source: sasview/sansmodels/src/sans/models/c_models/CTriaxialEllipsoidModel.cpp @ 2e38ebb

ESS_GUIESS_GUI_DocsESS_GUI_batch_fittingESS_GUI_bumps_abstractionESS_GUI_iss1116ESS_GUI_iss879ESS_GUI_iss959ESS_GUI_openclESS_GUI_orderingESS_GUI_sync_sascalccostrafo411magnetic_scattrelease-4.1.1release-4.1.2release-4.2.2release_4.0.1ticket-1009ticket-1094-headlessticket-1242-2d-resolutionticket-1243ticket-1249ticket885unittest-saveload
Last change on this file since 2e38ebb was 71e2de7, checked in by Gervaise Alina <gervyh@…>, 15 years ago

change destructor for models
  • Property mode set to 100644
File size: 23.8 KB
Line 
1/**
2        This software was developed by the University of Tennessee as part of the
3        Distributed Data Analysis of Neutron Scattering Experiments (DANSE)
4        project funded by the US National Science Foundation.
5
6        If you use DANSE applications to do scientific research that leads to
7        publication, we ask that you acknowledge the use of the software with the
8        following sentence:
9
10        "This work benefited from DANSE software developed under NSF award DMR-0520547."
11
12        copyright 2008, University of Tennessee
13 */
14
15/** CTriaxialEllipsoidModel
16 *
17 * C extension
18 *
19 * WARNING: THIS FILE WAS GENERATED BY WRAPPERGENERATOR.PY
20 *          DO NOT MODIFY THIS FILE, MODIFY triaxial_ellipsoid.h
21 *          AND RE-RUN THE GENERATOR SCRIPT
22 *
23 */
24#define NO_IMPORT_ARRAY
25#define PY_ARRAY_UNIQUE_SYMBOL PyArray_API_sans
26 
27extern "C" {
28#include <Python.h>
29#include <arrayobject.h>
30#include "structmember.h"
31#include <stdio.h>
32#include <stdlib.h>
33#include <math.h>
34#include <time.h>
35#include "triaxial_ellipsoid.h"
36}
37
38#include "models.hh"
39#include "dispersion_visitor.hh"
40
41/// Error object for raised exceptions
42static PyObject * CTriaxialEllipsoidModelError = NULL;
43
44
45// Class definition
46typedef struct {
47    PyObject_HEAD
48    /// Parameters
49    PyObject * params;
50    /// Dispersion parameters
51    PyObject * dispersion;
52    /// Underlying model object
53    TriaxialEllipsoidModel * model;
54    /// Log for unit testing
55    PyObject * log;
56} CTriaxialEllipsoidModel;
57
58
59static void
60CTriaxialEllipsoidModel_dealloc(CTriaxialEllipsoidModel* self)
61{
62    Py_DECREF(self->params);
63    Py_DECREF(self->dispersion);
64    Py_DECREF(self->log);
65    delete self->model;
66    self->ob_type->tp_free((PyObject*)self);
67   
68
69}
70
71static PyObject *
72CTriaxialEllipsoidModel_new(PyTypeObject *type, PyObject *args, PyObject *kwds)
73{
74    CTriaxialEllipsoidModel *self;
75   
76    self = (CTriaxialEllipsoidModel *)type->tp_alloc(type, 0);
77   
78    return (PyObject *)self;
79}
80
81static int
82CTriaxialEllipsoidModel_init(CTriaxialEllipsoidModel *self, PyObject *args, PyObject *kwds)
83{
84    if (self != NULL) {
85       
86        // Create parameters
87        self->params = PyDict_New();
88        self->dispersion = PyDict_New();
89        self->model = new TriaxialEllipsoidModel();
90       
91        // Initialize parameter dictionary
92        PyDict_SetItemString(self->params,"scale",Py_BuildValue("d",1.000000));
93        PyDict_SetItemString(self->params,"axis_psi",Py_BuildValue("d",0.000000));
94        PyDict_SetItemString(self->params,"axis_theta",Py_BuildValue("d",1.000000));
95        PyDict_SetItemString(self->params,"semi_axisA",Py_BuildValue("d",35.000000));
96        PyDict_SetItemString(self->params,"semi_axisB",Py_BuildValue("d",100.000000));
97        PyDict_SetItemString(self->params,"semi_axisC",Py_BuildValue("d",400.000000));
98        PyDict_SetItemString(self->params,"axis_phi",Py_BuildValue("d",1.000000));
99        PyDict_SetItemString(self->params,"background",Py_BuildValue("d",0.000000));
100        PyDict_SetItemString(self->params,"contrast",Py_BuildValue("d",0.000005));
101        // Initialize dispersion / averaging parameter dict
102        DispersionVisitor* visitor = new DispersionVisitor();
103        PyObject * disp_dict;
104        disp_dict = PyDict_New();
105        self->model->axis_theta.dispersion->accept_as_source(visitor, self->model->axis_theta.dispersion, disp_dict);
106        PyDict_SetItemString(self->dispersion, "axis_theta", disp_dict);
107        disp_dict = PyDict_New();
108        self->model->axis_phi.dispersion->accept_as_source(visitor, self->model->axis_phi.dispersion, disp_dict);
109        PyDict_SetItemString(self->dispersion, "axis_phi", disp_dict);
110        disp_dict = PyDict_New();
111        self->model->axis_psi.dispersion->accept_as_source(visitor, self->model->axis_psi.dispersion, disp_dict);
