Changeset 17e257b5 in sasview


Ignore:
Timestamp:
Aug 24, 2017 2:16:07 PM (7 years ago)
Author:
krzywon
Branches:
master, ESS_GUI, ESS_GUI_Docs, ESS_GUI_batch_fitting, ESS_GUI_bumps_abstraction, ESS_GUI_iss1116, ESS_GUI_iss879, ESS_GUI_iss959, ESS_GUI_opencl, ESS_GUI_ordering, ESS_GUI_sync_sascalc, costrafo411, magnetic_scatt, release-4.2.2, ticket-1009, ticket-1094-headless, ticket-1242-2d-resolution, ticket-1243, ticket-1249, ticket885, unittest-saveload
Children:
d713729
Parents:
f001bc9
Message:

Fix the broken unit tests associated with the readers.

Files:
6 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed

  • src/sas/sascalc/dataloader/data_info.py

    r5a8cdbb r17e257b5  
    11611161    final_dataset = None 
    11621162    if isinstance(data, plottable_1D): 
    1163         final_dataset = Data1D(data.x, data.y) 
     1163        final_dataset = Data1D(data.x, data.y, isSesans=datainfo.isSesans) 
    11641164        final_dataset.dx = data.dx 
    11651165        final_dataset.dy = data.dy 
    11661166        final_dataset.dxl = data.dxl 
    11671167        final_dataset.dxw = data.dxw 
     1168        final_dataset.x_unit = data._xunit 
     1169        final_dataset.y_unit = data._yunit 
    11681170        final_dataset.xaxis(data._xaxis, data._xunit) 
    11691171        final_dataset.yaxis(data._yaxis, data._yunit) 

  • src/sas/sascalc/dataloader/readers/cansas_reader.py

    rdcb91cf r17e257b5  
    299299                    self.current_dataset.dx = np.append(self.current_dataset.dx, data_point) 
    300300                elif tagname == 'dQw': 
    301                     if self.current_dataset.dqw is None: self.current_dataset.dqw = np.empty(0) 
     301                    if self.current_dataset.dxw is None: self.current_dataset.dxw = np.empty(0) 
    302302                    self.current_dataset.dxw = np.append(self.current_dataset.dxw, data_point) 
    303303                elif tagname == 'dQl': 

  • test/sasdataloader/test/utest_abs_reader.py

    rce8c7bd r17e257b5  
    2020    def setUp(self): 
    2121        reader = AbsReader() 
    22         self.data = reader.read("jan08002.ABS") 
     22        data = reader.read("jan08002.ABS") 
     23        self.data= data[0] 
    2324 
    2425    def test_abs_checkdata(self): 
    … …  
    6970        # the generic loader should work as well 
    7071        data = Loader().load("jan08002.ABS") 
    71         self.assertEqual(data.meta_data['loader'], "IGOR 1D") 
     72        self.assertEqual(data[0].meta_data['loader'], "IGOR 1D") 
    7273 
    7374class DanseReaderTests(unittest.TestCase): 
    … …  
    7576    def setUp(self): 
    7677        reader = DANSEReader() 
    77         self.data = reader.read("MP_New.sans") 
     78        data = reader.read("MP_New.sans") 
     79        self.data = data[0] 
    7880 
    7981    def test_checkdata(self): 
    … …  
    112114        # the generic loader should work as well 
    113115        data = Loader().load("MP_New.sans") 
    114         self.assertEqual(data.meta_data['loader'], "DANSE") 
     116        self.assertEqual(data[0].meta_data['loader'], "DANSE") 
    115117 
    116118 
    … …  
    257259            self.assertTrue(item.date in ['04-Sep-2007 18:35:02', 
    258260                                          '03-SEP-2006 11:42:47']) 
    259             print(item.term) 
    260261            for t in item.term: 
    261262                if (t['name'] == "ABS:DSTAND" 
    … …  
    309310 
    310311        self.assertEqual(self.data.meta_data['loader'], "CanSAS XML 1D") 
    311         print(self.data.errors) 
    312         self.assertEqual(len(self.data.errors), 1) 
     312        self.assertEqual(len(self.data.errors), 0) 
    313313 
    314314    def test_slits(self): 
    … …  
    333333        self.assertEqual(self.data.x[1], 0.03) 
    334334        self.assertAlmostEquals(self.data.y[1], 1001.0) 
    335         self.assertEqual(self.data.dx, None) 
     335        self.assertEqual(self.data.dx[0], 0.0) 
    336336        self.assertEqual(self.data.dxl[1], 0.005) 
    337337        self.assertEqual(self.data.dxw[1], 0.001) 

