Changes in / [46dfee9:9087214] in sasview


Ignore:
Location:
src/sas
Files:
10 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed

  • src/sas/sascalc/data_util/qsmearing.py

    rf8aa738 r392056d  
    55#This software was developed by the University of Tennessee as part of the 
    66#Distributed Data Analysis of Neutron Scattering Experiments (DANSE) 
    7 #project funded by the US National Science Foundation.  
     7#project funded by the US National Science Foundation. 
    88#See the license text in license.txt 
    99#copyright 2008, University of Tennessee 
    … …  
    1313import logging 
    1414import sys 
     15from sasmodels import sesans 
    1516 
    16 from sasmodels.resolution import Slit1D, Pinhole1D 
     17from sasmodels.resolution import Slit1D, Pinhole1D, SESANS1D 
    1718from sasmodels.resolution2d import Pinhole2D 
    1819 
    … …  
    4849 
    4950    # Look for resolution smearing data 
     51    _found_sesans = False 
     52    if data.dx is not None and data.meta_data['loader']=='SESANS': 
     53        if data.dx[0] > 0.0: 
     54            _found_sesans = True 
     55 
     56    if _found_sesans == True: 
     57        return sesans_smear(data, model) 
     58 
    5059    _found_resolution = False 
    5160    if data.dx is not None and len(data.dx) == len(data.x): 
    … …  
    92101        self.model = model 
    93102        self.resolution = resolution 
    94         self.offset = numpy.searchsorted(self.resolution.q_calc, self.resolution.q[0]) 
     103        if hasattr(self.resolution, 'data'): 
     104            if self.resolution.data.meta_data['loader'] == 'SESANS': 
     105                self.offset = 0 
     106            # This is default behaviour, for future resolution/transform functions this needs to be revisited. 
     107            else: 
     108                self.offset = numpy.searchsorted(self.resolution.q_calc, self.resolution.q[0]) 
     109        else: 
     110            self.offset = numpy.searchsorted(self.resolution.q_calc, self.resolution.q[0]) 
     111 
     112        #self.offset = numpy.searchsorted(self.resolution.q_calc, self.resolution.q[0]) 
    95113 
    96114    def apply(self, iq_in, first_bin=0, last_bin=None): 
    … …  
    126144        q[first:last+1]. 
    127145        """ 
     146 
    128147        q = self.resolution.q 
    129148        first = numpy.searchsorted(q, q_min) 
    … …  
    142161    width = data.dx if data.dx is not None else 0 
    143162    return PySmear(Pinhole1D(q, width), model) 
     163 
     164def sesans_smear(data, model=None): 
     165    #This should be calculated characteristic length scale 
     166    #Probably not a data prameter either 
     167    #Need function to calculate this based on model 
     168    #Here assume a number 
     169    Rmax = 1000000 
     170    q_calc = sesans.make_q(data.sample.zacceptance, Rmax) 
     171    return PySmear(SESANS1D(data,q_calc),model) 

