Changeset cc31608 in sasview


Ignore:
Timestamp:
Jul 19, 2011 5:35:27 PM (13 years ago)
Author:
Gervaise Alina <gervyh@…>
Branches:
master, ESS_GUI, ESS_GUI_Docs, ESS_GUI_batch_fitting, ESS_GUI_bumps_abstraction, ESS_GUI_iss1116, ESS_GUI_iss879, ESS_GUI_iss959, ESS_GUI_opencl, ESS_GUI_ordering, ESS_GUI_sync_sascalc, costrafo411, magnetic_scatt, release-4.1.1, release-4.1.2, release-4.2.2, release_4.0.1, ticket-1009, ticket-1094-headless, ticket-1242-2d-resolution, ticket-1243, ticket-1249, ticket885, unittest-saveload
Children:
24adb89
Parents:
d771c72
Message:

working on batch fit

Location:
sansview/perspectives/fitting
Files:
1 added
6 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed

  • sansview/perspectives/fitting/basepage.py

    r70468a5 rcc31608  
    6464        ## data 
    6565        self.data = None 
     66        #list of available data 
     67        self.data_list = [] 
    6668        self.mask = None 
    6769        self.uid = None 
    … …  
    364366        """ 
    365367        return self.state 
     368     
    366369    def get_data(self): 
    367370        """ 
    … …  
    369372        """ 
    370373        return self.data   
     374     
     375    def get_data_list(self): 
     376        """ 
     377        return the current data  
     378        """ 
     379        return self.data_list   
    371380     
    372381    def set_manager(self, manager): 

  • sansview/perspectives/fitting/fit_thread.py

    r40953a9 rcc31608  
    33from data_util.calcthread import CalcThread 
    44 
     5def map_getattr(classInstance, classFunc, *args): 
     6    """ 
     7    Take an instance of a class and a function name as a string. 
     8    Execute class.function and return result 
     9    """ 
     10    return  getattr(classInstance,classFunc)(*args) 
     11 
     12def map_apply(arguments): 
     13    return apply(arguments[0], arguments[1:]) 
    514 
    615class FitThread(CalcThread): 
    … …  
    4554        """ 
    4655        msg = "" 
    47         try:  
     56        try: 
     57            list_handler = [] 
     58            list_curr_thread = []  
     59            list_ftol = [] 
     60            list_map_get_attr = [] 
     61            list_fit_function = [] 
     62            list_q = [] 
     63            for i in range(len(self.fitter)): 
     64                list_handler.append(None) 
     65                list_q.append(None) 
     66                list_curr_thread.append(None) 
     67                list_ftol.append(self.ftol) 
     68                list_fit_function.append('fit') 
     69                list_map_get_attr.append(map_getattr) 
     70            from multiprocessing import Pool 
     71            inputs = zip(list_map_get_attr,self.fitter, list_fit_function, list_handler, list_q, list_curr_thread,list_ftol) 
     72            print inputs 
     73            result =  Pool(1).map(func=map_apply,  
     74                               iterable=inputs) 
    4875            #self.handler.starting_fit() 
    4976            #Result from the fit 
    50             result = self.fitter.fit(handler=self.handler,  
    51                                      curr_thread=self, 
    52                                      ftol=self.ftol) 
     77            """ 
     78                result = self.fitter.fit(handler=self.handler,  
     79                                         curr_thread=self, 
     80                                         ftol=self.ftol) 
     81            """ 
     82            print "fithread result", result 
    5383            self.complete(result= result, 
    5484                          page_id=self.page_id, 