112        PyDict_SetItemString(self->dispersion, "axis_psi", disp_dict);
113
114
115         
116        // Create empty log
117        self->log = PyDict_New();
118       
119       
120
121    }
122    return 0;
123}
124
125static PyMemberDef CTriaxialEllipsoidModel_members[] = {
126    {"params", T_OBJECT, offsetof(CTriaxialEllipsoidModel, params), 0,
127     "Parameters"},
128        {"dispersion", T_OBJECT, offsetof(CTriaxialEllipsoidModel, dispersion), 0,
129          "Dispersion parameters"},     
130    {"log", T_OBJECT, offsetof(CTriaxialEllipsoidModel, log), 0,
131     "Log"},
132    {NULL}  /* Sentinel */
133};
134
135/** Read double from PyObject
136    @param p PyObject
137    @return double
138*/
139double CTriaxialEllipsoidModel_readDouble(PyObject *p) {
140    if (PyFloat_Check(p)==1) {
141        return (double)(((PyFloatObject *)(p))->ob_fval);
142    } else if (PyInt_Check(p)==1) {
143        return (double)(((PyIntObject *)(p))->ob_ival);
144    } else if (PyLong_Check(p)==1) {
145        return (double)PyLong_AsLong(p);
146    } else {
147        return 0.0;
148    }
149}
150/**
151 * Function to call to evaluate model
152 * @param args: input numpy array q[]
153 * @return: numpy array object
154 */
155 
156static PyObject *evaluateOneDim(TriaxialEllipsoidModel* model, PyArrayObject *q){
157    PyArrayObject *result;
158   
159    // Check validity of array q , q must be of dimension 1, an array of double
160    if (q->nd != 1 || q->descr->type_num != PyArray_DOUBLE)
161    {
162        //const char * message= "Invalid array: q->nd=%d,type_num=%d\n",q->nd,q->descr->type_num;
163        //PyErr_SetString(PyExc_ValueError , message);
164        return NULL;
165    }
166    result = (PyArrayObject *)PyArray_FromDims(q->nd, (int *)(q->dimensions), 
167                                                                                  PyArray_DOUBLE);
168        if (result == NULL) {
169        const char * message= "Could not create result ";
170        PyErr_SetString(PyExc_RuntimeError , message);
171                return NULL;
172        }
173         for (int i = 0; i < q->dimensions[0]; i++){
174      double q_value  = *(double *)(q->data + i*q->strides[0]);
175      double *result_value = (double *)(result->data + i*result->strides[0]);
176      *result_value =(*model)(q_value);
177        }
178    return PyArray_Return(result); 
179 }
180
181 /**
182 * Function to call to evaluate model
183 * @param args: input numpy array  [x[],y[]]
184 * @return: numpy array object
185 */
186 static PyObject * evaluateTwoDimXY( TriaxialEllipsoidModel* model, 
187                              PyArrayObject *x, PyArrayObject *y)
188 {
189    PyArrayObject *result;
190    int i,j, x_len, y_len, dims[2];
191    //check validity of input vectors
192    if (x->nd != 2 || x->descr->type_num != PyArray_DOUBLE
193        || y->nd != 2 || y->descr->type_num != PyArray_DOUBLE
194        || y->dimensions[1] != x->dimensions[0]){
195        const char * message= "evaluateTwoDimXY  expect 2 numpy arrays";
196        PyErr_SetString(PyExc_ValueError , message); 
197        return NULL;
198    }
199   
200        if (PyArray_Check(x) && PyArray_Check(y)) {
201               
202            x_len = dims[1]= x->dimensions[1];
203        y_len = dims[0]= y->dimensions[0];
204           
205            // Make a new double matrix of same dims
206        result=(PyArrayObject *) PyArray_FromDims(2,dims,NPY_DOUBLE);
207        if (result == NULL){
208            const char * message= "Could not create result ";
209        PyErr_SetString(PyExc_RuntimeError , message);
210            return NULL;
211            }
212       
213        /* Do the calculation. */
214        for ( j=0; j< y_len; j++) {
215            for ( i=0; i< x_len; i++) {
216                double x_value = *(double *)(x->data + i*x->strides[1]);
217                    double y_value = *(double *)(y->data + j*y->strides[0]);
218                        double *result_value = (double *)(result->data +
219                              j*result->strides[0] + i*result->strides[1]);
220                        *result_value = (*model)(x_value, y_value);
221            }           
222        }
223        return PyArray_Return(result); 
224       
225        }else{
226                    PyErr_SetString(CTriaxialEllipsoidModelError, 
227                   "CTriaxialEllipsoidModel.evaluateTwoDimXY couldn't run.");
228                return NULL;
229                }       
230}
231/**
232 *  evalDistribution function evaluate a model function with input vector