  • src/sas/sascalc/dataloader/data_info.py

    r1b1a1c1 r1fac6c0  
    2525import numpy 
    2626import math 
    27  
    28 class plottable_sesans1D(object): 
    29     """ 
    30     SESANS is a place holder for 1D SESANS plottables. 
    31  
    32     #TODO: This was directly copied from the plottables_1D. Modified Somewhat. 
    33     #Class has been updated. 
    34     """ 
    35     # The presence of these should be mutually 
    36     # exclusive with the presence of Qdev (dx) 
    37     x = None 
    38     y = None 
    39     lam = None 
    40     dx = None 
    41     dy = None 
    42     dlam = None 
    43     ## Slit smearing length 
    44     dxl = None 
    45     ## Slit smearing width 
    46     dxw = None 
    47  
    48     # Units 
    49     _xaxis = '' 
    50     _xunit = '' 
    51     _yaxis = '' 
    52     _yunit = '' 
    53  
    54     def __init__(self, x, y, lam, dx=None, dy=None, dlam=None): 
    55 #        print "SESANS plottable working" 
    56         self.x = numpy.asarray(x) 
    57         self.y = numpy.asarray(y) 
    58         self.lam = numpy.asarray(lam) 
    59         if dx is not None: 
    60             self.dx = numpy.asarray(dx) 
    61         if dy is not None: 
    62             self.dy = numpy.asarray(dy) 
    63         if dlam is not None: 
    64             self.dlam = numpy.asarray(dlam) 
    65  
    66     def xaxis(self, label, unit): 
    67         """ 
    68         set the x axis label and unit 
    69         """ 
    70         self._xaxis = label 
    71         self._xunit = unit 
    72  
    73     def yaxis(self, label, unit): 
    74         """ 
    75         set the y axis label and unit 
    76         """ 
    77         self._yaxis = label 
    78         self._yunit = unit 
    79  
    80  
    8127class plottable_1D(object): 
    8228    """ 
    … …  
    9440    dxw = None 
    9541 
     42    ## SESANS specific params (wavelengths for spin echo length calculation) 
     43 
     44    lam = None 
     45    dlam = None 
     46 
    9647    # Units 
    9748    _xaxis = '' 
    … …  
    10051    _yunit = '' 
    10152 
    102     def __init__(self, x, y, dx=None, dy=None, dxl=None, dxw=None): 
     53    def __init__(self, x, y, dx=None, dy=None, dxl=None, dxw=None, lam=None, dlam=None): 
    10354        self.x = numpy.asarray(x) 
    10455        self.y = numpy.asarray(y) 
    … …  
    11162        if dxw is not None: 
    11263            self.dxw = numpy.asarray(dxw) 
     64        if lam is not None: 
     65            self.lam = numpy.asarray(lam) 
     66        if dlam is not None: 
     67            self.dlam = numpy.asarray(dlam) 
    11368 
    11469    def xaxis(self, label, unit): 
    … …  
    736691        return self._perform_union(other) 
    737692 
    738 class SESANSData1D(plottable_sesans1D, DataInfo): 
    739     """ 
    740     SESANS 1D data class 
    741     """ 
    742     x_unit = 'nm' 
    743     y_unit = 'pol' 
    744  
    745     def __init__(self, x=None, y=None, lam=None, dx=None, dy=None, dlam=None): 
     693class Data1D(plottable_1D, DataInfo): 
     694    """ 
     695    1D data class 
     696    """ 
     697    #if plottable_1D.lam is None: # This means it's SANS data! 
     698     #   x_unit = '1/A' 
     699      #  y_unit = '1/cm' 
     700    #elif plottable_1D.lam is not None: # This means it's SESANS data! 
     701     #   x_unit = 'A' 
     702      #  y_unit = 'pol' 
     703    #else: # and if it's neither, you get punished! 
     704     #   raise(TypeError,'This is neither SANS nor SESANS data, what the hell are you doing??') 
     705 
     706    def __init__(self, x=None, y=None, dx=None, dy=None, lam=None, dlam=None, isSesans=False): 
