Changeset 0b99881 in sasview


Ignore:
Timestamp:
Mar 6, 2009 5:06:30 PM (16 years ago)
Author:
Gervaise Alina <gervyh@…>
Branches:
master, ESS_GUI, ESS_GUI_Docs, ESS_GUI_batch_fitting, ESS_GUI_bumps_abstraction, ESS_GUI_iss1116, ESS_GUI_iss879, ESS_GUI_iss959, ESS_GUI_opencl, ESS_GUI_ordering, ESS_GUI_sync_sascalc, costrafo411, magnetic_scatt, release-4.1.1, release-4.1.2, release-4.2.2, release_4.0.1, ticket-1009, ticket-1094-headless, ticket-1242-2d-resolution, ticket-1243, ticket-1249, ticket885, unittest-saveload
Children:
fbc3e04
Parents:
19ef1e5
Message:

working opn refactoring files

Location:
sansview/perspectives/fitting
Files:
2 added
3 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed

  • sansview/perspectives/fitting/fitpage1D.py

    r76dab10 r0b99881  
    1818class FitPage1D(ModelPage): 
    1919    """ 
    20         FitPanel class contains fields allowing to display results when 
    21         fitting  a model and one data 
     20        FitPage1D class contains fields allowing to display results when 
     21        fitting  a model and one data. 
     22        This class used most of the methods of ModelPage class. 
    2223        @note: For Fit to be performed the user should check at least one parameter 
    2324        on fit Panel window. 
    … …  
    3031    name=None 
    3132     
    32     def __init__(self, parent,data, *args, **kwargs): 
    33         wx.ScrolledWindow.__init__(self, parent, *args, **kwargs) 
    34          
     33    def __init__(self, parent,data,model=None, name=None, *args, **kwargs): 
    3534        """  
    3635            Initialization of the Panel 
    3736        """ 
     37        ModelPage.__init__(self, parent,model,name,data,*args, **kwargs) 
     38        
    3839        #TODO: remove this once the inheritence is cleaned up 
    3940        ## Data member to store the dispersion object created 
    40         self._disp_obj_dict = {} 
    41  
    42         #Data used for fitting  
    43         self.data = data 
    44         # flag to allow data2D plot 
    45         self.enable2D=False 
    46         #fit page manager  
    47         self.manager = None 
    48         #Store the parent of this panel parent 
    49         # For this application fitpanel is the parent 
    50         self.parent  = parent 
    51         # Event_owner is the owner of model event 
    52         self.event_owner = None 
     41         
     42     
     43         
     44    def draw_panel(self): 
    5345        #panel interface 
    5446        self.vbox  = wx.BoxSizer(wx.VERTICAL) 
    … …  
    8779        #---------sizer 1 draw-------------------------------- 
    8880        #Filling the sizer containing data related fields 
    89         self.DataSource  =wx.StaticText(self, -1,str(data.name)) 
     81        self.DataSource  =wx.StaticText(self, -1,str(self.data.name)) 
    9082        ix = 0 
    9183        iy = 1 
    … …  
    10193            iy = 1 
    10294            # Minimum value of data    
    103             self.data_min    = wx.StaticText(self, -1,str(format_number(numpy.min(data.x)))) 
     95            self.data_min = wx.StaticText(self, -1,str(format_number(numpy.min(self.data.x)))) 
    10496            # Maximum value of data   
    105             self.data_max    =  wx.StaticText(self, -1,str(format_number(numpy.max(data.x))))    
     97            self.data_max =  wx.StaticText(self, -1,str(format_number(numpy.max(self.data.x))))    
    10698            self.text4_3 = wx.StaticText(self, -1, 'Maximum Data Range(Linear)', style=wx.ALIGN_LEFT) 
    10799            self.sizer2.Add(self.text4_3,(iy,ix),(1,1),\ 
    … …  
    160152        self.disable_disp = wx.RadioButton(self, -1, 'No', (10, 10), style=wx.RB_GROUP) 
    161153        self.enable_disp = wx.RadioButton(self, -1, 'Yes', (10, 30)) 
    162         self.Bind(wx.EVT_RADIOBUTTON, self.Set_DipersParam, id=self.disable_disp.GetId()) 
    163         self.Bind(wx.EVT_RADIOBUTTON, self.Set_DipersParam, id=self.enable_disp.GetId()) 
     154        self.Bind(wx.EVT_RADIOBUTTON, self.set_Dispers_Param, id=self.disable_disp.GetId()) 
     155        self.Bind(wx.EVT_RADIOBUTTON, self.set_Dispers_Param, id=self.enable_disp.GetId()) 
    164156        ix= 0 
    165157        iy=1 
    … …  
