source: sasview/sansmodels/src/sans/models/c_models/CCappedCylinderModel.cpp @ 01de557

ESS_GUIESS_GUI_DocsESS_GUI_batch_fittingESS_GUI_bumps_abstractionESS_GUI_iss1116ESS_GUI_iss879ESS_GUI_iss959ESS_GUI_openclESS_GUI_orderingESS_GUI_sync_sascalccostrafo411magnetic_scattrelease-4.1.1release-4.1.2release-4.2.2release_4.0.1ticket-1009ticket-1094-headlessticket-1242-2d-resolutionticket-1243ticket-1249ticket885unittest-saveload
Last change on this file since 01de557 was 0b082f3, checked in by Mathieu Doucet <doucetm@…>, 13 years ago

Re #7 Enable openmp for all models
  • Property mode set to 100644
File size: 25.4 KB
Line 
1/**
2        This software was developed by the University of Tennessee as part of the
3        Distributed Data Analysis of Neutron Scattering Experiments (DANSE)
4        project funded by the US National Science Foundation.
5
6        If you use DANSE applications to do scientific research that leads to
7        publication, we ask that you acknowledge the use of the software with the
8        following sentence:
9
10        "This work benefited from DANSE software developed under NSF award DMR-0520547."
11
12        copyright 2008, University of Tennessee
13 */
14
15/** CCappedCylinderModel
16 *
17 * C extension
18 *
19 * WARNING: THIS FILE WAS GENERATED BY WRAPPERGENERATOR.PY
20 *          DO NOT MODIFY THIS FILE, MODIFY capcyl.h
21 *          AND RE-RUN THE GENERATOR SCRIPT
22 *
23 */
24#define NO_IMPORT_ARRAY
25#define PY_ARRAY_UNIQUE_SYMBOL PyArray_API_sans
26 
27extern "C" {
28#include <Python.h>
29#include <arrayobject.h>
30#include "structmember.h"
31#include <stdio.h>
32#include <stdlib.h>
33#include <math.h>
34#include <time.h>
35#include "capcyl.h"
36}
37
38#include "models.hh"
39#include "dispersion_visitor.hh"
40
41/// Error object for raised exceptions
42static PyObject * CCappedCylinderModelError = NULL;
43
44
45// Class definition
46typedef struct {
47    PyObject_HEAD
48    /// Parameters
49    PyObject * params;
50    /// Dispersion parameters
51    PyObject * dispersion;
52    /// Underlying model object
53    CappedCylinderModel * model;
54    /// Log for unit testing
55    PyObject * log;
56} CCappedCylinderModel;
57
58
59static void
60CCappedCylinderModel_dealloc(CCappedCylinderModel* self)
61{
62    Py_DECREF(self->params);
63    Py_DECREF(self->dispersion);
64    Py_DECREF(self->log);
65    delete self->model;
66    self->ob_type->tp_free((PyObject*)self);
67   
68
69}
70
71static PyObject *
72CCappedCylinderModel_new(PyTypeObject *type, PyObject *args, PyObject *kwds)
73{
74    CCappedCylinderModel *self;
75   
76    self = (CCappedCylinderModel *)type->tp_alloc(type, 0);
77   
78    return (PyObject *)self;
79}
80
81static int
82CCappedCylinderModel_init(CCappedCylinderModel *self, PyObject *args, PyObject *kwds)
83{
84    if (self != NULL) {
85       
86        // Create parameters
87        self->params = PyDict_New();
88        self->dispersion = PyDict_New();
89        self->model = new CappedCylinderModel();
90       
91        // Initialize parameter dictionary
92        PyDict_SetItemString(self->params,"phi",Py_BuildValue("d",0.000000000000));
93        PyDict_SetItemString(self->params,"len_cyl",Py_BuildValue("d",400.000000000000));
94        PyDict_SetItemString(self->params,"sld_capcyl",Py_BuildValue("d",0.000001000000));
95        PyDict_SetItemString(self->params,"scale",Py_BuildValue("d",1.000000000000));
96        PyDict_SetItemString(self->params,"background",Py_BuildValue("d",0.000000000000));
97        PyDict_SetItemString(self->params,"theta",Py_BuildValue("d",0.000000000000));
98        PyDict_SetItemString(self->params,"rad_cap",Py_BuildValue("d",40.000000000000));
99        PyDict_SetItemString(self->params,"sld_solv",Py_BuildValue("d",0.000006300000));
100        PyDict_SetItemString(self->params,"rad_cyl",Py_BuildValue("d",20.000000000000));
101        // Initialize dispersion / averaging parameter dict
102        DispersionVisitor* visitor = new DispersionVisitor();
103        PyObject * disp_dict;
104        disp_dict = PyDict_New();