     707        self.isSesans = isSesans 
    746708        DataInfo.__init__(self) 
    747         plottable_sesans1D.__init__(self, x, y, lam, dx, dy, dlam) 
     709        plottable_1D.__init__(self, x, y, dx, dy,None, None, lam, dlam) 
     710        if self.isSesans: 
     711            x_unit = 'A' 
     712            y_unit = 'pol' 
     713        elif not self.isSesans: # it's SANS data! (Could also be simple else statement, but i prefer exhaustive conditionals...-JHB) 
     714            x_unit = '1/A' 
     715            y_unit = '1/cm' 
     716        else: # and if it's neither, you get punished! 
     717            raise(TypeError,'This is neither SANS nor SESANS data, what the hell are you doing??') 
    748718 
    749719    def __str__(self): 
    … …  
    759729        return _str 
    760730 
    761     def clone_without_data(self, length=0, clone=None): 
    762         """ 
    763         Clone the current object, without copying the data (which 
    764         will be filled out by a subsequent operation). 
    765         The data arrays will be initialized to zero. 
    766  
    767         :param length: length of the data array to be initialized 
    768         :param clone: if provided, the data will be copied to clone 
    769         """ 
    770         from copy import deepcopy 
    771         if clone is None or not issubclass(clone.__class__, Data1D): 
    772             x = numpy.zeros(length) 
    773             dx = numpy.zeros(length) 
    774             y = numpy.zeros(length) 
    775             dy = numpy.zeros(length) 
    776             clone = Data1D(x, y, dx=dx, dy=dy) 
    777  
    778         clone.title = self.title 
    779         clone.run = self.run 
    780         clone.filename = self.filename 
    781         clone.instrument = self.instrument 
    782         clone.notes = deepcopy(self.notes) 
    783         clone.process = deepcopy(self.process) 
    784         clone.detector = deepcopy(self.detector) 
    785         clone.sample = deepcopy(self.sample) 
    786         clone.source = deepcopy(self.source) 
    787         clone.collimation = deepcopy(self.collimation) 
    788         clone.trans_spectrum = deepcopy(self.trans_spectrum) 
    789         clone.meta_data = deepcopy(self.meta_data) 
    790         clone.errors = deepcopy(self.errors) 
    791  
    792         return clone 
    793  
    794 class Data1D(plottable_1D, DataInfo): 
    795     """ 
    796     1D data class 
    797     """ 
    798     x_unit = '1/A' 
    799     y_unit = '1/cm' 
    800  
    801     def __init__(self, x, y, dx=None, dy=None): 
    802         DataInfo.__init__(self) 
    803         plottable_1D.__init__(self, x, y, dx, dy) 
    804  
    805     def __str__(self): 
    806         """ 
    807         Nice printout 
    808         """ 
    809         _str = "%s\n" % DataInfo.__str__(self) 
    810         _str += "Data:\n" 
    811         _str += "   Type:         %s\n" % self.__class__.__name__ 
    812         _str += "   X-axis:       %s\t[%s]\n" % (self._xaxis, self._xunit) 
    813         _str += "   Y-axis:       %s\t[%s]\n" % (self._yaxis, self._yunit) 
    814         _str += "   Length:       %g\n" % len(self.x) 
    815         return _str 
    816  
    817731    def is_slit_smeared(self): 
    818732        """ 
    … …  
    843757            y = numpy.zeros(length) 
    844758            dy = numpy.zeros(length) 
    845             clone = Data1D(x, y, dx=dx, dy=dy) 
     759            lam = numpy.zeros(length) 
     760            dlam = numpy.zeros(length) 
     761            clone = Data1D(x, y, lam=lam, dx=dx, dy=dy, dlam=dlam ) 
    846762 
    847763        clone.title = self.title 

