 
     200            double x_value = *(double *)(x->data + i*x->strides[0]); 
     201                    double y_value = *(double *)(y->data + i*y->strides[0]); 
     202                        double *result_value = (double *)(result->data + 
     203                              i*result->strides[0]); 
     204                        *result_value = (*model)(x_value, y_value); 
     205        }            
    208206        return PyArray_Return(result);  
    209207         

  • sansmodels/src/sans/models/c_models/CMultiShellModel.cpp

    r71e2de7 r3080527  
    187187 { 
    188188    PyArrayObject *result; 
    189     int i,j, x_len, y_len, dims[2]; 
     189    int i,j, x_len, y_len, dims[1]; 
    190190    //check validity of input vectors 
    191     if (x->nd != 2 || x->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
    192         || y->nd != 2 || y->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
    193         || y->dimensions[1] != x->dimensions[0]){ 
     191    if (x->nd != 1 || x->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
     192        || y->nd != 1 || y->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
     193        || y->dimensions[0] != x->dimensions[0]){ 
    194194        const char * message= "evaluateTwoDimXY  expect 2 numpy arrays"; 
    195195        PyErr_SetString(PyExc_ValueError , message);  
    … …  
    199199        if (PyArray_Check(x) && PyArray_Check(y)) { 
    200200                 
    201             x_len = dims[1]= x->dimensions[1]; 
     201            x_len = dims[0]= x->dimensions[0]; 
    202202        y_len = dims[0]= y->dimensions[0]; 
    203203             
    204204            // Make a new double matrix of same dims 
    205         result=(PyArrayObject *) PyArray_FromDims(2,dims,NPY_DOUBLE); 
     205        result=(PyArrayObject *) PyArray_FromDims(1,dims,NPY_DOUBLE); 
    206206        if (result == NULL){ 
    207207            const char * message= "Could not create result "; 
    … …  
    211211        
    212212        /* Do the calculation. */ 
    213         for ( j=0; j< y_len; j++) { 
    214             for ( i=0; i< x_len; i++) { 
    215                 double x_value = *(double *)(x->data + i*x->strides[1]); 
    216                     double y_value = *(double *)(y->data + j*y->strides[0]); 
    217                         double *result_value = (double *)(result->data + 
    218                               j*result->strides[0] + i*result->strides[1]); 
    219                         *result_value = (*model)(x_value, y_value); 
    220             }            
    221         } 
     213        for ( i=0; i< x_len; i++) { 
     214            double x_value = *(double *)(x->data + i*x->strides[0]); 
     215                    double y_value = *(double *)(y->data + i*y->strides[0]); 
     216                        double *result_value = (double *)(result->data + 
     217                              i*result->strides[0]); 
     218                        *result_value = (*model)(x_value, y_value); 
     219        }            
    222220        return PyArray_Return(result);  
    223221         

  • sansmodels/src/sans/models/c_models/COblateModel.cpp

    r71e2de7 r3080527  
    192192 { 
    193193    PyArrayObject *result; 
    194     int i,j, x_len, y_len, dims[2]; 
     194    int i,j, x_len, y_len, dims[1]; 
    195195    //check validity of input vectors 
    196     if (x->nd != 2 || x->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
    197         || y->nd != 2 || y->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
    198         || y->dimensions[1] != x->dimensions[0]){ 
     196    if (x->nd != 1 || x->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
     197        || y->nd != 1 || y->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
     198        || y->dimensions[0] != x->dimensions[0]){ 
    199199        const char * message= "evaluateTwoDimXY  expect 2 numpy arrays"; 
    200200        PyErr_SetString(PyExc_ValueError , message);  
    … …  
    204204        if (PyArray_Check(x) && PyArray_Check(y)) { 
    205205                 
    206             x_len = dims[1]= x->dimensions[1]; 
     206            x_len = dims[0]= x->dimensions[0]; 
    207207        y_len = dims[0]= y->dimensions[0]; 
    208208             
    209209            // Make a new double matrix of same dims 
    210         result=(PyArrayObject *) PyArray_FromDims(2,dims,NPY_DOUBLE); 
     210        result=(PyArrayObject *) PyArray_FromDims(1,dims,NPY_DOUBLE); 
    211211        if (result == NULL){ 
    212212            const char * message= "Could not create result "; 
    … …  
    216216        
    217217        /* Do the calculation. */ 
    218         for ( j=0; j< y_len; j++) { 
    219             for ( i=0; i< x_len; i++) { 
    220                 double x_value = *(double *)(x->data + i*x->strides[1]); 
    221                     double y_value = *(double *)(y->data + j*y->strides[0]); 
    222                         double *result_value = (double *)(result->data + 
    223                               j*result->strides[0] + i*result->strides[1]); 
    224                         *result_value = (*model)(x_value, y_value); 
    225             }            
    226         } 
     218        for ( i=0; i< x_len; i++) { 
     219            double x_value = *(double *)(x->data + i*x->strides[0]); 
     220                    double y_value = *(double *)(y->data + i*y->strides[0]); 
     221                        double *result_value = (double *)(result->data + 
     222                              i*result->strides[0]); 
     223                        *result_value = (*model)(x_value, y_value); 
     224        }            
    227225        return PyArray_Return(result);  
    228226         

