Changeset ee18d33 in sasview


Ignore:
Timestamp:
Aug 9, 2017 9:52:07 AM (7 years ago)
Author:
Piotr Rozyczko <rozyczko@…>
Branches:
ESS_GUI, ESS_GUI_Docs, ESS_GUI_batch_fitting, ESS_GUI_bumps_abstraction, ESS_GUI_iss1116, ESS_GUI_iss879, ESS_GUI_iss959, ESS_GUI_opencl, ESS_GUI_ordering, ESS_GUI_sync_sascalc
Children:
38eb433
Parents:
985ad94
Message:

Initial setup for batch fitting. SASVIEW-615

Location:
src/sas/qtgui
Files:
7 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed

  • src/sas/qtgui/MainWindow/DataExplorer.py

    rb0c5e8c ree18d33  
    352352 
    353353        # Notify the GuiManager about the send request 
    354         self._perspective().setData(data_item=selected_items) 
     354        self._perspective().setData(data_item=selected_items, is_batch=self.chkBatch.isChecked()) 
    355355 
    356356    def freezeTheory(self, event): 

  • src/sas/qtgui/Perspectives/Fitting/FitThread.py

    r7adc2a8 ree18d33  
    7070            list_fit_function = ['fit']*fitter_size 
    7171            list_q = [None]*fitter_size 
     72 
    7273            inputs = zip(list_map_get_attr, self.fitter, list_fit_function, 
    7374                         list_q, list_q, list_handler, list_curr_thread, 
    7475                         list_reset_flag) 
    7576            result = map(map_apply, inputs) 
    76             results = (result[0], time.time()-self.starttime) 
     77            results = (result, time.time()-self.starttime) 
    7778            if self.handler: 
    7879                self.completefn(results) 

  • src/sas/qtgui/Perspectives/Fitting/FittingLogic.py

    rdc5ef15 ree18d33  
    178178    def computeDataRange(self): 
    179179        """ 
     180        Wrapper for calculating the data range based on local dataset 
     181        """ 
     182        return self.computeRangeFromData(self.data) 
     183 
     184    def computeRangeFromData(self, data): 
     185        """ 
    180186        Compute the minimum and the maximum range of the data 
    181187        return the npts contains in data 
    182188        """ 
    183189        qmin, qmax, npts = None, None, None 
    184         if isinstance(self.data, Data1D): 
     190        if isinstance(data, Data1D): 
    185191            try: 
    186                 qmin = min(self.data.x) 
    187                 qmax = max(self.data.x) 
    188                 npts = len(self.data.x) 
     192                qmin = min(data.x) 
     193                qmax = max(data.x) 
     194                npts = len(data.x) 
    189195            except (ValueError, TypeError): 
    190196                msg = "Unable to find min/max/length of \n data named %s" % \ 
    … …  
    195201            qmin = 0 
    196202            try: 
    197                 x = max(np.fabs(self.data.xmin), np.fabs(self.data.xmax)) 
    198                 y = max(np.fabs(self.data.ymin), np.fabs(self.data.ymax)) 
     203                x = max(np.fabs(data.xmin), np.fabs(data.xmax)) 
     204                y = max(np.fabs(data.ymin), np.fabs(data.ymax)) 
    199205            except (ValueError, TypeError): 
    200206                msg = "Unable to find min/max of \n data named %s" % \ 
    … …  
    202208                raise ValueError, msg 
    203209            qmax = np.sqrt(x * x + y * y) 
    204             npts = len(self.data.data) 
     210            npts = len(data.data) 
    205211        return qmin, qmax, npts 

