Changes in / [a3c59503:d00475d] in sasview


Ignore:
Files:
2 added
20 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed

  • build_tools/conda_qt5_min_osx.yml

    r16417bb rc18ca00  
    1515 - pytest 
    1616 - mako 
    17  - pyinstaller  
     17 - pyinstaller=3.3.1 
    1818 - pyopencl 
    1919 - testpath=0.3.1 

  • build_tools/conda_qt5_win.yml

    r16417bb r7ecece1  
    1717 - pytest 
    1818 - mako 
    19  - pyinstaller  
     19 - pyinstaller=3.3.1 
    2020 - pyopencl 
    2121 - testpath=0.3.1 

  • src/sas/qtgui/MainWindow/DataExplorer.py

    ra3c59503 r6bc0840  
    14701470        self.manager.update_stored_data(deleted_names) 
    14711471 
     1472    def closeAllPlots(self): 
     1473        """ 
     1474        Close all currently displayed plots 
     1475        """ 
     1476 
     1477        for plot_id in PlotHelper.currentPlots(): 
     1478            try: 
     1479                plotter = PlotHelper.plotById(plot_id) 
     1480                plotter.close() 
     1481                self.plot_widgets[plot_id].close() 
     1482                self.plot_widgets.pop(plot_id, None) 
     1483            except AttributeError as ex: 
     1484                logging.error("Closing of %s failed:\n %s" % (plot_id, str(ex))) 
     1485 
    14721486    def closePlotsForItem(self, item): 
    14731487        """ 

  • src/sas/qtgui/MainWindow/GuiManager.py

    ra3c59503 r8748751  
    2424from sas.qtgui.Utilities.PluginManager import PluginManager 
    2525from sas.qtgui.Utilities.GridPanel import BatchOutputPanel 
     26from sas.qtgui.Utilities.ResultPanel import ResultPanel 
    2627 
    2728from sas.qtgui.Utilities.ReportDialog import ReportDialog 
    … …  
    147148        self.aboutWidget = AboutBox() 
    148149        self.categoryManagerWidget = CategoryManager(self._parent, manager=self) 
     150 
    149151        self.grid_window = None 
    150152        self.grid_window = BatchOutputPanel(parent=self) 
    … …  
    154156        self.grid_subwindow.setVisible(False) 
    155157        self.grid_window.windowClosedSignal.connect(lambda: self.grid_subwindow.setVisible(False)) 
     158 
     159        self.results_panel = ResultPanel(parent=self._parent, manager=self) 
     160        self.results_frame = self._workspace.workspace.addSubWindow(self.results_panel) 
     161        self.results_frame.setVisible(False) 
     162        self.results_panel.windowClosedSignal.connect(lambda: self.results_frame.setVisible(False)) 
    156163 
    157164        self._workspace.toolBar.setVisible(LocalConfig.TOOLBAR_SHOW) 
    … …  
    443450        """ 
    444451        # disable not yet fully implemented actions 
    445         #self._workspace.actionOpen_Analysis.setVisible(False) 
    446452        self._workspace.actionUndo.setVisible(False) 
    447453        self._workspace.actionRedo.setVisible(False) 
    … …  
    450456        self._workspace.actionImage_Viewer.setVisible(False) 
    451457        self._workspace.actionCombine_Batch_Fit.setVisible(False) 
    452         self._workspace.actionFit_Results.setVisible(False) 
    453458        # orientation viewer set to invisible SASVIEW-1132 
    454459        self._workspace.actionOrientation_Viewer.setVisible(False) 
    … …  
    510515        self._workspace.actionNext.triggered.connect(self.actionNext) 
    511516        self._workspace.actionPrevious.triggered.connect(self.actionPrevious) 
     517        self._workspace.actionClosePlots.triggered.connect(self.actionClosePlots) 
    512518        # Analysis 
    513519        self._workspace.actionFitting.triggered.connect(self.actionFitting) 
    … …  
    524530 
    525531        self.communicate.sendDataToGridSignal.connect(self.showBatchOutput) 
     532        self.communicate.resultPlotUpdateSignal.connect(self.showFitResults) 
    526533 
    527534    #============ FILE ================= 
    … …  
    853860        """ 
    854861        """ 
    855         print("actionFit_Results TRIGGERED") 
    856         pass 
     862        self.showFitResults(None) 
     863 
     864    def showFitResults(self, output_data): 
     865        """ 
     866        Show bumps convergence plots 
     867        """ 
     868        self.results_frame.setVisible(True) 
     869        if output_data: 
     870            self.results_panel.onPlotResults(output_data) 
    857871 
    858872    def actionAdd_Custom_Model(self): 
    … …  
    945959        """ 
    946960        self._workspace.workspace.activatePreviousSubWindow() 
     961 
     962    def actionClosePlots(self): 
     963        """ 
     964        Closes all Plotters and Plotter2Ds. 
     965        """ 
     966        self.filesWidget.closeAllPlots() 
     967        pass 
    947968 
    948969    #============ HELP ================= 