  • sansmodels/src/sans/models/c_models/CParallelepipedModel.cpp

    r71e2de7 r3080527  
    197197 { 
    198198    PyArrayObject *result; 
    199     int i,j, x_len, y_len, dims[2]; 
     199    int i,j, x_len, y_len, dims[1]; 
    200200    //check validity of input vectors 
    201     if (x->nd != 2 || x->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
    202         || y->nd != 2 || y->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
    203         || y->dimensions[1] != x->dimensions[0]){ 
     201    if (x->nd != 1 || x->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
     202        || y->nd != 1 || y->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
     203        || y->dimensions[0] != x->dimensions[0]){ 
    204204        const char * message= "evaluateTwoDimXY  expect 2 numpy arrays"; 
    205205        PyErr_SetString(PyExc_ValueError , message);  
    … …  
    209209        if (PyArray_Check(x) && PyArray_Check(y)) { 
    210210                 
    211             x_len = dims[1]= x->dimensions[1]; 
     211            x_len = dims[0]= x->dimensions[0]; 
    212212        y_len = dims[0]= y->dimensions[0]; 
    213213             
    214214            // Make a new double matrix of same dims 
    215         result=(PyArrayObject *) PyArray_FromDims(2,dims,NPY_DOUBLE); 
     215        result=(PyArrayObject *) PyArray_FromDims(1,dims,NPY_DOUBLE); 
    216216        if (result == NULL){ 
    217217            const char * message= "Could not create result "; 
    … …  
    221221        
    222222        /* Do the calculation. */ 
    223         for ( j=0; j< y_len; j++) { 
    224             for ( i=0; i< x_len; i++) { 
    225                 double x_value = *(double *)(x->data + i*x->strides[1]); 
    226                     double y_value = *(double *)(y->data + j*y->strides[0]); 
    227                         double *result_value = (double *)(result->data + 
    228                               j*result->strides[0] + i*result->strides[1]); 
    229                         *result_value = (*model)(x_value, y_value); 
    230             }            
    231         } 
     223        for ( i=0; i< x_len; i++) { 
     224            double x_value = *(double *)(x->data + i*x->strides[0]); 
     225                    double y_value = *(double *)(y->data + i*y->strides[0]); 
     226                        double *result_value = (double *)(result->data + 
     227                              i*result->strides[0]); 
     228                        *result_value = (*model)(x_value, y_value); 
     229        }            
    232230        return PyArray_Return(result);  
    233231         