  • sansview/perspectives/fitting/fitpage.py

    r515bf4f rcc31608  
    1010from sans.models.dispersion_models import ArrayDispersion, GaussianDispersion 
    1111from DataLoader.data_info import Data1D 
    12 from sans.guiframe.events import StatusEvent    
     12from sans.guiframe.events import StatusEvent  
     13from sans.guiframe.events import NewPlotEvent   
    1314from sans.guiframe.utils import format_number,check_float 
    1415 
    … …  
    4142         
    4243        ## draw sizer 
    43         self._fill_datainfo_sizer() 
     44        self._fill_data_sizer() 
    4445        self.is_2D = None 
    4546        self.fit_started = False 
    … …  
    5960        self._set_paste_flag(False) 
    6061        self.btFit.SetFocus() 
    61    
     62        self.fill_data_combobox(data_list=self.data_list) 
     63     
     64     
     65    def _fill_data_sizer(self): 
     66        """ 
     67        fill sizer 0 with data info 
     68        """ 
     69        box_description= wx.StaticBox(self, -1, 'I(q) Data Source') 
     70        boxsizer1 = wx.StaticBoxSizer(box_description, wx.VERTICAL) 
     71        #---------------------------------------------------------- 
     72        sizer_data = wx.BoxSizer(wx.HORIZONTAL) 
     73        self.dataSource = wx.ComboBox(self, -1, style=wx.CB_READONLY) 
     74        wx.EVT_COMBOBOX(self.dataSource, -1, self.on_select_data) 
     75        self.dataSource.SetMinSize((_DATA_BOX_WIDTH, -1)) 
     76        sizer_data.Add(wx.StaticText(self, -1, 'Name : ')) 
     77        sizer_data.Add(self.dataSource) 
     78        sizer_data.Add( (0,5) ) 
     79        boxsizer1.Add(sizer_data,0, wx.ALL, 10) 
     80        self.sizer0.Add(boxsizer1,0, wx.EXPAND | wx.ALL, 10) 
     81        self.sizer0.Layout() 
     82         
     83    def enable_datasource(self): 
     84        """ 
     85        Enable or disable data source control depending on existing data 
     86        """ 
     87        if not self.data_list: 
     88            self.dataSource.Disable() 
     89        else: 
     90            self.dataSource.Enable() 
     91             
     92    def fill_data_combobox(self, data_list): 
     93        """ 
     94        Get a list of data and fill the corresponding combobox 
     95        """ 
     96        self.dataSource.Clear() 
     97        self.data_list = data_list 
     98        self.enable_datasource() 
     99        for data in self.data_list: 
     100            if data is not None: 
     101                self.dataSource.Append(str(data.name), clientData=data) 
     102        self.dataSource.SetSelection(0) 
     103        self.on_select_data(event=None) 
     104                 
     105    def on_select_data(self, event=None): 
     106        """ 
     107        """ 
     108        if event is None and self.dataSource.GetCount() > 0: 
     109            data = self.dataSource.GetClientData(0) 
     110            self.set_data(data) 
     111        elif self.dataSource.GetCount() > 0: 
     112            pos = self.dataSource.GetSelection() 
     113            data = self.dataSource.GetClientData(pos) 
     114            self.set_data(data) 
     115     
     116     
    62117         
    63118    def _on_fit_complete(self): 
    … …  
    293348        sizer_chi2.Add(sizer_smearer_box) 
    294349        sizer_chi2.Add((-1,5)) 
    295  
     350         
    296351        # hide all smear messages and textctrl 
    297352        self._hide_all_smear_info() 
    … …  
    386441        self.sizer5.Layout() 
    387442 
    388     def _fill_datainfo_sizer(self): 
    389         """ 
    390         fill sizer 0 with data info 
    391         """ 
    392         ## no loaded data , don't fill the sizer 
    393         if self.data is None: 
    394             data_min = "" 
    395             data_max = "" 
    396             data_name = " None" 
    397         else: 
    398             data_name = self.data.name 
    399             #set maximum range for x in linear scale 
    400             if not hasattr(self.data,"data"): #Display only for 1D data fit 
    401                 # Minimum value of data    
    402                 data_min = min(self.data.x) 
    403                 # Maximum value of data   
    404                 data_max = max(self.data.x) 
