source: sasview/setup.py @ 6574940a

ESS_GUIESS_GUI_DocsESS_GUI_batch_fittingESS_GUI_bumps_abstractionESS_GUI_iss1116ESS_GUI_iss879ESS_GUI_iss959ESS_GUI_openclESS_GUI_orderingESS_GUI_sync_sascalccostrafo411magnetic_scattrelease-4.1.1release-4.1.2release-4.2.2release_4.0.1ticket-1009ticket-1094-headlessticket-1242-2d-resolutionticket-1243ticket-1249ticket885unittest-saveload
Last change on this file since 6574940a was 01de557, checked in by Mathieu Doucet <doucetm@…>, 13 years ago

Re #7 Turn off openmp for gcc4.0 on mac

  • Property mode set to 100644
File size: 10.5 KB
Line 
1"""
2    Setup for SansView
3    #TODO: Add checks to see that all the dependencies are on the system
4"""
5import sys
6import os
7import platform
8#from distutils.core import setup, Extension
9from setuptools import setup, Extension, find_packages
10try:
11    from numpy.distutils.misc_util import get_numpy_include_dirs
12    NUMPY_INC = get_numpy_include_dirs()[0]
13except:
14    try:
15        import numpy
16        NUMPY_INC = os.path.join(os.path.split(numpy.__file__)[0],"core","include")
17    except:
18        print "\nNumpy is needed to build SansView. Try easy_install numpy.\n  %s" % str(sys.exc_value)
19        sys.exit(0)
20
21package_dir = {}
22package_data = {}
23packages = []
24ext_modules = []
25
26# TODO check for sans/__init__.py
27
28# Enable OpenMP
29extra_compile_args = []
30extra_link_args = []
31if sys.platform=='linux2' or (sys.platform=='darwin' and platform.architecture()[0]=='64bit'):
32    extra_compile_args = ['-fopenmp']
33    extra_link_args = ['-lgomp']
34elif os.name=='nt':
35    extra_compile_args = ['/openmp']
36
37# sans.invariant
38package_dir["sans.invariant"] = "sansinvariant/src/sans/invariant"
39packages.extend(["sans.invariant"])
40
41# sans.guiframe
42guiframe_path = os.path.join("sansguiframe", "src", "sans", "guiframe")
43package_dir["sans.guiframe"] = guiframe_path
44package_dir["sans.guiframe.local_perspectives"] = os.path.join(guiframe_path, "local_perspectives")
45package_data["sans.guiframe"] = ['images/*', 'media/*']
46packages.extend(["sans.guiframe", "sans.guiframe.local_perspectives"])
47# build local plugin
48for dir in os.listdir(os.path.join(guiframe_path, "local_perspectives")):
49    if dir not in ['.svn','__init__.py', '__init__.pyc']:
50        package_name = "sans.guiframe.local_perspectives." + dir
51        packages.append(package_name)
52        package_dir[package_name] = os.path.join(guiframe_path, "local_perspectives", dir)
53
54# sans.dataloader
55package_dir["sans.dataloader"] = os.path.join("sansdataloader", "src", "sans", "dataloader")
56package_data["sans.dataloader.readers"] = ['defaults.xml']
57packages.extend(["sans.dataloader","sans.dataloader.readers"])
58
59# sans.calculator
60package_dir["sans.calculator"] = "sanscalculator/src/sans/calculator"
61packages.extend(["sans.calculator"])
62   
63# sans.pr
64numpy_incl_path = os.path.join(NUMPY_INC, "numpy")
65srcdir  = os.path.join("pr_inversion", "src", "sans", "pr", "c_extensions")
66
67
68   
69package_dir["sans.pr.core"] = srcdir
70package_dir["sans.pr"] = os.path.join("pr_inversion", "src","sans", "pr")
71packages.extend(["sans.pr","sans.pr.core"])
72ext_modules.append( Extension("sans.pr.core.pr_inversion",
73                              sources = [ os.path.join(srcdir, "Cinvertor.c"),
74                                         os.path.join(srcdir, "invertor.c"),
75                                         ],
76                              include_dirs=[numpy_incl_path],
77                              extra_compile_args=extra_compile_args,
78                              extra_link_args=extra_link_args                             
79                              ) )
80       
81# sans.fit (park integration)
82package_dir["sans.fit"] = "park_integration/src/sans/fit"
83packages.append("sans.fit")
84
85# inversion view
86package_dir["sans.perspectives"] = "inversionview/src/sans/perspectives"
87package_dir["sans.perspectives.pr"] = "inversionview/src/sans/perspectives/pr"
