Changes in / [3522037:6701a0b] in sasview


Ignore:
Location:
src/sas/qtgui
Files:
11 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed

  • src/sas/qtgui/Calculators/SldPanel.py

    r5c0e717 raed0532  
    66 
    77from periodictable import formula as Formula 
    8 from periodictable.xsf import xray_energy, xray_sld 
     8from periodictable.xsf import xray_energy, xray_sld_from_atoms 
    99from periodictable.nsf import neutron_scattering 
    1010 
    … …  
    2121    'MOLECULAR_FORMULA', 
    2222    'MASS_DENSITY', 
    23     'NEUTRON_WAVELENGTH', 
     23    'WAVELENGTH', 
    2424    'NEUTRON_SLD_REAL', 
    2525    'NEUTRON_SLD_IMAG', 
    26     'XRAY_WAVELENGTH', 
    27     'XRAY_SLD_REAL', 
    28     'XRAY_SLD_IMAG', 
     26    'CU_KA_SLD_REAL', 
     27    'CU_KA_SLD_IMAG', 
     28    'MO_KA_SLD_REAL', 
     29    'MO_KA_SLD_IMAG', 
    2930    'NEUTRON_INC_XS', 
    3031    'NEUTRON_ABS_XS', 
    … …  
    3334 
    3435class SldResult(object): 
    35     def __init__(self, molecular_formula, mass_density, 
    36         neutron_wavelength, neutron_sld_real, neutron_sld_imag, 
    37         xray_wavelength, xray_sld_real, xray_sld_imag, 
     36    def __init__(self, molecular_formula, mass_density, wavelength, 
     37        neutron_sld_real, neutron_sld_imag, 
     38        cu_ka_sld_real, cu_ka_sld_imag, 
     39        mo_ka_sld_real, mo_ka_sld_imag, 
    3840        neutron_inc_xs, neutron_abs_xs, neutron_length): 
    3941 
    4042        self.molecular_formula = molecular_formula 
    4143        self.mass_density = mass_density 
    42         self.neutron_wavelength = neutron_wavelength 
     44        self.wavelength = wavelength 
    4345        self.neutron_sld_real = neutron_sld_real 
    4446        self.neutron_sld_imag = neutron_sld_imag 
    45         self.xray_wavelength = xray_wavelength 
    46         self.xray_sld_real = xray_sld_real 
    47         self.xray_sld_imag = xray_sld_imag 
     47        self.cu_ka_sld_real = cu_ka_sld_real 
     48        self.cu_ka_sld_imag = cu_ka_sld_imag 
     49        self.mo_ka_sld_real = mo_ka_sld_real 
     50        self.mo_ka_sld_imag = mo_ka_sld_imag 
    4851        self.neutron_inc_xs = neutron_inc_xs 
    4952        self.neutron_abs_xs = neutron_abs_xs 
    5053        self.neutron_length = neutron_length 
    5154 
    52 def sldAlgorithm(molecular_formula, mass_density, neutron_wavelength, xray_wavelength): 
    53  
    54     xray_sld_real, xray_sld_imag = xray_sld( 
    55             compound=molecular_formula, 
     55def sldAlgorithm(molecular_formula, mass_density, wavelength): 
     56 
     57    sld_formula = Formula(molecular_formula, density=mass_density) 
     58 
     59    def calculate_sld(formula): 
     60        if len(formula.atoms) != 1: 
     61            raise NotImplementedError() 
     62        energy = xray_energy(list(formula.atoms.keys())[0].K_alpha) 
     63        return xray_sld_from_atoms( 
     64            sld_formula.atoms, 
    5665            density=mass_density, 
    57             wavelength=xray_wavelength) 
    58  
    59     (neutron_sld_real, neutron_sld_imag, _), (_, neutron_abs_xs, neutron_inc_xs), neutron_length = \ 
     66            energy=energy) 
     67 
     68    cu_real, cu_imag = calculate_sld(Formula("Cu")) 
     69    mo_real, mo_imag = calculate_sld(Formula("Mo")) 
     70 
     71    (sld_real, sld_imag, _), (_, neutron_abs_xs, neutron_inc_xs), neutron_length = \ 
    6072        neutron_scattering( 
    6173            compound=molecular_formula, 
    6274            density=mass_density, 
    63             wavelength=neutron_wavelength) 
     75            wavelength=wavelength) 
    6476 
    6577    SCALE = 1e-6 
    6678 
    6779    # neutron sld 
    68     scaled_neutron_sld_real = SCALE * neutron_sld_real 
    69     scaled_neutron_sld_imag = SCALE * abs(neutron_sld_imag) 
    70  
    71     # xray sld 
    72     scaled_xray_sld_real = SCALE * xray_sld_real 
    73     scaled_xray_sld_imag = SCALE * abs(xray_sld_imag) 
    74  
     80    neutron_sld_real = SCALE * sld_real 
     81    neutron_sld_imag = SCALE * abs(sld_imag) 
     82 
     83    # Cu sld 
     84    cu_ka_sld_real = SCALE * cu_real 
     85    cu_ka_sld_imag = SCALE * abs(cu_imag) 
     86 
     87    # Mo sld 
     88    mo_ka_sld_real = SCALE * mo_real 
     89    mo_ka_sld_imag = SCALE * abs(mo_imag) 
    7590 
    7691    return SldResult( 
    77         molecular_formula, mass_density, 
    78         neutron_wavelength, scaled_neutron_sld_real, scaled_neutron_sld_imag, 
    79         xray_wavelength, scaled_xray_sld_real, scaled_xray_sld_imag, 
     92        molecular_formula, mass_density, wavelength, 
     93        neutron_sld_real, neutron_sld_imag, 
     94        cu_ka_sld_real, cu_ka_sld_imag, 
     95        mo_ka_sld_real, mo_ka_sld_imag, 
    8096        neutron_inc_xs, neutron_abs_xs, neutron_length) 
    8197 
    … …  
    96112            MODEL.NEUTRON_SLD_REAL: self.ui.editNeutronSldReal, 
    97113            MODEL.NEUTRON_SLD_IMAG: self.ui.editNeutronSldImag, 
    98             MODEL.XRAY_SLD_REAL: self.ui.editXraySldReal, 
    99             MODEL.XRAY_SLD_IMAG: self.ui.editXraySldImag, 
     114            MODEL.CU_KA_SLD_REAL: self.ui.editCuKaSldReal, 
     115            MODEL.CU_KA_SLD_IMAG: self.ui.editCuKaSldImag, 
     116            MODEL.MO_KA_SLD_REAL: self.ui.editMoKaSldReal, 
     117            MODEL.MO_KA_SLD_IMAG: self.ui.editMoKaSldImag, 
    100118            MODEL.NEUTRON_INC_XS: self.ui.editNeutronIncXs, 
    101119            MODEL.NEUTRON_ABS_XS: self.ui.editNeutronAbsXs, 
    … …  
    113131        rx = QtCore.QRegExp("[+\-]?(?:0|[1-9]\d*)(?:\.\d*)?(?:[eE][+\-]?\d+)?") 
    114132        self.ui.editMassDensity.setValidator(QtGui.QRegExpValidator(rx, self.ui.editMassDensity)) 
    115         self.ui.editNeutronWavelength.setValidator(QtGui.QRegExpValidator(rx, self.ui.editNeutronWavelength)) 
    116         self.ui.editXrayWavelength.setValidator(QtGui.QRegExpValidator(rx, self.ui.editXrayWavelength)) 
     133        self.ui.editWavelength.setValidator(QtGui.QRegExpValidator(rx, self.ui.editWavelength)) 
    117134 
    118135        # signals 
    119         self.ui.helpButton.clicked.connect(self.displayHelp) 
    120         self.ui.closeButton.clicked.connect(self.closePanel) 
    121         self.ui.recalculateButton.clicked.connect(self.calculateSLD) 
    122  
    123     def calculateSLD(self): 
    124         self.recalculateSLD() 
     136        self.ui.buttonBox.button(QtWidgets.QDialogButtonBox.Reset).clicked.connect(self.modelReset) 
     137        self.ui.buttonBox.button(QtWidgets.QDialogButtonBox.Help).clicked.connect(self.displayHelp) 
    125138 
    126139    def setupModel(self): 
    127140        self.model = QtGui.QStandardItemModel(self) 
    128         self.model.setItem(MODEL.MOLECULAR_FORMULA , QtGui.QStandardItem()) 