    405             else: 
    406                 ## Minimum value of data  
    407                 data_min = 0 
    408                 x = max(math.fabs(self.data.xmin), math.fabs(self.data.xmax))  
    409                 y = max(math.fabs(self.data.ymin), math.fabs(self.data.ymax)) 
    410                 ## Maximum value of data   
    411                 data_max = math.sqrt(x*x + y*y) 
    412             ## set q range to plot 
    413             self.qmin_x = data_min 
    414             self.qmax_x = data_max 
    415         box_description= wx.StaticBox(self, -1, 'I(q) Data Source') 
    416         boxsizer1 = wx.StaticBoxSizer(box_description, wx.VERTICAL) 
    417         #---------------------------------------------------------- 
    418         sizer_data = wx.BoxSizer(wx.HORIZONTAL) 
    419         #Filling the sizer containing data related fields 
    420         #self.dataSource = wx.StaticText(self, -1,str(self.data.name)) 
    421         self.dataSource = BGTextCtrl(self, -1) 
    422         self.dataSource.SetValue(str(data_name)) 
    423         #self.dataSource.SetEditable(False) 
    424         self.dataSource.SetMinSize((_DATA_BOX_WIDTH, -1)) 
    425         sizer_data.Add(wx.StaticText(self, -1, 'Name : ')) 
    426         sizer_data.Add(self.dataSource ) 
    427         sizer_data.Add( (0,5) ) 
    428         """ 
    429         #---------sizer 2 draw-------------------------------- 
    430         text4_3 = wx.StaticText(self, -1, 'Total Q Range (1/A)', 
    431                                  style=wx.ALIGN_LEFT) 
    432         sizer_range = wx.BoxSizer(wx.HORIZONTAL) 
    433         sizer_range.Add( text4_3 ,0, wx.RIGHT, 10) 
    434         self.minimum_q = BGTextCtrl(self, -1, size=(_BOX_WIDTH,20)) 
    435         self.minimum_q.SetValue(str(data_min)) 
    436         self.maximum_q = BGTextCtrl(self, -1,size=(_BOX_WIDTH,20)) 
    437         self.maximum_q.SetValue(str(data_max)) 
    438         sizer_range.Add(wx.StaticText(self, -1, "Min: "),0, wx.LEFT, 10) 
    439         sizer_range.Add(self.minimum_q,0, wx.LEFT, 10) 
    440         sizer_range.Add(wx.StaticText(self, -1, "Max: "),0, wx.LEFT, 10) 
    441         sizer_range.Add(self.maximum_q,0, wx.LEFT, 10) 
    442         """ 
    443         boxsizer1.Add(sizer_data,0, wx.ALL, 10) 
    444         #boxsizer1.Add(sizer_range, 0 , wx.LEFT, 10) 
    445         #------------------------------------------------------------ 
    446          
    447         self.sizer0.Add(boxsizer1,0, wx.EXPAND | wx.ALL, 10) 
    448         self.sizer0.Layout() 
    449443        
    450444    def _fill_model_sizer(self, sizer): 
    … …  
    16361630        reset the current data  
    16371631        """ 
     1632        id = None 
     1633        group_id = None 
    16381634        flag = False 
    16391635        if self.data is None and data is not None: 
    1640             self.window_name = str(data.name) 
    1641             ## Title to appear on top of the window 
    1642             self.window_caption = str(data.name) 
    16431636            flag = True 
     1637        if data is not None: 
     1638            id = data.id 
     1639            group_id = data.group_id 
     1640            if self.data is not None: 
     1641                flag = (data.id != self.data.id) 
    16441642        self.data = data 
    16451643        if self.data is None: 
    … …  
    17271725                 
    17281726            self.model_view.Disable() 
     1727             
     1728            #replace data plot on combo box selection 
     1729            #by removing the previous selected data 
     1730            wx.PostEvent(self._manager.parent, NewPlotEvent(action="remove", 
     1731                                                    group_id=group_id, id=id)) 
     1732            #plot the current selected data 
     1733            wx.PostEvent(self._manager.parent, NewPlotEvent(plot=self.data,  
     1734                                                           title=str(self.data.title))) 
     1735            self._manager.store_data(uid=self.uid, data=data, 
     1736                                     data_list=self.data_list, 
     1737                                      caption=self.window_name) 
    17291738            self._draw_model() 
    17301739     

