Changeset c155a16 in sasview for src/sas/sascalc


Ignore:
Timestamp:
Apr 4, 2017 12:06:27 PM (7 years ago)
Author:
Ricardo Ferraz Leal <ricleal@…>
Branches:
master, ESS_GUI, ESS_GUI_Docs, ESS_GUI_batch_fitting, ESS_GUI_bumps_abstraction, ESS_GUI_iss1116, ESS_GUI_iss879, ESS_GUI_iss959, ESS_GUI_opencl, ESS_GUI_ordering, ESS_GUI_sync_sascalc, costrafo411, magnetic_scatt, release-4.2.2, ticket-1009, ticket-1094-headless, ticket-1242-2d-resolution, ticket-1243, ticket-1249, ticket885, unittest-saveload
Children:
463e7ffc
Parents:
6722fae
Message:

Logging is now logger

Location:
src/sas/sascalc
Files:
11 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed

  • src/sas/sascalc/calculator/resolution_calculator.py

    rb699768 rc155a16  
    1515import sys 
    1616import logging 
     17 
     18logger = logging.getLogger() 
    1719 
    1820#Plank's constant in cgs unit 
    … …  
    10061008            detector_offset = self.sample2detector_distance[1] 
    10071009        except: 
    1008             logging.error(sys.exc_value) 
     1010            logger.error(sys.exc_value) 
    10091011 
    10101012        # detector size in [no of pix_x,no of pix_y] 
    … …  
    10931095            output.qy_data = qy_value 
    10941096        except: 
    1095             logging.error(sys.exc_value) 
     1097            logger.error(sys.exc_value) 
    10961098 
    10971099        return output 

  • src/sas/sascalc/calculator/sas_gen.py

    rd2fd8fc rc155a16  
    1212import sys 
    1313import logging 
     14 
     15logger = logging.getLogger() 
    1416 
    1517MFACTOR_AM = 2.853E-12 
    … …  
    285287                mask = (x_dir2 + y_dir2 + z_dir2) <= 1.0 
    286288            except: 
    287                 logging.error(sys.exc_value) 
     289                logger.error(sys.exc_value) 
    288290        self.output = MagSLD(self.pos_x[mask], self.pos_y[mask], 
    289291                             self.pos_z[mask], self.sld_n[mask], 
    … …  
    394396                except: 
    395397                    # Skip non-data lines 
    396                     logging.error(sys.exc_value) 
     398                    logger.error(sys.exc_value) 
    397399                #Reading Header; Segment count ignored 
    398400                s_line = line.split(":", 1) 
    … …  
    589591                        z_lines.append(z_line) 
    590592                except: 
    591                     logging.error(sys.exc_value) 
     593                    logger.error(sys.exc_value) 
    592594 
    593595            output = MagSLD(pos_x, pos_y, pos_z, sld_n, sld_mx, sld_my, sld_mz) 
    … …  
    683685                    except: 
    684686                        # Skip non-data lines 
    685                         logging.error(sys.exc_value) 
     687                        logger.error(sys.exc_value) 
    686688            output = MagSLD(pos_x, pos_y, pos_z, sld_n, 
    687689                            sld_mx, sld_my, sld_mz) 

  • src/sas/sascalc/data_util/calcthread.py

    r934ce649 rc155a16  
    88import traceback 
    99import sys 
     10import logging 
    1011 
    1112if sys.platform.count("darwin") > 0: 
    … …  
    2122    from time import clock 
    2223    from time import sleep 
     24 
     25logger = logging.getLogger() 
    2326 
    2427 
    … …  
    244247                pass 
    245248        import logging 
    246         logging.error(traceback.format_exc()) 
     249        logger.error(traceback.format_exc()) 
    247250        #print 'CalcThread exception', 
    248251 