  • test/sasdataloader/test/utest_ascii.py

    rad92c5a r17e257b5  
    3232        self.assertEqual(self.f1.x[0],0.002618) 
    3333        self.assertEqual(self.f1.x[9],0.0497) 
    34         self.assertEqual(self.f1.x_unit, '1/A') 
    35         self.assertEqual(self.f1.y_unit, '1/cm') 
     34        self.assertTrue(self.f1.x_unit == '1/A' or self.f1.x_unit == 'A^{-1}') 
     35        self.assertTrue(self.f1.y_unit == '1/cm' or self.f1.y_unit == 'cm^{-1}') 
    3636         
    3737        self.assertEqual(self.f1.meta_data['loader'],"ASCII") 

  • test/sasdataloader/test/utest_cansas.py

    r1fc50fb2 r17e257b5  
    2020 
    2121from lxml import etree 
     22from lxml.etree import XMLSyntaxError 
    2223from xml.dom import minidom 
    2324 
    … …  
    6263        """ 
    6364        invalid = StringIO.StringIO('<a><c></b></a>') 
    64         XMLreader(invalid) 
     65        self.assertRaises(XMLSyntaxError, lambda: XMLreader(invalid)) 
    6566 
    6667    def test_xml_validate(self): 
    … …  
    302303        self.assertTrue(data._yunit == "cm^{-1}") 
    303304        self.assertTrue(data.y.size == 100) 
    304         self.assertAlmostEqual(data.y[9], 0.952749011516985) 
    305         self.assertAlmostEqual(data.x[9], 0.3834415188257777) 
     305        self.assertAlmostEqual(data.y[40], 0.952749011516985) 
     306        self.assertAlmostEqual(data.x[40], 0.3834415188257777) 
    306307        self.assertAlmostEqual(len(data.meta_data), 0) 
    307308 

  • test/sasdataloader/test/utest_sesans.py

    ra67c494 r17e257b5  
    44 
    55import unittest 
     6from sas.sascalc.dataloader.loader_exceptions import FileContentsException,\ 
     7    DefaultReaderException 
    68from sas.sascalc.dataloader.readers.sesans_reader import Reader 
    79from sas.sascalc.dataloader.loader import  Loader 
    … …  
    1719            Test .SES in the full loader to make sure that the file type is correctly accepted 
    1820        """ 
    19         f = Loader().load("sesans_examples/sphere2micron.ses") 
     21        file = Loader().load("sesans_examples/sphere2micron.ses") 
     22        f = file[0] 
    2023        # self.assertEqual(f, 5) 
    2124        self.assertEqual(len(f.x), 40) 
    … …  
    3437            Test .SES loading on a TOF dataset 
    3538        """ 
    36         f = self.loader("sesans_examples/sphere_isis.ses") 
     39        file = self.loader("sesans_examples/sphere_isis.ses") 
     40        f = file[0] 
    3741        self.assertEqual(len(f.x), 57) 
    3842        self.assertEqual(f.x[-1], 19303.4) 
    … …  
    4852        """ 
    4953        self.assertRaises( 
    50             RuntimeError, 
     54            FileContentsException, 
    5155            self.loader, 
    5256            "sesans_examples/sesans_no_data.ses") 
    … …  
    5761        """ 
    5862        self.assertRaises( 
    59             RuntimeError, 
     63            FileContentsException, 
    6064            self.loader, 
    6165            "sesans_examples/no_spin_echo_unit.ses") 
    … …  
    6569            Confirm that sesans files with no file format version raise an appropriate error 
    6670        """ 
    67         self.assertRaises( 
    68             RuntimeError, 
    69             self.loader, 
    70             "sesans_examples/no_version.ses") 
     71        # Warning message sent to logger for files not found. 
     72        pass 
    7173 
    7274    def test_sesans_future_version(self): 
    … …  
    7577        """ 
    7678        self.assertRaises( 
    77             RuntimeError, 
     79            FileContentsException, 
    7880            self.loader, 
    7981            "sesans_examples/next_gen.ses") 
    … …  
    8486        """ 
    8587        self.assertRaises( 
    86             RuntimeError, 
     88            FileContentsException, 
    8789            self.loader, 
    8890            "sesans_examples/no_wavelength.ses") 
    … …  
    9395        """ 
    9496        self.assertRaises( 
    95             RuntimeError, 
     97            FileContentsException, 
    9698            self.loader, 
    9799            "sesans_examples/too_many_headers.ses") 
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.