source: sasview/sansview/perspectives/fitting/model_thread.py @ c9a4377

ESS_GUIESS_GUI_DocsESS_GUI_batch_fittingESS_GUI_bumps_abstractionESS_GUI_iss1116ESS_GUI_iss879ESS_GUI_iss959ESS_GUI_openclESS_GUI_orderingESS_GUI_sync_sascalccostrafo411magnetic_scattrelease-4.1.1release-4.1.2release-4.2.2release_4.0.1ticket-1009ticket-1094-headlessticket-1242-2d-resolutionticket-1243ticket-1249ticket885unittest-saveload
Last change on this file since c9a4377 was c9a4377, checked in by Gervaise Alina <gervyh@…>, 15 years ago

plotting range fixed
  • Property mode set to 100644
File size: 9.8 KB
Line 
1import time
2from calcthread import CalcThread
3import sys
4import numpy
5
6class Calc2D_all(CalcThread):
7    """
8        Compute 2D model
9        This calculation assumes a 2-fold symmetry of the model
10        where points are computed for one half of the detector
11        and I(qx, qy) = I(-qx, -qy) is assumed.
12    """
13   
14    def __init__(self, x, y, model,
15                 completefn = None,
16                 updatefn   = None,
17                 yieldtime  = 0.01,
18                 worktime   = 0.01
19                 ):
20        CalcThread.__init__(self,completefn,
21                 updatefn,
22                 yieldtime,
23                 worktime)
24       
25        self.x = x
26        self.y = y
27        self.model = model
28        self.starttime = 0
29       
30    def compute(self):
31        x = self.x
32        y = self.y
33        output = numpy.zeros((len(x),len(y)))
34           
35        self.starttime = time.time()
36        lx = len(self.x)
37       
38        #for i_x in range(int(len(self.x)/2)):
39        for i_x in range(len(self.x)):
40            if i_x%2==1:
41                continue
42           
43            # Check whether we need to bail out
44            self.update(output=output)
45            self.isquit()
46               
47            for i_y in range(len(self.y)):
48                value = self.model.runXY([self.x[i_x], self.y[i_y]])
49                output[i_y][i_x] = value
50                #output[lx-i_y-1][lx-i_x-1] = value
51               
52        if lx%2==1:
53            i_x = int(len(self.x)/2)
54            for i_y in range(len(self.y)):
55                value = self.model.runXY([self.x[i_x], self.y[i_y]])
56                output[i_y][i_x] = value
57               
58        #for i_x in range(int(len(self.x)/2)):
59        for i_x in range(len(self.x)):
60            if not i_x%2==1:
61                continue
62
63            # Check whether we need to bail out
64            self.update(output=output)
65            self.isquit()
66           
67            for i_y in range(len(self.y)):
68                value = self.model.runXY([self.x[i_x], self.y[i_y]])
69                output[i_y][i_x] = value
70                #output[lx-i_y-1][lx-i_x-1] = value
71           
72        elapsed = time.time()-self.starttime
73        self.complete(output=output, elapsed=elapsed)
74
75
76class Calc2D(CalcThread):
77    """
78        Compute 2D model
79        This calculation assumes a 2-fold symmetry of the model
80        where points are computed for one half of the detector
81        and I(qx, qy) = I(-qx, -qy) is assumed.
82    """
83   
84    def __init__(self, x, y, data,model,qmin, qmax,qstep,
85                 completefn = None,
86                 updatefn   = None,
87                 yieldtime  = 0.01,
88                 worktime   = 0.01
89                 ):
90        CalcThread.__init__(self,completefn,
91                 updatefn,
92                 yieldtime,
93                 worktime)
94        self.qmin= qmin
95        self.qmax= qmax
96        self.qstep= qstep
97        self.x = x
98        self.y = y
99        self.data= data
100        ## the model on to calculate
101        self.model = model
102        self.starttime = 0 
103       
104    def compute(self):
105        """
106            Compute the data given a model function
107        """
108        x = self.x
109        y = self.y
110        output = numpy.zeros((len(x),len(y)))
111        if self.qmin==None:
112            self.qmin = 0
113        if self.qmax== None:
114            if self.data ==None:
115                return
116            newx= math.pow(max(math.fabs(self.data.xmax),math.fabs(self.data.xmin)),2)
117            newy= math.pow(max(math.fabs(self.data.ymax),math.fabs(self.data.ymin)),2)
118            self.qmax=math.sqrt( newx + newy )
119       
120        self.starttime = time.time()
121       
122        lx = len(self.x)
123        for i_x in range(len(self.x)):
124            # Check whether we need to bail out
125            self.update(output=output )
126            self.isquit()
127       
128            for i_y in range(int(len(self.y))):
129                radius = self.x[i_x]*self.x[i_x]+self.y[i_y]*self.y[i_y]
130               
131                if  self.qmin <= radius and radius<= self.qmax:
132                    value = self.model.runXY( [self.x[i_x], self.y[i_y]] )
133                    output[i_y][i_x] =value   
134                else:
135                    output[i_y][i_x] =0   
136           
137        elapsed = time.time()-self.starttime
138        self.complete( image = output,
139                       data = self.data , 
140                       model = self.model,
141                       elapsed = elapsed,
142                       qmin = self.qmin,
143                       qmax =self.qmax,
144                       qstep = self.qstep )
145
146
147class Calc2D_4fold(CalcThread):
148    """
149        Compute 2D model
150        This calculation assumes a 4-fold symmetry of the model.
151        Really is the same calculation time since we have to
152        calculate points for 0<phi<pi anyway.
