Ignore:
Timestamp:
Oct 27, 2017 7:48:48 AM (7 years ago)
Author:
krzywon
Branches:
ESS_GUI, ESS_GUI_Docs, ESS_GUI_batch_fitting, ESS_GUI_bumps_abstraction, ESS_GUI_iss1116, ESS_GUI_iss879, ESS_GUI_iss959, ESS_GUI_opencl, ESS_GUI_ordering, ESS_GUI_sync_sascalc
Children:
dab3351
Parents:
406f420
Message:

Data loading into p(r) properly and estimates running.

Location:
src/sas/qtgui/Perspectives/PrInversion
Files:
3 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed

  • src/sas/qtgui/Perspectives/PrInversion/PrInversionPerspective.py

    r406f420 rbde1a6b  
    88# pr inversion gui elements 
    99from PrInversionUtils import WIDGETS 
     10import UI.TabbedPrInversionUI 
    1011from UI.TabbedPrInversionUI import Ui_PrInversion 
     12 
     13# pr inversion calculation elements 
     14from sas.sascalc.pr.invertor import Invertor 
     15from sas.sasgui.perspectives.pr import pr_thread as pr_thread 
     16 
    1117 
    1218class PrInversionWindow(QtGui.QTabWidget, Ui_PrInversion): 
    … …  
    2733        self._helpView = QtWebKit.QWebView() 
    2834 
     35        self.communicate = GuiUtils.Communicate() 
     36 
     37        # The window should not close 
     38        self._allow_close = False 
     39 
     40        # is there data 
     41        self._has_data = False 
     42 
     43        # Current data object in view 
     44        self._data_index = 0 
     45        # list mapping data to p(r) calculation 
     46        self._data_list = [] 
    2947        if not isinstance(data, list): 
    3048            data = [data] 
    31         self._data = data 
    32  
    33         # The tabs need to be closeable 
    34         self._allow_close = False 
    35  
    36         # Set initial values 
    37         self._data_index = 0 
    38         self._path = "" 
    39         self._background = 0.0 
    40         self._qmin = 0.0 
    41         self._qmax = 1.0 
    42         self._slit_height = 0.0 
    43         self._slit_width = 0.0 
    44         self._terms = 10 
    45         self._regularization = 0.0001 
    46         self._max_distance = 140 
    47         self._bgd_input = False 
    48         self._terms_button = False 
    49         self._reg_button = False 
    50         self._terms_label = "" 
    51         self._reg_label = "" 
    52         # Set results 
    53         self._rg = 0.0 
    54         self._i_0 = 0.0 
    55         self._comp_time = 0.0 
    56         self._chi_dof = 0.0 
    57         self._oscillations = 0.0 
    58         self._pos_fraction = 0.0 
    59         self._sigma_pos_fraction = 0.0 
    60  
    61         # Let's choose the Standard Item Model. 
     49        for datum in data: 
     50            self._data_list.append({datum : None}) 
     51 
     52        # p(r) calculator 
     53        self._calculator = Invertor() 
     54 
    6255        self.model = QtGui.QStandardItemModel(self) 
     56        self.mapper = QtGui.QDataWidgetMapper(self) 
     57        # Link user interactions with methods 
     58        self.setupLinks() 
     59        # Set values 
     60        self.setupModel() 
    6361        # Set up the Widget Map 
    6462        self.setupMapper() 
    65         # Set values 
    66         self.setupModel() 
    67         # Link user interactions with methods 
    68         self.setupLinks() 
    69  
    70         self.communicate = GuiUtils.Communicate() 
    7163 
    7264    ###################################################################### 
    … …  
    7466 
    7567    def allowBatch(self): 
    76         return True 
     68        return False 
    7769 
    7870    def setClosable(self, value=True): 
    … …  
    10092 
    10193    def setupLinks(self): 
    102         self.dataList.currentIndexChanged.connect(self.displayChange) 
    103         self.calculateButton.clicked.connect(self.calculatePrInversion) 
     94        """Connect the use controls to their appropriate methods""" 
     95        self.enableButtons() 
     96        self.checkBgdClicked(False) 
     97        # TODO: enable the drop down box once batch is working 
     98        self.dataList.setEnabled(False) 
     99        # TODO: enable displayChange once batch is working 
     100        # self.dataList.currentIndexChanged.connect(self.displayChange) 
     101        self.calculateButton.clicked.connect(self._calculation) 
    104102        self.statusButton.clicked.connect(self.status) 
    105103        self.helpButton.clicked.connect(self.help) 
    … …  
    107105        self.manualBgd.toggled.connect(self.toggleBgd) 
    108106        self.explorerButton.clicked.connect(self.openExplorerWindow) 
    109         pass 
     107        self.model.itemChanged.connect(self.model_changed) 
    110108 
    111109    def setupMapper(self): 
    112110        # Set up the mapper. 
    113         self.mapper = QtGui.QDataWidgetMapper(self) 
    114111        self.mapper.setOrientation(QtCore.Qt.Vertical) 
    115112        self.mapper.setModel(self.model) 
    … …  
    118115        self.mapper.addMapping(self.dataList, WIDGETS.W_FILENAME) 
    119116        # Background 
    120         self.mapper.addMapping(self.backgroundInput, WIDGETS.W_BACKGROUND) 
     117        self.mapper.addMapping(self.backgroundInput, WIDGETS.W_BACKGROUND_INPUT) 
    121118        self.mapper.addMapping(self.estimateBgd, WIDGETS.W_ESTIMATE) 
