source: sasview/sansview/perspectives/fitting/models.py @ 8a48713

ESS_GUIESS_GUI_DocsESS_GUI_batch_fittingESS_GUI_bumps_abstractionESS_GUI_iss1116ESS_GUI_iss879ESS_GUI_iss959ESS_GUI_openclESS_GUI_orderingESS_GUI_sync_sascalccostrafo411magnetic_scattrelease-4.1.1release-4.1.2release-4.2.2release_4.0.1ticket-1009ticket-1094-headlessticket-1242-2d-resolutionticket-1243ticket-1249ticket885unittest-saveload
Last change on this file since 8a48713 was 3b9e023, checked in by Gervaise Alina <gervyh@…>, 15 years ago

working on save dispersity

  • Property mode set to 100644
File size: 13.2 KB
Line 
1#TODO: add comments to document this module
2#TODO: clean-up the exception handling.
3#TODO: clean-up existing comments/documentation.
4#      For example, the _getModelList method advertises
5#      an 'id' parameter that is not part of the method's signature.
6#      It also advertises an ID as return value but it always returns zero.
7#TODO: clean-up the FractalAbsModel and PowerLawAbsModel menu items. Those
8#      model definitions do not belong here. They belong with the rest of the
9#      models.
10
11import wx
12import wx.lib.newevent
13import imp
14import os,sys,math
15import os.path
16
17(ModelEvent, EVT_MODEL) = wx.lib.newevent.NewEvent()
18
19# Time is needed by the log method
20import time
21
22# Explicitly import from the pluginmodel module so that py2exe
23# places it in the distribution. The Model1DPlugin class is used
24# as the base class of plug-in models.
25from sans.models.pluginmodel import Model1DPlugin
26   
27def log(message):
28    out = open("plugins.log", 'a')
29    out.write("%10g%s\n" % (time.clock(), message))
30    out.close()
31
32def findModels():
33    log("looking for models in: %s/plugins" % os.getcwd())
34    if os.path.isdir('plugins'):
35        return _findModels('plugins')
36    return []
37   
38def _findModels(dir):
39    # List of plugin objects
40    plugins = []
41    # Go through files in plug-in directory
42    try:
43        list = os.listdir(dir)
44        for item in list:
45            toks = os.path.splitext(os.path.basename(item))
46            if toks[1]=='.py' and not toks[0]=='__init__':
47                name = toks[0]
48           
49                path = [os.path.abspath(dir)]
50                file = None
51                try:
52                    (file, path, info) = imp.find_module(name, path)
53                    module = imp.load_module( name, file, item, info )
54                    if hasattr(module, "Model"):
55                        try:
56                            plugins.append(module.Model)
57                        except:
58                            log("Error accessing Model in %s\n  %s" % (name, sys.exc_value))
59                except:
60                    log("Error accessing Model in %s\n  %s" % (name, sys.exc_value))
61                finally:
62             
63                    if not file==None:
64                        file.close()
65    except:
66        # Don't deal with bad plug-in imports. Just skip.
67        pass
68    return plugins
69
70class ModelList(object):
71    """
72        Contains dictionary of model and their type
73    """
74    def __init__(self):
75        self.mydict={}
76       
77    def set_list(self, name, mylist):
78        """
79            @param name: the type of the list
80            @param mylist: the list to add
81        """
82        if name not in self.mydict.keys():
83            self.mydict[name] = mylist
84           
85           
86    def get_list(self):
87        """
88         return all the list stored in a dictionary object
89        """
90        return self.mydict
91       
92class ModelManager:
93    ## external dict for models
94    model_combobox = ModelList()
95    ## Dictionary of form models
96    form_factor_dict = {}
97    ## dictionary of other
98    struct_factor_dict = {}
99    ##list of form factors
100    shape_list =[]
101    ## independent shape model list
102    shape_indep_list = []
103    ##list of structure factors
104    struct_list= []
105    ##list of model allowing multiplication
106    multiplication_factor=[]
107    ## list of added models
108    plugins=[]
109    ## Event owner (guiframe)
110    event_owner = None
111   
112    def _getModelList(self):
113        """
114            List of models we want to make available by default
115            for this application
116           
117            @param id: first event ID to register the menu events with
118            @return: the next free event ID following the new menu events
119        """
120        ## form factor
121        from sans.models.SphereModel import SphereModel
122        self.shape_list.append(SphereModel)
123        self.multiplication_factor.append(SphereModel)
124       
125        from sans.models.CylinderModel import CylinderModel
126        self.shape_list.append(CylinderModel)
