source: sasview/setup.py @ 29e96f3

ESS_GUIESS_GUI_DocsESS_GUI_batch_fittingESS_GUI_bumps_abstractionESS_GUI_iss1116ESS_GUI_iss879ESS_GUI_iss959ESS_GUI_openclESS_GUI_orderingESS_GUI_sync_sascalccostrafo411magnetic_scattrelease-4.1.1release-4.1.2release-4.2.2release_4.0.1ticket-1009ticket-1094-headlessticket-1242-2d-resolutionticket-1243ticket-1249ticket885unittest-saveload
Last change on this file since 29e96f3 was 29e96f3, checked in by Mathieu Doucet <doucetm@…>, 12 years ago

Re #7 compile with openmp
  • Property mode set to 100644
File size: 10.4 KB
Line 
1"""
2    Setup for SansView
3    #TODO: Add checks to see that all the dependencies are on the system
4"""
5import sys
6import os
7#from distutils.core import setup, Extension
8from setuptools import setup, Extension, find_packages
9try:
10    from numpy.distutils.misc_util import get_numpy_include_dirs
11    NUMPY_INC = get_numpy_include_dirs()[0]
12except:
13    try:
14        import numpy
15        NUMPY_INC = os.path.join(os.path.split(numpy.__file__)[0],"core","include")
16    except:
17        print "\nNumpy is needed to build SansView. Try easy_install numpy.\n  %s" % str(sys.exc_value)
18        sys.exit(0)
19
20package_dir = {}
21package_data = {}
22packages = []
23ext_modules = []
24
25# TODO check for sans/__init__.py
26
27# Enable OpenMP
28extra_compile_args = []
29extra_link_args = []
30if not os.name=='nt':
31    extra_compile_args = ['-fopenmp']
32    extra_link_args = ['-lgomp']
33
34# sans.invariant
35package_dir["sans.invariant"] = "sansinvariant/src/sans/invariant"
36packages.extend(["sans.invariant"])
37
38# sans.guiframe
39guiframe_path = os.path.join("sansguiframe", "src", "sans", "guiframe")
40package_dir["sans.guiframe"] = guiframe_path
41package_dir["sans.guiframe.local_perspectives"] = os.path.join(guiframe_path, "local_perspectives")
42package_data["sans.guiframe"] = ['images/*', 'media/*']
43packages.extend(["sans.guiframe", "sans.guiframe.local_perspectives"])
44# build local plugin
45for dir in os.listdir(os.path.join(guiframe_path, "local_perspectives")):
46    if dir not in ['.svn','__init__.py', '__init__.pyc']:
47        package_name = "sans.guiframe.local_perspectives." + dir
48        packages.append(package_name)
49        package_dir[package_name] = os.path.join(guiframe_path, "local_perspectives", dir)
50
51# sans.dataloader
52package_dir["sans.dataloader"] = os.path.join("sansdataloader", "src", "sans", "dataloader")
53package_data["sans.dataloader.readers"] = ['defaults.xml']
54packages.extend(["sans.dataloader","sans.dataloader.readers"])
55
56# sans.calculator
57package_dir["sans.calculator"] = "sanscalculator/src/sans/calculator"
58packages.extend(["sans.calculator"])
59   
60# sans.pr
61numpy_incl_path = os.path.join(NUMPY_INC, "numpy")
62srcdir  = os.path.join("pr_inversion", "src", "sans", "pr", "c_extensions")
63
64
65   
66package_dir["sans.pr.core"] = srcdir
67package_dir["sans.pr"] = os.path.join("pr_inversion", "src","sans", "pr")
68packages.extend(["sans.pr","sans.pr.core"])
69ext_modules.append( Extension("sans.pr.core.pr_inversion",
70                              sources = [ os.path.join(srcdir, "Cinvertor.c"),
71                                         os.path.join(srcdir, "invertor.c"),
72                                         ],
73                              include_dirs=[numpy_incl_path],
74                              extra_compile_args=extra_compile_args,
75                              extra_link_args=extra_link_args                             
76                              ) )
77       
78# sans.fit (park integration)
79package_dir["sans.fit"] = "park_integration/src/sans/fit"
80packages.append("sans.fit")
81
82# inversion view
83package_dir["sans.perspectives"] = "inversionview/src/sans/perspectives"
84package_dir["sans.perspectives.pr"] = "inversionview/src/sans/perspectives/pr"
85packages.extend(["sans.perspectives","sans.perspectives.pr"])
86package_data["sans.perspectives.pr"] = ['images/*']