    247239        iy+=1  
    248240        self.sizer9.Add((20,20),(iy,ix),(1,1), wx.LEFT|wx.EXPAND|wx.ADJUST_MINSIZE, 0) 
    249          
    250         # Contains link between  model ,all its parameters, and panel organization 
    251         self.parameters=[] 
    252         # Contains list of parameters that cannot be fitted and reference to  
    253         #panel objects  
    254         self.fixed_param=[] 
    255         # Contains list of parameters with dispersity and reference to  
    256         #panel objects  
    257         self.fittable_param=[] 
    258         #list of dispersion paramaters 
    259         self.disp_list=[] 
    260         #contains link between a model and selected parameters to fit  
    261         self.param_toFit=[] 
    262         # model on which the fit would be performed 
    263         self.model=None 
    264          
    265         self.back_up_model= None 
    266         #dictionary of model name and model class 
    267         self.model_list_box={}     
    268                       
    269         if self.model == None: 
    270             self.qmin.Disable() 
    271             self.qmax.Disable()  
    272         else: 
    273             self.qmin.Enable() 
    274             self.qmax.Enable()  
    275  
     241        
    276242     
    277243        self.vbox.Layout() 
    … …  
    280246        self.SetScrollbars(20,20,55,40) 
    281247         
    282         self.Centre() 
    283         self.Layout() 
    284         self.GrandParent.GetSizer().Layout() 
    285     
    286248    def compute_chisqr2D(self): 
    287249        """  
    … …  
    298260                    for j in range(len(self.data.y_bins)): 
    299261                        #Check the range containing data between self.qmin_x and self.qmax_x 
    300                         if math.pow(self.data.x_bins[i],2)+math.pow(self.data.y_bins[j],2)>=math.pow(self.qmin_x,2): 
    301                             if math.pow(self.data.x_bins[i],2)+math.pow(self.data.y_bins[j],2)<=math.pow(self.qmax_x,2): 
    302                                 chisqrji=(self.data.data[j][i]- self.model.runXY(\ 
    303                                                                                     [self.data.y_bins[j],self.data.x_bins[i]]))\ 
    304                                                                                     /self.data.err_data[j][i] 
     262                        radius = math.pow(self.data.x_bins[i],2)\ 
     263                            + math.pow(self.data.y_bins[j],2) 
     264                             
     265                        if radius >= math.pow(self.qmin_x,2): 
     266                            if radius <=math.pow(self.qmax_x,2): 
     267                                temp= self.model.runXY( [self.data.y_bins[j],self.data.x_bins[i]] ) 
     268                                chisqrji=(self.data.data[j][i]- temp)/self.data.err_data[j][i] 
    305269                                #Vector containing residuals 
    306270                                res.append( math.pow(chisqrji,2) ) 
    … …  
    312276                self.tcChi.SetLabel(format_number(math.fabs(sum/ len(res)))) 
    313277            except: 
    314                 wx.PostEvent(self.parent.GrandParent, StatusEvent(status=\ 
    315                             "Chisqr cannot be compute: %s"% sys.exc_value)) 
     278                msg= "Chisqr cannot be compute: %s"% sys.exc_value 
     279                wx.PostEvent(self.parent.GrandParent, StatusEvent(status= msg )) 
    316280                return 
    317281     
    … …  
    331295                    self.qmin_x = float(self.qmin.GetValue()) 
    332296                    self.qmax_x = float(self.qmax.GetValue()) 
    333                     # return residuals within self.qmin_x and self.qmax_x 
     297                    # Compute residuals within self.qmin_x and self.qmax_x 
    334298                    x,y,dy = [numpy.asarray(v) for v in (self.data.x,self.data.y,self.data.dy)] 
    335299                    if self.qmin_x==None and self.qmax_x==None:  
    … …  
    349313                    self.tcChi.SetLabel(format_number(math.fabs(sum/ len(res)))) 
    350314            except: 
    351                 wx.PostEvent(self.parent.GrandParent, StatusEvent(status=\ 