    129         self.model.setItem(MODEL.MASS_DENSITY      , QtGui.QStandardItem()) 
    130         self.model.setItem(MODEL.NEUTRON_WAVELENGTH, QtGui.QStandardItem()) 
    131         self.model.setItem(MODEL.XRAY_WAVELENGTH   , QtGui.QStandardItem()) 
     141        self.model.setItem(MODEL.MOLECULAR_FORMULA, QtGui.QStandardItem()) 
     142        self.model.setItem(MODEL.MASS_DENSITY     , QtGui.QStandardItem()) 
     143        self.model.setItem(MODEL.WAVELENGTH       , QtGui.QStandardItem()) 
    132144 
    133145        for key in list(self._getOutputs().keys()): 
    … …  
    135147 
    136148        self.model.dataChanged.connect(self.dataChanged) 
    137  
    138         self.ui.editMassDensity.textEdited.connect(self.recalculateSLD) 
    139         self.ui.editMolecularFormula.textEdited.connect(self.recalculateSLD) 
    140         self.ui.editNeutronWavelength.textEdited.connect(self.recalculateSLD) 
    141         self.ui.editXrayWavelength.textEdited.connect(self.recalculateSLD) 
    142149 
    143150        self.modelReset() 
    … …  
    147154        self.mapper.setModel(self.model) 
    148155        self.mapper.setOrientation(QtCore.Qt.Vertical) 
    149         self.mapper.addMapping(self.ui.editMolecularFormula , MODEL.MOLECULAR_FORMULA) 
    150         self.mapper.addMapping(self.ui.editMassDensity      , MODEL.MASS_DENSITY) 
    151         self.mapper.addMapping(self.ui.editNeutronWavelength, MODEL.NEUTRON_WAVELENGTH) 
    152         self.mapper.addMapping(self.ui.editXrayWavelength   , MODEL.XRAY_WAVELENGTH) 
     156        self.mapper.addMapping(self.ui.editMolecularFormula, MODEL.MOLECULAR_FORMULA) 
     157        self.mapper.addMapping(self.ui.editMassDensity     , MODEL.MASS_DENSITY) 
     158        self.mapper.addMapping(self.ui.editWavelength      , MODEL.WAVELENGTH) 
    153159 
    154160        for key, edit in self._getOutputs().items(): 
    … …  
    160166        update = False 
    161167        for index in range(top.row(), bottom.row() + 1): 
    162             if (index == MODEL.MOLECULAR_FORMULA) or (index == MODEL.MASS_DENSITY) or (index == MODEL.NEUTRON_WAVELENGTH) or (index == MODEL.XRAY_WAVELENGTH): 
     168            if (index == MODEL.MOLECULAR_FORMULA) or (index == MODEL.MASS_DENSITY) or (index == MODEL.WAVELENGTH): 
    163169                update = True 
    164170 
    165         # calculation 
     171        # calcualtion 
    166172        if update: 
    167             self.recalculateSLD() 
    168  
    169     def recalculateSLD(self): 
    170         formula = self.ui.editMolecularFormula.text() 
    171         density = self.ui.editMassDensity.text() 
    172         neutronWavelength = self.ui.editNeutronWavelength.text() 
    173         xrayWavelength = self.ui.editXrayWavelength.text() 
    174  
    175         if len(formula) > 0 and len(density) > 0 and len(neutronWavelength) > 0 and len(xrayWavelength) > 0: 
    176             try: 
    177                 results = sldAlgorithm(str(formula), float(density), float(neutronWavelength), float(xrayWavelength)) 
    178  
    179                 def format(value): 
    180                     return ("%-5.3g" % value).strip() 
    181  
    182                 self.model.item(MODEL.NEUTRON_SLD_REAL).setText(format(results.neutron_sld_real)) 
    183                 self.model.item(MODEL.NEUTRON_SLD_IMAG).setText(format(results.neutron_sld_imag)) 
    184  
    185                 self.model.item(MODEL.XRAY_SLD_REAL).setText(format(results.xray_sld_real)) 
    186                 self.model.item(MODEL.XRAY_SLD_IMAG).setText(format(results.xray_sld_imag)) 
    187  
    188                 self.model.item(MODEL.NEUTRON_INC_XS).setText(format(results.neutron_inc_xs)) 
    189                 self.model.item(MODEL.NEUTRON_ABS_XS).setText(format(results.neutron_abs_xs)) 
    190                 self.model.item(MODEL.NEUTRON_LENGTH).setText(format(results.neutron_length)) 
    191  
    192                 return 
    193  
    194             except Exception as e: 
    195                 pass 
    196  
    197         for key in list(self._getOutputs().keys()): 
    198             self.model.item(key).setText("") 
     173            formula = self.model.item(MODEL.MOLECULAR_FORMULA).text() 
     174            density = self.model.item(MODEL.MASS_DENSITY).text() 
     175            wavelength = self.model.item(MODEL.WAVELENGTH).text() 
     176            if len(formula) > 0 and len(density) > 0 and len(wavelength) > 0: 
     177                try: 
     178                    results = sldAlgorithm(str(formula), float(density), float(wavelength)) 
     179 
     180                    def format(value): 
     181                        return ("%-5.3g" % value).strip() 
     182 
     183                    self.model.item(MODEL.NEUTRON_SLD_REAL).setText(format(results.neutron_sld_real)) 
     184                    self.model.item(MODEL.NEUTRON_SLD_IMAG).setText(format(results.neutron_sld_imag)) 
     185 
     186                    self.model.item(MODEL.CU_KA_SLD_REAL).setText(format(results.cu_ka_sld_real)) 
     187                    self.model.item(MODEL.CU_KA_SLD_IMAG).setText(format(results.cu_ka_sld_imag)) 
     188 
     189                    self.model.item(MODEL.MO_KA_SLD_REAL).setText(format(results.mo_ka_sld_real)) 
     190                    self.model.item(MODEL.MO_KA_SLD_IMAG).setText(format(results.mo_ka_sld_imag)) 
     191 
     192                    self.model.item(MODEL.NEUTRON_INC_XS).setText(format(results.neutron_inc_xs)) 
     193                    self.model.item(MODEL.NEUTRON_ABS_XS).setText(format(results.neutron_abs_xs)) 
     194                    self.model.item(MODEL.NEUTRON_LENGTH).setText(format(results.neutron_length)) 
     195 
     196                    return 
     197             
     198                except Exception as e: 
     199                    pass 
     200 
     201            for key in list(self._getOutputs().keys()): 
     202                self.model.item(key).setText("") 
    199203 
    200204    def modelReset(self): 
    201205        #self.model.beginResetModel() 
    202206        try: 
    203             self.model.item(MODEL.MOLECULAR_FORMULA ).setText("H2O") 
    204             self.model.item(MODEL.MASS_DENSITY      ).setText("1.0") 
    205             self.model.item(MODEL.NEUTRON_WAVELENGTH).setText("6.0") 
    206             self.model.item(MODEL.XRAY_WAVELENGTH   ).setText("1.0") 
    207             self.recalculateSLD() 
     207            self.model.item(MODEL.MOLECULAR_FORMULA).setText("H2O") 
     208            self.model.item(MODEL.MASS_DENSITY     ).setText("1") 
     209            self.model.item(MODEL.WAVELENGTH       ).setText("6") 
    208210        finally: 
    209211            pass 
    … …  
    215217 
    216218 
    217     def closePanel(self): 
    218         """ 
    219         close the window containing this panel 
    220         """ 
    221         self.close() 
    222  