  • sansview/perspectives/fitting/fitpanel.py

    r00ea2a7 rcc31608  
    5454        ## list of existing fit page 
    5555        self.opened_pages = {} 
     56        #index of fit page 
     57        self.fit_page_index = 0 
     58        #index of batch page 
     59        self.batch_page_index = 0 
    5660        #page of simultaneous fit  
    5761        self.sim_page = None 
    … …  
    309313        add an empty page 
    310314        """ 
    311         from fitpage import FitPage 
    312         panel = FitPage(parent=self) 
     315        if self.batch_on: 
     316            from batchfitpage import BatchFitPage 
     317            panel = BatchFitPage(parent=self) 
     318            #Increment index of batch page 
     319            self.batch_page_index += 1 
     320            index = self.batch_page_index 
     321        else: 
     322            from fitpage import FitPage 
     323            panel = FitPage(parent=self) 
     324            #Increment index of fit page 
     325            self.fit_page_index += 1 
     326            index = self.fit_page_index 
    313327        panel.uid = wx.NewId() 
    314328        panel.populate_box(dict=self.model_list_box) 
    315329        panel.set_manager(self._manager) 
    316         index = self.GetPageCount() 
    317         #caption = str(panel.window_name) + " " + str(self._manager.index_model) 
    318         caption = str(panel.window_name) + " " + str(index) 
     330        caption = str(panel.window_caption) + " " + str(index) 
    319331        self.AddPage(panel, caption, select=True) 
    320332        self.opened_pages[panel.uid] = panel 
    … …  
    360372                self._manager.on_add_new_page(event=None) 
    361373         
    362     def set_data(self, data): 
     374    def set_data(self, data_list): 
    363375        """  
    364376        Add a fitting page on the notebook contained by fitpanel 
    … …  
    369381         
    370382        """ 
    371         if data is None: 
     383        if not data_list: 
    372384            return None 
     385         
     386        if self.batch_on: 
     387            page = self.add_empty_page() 
     388            print  "batch on fitpanel", page.__class__.__name__, page.window_caption 
     389            pos = self.GetPageIndex(page) 
     390            page.fill_data_combobox(data_list) 
     391            self.opened_pages[page.uid] = page 
     392            return page 
     393        else: 
     394            data = None 
     395            data = data_list[0] 
     396            if data is None: 
     397                return None 
    373398        for page in self.opened_pages.values(): 
    374399            #check if the selected data existing in the fitpanel 
    375400            pos = self.GetPageIndex(page) 
    376401            if page.get_data() is None: 
     402                #make sure data get placed in 1D empty tab if data is 1D 
     403                #else data get place on 2D tab empty tab 
    377404                enable2D = page.get_view_mode() 
    378405                if (data.__class__.__name__ == "Data2D" and enable2D)\ 
    379406                or (data.__class__.__name__ == "Data1D" and not enable2D): 
    380                     page.set_data(data) 
     407                    #page.set_data(data) 
     408                    page.fill_data_combobox(data_list) 
    381409                    self.SetPageText(pos, str(data.name)) 
    382410                    self.SetSelection(pos) 
    383411                    return page 
    384             # Todo: Need to set different window name when has same data 
    385             # Todo: to catch page with same data even if it is not on the top. 
    386             """ 
    387             elif page.get_data().id == data.id: 
    388                 msg = "Data already existing in the fitting panel" 
    389                 wx.PostEvent(self._manager.parent,  
    390                              StatusEvent(status=msg, info='warning'))  
    391                 self.SetSelection(pos) 
    392                 return page 
    393             """ 
     412                # Todo: Need to set different window name when has same data 
     413                # Todo: to catch page with same data even if it is not on the top. 
     414                """ 
     415                elif page.get_data().id == data.id: 
     416                    msg = "Data already existing in the fitting panel" 
     417                    wx.PostEvent(self._manager.parent,  
     418                                 StatusEvent(status=msg, info='warning'))  
     419                    self.SetSelection(pos) 
     420                    return page 
     421                """ 
    394422        page = self.add_empty_page() 
    395423        pos = self.GetPageIndex(page) 
    396         page.set_data(data) 
     424        page.fill_data_combobox(data_list) 
     425        #page.set_data(data) 
    397426        self.SetPageText(pos, str(data.name)) 
    398427        self.opened_pages[page.uid] = page 
    … …  
    447476            self._manager.sim_page=None  
    448477            return 
    449          
     478        if selected_page.__class__.__name__ == "FitPage": 
     479            self.fit_page_index -= 1 
     480        else: 
     481            self.batch_page_index -= 1 
    450482        ## closing other pages 
    451483        state = selected_page.createMemento() 

  • sansview/perspectives/fitting/fitproblem.py

    rba1f0b2 rcc31608  
    1313        ## data used for fitting 
    1414        self.fit_data = None 
     15        #list of data  in case of batch mode 
     16        self.data_list = [] 
     17        #dictionary of data id and location to corresponding fitproblem 
     18        self.fitproblem_pointers = {} 
    1519        self.theory_data = None 
    1620        ## the current model 
    … …  
    2832        self.qmin = None 
    2933        self.qmax = None 
     34        self.result = [] 
    3035         
    3136        # 1D or 2D 
    … …  
    143148        return self.fit_data 
    144149     
     150    def set_fit_data_list(self, data_list): 
     151        """  
     152        save a copy of a list of data 
     153         
     154        :param data_list: list of data 
     155         
     156        """ 
     157        self.data_list = data_list 
     158             
     159    def get_fit_data_list(self): 
     160        """ 
     161        """ 
     162        return self.data_list 
     163     
    145164    def set_model_param(self,name,value=None): 
    146165        """  
    … …  
    205224        """ 
    206225        return self.enable2D 
     226     
     227    def get_pointer_to_fitproblem(self): 
     228        """ 
     229        return dictionary of id of fitproblem 
     230        """ 
     231        return self.fitproblem_pointers 
     232     
     233    def set_pointer_to_fitproblem(self, data_id, page_id): 
     234        """ 
     235        """ 
     236        self.fitproblem_pointers[data_id] = page_id 
     237         
     238    def set_result(self, result): 
     239        """ 
     240        set a list of result 
     241        """ 
     242        self.result = result 
     243         
     244    def get_result(self): 
     245        """ 
     246        get result  
     247        """ 
     248        return self.result 
     249         
    207250    

