Changeset 3694eab3 in sasview for src/sas/sasgui


Ignore:
Timestamp:
Mar 21, 2016 10:30:34 AM (9 years ago)
Author:
krzywon
Branches:
master, ESS_GUI, ESS_GUI_Docs, ESS_GUI_batch_fitting, ESS_GUI_bumps_abstraction, ESS_GUI_iss1116, ESS_GUI_iss879, ESS_GUI_iss959, ESS_GUI_opencl, ESS_GUI_ordering, ESS_GUI_sync_sascalc, costrafo411, magnetic_scatt, release-4.1.1, release-4.1.2, release-4.2.2, release_4.0.1, ticket-1009, ticket-1094-headless, ticket-1242-2d-resolution, ticket-1243, ticket-1249, ticket885, unittest-saveload
Children:
3404554
Parents:
08959b8 (diff), 0adfe2e (diff)
Note: this is a merge changeset, the changes displayed below correspond to the merge itself.
Use the (diff) links above to see all the changes relative to each parent.
Message:

Merge branch 'master' of ​https://github.com/SasView/sasview

Location:
src/sas/sasgui/perspectives
Files:
3 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed

  • src/sas/sasgui/perspectives/calculator/model_editor.py

    r5876f7e rcf92b1f  
    745745        self.param_sizer.AddMany([(param_txt, 0, wx.LEFT, 10), 
    746746                                  (self.param_tcl, 1, wx.EXPAND | wx.ALL, 10)]) 
     747         
     748        # Parameters with polydispersity 
     749        pd_param_txt = wx.StaticText(self, -1, 'Fit Parameters requiring polydispersity (if any): ') 
     750 
     751        pd_param_tip = "#Set the parameters and initial values.\n" 
     752        pd_param_tip += "#Example:\n" 
     753        pd_param_tip += "C = 2\nD = 2" 
     754        newid = wx.NewId() 
     755        self.pd_param_tcl = EditWindow(self, newid, wx.DefaultPosition, 
     756                                    wx.DefaultSize, 
     757                                    wx.CLIP_CHILDREN | wx.SUNKEN_BORDER) 
     758        self.pd_param_tcl.setDisplayLineNumbers(True) 
     759        self.pd_param_tcl.SetToolTipString(pd_param_tip) 
     760         
     761        self.param_sizer.AddMany([(pd_param_txt, 0, wx.LEFT, 10), 
     762                                  (self.pd_param_tcl, 1, wx.EXPAND | wx.ALL, 10)]) 
    747763 
    748764    def _layout_function(self): 
    … …  
    946962            description = self.desc_tcl.GetValue() 
    947963            param_str = self.param_tcl.GetText() 
     964            pd_param_str = self.pd_param_tcl.GetText() 
    948965            func_str = self.function_tcl.GetText() 
    949966            # No input for the model function 
    950967            if func_str.lstrip().rstrip(): 
    951968                if func_str.count('return') > 0: 
    952                     self.write_file(self.fname, description, param_str, 
    953                                     func_str) 
    954                     tr_msg = _compile_file(self.fname) 
    955                     msg = str(tr_msg.__str__()) 
    956                     # Compile error 
    957                     if msg: 
    958                         msg.replace("  ", "\n") 
    959                         msg += "\nCompiling Failed" 
    960                         try: 
    961                             # try to remove pyc file if exists 
    962                             _delete_file(self.fname) 
    963                             _delete_file(self.fname + "c") 
    964                         except: 
    965                             pass 
     969                    self.write_file(self.fname, name, description, param_str, 
     970                                    pd_param_str, func_str) 
     971                    # Modified compiling test, as it will fail for sasmodels.sasview_model class 
     972                    # Should add a test to check that the class is correctly built  
     973                    # by sasview_model.make_class_from_file? 
     974#                    try:  
     975#                        tr_msg = _compile_file(self.fname) 
     976#                        msg = str(tr_msg.__str__()) 
     977#                        # Compile error 
     978#                        if msg: 
     979#                            msg.replace("  ", "\n") 
     980#                            msg += "\nCompiling Failed" 
     981#                            try: 
     982#                                # try to remove pyc file if exists 
     983#                                _delete_file(self.fname) 
     984#                                _delete_file(self.fname + "c") 
     985#                            except: 