  • src/sas/qtgui/Calculators/UI/SldPanel.ui

    r5c0e717 rcd2cc745  
    77    <x>0</x> 
    88    <y>0</y> 
    9     <width>490</width> 
    10     <height>490</height> 
     9    <width>447</width> 
     10    <height>403</height> 
    1111   </rect> 
    1212  </property> 
    … …  
    2525  </property> 
    2626  <layout class="QGridLayout" name="gridLayout_2"> 
    27    <item row="3" column="0"> 
    28     <spacer name="verticalSpacer"> 
    29      <property name="orientation"> 
    30       <enum>Qt::Vertical</enum> 
    31      </property> 
    32      <property name="sizeHint" stdset="0"> 
    33       <size> 
    34        <width>20</width> 
    35        <height>40</height> 
    36       </size> 
    37      </property> 
    38     </spacer> 
    39    </item> 
    40    <item row="4" column="0"> 
    41     <widget class="QWidget" name="widget" native="true"> 
    42      <property name="minimumSize"> 
    43       <size> 
    44        <width>466</width> 
    45        <height>32</height> 
    46       </size> 
    47      </property> 
    48      <widget class="QPushButton" name="recalculateButton"> 
    49       <property name="geometry"> 
    50        <rect> 
    51         <x>0</x> 
    52         <y>0</y> 
    53         <width>114</width> 
    54         <height>32</height> 
    55        </rect> 
    56       </property> 
    57       <property name="text"> 
    58        <string>Recalculate</string> 
    59       </property> 
    60      </widget> 
    61      <widget class="QPushButton" name="helpButton"> 
    62       <property name="geometry"> 
    63        <rect> 
    64         <x>176</x> 
    65         <y>0</y> 
    66         <width>114</width> 
    67         <height>32</height> 
    68        </rect> 
    69       </property> 
    70       <property name="text"> 
    71        <string>Help</string> 
    72       </property> 
    73      </widget> 
    74      <widget class="QPushButton" name="closeButton"> 
    75       <property name="geometry"> 
    76        <rect> 
    77         <x>352</x> 
    78         <y>0</y> 
    79         <width>114</width> 
    80         <height>32</height> 
    81        </rect> 
    82       </property> 
    83       <property name="text"> 
    84        <string>Close</string> 
    85       </property> 
    86      </widget> 
    87     </widget> 
    88    </item> 
    8927   <item row="0" column="0"> 
    9028    <widget class="QGroupBox" name="groupBoxInput"> 
    … …  
    12058       <widget class="QLineEdit" name="editMassDensity"/> 
    12159      </item> 
     60      <item row="2" column="1"> 
     61       <widget class="QLineEdit" name="editWavelength"> 
     62        <property name="styleSheet"> 
     63         <string notr="true"/> 
     64        </property> 
     65        <property name="readOnly"> 
     66         <bool>false</bool> 
     67        </property> 
     68       </widget> 
     69      </item> 
    12270      <item row="2" column="2"> 
    12371       <widget class="QLabel" name="label_12"> 
    … …  
    13886       <widget class="QLabel" name="label_11"> 
    13987        <property name="text"> 
    140          <string>Neutron Wavelength</string> 
    141         </property> 
    142        </widget> 
    143       </item> 
    144       <item row="2" column="1"> 
    145        <widget class="QLineEdit" name="editNeutronWavelength"> 
    146         <property name="styleSheet"> 
    147          <string notr="true"/> 
    148         </property> 
    149         <property name="readOnly"> 
    150          <bool>false</bool> 
    151         </property> 
    152        </widget> 
    153       </item> 
    154       <item row="3" column="1"> 
    155        <widget class="QLineEdit" name="editXrayWavelength"/> 
    156       </item> 
    157       <item row="3" column="0"> 
    158        <widget class="QLabel" name="label_13"> 
    159         <property name="text"> 
    160          <string>X-Ray Wavelength</string> 
    161         </property> 
    162        </widget> 
    163       </item> 
    164       <item row="3" column="2"> 
    165        <widget class="QLabel" name="label"> 
    166         <property name="text"> 
    167          <string>à
    168 </string> 
     88         <string>Wavelength</string> 
    16989        </property> 
    17090       </widget> 
    … …  
    17999     </property> 
    180100     <layout class="QGridLayout" name="gridLayoutOutput"> 
     101      <item row="0" column="0"> 
     102       <widget class="QLabel" name="label_17"> 
     103        <property name="text"> 
     104         <string>Neutron SLD</string> 
     105        </property> 
     106       </widget> 
     107      </item> 
    181108      <item row="0" column="1"> 
    182109       <widget class="QLineEdit" name="editNeutronSldReal"> 
    183         <property name="enabled"> 
    184          <bool>false</bool> 
    185         </property> 
    186         <property name="readOnly"> 
    187          <bool>true</bool> 
    188         </property> 
    189        </widget> 
    190       </item> 
    191       <item row="0" column="0"> 
    192        <widget class="QLabel" name="label_17"> 
    193         <property name="text"> 
    194          <string>Neutron SLD</string> 
    195         </property> 
    196        </widget> 
    197       </item> 
    198       <item row="5" column="0"> 
    199        <widget class="QLabel" name="label_3"> 
    200         <property name="text"> 
    201          <string>Neutron 1/e length</string> 
    202         </property> 
    203        </widget> 
    204       </item> 
    205       <item row="3" column="1"> 
    206        <widget class="QLineEdit" name="editNeutronIncXs"> 
    207         <property name="enabled"> 
    208          <bool>false</bool> 
    209         </property> 
    210         <property name="readOnly"> 
    211          <bool>true</bool> 
    212         </property> 
