source: sasview/src/sas/sasgui/perspectives/fitting/models.py @ cf8e119

ESS_GUIESS_GUI_DocsESS_GUI_batch_fittingESS_GUI_bumps_abstractionESS_GUI_iss1116ESS_GUI_iss879ESS_GUI_iss959ESS_GUI_openclESS_GUI_orderingESS_GUI_sync_sascalccostrafo411magnetic_scattrelease-4.1.1release-4.1.2release-4.2.2release_4.0.1ticket-1009ticket-1094-headlessticket-1242-2d-resolutionticket-1243ticket-1249ticket885unittest-saveload
Last change on this file since cf8e119 was cde9d7d, checked in by ajj, 9 years ago

Deal with dodgy models

  • Property mode set to 100644
File size: 15.4 KB
Line 
1"""
2    Utilities to manage models
3"""
4import wx
5import imp
6import os
7import sys
8import math
9import os.path
10# Time is needed by the log method
11import time
12import logging
13import py_compile
14import shutil
15from sas.sasgui.guiframe.events import StatusEvent
16# Explicitly import from the pluginmodel module so that py2exe
17# places it in the distribution. The Model1DPlugin class is used
18# as the base class of plug-in models.
19from sas.models.pluginmodel import Model1DPlugin
20from sas.models.BaseComponent import BaseComponent
21from sas.sasgui.guiframe.CategoryInstaller import CategoryInstaller
22from sasmodels.sasview_model import make_class
23import sasmodels.core
24
25
26PLUGIN_DIR = 'plugin_models'
27
28def get_model_python_path():
29    """
30        Returns the python path for a model
31    """
32    return os.path.dirname(__file__)
33
34
35def log(message):
36    """
37        Log a message in a file located in the user's home directory
38    """
39    dir = os.path.join(os.path.expanduser("~"), '.sasview', PLUGIN_DIR)
40    out = open(os.path.join(dir, "plugins.log"), 'a')
41    out.write("%10g%s\n" % (time.clock(), message))
42    out.close()
43
44
45def _check_plugin(model, name):
46    """
47    Do some checking before model adding plugins in the list
48
49    :param model: class model to add into the plugin list
50    :param name:name of the module plugin
51
52    :return model: model if valid model or None if not valid
53
54    """
55    #Check if the plugin is of type Model1DPlugin
56    if not issubclass(model, Model1DPlugin):
57        msg = "Plugin %s must be of type Model1DPlugin \n" % str(name)
58        log(msg)
59        return None
60    if model.__name__ != "Model":
61        msg = "Plugin %s class name must be Model \n" % str(name)
62        log(msg)
63        return None
64    try:
65        new_instance = model()
66    except:
67        msg = "Plugin %s error in __init__ \n\t: %s %s\n" % (str(name),
68                                                             str(sys.exc_type),
69                                                             sys.exc_info()[1])
70        log(msg)
71        return None
72
73    if hasattr(new_instance, "function"):
74        try:
75            value = new_instance.function()
76        except:
77            msg = "Plugin %s: error writing function \n\t :%s %s\n " % \
78                    (str(name), str(sys.exc_type), sys.exc_info()[1])
79            log(msg)
80            return None
81    else:
82        msg = "Plugin  %s needs a method called function \n" % str(name)
83        log(msg)
84        return None
85    return model
86
87
88def find_plugins_dir():
89    """
90        Find path of the plugins directory.
91        The plugin directory is located in the user's home directory.
92    """
93    dir = os.path.join(os.path.expanduser("~"), '.sasview', PLUGIN_DIR)
94
95    # If the plugin directory doesn't exist, create it
96    if not os.path.isdir(dir):
97        os.makedirs(dir)
98
99    # Find paths needed
100    try:
101        # For source
102        if os.path.isdir(os.path.dirname(__file__)):
103            p_dir = os.path.join(os.path.dirname(__file__), PLUGIN_DIR)
104        else:
105            raise
106    except:
107        # Check for data path next to exe/zip file.
