source: sasview/guiframe/dataFitting.py @ d7a39e5

ESS_GUIESS_GUI_DocsESS_GUI_batch_fittingESS_GUI_bumps_abstractionESS_GUI_iss1116ESS_GUI_iss879ESS_GUI_iss959ESS_GUI_openclESS_GUI_orderingESS_GUI_sync_sascalccostrafo411magnetic_scattrelease-4.1.1release-4.1.2release-4.2.2release_4.0.1ticket-1009ticket-1094-headlessticket-1242-2d-resolutionticket-1243ticket-1249ticket885unittest-saveload
Last change on this file since d7a39e5 was d955bf19, checked in by Gervaise Alina <gervyh@…>, 14 years ago

working on documentation
  • Property mode set to 100644
File size: 8.0 KB
Line 
1"""
2Adapters for fitting module
3"""
4import copy
5import numpy
6import math
7from data_util.uncertainty import Uncertainty
8from danse.common.plottools.plottables import Data1D as PlotData1D
9from danse.common.plottools.plottables import Data2D as PlotData2D
10from danse.common.plottools.plottables import Theory1D as PlotTheory1D
11
12from DataLoader.data_info import Data1D as LoadData1D
13from DataLoader.data_info import Data2D as LoadData2D
14
15class Data1D(PlotData1D, LoadData1D):
16    """
17    """
18    def __init__(self, x=[], y=[], dx=None, dy=None):
19        """
20        """
21        PlotData1D.__init__(self, x, y, dx, dy)
22        LoadData1D.__init__(self, x, y, dx, dy)
23        self.id = None
24        self.group_id = None
25        self.is_data = True
26   
27    def copy_from_datainfo(self, data1d):
28        """
29        copy values of Data1D of type DataLaoder.Data_info
30        """
31        self.x  = copy.deepcopy(data1d.x)
32        self.y  = copy.deepcopy(data1d.y)
33        self.dy = copy.deepcopy(data1d.dy)
34       
35        if hasattr(data1d, "dx"):
36            self.dx = copy.deepcopy(data1d.dx)   
37        if hasattr(data1d, "dxl"):
38            self.dxl = copy.deepcopy(data1d.dxl)
39        if hasattr(data1d, "dxw"):
40            self.dxw = copy.deepcopy(data1d.dxw)
41   
42        self.xaxis(data1d._xaxis, data1d._xunit)
43        self.yaxis(data1d._yaxis, data1d._yunit)
44       
45    def __str__(self):
46        """
47        print data
48        """
49        _str = "%s\n" % LoadData1D.__str__(self)
50     
51        return _str
52   
53    def _perform_operation(self, other, operation):
54        """
55        """
56        # First, check the data compatibility
57        dy, dy_other = self._validity_check(other)
58        result = Data1D(x=[], y=[], dx=None, dy=None)
59        result.clone_without_data(clone=self)
60        result.copy_from_datainfo(data1d=self)
61        for i in range(len(self.x)):
62            result.x[i] = self.x[i]
63            if self.dx is not None and len(self.x) == len(self.dx):
64                result.dx[i] = self.dx[i]
65           
66            a = Uncertainty(self.y[i], dy[i]**2)
67            if isinstance(other, Data1D):
68                b = Uncertainty(other.y[i], dy_other[i]**2)
69            else:
70                b = other
71           
72            output = operation(a, b)
73            result.y[i] = output.x
74            if result.dy is None: result.dy = numpy.zeros(len(self.x))
75            result.dy[i] = math.sqrt(math.fabs(output.variance))
76        return result
77   
78class Theory1D(PlotTheory1D,LoadData1D):
79    """
80    """
81    def __init__(self, x=[], y=[], dy=None):
82        """
83        """
84        PlotTheory1D.__init__(self, x, y, dy)
85        LoadData1D.__init__(self, x, y, dy)
86        self.id = None
87        self.group_id = None
88        self.is_data = True
89   
90    def copy_from_datainfo(self, data1d):
91        """
92        copy values of Data1D of type DataLaoder.Data_info
93        """
94        self.x  = copy.deepcopy(data1d.x)
95        self.y  = copy.deepcopy(data1d.y)
96        self.dy = copy.deepcopy(data1d.dy)
97        if hasattr(data1d, "dx"):
98            self.dx = copy.deepcopy(data1d.dx) 
99        if hasattr(data1d, "dxl"):
100            self.dxl = copy.deepcopy(data1d.dxl)
101        if hasattr(data1d, "dxw"):
102            self.dxw = copy.deepcopy(data1d.dxw)   
103        self.xaxis(data1d._xaxis, data1d._xunit)
104        self.yaxis(data1d._yaxis, data1d._yunit)
105       
106    def __str__(self):
107        """
108        print data
109        """
110        _str = "%s\n" % LoadData1D.__str__(self)
111     
112        return _str
113   
114    def _perform_operation(self, other, operation):
115        """
116        """
117        # First, check the data compatibility
118        dy, dy_other = self._validity_check(other)
119        result = Theory1D(x=[], y=[], dy=None)