  • sansmodels/src/sans/models/c_models/CProlateModel.cpp

    r71e2de7 r3080527  
    190190 { 
    191191    PyArrayObject *result; 
    192     int i,j, x_len, y_len, dims[2]; 
     192    int i,j, x_len, y_len, dims[1]; 
    193193    //check validity of input vectors 
    194     if (x->nd != 2 || x->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
    195         || y->nd != 2 || y->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
    196         || y->dimensions[1] != x->dimensions[0]){ 
     194    if (x->nd != 1 || x->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
     195        || y->nd != 1 || y->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
     196        || y->dimensions[0] != x->dimensions[0]){ 
    197197        const char * message= "evaluateTwoDimXY  expect 2 numpy arrays"; 
    198198        PyErr_SetString(PyExc_ValueError , message);  
    … …  
    202202        if (PyArray_Check(x) && PyArray_Check(y)) { 
    203203                 
    204             x_len = dims[1]= x->dimensions[1]; 
     204            x_len = dims[0]= x->dimensions[0]; 
    205205        y_len = dims[0]= y->dimensions[0]; 
    206206             
    207207            // Make a new double matrix of same dims 
    208         result=(PyArrayObject *) PyArray_FromDims(2,dims,NPY_DOUBLE); 
     208        result=(PyArrayObject *) PyArray_FromDims(1,dims,NPY_DOUBLE); 
    209209        if (result == NULL){ 
    210210            const char * message= "Could not create result "; 
    … …  
    214214        
    215215        /* Do the calculation. */ 
    216         for ( j=0; j< y_len; j++) { 
    217             for ( i=0; i< x_len; i++) { 
    218                 double x_value = *(double *)(x->data + i*x->strides[1]); 
    219                     double y_value = *(double *)(y->data + j*y->strides[0]); 
    220                         double *result_value = (double *)(result->data + 
    221                               j*result->strides[0] + i*result->strides[1]); 
    222                         *result_value = (*model)(x_value, y_value); 
    223             }            
    224         } 
     216        for ( i=0; i< x_len; i++) { 
     217            double x_value = *(double *)(x->data + i*x->strides[0]); 
     218                    double y_value = *(double *)(y->data + i*y->strides[0]); 
     219                        double *result_value = (double *)(result->data + 
     220                              i*result->strides[0]); 
     221                        *result_value = (*model)(x_value, y_value); 
     222        }            
    225223        return PyArray_Return(result);  
    226224         

  • sansmodels/src/sans/models/c_models/CSchulz.cpp

    r71e2de7 r3080527  
    173173 { 
    174174    PyArrayObject *result; 
    175     int i,j, x_len, y_len, dims[2]; 
     175    int i,j, x_len, y_len, dims[1]; 
    176176    //check validity of input vectors 
    177     if (x->nd != 2 || x->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
    178         || y->nd != 2 || y->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
    179         || y->dimensions[1] != x->dimensions[0]){ 
     177    if (x->nd != 1 || x->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
     178        || y->nd != 1 || y->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
     179        || y->dimensions[0] != x->dimensions[0]){ 
    180180        const char * message= "evaluateTwoDimXY  expect 2 numpy arrays"; 
    181181        PyErr_SetString(PyExc_ValueError , message);  
    … …  
    185185        if (PyArray_Check(x) && PyArray_Check(y)) { 
    186186                 
    187             x_len = dims[1]= x->dimensions[1]; 
     187            x_len = dims[0]= x->dimensions[0]; 
    188188        y_len = dims[0]= y->dimensions[0]; 
    189189             
    190190            // Make a new double matrix of same dims 
    191         result=(PyArrayObject *) PyArray_FromDims(2,dims,NPY_DOUBLE); 
     191        result=(PyArrayObject *) PyArray_FromDims(1,dims,NPY_DOUBLE); 
    192192        if (result == NULL){ 
    193193            const char * message= "Could not create result "; 
    … …  
    197197        
    198198        /* Do the calculation. */ 
    199         for ( j=0; j< y_len; j++) { 
    200             for ( i=0; i< x_len; i++) { 
    201                 double x_value = *(double *)(x->data + i*x->strides[1]); 
    202                     double y_value = *(double *)(y->data + j*y->strides[0]); 
    203                         double *result_value = (double *)(result->data + 
    204                               j*result->strides[0] + i*result->strides[1]); 
    205                         *result_value = (*model)(x_value, y_value); 
    206             }            
    207         } 
     199        for ( i=0; i< x_len; i++) { 
     200            double x_value = *(double *)(x->data + i*x->strides[0]); 
     201                    double y_value = *(double *)(y->data + i*y->strides[0]); 
     202                        double *result_value = (double *)(result->data + 
     203                              i*result->strides[0]); 
     204                        *result_value = (*model)(x_value, y_value); 
     205        }            
    208206        return PyArray_Return(result);  
    209207         