  • src/sas/qtgui/MainWindow/MainWindow.py

    rb14db78 r33812c3  
    66from PyQt5.QtWidgets import QApplication 
    77from PyQt5.QtGui import QPixmap 
     8from PyQt5.QtCore import Qt 
    89import os 
    910import sys 
    … …  
    5859    splash = SplashScreen() 
    5960    splash.show() 
    60  
     61    app.setAttribute(Qt.AA_EnableHighDpiScaling) 
    6162    # fix for pyinstaller packages app to avoid ReactorAlreadyInstalledError 
    6263    import sys 

  • src/sas/qtgui/MainWindow/UI/MainWindowUI.ui

    refaf022 r6bc0840  
    2525     <y>0</y> 
    2626     <width>915</width> 
    27      <height>21</height> 
     27     <height>26</height> 
    2828    </rect> 
    2929   </property> 
    … …  
    128128    <addaction name="actionPrevious"/> 
    129129    <addaction name="separator"/> 
     130    <addaction name="actionClosePlots"/> 
    130131   </widget> 
    131132   <widget class="QMenu" name="menuAnalysis"> 
    … …  
    571572   </property> 
    572573  </action> 
     574  <action name="actionClosePlots"> 
     575   <property name="text"> 
     576    <string>Close All Plots</string> 
     577   </property> 
     578  </action> 
    573579 </widget> 
    574580 <resources/> 

  • src/sas/qtgui/Perspectives/Fitting/FittingWidget.py

    rb8dccb8 r75906a1  
    15731573        if param_dict is None: 
    15741574            return 
     1575        if hasattr(res, 'convergence') and len(res.convergence)>0: 
     1576            self.communicate.resultPlotUpdateSignal.emit(result[0]) 
    15751577 
    15761578        elapsed = result[1] 
    … …  
    23332335        max_column = self.lstParams.itemDelegate().param_max 
    23342336        if model_column == param_column: 
    2335             self.kernel_module.setParam(parameter_name, value) 
     2337            # don't try to update multiplicity counters if they aren't there. 
     2338            # Note that this will fail for proper bad update where the model 
     2339            # doesn't contain multiplicity parameter 
     2340            if parameter_name != self.kernel_module.multiplicity_info.control: 
     2341                self.kernel_module.setParam(parameter_name, value) 
    23362342        elif model_column == min_column: 
    23372343            # min/max to be changed in self.kernel_module.details[parameter_name] = ['Ang', 0.0, inf] 
    … …  
    33733379        else: 
    33743380            index = self.theory_item 
     3381        params = FittingUtilities.getStandardParam(self._model_model) 
    33753382        report_logic = ReportPageLogic(self, 
    33763383                                       kernel_module=self.kernel_module, 
    33773384                                       data=self.data, 
    33783385                                       index=index, 
    3379                                        model=self._model_model) 
     3386                                       params=params) 
    33803387 
    33813388        return report_logic.reportList() 

  • src/sas/qtgui/Perspectives/Fitting/ReportPageLogic.py

    r085ee014 r75906a1  
    1313 
    1414import sas.qtgui.Utilities.GuiUtils as GuiUtils 
    15 from sas.qtgui.Perspectives.Fitting import FittingUtilities 
    1615 
    1716class ReportPageLogic(object): 
    … …  
    1918    Logic for the Report Page functionality. Refactored from FittingWidget. 
    2019    """ 
    21     def __init__(self, parent=None, kernel_module=None, data=None, index=None, model=None): 
     20    def __init__(self, parent=None, kernel_module=None, data=None, index=None, params=None): 
    2221 
    2322        self.parent = parent 
    … …  
    2524        self.data = data 
    2625        self._index = index 
    27         self.model = model 
     26        self.params = params 
    2827 
    2928    @staticmethod 
    … …  
    119118        Look at widget state and extract parameters 
    120119        """ 
    121         pars = FittingUtilities.getStandardParam(self.model) 
    122         if pars is None: 
     120        if self.params is None: 
    123121            return "" 
    124122 
    125123        report = "" 
    126124        plus_minus = " &#177; " 
    127         for value in pars: 
     125        for value in self.params: 
    128126            try: 
    129127                par_name = value[1] 

  • src/sas/qtgui/Perspectives/Inversion/InversionPerspective.py

    r6ae7466 raed159f  
    473473            self._calculator.set_qmax(qmax) 
    474474            if np.size(self.logic.data.dy) == 0 or np.all(self.logic.data.dy) == 0: 
    475                 self.logic.data.dy = self._calculator.add_errors(self.logic.data.y) 
     475                self._calculator.add_errors() 
    476476            self.updateDataList(data) 
    477477            self.populateDataComboBox(self.logic.data.filename, data) 