105        self->model->rad_cyl.dispersion->accept_as_source(visitor, self->model->rad_cyl.dispersion, disp_dict);
106        PyDict_SetItemString(self->dispersion, "rad_cyl", disp_dict);
107        disp_dict = PyDict_New();
108        self->model->len_cyl.dispersion->accept_as_source(visitor, self->model->len_cyl.dispersion, disp_dict);
109        PyDict_SetItemString(self->dispersion, "len_cyl", disp_dict);
110        disp_dict = PyDict_New();
111        self->model->rad_cap.dispersion->accept_as_source(visitor, self->model->rad_cap.dispersion, disp_dict);
112        PyDict_SetItemString(self->dispersion, "rad_cap", disp_dict);
113        disp_dict = PyDict_New();
114        self->model->phi.dispersion->accept_as_source(visitor, self->model->phi.dispersion, disp_dict);
115        PyDict_SetItemString(self->dispersion, "phi", disp_dict);
116        disp_dict = PyDict_New();
117        self->model->theta.dispersion->accept_as_source(visitor, self->model->theta.dispersion, disp_dict);
118        PyDict_SetItemString(self->dispersion, "theta", disp_dict);
119
120
121         
122        // Create empty log
123        self->log = PyDict_New();
124       
125       
126
127    }
128    return 0;
129}
130
131static char name_params[] = "params";
132static char def_params[] = "Parameters";
133static char name_dispersion[] = "dispersion";
134static char def_dispersion[] = "Dispersion parameters";
135static char name_log[] = "log";
136static char def_log[] = "Log";
137
138static PyMemberDef CCappedCylinderModel_members[] = {
139    {name_params, T_OBJECT, offsetof(CCappedCylinderModel, params), 0, def_params},
140        {name_dispersion, T_OBJECT, offsetof(CCappedCylinderModel, dispersion), 0, def_dispersion},     
141    {name_log, T_OBJECT, offsetof(CCappedCylinderModel, log), 0, def_log},
142    {NULL}  /* Sentinel */
143};
144
145/** Read double from PyObject
146    @param p PyObject
147    @return double
148*/
149double CCappedCylinderModel_readDouble(PyObject *p) {
150    if (PyFloat_Check(p)==1) {
151        return (double)(((PyFloatObject *)(p))->ob_fval);
152    } else if (PyInt_Check(p)==1) {
153        return (double)(((PyIntObject *)(p))->ob_ival);
154    } else if (PyLong_Check(p)==1) {
155        return (double)PyLong_AsLong(p);
156    } else {
157        return 0.0;
158    }
159}
160/**
161 * Function to call to evaluate model
162 * @param args: input numpy array q[]
163 * @return: numpy array object
164 */
165 
166static PyObject *evaluateOneDim(CappedCylinderModel* model, PyArrayObject *q){
167    PyArrayObject *result;
168   
169    // Check validity of array q , q must be of dimension 1, an array of double
170    if (q->nd != 1 || q->descr->type_num != PyArray_DOUBLE)
171    {
172        //const char * message= "Invalid array: q->nd=%d,type_num=%d\n",q->nd,q->descr->type_num;
173        //PyErr_SetString(PyExc_ValueError , message);
174        return NULL;
175    }
176    result = (PyArrayObject *)PyArray_FromDims(q->nd, (int *)(q->dimensions), 
177                                                                                  PyArray_DOUBLE);
178        if (result == NULL) {
179        const char * message= "Could not create result ";
180        PyErr_SetString(PyExc_RuntimeError , message);
181                return NULL;
182        }
183#pragma omp parallel for
184         for (int i = 0; i < q->dimensions[0]; i++){
185      double q_value  = *(double *)(q->data + i*q->strides[0]);
186      double *result_value = (double *)(result->data + i*result->strides[0]);
187      *result_value =(*model)(q_value);
188        }
189    return PyArray_Return(result); 
190 }
191
192 /**
193 * Function to call to evaluate model
194 * @param args: input numpy array  [x[],y[]]
195 * @return: numpy array object
196 */
197 static PyObject * evaluateTwoDimXY( CappedCylinderModel* model, 
198                              PyArrayObject *x, PyArrayObject *y)
199 {
200    PyArrayObject *result;
201    int x_len, y_len, dims[1];
202    //check validity of input vectors
