source: sasview/setup.py @ 0438933

ESS_GUIESS_GUI_DocsESS_GUI_batch_fittingESS_GUI_bumps_abstractionESS_GUI_iss1116ESS_GUI_iss879ESS_GUI_iss959ESS_GUI_openclESS_GUI_orderingESS_GUI_sync_sascalccostrafo411magnetic_scattrelease-4.1.1release-4.1.2release-4.2.2release_4.0.1ticket-1009ticket-1094-headlessticket-1242-2d-resolutionticket-1243ticket-1249ticket885unittest-saveload
Last change on this file since 0438933 was 8969521, checked in by Mathieu Doucet <doucetm@…>, 13 years ago

Re #7 compile with openmp
  • Property mode set to 100644
File size: 10.4 KB
Line 
1"""
2    Setup for SansView
3    #TODO: Add checks to see that all the dependencies are on the system
4"""
5import sys
6import os
7#from distutils.core import setup, Extension
8from setuptools import setup, Extension, find_packages
9try:
10    from numpy.distutils.misc_util import get_numpy_include_dirs
11    NUMPY_INC = get_numpy_include_dirs()[0]
12except:
13    try:
14        import numpy
15        NUMPY_INC = os.path.join(os.path.split(numpy.__file__)[0],"core","include")
16    except:
17        print "\nNumpy is needed to build SansView. Try easy_install numpy.\n  %s" % str(sys.exc_value)
18        sys.exit(0)
19
20package_dir = {}
21package_data = {}
22packages = []
23ext_modules = []
24
25# TODO check for sans/__init__.py
26
27# Enable OpenMP
28extra_compile_args = []
29extra_link_args = []
30if not os.name=='nt':
31    extra_compile_args = ['-fopenmp']
32    extra_link_args = ['-lgomp']
33else:
34    extra_compile_args = ['/openmp']
35
36# sans.invariant
37package_dir["sans.invariant"] = "sansinvariant/src/sans/invariant"
38packages.extend(["sans.invariant"])
39
40# sans.guiframe
41guiframe_path = os.path.join("sansguiframe", "src", "sans", "guiframe")
42package_dir["sans.guiframe"] = guiframe_path
43package_dir["sans.guiframe.local_perspectives"] = os.path.join(guiframe_path, "local_perspectives")
44package_data["sans.guiframe"] = ['images/*', 'media/*']
45packages.extend(["sans.guiframe", "sans.guiframe.local_perspectives"])
46# build local plugin
47for dir in os.listdir(os.path.join(guiframe_path, "local_perspectives")):
48    if dir not in ['.svn','__init__.py', '__init__.pyc']:
49        package_name = "sans.guiframe.local_perspectives." + dir
50        packages.append(package_name)
51        package_dir[package_name] = os.path.join(guiframe_path, "local_perspectives", dir)
52
53# sans.dataloader
54package_dir["sans.dataloader"] = os.path.join("sansdataloader", "src", "sans", "dataloader")
55package_data["sans.dataloader.readers"] = ['defaults.xml']
56packages.extend(["sans.dataloader","sans.dataloader.readers"])
57
58# sans.calculator
59package_dir["sans.calculator"] = "sanscalculator/src/sans/calculator"
60packages.extend(["sans.calculator"])
61   
62# sans.pr
63numpy_incl_path = os.path.join(NUMPY_INC, "numpy")
64srcdir  = os.path.join("pr_inversion", "src", "sans", "pr", "c_extensions")
65
66
67   
68package_dir["sans.pr.core"] = srcdir
69package_dir["sans.pr"] = os.path.join("pr_inversion", "src","sans", "pr")
70packages.extend(["sans.pr","sans.pr.core"])
71ext_modules.append( Extension("sans.pr.core.pr_inversion",
72                              sources = [ os.path.join(srcdir, "Cinvertor.c"),
73                                         os.path.join(srcdir, "invertor.c"),
74                                         ],
75                              include_dirs=[numpy_incl_path],
76                              extra_compile_args=extra_compile_args,
77                              extra_link_args=extra_link_args                             
78                              ) )
79       
80# sans.fit (park integration)
81package_dir["sans.fit"] = "park_integration/src/sans/fit"
82packages.append("sans.fit")
83
84# inversion view
85package_dir["sans.perspectives"] = "inversionview/src/sans/perspectives"
86package_dir["sans.perspectives.pr"] = "inversionview/src/sans/perspectives/pr"
87packages.extend(["sans.perspectives","sans.perspectives.pr"])