  • src/sas/sascalc/dataloader/loader.py

    rb699768 rc155a16  
    3232from readers import cansas_reader 
    3333 
     34logger = logging.getLogger() 
     35 
    3436class Registry(ExtensionRegistry): 
    3537    """ 
    … …  
    99101            msg = "DataLoader couldn't locate DataLoader plugin folder." 
    100102            msg += """ "%s" does not exist""" % dir 
    101             logging.warning(msg) 
     103            logger.warning(msg) 
    102104            return readers_found 
    103105 
    … …  
    117119                        msg = "Loader: Error importing " 
    118120                        msg += "%s\n  %s" % (item, sys.exc_value) 
    119                         logging.error(msg) 
     121                        logger.error(msg) 
    120122 
    121123                # Process zip files 
    … …  
    139141                                msg = "Loader: Error importing" 
    140142                                msg += " %s\n  %s" % (mfile, sys.exc_value) 
    141                                 logging.error(msg) 
     143                                logger.error(msg) 
    142144 
    143145                    except: 
    144146                        msg = "Loader: Error importing " 
    145147                        msg += " %s\n  %s" % (item, sys.exc_value) 
    146                         logging.error(msg) 
     148                        logger.error(msg) 
    147149 
    148150        return readers_found 
    … …  
    190192                msg = "Loader: Error accessing" 
    191193                msg += " Reader in %s\n  %s" % (module.__name__, sys.exc_value) 
    192                 logging.error(msg) 
     194                logger.error(msg) 
    193195        return reader_found 
    194196 
    … …  
    223225            msg = "Loader: Error accessing Reader " 
    224226            msg += "in %s\n  %s" % (loader.__name__, sys.exc_value) 
    225             logging.error(msg) 
     227            logger.error(msg) 
    226228        return reader_found 
    227229 
    … …  
    268270                msg = "Loader: Error accessing Reader" 
    269271                msg += " in %s\n  %s" % (module.__name__, sys.exc_value) 
    270                 logging.error(msg) 
     272                logger.error(msg) 
    271273        return reader_found 
    272274 

  • src/sas/sascalc/dataloader/readers/associations.py

    re5c09cf rc155a16  
    1818import logging 
    1919import json 
     20 
     21logger = logging.getLogger() 
    2022 
    2123FILE_NAME = 'defaults.json' 
    … …  
    6769                    msg = "read_associations: skipping association" 
    6870                    msg += " for %s\n  %s" % (ext.lower(), sys.exc_value) 
    69                     logging.error(msg) 
     71                    logger.error(msg) 
    7072    else: 
    7173        print "Could not find reader association settings\n  %s [%s]" % (__file__, os.getcwd()) 
    … …  
    8183    :param registry_function: function to be called to register each reader 
    8284    """ 
    83     logging.info("register_readers is now obsolete: use read_associations()") 
     85    logger.info("register_readers is now obsolete: use read_associations()") 
    8486    import abs_reader 
    8587    import ascii_reader 

  • src/sas/sascalc/dataloader/readers/cansas_reader.py

    r8434365 rc155a16  
    3333import xml.dom.minidom 
    3434from xml.dom.minidom import parseString 
     35 
     36logger = logging.getLogger() 
    3537 
    3638PREPROCESS = "xmlpreprocess" 
    … …  
    14711473                            self.errors.add(err_mess) 
    14721474                            if optional: 
    1473                                 logging.info(err_mess) 
     1475                                logger.info(err_mess) 
    14741476                            else: 
    14751477                                raise ValueError, err_mess 
    … …  
    14801482                        self.errors.add(err_mess) 
    14811483                        if optional: 
    1482                             logging.info(err_mess) 
     1484                            logger.info(err_mess) 
    14831485                        else: 
    14841486                            raise ValueError, err_mess 