233 *  @param args: input q as vector or [qx, qy] where qx, qy are vectors
234 *
235 */ 
236static PyObject * evalDistribution(CTriaxialEllipsoidModel *self, PyObject *args){
237        PyObject *qx, *qy;
238        PyArrayObject * pars;
239        int npars ,mpars;
240       
241        // Get parameters
242       
243            // Reader parameter dictionary
244    self->model->scale = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "scale") );
245    self->model->axis_psi = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "axis_psi") );
246    self->model->axis_theta = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "axis_theta") );
247    self->model->semi_axisA = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "semi_axisA") );
248    self->model->semi_axisB = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "semi_axisB") );
249    self->model->semi_axisC = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "semi_axisC") );
250    self->model->axis_phi = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "axis_phi") );
251    self->model->background = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "background") );
252    self->model->contrast = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "contrast") );
253    // Read in dispersion parameters
254    PyObject* disp_dict;
255    DispersionVisitor* visitor = new DispersionVisitor();
256    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "axis_theta");
257    self->model->axis_theta.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->axis_theta.dispersion, disp_dict);
258    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "axis_phi");
259    self->model->axis_phi.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->axis_phi.dispersion, disp_dict);
260    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "axis_psi");
261    self->model->axis_psi.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->axis_psi.dispersion, disp_dict);
262
263       
264        // Get input and determine whether we have to supply a 1D or 2D return value.
265        if ( !PyArg_ParseTuple(args,"O",&pars) ) {
266            PyErr_SetString(CTriaxialEllipsoidModelError, 
267                "CTriaxialEllipsoidModel.evalDistribution expects a q value.");
268                return NULL;
269        }
270    // Check params
271       
272    if(PyArray_Check(pars)==1) {
273               
274            // Length of list should 1 or 2
275            npars = pars->nd; 
276            if(npars==1) {
277                // input is a numpy array
278                if (PyArray_Check(pars)) {
279                        return evaluateOneDim(self->model, (PyArrayObject*)pars); 
280                    }
281                }else{
282                    PyErr_SetString(CTriaxialEllipsoidModelError, 
283                   "CTriaxialEllipsoidModel.evalDistribution expect numpy array of one dimension.");
284                return NULL;
285                }
286    }else if( PyList_Check(pars)==1) {
287        // Length of list should be 2 for I(qx,qy)
288            mpars = PyList_GET_SIZE(pars); 
289            if(mpars!=2) {
290                PyErr_SetString(CTriaxialEllipsoidModelError, 
291                        "CTriaxialEllipsoidModel.evalDistribution expects a list of dimension 2.");
292                return NULL;
293            }
294             qx = PyList_GET_ITEM(pars,0);
295             qy = PyList_GET_ITEM(pars,1);
296             if (PyArray_Check(qx) && PyArray_Check(qy)) {
297                 return evaluateTwoDimXY(self->model, (PyArrayObject*)qx,
298                           (PyArrayObject*)qy);
299                 }else{
300                    PyErr_SetString(CTriaxialEllipsoidModelError, 
301                   "CTriaxialEllipsoidModel.evalDistribution expect 2 numpy arrays in list.");
302                return NULL;
303             }
304        }
305        PyErr_SetString(CTriaxialEllipsoidModelError, 
306                   "CTriaxialEllipsoidModel.evalDistribution couln't be run.");
307        return NULL;
308       
309}
310
311/**
312 * Function to call to evaluate model
313 * @param args: input q or [q,phi]
314 * @return: function value
315 */
316static PyObject * run(CTriaxialEllipsoidModel *self, PyObject *args) {
317        double q_value, phi_value;
318        PyObject* pars;
319        int npars;
320       
321        // Get parameters
322       
323            // Reader parameter dictionary
324    self->model->scale = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "scale") );
325    self->model->axis_psi = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "axis_psi") );