88package_data["sans.perspectives.pr"] = ['images/*']
89
90# Invariant view
91package_dir["sans.perspectives"] = os.path.join("invariantview", "src", "sans", "perspectives")
92package_dir["sans.perspectives.invariant"] = os.path.join("invariantview", "src", "sans", "perspectives", "invariant")
93               
94package_data['sans.perspectives.invariant'] = [os.path.join("media",'*')]
95packages.extend(["sans.perspectives","sans.perspectives.invariant"]) 
96
97# Fitting view
98package_dir["sans.perspectives"] = os.path.join("fittingview", "src", "sans", "perspectives"),
99package_dir["sans.perspectives.fitting"] = os.path.join("fittingview", "src", "sans", "perspectives", "fitting")
100package_data['sans.perspectives.fitting'] = ['media/*']
101packages.extend(["sans.perspectives", "sans.perspectives.fitting"])
102
103# Calculator view
104package_dir["sans.perspectives"] = "calculatorview/src/sans/perspectives"
105package_dir["sans.perspectives.calculator"] = os.path.join("calculatorview", "src", "sans", "perspectives", "calculator")
106package_data['sans.perspectives.calculator'] = ['images/*', 'media/*']
107packages.extend(["sans.perspectives", "sans.perspectives.calculator"])
108     
109# Data util
110package_dir["data_util"] = "sansutil"
111packages.extend(["data_util"])
112
113# Plottools
114package_dir["danse"] = os.path.join("plottools", "src", "danse")
115package_dir["danse.common"] = os.path.join("plottools", "src", "danse", "common")
116package_dir["danse.common.plottools"] = os.path.join("plottools", "src", "danse", "common", "plottools")
117packages.extend(["danse", "danse.common", "danse.common.plottools"])
118
119# Park 1.2.1
120package_dir["park"]="park-1.2.1/park"
121packages.extend(["park"])
122package_data["park"] = ['park-1.2.1/*.txt', 'park-1.2.1/park.epydoc']
123ext_modules.append( Extension("park._modeling",
124                              sources = [ os.path.join("park-1.2.1", "park", "lib", "modeling.cc"),
125                                         os.path.join("park-1.2.1", "park", "lib", "resolution.c"),
126                                         ],
127                              extra_compile_args=extra_compile_args,
128                              extra_link_args=extra_link_args
129                              ) )
130
131# Sans models
132srcdir  = os.path.join("sansmodels", "src", "sans", "models", "c_extensions")
133igordir = os.path.join("sansmodels", "src","sans", "models", "libigor")
134c_model_dir = os.path.join("sansmodels", "src", "sans", "models", "c_models")
135smear_dir  = os.path.join("sansmodels", "src", "sans", "models", "c_smearer")
136
137IGNORED_FILES = ["a.exe",
138                 "__init__.py"
139                 ".svn",
140                   "lineparser.py",
141                   "run.py",
142                   "CGaussian.cpp",
143                   "CLogNormal.cpp",
144                   "CLorentzian.cpp",
145                   "CSchulz.cpp",
146                   "WrapperGenerator.py",
147                   "wrapping.py"
148                   ]
149
150if not os.name=='nt':
151    IGNORED_FILES.extend(["gamma_win.c","winFuncs.c"])
152
153
154EXTENSIONS = [".c", ".cpp"]
155
156def append_file(file_list, dir_path):
157    """
158    Add sources file to sources
159    """
160    for f in os.listdir(dir_path):
161        if os.path.isfile(os.path.join(dir_path, f)):
162            _, ext = os.path.splitext(f)
163            if ext.lower() in EXTENSIONS and f not in IGNORED_FILES:
164                file_list.append(os.path.join(dir_path, f)) 
165        elif os.path.isdir(os.path.join(dir_path, f)) and \
166                not f.startswith("."):
167            sub_dir = os.path.join(dir_path, f)
168            for new_f in os.listdir(sub_dir):
169                if os.path.isfile(os.path.join(sub_dir, new_f)):
170                    _, ext = os.path.splitext(new_f)
171                    if ext.lower() in EXTENSIONS and\
172                         new_f not in IGNORED_FILES:
173                        file_list.append(os.path.join(sub_dir, new_f)) 
174       
175model_sources = []
176append_file(file_list=model_sources, dir_path=srcdir)
177append_file(file_list=model_sources, dir_path=igordir)
178append_file(file_list=model_sources, dir_path=c_model_dir)
179smear_sources = []
180append_file(file_list=smear_sources, dir_path=smear_dir)
181
182
183package_dir["sans"] = os.path.join("sansmodels", "src", "sans")
184package_dir["sans.models"] = os.path.join("sansmodels", "src", "sans", "models")
185package_dir["sans.models.sans_extension"] = srcdir
186           
187package_data['sans.models'] = [os.path.join('media', "*")]
188packages.extend(["sans","sans.models","sans.models.sans_extension"])
189   
190smearer_sources = [os.path.join(smear_dir, "smearer.cpp"),
191                  os.path.join(smear_dir, "smearer_module.cpp")]
192
193if os.name=='nt':
194    smearer_sources.append(os.path.join(igordir, "winFuncs.c"))
195
196ext_modules.extend( [ Extension("sans.models.sans_extension.c_models",
197                                sources=model_sources,                 
198                                include_dirs=[igordir, srcdir, c_model_dir, numpy_incl_path],
199                                extra_compile_args=extra_compile_args,
200                                extra_link_args=extra_link_args
201                                ),       
202                    # Smearer extension
203                    Extension("sans.models.sans_extension.smearer",
204                              sources = smearer_sources,
205                              include_dirs=[igordir, smear_dir, numpy_incl_path],
206                              extra_compile_args=extra_compile_args,
207                              extra_link_args=extra_link_args
208                              ),
209                   
210                    Extension("sans.models.sans_extension.smearer2d_helper",
211                              sources = [os.path.join(smear_dir, 
212                                                      "smearer2d_helper_module.cpp"),
213                                         os.path.join(smear_dir, "smearer2d_helper.cpp"),],
214                              include_dirs=[smear_dir,numpy_incl_path],
215                              extra_compile_args=extra_compile_args,
216                              extra_link_args=extra_link_args
217                              )
218                    ] )
219       
220# SansView
221package_dir["sans.sansview"] = "sansview"
222package_data['sans.sansview'] = ['images/*', 'media/*', 'plugins/*', 'test/*']
223packages.append("sans.sansview")
224
225#required = ['lxml>=2.2.2', 'numpy>=1.4.1', 'matplotlib>=0.99.1.1', 'wxPython>=2.8.11',
226#            'pil','periodictable>=1.3.0', 'scipy>=0.7.2']
227required = ['lxml','periodictable>=1.3.0', 'unittest-xml-reporting']
228
229if os.name=='nt':
230    #required.extend(['comtypes', 'pisa', 'html5lib', 'reportlab'])
231    required.extend(['comtypes', 'pisa', 'html5lib'])
232else:
233    required.extend(['pil'])
234   
235 # Set up SansView   
236setup(
237    name="sansview",
238    version = "2.0.1",
239    description = "SansView application",
240    author = "University of Tennessee",
241    author_email = "sansdanse@gmail.com",
242    url = "http://danse.chem.utk.edu",
243    license = "PSF",
244    keywords = "small-angle neutron scattering analysis",
245    download_url = "https://sourceforge.net/projects/sansviewproject/files/",
246    package_dir = package_dir,
247    packages = packages,
248    package_data = package_data,
249    ext_modules = ext_modules,
250    install_requires = required,
251    zip_safe = False,
252    entry_points = {
253                    'console_scripts':[
254                                       "sansview = sans.sansview.sansview:run",
255                                       ]
256                    }
257    )   
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.