    122119        self.mapper.addMapping(self.manualBgd, WIDGETS.W_MANUAL_INPUT) 
    … …  
    144141        self.mapper.addMapping(self.rgValue, WIDGETS.W_RG) 
    145142        self.mapper.addMapping(self.iQ0Value, WIDGETS.W_I_ZERO) 
    146         self.mapper.addMapping(self.backgroundValue, WIDGETS.W_BACKGROUND) 
     143        self.mapper.addMapping(self.backgroundValue, WIDGETS.W_BACKGROUND_OUTPUT) 
    147144        self.mapper.addMapping(self.computationTimeValue, WIDGETS.W_COMP_TIME) 
    148145        self.mapper.addMapping(self.chiDofValue, WIDGETS.W_CHI_SQUARED) 
    … …  
    159156        self.mapper.toFirst() 
    160157 
     158    def setupModel(self): 
     159        """ 
     160        Update boxes with initial values 
     161        """ 
     162        item = QtGui.QStandardItem("") 
     163        self.model.setItem(WIDGETS.W_FILENAME, item) 
     164        item = QtGui.QStandardItem('0.0') 
     165        self.model.setItem(WIDGETS.W_BACKGROUND_INPUT, item) 
     166        item = QtGui.QStandardItem("") 
     167        self.model.setItem(WIDGETS.W_QMIN, item) 
     168        item = QtGui.QStandardItem("") 
     169        self.model.setItem(WIDGETS.W_QMAX, item) 
     170        item = QtGui.QStandardItem("") 
     171        self.model.setItem(WIDGETS.W_SLIT_WIDTH, item) 
     172        item = QtGui.QStandardItem("") 
     173        self.model.setItem(WIDGETS.W_SLIT_HEIGHT, item) 
     174        item = QtGui.QStandardItem("10") 
     175        self.model.setItem(WIDGETS.W_NO_TERMS, item) 
     176        item = QtGui.QStandardItem("0.0001") 
     177        self.model.setItem(WIDGETS.W_REGULARIZATION, item) 
     178        item = QtGui.QStandardItem("140.0") 
     179        self.model.setItem(WIDGETS.W_MAX_DIST, item) 
     180        item = QtGui.QStandardItem("") 
     181        self.model.setItem(WIDGETS.W_RG, item) 
     182        item = QtGui.QStandardItem("") 
     183        self.model.setItem(WIDGETS.W_I_ZERO, item) 
     184        item = QtGui.QStandardItem("") 
     185        self.model.setItem(WIDGETS.W_BACKGROUND_OUTPUT, item) 
     186        item = QtGui.QStandardItem("") 
     187        self.model.setItem(WIDGETS.W_COMP_TIME, item) 
     188        item = QtGui.QStandardItem("") 
     189        self.model.setItem(WIDGETS.W_CHI_SQUARED, item) 
     190        item = QtGui.QStandardItem("") 
     191        self.model.setItem(WIDGETS.W_OSCILLATION, item) 
     192        item = QtGui.QStandardItem("") 
     193        self.model.setItem(WIDGETS.W_POS_FRACTION, item) 
     194        item = QtGui.QStandardItem("") 
     195        self.model.setItem(WIDGETS.W_SIGMA_POS_FRACTION, item) 
     196 
    161197    ###################################################################### 
    162198    # Methods for updating GUI 
    163199 
    164     def setupModel(self): 
    165         """ 
    166         Update boxes with latest values 
    167         """ 
    168         item = QtGui.QStandardItem(self._path) 
    169         self.model.setItem(WIDGETS.W_FILENAME, item) 
    170         item = QtGui.QStandardItem(self._background) 
    171         self.model.setItem(WIDGETS.W_BACKGROUND, item) 
    172         self.checkBgdClicked(self._bgd_input) 
    173         item = QtGui.QStandardItem(self._qmin) 
    174         self.model.setItem(WIDGETS.W_QMIN, item) 
    175         item = QtGui.QStandardItem(self._qmax) 
    176         self.model.setItem(WIDGETS.W_QMAX, item) 
    177         item = QtGui.QStandardItem(self._slit_width) 
    178         self.model.setItem(WIDGETS.W_SLIT_WIDTH, item) 
    179         item = QtGui.QStandardItem(self._slit_height) 
    180         self.model.setItem(WIDGETS.W_SLIT_HEIGHT, item) 
    181         item = QtGui.QStandardItem(self._terms) 
    182         self.model.setItem(WIDGETS.W_NO_TERMS, item) 
    183         item = QtGui.QStandardItem(self._regularization) 
    184         self.model.setItem(WIDGETS.W_REGULARIZATION, item) 
    185         item = QtGui.QStandardItem(self._max_distance) 
    186         self.model.setItem(WIDGETS.W_MAX_DIST, item) 
    187         item = QtGui.QStandardItem(self._rg) 
    188         self.model.setItem(WIDGETS.W_RG, item) 
    189         item = QtGui.QStandardItem(self._i_0) 
    190         self.model.setItem(WIDGETS.W_I_ZERO, item) 
    191         item = QtGui.QStandardItem(self._background) 
    192         self.model.setItem(WIDGETS.W_BACKGROUND, item) 
    193         item = QtGui.QStandardItem(self._comp_time) 
    194         self.model.setItem(WIDGETS.W_COMP_TIME, item) 
    195         item = QtGui.QStandardItem(self._chi_dof) 
    196         self.model.setItem(WIDGETS.W_CHI_SQUARED, item) 
    197         item = QtGui.QStandardItem(self._oscillations) 
    198         self.model.setItem(WIDGETS.W_OSCILLATION, item) 
    199         item = QtGui.QStandardItem(self._pos_fraction) 
    200         self.model.setItem(WIDGETS.W_POS_FRACTION, item) 
    201         item = QtGui.QStandardItem(self._sigma_pos_fraction) 
    202         self.model.setItem(WIDGETS.W_SIGMA_POS_FRACTION, item) 
    203         self.enableButtons() 
    204  
    205200    def enableButtons(self): 
    206201        """ 
    207         Disable buttons when no data present, else enable them 
    208         """ 
    209         if self._path == "" and len(self._data) == 1: 
     202        Enable buttons when data is present, else disable them 