    352                             "Chisqr cannot be compute: %s"% sys.exc_value)) 
     315                msg=  "Chisqr cannot be compute: %s"% sys.exc_value 
     316                wx.PostEvent(self.parent.GrandParent, StatusEvent(status= msg)) 
    353317                return  
     318             
    354319             
    355320    def _on_select_model(self,event): 
    … …  
    380345             
    381346            if name ==event.GetString(): 
     347                self.model=item() 
     348                self.back_up_model= self.model.clone() 
     349                evt = ModelEventbox(model=self.model,name=name) 
     350                wx.PostEvent(self.event_owner, evt) 
    382351                try: 
    383                     self.model=item() 
    384                     self.back_up_model= self.model.clone() 
    385                     evt = ModelEventbox(model=self.model,name=name) 
    386                     wx.PostEvent(self.event_owner, evt) 
    387                     self.text1_1.Show() 
    388352                    self.compute_chisqr() 
    389353                    self.tcChi.Show() 
     354                    self.text1_1.Show() 
    390355                except: 
    391                     raise #ValueError,"model.name is not equal to model class name" 
     356                    self.text1_1.Hide() 
     357                    pass 
    392358                break   
    393              
     359                  
    394360                  
    395361    def onFit(self,event): 
    … …  
    417383            self.parent.GetSizer().Layout() 
    418384        else: 
    419             wx.PostEvent(self.parent.parent, StatusEvent(status=\ 
    420                             "Select at least one parameter to fit ")) 
     385            msg= "Select at least one parameter to fit " 
     386            wx.PostEvent(self.parent.parent, StatusEvent(status= msg )) 
    421387   
    422     
    423     def _onTextEnter(self,event): 
    424         """ 
    425             set a flag to determine if the fitting range entered by the user is valid 
    426         """ 
    427        
    428         try: 
    429             flag=self.checkFitRange() 
    430             if flag==True and self.model!=None: 
    431                 self.manager.redraw_model(float(self.xmin.GetValue())\ 
    432                                                ,float(self.xmax.GetValue())) 
    433         except: 
    434  
    435             wx.PostEvent(self.parent.GrandParent, StatusEvent(status=\ 
    436                             "Drawing  Error:wrong value entered %s"% sys.exc_value)) 
    437          
    438     
    439388     
    440389    def get_param_list(self): 
    … …  
    459408            self.compute_chisqr() 
    460409        except: 
     410            self.text1_1.Hide() 
    461411            pass 
    462412         
    … …  
    512462                if item in self.param_toFit: 
    513463                    self.param_toFit.remove(item)            
    514         #Set the value of checkbox that selected every checkbox or not             
     464        #Set the value of checkbox that selected all checkboxes or not to true or false            
    515465        if len(self.parameters)+len(self.fittable_param) ==len(self.param_toFit): 
    516466            self.cb1.SetValue(True) 

  • sansview/perspectives/fitting/fitpanel.py

    r925a30e r0b99881  
    126126        if not name in self.fit_page_name : 
    127127            from fitpage1D import FitPage1D 
    128             panel = FitPage1D(self,data, -1) 
     128            panel = FitPage1D(parent=self,data=data, id=-1) 
    129129            panel.name=name 
    130130             

  • sansview/perspectives/fitting/modelpage.py

    ra38c284 r0b99881  
    1414 
    1515 
    16  
    1716class ModelPage(wx.ScrolledWindow): 
    1817    """ 
    19         FitPanel class contains fields allowing to display results when 
    20         fitting  a model and one data 
    21         @note: For Fit to be performed the user should check at least one parameter 
    22         on fit Panel window. 
     18        ModelPage is a panel that allows the user to view information related to a  
     19        model.  