88packages.extend(["sans.perspectives","sans.perspectives.pr"])
89package_data["sans.perspectives.pr"] = ['images/*']
90
91# Invariant view
92package_dir["sans.perspectives"] = os.path.join("invariantview", "src", "sans", "perspectives")
93package_dir["sans.perspectives.invariant"] = os.path.join("invariantview", "src", "sans", "perspectives", "invariant")
94               
95package_data['sans.perspectives.invariant'] = [os.path.join("media",'*')]
96packages.extend(["sans.perspectives","sans.perspectives.invariant"]) 
97
98# Fitting view
99package_dir["sans.perspectives"] = os.path.join("fittingview", "src", "sans", "perspectives"),
100package_dir["sans.perspectives.fitting"] = os.path.join("fittingview", "src", "sans", "perspectives", "fitting")
101package_data['sans.perspectives.fitting'] = ['media/*']
102packages.extend(["sans.perspectives", "sans.perspectives.fitting"])
103
104# Calculator view
105package_dir["sans.perspectives"] = "calculatorview/src/sans/perspectives"
106package_dir["sans.perspectives.calculator"] = os.path.join("calculatorview", "src", "sans", "perspectives", "calculator")
107package_data['sans.perspectives.calculator'] = ['images/*', 'media/*']
108packages.extend(["sans.perspectives", "sans.perspectives.calculator"])
109     
110# Data util
111package_dir["data_util"] = "sansutil"
112packages.extend(["data_util"])
113
114# Plottools
115package_dir["danse"] = os.path.join("plottools", "src", "danse")
116package_dir["danse.common"] = os.path.join("plottools", "src", "danse", "common")
117package_dir["danse.common.plottools"] = os.path.join("plottools", "src", "danse", "common", "plottools")
118packages.extend(["danse", "danse.common", "danse.common.plottools"])
119
120# Park 1.2.1
121package_dir["park"]="park-1.2.1/park"
122packages.extend(["park"])
123package_data["park"] = ['park-1.2.1/*.txt', 'park-1.2.1/park.epydoc']
124ext_modules.append( Extension("park._modeling",
125                              sources = [ os.path.join("park-1.2.1", "park", "lib", "modeling.cc"),
126                                         os.path.join("park-1.2.1", "park", "lib", "resolution.c"),
127                                         ],
128                              extra_compile_args=extra_compile_args,
129                              extra_link_args=extra_link_args
130                              ) )
131
132# Sans models
133srcdir  = os.path.join("sansmodels", "src", "sans", "models", "c_extensions")
134igordir = os.path.join("sansmodels", "src","sans", "models", "libigor")
135c_model_dir = os.path.join("sansmodels", "src", "sans", "models", "c_models")
136smear_dir  = os.path.join("sansmodels", "src", "sans", "models", "c_smearer")
137
138IGNORED_FILES = ["a.exe",
139                 "__init__.py"
140                 ".svn",
141                   "lineparser.py",
142                   "run.py",
143                   "CGaussian.cpp",
144                   "CLogNormal.cpp",
145                   "CLorentzian.cpp",
146                   "CSchulz.cpp",
147                   "WrapperGenerator.py",
148                   "wrapping.py"
149                   ]
150
151if not os.name=='nt':
152    IGNORED_FILES.extend(["gamma_win.c","winFuncs.c"])
153
154
155EXTENSIONS = [".c", ".cpp"]
156
157def append_file(file_list, dir_path):
158    """
159    Add sources file to sources
160    """
161    for f in os.listdir(dir_path):
162        if os.path.isfile(os.path.join(dir_path, f)):
163            _, ext = os.path.splitext(f)
164            if ext.lower() in EXTENSIONS and f not in IGNORED_FILES:
165                file_list.append(os.path.join(dir_path, f)) 
166        elif os.path.isdir(os.path.join(dir_path, f)) and \
167                not f.startswith("."):
168            sub_dir = os.path.join(dir_path, f)
169            for new_f in os.listdir(sub_dir):
170                if os.path.isfile(os.path.join(sub_dir, new_f)):
171                    _, ext = os.path.splitext(new_f)
172                    if ext.lower() in EXTENSIONS and\