    213        </widget> 
    214       </item> 
    215       <item row="3" column="0"> 
    216        <widget class="QLabel" name="label_21"> 
    217         <property name="text"> 
    218          <string>Neutron Inc. Xs</string> 
     110        <property name="readOnly"> 
     111         <bool>true</bool> 
    219112        </property> 
    220113       </widget> 
    … …  
    227120       </widget> 
    228121      </item> 
     122      <item row="0" column="3"> 
     123       <widget class="QLineEdit" name="editNeutronSldImag"> 
     124        <property name="readOnly"> 
     125         <bool>true</bool> 
     126        </property> 
     127       </widget> 
     128      </item> 
     129      <item row="0" column="4"> 
     130       <widget class="QLabel" name="label_5"> 
     131        <property name="text"> 
     132         <string>1/à
     133²</string> 
     134        </property> 
     135       </widget> 
     136      </item> 
     137      <item row="1" column="0"> 
     138       <widget class="QLabel" name="label_19"> 
     139        <property name="text"> 
     140         <string>Cu Ka SLD</string> 
     141        </property> 
     142       </widget> 
     143      </item> 
     144      <item row="1" column="1"> 
     145       <widget class="QLineEdit" name="editCuKaSldReal"> 
     146        <property name="styleSheet"> 
     147         <string notr="true"/> 
     148        </property> 
     149        <property name="readOnly"> 
     150         <bool>true</bool> 
     151        </property> 
     152       </widget> 
     153      </item> 
    229154      <item row="1" column="2"> 
    230155       <widget class="QLabel" name="label_20"> 
    … …  
    234159       </widget> 
    235160      </item> 
    236       <item row="0" column="3"> 
    237        <widget class="QLineEdit" name="editNeutronSldImag"> 
    238         <property name="enabled"> 
    239          <bool>false</bool> 
    240         </property> 
    241         <property name="readOnly"> 
    242          <bool>true</bool> 
    243         </property> 
    244        </widget> 
    245       </item> 
    246       <item row="5" column="2" colspan="2"> 
    247        <widget class="QLabel" name="label_4"> 
    248         <property name="text"> 
    249          <string>cm</string> 
    250         </property> 
    251        </widget> 
    252       </item> 
    253       <item row="5" column="1"> 
    254        <widget class="QLineEdit" name="editNeutronLength"> 
    255         <property name="enabled"> 
    256          <bool>false</bool> 
    257         </property> 
    258         <property name="readOnly"> 
    259          <bool>true</bool> 
    260         </property> 
    261        </widget> 
    262       </item> 
    263       <item row="4" column="2" colspan="2"> 
    264        <widget class="QLabel" name="label_24"> 
    265         <property name="text"> 
    266          <string>1/cm</string> 
    267         </property> 
    268        </widget> 
    269       </item> 
    270       <item row="4" column="1"> 
    271        <widget class="QLineEdit" name="editNeutronAbsXs"> 
    272         <property name="enabled"> 
    273          <bool>false</bool> 
    274         </property> 
    275         <property name="readOnly"> 
    276          <bool>true</bool> 
    277         </property> 
    278        </widget> 
    279       </item> 
    280       <item row="4" column="0"> 
    281        <widget class="QLabel" name="label_23"> 
    282         <property name="text"> 
    283          <string>Neutron Abs. Xs</string> 
    284         </property> 
    285        </widget> 
    286       </item> 
    287       <item row="3" column="2" colspan="2"> 
    288        <widget class="QLabel" name="label_22"> 
    289         <property name="text"> 
    290          <string>1/cm</string> 
     161      <item row="1" column="3"> 
     162       <widget class="QLineEdit" name="editCuKaSldImag"> 
     163        <property name="readOnly"> 
     164         <bool>true</bool> 
    291165        </property> 
    292166       </widget> 
    … …  
    300174       </widget> 
    301175      </item> 
    302       <item row="1" column="0"> 
    303        <widget class="QLabel" name="label_19"> 
    304         <property name="text"> 
    305          <string>X-Ray SLD</string> 
    306         </property> 
    307        </widget> 
    308       </item> 
    309       <item row="0" column="4"> 
    310        <widget class="QLabel" name="label_5"> 
     176      <item row="2" column="0"> 
     177       <widget class="QLabel" name="label"> 
     178        <property name="text"> 
     179         <string>Mo Ka SLD</string> 
     180        </property> 
     181       </widget> 
     182      </item> 
     183      <item row="2" column="1"> 
     184       <widget class="QLineEdit" name="editMoKaSldReal"> 
     185        <property name="readOnly"> 
     186         <bool>true</bool> 
     187        </property> 
     188       </widget> 
     189      </item> 
     190      <item row="2" column="2"> 
     191       <widget class="QLabel" name="label_2"> 
     192        <property name="text"> 
     193         <string>-i</string> 
     194        </property> 
     195       </widget> 
     196      </item> 
     197      <item row="2" column="3"> 
     198       <widget class="QLineEdit" name="editMoKaSldImag"> 
     199        <property name="readOnly"> 
     200         <bool>true</bool> 
     201        </property> 
     202       </widget> 
     203      </item> 
     204      <item row="2" column="4"> 
     205       <widget class="QLabel" name="label_7"> 
    311206        <property name="text"> 
    312207         <string>1/à
    … …  
    315210       </widget> 
    316211      </item> 
    317       <item row="2" column="0" colspan="5"> 
     212      <item row="3" column="0" colspan="5"> 
    318213       <widget class="QFrame" name="frame"> 