  • src/sas/sascalc/dataloader/readers/sesans_reader.py

    r1c0e3b0 r392056d  
    88import numpy 
    99import os 
    10 from sas.sascalc.dataloader.data_info import SESANSData1D 
     10from sas.sascalc.dataloader.data_info import Data1D 
    1111 
    1212# Check whether we have a converter available 
    … …  
    8484                tdx = numpy.zeros(0) 
    8585#                print "all good" 
    86                 output = SESANSData1D(x=x, y=y, lam=lam, dy=dy, dx=dx, dlam=dlam) 
     86                output = Data1D(x=x, y=y, lam=lam, dy=dy, dx=dx, dlam=dlam, isSesans=True ) 
    8787#                print output                 
    8888                self.filename = output.filename = basename 
    … …  
    121121                        paramvals.append(toks[1]) 
    122122                    if len(toks)>5: 
     123                       #zvals.append(toks[0]) 
     124                        #dzvals.append(toks[1]) 
     125                        #lamvals.append(toks[2]) 
     126                        #dlamvals.append(toks[3]) 
     127                        #Pvals.append(toks[4]) 
     128                        #dPvals.append(toks[5]) 
     129 
    123130                        zvals.append(toks[0]) 
    124                         dzvals.append(toks[1]) 
    125                         lamvals.append(toks[2]) 
    126                         dlamvals.append(toks[3]) 
    127                         Pvals.append(toks[4]) 
    128                         dPvals.append(toks[5]) 
     131                        dzvals.append(toks[3]) 
     132                        lamvals.append(toks[4]) 
     133                        dlamvals.append(toks[5]) 
     134                        Pvals.append(toks[1]) 
     135                        dPvals.append(toks[2]) 
    129136                    else: 
    130137                        continue 
    … …  
    140147                default_z_unit = "A" 
    141148                data_conv_P = None 
    142                 default_p_unit = " " 
     149                default_p_unit = " " # Adjust unit for axis (L^-3) 
    143150                lam_unit = lam_header[1].replace("[","").replace("]","") 
     151                if lam_unit == 'AA': 
     152                    lam_unit = 'A' 
    144153                varheader=[zvals[0],dzvals[0],lamvals[0],dlamvals[0],Pvals[0],dPvals[0]] 
    145154                valrange=range(1, len(zvals)) 
    … …  
    161170                output.x, output.x_unit = self._unit_conversion(x, lam_unit, default_z_unit) 
    162171                output.y = y 
     172                output.y_unit = '\AA^{-2} cm^{-1}' # output y_unit erbij 
    163173                output.dx, output.dx_unit = self._unit_conversion(dx, lam_unit, default_z_unit) 
    164174                output.dy = dy 
    … …  
    166176                output.dlam, output.dlam_unit = self._unit_conversion(dlam, lam_unit, default_z_unit) 
    167177 
    168                 output.xaxis("\rm{z}", output.x_unit) 
    169                 output.yaxis("\\rm{P/P0}", output.y_unit) 
     178                output.xaxis("\\rm{z}", output.x_unit) 
     179                output.yaxis("\\rm{ln(P)/(t \lambda^2)}", output.y_unit) # Adjust label to ln P/(lam^2 t), remove lam column refs 
    170180                # Store loading process information 
    171181                output.meta_data['loader'] = self.type_name 
    172                 output.sample.thickness = float(paramvals[6]) 
     182                #output.sample.thickness = float(paramvals[6]) 
    173183                output.sample.name = paramvals[1] 
    174184                output.sample.ID = paramvals[0] 
    175185                zaccept_unit_split = paramnames[7].split("[") 
    176186                zaccept_unit = zaccept_unit_split[1].replace("]","") 
    177                 if zaccept_unit.strip() == '\AA^-1': 
     187                if zaccept_unit.strip() == '\AA^-1' or zaccept_unit.strip() == '\A^-1': 
    178188                    zaccept_unit = "1/A" 
    179189                output.sample.zacceptance=(float(paramvals[7]),zaccept_unit) 