     986#                                pass 
     987#                    except: 
     988#                        pass 
    966989                else: 
    967990                    msg = "Error: The func(x) must 'return' a value at least.\n" 
    … …  
    971994        else: 
    972995            msg = "Name exists already." 
     996 
    973997        # Prepare the messagebox 
    974998        if self.base != None and not msg: 
    975999            self.base.update_custom_combo() 
     1000            # Passed exception in import test as it will fail for sasmodels.sasview_model class 
     1001            # Should add similar test for new style? 
    9761002            Model = None 
    9771003            try: 
    9781004                exec "from %s import Model" % name 
    9791005            except: 
    980                 msg = 'new model fails to import in python' 
    981                 try: 
    982                     # try to remove pyc file if exists 
    983                     _delete_file(self.fname + "c") 
    984                 except: 
    985                     pass 
    986         if self.base != None and not msg: 
    987             try: 
    988                 Model().run(0.01) 
    989             except: 
    990                 msg = "new model fails on run method:" 
    991                 _, value, _ = sys.exc_info() 
    992                 msg += "in %s:\n%s\n" % (name, value) 
    993                 try: 
    994                     # try to remove pyc file if exists 
    995                     _delete_file(self.fname + "c") 
    996                 except: 
    997                     pass 
     1006                pass 
     1007#            except: 
     1008#                msg = 'new model fails to import in python' 
     1009#                try: 
     1010#                    # try to remove pyc file if exists 
     1011#                    _delete_file(self.fname + "c") 
     1012#                except: 
     1013#                    pass 
     1014# 
     1015# And also need to test if model runs             
     1016#        if self.base != None and not msg: 
     1017#            try: 
     1018#                Model().run(0.01) 
     1019#            except: 
     1020#                msg = "new model fails on run method:" 
     1021#                _, value, _ = sys.exc_info() 
     1022#                msg += "in %s:\n%s\n" % (name, value) 
     1023#                try: 
     1024#                    # try to remove pyc file if exists 
     1025#                    _delete_file(self.fname + "c") 
     1026#                except: 
     1027#                    pass 
    9981028        # Prepare the messagebox 
    9991029        if msg: 
    … …  
    10141044        self.warning = msg 
    10151045 
    1016  
    1017     def write_file(self, fname, desc_str, param_str, func_str): 
     1046    def write_file(self, fname, name, desc_str, param_str, pd_param_str, func_str): 
    10181047        """ 
    10191048        Write content in file 
    … …  
    10221051        :param desc_str: content of the description strings 
    10231052        :param param_str: content of params; Strings 
     1053        :param pd_param_str: content of params requiring polydispersity; Strings 
    10241054        :param func_str: content of func; Strings 
    10251055        """ 
    … …  
    10321062 
    10331063        has_scipy = func_str.count("scipy.") 
    1034         self.is_2d = func_str.count("#self.ndim = 2") 
    1035         line_2d = '' 
    1036         if self.is_2d: 
    1037             line_2d = CUSTOM_2D_TEMP.split('\n') 
    1038         line_test = TEST_TEMPLATE.split('\n') 
    1039         local_params = '' 
    1040         spaces = '        '#8spaces 
     1064        if has_scipy: 
     1065            lines.insert(0, 'import scipy') 
     1066         
     1067        # Think about 2D later         
     1068        #self.is_2d = func_str.count("#self.ndim = 2") 
     1069        #line_2d = '' 
     1070        #if self.is_2d: 
     1071        #    line_2d = CUSTOM_2D_TEMP.split('\n') 
     1072         
     1073        # Also think about test later         
     1074        #line_test = TEST_TEMPLATE.split('\n') 
     1075        #local_params = '' 
     1076        #spaces = '        '#8spaces 
     1077        spaces4  = ' '*4 
     1078        spaces13 = ' '*13 
     1079        spaces16 = ' '*16      
     1080        param_names = []    # to store parameter names 