    319214        <property name="minimumSize"> 
    … …  
    337232       </widget> 
    338233      </item> 
    339       <item row="1" column="1"> 
    340        <widget class="QLineEdit" name="editXraySldReal"> 
    341         <property name="enabled"> 
    342          <bool>false</bool> 
    343         </property> 
    344         <property name="readOnly"> 
    345          <bool>true</bool> 
    346         </property> 
    347        </widget> 
    348       </item> 
    349       <item row="1" column="3"> 
    350        <widget class="QLineEdit" name="editXraySldImag"> 
    351         <property name="enabled"> 
    352          <bool>false</bool> 
    353         </property> 
    354         <property name="readOnly"> 
    355          <bool>true</bool> 
     234      <item row="4" column="0"> 
     235       <widget class="QLabel" name="label_21"> 
     236        <property name="text"> 
     237         <string>Neutron Inc. Xs</string> 
     238        </property> 
     239       </widget> 
     240      </item> 
     241      <item row="4" column="1"> 
     242       <widget class="QLineEdit" name="editNeutronIncXs"> 
     243        <property name="readOnly"> 
     244         <bool>true</bool> 
     245        </property> 
     246       </widget> 
     247      </item> 
     248      <item row="4" column="2" colspan="2"> 
     249       <widget class="QLabel" name="label_22"> 
     250        <property name="text"> 
     251         <string>1/cm</string> 
     252        </property> 
     253       </widget> 
     254      </item> 
     255      <item row="5" column="0"> 
     256       <widget class="QLabel" name="label_23"> 
     257        <property name="text"> 
     258         <string>Neutron Abs. Xs</string> 
     259        </property> 
     260       </widget> 
     261      </item> 
     262      <item row="5" column="1"> 
     263       <widget class="QLineEdit" name="editNeutronAbsXs"> 
     264        <property name="readOnly"> 
     265         <bool>true</bool> 
     266        </property> 
     267       </widget> 
     268      </item> 
     269      <item row="5" column="2" colspan="2"> 
     270       <widget class="QLabel" name="label_24"> 
     271        <property name="text"> 
     272         <string>1/cm</string> 
     273        </property> 
     274       </widget> 
     275      </item> 
     276      <item row="6" column="0"> 
     277       <widget class="QLabel" name="label_3"> 
     278        <property name="text"> 
     279         <string>Neutron 1/e length</string> 
     280        </property> 
     281       </widget> 
     282      </item> 
     283      <item row="6" column="1"> 
     284       <widget class="QLineEdit" name="editNeutronLength"> 
     285        <property name="readOnly"> 
     286         <bool>true</bool> 
     287        </property> 
     288       </widget> 
     289      </item> 
     290      <item row="6" column="2" colspan="2"> 
     291       <widget class="QLabel" name="label_4"> 
     292        <property name="text"> 
     293         <string>cm</string> 
    356294        </property> 
    357295       </widget> 
    358296      </item> 
    359297     </layout> 
     298    </widget> 
     299   </item> 
     300   <item row="2" column="0"> 
     301    <spacer name="verticalSpacer"> 
     302     <property name="orientation"> 
     303      <enum>Qt::Vertical</enum> 
     304     </property> 
     305     <property name="sizeHint" stdset="0"> 
     306      <size> 
     307       <width>20</width> 
     308       <height>40</height> 
     309      </size> 
     310     </property> 
     311    </spacer> 
     312   </item> 
     313   <item row="3" column="0"> 
     314    <widget class="QDialogButtonBox" name="buttonBox"> 
     315     <property name="orientation"> 
     316      <enum>Qt::Horizontal</enum> 
     317     </property> 
     318     <property name="standardButtons"> 
     319      <set>QDialogButtonBox::Close|QDialogButtonBox::Help|QDialogButtonBox::Reset</set> 
     320     </property> 
     321     <property name="centerButtons"> 
     322      <bool>true</bool> 
     323     </property> 
    360324    </widget> 
    361325   </item> 
    … …  
    365329  <tabstop>editMolecularFormula</tabstop> 
    366330  <tabstop>editMassDensity</tabstop> 
    367   <tabstop>editNeutronWavelength</tabstop> 
     331  <tabstop>editWavelength</tabstop> 
    368332  <tabstop>editNeutronSldReal</tabstop> 
    369333  <tabstop>editNeutronSldImag</tabstop> 
     334  <tabstop>editCuKaSldReal</tabstop> 
     335  <tabstop>editCuKaSldImag</tabstop> 
     336  <tabstop>editMoKaSldReal</tabstop> 
     337  <tabstop>editMoKaSldImag</tabstop> 
    370338  <tabstop>editNeutronIncXs</tabstop> 
    371339  <tabstop>editNeutronAbsXs</tabstop> 
    372340  <tabstop>editNeutronLength</tabstop> 
     341  <tabstop>buttonBox</tabstop> 
    373342 </tabstops> 
    374343 <resources/> 
    375  <connections/> 
     344 <connections> 
     345  <connection> 
     346   <sender>buttonBox</sender> 
     347   <signal>accepted()</signal> 
     348   <receiver>SldPanel</receiver> 
     349   <slot>accept()</slot> 
     350   <hints> 
     351    <hint type="sourcelabel"> 
     352     <x>248</x> 
     353     <y>254</y> 
     354    </hint> 
     355    <hint type="destinationlabel"> 
     356     <x>157</x> 
     357     <y>274</y> 
     358    </hint> 
     359   </hints> 
     360  </connection> 
     361  <connection> 
     362   <sender>buttonBox</sender> 
     363   <signal>rejected()</signal> 
     364   <receiver>SldPanel</receiver> 
     365   <slot>reject()</slot> 
     366   <hints> 
     367    <hint type="sourcelabel"> 
     368     <x>316</x> 
     369     <y>260</y> 
     370    </hint> 
     371    <hint type="destinationlabel"> 
     372     <x>286</x> 
     373     <y>274</y> 
     374    </hint> 
     375   </hints> 
     376  </connection> 
     377 </connections> 
    376378</ui> 