  • src/sas/qtgui/Perspectives/Fitting/FittingPerspective.py

    rb0c5e8c ree18d33  
    9797            event.ignore() 
    9898 
    99     def addFit(self, data): 
     99    def addFit(self, data, is_batch=False): 
    100100        """ 
    101101        Add a new tab for passed data 
    102102        """ 
    103103        tab     = FittingWidget(parent=self.parent, data=data, tab_id=self.maxIndex+1) 
     104        tab.is_batch_fitting = is_batch 
    104105        # Add this tab to the object library so it can be retrieved by scripting/jupyter 
    105106        ObjectLibrary.addObject(self.tabName(), tab) 
    … …  
    133134        return True 
    134135 
    135     def setData(self, data_item=None): 
     136    def setData(self, data_item=None, is_batch=False): 
    136137        """ 
    137138        Assign new dataset to the fitting instance 
    … …  
    149150            raise AttributeError, msg 
    150151 
    151         for data in data_item: 
     152        items = [data_item] if is_batch else data_item 
     153 
     154        for data in items: 
    152155            # Find the first unassigned tab. 
    153156            # If none, open a new tab. 
    … …  
    157160                self.tabs[available_tabs.index(True)].data = data 
    158161            else: 
    159                 self.addFit(data) 
     162                self.addFit(data, is_batch=is_batch) 
    160163 
    161164    def onFittingOptionsChange(self, fit_engine): 

