Changes in / [7b3f154:5c1c486] in sasview


Ignore:
Files:
5 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed

  • src/sas/sasgui/perspectives/fitting/basepage.py

    ra1b8fee rb76e65a  
    29292929            return False 
    29302930 
     2931 
     2932    def _get_copy_params_details(self): 
     2933        """ 
     2934        Combines polydisperse parameters with self.parameters so that they can 
     2935        be written to the clipboard (for Excel or LaTeX). Also returns a list of 
     2936        the names of parameters that have been fitted 
     2937 
     2938        :returns: all_params - A list of all parameters, in the format of  
     2939        self.parameters 
     2940        :returns: fitted_par_names - A list of the names of parameters that have 
     2941        been fitted 
     2942        """ 
     2943        # Names of params that are being fitted 
     2944        fitted_par_names = [param[1] for param in self.param_toFit] 
     2945        # Names of params with associated polydispersity 
     2946        disp_params = [param[1].split('.')[0] for param in self.fittable_param] 
     2947 
     2948        # Create array of all parameters 
     2949        all_params = copy.copy(self.parameters) 
     2950        for param in self.parameters: 
     2951            if param[1] in disp_params: 
     2952                # Polydisperse params aren't in self.parameters, so need adding 
     2953                # to all_params 
     2954                name = param[1] + ".width" 
     2955                index = all_params.index(param) + 1 
     2956                to_insert = [] 
     2957                if name in fitted_par_names: 
     2958                    # Param is fitted, so already has a param list in self.param_toFit 
     2959                    to_insert = self.param_toFit[fitted_par_names.index(name)] 
     2960                else: 
     2961                    # Param isn't fitted, so mockup a param list 
     2962                    to_insert = [None, name, self.model.getParam(name), None, None] 
     2963                all_params.insert(index, to_insert) 
     2964        return all_params, fitted_par_names 
     2965 
    29312966    def get_copy_excel(self): 
    29322967        """ 
    … …  
    29422977        Get the string copies of the param names and values in the tap 
    29432978        """ 
     2979        if not self.parameters: 
     2980            # Do nothing if parameters doesn't exist 
     2981            return False 
     2982 
    29442983        content = '' 
    2945  
    29462984        crlf = chr(13) + chr(10) 
    29472985        tab = chr(9) 
    29482986 
    2949         # Do it if params exist 
    2950         if self.parameters: 
    2951  
    2952             for param in self.parameters: 
    2953                 content += param[1]  # parameter name 
     2987        all_params, fitted_param_names = self._get_copy_params_details() 
     2988 
     2989        # Construct row of parameter names 
     2990        for param in all_params: 
     2991            name = param[1] # Parameter name 
     2992            content += name 
     2993            content += tab 
     2994            if name in fitted_param_names: 
     2995                # Only print errors for fitted parameters 
     2996                content += name + "_err" 
    29542997                content += tab 
    2955                 content += param[1] + "_err" 
    2956                 content += tab 
    2957  
    2958             content += crlf 
    2959  
    2960             # row of values and errors... 
    2961             for param in self.parameters: 
    2962                 content += param[2].GetValue()  # value 
    2963                 content += tab 
    2964                 content += param[4].GetValue()  # error 
    2965                 content += tab 
    2966  
    2967             return content 
    2968         else: 
    2969             return False 
     2998 
     2999        content += crlf 
     3000 
     3001        # Construct row of parameter values and errors 
     3002        for param in all_params: 
     3003            value = param[2] 
     3004            if hasattr(value, 'GetValue'): 
     3005                # param[2] is a text box 
     3006                value = value.GetValue() 
     3007            else: 
     3008                # param[2] is a float (from our self._get_copy_params_details) 