  • src/sas/qtgui/MainWindow/DataExplorer.py

    r6b50296 ra24eacf  
    394394        # Notify the GuiManager about the send request 
    395395        self._perspective().setData(data_item=selected_items, is_batch=self.chkBatch.isChecked()) 
    396  
    397     def freezeCheckedData(self): 
    398         """ 
    399         Convert checked results (fitted model, residuals) into separate dataset. 
    400         """ 
    401         outer_index = -1 
    402         theories_copied = 0 
    403         orig_model_size = self.model.rowCount() 
    404         while outer_index < orig_model_size: 
    405             outer_index += 1 
    406             outer_item = self.model.item(outer_index) 
    407             if not outer_item: 
    408                 continue 
    409             if not outer_item.isCheckable(): 
    410                 continue 
    411             # Look for checked inner items 
    412             inner_index = -1 
    413             while inner_index < outer_item.rowCount(): 
    414                inner_item = outer_item.child(inner_index) 
    415                inner_index += 1 
    416                if not inner_item: 
    417                    continue 
    418                if not inner_item.isCheckable(): 
    419                    continue 
    420                if inner_item.checkState() != QtCore.Qt.Checked: 
    421                    continue 
    422                self.model.beginResetModel() 
    423                theories_copied += 1 
    424                new_item = self.cloneTheory(inner_item) 
    425                self.model.appendRow(new_item) 
    426                self.model.endResetModel() 
    427  
    428         freeze_msg = "" 
    429         if theories_copied == 0: 
    430             return 
    431         elif theories_copied == 1: 
    432             freeze_msg = "1 theory copied to a separate data set" 
    433         elif theories_copied > 1: 
    434             freeze_msg = "%i theories copied to separate data sets" % theories_copied 
    435         else: 
    436             freeze_msg = "Unexpected number of theories copied: %i" % theories_copied 
    437             raise AttributeError(freeze_msg) 
    438         self.communicator.statusBarUpdateSignal.emit(freeze_msg) 
    439396 
    440397    def freezeTheory(self, event): 