  • src/sas/sascalc/fit/AbstractFitEngine.py

    rfc18690 r7988501  
    131131        a way to get residuals from data. 
    132132    """ 
    133     def __init__(self, x, y, dx=None, dy=None, smearer=None, data=None): 
     133    def __init__(self, x, y, dx=None, dy=None, smearer=None, data=None, lam=None, dlam=None): 
    134134        """ 
    135135            :param smearer: is an object of class QSmearer or SlitSmearer 
    … …  
    152152                 
    153153        """ 
    154         Data1D.__init__(self, x=x, y=y, dx=dx, dy=dy) 
     154        Data1D.__init__(self, x=x, y=y, dx=dx, dy=dy, lam=lam,dlam=dlam) 
    155155        self.num_points = len(x) 
    156156        self.sas_data = data 

  • src/sas/sascalc/fit/BumpsFitting.py

    rb699768 r7988501  
    2626from bumps import parameter 
    2727from bumps.fitproblem import FitProblem 
    28  
    2928 
    3029from sas.sascalc.fit.AbstractFitEngine import FitEngine 

  • src/sas/sasgui/guiframe/dataFitting.py

    r9b6d62d r1fac6c0  
    1717    """ 
    1818    """ 
    19     def __init__(self, x=None, y=None, dx=None, dy=None): 
     19    def __init__(self, x=None, y=None, dx=None, dy=None, lam=None, dlam=None, isSesans=False): 
    2020        """ 
    2121        """ 
    … …  
    2424        if y is None: 
    2525            y = [] 
    26         PlotData1D.__init__(self, x, y, dx, dy) 
    27         LoadData1D.__init__(self, x, y, dx, dy) 
     26        self.isSesans = isSesans 
     27        PlotData1D.__init__(self, x, y, dx, dy, lam, dlam) 
     28        LoadData1D.__init__(self, x, y, dx, dy, lam, dlam, isSesans) 
    2829        self.id = None 
    2930        self.list_group_id = [] 
    … …  
    6869        # First, check the data compatibility 
    6970        dy, dy_other = self._validity_check(other) 
    70         result = Data1D(x=[], y=[], dx=None, dy=None) 
     71        result = Data1D(x=[], y=[], lam=[], dx=None, dy=None, dlam=None) 
    7172        result.clone_without_data(length=len(self.x), clone=self) 
    7273        result.copy_from_datainfo(data1d=self) 
    … …  
    115116        # First, check the data compatibility 
    116117        self._validity_check_union(other) 
    117         result = Data1D(x=[], y=[], dx=None, dy=None) 
     118        result = Data1D(x=[], y=[], lam=[], dx=None, dy=None, dlam=None) 
    118119        tot_length = len(self.x) + len(other.x) 
    119120        result = self.clone_without_data(length=tot_length, clone=result) 
     121        if self.dlam == None or other.dlam is None: 
     122            result.dlam = None 
     123        else: 
     124            result.dlam = numpy.zeros(tot_length) 
    120125        if self.dy == None or other.dy is None: 
    121126            result.dy = None 
    … …  
    141146        result.y = numpy.append(self.y, other.y) 
    142147        result.y = result.y[ind] 
     148        result.lam = numpy.append(self.lam, other.lam) 
     149        result.lam = result.lam[ind] 
     150        if result.dlam != None: 
     151            result.dlam = numpy.append(self.dlam, other.dlam) 
     152            result.dlam = result.dlam[ind] 
    143153        if result.dy != None: 
    144154            result.dy = numpy.append(self.dy, other.dy) 
    … …  
    260270        # First, check the data compatibility 
    261271        self._validity_check_union(other) 
    262         result = Data1D(x=[], y=[], dx=None, dy=None) 
     272        result = Data1D(x=[], y=[], lam=[], dx=None, dy=None, dlam=[]) 
    263273        tot_length = len(self.x)+len(other.x) 
    264274        result.clone_without_data(length=tot_length, clone=self) 
     275        if self.dlam == None or other.dlam is None: 
     276            result.dlam = None 
     277        else: 
     278            result.dlam = numpy.zeros(tot_length) 
    265279        if self.dy == None or other.dy is None: 
    266280            result.dy = None 
    … …  
    285299        result.y = numpy.append(self.y, other.y) 
    286300        result.y = result.y[ind] 
     301        result.lam = numpy.append(self.lam, other.lam) 
     302        result.lam = result.lam[ind] 
    287303        if result.dy != None: 
    288304            result.dy = numpy.append(self.dy, other.dy) 

