source: sasview/sansview/perspectives/fitting/model_thread.py @ d16e396

ESS_GUIESS_GUI_DocsESS_GUI_batch_fittingESS_GUI_bumps_abstractionESS_GUI_iss1116ESS_GUI_iss879ESS_GUI_iss959ESS_GUI_openclESS_GUI_orderingESS_GUI_sync_sascalccostrafo411magnetic_scattrelease-4.1.1release-4.1.2release-4.2.2release_4.0.1ticket-1009ticket-1094-headlessticket-1242-2d-resolutionticket-1243ticket-1249ticket885unittest-saveload
Last change on this file since d16e396 was d16e396, checked in by Gervaise Alina <gervyh@…>, 15 years ago

cal2d range fixed
  • Property mode set to 100644
File size: 9.8 KB
Line 
1import time
2from calcthread import CalcThread
3import sys
4import numpy,math
5
6class Calc2D_all(CalcThread):
7    """
8        Compute 2D model
9        This calculation assumes a 2-fold symmetry of the model
10        where points are computed for one half of the detector
11        and I(qx, qy) = I(-qx, -qy) is assumed.
12    """
13   
14    def __init__(self, x, y, model,
15                 completefn = None,
16                 updatefn   = None,
17                 yieldtime  = 0.01,
18                 worktime   = 0.01
19                 ):
20        CalcThread.__init__(self,completefn,
21                 updatefn,
22                 yieldtime,
23                 worktime)
24       
25        self.x = x
26        self.y = y
27        self.model = model
28        self.starttime = 0
29       
30    def compute(self):
31        x = self.x
32        y = self.y
33        output = numpy.zeros((len(x),len(y)))
34           
35        self.starttime = time.time()
36        lx = len(self.x)
37       
38        #for i_x in range(int(len(self.x)/2)):
39        for i_x in range(len(self.x)):
40            if i_x%2==1:
41                continue
42           
43            # Check whether we need to bail out
44            self.update(output=output)
45            self.isquit()
46               
47            for i_y in range(len(self.y)):
48                value = self.model.runXY([self.x[i_x], self.y[i_y]])
49                output[i_y][i_x] = value
50                #output[lx-i_y-1][lx-i_x-1] = value
51               
52        if lx%2==1:
53            i_x = int(len(self.x)/2)
54            for i_y in range(len(self.y)):
55                value = self.model.runXY([self.x[i_x], self.y[i_y]])
56                output[i_y][i_x] = value
57               
58        #for i_x in range(int(len(self.x)/2)):
59        for i_x in range(len(self.x)):
60            if not i_x%2==1:
61                continue
62
63            # Check whether we need to bail out
64            self.update(output=output)
65            self.isquit()
66           
67            for i_y in range(len(self.y)):
68                value = self.model.runXY([self.x[i_x], self.y[i_y]])
69                output[i_y][i_x] = value
70                #output[lx-i_y-1][lx-i_x-1] = value
71           
72        elapsed = time.time()-self.starttime
73        self.complete(output=output, elapsed=elapsed)
74
75
76class Calc2D(CalcThread):
77    """
78        Compute 2D model
79        This calculation assumes a 2-fold symmetry of the model
80        where points are computed for one half of the detector
81        and I(qx, qy) = I(-qx, -qy) is assumed.
82    """
83   
84    def __init__(self, x, y, data,model,qmin, qmax,qstep,
85                 completefn = None,
86                 updatefn   = None,
87                 yieldtime  = 0.01,
88                 worktime   = 0.01
89                 ):
90        CalcThread.__init__(self,completefn,
91                 updatefn,
92                 yieldtime,
93                 worktime)
94        self.qmin= qmin
95        self.qmax= qmax
96        self.qstep= qstep
97        self.x = x
98        self.y = y
99        self.data= data
100        ## the model on to calculate
101        self.model = model
102        self.starttime = 0 
103       
104    def compute(self):
105        """
106            Compute the data given a model function
107        """
108        x = self.x
109        y = self.y
110        output = numpy.zeros((len(x),len(y)))
111        if self.qmin==None:
112            self.qmin = 0
113        if self.qmax== None:
114            if self.data ==None:
115                return
116            newx= math.pow(max(math.fabs(self.data.xmax),math.fabs(self.data.xmin)),2)
117            newy= math.pow(max(math.fabs(self.data.ymax),math.fabs(self.data.ymin)),2)
118            self.qmax=math.sqrt( newx + newy )
119       
120        self.starttime = time.time()
121        lx = len(self.x)
122        for i_x in range(len(self.x)):
123            # Check whether we need to bail out
124            self.update(output=output )
125            self.isquit()
126       
127            for i_y in range(int(len(self.y))):
128                radius = math.sqrt(self.x[i_x]*self.x[i_x]+self.y[i_y]*self.y[i_y])
129               
130                if  self.qmin <= radius and radius<= self.qmax:
131                    value = self.model.runXY( [self.x[i_x], self.y[i_y]] )
132                    output[i_y][i_x] =value   
133                else:
134                    output[i_y][i_x] =0   
135           
136        elapsed = time.time()-self.starttime
137        self.complete( image = output,
138                       data = self.data , 
139                       model = self.model,
140                       elapsed = elapsed,
141                       qmin = self.qmin,
142                       qmax =self.qmax,
143                       qstep = self.qstep )
144
145
146class Calc2D_4fold(CalcThread):
147    """
148        Compute 2D model
149        This calculation assumes a 4-fold symmetry of the model.
150        Really is the same calculation time since we have to
151        calculate points for 0<phi<pi anyway.