  • sansmodels/src/sans/models/c_models/CSphereModel.cpp

    r71e2de7 r3080527  
    177177 { 
    178178    PyArrayObject *result; 
    179     int i,j, x_len, y_len, dims[2]; 
     179    int i,j, x_len, y_len, dims[1]; 
    180180    //check validity of input vectors 
    181     if (x->nd != 2 || x->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
    182         || y->nd != 2 || y->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
    183         || y->dimensions[1] != x->dimensions[0]){ 
     181    if (x->nd != 1 || x->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
     182        || y->nd != 1 || y->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
     183        || y->dimensions[0] != x->dimensions[0]){ 
    184184        const char * message= "evaluateTwoDimXY  expect 2 numpy arrays"; 
    185185        PyErr_SetString(PyExc_ValueError , message);  
    … …  
    189189        if (PyArray_Check(x) && PyArray_Check(y)) { 
    190190                 
    191             x_len = dims[1]= x->dimensions[1]; 
     191            x_len = dims[0]= x->dimensions[0]; 
    192192        y_len = dims[0]= y->dimensions[0]; 
    193193             
    194194            // Make a new double matrix of same dims 
    195         result=(PyArrayObject *) PyArray_FromDims(2,dims,NPY_DOUBLE); 
     195        result=(PyArrayObject *) PyArray_FromDims(1,dims,NPY_DOUBLE); 
    196196        if (result == NULL){ 
    197197            const char * message= "Could not create result "; 
    … …  
    201201        
    202202        /* Do the calculation. */ 
    203         for ( j=0; j< y_len; j++) { 
    204             for ( i=0; i< x_len; i++) { 
    205                 double x_value = *(double *)(x->data + i*x->strides[1]); 
    206                     double y_value = *(double *)(y->data + j*y->strides[0]); 
    207                         double *result_value = (double *)(result->data + 
    208                               j*result->strides[0] + i*result->strides[1]); 
    209                         *result_value = (*model)(x_value, y_value); 
    210             }            
    211         } 
     203        for ( i=0; i< x_len; i++) { 
     204            double x_value = *(double *)(x->data + i*x->strides[0]); 
     205                    double y_value = *(double *)(y->data + i*y->strides[0]); 
     206                        double *result_value = (double *)(result->data + 
     207                              i*result->strides[0]); 
     208                        *result_value = (*model)(x_value, y_value); 
     209        }            
    212210        return PyArray_Return(result);  
    213211         

  • sansmodels/src/sans/models/c_models/CSquareWellStructure.cpp

    r71e2de7 r3080527  
    177177 { 
    178178    PyArrayObject *result; 
    179     int i,j, x_len, y_len, dims[2]; 
     179    int i,j, x_len, y_len, dims[1]; 
    180180    //check validity of input vectors 
    181     if (x->nd != 2 || x->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
    182         || y->nd != 2 || y->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
    183         || y->dimensions[1] != x->dimensions[0]){ 
     181    if (x->nd != 1 || x->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
     182        || y->nd != 1 || y->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
     183        || y->dimensions[0] != x->dimensions[0]){ 
    184184        const char * message= "evaluateTwoDimXY  expect 2 numpy arrays"; 
    185185        PyErr_SetString(PyExc_ValueError , message);  
    … …  
    189189        if (PyArray_Check(x) && PyArray_Check(y)) { 
    190190                 
    191             x_len = dims[1]= x->dimensions[1]; 
     191            x_len = dims[0]= x->dimensions[0]; 
    192192        y_len = dims[0]= y->dimensions[0]; 
    193193             
    194194            // Make a new double matrix of same dims 
    195         result=(PyArrayObject *) PyArray_FromDims(2,dims,NPY_DOUBLE); 
     195        result=(PyArrayObject *) PyArray_FromDims(1,dims,NPY_DOUBLE); 
    196196        if (result == NULL){ 
    197197            const char * message= "Could not create result "; 
    … …  
    201201        
    202202        /* Do the calculation. */ 
    203         for ( j=0; j< y_len; j++) { 
    204             for ( i=0; i< x_len; i++) { 
    205                 double x_value = *(double *)(x->data + i*x->strides[1]); 
    206                     double y_value = *(double *)(y->data + j*y->strides[0]); 
    207                         double *result_value = (double *)(result->data + 
    208                               j*result->strides[0] + i*result->strides[1]); 
    209                         *result_value = (*model)(x_value, y_value); 
    210             }            
    211         } 
     203        for ( i=0; i< x_len; i++) { 
     204            double x_value = *(double *)(x->data + i*x->strides[0]); 
     205                    double y_value = *(double *)(y->data + i*y->strides[0]); 
     206                        double *result_value = (double *)(result->data + 
     207                              i*result->strides[0]); 
     208                        *result_value = (*model)(x_value, y_value); 
     209        }            
    212210        return PyArray_Return(result);  
    213211         