  • src/sas/sasgui/guiframe/data_manager.py

    rd85c194 r1fac6c0  
    6262        if issubclass(Data2D, data.__class__): 
    6363            new_plot = Data2D(image=None, err_image=None)  
    64         else:  
    65             new_plot = Data1D(x=[], y=[], dx=None, dy=None) 
     64        elif data.meta_data['loader'] == 'SESANS': 
     65            new_plot = Data1D(x=[], y=[], dx=None, dy=None, lam=None, dlam=None, isSesans=True) 
     66        else: 
     67            new_plot = Data1D(x=[], y=[], dx=None, dy=None, lam=None, dlam=None) #SESANS check??? 
    6668            
    6769        new_plot.copy_from_datainfo(data) 

  • src/sas/sasgui/perspectives/fitting/basepage.py

    rf22b43c rf22b43c  
    142142        self.theory_qmin_x = None 
    143143        self.theory_qmax_x = None 
     144        self.cb1 = None 
    144145        self.btEditMask = None 
    145146        self.btFit = None 
    … …  
    280281                           num=self.npts_x, endpoint=True) 
    281282        self.data = Data1D(x=x) 
    282         self.data.xaxis('\\rm{Q}', "A^{-1}") 
    283         self.data.yaxis('\\rm{Intensity}', "cm^{-1}") 
     283        #self.data.xaxis('\\rm{Q}', "A^{-1}") 
     284        self.data.xaxis('\\rm{X}', "") 
     285        #self.data.yaxis('\\rm{Intensity}', "cm^{-1}") 
     286        self.data.yaxis('\\rm{Y}', "") 
    284287        self.data.is_data = False 
    285288        self.data.id = str(self.uid) + " data" 
    … …  
    306309                           num=self.npts_x, endpoint=True, base=10.0) 
    307310        self.data = Data1D(x=x) 
    308         self.data.xaxis('\\rm{Q}', "A^{-1}") 
    309         self.data.yaxis('\\rm{Intensity}', "cm^{-1}") 
     311        #self.data.xaxis('\\rm{Q}', "A^{-1}") 
     312        #self.data.yaxis('\\rm{Intensity}', "cm^{-1}") 
     313        self.data.xaxis('\\rm{X}', "") 
     314        self.data.yaxis('\\rm{Y}', "") 
    310315        self.data.is_data = False 
    311316        self.data.id = str(self.uid) + " data" 
    … …  
    426431        self.sizer2 = wx.BoxSizer(wx.VERTICAL) 
    427432        self.sizer3 = wx.BoxSizer(wx.VERTICAL) 
     433        self.sizerTrafo = wx.BoxSizer(wx.VERTICAL) 
    428434        self.sizer4 = wx.BoxSizer(wx.VERTICAL) 
    429435        self.sizer5 = wx.BoxSizer(wx.VERTICAL) 
    … …  
    434440        self.sizer2.SetMinSize((PANEL_WIDTH, -1)) 
    435441        self.sizer3.SetMinSize((PANEL_WIDTH, -1)) 
     442        self.sizerTrafo.SetMinSize((PANEL_WIDTH, -1)) 
    436443        self.sizer4.SetMinSize((PANEL_WIDTH, -1)) 
    437444        self.sizer5.SetMinSize((PANEL_WIDTH, -1)) 
    … …  
    442449        self.vbox.Add(self.sizer2) 
    443450        self.vbox.Add(self.sizer3) 
     451        self.vbox.Add(self.sizerTrafo) 
    444452        self.vbox.Add(self.sizer4) 
    445453        self.vbox.Add(self.sizer5) 
    … …  
    11221130        # set data, etc. from the state 
    11231131        # reset page between theory and fitting from bookmarking 
     1132        #if state.data == None: 
     1133        #    data = None 
     1134        #else: 
    11241135        data = state.data 
    11251136 
    … …  
    11471158        self.disp_cb_dict = state.disp_cb_dict 
    11481159        self.disp_list = state.disp_list 
     1160 
     1161        ## set the state of the radio box 
     1162        #self.shape_rbutton.SetValue(state.shape_rbutton) 
     1163        #self.shape_indep_rbutton.SetValue(state.shape_indep_rbutton) 
     1164        #self.struct_rbutton.SetValue(state.struct_rbutton) 
     1165        #self.plugin_rbutton.SetValue(state.plugin_rbutton) 
    11491166 
    11501167        ## fill model combobox 
    … …  
    12071224            else: 
    12081225                self.model_view.SetLabel("1D Mode") 
     1226 
     1227        ## set the select all check box to the a given state 
     1228        self.cb1.SetValue(state.cb1) 
    12091229 
    12101230        ## reset state of checkbox,textcrtl  and  regular parameters value 
    … …  
    13371357                            logging.error(traceback.format_exc()) 
    13381358 
     1359        # Make sure the check box updated when all checked 
     1360        if self.cb1.GetValue(): 
     1361            self.select_all_param(None) 
     1362 
    13391363    def _selectDlg(self): 
    13401364        """ 
    … …  
    14391463                self.fitrange = False 
    14401464 
     1465            if not self.data.is_data: 
     1466                is_modified = True 
     1467 
    14411468            ## if any value is modify draw model with new value 
    14421469            if not self.fitrange: 
    … …  
    14541481                self._draw_model() 
    14551482                self.Refresh() 
    1456  
    1457         #logging.info("is_modified flag set to %g",is_modified) 
    14581483        return is_modified 
    14591484 
    … …  
    24772502                        item[2].Enable() 
    24782503 
    2479             # Make sure the check box updated 
    2480             self.get_all_checked_params() 
     2504            # Make sure the check box updated when all checked 
     2505            if self.cb1.GetValue(): 
     2506                #self.select_all_param(None) 
     2507                self.get_all_checked_params() 
    24812508 
    24822509            # update params 
    … …  
    36573684        call back for model selection if implemented 
    36583685        """ 
     3686    def select_all_param(self, event): 
     3687        """ 
     3688        set to true or false all checkBox if implemented 
     3689        """ 
    36593690    def get_weight_flag(self): 
    36603691        """ 