127        self.multiplication_factor.append(CylinderModel)
128       
129        #from sans.models.ParallelepipedModel import ParallelepipedModel
130        #self.shape_list.append(ParallelepipedModel)
131        #self.multiplication_factor.append(ParallelepipedModel)
132       
133        from sans.models.CoreShellModel import CoreShellModel
134        self.shape_list.append(CoreShellModel)
135       
136        from sans.models.CoreShellCylinderModel import CoreShellCylinderModel
137        self.shape_list.append(CoreShellCylinderModel)
138       
139        from sans.models.EllipticalCylinderModel import EllipticalCylinderModel
140        self.shape_list.append(EllipticalCylinderModel)
141       
142        from sans.models.EllipsoidModel import EllipsoidModel
143        self.shape_list.append(EllipsoidModel)
144        self.multiplication_factor.append(EllipsoidModel)
145         
146       
147       
148        ## Structure factor
149     
150        from sans.models.SquareWellStructure import SquareWellStructure
151        self.struct_list.append(SquareWellStructure)
152       
153        from sans.models.HardsphereStructure import HardsphereStructure
154        self.struct_list.append(HardsphereStructure)
155         
156        from sans.models.StickyHSStructure import StickyHSStructure
157        self.struct_list.append(StickyHSStructure)
158       
159        from sans.models.HayterMSAStructure import HayterMSAStructure
160        self.struct_list.append(HayterMSAStructure)
161       
162       
163        ##shape-independent models
164        from sans.models.BEPolyelectrolyte import BEPolyelectrolyte
165        self.shape_indep_list.append(BEPolyelectrolyte )
166        self.form_factor_dict[str(wx.NewId())] =  [SphereModel]
167        from sans.models.DABModel import DABModel
168        self.shape_indep_list.append(DABModel )
169       
170        from sans.models.GuinierModel import GuinierModel
171        self.shape_indep_list.append(GuinierModel )
172       
173        from sans.models.DebyeModel import DebyeModel
174        self.shape_indep_list.append(DebyeModel )
175       
176        from sans.models.PorodModel import PorodModel
177        self.shape_indep_list.append(PorodModel )
178       
179        from sans.models.LineModel import LineModel
180        self.shape_indep_list.append(LineModel)
181       
182        from sans.models.FractalModel import FractalModel
183        class FractalAbsModel(FractalModel):
184            def _Fractal(self, x):
185                return FractalModel._Fractal(self, math.fabs(x))
186        self.shape_indep_list.append(FractalAbsModel)
187       
188        from sans.models.LorentzModel import LorentzModel
189        self.shape_indep_list.append( LorentzModel) 
190           
191        from sans.models.PowerLawModel import PowerLawModel
192        class PowerLawAbsModel(PowerLawModel):
193            def _PowerLaw(self, x):
194                try:
195                    return PowerLawModel._PowerLaw(self, math.fabs(x))
196                except:
197                    print sys.exc_value 
198        self.shape_indep_list.append( PowerLawAbsModel )
199        from sans.models.TeubnerStreyModel import TeubnerStreyModel
200        self.shape_indep_list.append(TeubnerStreyModel )
201   
202        #Looking for plugins
203        self.plugins = findModels()
204       
205        return 0
206
207   
208    def populate_menu(self, modelmenu, event_owner):
209        """
210            Populate a menu with our models
211           
212            @param id: first menu event ID to use when binding the menu events
213            @param modelmenu: wx.Menu object to populate
214            @param event_owner: wx object to bind the menu events to
215            @return: the next free event ID following the new menu events
216        """
217        ## Fill model lists
218        self._getModelList()
219        ## store reference to model menu of guiframe
220        self.modelmenu = modelmenu
221        ## guiframe reference
222        self.event_owner = event_owner
223       
224       
225        shape_submenu = wx.Menu()
226        shape_indep_submenu = wx.Menu()
227        structure_factor = wx.Menu()
228        added_models = wx.Menu()
229        multip_models = wx.Menu()
230        ## create menu with shape
231        self._fill_simple_menu( menuinfo = ["Shapes",shape_submenu," simple shape"],
232                         list1 = self.shape_list )
233       
234        self._fill_simple_menu( menuinfo = ["Shape-Independent",shape_indep_submenu,
235                                    "List of shape-independent models"],
236                         list1 = self.shape_indep_list )
237       
238        self._fill_simple_menu( menuinfo= ["Structure Factors",structure_factor,
239                                          "List of Structure factors models" ],