  • src/sas/qtgui/MainWindow/GuiManager.py

    r6b50296 raa1db44  
    438438        self._workspace.actionImage_Viewer.triggered.connect(self.actionImage_Viewer) 
    439439        self._workspace.actionOrientation_Viewer.triggered.connect(self.actionOrientation_Viewer) 
    440         self._workspace.actionFreeze_Theory.triggered.connect(self.actionFreeze_Theory) 
    441440        # Fitting 
    442441        self._workspace.actionNew_Fit_Page.triggered.connect(self.actionNew_Fit_Page) 
    … …  
    684683        self._workspace.addDockWidget(Qt.RightDockWidgetArea, self.ipDockWidget) 
    685684 
    686     def actionFreeze_Theory(self): 
    687         """ 
    688         Convert a child index with data into a separate top level dataset 
    689         """ 
    690         self.filesWidget.freezeCheckedData() 
    691  
    692685    def actionOrientation_Viewer(self): 
    693686        """ 

  • src/sas/qtgui/MainWindow/UI/MainWindowUI.ui

    r6b50296 raa1db44  
    6464    <addaction name="actionReport"/> 
    6565    <addaction name="actionReset"/> 
    66     <addaction name="separator"/> 
    67     <addaction name="actionFreeze_Theory"/> 
    6866   </widget> 
    6967   <widget class="QMenu" name="menuView"> 
    … …  
    537535   </property> 
    538536  </action> 
    539   <action name="actionFreeze_Theory"> 
    540    <property name="text"> 
    541     <string>Freeze Theory</string> 
    542    </property> 
    543   </action> 
    544537 </widget> 
    545538 <resources/> 

  • src/sas/qtgui/Perspectives/Fitting/FittingUtilities.py

    rf6c19cf rff3b293  
    430430 
    431431    theory_name = str(current_data.name.split()[0]) 
    432     res_name = reference_data.filename if reference_data.filename else reference_data.name 
    433     residuals.name = "Residuals for " + str(theory_name) + "[" + res_name + "]" 
     432    residuals.name = "Residuals for " + str(theory_name) + "[" + \ 
     433                    str(reference_data.filename) + "]" 
    434434    residuals.title = residuals.name 
    435435    residuals.ytransform = 'y' 

  • src/sas/qtgui/Perspectives/Fitting/FittingWidget.py

    r5aad7a5 r6dbff18  
    267267        self.has_magnet_error_column = False 
    268268 
    269         # If the widget generated theory item, save it 
    270         self.theory_item = None 
    271  
    272269        # signal communicator 
    273270        self.communicate = self.parent.communicate 
    … …  
    392389        # Tag along functionality 
    393390        self.label.setText("Data loaded from: ") 
    394         if self.logic.data.filename: 
    395             self.lblFilename.setText(self.logic.data.filename) 
    396         else: 
    397             self.lblFilename.setText(self.logic.data.name) 
     391        self.lblFilename.setText(self.logic.data.filename) 
    398392        self.updateQRange() 
    399393        # Switch off Data2D control 
    … …  
    958952        model = self.cbModel.currentText() 
    959953 
    960         # Assure the control is active 
    961         if not self.cbModel.isEnabled(): 
    962             return 
    963         # Empty combobox forced to be read 
     954        # empty combobox forced to be read 
    964955        if not model: 
    965956            return 
    … …  
    11151106            self.disableModelCombo() 
    11161107            self.enableStructureCombo() 
    1117             # set the index to 0 
    1118             self.cbStructureFactor.setCurrentIndex(0) 
    1119             self.model_parameters = None 
    11201108            self._model_model.clear() 
    11211109            return 
    … …  
    11421130        model_row = item.row() 
    11431131        name_index = self._poly_model.index(model_row, 0) 
    1144         parameter_name = str(name_index.data()) # "distribution of sld" etc. 
    1145         if "istribution of" in parameter_name: 
     1132        parameter_name = str(name_index.data()).lower() # "distribution of sld" etc. 
     1133        if "distribution of" in parameter_name: 
    11461134            # just the last word 
    11471135            parameter_name = parameter_name.rsplit()[-1] 
    … …  
    20031991        """ 
    20041992        name = model_name 
    2005         kernel_module = None 
    20061993        if self.cbCategory.currentText() == CATEGORY_CUSTOM: 
    20071994            # custom kernel load requires full path 
    … …  
    20091996        try: 
    20101997            kernel_module = generate.load_kernel_module(name) 
    2011         except ModuleNotFoundError as ex: 
    2012             pass 
    2013  
    2014         if kernel_module is None: 
    2015             # mismatch between "name" attribute and actual filename. 
    2016             curr_model = self.models[model_name] 
    2017             name, _ = os.path.splitext(os.path.basename(curr_model.filename)) 
    2018             try: 
    2019                 kernel_module = generate.load_kernel_module(name) 
    2020             except ModuleNotFoundError as ex: 
    2021                 logging.error("Can't find the model "+ str(ex)) 
    2022                 return 
     1998        except ModuleNotFoundError: 
     1999            # maybe it's a recategorised custom model? 
     2000            name = os.path.join(ModelUtilities.find_plugins_dir(), model_name+".py") 
     2001            # If this rises, it's a valid problem. 
     2002            kernel_module = generate.load_kernel_module(name) 
    20232003 
    20242004        if hasattr(kernel_module, 'parameters'): 
    … …  
    22132193        name = self.nameFromData(fitted_data) 
    22142194        # Notify the GUI manager so it can create the theory model in DataExplorer 
    2215         self.theory_item = GuiUtils.createModelItemWithPlot(fitted_data, name=name) 
    2216         self.communicate.updateTheoryFromPerspectiveSignal.emit(self.theory_item) 
     2195        new_item = GuiUtils.createModelItemWithPlot(fitted_data, name=name) 
     2196        self.communicate.updateTheoryFromPerspectiveSignal.emit(new_item) 
    22172197 
    22182198    def nameFromData(self, fitted_data): 
    … …  
    23042284        residuals = self.calculateResiduals(fitted_data) 
    23052285        self.model_data = fitted_data 
    2306         new_plots = [fitted_data] 
    2307         if residuals is not None: 
    2308             new_plots.append(residuals) 
     2286 
     2287        new_plots = [fitted_data, residuals] 
    23092288 
    23102289        # Create plots for intermediate product data 
    … …  
    23242303            GuiUtils.deleteRedundantPlots(self.all_data[self.data_index], new_plots) 
    23252304 
    2326         # Update/generate plots 
    23272305        for plot in new_plots: 
    2328             self.communicate.plotUpdateSignal.emit([plot]) 
     2306            if hasattr(plot, "id") and "esidual" in plot.id: 
     2307                # TODO: fix updates to residuals plot 
     2308                pass 
     2309            elif plot is not None: 
     2310                self.communicate.plotUpdateSignal.emit([plot]) 
    23292311 
    23302312    def complete2D(self, return_data): 
    … …  
    24282410        self._poly_model.clear() 
    24292411 
    2430         parameters = self.model_parameters.form_volume_parameters 
    2431         if self.is2D: 
    2432             parameters += self.model_parameters.orientation_parameters 
    2433  
    24342412        [self.setPolyModelParameters(i, param) for i, param in \ 
    2435             enumerate(parameters) if param.polydisperse] 
    2436  
     2413            enumerate(self.model_parameters.form_volume_parameters) if param.polydisperse] 
    24372414        FittingUtilities.addPolyHeadersToModel(self._poly_model) 
    24382415 
    … …  
    28542831        if self.all_data: 
    28552832            index = self.all_data[self.data_index] 
    2856         else: 
    2857             index = self.theory_item 
    28582833        report_logic = ReportPageLogic(self, 
    28592834                                       kernel_module=self.kernel_module, 