  • sansview/perspectives/fitting/fitting.py

    r0145a25 rcc31608  
    3434from sans.guiframe.plugin_base import PluginBase  
    3535 
    36 #from .console import ConsoleUpdate 
     36from .console import ConsoleUpdate 
    3737from .fitproblem import FitProblem 
    3838from .fitpanel import FitPanel 
    39 #from .fit_thread import FitThread 
     39from .fit_thread import FitThread 
    4040from .pagestate import Reader 
    4141from .fitpage import Chi2UpdateEvent 
    … …  
    108108        logging.info("Fitting plug-in started")  
    109109         
     110    def on_batch_selection(self, flag): 
     111        """ 
     112        switch the the notebook of batch mode or not 
     113        """ 
     114        self.batch_on = flag 
     115        if self.batch_on: 
     116            if self.fit_panel is not None: 
     117                self.fit_panel.batch_on = flag 
     118         
    110119    def populate_menu(self, owner): 
    111120        """ 
    … …  
    275284            data_list = [] 
    276285        selected_data_list = [] 
    277         if len(data_list) > MAX_NBR_DATA : 
    278             from fitting_widgets import DataDialog 
    279             dlg = DataDialog(data_list=data_list, nb_data=MAX_NBR_DATA) 
    280             if dlg.ShowModal() == wx.ID_OK: 
    281                 selected_data_list = dlg.get_data() 
    282             dlg.Destroy() 
    283              
     286        if self.batch_on: 
     287            page = self.add_fit_page(data=data_list) 
    284288        else: 
    285             selected_data_list = data_list 
    286         try: 
    287             for data in selected_data_list: 
    288                 page = self.add_fit_page(data=data) 
    289                 wx.PostEvent(self.parent, NewPlotEvent(plot=data,  
    290                                                        title=str(data.title))) 
    291         except: 
    292             msg = "Fitting Set_data: " + str(sys.exc_value) 
    293             wx.PostEvent(self.parent, StatusEvent(status=msg, info="error")) 
     289            if len(data_list) > MAX_NBR_DATA: 
     290                from fitting_widgets import DataDialog 
     291                dlg = DataDialog(data_list=data_list, nb_data=MAX_NBR_DATA) 
     292                if dlg.ShowModal() == wx.ID_OK: 
     293                    selected_data_list = dlg.get_data() 
     294                dlg.Destroy() 
     295                 
     296            else: 
     297                selected_data_list = data_list 
     298            try: 
     299                for data in selected_data_list: 
     300                    page = self.add_fit_page(data=[data]) 
     301            except: 
     302                msg = "Fitting Set_data: " + str(sys.exc_value) 
     303                wx.PostEvent(self.parent, StatusEvent(status=msg, info="error")) 
    294304     
    295305    def set_top_panel(self): 
    … …  
    371381                wx.PostEvent(self.parent, NewPlotEvent(plot=data, 
    372382                                        title=data.title)) 
    373                 page = self.add_fit_page(data) 
     383                page = self.add_fit_page([data]) 
    374384                caption = page.window_name 
    375                 self.store_data(page=page.uid, data=data, caption=caption) 
     385                self.store_data(uid=page.uid, data=page.get_data(), 
     386                        data_list=page.get_data_list(),  
     387                        caption=page.window_name) 
    376388                self.mypanels.append(page)  
    377389                 
    … …  
    602614        """ 
    603615        perform fit  
    604          
    605         : param type: uid for single fit, None for simultaneous fit 
    606         """ 
    607         from sans.fit.Fitting import Fit 
    608         from .fit_thread import FitThread 
    609         from .console import ConsoleUpdate 
     616        """ 
    610617        ##  count the number of fitproblem schedule to fit  
    611         #if uid == None or self._fit_engine == "park": 
    612618        fitproblem_count = 0 
    613619        for value in self.page_finder.values(): 
    … …  
    616622                 
    617623        ## if simultaneous fit change automatically the engine to park 
    618         # scipy can not handle two thread running at the same time 
    619         if fitproblem_count > 1 or len(self.fit_thread_list)>0: 
     624        if fitproblem_count > 1: 
    620625            self._on_change_engine(engine='park') 
    621626             
    622627        self.fitproblem_count = fitproblem_count   
    623  
     628           
     629        from sans.fit.Fitting import Fit 
    624630        fitter = Fit(self._fit_engine) 
     631         
    625632        if self._fit_engine == "park": 
    626633            engineType = "Simultaneous Fit" 
    … …  
    628635            engineType = "Single Fit" 
    629636             
     637        fitter_list = [] 
    630638        fproblemId = 0 
    631639        self.current_pg = None 
    … …  
    655663                    self._fit_helper(value=value, pars=pars, 
    656664                                     fitter=fitter, 
     665                                     fitter_list=fitter_list, 
    657666                                      fitproblem_id=fproblemId, 
    658667                                      title=engineType)  
    … …  
    679688        self._mac_sleep(0.2) 