    2320   
    2421    """ 
    … …  
    2724    ## Title to appear on top of the window 
    2825    window_caption = "Fit Page" 
    29     name="" 
    30      
    31     def __init__(self, parent,model,name, *args, **kwargs): 
     26    # name of the panel directly related to the model name selected 
     27    name =" " 
     28 
     29    def __init__(self, parent,model=None,name=None,data=None, *args, **kwargs): 
    3230        wx.ScrolledWindow.__init__(self, parent, *args, **kwargs) 
    3331        """  
    … …  
    3937        ## Data member to store the dispersion object created 
    4038        self._disp_obj_dict = {} 
    41  
    42         #list of dispersion paramaters 
     39         
     40        #list of dispersion parameters 
    4341        self.disp_list=[] 
    4442        try: 
    … …  
    5149        # this panel does contain data .existing data allow a different drawing 
    5250        #on set_model parameters 
    53         self.data=None 
     51        self.data=data 
     52         
     53         
     54        # contains link between  model ,all its parameters, and panel organization 
     55        self.parameters=[] 
     56        #list of parameters that cannot be fitted and panel object related to this parameters 
     57        #values 
     58        self.fixed_param=[] 
     59        # 
     60        self.fittable_param=[] 
     61        self.polydisp= {} 
     62        #contains link between a model and selected parameters to fit  
     63        self.param_toFit=[] 
     64         
     65        self.prevmodel_name=name 
     66        self.draw_panel() 
     67        #dictionary of model name and model class 
     68        self.model_list_box={} 
     69        #Draw initial panel 
     70        if self.model!=None: 
     71            self.set_panel(self.model) 
     72        self.theta_cb=None 
     73        # flag to allow data2D plot 
     74        self.enable2D=False 
     75         
     76     
     77        self.Centre() 
     78        self.Layout() 
     79        self.parent.GetSizer().Layout() 
     80         
     81    def draw_panel(self):    
    5482        #panel interface 
    5583        self.vbox  = wx.BoxSizer(wx.VERTICAL) 
    … …  
    6290        self.sizer5 = wx.GridBagSizer(5,5) 
    6391        self.sizer4 = wx.GridBagSizer(5,5) 
    64         
    6592        #model selection 
    6693        self.vbox.Add(wx.StaticLine(self, -1), 0, wx.EXPAND, 0) 
    … …  
    79106        # plotting range 
    80107        self.vbox.Add(self.sizer9) 
    81         #close layer 
    82         #self.vbox.Add(wx.StaticLine(self, -1), 0, wx.EXPAND, 0) 
    83         #self.vbox.Add(self.sizer10) 
    84          
    85        
     108     
    86109        #------------------ sizer 4  draw------------------------   
    87         
    88         
    89110        # define combox box 
    90111        self.modelbox = wx.ComboBox(self, -1) 
    91112         # preview selected model name 
    92         self.prevmodel_name=name 
     113         
    93114        #print "model view prev_model",name 
    94115        self.modelbox.SetValue(self.prevmodel_name) 
    … …  
    121142        self.disable_disp = wx.RadioButton(self, -1, 'No', (10, 10), style=wx.RB_GROUP) 
    122143        self.enable_disp = wx.RadioButton(self, -1, 'Yes', (10, 30)) 
    123         self.Bind(wx.EVT_RADIOBUTTON, self.Set_DipersParam, id=self.disable_disp.GetId()) 
    124         self.Bind(wx.EVT_RADIOBUTTON, self.Set_DipersParam, id=self.enable_disp.GetId()) 
     144        self.Bind(wx.EVT_RADIOBUTTON, self.set_Dispers_Param, id=self.disable_disp.GetId()) 
     145        self.Bind(wx.EVT_RADIOBUTTON, self.set_Dispers_Param, id=self.enable_disp.GetId()) 
    125146        ix= 0 
    126147        iy=1 
    … …  
    134155        iy+=1 
    135156        self.sizer6.Add((20,20),(iy,ix),(1,1),wx.LEFT|wx.EXPAND|wx.ADJUST_MINSIZE, 15)   
    136  
    137          
    138157        #---------sizer 9 draw---------------------------------------- 
    139         
    140          ## Q range 
     158        ## Q range 
    141159        self.qmin_x= 0.001 
    142160        self.qmax_x= 0.1 
    … …  
    190208        iy+=1  
    191209        self.sizer9.Add((20,20),(iy,ix),(1,1), wx.LEFT|wx.EXPAND|wx.ADJUST_MINSIZE, 0) 
    192         #----------sizer 10 draw------------------------------------------------------ 
    193         """ 
    194         id = wx.NewId() 
    195         self.btClose =wx.Button(self,id,'Close') 
    196         self.btClose.Bind(wx.EVT_BUTTON, self.onClose,id=id) 
    197         self.btClose.SetToolTipString("Close page.") 