152    """
153   
154    def __init__(self, x, y, model,
155                 completefn = None,
156                 updatefn   = None,
157                 yieldtime  = 0.01,
158                 worktime   = 0.01
159                 ):
160        CalcThread.__init__(self,completefn,
161                 updatefn,
162                 yieldtime,
163                 worktime)
164        self.x = x
165        self.y = y
166        self.model = model
167        self.starttime = 0
168       
169    def compute(self):
170        x = self.x
171        y = self.y
172        output = numpy.zeros((len(x),len(y)))
173           
174        self.starttime = time.time()
175        lx = len(self.x)
176       
177        for i_x in range(int(len(self.x)/2)):
178            if i_x%2==1:
179                continue
180           
181            # Check whether we need to bail out
182            self.update(output=output)
183            self.isquit()
184               
185            for i_y in range(int(len(self.y)/2)):
186                value1 = self.model.runXY([self.x[i_x], self.y[i_y]])
187                value2 = self.model.runXY([self.x[i_x], self.y[lx-i_y-1]])
188                output[i_y][i_x] = value1 + value2
189                output[lx-i_y-1][lx-i_x-1] = value1 + value2
190                output[lx-i_y-1][i_x] = value1 + value2
191                output[i_y][lx-i_x-1] = value1 + value2
192               
193        if lx%2==1:
194            i_x = int(len(self.x)/2)
195            for i_y in range(int(len(self.y)/2)):
196                value1 = self.model.runXY([self.x[i_x], self.y[i_y]])
197                value2 = self.model.runXY([self.x[i_x], self.y[lx-i_y-1]])
198                output[i_y][i_x] = value1 + value2
199                output[lx-i_y-1][lx-i_x-1] = value1 + value2
200                output[lx-i_y-1][i_x] = value1 + value2
201                output[i_y][lx-i_x-1] = value1 + value2
202               
203        for i_x in range(int(len(self.x)/2)):
204            if not i_x%2==1:
205                continue
206
207            # Check whether we need to bail out
208            self.update(output=output)
209            self.isquit()
210           
211            for i_y in range(int(len(self.y)/2)):
212                value1 = self.model.runXY([self.x[i_x], self.y[i_y]])
213                value2 = self.model.runXY([self.x[i_x], self.y[lx-i_y-1]])
214                output[i_y][i_x] = value1 + value2
215                output[lx-i_y-1][lx-i_x-1] = value1 + value2
216                output[lx-i_y-1][i_x] = value1 + value2
217                output[i_y][lx-i_x-1] = value1 + value2
218           
219        elapsed = time.time()-self.starttime
220        self.complete(output=output, elapsed=elapsed)
221
222
223
224class Calc1D(CalcThread):
225    """Compute 1D data"""
226   
227    def __init__(self, x, model,
228                 data=None,
229                 qmin=None,
230                 qmax=None,
231                 smearer=None,
232                 completefn = None,
233                 updatefn   = None,
234                 yieldtime  = 0.01,
235                 worktime   = 0.01
236                 ):
237        CalcThread.__init__(self,completefn,
238                 updatefn,
239                 yieldtime,
240                 worktime)
241        self.x = x
242        self.data= data
243        self.qmin= qmin
244        self.qmax= qmax
245        self.model = model
246        self.smearer= smearer
247        self.starttime = 0
248       
249    def compute(self):
250        """
251            Compute model 1d value given qmin , qmax , x value
252        """
253        output = numpy.zeros(len(self.x))
254       
255        self.starttime = time.time()
256       
257        for i_x in range(len(self.x)):
258            self.update(x= self.x, output=output )
259            # Check whether we need to bail out
260            self.isquit()
261            if self.qmin <= self.x[i_x] and self.x[i_x] <= self.qmax:
262                value = self.model.run(self.x[i_x])
263                output[i_x] = value
264               
265        if self.smearer!=None:
266            output = self.smearer(output)
267           
268                     
269        elapsed = time.time()-self.starttime
270        self.complete(x= self.x, y= output, 
271                      elapsed=elapsed, model= self.model, data=self.data)
272       
273       
274
275class CalcCommandline:
276    def __init__(self, n=20000):
277        #print thread.get_ident()
278        from sans.models.CylinderModel import CylinderModel
279       
280        model = CylinderModel()
281       
282         
283        print model.runXY([0.01, 0.02])
284       
285        qmax = 0.01
286        qstep = 0.0001
287        self.done = False
288       
289        x = numpy.arange(-qmax, qmax+qstep*0.01, qstep)
290        y = numpy.arange(-qmax, qmax+qstep*0.01, qstep)
291   
292   
293        calc_thread_2D = Calc2D(x, y, None, model.clone(),-qmax, qmax,qstep,
294                                        completefn=self.complete,
295                                        updatefn=self.update ,
296                                        yieldtime=0.0)
297     
298        calc_thread_2D.queue()
299        calc_thread_2D.ready(2.5)
300       
301        while not self.done:
302            time.sleep(1)
303
304    def update(self,output):
305        print "update"
306
307    def complete(self, image, data, model, elapsed, qmin, qmax, qstep ):
308        print "complete"
309        self.done = True
310
311if __name__ == "__main__":
312    CalcCommandline()
313   
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.