203    if (x->nd != 1 || x->descr->type_num != PyArray_DOUBLE
204        || y->nd != 1 || y->descr->type_num != PyArray_DOUBLE
205        || y->dimensions[0] != x->dimensions[0]){
206        const char * message= "evaluateTwoDimXY  expect 2 numpy arrays";
207        PyErr_SetString(PyExc_ValueError , message); 
208        return NULL;
209    }
210   
211        if (PyArray_Check(x) && PyArray_Check(y)) {
212               
213            x_len = dims[0]= x->dimensions[0];
214        y_len = dims[0]= y->dimensions[0];
215           
216            // Make a new double matrix of same dims
217        result=(PyArrayObject *) PyArray_FromDims(1,dims,NPY_DOUBLE);
218        if (result == NULL){
219            const char * message= "Could not create result ";
220        PyErr_SetString(PyExc_RuntimeError , message);
221            return NULL;
222            }
223       
224        /* Do the calculation. */
225#pragma omp parallel for
226        for (int i=0; i< x_len; i++) {
227            double x_value = *(double *)(x->data + i*x->strides[0]);
228                    double y_value = *(double *)(y->data + i*y->strides[0]);
229                        double *result_value = (double *)(result->data +
230                              i*result->strides[0]);
231                        *result_value = (*model)(x_value, y_value);
232        }           
233        return PyArray_Return(result); 
234       
235        }else{
236                    PyErr_SetString(CCappedCylinderModelError, 
237                   "CCappedCylinderModel.evaluateTwoDimXY couldn't run.");
238                return NULL;
239                }       
240}
241/**
242 *  evalDistribution function evaluate a model function with input vector
243 *  @param args: input q as vector or [qx, qy] where qx, qy are vectors
244 *
245 */ 
246static PyObject * evalDistribution(CCappedCylinderModel *self, PyObject *args){
247        PyObject *qx, *qy;
248        PyArrayObject * pars;
249        int npars ,mpars;
250       
251        // Get parameters
252       
253            // Reader parameter dictionary
254    self->model->phi = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "phi") );
255    self->model->len_cyl = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "len_cyl") );
256    self->model->sld_capcyl = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "sld_capcyl") );
257    self->model->scale = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "scale") );
258    self->model->background = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "background") );
259    self->model->theta = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "theta") );
260    self->model->rad_cap = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "rad_cap") );
261    self->model->sld_solv = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "sld_solv") );
262    self->model->rad_cyl = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "rad_cyl") );
263    // Read in dispersion parameters
264    PyObject* disp_dict;
265    DispersionVisitor* visitor = new DispersionVisitor();
266    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "rad_cyl");
267    self->model->rad_cyl.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->rad_cyl.dispersion, disp_dict);
268    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "len_cyl");
269    self->model->len_cyl.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->len_cyl.dispersion, disp_dict);
270    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "rad_cap");
271    self->model->rad_cap.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->rad_cap.dispersion, disp_dict);
272    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "phi");
273    self->model->phi.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->phi.dispersion, disp_dict);
274    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "theta");
275    self->model->theta.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->theta.dispersion, disp_dict);
276
277       
278        // Get input and determine whether we have to supply a 1D or 2D return value.