    198          
    199         ix= 3 
    200         iy= 1 
    201         self.sizer10.Add((20,20),(iy,ix),(1,1),wx.LEFT|wx.EXPAND|wx.ADJUST_MINSIZE, 15) 
    202         ix +=1 
    203         self.sizer10.Add( self.btClose,(iy,ix),(1,1), wx.LEFT|wx.EXPAND|wx.ADJUST_MINSIZE, 0) 
    204         ix =0 
    205         iy+=1 
    206         self.sizer10.Add((20,20),(iy,ix),(1,1),wx.LEFT|wx.EXPAND|wx.ADJUST_MINSIZE, 15) 
    207         """ 
    208         # contains link between  model ,all its parameters, and panel organization 
    209         self.parameters=[] 
    210         self.fixed_param=[] 
    211         self.fittable_param=[] 
    212         self.polydisp= {} 
    213         #contains link between a model and selected parameters to fit  
    214         self.param_toFit=[] 
    215          
    216         #dictionary of model name and model class 
    217         self.model_list_box={} 
    218         #Draw initial panel 
    219          #-----sizer 11--------------------model description------ 
    220         if self.model!=None: 
    221             self.set_panel(self.model) 
    222         self.theta_cb=None 
    223         
    224         
    225210        self.vbox.Layout() 
    226211        self.vbox.Fit(self)  
    … …  
    228213        self.SetScrollbars(20,20,55,40) 
    229214         
    230         self.Centre() 
    231         self.Layout() 
    232         self.parent.GetSizer().Layout() 
     215         
    233216    def set_model_description(self, model): 
    234          
     217        """ 
     218            Set a sizer with model description field 
     219            @param model: the model select that provides the description 
     220        """ 
    235221        if model !=None and str(model.description)!=""and self.data==None: 
    236222            self.sizer11.Clear(True) 
    … …  
    280266     
    281267 
    282     def Set_DipersParam(self, event): 
    283         """ 
    284             This method is called when the user changes the state  
    285             of the "dispersity" radio buttons. 
    286              
    287             #TODO: correct the spelling mistake in the name of this method, start name with lowercase. 
     268    def set_Dispers_Param(self, event): 
     269        """ 
     270             set a sizer with dispersion parameters  
    288271        """ 
    289272        if self.enable_disp.GetValue(): 
    … …  
    304287                return  
    305288            else: 
    306                 # Show the default dispersion/averaging sub-panel 
     289                # allow to recognize data panel from model panel 
     290                if self.data !=None and self.model !=None:  
     291                     
     292                    self.cb1.SetValue(False) 
     293                    self.select_all_param_helper() 
     294                 
    307295                self.populate_disp_box() 
    308296                self.set_panel_dispers(self.disp_list) 
    … …  
    335323             
    336324    def populate_disp_box(self): 
     325        """ 
     326            populate polydispersion combo box  
     327        """ 
    337328        self.sizer7.Clear(True) 
    338329        if len(self.disp_list)>0: 
    … …  
    381372        self.qmax.SetValue(format_number(self.qmax_x)) 
    382373        self.npts.SetValue(format_number(self.num_points)) 
     374         
     375         
    383376    def checkFitRange(self): 
    384377        """ 
    … …  
    387380            background is colored in pink. 