87
88# Invariant view
89package_dir["sans.perspectives"] = os.path.join("invariantview", "src", "sans", "perspectives")
90package_dir["sans.perspectives.invariant"] = os.path.join("invariantview", "src", "sans", "perspectives", "invariant")
91               
92package_data['sans.perspectives.invariant'] = [os.path.join("media",'*')]
93packages.extend(["sans.perspectives","sans.perspectives.invariant"]) 
94
95# Fitting view
96package_dir["sans.perspectives"] = os.path.join("fittingview", "src", "sans", "perspectives"),
97package_dir["sans.perspectives.fitting"] = os.path.join("fittingview", "src", "sans", "perspectives", "fitting")
98package_data['sans.perspectives.fitting'] = ['media/*']
99packages.extend(["sans.perspectives", "sans.perspectives.fitting"])
100
101# Calculator view
102package_dir["sans.perspectives"] = "calculatorview/src/sans/perspectives"
103package_dir["sans.perspectives.calculator"] = os.path.join("calculatorview", "src", "sans", "perspectives", "calculator")
104package_data['sans.perspectives.calculator'] = ['images/*', 'media/*']
105packages.extend(["sans.perspectives", "sans.perspectives.calculator"])
106     
107# Data util
108package_dir["data_util"] = "sansutil"
109packages.extend(["data_util"])
110
111# Plottools
112package_dir["danse"] = os.path.join("plottools", "src", "danse")
113package_dir["danse.common"] = os.path.join("plottools", "src", "danse", "common")
114package_dir["danse.common.plottools"] = os.path.join("plottools", "src", "danse", "common", "plottools")
115packages.extend(["danse", "danse.common", "danse.common.plottools"])
116
117# Park 1.2.1
118package_dir["park"]="park-1.2.1/park"
119packages.extend(["park"])
120package_data["park"] = ['park-1.2.1/*.txt', 'park-1.2.1/park.epydoc']
121ext_modules.append( Extension("park._modeling",
122                              sources = [ os.path.join("park-1.2.1", "park", "lib", "modeling.cc"),
123                                         os.path.join("park-1.2.1", "park", "lib", "resolution.c"),
124                                         ],
125                              extra_compile_args=extra_compile_args,
126                              extra_link_args=extra_link_args
127                              ) )
128
129# Sans models
130srcdir  = os.path.join("sansmodels", "src", "sans", "models", "c_extensions")
131igordir = os.path.join("sansmodels", "src","sans", "models", "libigor")
132c_model_dir = os.path.join("sansmodels", "src", "sans", "models", "c_models")
133smear_dir  = os.path.join("sansmodels", "src", "sans", "models", "c_smearer")
134
135IGNORED_FILES = ["a.exe",
136                 "__init__.py"
137                 ".svn",
138                   "lineparser.py",
139                   "run.py",
140                   "CGaussian.cpp",
141                   "CLogNormal.cpp",
142                   "CLorentzian.cpp",
143                   "CSchulz.cpp",
144                   "WrapperGenerator.py",
145                   "wrapping.py"
146                   ]
147
148if not os.name=='nt':
149    IGNORED_FILES.extend(["gamma_win.c","winFuncs.c"])
150
151
152EXTENSIONS = [".c", ".cpp"]
153
154def append_file(file_list, dir_path):
155    """
156    Add sources file to sources
157    """
158    for f in os.listdir(dir_path):
159        if os.path.isfile(os.path.join(dir_path, f)):
160            _, ext = os.path.splitext(f)
161            if ext.lower() in EXTENSIONS and f not in IGNORED_FILES:
162                file_list.append(os.path.join(dir_path, f)) 
163        elif os.path.isdir(os.path.join(dir_path, f)) and \
164                not f.startswith("."):
165            sub_dir = os.path.join(dir_path, f)
166            for new_f in os.listdir(sub_dir):
167                if os.path.isfile(os.path.join(sub_dir, new_f)):
168                    _, ext = os.path.splitext(new_f)
169                    if ext.lower() in EXTENSIONS and\
170                         new_f not in IGNORED_FILES:
171                        file_list.append(os.path.join(sub_dir, new_f)) 
172       
173model_sources = []
174append_file(file_list=model_sources, dir_path=srcdir)
175append_file(file_list=model_sources, dir_path=igordir)
176append_file(file_list=model_sources, dir_path=c_model_dir)
177smear_sources = []
178append_file(file_list=smear_sources, dir_path=smear_dir)
179
180
181package_dir["sans"] = os.path.join("sansmodels", "src", "sans")
182package_dir["sans.models"] = os.path.join("sansmodels", "src", "sans", "models")
183package_dir["sans.models.sans_extension"] = srcdir
184           
185package_data['sans.models'] = [os.path.join('media', "*")]
186packages.extend(["sans","sans.models","sans.models.sans_extension"])
187   
188smearer_sources = [os.path.join(smear_dir, "smearer.cpp"),
189                  os.path.join(smear_dir, "smearer_module.cpp")]
190
191if os.name=='nt':
192    smearer_sources.append(os.path.join(igordir, "winFuncs.c"))
193
194ext_modules.extend( [ Extension("sans.models.sans_extension.c_models",
195                                sources=model_sources,                 
196                                include_dirs=[igordir, srcdir, c_model_dir, numpy_incl_path],
197                                extra_compile_args=extra_compile_args,
198                                extra_link_args=extra_link_args
199                                ),       
200                    # Smearer extension
201                    Extension("sans.models.sans_extension.smearer",
202                              sources = smearer_sources,
203                              include_dirs=[igordir, smear_dir, numpy_incl_path],
204                              extra_compile_args=extra_compile_args,
205                              extra_link_args=extra_link_args
206                              ),
207                   
208                    Extension("sans.models.sans_extension.smearer2d_helper",
209                              sources = [os.path.join(smear_dir, 
210                                                      "smearer2d_helper_module.cpp"),
211                                         os.path.join(smear_dir, "smearer2d_helper.cpp"),],
212                              include_dirs=[smear_dir,numpy_incl_path],
213                              extra_compile_args=extra_compile_args,
214                              extra_link_args=extra_link_args
215                              )
216                    ] )
217       
218# SansView
219package_dir["sans.sansview"] = "sansview"
220package_data['sans.sansview'] = ['images/*', 'media/*', 'plugins/*', 'test/*']
221packages.append("sans.sansview")
222
223#required = ['lxml>=2.2.2', 'numpy>=1.4.1', 'matplotlib>=0.99.1.1', 'wxPython>=2.8.11',
224#            'pil','periodictable>=1.3.0', 'scipy>=0.7.2']
225required = ['lxml','periodictable>=1.3.0', 'unittest-xml-reporting']
226
227if os.name=='nt':
228    #required.extend(['comtypes', 'pisa', 'html5lib', 'reportlab'])
229    required.extend(['comtypes', 'pisa', 'html5lib'])
230else:
231    required.extend(['pil'])
232   
233 # Set up SansView   
234setup(
235    name="sansview",
236    version = "2.0.1",
237    description = "SansView application",
238    author = "University of Tennessee",
239    author_email = "sansdanse@gmail.com",
240    url = "http://danse.chem.utk.edu",
241    license = "PSF",
242    keywords = "small-angle neutron scattering analysis",
243    download_url = "https://sourceforge.net/projects/sansviewproject/files/",
244    package_dir = package_dir,
245    packages = packages,
246    package_data = package_data,
247    ext_modules = ext_modules,
248    install_requires = required,
249    zip_safe = False,
250    entry_points = {
251                    'console_scripts':[
252                                       "sansview = sans.sansview.sansview:run",
253                                       ]
254                    }
255    )   
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.