    680689        ## perform single fit 
    681          
    682690        if fitproblem_count == 1: 
     691            print "fitter_list", fitter_list 
    683692            calc_fit = FitThread(handler = handler, 
    684                                     fn=fitter, 
     693                                    fn=fitter_list, 
    685694                                    pars=pars, 
    686695                                    page_id=list_page_id, 
    … …  
    691700            ## Perform more than 1 fit at the time 
    692701            calc_fit = FitThread(handler=handler, 
    693                                     fn=fitter, 
     702                                    fn=fitter_list, 
    694703                                    page_id=list_page_id, 
    695704                                    updatefn=handler.update_fit, 
    696705                                    completefn=self._simul_fit_completed, 
    697706                                    ftol=self.ftol) 
    698  
    699707        self.fit_thread_list[current_page_id] = calc_fit 
    700         self._mac_sleep(0.2) 
    701          
    702         #self.ready_fit(calc_fit=calc_fit) 
    703708        calc_fit.queue() 
    704              
     709        msg = "Fitting is in progress..." 
     710        wx.PostEvent( self.parent, StatusEvent(status=msg, type="progress" )) 
     711         
     712        self.ready_fit(calc_fit=calc_fit) 
     713         
    705714    def ready_fit(self, calc_fit): 
    706715        """ 
    … …  
    730739                                                   action='remove')) 
    731740            
    732     def store_data(self, uid, data=None, caption=None): 
     741    def store_data(self, uid, data=None, data_list=None, caption=None): 
    733742        """ 
    734743        Helper to save page reference into the plug-in 
    … …  
    737746         
    738747        """ 
     748        if data_list is None: 
     749            data_list = [] 
    739750        #create a fitproblem storing all link to data,model,page creation 
    740751        if not uid in self.page_finder.keys(): 
    741752            self.page_finder[uid] = FitProblem() 
    742753        self.page_finder[uid].set_fit_data(data) 
     754        self.page_finder[uid].set_fit_data_list(data_list) 
    743755        self.page_finder[uid].set_fit_tab_caption(caption) 
    744756         
    … …  
    778790        if page.uid in self.page_finder: 
    779791            theory_data = self.page_finder[page.uid].get_theory_data() 
     792            data = page.get_data() 
    780793            if issubclass(data.__class__, Data2D): 
    781794                data.group_id = wx.NewId() 
    … …  
    795808                    self.parent.update_data(prev_data=theory_data, new_data=data)    
    796809               
    797         self.store_data(uid=page.uid, data=data, caption=page.window_name) 
     810        self.store_data(uid=page.uid, data=page.get_data(), 
     811                        data_list=page.get_data_list(),  
     812                        caption=page.window_name) 
    798813        if self.sim_page is not None: 
    799814            self.sim_page.draw_page() 
    … …  
    875890            self.page_finder[uid].schedule_tofit(value) 
    876891                 
    877     def _fit_helper(self, pars, value, fitproblem_id,fitter, title="Single Fit " ): 
    878         """ 
    879         helper for fitting 
    880         """ 
    881         metadata = value.get_fit_data() 
     892    def _fit_setter(self, data, value, fitter, fit_id, pars): 
     893        """ 
     894        """ 
    882895        model = value.get_model() 
    883896        smearer = value.get_smearer() 
    884897        qmin, qmax = value.get_range() 
    885         self.fit_id = fitproblem_id 
     898        #Extra list of parameters and their constraints 
     899        listOfConstraint = [] 
     900         
     901        param = value.get_model_param() 
     902        if len(param) > 0: 
     903            for item in param: 
     904                ## check if constraint 
     905                if item[0] != None and item[1] != None: 
     906                    listOfConstraint.append((item[0],item[1])) 
     907                
     908        #Do the single fit 
     909        fitter.set_model(deepcopy(model), fit_id, 
     910                               pars, constraints=listOfConstraint) 
     911         
     912        fitter.set_data(data=data, id=fit_id, 
     913                             smearer=smearer, qmin=qmin, qmax=qmax) 
     914        
     915        fitter.select_problem_for_fit(id=fit_id, value=1) 
     916        value.clear_model_param() 
     917             
     918             
     919    def _fit_helper(self, pars, value, fitproblem_id, fitter_list, 
     920                    fitter=None, title="Single Fit " ): 
     921        """ 
     922        helper for fitting 
     923        """ 
     924        from sans.fit.Fitting import Fit 
     925        self.fit_id = 0 
     926        data_list = value.get_fit_data_list() 
     927        pointer_to_fitproblem = value.get_pointer_to_fitproblem() 
    886928        #Create list of parameters for fitting used 
    887929        templist = [] 
    888         
    889         try: 
    890             #Extra list of parameters and their constraints 
    891             listOfConstraint = [] 
    892              
