Changes in / [998ca90:ff3f5821] in sasview


Ignore:
Files:
6 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed

  • docs/sphinx-docs/build_sphinx.py

    r5dd7499 rdd72190  
    3636#/sasview-local-trunk/docs/sphinx-docs/build_sphinx.py 
    3737SASMODELS_SOURCE_PROLOG = os.path.join(CURRENT_SCRIPT_DIR, "..", "..", "..", "sasmodels", "doc") 
     38SASMODELS_SOURCE_GPU = os.path.join(CURRENT_SCRIPT_DIR, "..", "..", "..", "sasmodels", "doc", "ref", "gpu") 
    3839SASMODELS_SOURCE_SESANS = os.path.join(CURRENT_SCRIPT_DIR, "..", "..", "..", "sasmodels", "doc", "ref", "sesans") 
     40SASMODELS_SOURCE_SESANSIMG = os.path.join(CURRENT_SCRIPT_DIR, "..", "..", "..", "sasmodels", "doc", "ref", "sesans", "sesans_img") 
    3941SASMODELS_SOURCE_MAGNETISM = os.path.join(CURRENT_SCRIPT_DIR, "..", "..", "..", "sasmodels", "doc", "ref", "magnetism") 
    4042SASMODELS_SOURCE_MAGIMG = os.path.join(CURRENT_SCRIPT_DIR, "..", "..", "..", "sasmodels", "doc", "ref", "magnetism", "mag_img") 
    … …  
    5052SASMODELS_DEST_IMG = os.path.join(SASMODELS_DEST_PROLOG, "user", "model-imgs", "new-models") 
    5153SASMODELS_DEST_MAGIMG = os.path.join(SASMODELS_DEST_PROLOG, "user", "mag_img") 
     54SASMODELS_DEST_SESANSIMG = os.path.join(SASMODELS_DEST_PROLOG, "user", "sesans_img") 
    5255SASMODELS_DEST_BUILDIMG = os.path.join(SASMODELS_DEST_PROLOG, "user", "models", "img") 
    5356 
    … …  
    190193            tohere=os.path.join(SASMODELS_DEST_IMG,files) 
    191194            shutil.copy(fromhere,tohere) 
    192         else: print "no source directorty",SASMODELS_SOURCE_AUTOIMG ,"was found" 
     195    else: print "no source directory",SASMODELS_SOURCE_AUTOIMG ,"was found" 
    193196 
    194197    # And the rst prolog with the unit substitutions 
    … …  
    204207                    shutil.copy(fromhere,tohere) 
    205208 
     209    if os.path.exists(SASMODELS_SOURCE_GPU): 
     210        print "Found docs folder SASMODELS_SOURCE_GPU at ", SASMODELS_SOURCE_GPU 
     211        if os.path.exists(SPHINX_SOURCE_USER): 
     212            print "Found docs folder SPHINX_SOURCE_USER      at ", SPHINX_SOURCE_USER 
     213            print "Copying sasmodels gpu files..." 
     214            for files in os.listdir(SASMODELS_SOURCE_GPU): 
     215                if files.endswith(".rst"): 
     216                    fromhere=os.path.join(SASMODELS_SOURCE_GPU,files) 
     217                    tohere=os.path.join(SPHINX_SOURCE_USER,files) 
     218                    shutil.copy(fromhere,tohere) 
     219 
     220 
    206221    if os.path.exists(SASMODELS_SOURCE_SESANS): 
    207222        print "Found docs folder SASMODELS_SOURCE_SESANS at ", SASMODELS_SOURCE_SESANS 
    … …  
    227242 
    228243    if os.path.exists(SASMODELS_SOURCE_MAGIMG): 
    229         print "Found img  folder SASMODELS_SOURCE_MAGIMG    at ", SASMODELS_SOURCE_MAGIMG 
     244        print "Found img folder SASMODELS_SOURCE_MAGIMG   at ", SASMODELS_SOURCE_MAGIMG 
    230245        if not os.path.exists(SASMODELS_DEST_MAGIMG): 
    231246            print "Missing docs folder SASMODELS_DEST_MAGIMG at ", SASMODELS_DEST_MAGIMG 
    … …  
    237252            tohere=os.path.join(SASMODELS_DEST_MAGIMG,files) 
    238253            shutil.copy(fromhere,tohere) 
    239         else: print "no source directorty",SASMODELS_SOURCE_MAGIMG ,"was found" 
     254    else: print "no source directory",SASMODELS_SOURCE_MAGIMG ,"was found" 
     255 
     256    if os.path.exists(SASMODELS_SOURCE_SESANSIMG): 
     257        print "Found img folder SASMODELS_SOURCE_MAGIMG   at ", SASMODELS_SOURCE_SESANSIMG 
     258        if not os.path.exists(SASMODELS_DEST_MAGIMG): 
     259            print "Missing docs folder SASMODELS_DEST_MAGIMG at ", SASMODELS_DEST_SESANSIMG 
     260            os.makedirs(SASMODELS_DEST_SESANSIMG) 
     261            print "created SASMODELS_DEST_SESANSIMG at ", SASMODELS_DEST_SESANSIMG 
     262        print "Copying sasmodels model auto-generated image files..." 
     263        for files in os.listdir(SASMODELS_SOURCE_SESANSIMG): 
     264            fromhere=os.path.join(SASMODELS_SOURCE_SESANSIMG,files) 
     265            tohere=os.path.join(SASMODELS_DEST_SESANSIMG,files) 
     266            shutil.copy(fromhere,tohere) 
     267    else: print "no source directory",SASMODELS_SOURCE_SESANSIMG ,"was found" 
    240268 
    241269    if os.path.exists(SASMODELS_SOURCE_REF_MODELS): 