240                                list1= self.struct_list )
241       
242        self._fill_simple_menu( menuinfo = ["Customized Models", added_models,
243                                            "List of additional models"],
244                                 list1= self.plugins )
245       
246        self._fill_menu(menuinfo=["P(Q)*S(Q)",multip_models,
247                                  "mulplication of 2 models"],
248                                   list1 = self.multiplication_factor ,
249                                   list2 =  self.struct_list)
250       
251       
252        return 0
253   
254    def _fill_simple_menu(self,menuinfo, list1):
255        """
256            Fill the menu with list item
257            @param modelmenu: the menu to fill
258            @param menuinfo: submenu item for the first column of this modelmenu
259                             with info.Should be a list :
260                             [name(string) , menu(wx.menu), help(string)]
261            @param list1: contains item (form factor )to fill modelmenu second column
262        """
263        if len(list1)>0:
264            self.model_combobox.set_list(menuinfo[0],list1)
265             
266            for item in list1:
267                id = wx.NewId() 
268                struct_factor=item()
269                struct_name = struct_factor.__class__.__name__
270                if hasattr(struct_factor, "name"):
271                    struct_name = struct_factor.name
272                   
273                menuinfo[1].Append(int(id),struct_name,struct_name)
274                if not  item in self.struct_factor_dict.itervalues():
275                    self.struct_factor_dict[str(id)]= item
276                wx.EVT_MENU(self.event_owner, int(id), self._on_model)
277               
278        id = wx.NewId()         
279        self.modelmenu.AppendMenu(id, menuinfo[0],menuinfo[1],menuinfo[2])
280       
281       
282       
283    def _fill_menu(self,menuinfo, list1,list2  ):
284        """
285            Fill the menu with list item
286            @param menuinfo: submenu item for the first column of this modelmenu
287                             with info.Should be a list :
288                             [name(string) , menu(wx.menu), help(string)]
289            @param list1: contains item (form factor )to fill modelmenu second column
290            @param list2: contains item (Structure factor )to fill modelmenu third column
291        """
292        if len(list1)>0:
293            self.model_combobox.set_list(menuinfo[0],list1)
294           
295            for item in list1:   
296                form_factor= item()
297                form_name = form_factor.__class__.__name__
298                if hasattr(form_factor, "name"):
299                    form_name = form_factor.name
300                ### store form factor to return to other users   
301                newmenu= wx.Menu()
302                if len(list2)>0:
303                    for model  in list2:
304                        id = wx.NewId()
305                        struct_factor = model()
306                        name = struct_factor.__class__.__name__
307                        if hasattr(struct_factor, "name"):
308                            name = struct_factor.name
309                        newmenu.Append(id,name, name)
310                        wx.EVT_MENU(self.event_owner, int(id), self._on_model)
311                        ## save form_fact and struct_fact
312                        self.form_factor_dict[int(id)] = [form_factor,struct_factor]
313                       
314                form_id= wx.NewId()   
315                menuinfo[1].AppendMenu(int(form_id), form_name,newmenu,menuinfo[2])
316        id=wx.NewId()
317        self.modelmenu.AppendMenu(id,menuinfo[0],menuinfo[1], menuinfo[2])
318       
319       
320       
321       
322    def _on_model(self, evt):
323        """
324            React to a model menu event
325            @param event: wx menu event
326        """
327        if int(evt.GetId()) in self.form_factor_dict.keys():
328            from sans.models.MultiplicationModel import MultiplicationModel
329            model1, model2 = self.form_factor_dict[int(evt.GetId())]
330            model = MultiplicationModel(model1, model2)
331               
332        else:
333            model= self.struct_factor_dict[str(evt.GetId())]()
334           
335        evt = ModelEvent( model= model )
336        wx.PostEvent(self.event_owner, evt)
337       
338    def get_model_list(self):   
339        """ @ return dictionary of models for fitpanel use """
340        self.model_combobox.set_list("multiplication", self.multiplication_factor)
341        return self.model_combobox
342   
343 
344       
345   
346   
347 
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.