  • src/sas/sasgui/perspectives/fitting/fitpage.py

    r3bec50a r3bec50a  
    5555        self.weightbt_string = None 
    5656        self.m_name = None 
     57        # transform implementation 
     58        self._fill_Trafo_sizer() 
     59       # self.Trafobt_string() 
    5760        # get smear info from data 
    5861        self._get_smear_info() 
    … …  
    9295        self.parent.on_set_focus(event) 
    9396        self.on_tap_focus() 
     97 
     98    def onTrafo(self, event): 
     99        """ 
     100        On Trafo radio button event, sets the Trafobt_string 
     101        """ 
     102        self.Trafobt_string = event.GetEventObject().GetLabelText() 
     103        self._set_Trafo() 
     104 
     105    def _fill_Trafo_sizer(self): 
     106 
     107        title = "Transform" 
     108        box_description_trafo = wx.StaticBox(self, wx.ID_ANY, str(title)) 
     109        box_description_trafo.SetForegroundColour(wx.BLUE) 
     110        #boxsizer_trafo = wx.StaticBoxSizer(box_description_trafo, wx.VERTICAL) 
     111        boxsizer_trafo = wx.StaticBoxSizer(box_description_trafo, wx.HORIZONTAL) 
     112        #sizer_trafo = wx.StaticBoxSizer(box_description_trafo, wx.HORIZONTAL) 
     113        #weighting_set_box = wx.StaticBox(self, wx.ID_ANY, 
     114         #                              'Select the type of SESANS analysis') 
     115 
     116        #sizer_weighting = wx.BoxSizer(wx.HORIZONTAL) 
     117          #      weighting_box.SetMinSize((_DATA_BOX_WIDTH, 60)) 
     118 
     119        #For every radio button (each statement x3): 
     120        self.no_transform = wx.RadioButton(self, wx.ID_ANY, 
     121                                                  'None', style=wx.RB_GROUP) 
     122 
     123        #self.Bind(wx.EVT_RADIOBUTTON, self.onTrafo, 
     124         #                 id=self.no_transform.GetId()) 
     125        self.hankel = wx.RadioButton(self, wx.ID_ANY, 
     126                                                  'Hankel') 
     127        #self.Bind(wx.EVT_RADIOBUTTON, self.onTrafo, 
     128        #                  id=self.hankel.GetId()) 
     129        self.cosine = wx.RadioButton(self, wx.ID_ANY, 
     130                                                  'Cosine') 
     131        #self.Bind(wx.EVT_RADIOBUTTON, self.onTrafo, 
     132         #                 id=self.cosine.GetId()) 
     133 
     134        #Not sure about this (only once though) 
     135        self.no_transform.SetValue(True) 
     136 
     137        #For every radio button (each statement x3): 
     138        boxsizer_trafo.Add(self.no_transform, 0, wx.LEFT, 10) 
     139        boxsizer_trafo.Add((14, 10)) 
     140        boxsizer_trafo.Add(self.hankel) 
     141        boxsizer_trafo.Add((14, 10)) 
     142        boxsizer_trafo.Add(self.cosine) 
     143        boxsizer_trafo.Add((14, 10)) 
     144            #Default for weighting is False, but these need to be on by default! 
     145        self.no_transform.Enable(True) 
     146 
     147        #Not sure about this (only once though) 
     148        #weighting_box.Add(sizer_trafo) 
     149 
     150        self.sizerTrafo.Clear(True) 
     151        self.sizerTrafo.Add(boxsizer_trafo, 0, wx.EXPAND | wx.ALL, 10) 
     152        #self.sizerTrafo.Add(sizer_trafo, 0, wx.EXPAND | wx.ALL, 10) 
     153        self.sizerTrafo.Layout() 
    94154 
    95155    def _fill_data_sizer(self): 
    … …  
    624684        ## fill a sizer with the combobox to select dispersion type 
    625685        model_disp = wx.StaticText(self, wx.ID_ANY, 'Function') 
    626         CHECK_STATE = False 
     686        CHECK_STATE = self.cb1.GetValue() 
    627687 
    628688        ix = 0 
    … …  
    9691029        self.state.model = self.model.clone() 
    9701030        ## save state into 
     1031        self.state.cb1 = self.cb1.GetValue() 
    9711032        self._copy_parameters_state(self.parameters, self.state.parameters) 
    9721033        self._copy_parameters_state(self.orientation_params_disp, 
    … …  
    9791040                     StatusEvent(status=" Selected Distribution: Gaussian")) 
    9801041        #Fill the list of fittable parameters 
     1042        #self.select_all_param(event=None) 
    9811043        self.get_all_checked_params() 
    9821044        self.Layout() 
    … …  
    26932755        self._manager.set_param2fit(self.uid, param2fit) 
    26942756 
     2757    def select_all_param(self, event): 
     2758        """ 
     2759        set to true or false all checkBox given the main checkbox value cb1 
     2760        """ 
     2761        self.param_toFit = [] 
     2762        if  self.parameters != []: 
     2763            if  self.cb1.GetValue(): 
     2764                for item in self.parameters: 
     2765                    if item[0].IsShown(): 
     2766                        ## for data2D select all to fit 
     2767                        if self.data.__class__.__name__ == "Data2D" or \ 
     2768                                self.enable2D: 
     2769                            item[0].SetValue(True) 