     203        """ 
     204        if self._has_data: 
     205            self.statusButton.setEnabled(True) 
     206            self.explorerButton.setEnabled(True) 
     207            self.calculateButton.setEnabled(True) 
     208        else: 
    210209            self.calculateButton.setEnabled(False) 
    211210            self.explorerButton.setEnabled(False) 
    212211            self.statusButton.setEnabled(False) 
    213         else: 
    214             self.statusButton.setEnabled(True) 
    215             self.explorerButton.setEnabled(True) 
    216             self.calculateButton.setEnabled(True) 
    217  
    218     def reDraw(self): 
    219         """ 
    220         Redraws the window with any and all necessary updates. 
    221         """ 
    222         self.populateDataComboBox() 
    223         self.dataList.setCurrentIndex(self._data_index) 
    224         self._get_data_from_data_set() 
    225  
    226     def populateDataComboBox(self): 
    227         string_list = QtCore.QStringList() 
    228         for item in self._path: 
    229             qt_item = QtCore.QString.fromUtf8(item) 
    230             string_list.append(qt_item) 
    231         self.dataList.addItems(string_list) 
    232  
    233     def _addPr(self, data_list): 
    234         """ 
    235         Add a new data set to the P(r) window and updates as needed. 
    236         :param data_list: List of data sent from the data manager 
    237         """ 
    238         assert data_list is not None 
    239         for data in data_list: 
    240             # TODO: Get get object via GuiUtils 
    241             self._data.append(None) 
    242         self.reDraw() 
    243  
    244     def _get_data_from_data_set(self): 
    245         data = self._data[self._data_index] 
    246         # TODO: Get all items from data 
    247         # self._qmin = data.qmin 
    248         # self._qmax = data.qmax 
    249         self.setupModel() 
     212 
     213    def populateDataComboBox(self, filename): 
     214        """ 
     215        Append a new file name to the data combobox 
     216        :param data: Data1D object 
     217        """ 
     218        qt_item = QtCore.QString.fromUtf8(filename) 
     219        self.dataList.addItem(qt_item) 
    250220 
    251221    ###################################################################### 
    252222    # GUI Actions 
    253223 
    254     def calculatePrInversion(self): 
     224    def _calculation(self): 
    255225        """ 
    256226        Calculate the P(r) for every data set in the data list 
    257227        """ 
     228        # TODO: Run the calculations 
    258229        pass 
    259230 
     231    def model_changed(self): 
     232        """Update the values when user makes changes""" 
     233        if not self.mapper: 
     234            return 
     235        self.mapper.toFirst() 
     236        # TODO: Update plots, etc. 
     237 
    260238    def status(self): 
    261239        """ 
    262240        Show the status of the calculations 
    263241        """ 
     242        # TODO: Status - is this even needed/wanted? 
    264243        pass 
    265244 
    … …  
    281260            self.manualBgd.setChecked(True) 
    282261            self.toggleBgd(self.manualBgd) 
    283             self._bgd_input = True 
    284262        else: 
    285263            self.estimateBgd.setChecked(True) 
    286264            self.toggleBgd(self.estimateBgd) 
    287             self._bgd_input = False 
    288265 
    289266    def toggleBgd(self, item=None): 
    … …  
    307284        pass 
    308285 
    309     def displayChange(self): 
    310         """ 
    311         Display the values of the data set selected from the data combo box 
    312         """ 
    313         self._data_index = self.dataList.currentIndex() 
    314         self.setupModel() 
    315  
    316286    ###################################################################### 
    317287    # Response Actions 
    … …  
    333303            raise AttributeError, msg 
    334304 
    335         self._addPr(data_item) 
     305        for data in data_item: 
     306            data_object = GuiUtils.dataFromItem(data) 
     307            self._data_list.append({data_object: None}) 
     308            self._has_data = True 
     309            self.enableButtons() 
     310            self.populateDataComboBox(data_object.filename) 
     311            self.model.setItem(WIDGETS.W_QMIN, 
     312                               QtGui.QStandardItem(str(data_object.x.min()))) 
     313            self.model.setItem(WIDGETS.W_QMAX, 
     314                               QtGui.QStandardItem(str(data_object.x.max()))) 
     315 
     316            # TODO: Get value estimates 
     317            no_terms, alpha, _ = self._calculator.estimate_numterms( 
     318                self._calculator) 
     319            self.noOfTermsSuggestionButton.setText( 
     320                QtCore.QString(str(no_terms))) 
     321            self.noOfTermsSuggestionButton.setEnabled(True) 
     322            self.regConstantSuggestionButton.setText(QtCore.QString(str(alpha))) 
     323            self.regConstantSuggestionButton.setEnabled(True) 
     324 
     325            # TODO: Only load in the 1st data until batch mode is working 
     326            break 