  • sansmodels/src/sans/models/c_models/CStackedDisksModel.cpp

    r71e2de7 r3080527  
    197197 { 
    198198    PyArrayObject *result; 
    199     int i,j, x_len, y_len, dims[2]; 
     199    int i,j, x_len, y_len, dims[1]; 
    200200    //check validity of input vectors 
    201     if (x->nd != 2 || x->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
    202         || y->nd != 2 || y->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
    203         || y->dimensions[1] != x->dimensions[0]){ 
     201    if (x->nd != 1 || x->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
     202        || y->nd != 1 || y->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
     203        || y->dimensions[0] != x->dimensions[0]){ 
    204204        const char * message= "evaluateTwoDimXY  expect 2 numpy arrays"; 
    205205        PyErr_SetString(PyExc_ValueError , message);  
    … …  
    209209        if (PyArray_Check(x) && PyArray_Check(y)) { 
    210210                 
    211             x_len = dims[1]= x->dimensions[1]; 
     211            x_len = dims[0]= x->dimensions[0]; 
    212212        y_len = dims[0]= y->dimensions[0]; 
    213213             
    214214            // Make a new double matrix of same dims 
    215         result=(PyArrayObject *) PyArray_FromDims(2,dims,NPY_DOUBLE); 
     215        result=(PyArrayObject *) PyArray_FromDims(1,dims,NPY_DOUBLE); 
    216216        if (result == NULL){ 
    217217            const char * message= "Could not create result "; 
    … …  
    221221        
    222222        /* Do the calculation. */ 
    223         for ( j=0; j< y_len; j++) { 
    224             for ( i=0; i< x_len; i++) { 
    225                 double x_value = *(double *)(x->data + i*x->strides[1]); 
    226                     double y_value = *(double *)(y->data + j*y->strides[0]); 
    227                         double *result_value = (double *)(result->data + 
    228                               j*result->strides[0] + i*result->strides[1]); 
    229                         *result_value = (*model)(x_value, y_value); 
    230             }            
    231         } 
     223        for ( i=0; i< x_len; i++) { 
     224            double x_value = *(double *)(x->data + i*x->strides[0]); 
     225                    double y_value = *(double *)(y->data + i*y->strides[0]); 
     226                        double *result_value = (double *)(result->data + 
     227                              i*result->strides[0]); 
     228                        *result_value = (*model)(x_value, y_value); 
     229        }            
    232230        return PyArray_Return(result);  
    233231         

  • sansmodels/src/sans/models/c_models/CStickyHSStructure.cpp

    r71e2de7 r3080527  
    177177 { 
    178178    PyArrayObject *result; 
    179     int i,j, x_len, y_len, dims[2]; 
     179    int i,j, x_len, y_len, dims[1]; 
    180180    //check validity of input vectors 
    181     if (x->nd != 2 || x->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
    182         || y->nd != 2 || y->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
    183         || y->dimensions[1] != x->dimensions[0]){ 
     181    if (x->nd != 1 || x->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
     182        || y->nd != 1 || y->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
     183        || y->dimensions[0] != x->dimensions[0]){ 
    184184        const char * message= "evaluateTwoDimXY  expect 2 numpy arrays"; 
    185185        PyErr_SetString(PyExc_ValueError , message);  
    … …  
    189189        if (PyArray_Check(x) && PyArray_Check(y)) { 
    190190                 
    191             x_len = dims[1]= x->dimensions[1]; 
     191            x_len = dims[0]= x->dimensions[0]; 
    192192        y_len = dims[0]= y->dimensions[0]; 
    193193             
    194194            // Make a new double matrix of same dims 
    195         result=(PyArrayObject *) PyArray_FromDims(2,dims,NPY_DOUBLE); 
     195        result=(PyArrayObject *) PyArray_FromDims(1,dims,NPY_DOUBLE); 
    196196        if (result == NULL){ 
    197197            const char * message= "Could not create result "; 
    … …  
    201201        
    202202        /* Do the calculation. */ 
    203         for ( j=0; j< y_len; j++) { 
    204             for ( i=0; i< x_len; i++) { 
    205                 double x_value = *(double *)(x->data + i*x->strides[1]); 
    206                     double y_value = *(double *)(y->data + j*y->strides[0]); 
    207                         double *result_value = (double *)(result->data + 
    208                               j*result->strides[0] + i*result->strides[1]); 
    209                         *result_value = (*model)(x_value, y_value); 
    210             }            
    211         } 
     203        for ( i=0; i< x_len; i++) { 
     204            double x_value = *(double *)(x->data + i*x->strides[0]); 
     205                    double y_value = *(double *)(y->data + i*y->strides[0]); 
     206                        double *result_value = (double *)(result->data + 
     207                              i*result->strides[0]); 
     208                        *result_value = (*model)(x_value, y_value); 
     209        }            
    212210        return PyArray_Return(result);  
    213211         