326    self->model->axis_theta = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "axis_theta") );
327    self->model->semi_axisA = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "semi_axisA") );
328    self->model->semi_axisB = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "semi_axisB") );
329    self->model->semi_axisC = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "semi_axisC") );
330    self->model->axis_phi = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "axis_phi") );
331    self->model->background = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "background") );
332    self->model->contrast = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "contrast") );
333    // Read in dispersion parameters
334    PyObject* disp_dict;
335    DispersionVisitor* visitor = new DispersionVisitor();
336    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "axis_theta");
337    self->model->axis_theta.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->axis_theta.dispersion, disp_dict);
338    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "axis_phi");
339    self->model->axis_phi.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->axis_phi.dispersion, disp_dict);
340    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "axis_psi");
341    self->model->axis_psi.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->axis_psi.dispersion, disp_dict);
342
343       
344        // Get input and determine whether we have to supply a 1D or 2D return value.
345        if ( !PyArg_ParseTuple(args,"O",&pars) ) {
346            PyErr_SetString(CTriaxialEllipsoidModelError, 
347                "CTriaxialEllipsoidModel.run expects a q value.");
348                return NULL;
349        }
350         
351        // Check params
352        if( PyList_Check(pars)==1) {
353               
354                // Length of list should be 2 for I(q,phi)
355            npars = PyList_GET_SIZE(pars); 
356            if(npars!=2) {
357                PyErr_SetString(CTriaxialEllipsoidModelError, 
358                        "CTriaxialEllipsoidModel.run expects a double or a list of dimension 2.");
359                return NULL;
360            }
361            // We have a vector q, get the q and phi values at which
362            // to evaluate I(q,phi)
363            q_value = CTriaxialEllipsoidModel_readDouble(PyList_GET_ITEM(pars,0));
364            phi_value = CTriaxialEllipsoidModel_readDouble(PyList_GET_ITEM(pars,1));
365            // Skip zero
366            if (q_value==0) {
367                return Py_BuildValue("d",0.0);
368            }
369                return Py_BuildValue("d",(*(self->model)).evaluate_rphi(q_value,phi_value));
370
371        } else {
372
373                // We have a scalar q, we will evaluate I(q)
374                q_value = CTriaxialEllipsoidModel_readDouble(pars);             
375               
376                return Py_BuildValue("d",(*(self->model))(q_value));
377        }       
378}
379/**
380 * Function to call to calculate_ER
381 * @return: effective radius value
382 */
383static PyObject * calculate_ER(CTriaxialEllipsoidModel *self) {
384
385        PyObject* pars;
386        int npars;
387       
388        // Get parameters
389       
390            // Reader parameter dictionary
391    self->model->scale = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "scale") );
392    self->model->axis_psi = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "axis_psi") );
393    self->model->axis_theta = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "axis_theta") );
394    self->model->semi_axisA = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "semi_axisA") );
395    self->model->semi_axisB = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "semi_axisB") );
396    self->model->semi_axisC = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "semi_axisC") );
397    self->model->axis_phi = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "axis_phi") );
398    self->model->background = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "background") );
399    self->model->contrast = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "contrast") );
400    // Read in dispersion parameters
401    PyObject* disp_dict;
402    DispersionVisitor* visitor = new DispersionVisitor();
403    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "axis_theta");
404    self->model->axis_theta.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->axis_theta.dispersion, disp_dict);
405    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "axis_phi");