    893             param = value.get_model_param() 
    894             if len(param) > 0: 
    895                 for item in param: 
    896                     ## check if constraint 
    897                     if item[0] != None and item[1] != None: 
    898                         listOfConstraint.append((item[0],item[1])) 
    899                     
    900             #Do the single fit 
    901             fitter.set_model(model, self.fit_id, 
    902                                    pars, constraints=listOfConstraint) 
    903              
    904             fitter.set_data(data=metadata, id=self.fit_id, 
    905                                  smearer=smearer, qmin=qmin, qmax=qmax) 
    906             
    907             fitter.select_problem_for_fit(id=self.fit_id, 
    908                                                value=value.get_scheduled()) 
    909             value.clear_model_param() 
    910         except: 
    911             raise 
    912             #msg = title + " error: %s" % sys.exc_value 
    913             #wx.PostEvent(self.parent, StatusEvent(status=msg, type="stop")) 
    914            
     930        for single_data in data_list: 
     931            fitter = Fit(self._fit_engine) 
     932            try: 
     933                if single_data.id in pointer_to_fitproblem: 
     934                     new_value = self.page_finder[pointer_to_fitproblem[single_data.id]] 
     935                     self._fit_setter(data=single_data, value=new_value,  
     936                                     fitter=fitter, 
     937                                     pars=pars, 
     938                                      fit_id=self.fit_id) 
     939                else: 
     940                    self._fit_setter(data=single_data, value=value,  
     941                                     fitter=fitter, 
     942                                     pars=pars, 
     943                                      fit_id=self.fit_id) 
     944            except: 
     945                raise 
     946                #msg = title + " error: %s" % sys.exc_value 
     947                #wx.PostEvent(self.parent, StatusEvent(status=msg, type="stop")) 
     948            fitter_list.append(fitter) 
     949            self.fit_id += 1 
     950             
    915951    def _onSelect(self,event): 
    916952        """  
    … …  
    925961                if plottable == self.panel.plots[data_id]: 
    926962                    data = plottable 
    927                     self.add_fit_page(data=data) 
     963                    self.add_fit_page(data=[data]) 
    928964                    return 
    929965            else: 
    930966                data = plottable 
    931                 self.add_fit_page(data=data) 
     967                self.add_fit_page(data=[data]) 
    932968        self.set_top_panel() 
    933969             
    … …  
    936972        """ 
    937973        print "update_fit result", result 
     974         
     975    def _batch_single_fit_complete_helper(self,result, pars, page_id, elapsed=None): 
     976        """ 
     977        Fit result are display in batch mode 
     978        """ 
     979        self._update_fit_button(page_id) 
     980        msg = "Single Fitting complete " 
     981        wx.PostEvent(self.parent, StatusEvent(status=msg, info="info", 
     982                                                      type="stop")) 
     983        if self.batch_on: 
     984            batch_result = {"Chi2":[]} 
     985            for index  in range(len(pars)): 
     986                    batch_result[pars[index]] = [] 
     987                    batch_result["error on %s" % pars[index]] = [] 
     988            for res in result: 
     989                batch_result["Chi2"].append(res.fitness) 
     990                for index  in range(len(pars)): 
     991                    batch_result[pars[index]].append(res.pvec[index]) 
     992                    batch_result["error on %s" % pars[index]].append(res.stderr[index]) 
     993               
     994            pid = page_id[0] 
     995            self.page_finder[pid].set_result(result=batch_result)       
     996            self.parent.on_set_batch_result(data=batch_result, name=self.sub_menu) 
     997             
    938998         
    939999    def _single_fit_completed(self, result, pars, page_id, elapsed=None): 
    … …  
    9501010        self._mac_sleep(0.2) 
    9511011        if page_id[0] in self.fit_thread_list.keys(): 
    952             del self.fit_thread_list[page_id[0]]   
    953         try: 
    954             if result == None: 
     1012            del self.fit_thread_list[page_id[0]]  
     1013        if self.batch_on: 
     1014            wx.CallAfter(self._batch_single_fit_complete_helper, result, pars, page_id, elapsed=None) 
     1015            return  
     1016        else:   
     1017            try: 
     1018                result = result[0] 
     1019                if result == None: 
     1020                    self._update_fit_button(page_id) 
     1021                    msg= "Single Fitting did not converge!!!" 
     1022                    wx.PostEvent(self.parent,  
     1023                                 StatusEvent(status=msg,  
     1024                                             info="warning", 
     1025                                             type="stop")) 
     1026                    return 
     1027                if not numpy.isfinite(result.fitness) or \ 