  • src/sas/qtgui/Perspectives/PrInversion/PrInversionUtils.py

    re32b120 rbde1a6b  
    44 
    55WIDGETS = enum( 'W_FILENAME',               #0 
    6                 'W_BACKGROUND',             #1 
     6                'W_BACKGROUND_INPUT',             #1 
    77                'W_ESTIMATE',               #2 
    88                'W_MANUAL_INPUT',           #3 
    … …  
    2020                'W_RG', 
    2121                'W_I_ZERO', 
    22                 'W_BACKGROUND', 
     22                'W_BACKGROUND_OUTPUT', 
    2323                'W_COMP_TIME', 
    2424                'W_CHI_SQUARED', 

  • src/sas/qtgui/Perspectives/PrInversion/UI/TabbedPrInversionUI.ui

    r8045572 rbde1a6b  
    131131      <layout class="QVBoxLayout" name="verticalLayout_6" stretch="0,1,1,0"> 
    132132       <item> 
    133         <widget class="QGroupBox" name="groupBox"> 
     133        <widget class="QGroupBox" name="dataSourceGroupBox"> 
    134134         <property name="title"> 
    135135          <string>I(q) data source</string> 
    … …  
    197197       </item> 
    198198       <item> 
    199         <widget class="QGroupBox" name="groupBox_3"> 
     199        <widget class="QGroupBox" name="qRangeGroupBox"> 
    200200         <property name="title"> 
    201201          <string>Total Q range</string> 
    … …  
    254254       </item> 
    255255       <item> 
    256         <widget class="QGroupBox" name="groupBox_2"> 
     256        <widget class="QGroupBox" name="slitParamsGroupBox"> 
    257257         <property name="title"> 
    258258          <string>Slit Parameters</string> 
    … …  
    311311       </item> 
    312312       <item> 
    313         <widget class="QGroupBox" name="groupBox_5"> 
     313        <widget class="QGroupBox" name="paramGroupBox"> 
    314314         <property name="sizePolicy"> 
    315315          <sizepolicy hsizetype="Preferred" vsizetype="Preferred"> 
    … …  
    410410      <layout class="QGridLayout" name="gridLayout_6"> 
    411411       <item row="0" column="0"> 
    412         <widget class="QGroupBox" name="groupBox_4"> 
     412        <widget class="QGroupBox" name="outputsGroupBox"> 
    413413         <property name="title"> 
    414414          <string>Outputs</string> 
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.