     3009                value = str(value) 
     3010            content += value 
     3011            content += tab 
     3012            if param[1] in fitted_param_names: 
     3013                # Only print errors for fitted parameters 
     3014                content += param[4].GetValue() 
     3015                content += tab  
     3016 
     3017        return content 
    29703018 
    29713019    def get_copy_latex(self): 
    … …  
    29823030        Get the string copies of the param names and values in the tap 
    29833031        """ 
     3032        if not self.parameters: 
     3033            # Do nothing if self.parameters doesn't exist 
     3034            return False 
     3035         
    29843036        content = '\\begin{table}' 
    29853037        content += '\\begin{tabular}[h]' 
    … …  
    29883040        tab = chr(9) 
    29893041 
    2990         # Do it if params exist 
    2991         if self.parameters: 
    2992  
    2993             content += '{|' 
    2994             for param in self.parameters: 
    2995                 content += 'l|l|' 
    2996             content += '}\hline' 
    2997             content += crlf 
    2998  
    2999             for index, param in enumerate(self.parameters): 
    3000                 content += param[1].replace('_', '\_')  # parameter name 
     3042        all_params, fitted_param_names = self._get_copy_params_details() 
     3043 
     3044        content += '{|' 
     3045        for param in all_params: 
     3046            content += 'l|l|' 
     3047        content += '}\hline' 
     3048        content += crlf 
     3049 
     3050        # Construct row of parameter names 
     3051        for index, param in enumerate(all_params): 
     3052            name = param[1] # Parameter name 
     3053            content += name.replace('_', '\_')  # Escape underscores 
     3054            if name in fitted_param_names: 
     3055                # Only print errors for fitted parameters 
    30013056                content += ' & ' 
    3002                 content += param[1].replace('_', '\_') + "\_err" 
    3003                 if index < len(self.parameters) - 1: 
    3004                     content += ' & ' 
    3005             content += '\\\\ \\hline' 
    3006             content += crlf 
    3007  
    3008             # row of values and errors... 
    3009             for index, param in enumerate(self.parameters): 
    3010                 content += param[2].GetValue()  # parameter value 
     3057                content += name.replace('_', '\_') + "\_err" 
     3058            if index < len(all_params) - 1: 
    30113059                content += ' & ' 
    3012                 content += param[4].GetValue()  # parameter error 
    3013                 if index < len(self.parameters) - 1: 
    3014                     content += ' & ' 
    3015             content += '\\\\ \\hline' 
    3016             content += crlf 
    3017  
    3018             content += '\\end{tabular}' 
    3019             content += '\\end{table}' 
    3020             return content 
    3021         else: 
    3022             return False 
     3060 
     3061        content += '\\\\ \\hline' 
     3062        content += crlf 
     3063 
     3064        # Construct row of values and errors 
     3065        for index, param in enumerate(all_params): 
     3066            value = param[2] 
     3067            if hasattr(value, "GetValue"): 
     3068                # value is a text box 
     3069                value = value.GetValue() 
     3070            else: 
     3071                # value is a float (from self._get_copy_params_details) 
     3072                value = str(value) 
     3073            content += value 
     3074            if param[1] in fitted_param_names: 
     3075                # Only print errors for fitted params 
     3076                content += ' & ' 
     3077                content += param[4].GetValue() 
     3078            if index < len(all_params) - 1: 
     3079                content += ' & ' 
     3080         
     3081        content += '\\\\ \\hline' 
     3082        content += crlf 
     3083        content += '\\end{tabular}' 
     3084        content += '\\end{table}' 
     3085 
     3086        return content 
    30233087 
    30243088    def set_clipboard(self, content=None): 