    388381        """ 
    389         
    390382        flag = True 
    391383        valueMin = self.qmin.GetValue() 
    392384        valueMax = self.qmax.GetValue() 
    393385        # Check for possible values entered 
    394         #print "fitpage: checkfitrange:",valueMin,valueMax 
    395386        try: 
    396387            if (float(valueMax)> float(valueMin)): 
    … …  
    410401        return flag 
    411402     
    412  
    413          
    414     def onClose(self,event): 
    415         """ close the page associated with this panel""" 
    416         self.parent.onClose() 
    417          
    418    
    419403         
    420404    def onModel2D(self, event): 
    … …  
    456440        type =event.GetString() 
    457441        self.set_panel_dispers( self.disp_list,type ) 
    458                  
     442           
     443      
    459444    def _on_select_model(self,event): 
    460445        """ 
    … …  
    547532        self.text2_3.Hide()  
    548533         
    549         
    550534        ix +=1 
    551535        self.text2_4 = wx.StaticText(self, -1, 'Units') 
    … …  
    554538        self.text2_4.Hide() 
    555539        disp_list=self.model.getDispParamList() 
     540        #  
    556541        for item in keys: 
    557542            if not item in disp_list: 
    … …  
    614599         
    615600    def _selectDlg(self): 
     601        """ 
     602            Create a dialog to select files 
     603        """ 
    616604        import os 
    617605        dlg = wx.FileDialog(self, "Choose a weight file", os.getcwd(), "", "*.*", wx.OPEN) 
    … …  
    621609        dlg.Destroy() 
    622610        return path 
     611     
     612     
    623613    def read_file(self, path): 
     614        """ 
     615            Read a file  of 2 colons 
     616            @param path: the path to the file 
     617            @return 2 numpy arrays containing numbers 
     618        """ 
    624619        try: 
    625620            if path==None: 
    … …  
    646641            return numpy.array(angles), numpy.array(weights) 
    647642        except: 
    648             raise  
     643             msg= "Simultaneous Fit completed but Following error occurred: " 
     644             msg+= "%s"%sys.exc_value 
     645             wx.PostEvent(self.parent.parent, StatusEvent(status=msg)) 
     646             return   
    649647         
    650648           
    … …  
    654652            @param event: check box event 
    655653        """ 
    656          
    657          
    658654        # Go through the list of dispersion check boxes to identify which one has changed  
    659655        for p in self.disp_cb_dict: 
    … …  
    717713                    self._draw_model() 
    718714        return 
    719  
    720                        
    721                        
     715        
    722716                       
    723717    def set_panel_dispers(self, disp_list, type="GaussianModel" ): 
    724718        """ 
     719            Fill sizer with disperstion info 
    725720        """ 
    726721         
    … …  
    843838            self.parent.GetSizer().Layout()   
    844839           
     840           
    845841    def checkFitValues(self,val_min, val_max): 
    846842        """ 
    … …  
    898894        self.set_model_parameter() 
    899895         
     896         
     897         
    900898    def set_model_parameter(self): 
    901899        """ 
     900            Value Enter by the user on the parameter fields are used to reset the model 
     901            and model will be drawn again if the user enters different values 
    902902        """ 
    903903        if len(self.parameters) !=0 and self.model !=None: 
    … …  
    915915                          
    916916                except: 
    917                     #raise 
    918917                    wx.PostEvent(self.parent.parent, StatusEvent(status=\ 
    919918                            "Model Drawing  Error:wrong value entered : %s"% sys.exc_value)) 
    … …  
    932931                          
    933932                except: 
    934                     raise 
    935933                    wx.PostEvent(self.parent.parent, StatusEvent(status=\ 
    936                             "Model Drawing  Error:wrong value entered : %s"% sys.exc_value)) 
     934                            "Model Drawing Error:wrong value entered : %s"% sys.exc_value)) 
    937935                 
    938936            for item in self.parameters: 
    … …  
    949947                    #raise  
    950948                    wx.PostEvent(self.parent.parent, StatusEvent(status=\ 
    951                            "Model Drawing  Error:wrong value entered : %s"% sys.exc_value)) 
     949                           "Model Drawing Error:wrong value entered : %s"% sys.exc_value)) 
    952950                    return 
    953951                 
    … …  
    970968                self._draw_model()             
    971969             
     970             
    972971    def _draw_model(self, name=None): 
    973972        """ 
    … …  
    986985                                enable2D=self.enable2D) 
    987986        
     987        
    988988    def select_param(self,event): 
    989989        """ 
    990          
     990            Select_parameter is implemented in fitpage.py  
    991991        """ 
    992992        pass 
     993     
     994     
    993995    def select_all_param(self,event):  
    994996        """ 
    995          
     997            Implemented in fitpage.py 
    996998        """ 
    997999        pass 
     1000     
     1001     
    9981002    def select_all_param_helper(self): 
    9991003        """ 
    1000              Allows selecting or delecting button 
     1004             Allows selecting or unselecting  checkbutton 
    10011005        """ 
    10021006        self.param_toFit=[] 
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.