406    self->model->axis_phi.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->axis_phi.dispersion, disp_dict);
407    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "axis_psi");
408    self->model->axis_psi.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->axis_psi.dispersion, disp_dict);
409
410               
411        return Py_BuildValue("d",(*(self->model)).calculate_ER());
412
413}
414/**
415 * Function to call to evaluate model in cartesian coordinates
416 * @param args: input q or [qx, qy]]
417 * @return: function value
418 */
419static PyObject * runXY(CTriaxialEllipsoidModel *self, PyObject *args) {
420        double qx_value, qy_value;
421        PyObject* pars;
422        int npars;
423       
424        // Get parameters
425       
426            // Reader parameter dictionary
427    self->model->scale = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "scale") );
428    self->model->axis_psi = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "axis_psi") );
429    self->model->axis_theta = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "axis_theta") );
430    self->model->semi_axisA = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "semi_axisA") );
431    self->model->semi_axisB = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "semi_axisB") );
432    self->model->semi_axisC = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "semi_axisC") );
433    self->model->axis_phi = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "axis_phi") );
434    self->model->background = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "background") );
435    self->model->contrast = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "contrast") );
436    // Read in dispersion parameters
437    PyObject* disp_dict;
438    DispersionVisitor* visitor = new DispersionVisitor();
439    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "axis_theta");
440    self->model->axis_theta.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->axis_theta.dispersion, disp_dict);
441    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "axis_phi");
442    self->model->axis_phi.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->axis_phi.dispersion, disp_dict);
443    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "axis_psi");
444    self->model->axis_psi.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->axis_psi.dispersion, disp_dict);
445
446       
447        // Get input and determine whether we have to supply a 1D or 2D return value.
448        if ( !PyArg_ParseTuple(args,"O",&pars) ) {
449            PyErr_SetString(CTriaxialEllipsoidModelError, 
450                "CTriaxialEllipsoidModel.run expects a q value.");
451                return NULL;
452        }
453         
454        // Check params
455        if( PyList_Check(pars)==1) {
456               
457                // Length of list should be 2 for I(qx, qy))
458            npars = PyList_GET_SIZE(pars); 
459            if(npars!=2) {
460                PyErr_SetString(CTriaxialEllipsoidModelError, 
461                        "CTriaxialEllipsoidModel.run expects a double or a list of dimension 2.");
462                return NULL;
463            }
464            // We have a vector q, get the qx and qy values at which
465            // to evaluate I(qx,qy)
466            qx_value = CTriaxialEllipsoidModel_readDouble(PyList_GET_ITEM(pars,0));
467            qy_value = CTriaxialEllipsoidModel_readDouble(PyList_GET_ITEM(pars,1));
468            return Py_BuildValue("d",(*(self->model))(qx_value,qy_value));
469
470        } else {
471
472                // We have a scalar q, we will evaluate I(q)
473                qx_value = CTriaxialEllipsoidModel_readDouble(pars);           
474               
475                return Py_BuildValue("d",(*(self->model))(qx_value));
476        }       
477}
478
479static PyObject * reset(CTriaxialEllipsoidModel *self, PyObject *args) {
480   
481
482    return Py_BuildValue("d",0.0);
483}
484
485static PyObject * set_dispersion(CTriaxialEllipsoidModel *self, PyObject *args) {
486        PyObject * disp;
487        const char * par_name;
488
489        if ( !PyArg_ParseTuple(args,"sO", &par_name, &disp) ) {
490            PyErr_SetString(CTriaxialEllipsoidModelError,
491                "CTriaxialEllipsoidModel.set_dispersion expects a DispersionModel object.");
492                return NULL;
493        }
494        void *temp = PyCObject_AsVoidPtr(disp);
495        DispersionModel * dispersion = static_cast<DispersionModel *>(temp);
496
497
498        // Ugliness necessary to go from python to C
499            // TODO: refactor this