  • src/sas/sasgui/perspectives/fitting/fitpage.py

    r9a5097c r0b6f83c  
    289289        self.btFitHelp.SetToolTipString("General fitting help.") 
    290290        self.btFitHelp.Bind(wx.EVT_BUTTON, self._onFitHelp) 
    291          
     291 
    292292        # Resolution Smearing Help button (for now use same technique as 
    293293        # used for dI help to get tiniest possible button that works 
    … …  
    303303        self.btSmearHelp.SetToolTipString("Resolution smearing help.") 
    304304        self.btSmearHelp.Bind(wx.EVT_BUTTON, self._onSmearHelp) 
    305          
     305 
    306306        # textcntrl for custom resolution 
    307307        self.smear_pinhole_percent = ModelTextCtrl(self, wx.ID_ANY, 
    … …  
    564564        sizer.Add(self.draw_button, 0, 0) 
    565565        sizer.Add((-1, 5)) 
    566          
     566 
    567567        sizer.Add(self.tcChi, 0, 0) 
    568568        sizer.Add(self.Npts_fit, 0, 0) 
    … …  
    570570        sizer.Add(self.btFit, 0, 0) 
    571571        sizer.Add(self.btFitHelp, 0, 0) 
    572          
     572 
    573573        boxsizer_range.Add(sizer_chi2) 
    574574        boxsizer_range.Add(sizer) 
    … …  
    21812181        self.save_current_state() 
    21822182 
     2183        if not self.is_mac: 
     2184            self.Layout() 
     2185            self.Refresh() 
    21832186        # plot model ( when drawing, do not update chisqr value again) 
    21842187        self._draw_model(update_chisqr=False, source='fit') 
    … …  
    27752778            else: 
    27762779                return cmp(a.lower(), b.lower()) 
    2777          
     2780 
    27782781        # keys obtained now from ordered dict, so commenting alphabetical 
    27792782        # ordering keys.sort(custom_compare) 

  • src/sas/sasgui/perspectives/fitting/fitpanel.py

    r67b0a99 r6f9abd3  
    501501            if data is None: 
    502502                return None 
     503        focused_page = self.GetPage(self.GetSelection()) 
    503504        for page in self.opened_pages.values(): 
    504505            # check if the selected data existing in the fitpanel 
    505506            pos = self.GetPageIndex(page) 
    506507            if not check_data_validity(page.get_data()) and not page.batch_on: 
     508                if page.model is not None and page != focused_page: 
     509                    # Page has an active theory and is in background - don't 
     510                    # send data here. 
     511                    continue 
    507512                # make sure data get placed in 1D empty tab if data is 1D 
    508513                # else data get place on 2D tab empty tab 

  • src/sas/sasgui/perspectives/fitting/fitting.py

    r2d9526d r2d9526d  
    13261326 
    13271327                is_data2d = issubclass(data.__class__, Data2D) 
    1328                 #check consistency of arrays 
     1328                # Check consistency of arrays 
    13291329                if not is_data2d: 
    13301330                    if len(res.theory) == len(res.index[res.index]) and \ 
    … …  
    13371337                    new_theory[res.index == False] = np.nan 
    13381338                    correct_result = True 
    1339                 #get all fittable parameters of the current model 
     1339                # Get all fittable parameters of the current model 
    13401340                param_list = model.getParamList() 
    13411341                for param in model.getDispParamList(): 
    1342                     if not model.is_fittable(param) and \ 
     1342                    if '.' in param and param in param_list: 
     1343                        # Ensure polydispersity results are displayed 
     1344                        p1, p2 = param.split('.') 
     1345                        if not model.is_fittable(p1) and not (p2 == 'width' and param in res.param_list)\ 
     1346                            and param in param_list: 
     1347                            param_list.remove(param) 
     1348                    elif not model.is_fittable(param) and \ 
    13431349                        param in param_list: 
    13441350                        param_list.remove(param) 
    … …  
    13611367                    batch_outputs["Chi2"].append(ERROR) 
    13621368                    for param in param_list: 
    1363                         # save value of  fixed parameters 
     1369                        # Save value of  fixed parameters 
    13641370                        if param not in res.param_list: 
    13651371                            batch_outputs[str(param)].append(ERROR) 
    13661372                        else: 
    1367                             #save only fitted values 
     1373                            # Save only fitted values 
    13681374                            batch_outputs[param].append(ERROR) 
    13691375                            batch_inputs["error on %s" % str(param)].append(ERROR) 

  • test/corfunc/test/utest_corfunc.py

    r253eb6c6 r968d67e  
    1717            upperq=(0.15, 0.24)) 
    1818        self.extrapolation = None 
     19        self.transformation = None 
    1920 
    2021    def extrapolate(self): 
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.