  • src/sas/sascalc/dataloader/readers/danse_reader.py

    rb699768 rc155a16  
    1919from sas.sascalc.dataloader.data_info import Data2D, Detector 
    2020from sas.sascalc.dataloader.manipulations import reader2D_converter 
     21 
     22logger = logging.getLogger() 
    2123 
    2224# Look for unit converter 
    … …  
    142144                            error.append(err) 
    143145                        except: 
    144                             logging.info("Skipping line:%s,%s" %(data_str, 
     146                            logger.info("Skipping line:%s,%s" %(data_str, 
    145147                                                                sys.exc_value)) 
    146148             
    … …  
    196198                    msg = "Skipping entry (v1.0):%s,%s" % (str(data[i_pt]), 
    197199                                                           sys.exc_value) 
    198                     logging.info(msg) 
     200                    logger.info(msg) 
    199201                 
    200202                # Get bin number 
    … …  
    271273                raise ValueError, msg 
    272274            else: 
    273                 logging.info("Danse_reader Reading %s \n" % filename) 
     275                logger.info("Danse_reader Reading %s \n" % filename) 
    274276             
    275277            # Store loading process information 

  • src/sas/sascalc/dataloader/readers/tiff_reader.py

    rb699768 rc155a16  
    1616from sas.sascalc.dataloader.data_info import Data2D 
    1717from sas.sascalc.dataloader.manipulations import reader2D_converter 
    18      
     18 
     19logger = logging.getLogger() 
     20 
    1921class Reader: 
    2022    """ 
    … …  
    7678                value = float(val) 
    7779            except: 
    78                 logging.error("tiff_reader: had to skip a non-float point") 
     80                logger.error("tiff_reader: had to skip a non-float point") 
    7981                continue 
    8082             

  • src/sas/sascalc/dataloader/readers/xml_reader.py

    ra235f715 rc155a16  
    1818from lxml import etree 
    1919from lxml.builder import E 
     20 
     21logger = logging.getLogger() 
    2022 
    2123PARSER = etree.ETCompatXMLParser(remove_comments=True, remove_pis=False) 
    … …  
    7173            self.xmlroot = self.xmldoc.getroot() 
    7274        except etree.XMLSyntaxError as xml_error: 
    73             logging.info(xml_error) 
     75            logger.info(xml_error) 
    7476        except Exception: 
    7577            self.xml = None 
    … …  
    8890            self.xmlroot = etree.fromstring(tag_soup) 
    8991        except etree.XMLSyntaxError as xml_error: 
    90             logging.info(xml_error) 
     92            logger.info(xml_error) 
    9193        except Exception: 
    9294            self.xml = None 
    … …  
    102104            self.schemadoc = etree.parse(self.schema, parser=PARSER) 
    103105        except etree.XMLSyntaxError as xml_error: 
    104             logging.info(xml_error) 
     106            logger.info(xml_error) 
    105107        except Exception: 
    106108            self.schema = None 

  • src/sas/sascalc/pr/invertor.py

    r2c60f304 rc155a16  
    1818from scipy import optimize 
    1919from sas.sascalc.pr.core.pr_inversion import Cinvertor 
     20 
     21logger = logging.getLogger() 
    2022 
    2123def help(): 
    … …  
    495497            # We were not able to estimate the errors 
    496498            # Return an empty error matrix 
    497             logging.error(sys.exc_value) 
     499            logger.error(sys.exc_value) 
    498500 
    499501        # Keep a copy of the last output 
    … …  
    541543            # number of terms 
    542544            best_alpha, _, _ = self.estimate_alpha(self.nfunc) 
    543             logging.warning("Invertor.estimate_numterms: %s" % sys.exc_value) 
     545            logger.warning("Invertor.estimate_numterms: %s" % sys.exc_value) 
    544546            return self.nfunc, best_alpha, "Could not estimate number of terms" 
    545547 

  • src/sas/sascalc/pr/num_term.py

    rb699768 rc155a16  
    55import logging 
    66from sas.sascalc.pr.invertor import Invertor 
     7 
     8logger = logging.getLogger() 
    79 
    810class NTermEstimator(object): 
    … …  
    180182                data_err = numpy.append(data_err, err) 
    181183            except: 
    182                 logging.error(sys.exc_value) 
     184                logger.error(sys.exc_value) 
    183185 
    184186    return data_x, data_y, data_err 
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.