  • src/sas/sascalc/dataloader/data_info.py

    r45d7662 r1b1a1c1  
    881881                raise ValueError, msg 
    882882            # Here we could also extrapolate between data points 
    883             ZERO = 1.0e-12 
     883            TOLERANCE = 0.01 
    884884            for i in range(len(self.x)): 
    885                 if math.fabs(self.x[i] - other.x[i]) > ZERO: 
     885                if math.fabs((self.x[i] - other.x[i])/self.x[i]) > TOLERANCE: 
    886886                    msg = "Incompatible data sets: x-values do not match" 
    887887                    raise ValueError, msg 
    … …  
    10931093        """ 
    10941094        err_other = None 
     1095        TOLERANCE = 0.01 
    10951096        if isinstance(other, Data2D): 
    10961097            # Check that data lengths are the same 
    … …  
    11011102                raise ValueError, msg 
    11021103            for ind in range(len(self.data)): 
    1103                 if self.qx_data[ind] != other.qx_data[ind]: 
    1104                     msg = "Incompatible data sets: qx-values do not match" 
     1104                if math.fabs((self.qx_data[ind] - other.qx_data[ind])/self.qx_data[ind]) > TOLERANCE: 
     1105                    msg = "Incompatible data sets: qx-values do not match: %s %s" % (self.qx_data[ind], other.qx_data[ind]) 
    11051106                    raise ValueError, msg 
    1106                 if self.qy_data[ind] != other.qy_data[ind]: 
    1107                     msg = "Incompatible data sets: qy-values do not match" 
     1107                if math.fabs((self.qy_data[ind] - other.qy_data[ind])/self.qy_data[ind]) > TOLERANCE: 
     1108                    msg = "Incompatible data sets: qy-values do not match: %s %s" % (self.qy_data[ind], other.qy_data[ind]) 
    11081109                    raise ValueError, msg 
    11091110 

  • src/sas/sasgui/guiframe/dataFitting.py

    rd85c194 r9b6d62d  
    363363        _str = "%s\n" % LoadData2D.__str__(self) 
    364364        return _str  
    365      
    366     def _validity_check(self, other): 
    367         """ 
    368         Checks that the data lengths are compatible. 
    369         Checks that the x vectors are compatible. 
    370         Returns errors vectors equal to original 
    371         errors vectors if they were present or vectors 
    372         of zeros when none was found. 
    373          
    374         :param other: other data set for operation 
    375          
    376         :return: dy for self, dy for other [numpy arrays] 
    377          
    378         :raise ValueError: when lengths are not compatible 
    379          
    380         """ 
    381         err_other = None 
    382         if isinstance(other, Data2D): 
    383             # Check that data lengths are the same 
    384             if len(self.data) != len(other.data) or \ 
    385                 len(self.qx_data) != len(other.qx_data) or \ 
    386                 len(self.qy_data) != len(other.qy_data): 
    387                 msg = "Unable to perform operation: data length are not equal" 
    388                 raise ValueError, msg 
    389             #if len(self.data) < 1: 
    390             #    msg = "Incompatible data sets: I-values do not match" 
    391             #    raise ValueError, msg  
    392             for ind in range(len(self.data)): 
    393                 if self.qx_data[ind] != other.qx_data[ind]: 
    394                     msg = "Incompatible data sets: qx-values do not match" 
    395                     raise ValueError, msg 
    396                 if self.qy_data[ind] != other.qy_data[ind]: 
    397                     msg = "Incompatible data sets: qy-values do not match" 
    398                     raise ValueError, msg 
    399                     
    400             # Check that the scales match 
    401             err_other = other.err_data 
    402             if other.err_data == None or \ 
    403                 (len(other.err_data) != len(other.data)): 
    404                 err_other = numpy.zeros(len(other.data)) 
    405              
    406         # Check that we have errors, otherwise create zero vector 
    407         err = self.err_data 
    408         if self.err_data == None or \ 
    409             (len(self.err_data) != len(self.data)): 
    410             err = numpy.zeros(len(other.data)) 
    411              
    412         return err, err_other 
    413  
    414     def _validity_check_union(self, other): 
    415         """ 
    416         Checks that the data lengths are compatible. 
    417         Checks that the x vectors are compatible. 
    418         Returns errors vectors equal to original 
    419         errors vectors if they were present or vectors 
    420         of zeros when none was found. 
    421          
    422         :param other: other data set for operation 
    423          
    424         :return: bool 
    425          
    426         :raise ValueError: when data types are not compatible 
    427          
    428         """ 
    429         if not isinstance(other, Data2D): 
    430             msg = "Unable to perform operation: different types of data set" 
    431             raise ValueError, msg    
    432         return True 
    433      
     365 
    434366    def _perform_operation(self, other, operation): 
    435367        """ 