173                         new_f not in IGNORED_FILES:
174                        file_list.append(os.path.join(sub_dir, new_f)) 
175       
176model_sources = []
177append_file(file_list=model_sources, dir_path=srcdir)
178append_file(file_list=model_sources, dir_path=igordir)
179append_file(file_list=model_sources, dir_path=c_model_dir)
180smear_sources = []
181append_file(file_list=smear_sources, dir_path=smear_dir)
182
183
184package_dir["sans"] = os.path.join("sansmodels", "src", "sans")
185package_dir["sans.models"] = os.path.join("sansmodels", "src", "sans", "models")
186package_dir["sans.models.sans_extension"] = srcdir
187           
188package_data['sans.models'] = [os.path.join('media', "*")]
189packages.extend(["sans","sans.models","sans.models.sans_extension"])
190   
191smearer_sources = [os.path.join(smear_dir, "smearer.cpp"),
192                  os.path.join(smear_dir, "smearer_module.cpp")]
193
194if os.name=='nt':
195    smearer_sources.append(os.path.join(igordir, "winFuncs.c"))
196
197ext_modules.extend( [ Extension("sans.models.sans_extension.c_models",
198                                sources=model_sources,                 
199                                include_dirs=[igordir, srcdir, c_model_dir, numpy_incl_path],
200                                extra_compile_args=extra_compile_args,
201                                extra_link_args=extra_link_args
202                                ),       
203                    # Smearer extension
204                    Extension("sans.models.sans_extension.smearer",
205                              sources = smearer_sources,
206                              include_dirs=[igordir, smear_dir, numpy_incl_path],
207                              extra_compile_args=extra_compile_args,
208                              extra_link_args=extra_link_args
209                              ),
210                   
211                    Extension("sans.models.sans_extension.smearer2d_helper",
212                              sources = [os.path.join(smear_dir, 
213                                                      "smearer2d_helper_module.cpp"),
214                                         os.path.join(smear_dir, "smearer2d_helper.cpp"),],
215                              include_dirs=[smear_dir,numpy_incl_path],
216                              extra_compile_args=extra_compile_args,
217                              extra_link_args=extra_link_args
218                              )
219                    ] )
220       
221# SansView
222package_dir["sans.sansview"] = "sansview"
223package_data['sans.sansview'] = ['images/*', 'media/*', 'plugins/*', 'test/*']
224packages.append("sans.sansview")
225
226#required = ['lxml>=2.2.2', 'numpy>=1.4.1', 'matplotlib>=0.99.1.1', 'wxPython>=2.8.11',
227#            'pil','periodictable>=1.3.0', 'scipy>=0.7.2']
228required = ['lxml','periodictable>=1.3.0', 'unittest-xml-reporting']
229
230if os.name=='nt':
231    #required.extend(['comtypes', 'pisa', 'html5lib', 'reportlab'])
232    required.extend(['comtypes', 'pisa', 'html5lib'])
233else:
234    required.extend(['pil'])
235   
236 # Set up SansView   
237setup(
238    name="sansview",
239    version = "2.0.1",
240    description = "SansView application",
241    author = "University of Tennessee",
242    author_email = "sansdanse@gmail.com",
243    url = "http://danse.chem.utk.edu",
244    license = "PSF",
245    keywords = "small-angle neutron scattering analysis",
246    download_url = "https://sourceforge.net/projects/sansviewproject/files/",
247    package_dir = package_dir,
248    packages = packages,
249    package_data = package_data,
250    ext_modules = ext_modules,
251    install_requires = required,
252    zip_safe = False,
253    entry_points = {
254                    'console_scripts':[
255                                       "sansview = sans.sansview.sansview:run",
256                                       ]
257                    }
258    )   
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.