  • src/sas/qtgui/Perspectives/Fitting/FittingWidget.py

    r7adc2a8 ree18d33  
    4848DEFAULT_POLYDISP_FUNCTION = 'gaussian' 
    4949 
    50 USING_TWISTED = True 
     50USING_TWISTED = False 
    5151 
    5252class FittingWidget(QtGui.QWidget, Ui_FittingWidgetUI): 
    … …  
    6565 
    6666        # Main Data[12]D holder 
    67         self.logic = FittingLogic(data=data) 
     67        self.logic = FittingLogic() 
    6868 
    6969        # Globals 
    … …  
    117117    def data(self, value): 
    118118        """ data setter """ 
    119         assert isinstance(value, QtGui.QStandardItem) 
     119        if isinstance(value, list): 
     120            self.is_batch_fitting = True 
     121        else: 
     122            value = [value] 
     123 
     124        assert isinstance(value[0], QtGui.QStandardItem) 
    120125        # _index contains the QIndex with data 
    121         self._index = value 
     126        self._index = value[0] 
     127 
     128        # Keep reference to all datasets for batch 
     129        self.all_data = value 
    122130 
    123131        # Update logics with data items 
    124         self.logic.data = GuiUtils.dataFromItem(value) 
     132        self.logic.data = GuiUtils.dataFromItem(value[0]) 
    125133 
    126134        # Overwrite data type descriptor 
    … …  
    140148        # Data[12]D passed and set 
    141149        self.data_is_loaded = False 
     150        # Batch/single fitting 
     151        self.is_batch_fitting = False 
    142152        # Current SasModel in view 
    143153        self.kernel_module = None 
    … …  
    294304        self.chk2DView.setVisible(False) 
    295305        self.chkMagnetism.setEnabled(self.is2D) 
     306        # Combo box or label for file name" 
     307        if self.is_batch_fitting: 
     308            self.lblFilename.setVisible(False) 
     309            for dataitem in self.all_data: 
     310                filename = GuiUtils.dataFromItem(dataitem).filename 
     311                self.cbFileNames.addItem(filename) 
     312            self.cbFileNames.setVisible(True) 
    296313        # Similarly on other tabs 
    297314        self.options_widget.setEnablementOnDataLoad() 
    … …  
    344361        Set initial control enablement 
    345362        """ 
     363        self.cbFileNames.setVisible(False) 
    346364        self.cmdFit.setEnabled(False) 
    347365        self.cmdPlot.setEnabled(False) 
    … …  
    370388        self.cbCategory.currentIndexChanged.connect(self.onSelectCategory) 
    371389        self.cbModel.currentIndexChanged.connect(self.onSelectModel) 
     390        self.cbFileNames.currentIndexChanged.connect(self.onSelectBatchFilename) 
    372391        # Checkboxes 
    373392        self.chk2DView.toggled.connect(self.toggle2D) 
    … …  
    423442 
    424443        self.respondToModelStructure(model=model, structure_factor=None) 
     444 
     445    def onSelectBatchFilename(self, data_index): 
     446        """ 
     447        Update the logic based on the selected file in batch fitting 
     448        """ 
     449        self._index = self.all_data[data_index] 
     450        self.logic.data = GuiUtils.dataFromItem(self.all_data[data_index]) 
     451        self.updateQRange() 
    425452 
    426453    def onSelectStructureFactor(self): 
    … …  
    613640        Perform fitting on the current data 
    614641        """ 
    615         fitter = Fit() 
    616642 
    617643        # Data going in 
    … …  
    650676 
    651677        # Parameterize the fitter 
    652         fitter.set_model(model, fit_id, params_to_fit, data=data, 
    653                          constraints=constraints) 
    654  
    655         fitter.set_data(data=data, id=fit_id, smearer=smearer, qmin=qmin, 
    656                         qmax=qmax) 
    657         fitter.select_problem_for_fit(id=fit_id, value=1) 
    658  
    659         fitter.fitter_id = page_id 
     678        fitters = [] 
     679        for fit_index in self.all_data: 
     680            fitter = Fit() 
     681            data = GuiUtils.dataFromItem(fit_index) 
     682            fitter.set_model(model, fit_id, params_to_fit, data=data, 
     683                             constraints=constraints) 
     684            qmin, qmax, _ = self.logic.computeRangeFromData(data) 
     685            fitter.set_data(data=data, id=fit_id, smearer=smearer, qmin=qmin, 
     686                            qmax=qmax) 
     687            fitter.select_problem_for_fit(id=fit_id, value=1) 
     688            fitter.fitter_id = page_id 
     689            fit_id += 1 
     690            fitters.append(fitter) 
    660691 
    661692        # Create the fitting thread, based on the fitter 
     693        completefn = self.batchFitComplete if self.is_batch_fitting else self.fitComplete 
     694 
    662695        calc_fit = FitThread(handler=handler, 
    663                              fn=[fitter], 
    664                              batch_inputs=batch_inputs, 
    665                              batch_outputs=batch_outputs, 
    666                              page_id=list_page_id, 
    667                              updatefn=updater, 
    668                              completefn=self.fitComplete) 
     696                                fn=fitters, 
     697                                batch_inputs=batch_inputs, 
     698                                batch_outputs=batch_outputs, 
     699                                page_id=list_page_id, 
     700                                updatefn=updater, 
     701                                completefn=completefn) 
    669702 
    670703        if USING_TWISTED: 
    … …  
    696729        pass 
    697730 
    698     def fitComplete(self, result): 
    699         """ 
    700         Receive and display fitting results 
    701         "result" is a tuple of actual result list and the fit time in seconds 
     731    def batchFitComplete(self, result): 
     732        """ 
     733        Receive and display batch fitting results 
    702734        """ 
    703735        #re-enable the Fit button 
    … …  
    705737        self.cmdFit.setEnabled(True) 
    706738 
     739        print ("BATCH FITTING FINISHED") 
     740        # Add the Qt version of wx.aui.AuiNotebook and populate it 
     741        pass 
     742 
     743    def fitComplete(self, result): 
     744        """ 
     745        Receive and display fitting results 
     746        "result" is a tuple of actual result list and the fit time in seconds 
     747        """ 
     748        #re-enable the Fit button 
     749        self.cmdFit.setText("Fit") 
     750        self.cmdFit.setEnabled(True) 
     751 
    707752        assert result is not None 
    708753 
    709         res_list = result[0] 
     754        res_list = result[0][0] 
    710755        res = res_list[0] 
    711756        if res.fitness is None or \ 