  • sansmodels/src/sans/models/c_models/CTriaxialEllipsoidModel.cpp

    r71e2de7 r3080527  
    188188 { 
    189189    PyArrayObject *result; 
    190     int i,j, x_len, y_len, dims[2]; 
     190    int i,j, x_len, y_len, dims[1]; 
    191191    //check validity of input vectors 
    192     if (x->nd != 2 || x->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
    193         || y->nd != 2 || y->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
    194         || y->dimensions[1] != x->dimensions[0]){ 
     192    if (x->nd != 1 || x->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
     193        || y->nd != 1 || y->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
     194        || y->dimensions[0] != x->dimensions[0]){ 
    195195        const char * message= "evaluateTwoDimXY  expect 2 numpy arrays"; 
    196196        PyErr_SetString(PyExc_ValueError , message);  
    … …  
    200200        if (PyArray_Check(x) && PyArray_Check(y)) { 
    201201                 
    202             x_len = dims[1]= x->dimensions[1]; 
     202            x_len = dims[0]= x->dimensions[0]; 
    203203        y_len = dims[0]= y->dimensions[0]; 
    204204             
    205205            // Make a new double matrix of same dims 
    206         result=(PyArrayObject *) PyArray_FromDims(2,dims,NPY_DOUBLE); 
     206        result=(PyArrayObject *) PyArray_FromDims(1,dims,NPY_DOUBLE); 
    207207        if (result == NULL){ 
    208208            const char * message= "Could not create result "; 
    … …  
    212212        
    213213        /* Do the calculation. */ 
    214         for ( j=0; j< y_len; j++) { 
    215             for ( i=0; i< x_len; i++) { 
    216                 double x_value = *(double *)(x->data + i*x->strides[1]); 
    217                     double y_value = *(double *)(y->data + j*y->strides[0]); 
    218                         double *result_value = (double *)(result->data + 
    219                               j*result->strides[0] + i*result->strides[1]); 
    220                         *result_value = (*model)(x_value, y_value); 
    221             }            
    222         } 
     214        for ( i=0; i< x_len; i++) { 
     215            double x_value = *(double *)(x->data + i*x->strides[0]); 
     216                    double y_value = *(double *)(y->data + i*y->strides[0]); 
     217                        double *result_value = (double *)(result->data + 
     218                              i*result->strides[0]); 
     219                        *result_value = (*model)(x_value, y_value); 
     220        }            
    223221        return PyArray_Return(result);  
    224222         