  • src/sas/qtgui/Plotting/Binder.py

    rcee5c78 r75906a1  
    233233        """ 
    234234        # TODO: sort by zorder of axes then by zorder within axes 
    235         #self._artists.sort(cmp=lambda x, y: cmp(y.zorder, x.zorder)) 
    236         #self._artists.sort(cmp=lambda x, y: y.zorder.__gt__(x.zorder)) 
    237235        found = Selection() 
     236        self._artists.sort(key=lambda x: x.zorder, reverse=True) 
    238237        for artist in self._artists: 
    239238            # TODO: should contains() return false if invisible? 

  • src/sas/qtgui/Plotting/ColorMap.py

    rd6b8a1d r8fad50b  
    88 
    99import matplotlib as mpl 
    10 from matplotlib import pylab 
    1110import numpy 
    1211 
    … …  
    3231        self.data = data 
    3332        self._cmap_orig = self._cmap = cmap if cmap is not None else DEFAULT_MAP 
    34         self.all_maps = [m for m in pylab.cm.datad] 
     33        self.all_maps = [m for m in mpl.cm.datad] 
    3534        self.maps = sorted(m for m in self.all_maps if not m.endswith("_r")) 
    3635        self.rmaps = sorted(set(self.all_maps) - set(self.maps)) 

  • src/sas/qtgui/Plotting/ConvertUnits.py

    rb8080e1 r75906a1  
    1010    """ 
    1111    if power != 0: 
    12         if unit.find("^") != -1:  # if the unit contains a powerer ^ 
    13             toks = re.split("\^", unit) 
     12        if unit.find("^") != -1:  # if the unit contains a power ^ 
     13            toks = re.split(r"\^", unit) 
    1414            if toks[0].find("/") != -1 or \ 
    1515                toks[0].find("-") != -1: 

  • src/sas/qtgui/Plotting/Plotter2D.py

    r2f55df6 r8fad50b  
    11import copy 
    22import numpy 
    3 import pylab 
    43import functools 
    54import logging 
    … …  
    98from PyQt5 import QtWidgets 
    109 
    11 DEFAULT_CMAP = pylab.cm.jet 
    1210 
    1311#import sys 
    … …  
    1513import matplotlib as mpl 
    1614mpl.use("Qt5Agg") 
     15DEFAULT_CMAP = mpl.cm.jet 
    1716 
    1817from mpl_toolkits.mplot3d import Axes3D 

  • src/sas/qtgui/Plotting/PlotterBase.py

    r34f13a83 r8fad50b  
    1 import pylab 
    21import numpy 
    32 
    … …  
    109 
    1110import matplotlib.pyplot as plt 
     11import matplotlib as mpl 
    1212from matplotlib import rcParams 
    1313 
    14 DEFAULT_CMAP = pylab.cm.jet 
     14DEFAULT_CMAP = mpl.cm.jet 
    1515from sas.qtgui.Plotting.Binder import BindArtist 
    1616from sas.qtgui.Plotting.PlotterData import Data1D 

  • src/sas/qtgui/Plotting/Slicers/AzimutSlicer.py

    re20870bc r75906a1  
    137137        sector = sect(self.base.data2D) 
    138138 
    139         from sas.sasgui.guiframe.dataFitting import Data1D 
     139        from sas.qtgui.Plotting.PlotterData import Data1D 
    140140        if hasattr(sector, "dxl"): 
    141141            dxl = sector.dxl 

  • src/sas/qtgui/Utilities/CategoryInstaller.py

    rc889a3e r75906a1  
    2626    def __init__(self): 
    2727        """ initialization """ 
    28  
    29     @staticmethod 
    30     def _get_installed_model_dir(): 
    31         """ 
    32         returns the dir where installed_models.txt should be 
    33         """ 
    34         import sas.sascalc.dataloader.readers 
    35         return sas.sascalc.dataloader.readers.get_data_path() 
    36  
    37     @staticmethod 
    38     def _get_models_py_dir(): 
    39         """ 
    40         returns the dir where models.py should be 
    41         """ 
    42         import sas.sasgui.perspectives.fitting.models 
    43         return sas.sasgui.perspectives.fitting.models.get_model_python_path() 
    44  
    45     @staticmethod 
    46     def _get_default_cat_file_dir(): 
    47         """ 
    48         returns the dir where default_cat.j should be 
    49         """ 
    50         # The default categories file is usually found with the code, except 
    51         # when deploying using py2app (it will be in Contents/Resources), or 
    52         # py2exe (it will be in the exec dir). 
    53         import sas.sasview 
    54         cat_file = "default_categories.json" 
    55  
    56         possible_cat_file_paths = [ 
    57             os.path.join(os.path.split(sas.sasview.__file__)[0], cat_file),           # Source 
    58             os.path.join(os.path.dirname(sys.executable), '..', 'Resources', cat_file), # Mac 
    59             os.path.join(os.path.dirname(sys.executable), cat_file)                     # Windows 
    60         ] 
    61  
    62         for path in possible_cat_file_paths: 
    63             if os.path.isfile(path): 
    64                 return os.path.dirname(path) 
    65  
    66         raise RuntimeError('CategoryInstaller: Could not find folder containing default categories') 
    6728 
    6829    @staticmethod 