108        #Look for maximum n_dir up of the current dir to find plugins dir
109        n_dir = 12
110        p_dir = None
111        f_dir = os.path.join(os.path.dirname(__file__))
112        for i in range(n_dir):
113            if i > 1:
114                f_dir, _ = os.path.split(f_dir)
115            plugin_path = os.path.join(f_dir, PLUGIN_DIR)
116            if os.path.isdir(plugin_path):
117                p_dir = plugin_path
118                break
119        if not p_dir:
120            raise
121    # Place example user models as needed
122    if os.path.isdir(p_dir):
123        for file in os.listdir(p_dir):
124            file_path = os.path.join(p_dir, file)
125            if os.path.isfile(file_path):
126                if file.split(".")[-1] == 'py' and\
127                    file.split(".")[0] != '__init__':
128                    if not os.path.isfile(os.path.join(dir, file)):
129                        shutil.copy(file_path, dir)
130
131    return dir
132
133
134class ReportProblem:
135    """
136        Class to check for problems with specific values
137    """
138    def __nonzero__(self):
139        type, value, traceback = sys.exc_info()
140        if type is not None and issubclass(type, py_compile.PyCompileError):
141            print "Problem with", repr(value)
142            raise type, value, traceback
143        return 1
144
145report_problem = ReportProblem()
146
147
148def compile_file(dir):
149    """
150    Compile a py file
151    """
152    try:
153        import compileall
154        compileall.compile_dir(dir=dir, ddir=dir, force=1,
155                               quiet=report_problem)
156    except:
157        return sys.exc_info()[1]
158    return None
159
160
161def _findModels(dir):
162    """
163    """
164    # List of plugin objects
165    plugins = {}
166    dir = find_plugins_dir()
167    # Go through files in plug-in directory
168    #always recompile the folder plugin
169    if not os.path.isdir(dir):
170        msg = "SasView couldn't locate Model plugin folder."
171        msg += """ "%s" does not exist""" % dir
172        logging.warning(msg)
173        return plugins
174    else:
175        log("looking for models in: %s" % str(dir))
176        compile_file(dir)
177        logging.info("plugin model dir: %s" % str(dir))
178    try:
179        list = os.listdir(dir)
180        for item in list:
181            toks = os.path.splitext(os.path.basename(item))
182            if toks[1] == '.py' and not toks[0] == '__init__':
183                name = toks[0]
184
185                path = [os.path.abspath(dir)]
186                file = None
187                try:
188                    (file, path, info) = imp.find_module(name, path)
189                    module = imp.load_module(name, file, item, info)
190                    if hasattr(module, "Model"):
191                        try:
192                            if _check_plugin(module.Model, name) != None:
193                                plugins[name] = module.Model
194                        except:
195                            msg = "Error accessing Model"
196                            msg += "in %s\n  %s %s\n" % (name,
197                                                         str(sys.exc_type),
198                                                         sys.exc_info()[1])
199                            log(msg)
200                except:
201                    msg = "Error accessing Model"
202                    msg += " in %s\n  %s %s \n" % (name,
203                                                   str(sys.exc_type),
204                                                   sys.exc_info()[1])
205                    log(msg)
206                finally:
207
208                    if not file == None:
209                        file.close()
210    except:
211        # Don't deal with bad plug-in imports. Just skip.