  • sansmodels/src/sans/models/c_models/CVesicleModel.cpp

    r71e2de7 r3080527  
    182182 { 
    183183    PyArrayObject *result; 
    184     int i,j, x_len, y_len, dims[2]; 
     184    int i,j, x_len, y_len, dims[1]; 
    185185    //check validity of input vectors 
    186     if (x->nd != 2 || x->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
    187         || y->nd != 2 || y->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
    188         || y->dimensions[1] != x->dimensions[0]){ 
     186    if (x->nd != 1 || x->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
     187        || y->nd != 1 || y->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
     188        || y->dimensions[0] != x->dimensions[0]){ 
    189189        const char * message= "evaluateTwoDimXY  expect 2 numpy arrays"; 
    190190        PyErr_SetString(PyExc_ValueError , message);  
    … …  
    194194        if (PyArray_Check(x) && PyArray_Check(y)) { 
    195195                 
    196             x_len = dims[1]= x->dimensions[1]; 
     196            x_len = dims[0]= x->dimensions[0]; 
    197197        y_len = dims[0]= y->dimensions[0]; 
    198198             
    199199            // Make a new double matrix of same dims 
    200         result=(PyArrayObject *) PyArray_FromDims(2,dims,NPY_DOUBLE); 
     200        result=(PyArrayObject *) PyArray_FromDims(1,dims,NPY_DOUBLE); 
    201201        if (result == NULL){ 
    202202            const char * message= "Could not create result "; 
    … …  
    206206        
    207207        /* Do the calculation. */ 
    208         for ( j=0; j< y_len; j++) { 
    209             for ( i=0; i< x_len; i++) { 
    210                 double x_value = *(double *)(x->data + i*x->strides[1]); 
    211                     double y_value = *(double *)(y->data + j*y->strides[0]); 
    212                         double *result_value = (double *)(result->data + 
    213                               j*result->strides[0] + i*result->strides[1]); 
    214                         *result_value = (*model)(x_value, y_value); 
    215             }            
    216         } 
     208        for ( i=0; i< x_len; i++) { 
     209            double x_value = *(double *)(x->data + i*x->strides[0]); 
     210                    double y_value = *(double *)(y->data + i*y->strides[0]); 
     211                        double *result_value = (double *)(result->data + 
     212                              i*result->strides[0]); 
     213                        *result_value = (*model)(x_value, y_value); 
     214        }            
    217215        return PyArray_Return(result);  
    218216         

  • sansmodels/src/sans/models/c_models/classTemplate.txt

    r71e2de7 r3080527  
    163163 { 
    164164    PyArrayObject *result; 
    165     int i,j, x_len, y_len, dims[2]; 
     165    int i,j, x_len, y_len, dims[1]; 
    166166    //check validity of input vectors 
    167     if (x->nd != 2 || x->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
    168         || y->nd != 2 || y->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
    169         || y->dimensions[1] != x->dimensions[0]){ 
     167    if (x->nd != 1 || x->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
     168        || y->nd != 1 || y->descr->type_num != PyArray_DOUBLE 
     169        || y->dimensions[0] != x->dimensions[0]){ 
    170170        const char * message= "evaluateTwoDimXY  expect 2 numpy arrays"; 
    171171        PyErr_SetString(PyExc_ValueError , message);  
    … …  
    175175        if (PyArray_Check(x) && PyArray_Check(y)) { 
    176176                 
    177             x_len = dims[1]= x->dimensions[1]; 
     177            x_len = dims[0]= x->dimensions[0]; 
    178178        y_len = dims[0]= y->dimensions[0]; 
    179179             
    180180            // Make a new double matrix of same dims 
    181         result=(PyArrayObject *) PyArray_FromDims(2,dims,NPY_DOUBLE); 
     181        result=(PyArrayObject *) PyArray_FromDims(1,dims,NPY_DOUBLE); 
    182182        if (result == NULL){ 
    183183            const char * message= "Could not create result "; 
    … …  
    187187        
    188188        /* Do the calculation. */ 
    189         for ( j=0; j< y_len; j++) { 
    190             for ( i=0; i< x_len; i++) { 
    191                 double x_value = *(double *)(x->data + i*x->strides[1]); 
    192                     double y_value = *(double *)(y->data + j*y->strides[0]); 
    193                         double *result_value = (double *)(result->data + 
    194                               j*result->strides[0] + i*result->strides[1]); 
    195                         *result_value = (*model)(x_value, y_value); 
    196             }            
    197         } 
     189        for ( i=0; i< x_len; i++) { 
     190            double x_value = *(double *)(x->data + i*x->strides[0]); 
     191                    double y_value = *(double *)(y->data + i*y->strides[0]); 
     192                        double *result_value = (double *)(result->data + 
     193                              i*result->strides[0]); 
     194                        *result_value = (*model)(x_value, y_value); 
     195        }            
    198196        return PyArray_Return(result);  
    199197         
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.