     1081        has_scipy = func_str.count("scipy.") 
     1082        if has_scipy: 
     1083            lines.insert(0, 'import scipy') 
     1084 
    10411085        # write function here 
    10421086        for line in lines: 
    10431087            # The location where to put the strings is 
    10441088            # hard-coded in the template as shown below. 
    1045             if line.count("#self.params here"): 
     1089            out_f.write(line + '\n') 
     1090            if line.count('#name'): 
     1091                out_f.write('name = "%s" \n' % name)                
     1092            elif line.count('#title'): 
     1093                out_f.write('title = "User model for %s"\n' % name)                
     1094            elif line.count('#description'): 
     1095                out_f.write('description = "%s"\n' % desc_str)                
     1096            elif line.count('#parameters'): 
     1097                out_f.write('parameters = [ \n') 
    10461098                for param_line in param_str.split('\n'): 
    10471099                    p_line = param_line.lstrip().rstrip() 
    10481100                    if p_line: 
    1049                         p0_line = self.set_param_helper(p_line) 
    1050                         local_params += self.set_function_helper(p_line) 
    1051                         out_f.write(p0_line) 
    1052             elif line.count("#local params here"): 
    1053                 if local_params: 
    1054                     out_f.write(local_params) 
    1055             elif line.count("self.description = "): 
    1056                 des0 = self.name + "\\n" 
    1057                 desc = str(desc_str.lstrip().rstrip().replace('\"', '')) 
    1058                 out_f.write(line % (des0 + desc) + "\n") 
    1059             elif line.count("def function(self, x=0.0%s):"): 
    1060                 if self.is_2d: 
    1061                     y_str = ', y=0.0' 
    1062                     out_f.write(line % y_str + "\n") 
    1063                 else: 
    1064                     out_f.write(line % '' + "\n") 
    1065             elif line.count("#function here"): 
    1066                 for func_line in func_str.split('\n'): 
    1067                     f_line = func_line.rstrip() 
    1068                     if f_line: 
    1069                         out_f.write(spaces + f_line + "\n") 
    1070                 if not func_str: 
    1071                     dep_var = 'y' 
    1072                     if self.is_2d: 
    1073                         dep_var = 'z' 
    1074                     out_f.write(spaces + 'return %s' % dep_var + "\n") 
    1075             elif line.count("#import scipy?"): 
    1076                 if has_scipy: 
    1077                     out_f.write("import scipy" + "\n") 
    1078             #elif line.count("name = "): 
    1079             #    out_f.write(line % self.name + "\n") 
    1080             elif line: 
    1081                 out_f.write(line + "\n") 
    1082         # run string for 2d 
    1083         if line_2d: 
    1084             for line in line_2d: 
    1085                 out_f.write(line + "\n") 
    1086         # Test strins 
    1087         for line in line_test: 
    1088             out_f.write(line + "\n") 
     1101                        pname, pvalue = self.get_param_helper(p_line) 
     1102                        param_names.append(pname) 
     1103                        out_f.write("%s['%s', '', %s, [-numpy.inf, numpy.inf], '', ''],\n" % (spaces16, pname, pvalue)) 
     1104                for param_line in pd_param_str.split('\n'): 
     1105                    p_line = param_line.lstrip().rstrip() 
     1106                    if p_line: 
     1107                        pname, pvalue = self.get_param_helper(p_line) 
     1108                        param_names.append(pname) 
     1109                        out_f.write("%s['%s', '', %s, [-numpy.inf, numpy.inf], 'volume', ''],\n" % (spaces16, pname, pvalue)) 
     1110                out_f.write('%s]\n' % spaces13) 
     1111             
     1112        # No form_volume or ER available in simple model editor 
     1113        out_f.write('def form_volume(*arg): \n') 
     1114        out_f.write('    return 1.0 \n') 
     1115        out_f.write('\n') 
     1116        out_f.write('def ER(*arg): \n') 
     1117        out_f.write('    return 1.0 \n') 
     1118         