120        result.clone_without_data(clone=self)
121        result.copy_from_datainfo(data1d=self)
122        for i in range(len(self.x)):
123            result.x[i] = self.x[i]
124           
125            a = Uncertainty(self.y[i], dy[i]**2)
126            if isinstance(other, Data1D):
127                b = Uncertainty(other.y[i], dy_other[i]**2)
128            else:
129                b = other
130           
131            output = operation(a, b)
132            result.y[i] = output.x
133            if result.dy is None: result.dy = numpy.zeros(len(self.x))
134            result.dy[i] = math.sqrt(math.fabs(output.variance))
135        return result
136   
137     
138class Data2D(PlotData2D,LoadData2D):
139    """
140    """
141    def __init__(self, image=None, err_image=None,
142                 xmin=None, xmax=None, ymin=None, ymax=None,
143                 zmin=None, zmax=None, qx_data=None, qy_data=None,
144                 q_data=None, mask=None, dqx_data=None, dqy_data=None):
145        """
146        """
147        PlotData2D.__init__(self, image=image, err_image=err_image,
148                            xmin=xmin, xmax=xmax, ymin=ymin, ymax=ymax,
149                            zmin=zmin, zmax=zmax, qx_data=qx_data, 
150                            qy_data=qy_data)
151       
152        LoadData2D.__init__(self, data=image, err_data=err_image,
153                            qx_data=qx_data, qy_data=qy_data,
154                            dqx_data=dqx_data, dqy_data=dqy_data,
155                            q_data=q_data, mask=mask)
156       
157    def copy_from_datainfo(self, data2d):
158        """
159        copy value of Data2D of type DataLoader.data_info
160        """
161        self.data     =  copy.deepcopy(data2d.data)
162        self.qx_data  =  copy.deepcopy(data2d.qx_data)
163        self.qy_data  =  copy.deepcopy(data2d.qy_data)
164        self.q_data    =  copy.deepcopy(data2d.q_data)
165        self.mask     =  copy.deepcopy(data2d.mask)
166        self.err_data =  copy.deepcopy(data2d.err_data)
167        self.x_bins     = copy.deepcopy(data2d.x_bins)
168        self.y_bins     = copy.deepcopy(data2d.y_bins)
169        if data2d.dqx_data is not None: self.dqx_data = copy.deepcopy(data2d.dqx_data)
170        if data2d.dqy_data is not None: self.dqy_data = copy.deepcopy(data2d.dqy_data)
171        self.xmin       = data2d.xmin
172        self.xmax       = data2d.xmax
173        self.ymin       = data2d.ymin
174        self.ymax       = data2d.ymax
175        if hasattr(data2d, "zmin"):
176            self.zmin       = data2d.zmin
177        if hasattr(data2d, "zmax"):
178            self.zmax      = data2d.zmax
179       
180        self.xaxis(data2d._xaxis, data2d._xunit)
181        self.yaxis(data2d._yaxis, data2d._yunit)
182       
183    def __str__(self):
184        """
185        print data
186        """
187        _str = "%s\n" % LoadData2D.__str__(self)
188     
189        return _str
190   
191    def _perform_operation(self, other, operation):
192        """
193        Perform 2D operations between data sets
194       
195        :param other: other data set
196        :param operation: function defining the operation
197       
198        """
199        # First, check the data compatibility
200        dy, dy_other = self._validity_check(other)
201   
202        result = Data2D(image=None, qx_data=None, qy_data=None,
203                         err_image=None, xmin=None, xmax=None,
204                         ymin=None, ymax=None, zmin=None, zmax=None)
205       
206        result.clone_without_data(clone=self)
207        result.copy_from_datainfo(data2d=self)
208       
209        for i in range(numpy.size(self.data,0)):
210            for j in range(numpy.size(self.data,1)):
211                result.data[i][j] = self.data[i][j]
212                if self.err_data is not None and \
213                        numpy.size(self.data)==numpy.size(self.err_data):
214                    result.err_data[i][j] = self.err_data[i][j]
215               
216                a = Uncertainty(self.data[i][j], dy[i][j]**2)
217                if isinstance(other, Data2D):
218                    b = Uncertainty(other.data[i][j], dy_other[i][j]**2)
219                else:
220                    b = other
221               
222                output = operation(a, b)
223                result.data[i][j] = output.x
224                result.err_data[i][j] = math.sqrt(math.fabs(output.variance))
225        return result
226       
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.