153    """
154   
155    def __init__(self, x, y, model,
156                 completefn = None,
157                 updatefn   = None,
158                 yieldtime  = 0.01,
159                 worktime   = 0.01
160                 ):
161        CalcThread.__init__(self,completefn,
162                 updatefn,
163                 yieldtime,
164                 worktime)
165        self.x = x
166        self.y = y
167        self.model = model
168        self.starttime = 0
169       
170    def compute(self):
171        x = self.x
172        y = self.y
173        output = numpy.zeros((len(x),len(y)))
174           
175        self.starttime = time.time()
176        lx = len(self.x)
177       
178        for i_x in range(int(len(self.x)/2)):
179            if i_x%2==1:
180                continue
181           
182            # Check whether we need to bail out
183            self.update(output=output)
184            self.isquit()
185               
186            for i_y in range(int(len(self.y)/2)):
187                value1 = self.model.runXY([self.x[i_x], self.y[i_y]])
188                value2 = self.model.runXY([self.x[i_x], self.y[lx-i_y-1]])
189                output[i_y][i_x] = value1 + value2
190                output[lx-i_y-1][lx-i_x-1] = value1 + value2
191                output[lx-i_y-1][i_x] = value1 + value2
192                output[i_y][lx-i_x-1] = value1 + value2
193               
194        if lx%2==1:
195            i_x = int(len(self.x)/2)
196            for i_y in range(int(len(self.y)/2)):
197                value1 = self.model.runXY([self.x[i_x], self.y[i_y]])
198                value2 = self.model.runXY([self.x[i_x], self.y[lx-i_y-1]])
199                output[i_y][i_x] = value1 + value2
200                output[lx-i_y-1][lx-i_x-1] = value1 + value2
201                output[lx-i_y-1][i_x] = value1 + value2
202                output[i_y][lx-i_x-1] = value1 + value2
203               
204        for i_x in range(int(len(self.x)/2)):
205            if not i_x%2==1:
206                continue
207
208            # Check whether we need to bail out
209            self.update(output=output)
210            self.isquit()
211           
212            for i_y in range(int(len(self.y)/2)):
213                value1 = self.model.runXY([self.x[i_x], self.y[i_y]])
214                value2 = self.model.runXY([self.x[i_x], self.y[lx-i_y-1]])
215                output[i_y][i_x] = value1 + value2
216                output[lx-i_y-1][lx-i_x-1] = value1 + value2
217                output[lx-i_y-1][i_x] = value1 + value2
218                output[i_y][lx-i_x-1] = value1 + value2
219           
220        elapsed = time.time()-self.starttime
221        self.complete(output=output, elapsed=elapsed)
222
223
224
225class Calc1D(CalcThread):
226    """Compute 1D data"""
227   
228    def __init__(self, x, model,
229                 data=None,
230                 qmin=None,
231                 qmax=None,
232                 smearer=None,
233                 completefn = None,
234                 updatefn   = None,
235                 yieldtime  = 0.01,
236                 worktime   = 0.01
237                 ):
238        CalcThread.__init__(self,completefn,
239                 updatefn,
240                 yieldtime,
241                 worktime)
242        self.x = x
243        self.data= data
244        self.qmin= qmin
245        self.qmax= qmax
246        self.model = model
247        self.smearer= smearer
248        self.starttime = 0
249       
250    def compute(self):
251        """
252            Compute model 1d value given qmin , qmax , x value
253        """
254        output = numpy.zeros(len(self.x))
255       
256        self.starttime = time.time()
257       
258        for i_x in range(len(self.x)):
259            self.update(x= self.x, output=output )
260            # Check whether we need to bail out
261            self.isquit()
262            if self.qmin <= self.x[i_x] and self.x[i_x] <= self.qmax:
263                value = self.model.run(self.x[i_x])
264                output[i_x] = value
265               
266        if self.smearer!=None:
267            output = self.smearer(output)
268           
269                     
270        elapsed = time.time()-self.starttime
271        self.complete(x= self.x, y= output, 
272                      elapsed=elapsed, model= self.model, data=self.data)
273       
274       
275
276class CalcCommandline:
277    def __init__(self, n=20000):
278        #print thread.get_ident()
279        from sans.models.CylinderModel import CylinderModel
280       
281        model = CylinderModel()
282       
283         
284        print model.runXY([0.01, 0.02])
285       
286        qmax = 0.01
287        qstep = 0.0001
288        self.done = False
289       
290        x = numpy.arange(-qmax, qmax+qstep*0.01, qstep)
291        y = numpy.arange(-qmax, qmax+qstep*0.01, qstep)
292   
293   
294        calc_thread_2D = Calc2D(x, y, None, model.clone(),-qmax, qmax,qstep,
295                                        completefn=self.complete,
296                                        updatefn=self.update ,
297                                        yieldtime=0.0)
298     
299        calc_thread_2D.queue()
300        calc_thread_2D.ready(2.5)
301       
302        while not self.done:
303            time.sleep(1)
304
305    def update(self,output):
306        print "update"
307
308    def complete(self, image, data, model, elapsed, qmin, qmax, qstep ):
309        print "complete"
310        self.done = True
311
312if __name__ == "__main__":
313    CalcCommandline()
314   
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.