212        msg = "Could not import model plugin: %s" % sys.exc_info()[1]
213        log(msg)
214    return plugins
215
216
217class ModelList(object):
218    """
219    Contains dictionary of model and their type
220    """
221    def __init__(self):
222        """
223        """
224        self.mydict = {}
225
226    def set_list(self, name, mylist):
227        """
228        :param name: the type of the list
229        :param mylist: the list to add
230
231        """
232        if name not in self.mydict.keys():
233            self.reset_list(name, mylist)
234
235    def reset_list(self, name, mylist):
236        """
237        :param name: the type of the list
238        :param mylist: the list to add
239        """
240        self.mydict[name] = mylist
241
242    def get_list(self):
243        """
244        return all the list stored in a dictionary object
245        """
246        return self.mydict
247
248
249class ModelManagerBase:
250    """
251        Base class for the model manager
252    """
253    ## external dict for models
254    model_combobox = ModelList()
255    ## Dictionary of form factor models
256    form_factor_dict = {}
257    ## dictionary of structure factor models
258    struct_factor_dict = {}
259    ##list of structure factors
260    struct_list = []
261    ##list of model allowing multiplication by a structure factor
262    multiplication_factor = []
263    ##list of multifunctional shapes (i.e. that have user defined number of levels
264    multi_func_list = []
265    ## list of added models -- currently python models found in the plugin dir.
266    plugins = []
267    ## Event owner (guiframe)
268    event_owner = None
269    last_time_dir_modified = 0
270
271    def __init__(self):
272        """
273        """
274        self.model_dictionary = {}
275        self.stored_plugins = {}
276        self._getModelList()
277
278    def findModels(self):
279        """
280        find  plugin model in directory of plugin .recompile all file
281        in the directory if file were modified
282        """
283        temp = {}
284        if self.is_changed():
285            return  _findModels(dir)
286        logging.info("plugin model : %s" % str(temp))
287        return temp
288
289    def _getModelList(self):
290        """
291        List of models we want to make available by default
292        for this application
293
294        :return: the next free event ID following the new menu events
295
296        """
297
298        # regular model names only
299        base_message = "Unable to load model {0}"
300        self.model_name_list = []
301
302        #Build list automagically from sasmodels package
303        for mod_name in sasmodels.core.list_models():
304            try:
305                mod_def = sasmodels.core.load_model_info(mod_name)
306                self.model_dictionary[mod_def['name']] = make_class(mod_def,dtype=None,namestyle='name')
307                if mod_def['structure_factor'] == True:
308                    self.struct_list.append(self.model_dictionary[mod_def['name']])
309                if mod_def['variant_info'] is not None:
310                    self.multi_func_list.append(self.model_dictionary[mod_def['name']])
311                else:
312                    self.model_name_list.append(mod_def['name'])
313                if mod_def['ER'] is not None:
314                    self.multiplication_factor.append(self.model_dictionary[mod_def['name']])
315            except:
316                logging.info("Problem loading %s model" % mod_name)
317
318        #Looking for plugins
319        self.stored_plugins = self.findModels()
320        self.plugins = self.stored_plugins.values()
321        for name, plug in self.stored_plugins.iteritems():
322            self.model_dictionary[name] = plug
323
324        self._get_multifunc_models()
325
326        return 0
327
328    def is_changed(self):
329        """
330        check the last time the plugin dir has changed and return true
331         is the directory was modified else return false
332        """
333        is_modified = False
334        plugin_dir = find_plugins_dir()
335        if os.path.isdir(plugin_dir):
336            temp = os.path.getmtime(plugin_dir)
337            if  self.last_time_dir_modified != temp:
338                is_modified = True
339                self.last_time_dir_modified = temp
340
341        return is_modified
342
343    def update(self):
344        """
345        return a dictionary of model if
346        new models were added else return empty dictionary
347        """
348        new_plugins = self.findModels()
349        if len(new_plugins) > 0:
350            for name, plug in  new_plugins.iteritems():
351                if name not in self.stored_plugins.keys():
352                    self.stored_plugins[name] = plug
353                    self.plugins.append(plug)
354                    self.model_dictionary[name] = plug