279        if ( !PyArg_ParseTuple(args,"O",&pars) ) {
280            PyErr_SetString(CCappedCylinderModelError, 
281                "CCappedCylinderModel.evalDistribution expects a q value.");
282                return NULL;
283        }
284    // Check params
285       
286    if(PyArray_Check(pars)==1) {
287               
288            // Length of list should 1 or 2
289            npars = pars->nd; 
290            if(npars==1) {
291                // input is a numpy array
292                if (PyArray_Check(pars)) {
293                        return evaluateOneDim(self->model, (PyArrayObject*)pars); 
294                    }
295                }else{
296                    PyErr_SetString(CCappedCylinderModelError, 
297                   "CCappedCylinderModel.evalDistribution expect numpy array of one dimension.");
298                return NULL;
299                }
300    }else if( PyList_Check(pars)==1) {
301        // Length of list should be 2 for I(qx,qy)
302            mpars = PyList_GET_SIZE(pars); 
303            if(mpars!=2) {
304                PyErr_SetString(CCappedCylinderModelError, 
305                        "CCappedCylinderModel.evalDistribution expects a list of dimension 2.");
306                return NULL;
307            }
308             qx = PyList_GET_ITEM(pars,0);
309             qy = PyList_GET_ITEM(pars,1);
310             if (PyArray_Check(qx) && PyArray_Check(qy)) {
311                 return evaluateTwoDimXY(self->model, (PyArrayObject*)qx,
312                           (PyArrayObject*)qy);
313                 }else{
314                    PyErr_SetString(CCappedCylinderModelError, 
315                   "CCappedCylinderModel.evalDistribution expect 2 numpy arrays in list.");
316                return NULL;
317             }
318        }
319        PyErr_SetString(CCappedCylinderModelError, 
320                   "CCappedCylinderModel.evalDistribution couln't be run.");
321        return NULL;
322       
323}
324
325/**
326 * Function to call to evaluate model
327 * @param args: input q or [q,phi]
328 * @return: function value
329 */
330static PyObject * run(CCappedCylinderModel *self, PyObject *args) {
331        double q_value, phi_value;
332        PyObject* pars;
333        int npars;
334       
335        // Get parameters
336       
337            // Reader parameter dictionary
338    self->model->phi = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "phi") );
339    self->model->len_cyl = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "len_cyl") );
340    self->model->sld_capcyl = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "sld_capcyl") );
341    self->model->scale = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "scale") );
342    self->model->background = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "background") );
343    self->model->theta = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "theta") );
344    self->model->rad_cap = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "rad_cap") );
345    self->model->sld_solv = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "sld_solv") );
346    self->model->rad_cyl = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "rad_cyl") );
347    // Read in dispersion parameters
348    PyObject* disp_dict;
349    DispersionVisitor* visitor = new DispersionVisitor();
350    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "rad_cyl");
351    self->model->rad_cyl.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->rad_cyl.dispersion, disp_dict);
352    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "len_cyl");
353    self->model->len_cyl.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->len_cyl.dispersion, disp_dict);
354    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "rad_cap");
355    self->model->rad_cap.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->rad_cap.dispersion, disp_dict);
356    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "phi");
357    self->model->phi.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->phi.dispersion, disp_dict);
358    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "theta");
359    self->model->theta.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->theta.dispersion, disp_dict);
360
361       
362        // Get input and determine whether we have to supply a 1D or 2D return value.
363        if ( !PyArg_ParseTuple(args,"O",&pars) ) {
364            PyErr_SetString(CCappedCylinderModelError, 
365                "CCappedCylinderModel.run expects a q value.");
366                return NULL;
367        }
368         
369        // Check params
370        if( PyList_Check(pars)==1) {
371               
372                // Length of list should be 2 for I(q,phi)
373            npars = PyList_GET_SIZE(pars); 
374            if(npars!=2) {
375                PyErr_SetString(CCappedCylinderModelError, 
376                        "CCappedCylinderModel.run expects a double or a list of dimension 2.");
377                return NULL;
378            }
379            // We have a vector q, get the q and phi values at which
380            // to evaluate I(q,phi)
381            q_value = CCappedCylinderModel_readDouble(PyList_GET_ITEM(pars,0));
382            phi_value = CCappedCylinderModel_readDouble(PyList_GET_ITEM(pars,1));
383            // Skip zero
384            if (q_value==0) {
385                return Py_BuildValue("d",0.0);
386            }
387                return Py_BuildValue("d",(*(self->model)).evaluate_rphi(q_value,phi_value));
388
389        } else {
390
391                // We have a scalar q, we will evaluate I(q)
392                q_value = CCappedCylinderModel_readDouble(pars);               
393               
394                return Py_BuildValue("d",(*(self->model))(q_value));