500    if (!strcmp(par_name, "axis_theta")) {
501        self->model->axis_theta.dispersion = dispersion;
502    } else    if (!strcmp(par_name, "axis_phi")) {
503        self->model->axis_phi.dispersion = dispersion;
504    } else    if (!strcmp(par_name, "axis_psi")) {
505        self->model->axis_psi.dispersion = dispersion;
506    } else {
507            PyErr_SetString(CTriaxialEllipsoidModelError,
508                "CTriaxialEllipsoidModel.set_dispersion expects a valid parameter name.");
509                return NULL;
510        }
511
512        DispersionVisitor* visitor = new DispersionVisitor();
513        PyObject * disp_dict = PyDict_New();
514        dispersion->accept_as_source(visitor, dispersion, disp_dict);
515        PyDict_SetItemString(self->dispersion, par_name, disp_dict);
516    return Py_BuildValue("i",1);
517}
518
519
520static PyMethodDef CTriaxialEllipsoidModel_methods[] = {
521    {"run",      (PyCFunction)run     , METH_VARARGS,
522      "Evaluate the model at a given Q or Q, phi"},
523    {"runXY",      (PyCFunction)runXY     , METH_VARARGS,
524      "Evaluate the model at a given Q or Qx, Qy"},
525    {"calculate_ER",      (PyCFunction)calculate_ER     , METH_VARARGS,
526      "Evaluate the model at a given Q or Q, phi"},
527     
528    {"evalDistribution",  (PyCFunction)evalDistribution , METH_VARARGS,
529      "Evaluate the model at a given Q or Qx, Qy vector "},
530    {"reset",    (PyCFunction)reset   , METH_VARARGS,
531      "Reset pair correlation"},
532    {"set_dispersion",      (PyCFunction)set_dispersion     , METH_VARARGS,
533      "Set the dispersion model for a given parameter"},
534   {NULL}
535};
536
537static PyTypeObject CTriaxialEllipsoidModelType = {
538    PyObject_HEAD_INIT(NULL)
539    0,                         /*ob_size*/
540    "CTriaxialEllipsoidModel",             /*tp_name*/
541    sizeof(CTriaxialEllipsoidModel),             /*tp_basicsize*/
542    0,                         /*tp_itemsize*/
543    (destructor)CTriaxialEllipsoidModel_dealloc, /*tp_dealloc*/
544    0,                         /*tp_print*/
545    0,                         /*tp_getattr*/
546    0,                         /*tp_setattr*/
547    0,                         /*tp_compare*/
548    0,                         /*tp_repr*/
549    0,                         /*tp_as_number*/
550    0,                         /*tp_as_sequence*/
551    0,                         /*tp_as_mapping*/
552    0,                         /*tp_hash */
553    0,                         /*tp_call*/
554    0,                         /*tp_str*/
555    0,                         /*tp_getattro*/
556    0,                         /*tp_setattro*/
557    0,                         /*tp_as_buffer*/
558    Py_TPFLAGS_DEFAULT | Py_TPFLAGS_BASETYPE, /*tp_flags*/
559    "CTriaxialEllipsoidModel objects",           /* tp_doc */
560    0,                         /* tp_traverse */
561    0,                         /* tp_clear */
562    0,                         /* tp_richcompare */
563    0,                         /* tp_weaklistoffset */
564    0,                         /* tp_iter */
565    0,                         /* tp_iternext */
566    CTriaxialEllipsoidModel_methods,             /* tp_methods */
567    CTriaxialEllipsoidModel_members,             /* tp_members */
568    0,                         /* tp_getset */
569    0,                         /* tp_base */
570    0,                         /* tp_dict */
571    0,                         /* tp_descr_get */
572    0,                         /* tp_descr_set */
573    0,                         /* tp_dictoffset */
574    (initproc)CTriaxialEllipsoidModel_init,      /* tp_init */
575    0,                         /* tp_alloc */
576    CTriaxialEllipsoidModel_new,                 /* tp_new */
577};
578
579
580//static PyMethodDef module_methods[] = {
581//    {NULL}
582//};
583
584/**
585 * Function used to add the model class to a module
586 * @param module: module to add the class to
587 */ 
588void addCTriaxialEllipsoidModel(PyObject *module) {
589        PyObject *d;
590       
591    if (PyType_Ready(&CTriaxialEllipsoidModelType) < 0)
592        return;
593
594    Py_INCREF(&CTriaxialEllipsoidModelType);
595    PyModule_AddObject(module, "CTriaxialEllipsoidModel", (PyObject *)&CTriaxialEllipsoidModelType);
596   
597    d = PyModule_GetDict(module);
598    CTriaxialEllipsoidModelError = PyErr_NewException("CTriaxialEllipsoidModel.error", NULL, NULL);
599    PyDict_SetItemString(d, "CTriaxialEllipsoidModelError", CTriaxialEllipsoidModelError);
600}
601
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.