355            self.model_combobox.set_list("Customized Models", self.plugins)
356            return self.model_combobox.get_list()
357        else:
358            return {}
359
360    def plugins_reset(self):
361        """
362        return a dictionary of model
363        """
364        self.plugins = []
365        new_plugins = _findModels(dir)
366        for name, plug in  new_plugins.iteritems():
367            for stored_name, stored_plug in self.stored_plugins.iteritems():
368                if name == stored_name:
369                    del self.stored_plugins[name]
370                    del self.model_dictionary[name]
371                    break
372            self.stored_plugins[name] = plug
373            self.plugins.append(plug)
374            self.model_dictionary[name] = plug
375
376        self.model_combobox.reset_list("Customized Models", self.plugins)
377        return self.model_combobox.get_list()
378
379    def _on_model(self, evt):
380        """
381        React to a model menu event
382
383        :param event: wx menu event
384
385        """
386        if int(evt.GetId()) in self.form_factor_dict.keys():
387            from sas.models.MultiplicationModel import MultiplicationModel
388            self.model_dictionary[MultiplicationModel.__name__] = MultiplicationModel
389            model1, model2 = self.form_factor_dict[int(evt.GetId())]
390            model = MultiplicationModel(model1, model2)
391        else:
392            model = self.struct_factor_dict[str(evt.GetId())]()
393
394
395    def _get_multifunc_models(self):
396        """
397        Get the multifunctional models
398        """
399        for item in self.plugins:
400            try:
401                # check the multiplicity if any
402                if item.multiplicity_info[0] > 1:
403                    self.multi_func_list.append(item)
404            except:
405                # pass to other items
406                pass
407
408    def get_model_list(self):
409        """
410        return dictionary of models for fitpanel use
411
412        """
413        ## Model_list now only contains attribute lists not category list.
414        ## Eventually this should be in one master list -- read in category
415        ## list then pull those models that exist and get attributes then add
416        ## to list ..and if model does not exist remove from list as now
417        ## and update json file.
418        ##
419        ## -PDB   April 26, 2014
420
421#        self.model_combobox.set_list("Shapes", self.shape_list)
422#        self.model_combobox.set_list("Shape-Independent",
423#                                     self.shape_indep_list)
424        self.model_combobox.set_list("Structure Factors", self.struct_list)
425        self.model_combobox.set_list("Customized Models", self.plugins)
426        self.model_combobox.set_list("P(Q)*S(Q)", self.multiplication_factor)
427        self.model_combobox.set_list("multiplication",
428                                     self.multiplication_factor)
429        self.model_combobox.set_list("Multi-Functions", self.multi_func_list)
430        return self.model_combobox.get_list()
431
432    def get_model_name_list(self):
433        """
434        return regular model name list
435        """
436        return self.model_name_list
437
438    def get_model_dictionary(self):
439        """
440        return dictionary linking model names to objects
441        """
442        return self.model_dictionary
443
444
445class ModelManager(object):
446    """
447    implement model
448    """
449    __modelmanager = ModelManagerBase()
450    cat_model_list = [model_name for model_name \
451                      in __modelmanager.model_dictionary.keys() \
452                      if model_name not in __modelmanager.stored_plugins.keys()]
453
454    CategoryInstaller.check_install(model_list=cat_model_list)
455    def findModels(self):
456        return self.__modelmanager.findModels()
457
458    def _getModelList(self):
459        return self.__modelmanager._getModelList()
460
461    def is_changed(self):
462        return self.__modelmanager.is_changed()
463
464    def update(self):
465        return self.__modelmanager.update()
466
467    def plugins_reset(self):
468        return self.__modelmanager.plugins_reset()
469
470    def populate_menu(self, modelmenu, event_owner):
471        return self.__modelmanager.populate_menu(modelmenu, event_owner)
472
473    def _on_model(self, evt):
474        return self.__modelmanager._on_model(evt)
475
476    def _get_multifunc_models(self):
477        return self.__modelmanager._get_multifunc_models()
478
479    def get_model_list(self):
480        return self.__modelmanager.get_model_list()
481
482    def get_model_name_list(self):
483        return self.__modelmanager.get_model_name_list()
484
485    def get_model_dictionary(self):
486        return self.__modelmanager.get_model_dictionary()
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.