     1028                        numpy.any(result.pvec == None) or \ 
     1029                        not numpy.all(numpy.isfinite(result.pvec)): 
     1030                    msg = "Single Fitting did not converge!!!" 
     1031                    wx.PostEvent(self.parent,  
     1032                                 StatusEvent(status=msg,  
     1033                                             info="warning", 
     1034                                             type="stop")) 
     1035                    self._update_fit_button(page_id) 
     1036                    return 
     1037                 
     1038                for uid in page_id: 
     1039                    value = self.page_finder[uid]    
     1040                    model = value.get_model() 
     1041                    page_id = uid 
     1042                         
     1043                    param_name = [] 
     1044                    for name in pars: 
     1045                        param_name.append(name) 
     1046        
     1047                    cpage = self.fit_panel.get_page_by_id(uid) 
     1048                    # Make sure we got all results (CallAfter is important to MAC) 
     1049                    wx.CallAfter(cpage.onsetValues, result.fitness,  
     1050                                      param_name, result.pvec, result.stderr) 
     1051                    cpage._on_fit_complete() 
     1052                if result.stderr == None: 
     1053                    msg = "Fit Abort: " 
     1054                else: 
     1055                    msg = "Fitting: " 
     1056                msg += "Completed!!!" 
     1057                wx.PostEvent(self.parent, StatusEvent(status=msg)) 
     1058                return 
     1059            except ValueError: 
    9551060                self._update_fit_button(page_id) 
    956                 msg= "Single Fitting did not converge!!!" 
    957                 wx.PostEvent(self.parent,  
    958                              StatusEvent(status=msg,  
    959                                          info="warning", 
    960                                          type="stop")) 
     1061                msg = "Single Fitting did not converge!!!" 
     1062                wx.PostEvent(self.parent, StatusEvent(status=msg, info="error", 
     1063                                                      type="stop")) 
     1064                return   
     1065            except: 
     1066                self._update_fit_button(page_id) 
     1067                msg = "Single Fit completed but Following" 
     1068                msg += " error occurred:%s" % sys.exc_value 
     1069                wx.PostEvent(self.parent, StatusEvent(status=msg, info="error", 
     1070                                                      type="stop")) 
     1071                raise 
    9611072                return 
    962             if not numpy.isfinite(result.fitness) or \ 
    963                     numpy.any(result.pvec == None) or \ 
    964                     not numpy.all(numpy.isfinite(result.pvec)): 
    965                 msg = "Single Fitting did not converge!!!" 
    966                 wx.PostEvent(self.parent,  
    967                              StatusEvent(status=msg,  
    968                                          info="warning", 
    969                                          type="stop")) 
    970                 self._update_fit_button(page_id) 
    971                 return 
    972              
    973             for uid in page_id: 
    974                 value = self.page_finder[uid]    
    975                 model = value.get_model() 
    976                 page_id = uid 
    977                      
    978                 param_name = [] 
    979                 for name in pars: 
    980                     param_name.append(name) 
    981     
    982                 cpage = self.fit_panel.get_page_by_id(uid) 
    983                 # Make sure we got all results (CallAfter is important to MAC) 
    984                 wx.CallAfter(cpage.onsetValues, result.fitness,  
    985                                   param_name, result.pvec, result.stderr) 
    986                 cpage._on_fit_complete() 
    987             if result.stderr == None: 
    988                 msg = "Fit Abort: " 
    989             else: 
    990                 msg = "Fitting: " 
    991             msg += "Completed!!!" 
    992             wx.PostEvent(self.parent, StatusEvent(status=msg)) 
    993             return 
    994         except ValueError: 
    995             self._update_fit_button(page_id) 
    996             msg = "Single Fitting did not converge!!!" 
    997             wx.PostEvent(self.parent, StatusEvent(status=msg, info="error", 
    998                                                   type="stop")) 
    999             return   
    1000         except: 
    1001             self._update_fit_button(page_id) 
    1002             msg = "Single Fit completed but Following" 
    1003             msg += " error occurred:%s" % sys.exc_value 
    1004             wx.PostEvent(self.parent, StatusEvent(status=msg, info="error", 
    1005                                                   type="stop")) 
    1006             raise 
    1007             return 
    1008         
     1073            
    10091074    def _simul_fit_completed(self, result, page_id,pars=None, elapsed=None): 
    10101075        """ 
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.