  • src/sas/qtgui/Perspectives/Fitting/UI/FittingWidgetUI.ui

    raca8418 ree18d33  
    2020   <string>FittingWidget</string> 
    2121  </property> 
    22   <layout class="QGridLayout" name="gridLayout_15"> 
    23    <item row="0" column="0"> 
    24     <widget class="QLabel" name="label"> 
    25      <property name="text"> 
    26       <string>File name:</string> 
    27      </property> 
    28     </widget> 
    29    </item> 
    30    <item row="0" column="1"> 
    31     <widget class="QLabel" name="lblFilename"> 
    32      <property name="text"> 
    33       <string>None</string> 
    34      </property> 
    35     </widget> 
    36    </item> 
    37    <item row="0" column="2" colspan="4"> 
    38     <spacer name="horizontalSpacer_4"> 
    39      <property name="orientation"> 
    40       <enum>Qt::Horizontal</enum> 
    41      </property> 
    42      <property name="sizeHint" stdset="0"> 
    43       <size> 
    44        <width>459</width> 
    45        <height>20</height> 
    46       </size> 
    47      </property> 
    48     </spacer> 
    49    </item> 
    50    <item row="2" column="3"> 
    51     <widget class="QPushButton" name="cmdPlot"> 
    52      <property name="sizePolicy"> 
    53       <sizepolicy hsizetype="Fixed" vsizetype="Fixed"> 
    54        <horstretch>0</horstretch> 
    55        <verstretch>0</verstretch> 
    56       </sizepolicy> 
    57      </property> 
    58      <property name="minimumSize"> 
    59       <size> 
    60        <width>75</width> 
    61        <height>23</height> 
    62       </size> 
    63      </property> 
    64      <property name="text"> 
    65       <string>Show Plot</string> 
    66      </property> 
    67     </widget> 
    68    </item> 
    69    <item row="2" column="4"> 
    70     <widget class="QPushButton" name="cmdFit"> 
    71      <property name="sizePolicy"> 
    72       <sizepolicy hsizetype="Fixed" vsizetype="Fixed"> 
    73        <horstretch>0</horstretch> 
    74        <verstretch>0</verstretch> 
    75       </sizepolicy> 
    76      </property> 
    77      <property name="minimumSize"> 
    78       <size> 
    79        <width>75</width> 
    80        <height>23</height> 
    81       </size> 
    82      </property> 
    83      <property name="text"> 
    84       <string>Fit</string> 
    85      </property> 
    86     </widget> 
    87    </item> 
    88    <item row="2" column="5"> 
    89     <widget class="QPushButton" name="cmdHelp"> 
    90      <property name="sizePolicy"> 
    91       <sizepolicy hsizetype="Fixed" vsizetype="Fixed"> 
    92        <horstretch>0</horstretch> 
    93        <verstretch>0</verstretch> 
    94       </sizepolicy> 
    95      </property> 
    96      <property name="minimumSize"> 
    97       <size> 
    98        <width>75</width> 
    99        <height>23</height> 
    100       </size> 
    101      </property> 
    102      <property name="text"> 
    103       <string>Help</string> 
    104      </property> 
    105     </widget> 
    106    </item> 
    107    <item row="2" column="0" colspan="3"> 
    108     <spacer name="horizontalSpacer"> 
    109      <property name="orientation"> 
    110       <enum>Qt::Horizontal</enum> 
    111      </property> 
    112      <property name="sizeHint" stdset="0"> 
    113       <size> 
    114        <width>273</width> 
    115        <height>20</height> 
    116       </size> 
    117      </property> 
    118     </spacer> 
    119    </item> 
    120    <item row="1" column="0" colspan="6"> 
     22  <layout class="QGridLayout" name="gridLayout_4"> 
     23   <item row="0" column="0" colspan="4"> 
     24    <layout class="QHBoxLayout" name="horizontalLayout"> 
     25     <item> 
     26      <widget class="QLabel" name="label"> 
     27       <property name="text"> 
     28        <string>File name:</string> 
     29       </property> 
     30      </widget> 
     31     </item> 
     32     <item> 
     33      <layout class="QGridLayout" name="gridLayout_3"> 
     34       <item row="0" column="0"> 