     2770                            self.param_toFit.append(item) 
     2771                        else: 
     2772                            ## for 1D all parameters except orientation 
     2773                            if not item in self.orientation_params: 
     2774                                item[0].SetValue(True) 
     2775                                self.param_toFit.append(item) 
     2776                    else: 
     2777                        item[0].SetValue(False) 
     2778                #if len(self.fittable_param)>0: 
     2779                for item in self.fittable_param: 
     2780                    if item[0].IsShown(): 
     2781                        if self.data.__class__.__name__ == "Data2D" or \ 
     2782                                self.enable2D: 
     2783                            item[0].SetValue(True) 
     2784                            self.param_toFit.append(item) 
     2785                            try: 
     2786                                if len(self.values[item[1]]) > 0: 
     2787                                    item[0].SetValue(False) 
     2788                            except: 
     2789                                pass 
     2790 
     2791                        else: 
     2792                            ## for 1D all parameters except orientation 
     2793                            if not item in self.orientation_params_disp: 
     2794                                item[0].SetValue(True) 
     2795                                self.param_toFit.append(item) 
     2796                                try: 
     2797                                    if len(self.values[item[1]]) > 0: 
     2798                                        item[0].SetValue(False) 
     2799                                except: 
     2800                                    pass 
     2801                    else: 
     2802                        item[0].SetValue(False) 
     2803 
     2804            else: 
     2805                for item in self.parameters: 
     2806                    item[0].SetValue(False) 
     2807                for item in self.fittable_param: 
     2808                    item[0].SetValue(False) 
     2809                self.param_toFit = [] 
     2810 
     2811        self.save_current_state_fit() 
     2812 
     2813        if event != None: 
     2814            #self._undo.Enable(True) 
     2815            ## post state to fit panel 
     2816            event = PageInfoEvent(page=self) 
     2817            wx.PostEvent(self.parent, event) 
     2818        param2fit = [] 
     2819        for item in self.param_toFit: 
     2820            if item[0] and item[0].IsShown(): 
     2821                param2fit.append(item[1]) 
     2822        self.parent._manager.set_param2fit(self.uid, param2fit) 
     2823 
    26952824    def select_param(self, event): 
    26962825        """ 
    … …  
    27392868        if len(self.fittable_param) > 0: 
    27402869            len_orient_para *= 2 
     2870        #Set the value of checkbox that selected every checkbox or not 
     2871        if len(self.parameters) + len(self.fittable_param) - len_orient_para \ 
     2872            == len(self.param_toFit): 
     2873            self.cb1.SetValue(True) 
     2874        else: 
     2875            self.cb1.SetValue(False) 
    27412876 
    27422877        self.save_current_state_fit() 
    … …  
    28402975        iy = 0 
    28412976        ix = 0 
    2842         sizer.Add(wx.StaticText(self, wx.ID_ANY, 'Parameter'), 
    2843                   (iy, ix), (1, 1), wx.EXPAND | wx.ADJUST_MINSIZE, 0) 
     2977        select_text = "Select All" 
     2978        self.cb1 = wx.CheckBox(self, wx.ID_ANY, str(select_text), (10, 10)) 
     2979        wx.EVT_CHECKBOX(self, self.cb1.GetId(), self.select_all_param) 
     2980        self.cb1.SetToolTipString("To check/uncheck all the boxes below.") 
     2981        self.cb1.SetValue(True) 
     2982 
     2983        sizer.Add(self.cb1, (iy, ix), (1, 1), \ 
     2984                             wx.LEFT | wx.EXPAND | wx.ADJUST_MINSIZE, 5) 
    28442985        ix += 1 
    28452986        self.text2_2 = wx.StaticText(self, wx.ID_ANY, 'Value') 
    … …  
    28683009        self.text2_4.Hide() 
    28693010 
    2870         CHECK_STATE = False 
     3011        CHECK_STATE = self.cb1.GetValue() 
    28713012        for item in keys: 
    28723013 

  • src/sas/sasgui/plottools/plottables.py

    r8abd96d r1fac6c0  
    10221022    """ 
    10231023 
    1024     def __init__(self, x, y, dx=None, dy=None): 
     1024    def __init__(self, x, y, dx=None, dy=None, lam=None, dlam=None): 
    10251025        """ 
    10261026        Draw points specified by x[i],y[i] in the current color/symbol. 
    … …  
    10361036        self.x = x 
    10371037        self.y = y 
     1038        self.lam = lam 
    10381039        self.dx = dx 
    10391040        self.dy = dy 
     1041        self.dlam = dlam 
    10401042        self.source = None 
    10411043        self.detector = None 
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.