  • src/sas/qtgui/Perspectives/Fitting/OptionsWidget.py

    rc0a3b22e re20870bc  
    127127        Callback for running the mask editor 
    128128        """ 
    129         if isinstance(self.logic.data, Data2D): 
    130             self.parent.communicate.maskEditorSignal.emit(self.logic.data) 
     129        self.parent.communicate.maskEditorSignal.emit(self.logic.data) 
     130        pass 
    131131 
    132132    def onRangeReset(self): 
    … …  
    157157        Enable/disable various UI elements based on data loaded 
    158158        """ 
    159         is2Ddata = isinstance(self.logic.data, Data2D) 
    160159        self.boxWeighting.setEnabled(True) 
    161         self.cmdMaskEdit.setEnabled(is2Ddata) 
     160        self.cmdMaskEdit.setEnabled(True) 
    162161        # Switch off txtNpts related controls 
    163162        self.txtNpts.setEnabled(False) 

  • src/sas/qtgui/Utilities/AddMultEditor.py

    r287d356 raed0532  
    1515import re 
    1616import logging 
    17 import traceback 
    18  
    1917import sas.qtgui.Utilities.GuiUtils as GuiUtils 
    2018from sasmodels.sasview_model import load_standard_models 
    … …  
    204202                                     self.cbOperator.currentText()) 
    205203 
    206         try: 
    207             success = GuiUtils.checkModel(self.plugin_filename) 
    208         except Exception as ex: 
    209             # broad exception from sasmodels 
    210             msg = "Error building model: "+ str(ex) 
    211             logging.error(msg) 
    212             #print three last lines of the stack trace 
    213             # this will point out the exact line failing 
    214             last_lines = traceback.format_exc().split('\n')[-4:] 
    215             traceback_to_show = '\n'.join(last_lines) 
    216             logging.error(traceback_to_show) 
    217  
    218             # Set the status bar message 
    219             self.parent.communicate.statusBarUpdateSignal.emit("Model check failed") 
    220             return 
     204        success = GuiUtils.checkModel(self.plugin_filename) 
    221205 
    222206        if not success: 

  • src/sas/qtgui/Utilities/ReportDialog.py

    rcb90b65 rce30949  
    7373        # Use a sensible filename default 
    7474        default_name = os.path.join(location, 'fit_report.pdf') 
    75  
    7675        kwargs = { 
    7776            'parent'   : self, 
    7877            'caption'  : 'Save Report', 
    79             # don't use 'directory' in order to remember the previous user choice 
    80             #'directory': default_name, 
     78            'directory': default_name, 
    8179            'filter'   : 'PDF file (*.pdf);;HTML file (*.html);;Text file (*.txt)', 
    8280            'options'  : QtWidgets.QFileDialog.DontUseNativeDialog} 
    … …  
    10199 
    102100        # Create files with charts 
    103         pictures = [] 
    104         if self.data_images is not None: 
    105             pictures = self.getPictures(basename) 
     101        pictures = self.getPictures(basename) 
    106102 
    107103        # self.data_html contains all images at the end of the report, in base64 form; 

  • src/sas/qtgui/Utilities/UnitTesting/ReportDialogTest.py

    rcb90b65 r144fe21  
    158158 
    159159        self.assertTrue(logging.error.called) 
    160         #logging.error.assert_called_with("Error creating pdf") 
     160        logging.error.assert_called_with("Error creating pdf: Failed") 
    161161 
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.