     35        <widget class="QComboBox" name="cbFileNames"> 
     36         <property name="sizeAdjustPolicy"> 
     37          <enum>QComboBox::AdjustToContents</enum> 
     38         </property> 
     39        </widget> 
     40       </item> 
     41       <item row="0" column="1"> 
     42        <widget class="QLabel" name="lblFilename"> 
     43         <property name="text"> 
     44          <string>None</string> 
     45         </property> 
     46        </widget> 
     47       </item> 
     48      </layout> 
     49     </item> 
     50     <item> 
     51      <spacer name="horizontalSpacer_4"> 
     52       <property name="orientation"> 
     53        <enum>Qt::Horizontal</enum> 
     54       </property> 
     55       <property name="sizeHint" stdset="0"> 
     56        <size> 
     57         <width>459</width> 
     58         <height>20</height> 
     59        </size> 
     60       </property> 
     61      </spacer> 
     62     </item> 
     63    </layout> 
     64   </item> 
     65   <item row="1" column="0" colspan="4"> 
    12166    <widget class="QTabWidget" name="tabFitting"> 
    12267     <property name="currentIndex"> 
    … …  
    457402    </widget> 
    458403   </item> 
     404   <item row="2" column="0"> 
     405    <spacer name="horizontalSpacer"> 
     406     <property name="orientation"> 
     407      <enum>Qt::Horizontal</enum> 
     408     </property> 
     409     <property name="sizeHint" stdset="0"> 
     410      <size> 
     411       <width>273</width> 
     412       <height>20</height> 
     413      </size> 
     414     </property> 
     415    </spacer> 
     416   </item> 
     417   <item row="2" column="1"> 
     418    <widget class="QPushButton" name="cmdPlot"> 
     419     <property name="sizePolicy"> 
     420      <sizepolicy hsizetype="Fixed" vsizetype="Fixed"> 
     421       <horstretch>0</horstretch> 
     422       <verstretch>0</verstretch> 
     423      </sizepolicy> 
     424     </property> 
     425     <property name="minimumSize"> 
     426      <size> 
     427       <width>75</width> 
     428       <height>23</height> 
     429      </size> 
     430     </property> 
     431     <property name="text"> 
     432      <string>Show Plot</string> 
     433     </property> 
     434    </widget> 
     435   </item> 
     436   <item row="2" column="2"> 
     437    <widget class="QPushButton" name="cmdFit"> 
     438     <property name="sizePolicy"> 
     439      <sizepolicy hsizetype="Fixed" vsizetype="Fixed"> 
     440       <horstretch>0</horstretch> 
     441       <verstretch>0</verstretch> 
     442      </sizepolicy> 
     443     </property> 
     444     <property name="minimumSize"> 
     445      <size> 
     446       <width>75</width> 
     447       <height>23</height> 
     448      </size> 
     449     </property> 
     450     <property name="text"> 
     451      <string>Fit</string> 
     452     </property> 
     453    </widget> 
     454   </item> 
     455   <item row="2" column="3"> 
     456    <widget class="QPushButton" name="cmdHelp"> 
     457     <property name="sizePolicy"> 
     458      <sizepolicy hsizetype="Fixed" vsizetype="Fixed"> 
     459       <horstretch>0</horstretch> 
     460       <verstretch>0</verstretch> 
     461      </sizepolicy> 
     462     </property> 
     463     <property name="minimumSize"> 
     464      <size> 
     465       <width>75</width> 
     466       <height>23</height> 
     467      </size> 
     468     </property> 
     469     <property name="text"> 
     470      <string>Help</string> 
     471     </property> 
     472    </widget> 
     473   </item> 
    459474  </layout> 
    460475 </widget> 

  • src/sas/qtgui/Perspectives/Invariant/InvariantPerspective.py

    rb0c5e8c ree18d33  
    539539        self.mapper.toFirst() 
    540540 
    541     def setData(self, data_item): 
     541    def setData(self, data_item, is_batch=False): 
    542542        """ 
    543543        Obtain a QStandardItem object and dissect it to get Data1D/2D 
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.