  • src/sas/qtgui/Utilities/GridPanel.py

    ra4b9b7a r75906a1  
    491491        """ 
    492492        location = GuiUtils.HELP_DIRECTORY_LOCATION 
    493         url = "/user/sasgui/perspectives/pr/pr_help.html#batch-pr-mode" 
     493        url = "/user/qtgui/Perspectives/Fitting/fitting_help.html#batch-fit-mode" 
    494494        try: 
    495495            webbrowser.open('file://' + os.path.realpath(location + url)) 

  • src/sas/qtgui/Utilities/GuiUtils.py

    r2eeda93 raed159f  
    106106    except ImportError: 
    107107        pass 
    108         #logging.error("Error loading %s/%s: %s" % (path, confg_file, sys.exc_value)) 
    109108    except ValueError: 
    110109        print("Value error") 
    … …  
    113112        if fObj is not None: 
    114113            fObj.close() 
    115     #logging.info("GuiManager loaded %s/%s" % (path, confg_file)) 
    116114    return config_module 
    117115 
    … …  
    294292    changeDataExplorerTabSignal = QtCore.pyqtSignal(int) 
    295293 
    296 def updateModelItemWithPlot(item, update_data, name="", checkbox_state=None): 
     294    # Plot fitting results (FittingWidget->GuiManager) 
     295    resultPlotUpdateSignal = QtCore.pyqtSignal(list) 
     296 
    297297    """ 
    298298    Adds a checkboxed row named "name" to QStandardItem 

  • src/sas/sascalc/pr/fit/expression.py

    r1431dab raed159f  
    209209"""%("\n    ".join(assignments),"\n    ".join(code)) 
    210210 
    211     #print("Function: "+functiondef) 
    212     exec(functiondef) in globals, locals 
     211    exec(functiondef, globals, locals) 
    213212    retfn = locals['eval_expressions'] 
    214213 

  • src/sas/sascalc/pr/invertor.py

    reeea6a3 raed159f  
    227227        return None 
    228228 
    229     def add_errors(self, yvalues): 
    230         """ 
    231         Adds errors to data set is they are not avaialble 
    232         :return: 
    233         """ 
    234         stats_errors = np.zeros(len(yvalues)) 
    235         for i in range(len(yvalues)): 
    236             # Scale the error so that we can fit over several decades of Q 
    237             scale = 0.05 * np.sqrt(yvalues[i]) 
    238             min_err = 0.01 * yvalues[i] 
    239             stats_errors[i] = scale * np.sqrt(np.fabs(yvalues[i])) + min_err 
    240         logger.warning("Simulated errors have been added to the data set\n") 
    241         return stats_errors 
     229    def add_errors(self, sigma=0.05): 
     230        """ 
     231        Adds errors to data set is they are not available. 
     232        Uses  $\Delta y = \sigma | y |$. 
     233        """ 
     234        self.dy = sigma * np.fabs(self.y) 
    242235 
    243236    def clone(self): 
    … …  
    514507            # We were not able to estimate the errors 
    515508            # Return an empty error matrix 
    516             logger.error(sys.exc_value) 
     509            logger.error(sys.exc_info()[1]) 
    517510 
    518511        # Keep a copy of the last output 
    … …  
    559552            # number of terms 
    560553            best_alpha, _, _ = self.estimate_alpha(self.nfunc) 
    561             logger.warning("Invertor.estimate_numterms: %s" % sys.exc_value) 
     554            logger.warning("Invertor.estimate_numterms: %s" % sys.exc_info()[1]) 
    562555            return self.nfunc, best_alpha, "Could not estimate number of terms" 
    563556 
    … …  
    646639 
    647640        except: 
    648             message = "Invertor.estimate_alpha: %s" % sys.exc_value 
     641            message = "Invertor.estimate_alpha: %s" % sys.exc_info()[1] 
    649642            return 0, message, elapsed 
    650643 
    … …  
    763756 
    764757            except: 
    765                 msg = "Invertor.from_file: corrupted file\n%s" % sys.exc_value 
     758                msg = "Invertor.from_file: corrupted file\n%s" % sys.exc_info()[1] 
    766759                raise RuntimeError(msg) 
    767760        else: 
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.