395        }       
396}
397/**
398 * Function to call to calculate_ER
399 * @return: effective radius value
400 */
401static PyObject * calculate_ER(CCappedCylinderModel *self) {
402
403        // Get parameters
404       
405            // Reader parameter dictionary
406    self->model->phi = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "phi") );
407    self->model->len_cyl = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "len_cyl") );
408    self->model->sld_capcyl = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "sld_capcyl") );
409    self->model->scale = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "scale") );
410    self->model->background = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "background") );
411    self->model->theta = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "theta") );
412    self->model->rad_cap = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "rad_cap") );
413    self->model->sld_solv = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "sld_solv") );
414    self->model->rad_cyl = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "rad_cyl") );
415    // Read in dispersion parameters
416    PyObject* disp_dict;
417    DispersionVisitor* visitor = new DispersionVisitor();
418    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "rad_cyl");
419    self->model->rad_cyl.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->rad_cyl.dispersion, disp_dict);
420    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "len_cyl");
421    self->model->len_cyl.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->len_cyl.dispersion, disp_dict);
422    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "rad_cap");
423    self->model->rad_cap.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->rad_cap.dispersion, disp_dict);
424    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "phi");
425    self->model->phi.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->phi.dispersion, disp_dict);
426    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "theta");
427    self->model->theta.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->theta.dispersion, disp_dict);
428
429               
430        return Py_BuildValue("d",(*(self->model)).calculate_ER());
431
432}
433/**
434 * Function to call to evaluate model in cartesian coordinates
435 * @param args: input q or [qx, qy]]
436 * @return: function value
437 */
438static PyObject * runXY(CCappedCylinderModel *self, PyObject *args) {
439        double qx_value, qy_value;
440        PyObject* pars;
441        int npars;
442       
443        // Get parameters
444       
445            // Reader parameter dictionary
446    self->model->phi = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "phi") );
447    self->model->len_cyl = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "len_cyl") );
448    self->model->sld_capcyl = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "sld_capcyl") );
449    self->model->scale = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "scale") );
450    self->model->background = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "background") );
451    self->model->theta = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "theta") );
452    self->model->rad_cap = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "rad_cap") );
453    self->model->sld_solv = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "sld_solv") );
454    self->model->rad_cyl = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "rad_cyl") );
455    // Read in dispersion parameters
456    PyObject* disp_dict;
457    DispersionVisitor* visitor = new DispersionVisitor();
458    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "rad_cyl");
459    self->model->rad_cyl.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->rad_cyl.dispersion, disp_dict);
460    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "len_cyl");
461    self->model->len_cyl.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->len_cyl.dispersion, disp_dict);
462    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "rad_cap");
463    self->model->rad_cap.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->rad_cap.dispersion, disp_dict);
464    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "phi");
465    self->model->phi.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->phi.dispersion, disp_dict);
466    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "theta");
467    self->model->theta.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->theta.dispersion, disp_dict);
468
469       
470        // Get input and determine whether we have to supply a 1D or 2D return value.
471        if ( !PyArg_ParseTuple(args,"O",&pars) ) {
472            PyErr_SetString(CCappedCylinderModelError, 
473                "CCappedCylinderModel.run expects a q value.");
474                return NULL;
475        }
476         
477        // Check params
478        if( PyList_Check(pars)==1) {
479               
480                // Length of list should be 2 for I(qx, qy))
481            npars = PyList_GET_SIZE(pars); 
482            if(npars!=2) {
483                PyErr_SetString(CCappedCylinderModelError, 
484                        "CCappedCylinderModel.run expects a double or a list of dimension 2.");
485                return NULL;
486            }
487            // We have a vector q, get the qx and qy values at which
488            // to evaluate I(qx,qy)
489            qx_value = CCappedCylinderModel_readDouble(PyList_GET_ITEM(pars,0));
490            qy_value = CCappedCylinderModel_readDouble(PyList_GET_ITEM(pars,1));
491            return Py_BuildValue("d",(*(self->model))(qx_value,qy_value));
492
493        } else {
494
495                // We have a scalar q, we will evaluate I(q)