  • src/sas/sasgui/perspectives/calculator/data_operator.py

    r0e760e9 r61780e3  
    397397            self._set_textctrl_color(self.data1_cbox, 'pink') 
    398398            self._set_textctrl_color(self.data2_cbox, 'pink') 
    399             msg = "DataOperation: Data types must be same." 
     399            msg = "DataOperation: %s" % sys.exc_value 
    400400            self.send_warnings(msg, 'error') 
    401401            self.output = None 

  • src/sas/sasgui/perspectives/fitting/fitting.py

    re89aed5 r286c757  
    17421742                                      data_id=str(page_id) + " " + data.name + " unsmeared") 
    17431743 
    1744                 self.create_theory_1D(x, unsmeared_data, page_id, model, data, state, 
    1745                                       data_description="Data unsmeared", 
    1746                                       data_id="Data  " + data.name + " unsmeared", 
    1747                                       dy=unsmeared_error) 
     1744                if unsmeared_data is not None and unsmeared_error is not None: 
     1745                    self.create_theory_1D(x, unsmeared_data, page_id, model, data, state, 
     1746                                          data_description="Data unsmeared", 
     1747                                          data_id="Data  " + data.name + " unsmeared", 
     1748                                          dy=unsmeared_error) 
    17481749                 
    17491750            if sq_model is not None and pq_model is not None: 

  • src/sas/sasgui/perspectives/fitting/model_thread.py

    rca4d985 r286c757  
    179179            unsmeared_output[first_bin:last_bin+1] = self.model.evalDistribution(mask) 
    180180            output = self.smearer(unsmeared_output, first_bin, last_bin) 
    181              
     181 
    182182            # Rescale data to unsmeared model 
    183             unsmeared_data = numpy.zeros((len(self.data.x))) 
    184             unsmeared_error = numpy.zeros((len(self.data.x))) 
    185             unsmeared_data[first_bin:last_bin+1] = self.data.y[first_bin:last_bin+1]\ 
    186                                                     * unsmeared_output[first_bin:last_bin+1]\ 
    187                                                     / output[first_bin:last_bin+1] 
    188             unsmeared_error[first_bin:last_bin+1] = self.data.dy[first_bin:last_bin+1]\ 
    189                                                     * unsmeared_output[first_bin:last_bin+1]\ 
    190                                                     / output[first_bin:last_bin+1] 
    191             unsmeared_output=unsmeared_output[index] 
    192             unsmeared_data=unsmeared_data[index] 
    193             unsmeared_error=unsmeared_error 
     183            # Check that the arrays are compatible. If we only have a model but no data, 
     184            # the length of data.y will be zero. 
     185            if isinstance(self.data.y, numpy.ndarray) and output.shape == self.data.y.shape: 
     186                unsmeared_data = numpy.zeros((len(self.data.x))) 
     187                unsmeared_error = numpy.zeros((len(self.data.x))) 
     188                unsmeared_data[first_bin:last_bin+1] = self.data.y[first_bin:last_bin+1]\ 
     189                                                        * unsmeared_output[first_bin:last_bin+1]\ 
     190                                                        / output[first_bin:last_bin+1] 
     191                unsmeared_error[first_bin:last_bin+1] = self.data.dy[first_bin:last_bin+1]\ 
     192                                                        * unsmeared_output[first_bin:last_bin+1]\ 
     193                                                        / output[first_bin:last_bin+1] 
     194                unsmeared_output=unsmeared_output[index] 
     195                unsmeared_data=unsmeared_data[index] 
     196                unsmeared_error=unsmeared_error 
    194197        else: 
    195198            output[index] = self.model.evalDistribution(self.data.x[index]) 
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.