     1119        # function to compute 
     1120        out_f.write('\n') 
     1121        out_f.write('def Iq(x ') 
     1122        for name in param_names: 
     1123            out_f.write(', %s' % name) 
     1124        out_f.write('):\n') 
     1125        for func_line in func_str.split('\n'): 
     1126            out_f.write('%s%s\n' % (spaces4, func_line)) 
     1127         
     1128        Iqxy_string = 'return Iq(numpy.sqrt(x**2+y**2) ' 
     1129             
     1130        out_f.write('\n') 
     1131        out_f.write('def Iqxy(x, y ') 
     1132        for name in param_names: 
     1133            out_f.write(', %s' % name) 
     1134            Iqxy_string += ', ' + name 
     1135        out_f.write('):\n') 
     1136        Iqxy_string += ')' 
     1137        out_f.write('%s%s\n' % (spaces4, Iqxy_string)) 
    10891138 
    10901139        out_f.close() 
    10911140 
    1092     def set_param_helper(self, line): 
     1141    def get_param_helper(self, line): 
    10931142        """ 
    10941143        Get string in line to define the params dictionary 
    … …  
    10961145        :param line: one line of string got from the param_str 
    10971146        """ 
    1098         params_str = '' 
    1099         spaces = '        '#8spaces 
    11001147        items = line.split(";") 
    11011148        for item in items: 
    … …  
    11061153            except: 
    11071154                value = 1.0 # default 
    1108             params_str += spaces + "self.params['%s'] = %s\n" % (name, value) 
    1109  
    1110         return params_str 
     1155 
     1156        return name, value 
    11111157 
    11121158    def set_function_helper(self, line): 
    … …  
    11851231 
    11861232## Templates for custom models 
     1233#CUSTOM_TEMPLATE = """ 
     1234#from sas.models.pluginmodel import Model1DPlugin 
     1235#from math import * 
     1236#import os 
     1237#import sys 
     1238#import numpy 
     1239##import scipy? 
     1240#class Model(Model1DPlugin): 
     1241#    name = "" 
     1242#    def __init__(self): 
     1243#        Model1DPlugin.__init__(self, name=self.name) 
     1244#        #set name same as file name 
     1245#        self.name = self.get_fname() 
     1246#        #self.params here 
     1247#        self.description = "%s" 
     1248#        self.set_details() 
     1249#    def function(self, x=0.0%s): 
     1250#        #local params here 
     1251#        #function here 
     1252#""" 
     1253 
    11871254CUSTOM_TEMPLATE = """ 
    1188 from sas.models.pluginmodel import Model1DPlugin 
    11891255from math import * 
    11901256import os 
    11911257import sys 
    11921258import numpy 
    1193 #import scipy? 
    1194 class Model(Model1DPlugin): 
    1195     name = "" 
    1196     def __init__(self): 
    1197         Model1DPlugin.__init__(self, name=self.name) 
    1198         #set name same as file name 
    1199         self.name = self.get_fname() 
    1200         #self.params here 
    1201         self.description = "%s" 
    1202         self.set_details() 
    1203     def function(self, x=0.0%s): 
    1204         #local params here 
    1205         #function here 
     1259 
     1260#name  
     1261 
     1262#title 
     1263 
     1264#description 
     1265 
     1266#parameters  
     1267 
    12061268""" 
     1269 
    12071270CUSTOM_2D_TEMP = """ 
    12081271    def run(self, x=0.0, y=0.0): 

  • src/sas/sasgui/perspectives/fitting/basepage.py

    reb04d59 r08959b8  
    21462146 
    21472147        if  struct_factor != None: 
    2148             from sas.models.MultiplicationModel import MultiplicationModel 
     2148            from sas.sascalc.fit.MultiplicationModel import MultiplicationModel 
    21492149            self.model = MultiplicationModel(form_factor, struct_factor()) 
    21502150            # multifunctional form factor 

  • src/sas/sasgui/perspectives/fitting/models.py

    r9e531f2 r08959b8  
    384384        """ 
    385385        if int(evt.GetId()) in self.form_factor_dict.keys(): 
    386             from sas.models.MultiplicationModel import MultiplicationModel 
     386            from sas.sascalc.fit.MultiplicationModel import MultiplicationModel 
    387387            self.model_dictionary[MultiplicationModel.__name__] = MultiplicationModel 
    388388            model1, model2 = self.form_factor_dict[int(evt.GetId())] 
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.