496                qx_value = CCappedCylinderModel_readDouble(pars);               
497               
498                return Py_BuildValue("d",(*(self->model))(qx_value));
499        }       
500}
501
502static PyObject * reset(CCappedCylinderModel *self, PyObject *args) {
503   
504
505    return Py_BuildValue("d",0.0);
506}
507
508static PyObject * set_dispersion(CCappedCylinderModel *self, PyObject *args) {
509        PyObject * disp;
510        const char * par_name;
511
512        if ( !PyArg_ParseTuple(args,"sO", &par_name, &disp) ) {
513            PyErr_SetString(CCappedCylinderModelError,
514                "CCappedCylinderModel.set_dispersion expects a DispersionModel object.");
515                return NULL;
516        }
517        void *temp = PyCObject_AsVoidPtr(disp);
518        DispersionModel * dispersion = static_cast<DispersionModel *>(temp);
519
520
521        // Ugliness necessary to go from python to C
522            // TODO: refactor this
523    if (!strcmp(par_name, "rad_cyl")) {
524        self->model->rad_cyl.dispersion = dispersion;
525    } else    if (!strcmp(par_name, "len_cyl")) {
526        self->model->len_cyl.dispersion = dispersion;
527    } else    if (!strcmp(par_name, "rad_cap")) {
528        self->model->rad_cap.dispersion = dispersion;
529    } else    if (!strcmp(par_name, "phi")) {
530        self->model->phi.dispersion = dispersion;
531    } else    if (!strcmp(par_name, "theta")) {
532        self->model->theta.dispersion = dispersion;
533    } else {
534            PyErr_SetString(CCappedCylinderModelError,
535                "CCappedCylinderModel.set_dispersion expects a valid parameter name.");
536                return NULL;
537        }
538
539        DispersionVisitor* visitor = new DispersionVisitor();
540        PyObject * disp_dict = PyDict_New();
541        dispersion->accept_as_source(visitor, dispersion, disp_dict);
542        PyDict_SetItemString(self->dispersion, par_name, disp_dict);
543    return Py_BuildValue("i",1);
544}
545
546
547static PyMethodDef CCappedCylinderModel_methods[] = {
548    {"run",      (PyCFunction)run     , METH_VARARGS,
549      "Evaluate the model at a given Q or Q, phi"},
550    {"runXY",      (PyCFunction)runXY     , METH_VARARGS,
551      "Evaluate the model at a given Q or Qx, Qy"},
552    {"calculate_ER",      (PyCFunction)calculate_ER     , METH_VARARGS,
553      "Evaluate the model at a given Q or Q, phi"},
554     
555    {"evalDistribution",  (PyCFunction)evalDistribution , METH_VARARGS,
556      "Evaluate the model at a given Q or Qx, Qy vector "},
557    {"reset",    (PyCFunction)reset   , METH_VARARGS,
558      "Reset pair correlation"},
559    {"set_dispersion",      (PyCFunction)set_dispersion     , METH_VARARGS,
560      "Set the dispersion model for a given parameter"},
561   {NULL}
562};
563
564static PyTypeObject CCappedCylinderModelType = {
565    PyObject_HEAD_INIT(NULL)
566    0,                         /*ob_size*/
567    "CCappedCylinderModel",             /*tp_name*/
568    sizeof(CCappedCylinderModel),             /*tp_basicsize*/
569    0,                         /*tp_itemsize*/
570    (destructor)CCappedCylinderModel_dealloc, /*tp_dealloc*/
571    0,                         /*tp_print*/
572    0,                         /*tp_getattr*/
573    0,                         /*tp_setattr*/
574    0,                         /*tp_compare*/
575    0,                         /*tp_repr*/
576    0,                         /*tp_as_number*/
577    0,                         /*tp_as_sequence*/
578    0,                         /*tp_as_mapping*/
579    0,                         /*tp_hash */
580    0,                         /*tp_call*/
581    0,                         /*tp_str*/
582    0,                         /*tp_getattro*/
583    0,                         /*tp_setattro*/
584    0,                         /*tp_as_buffer*/
585    Py_TPFLAGS_DEFAULT | Py_TPFLAGS_BASETYPE, /*tp_flags*/
586    "CCappedCylinderModel objects",           /* tp_doc */
587    0,                         /* tp_traverse */
588    0,                         /* tp_clear */
589    0,                         /* tp_richcompare */
590    0,                         /* tp_weaklistoffset */
591    0,                         /* tp_iter */
592    0,                         /* tp_iternext */
593    CCappedCylinderModel_methods,             /* tp_methods */
594    CCappedCylinderModel_members,             /* tp_members */
595    0,                         /* tp_getset */
596    0,                         /* tp_base */
597    0,                         /* tp_dict */
598    0,                         /* tp_descr_get */
599    0,                         /* tp_descr_set */
600    0,                         /* tp_dictoffset */
601    (initproc)CCappedCylinderModel_init,      /* tp_init */
602    0,                         /* tp_alloc */
603    CCappedCylinderModel_new,                 /* tp_new */
604};
605
606
607//static PyMethodDef module_methods[] = {
608//    {NULL}
609//};
610
611/**
612 * Function used to add the model class to a module
613 * @param module: module to add the class to
614 */ 
615void addCCappedCylinderModel(PyObject *module) {
616        PyObject *d;
617       
618    if (PyType_Ready(&CCappedCylinderModelType) < 0)
619        return;
620
621    Py_INCREF(&CCappedCylinderModelType);
622    PyModule_AddObject(module, "CCappedCylinderModel", (PyObject *)&CCappedCylinderModelType);
623   
624    d = PyModule_GetDict(module);
625    static char error_name[] = "CCappedCylinderModel.error";
626    CCappedCylinderModelError = PyErr_NewException(error_name, NULL, NULL);
627    PyDict_SetItemString(d, "CCappedCylinderModelError", CCappedCylinderModelError);
628}
629
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.