source: sasview/setup.py @ e090c624

ESS_GUIESS_GUI_DocsESS_GUI_batch_fittingESS_GUI_bumps_abstractionESS_GUI_iss1116ESS_GUI_iss879ESS_GUI_iss959ESS_GUI_openclESS_GUI_orderingESS_GUI_sync_sascalccostrafo411magnetic_scattrelease-4.1.1release-4.1.2release-4.2.2release_4.0.1ticket-1009ticket-1094-headlessticket-1242-2d-resolutionticket-1243ticket-1249ticket885unittest-saveload
Last change on this file since e090c624 was eda8972, checked in by Jeff Krzywon <jeffery.krzywon@…>, 11 years ago

I will finalize this on Monday.

  • Property mode set to 100644
File size: 13.7 KB
RevLine 
[d6bc28cf]1"""
[c329f4d]2    Setup for SasView
[d6bc28cf]3    #TODO: Add checks to see that all the dependencies are on the system
4"""
[8ab3302]5import sys
[d6bc28cf]6import os
[5980b1a]7from setuptools import setup, Extension
[2cef9d3]8from distutils.command.build_ext import build_ext
9
[e13ef7f]10try:
11    from numpy.distutils.misc_util import get_numpy_include_dirs
12    NUMPY_INC = get_numpy_include_dirs()[0]
13except:
[cb5fb4a]14    try:
[e13ef7f]15        import numpy
[8ab3302]16        NUMPY_INC = os.path.join(os.path.split(numpy.__file__)[0], 
17                                 "core","include")
[cb5fb4a]18    except:
[c329f4d]19        msg = "\nNumpy is needed to build SasView. "
[8ab3302]20        print msg, "Try easy_install numpy.\n  %s" % str(sys.exc_value)
[e13ef7f]21        sys.exit(0)
[d6bc28cf]22
[5548954]23# Manage version number ######################################
[a134fc6]24import sansview
25VERSION = sansview.__version__
[5548954]26##############################################################
27
[d6bc28cf]28package_dir = {}
29package_data = {}
30packages = []
31ext_modules = []
32
[8ab3302]33# Remove all files that should be updated by this setup
34# We do this here because application updates these files from .sansview
35# except when there is no such file
36# Todo : make this list generic
37plugin_model_list = ['polynominal5.py', 'sph_bessel_jn.py', 
38                     'sum_Ap1_1_Ap2.py', 'sum_p1_p2.py', 
[b30ed8f]39                     'testmodel_2.py', 'testmodel.py',
40                     'polynominal5.pyc', 'sph_bessel_jn.pyc', 
41                     'sum_Ap1_1_Ap2.pyc', 'sum_p1_p2.pyc', 
[eb32080e]42                     'testmodel_2.pyc', 'testmodel.pyc', 'plugins.log']
[c329f4d]43sans_dir = os.path.join(os.path.expanduser("~"),'.sasview')
[8ab3302]44if os.path.isdir(sans_dir):
[c329f4d]45    f_path = os.path.join(sans_dir, "sasview.log")
[e615a0d]46    if os.path.isfile(f_path):
47        os.remove(f_path)
[ea5fa58]48    f_path = os.path.join(sans_dir, "serialized_cat.p")
49    if os.path.isfile(f_path):
50        os.remove(f_path)
[e615a0d]51    f_path = os.path.join(sans_dir, 'config', "custom_config.py")
52    if os.path.isfile(f_path):
53        os.remove(f_path)
54    f_path = os.path.join(sans_dir, 'plugin_models')
55    if os.path.isdir(f_path):
[5980b1a]56        for f in os.listdir(f_path): 
57            if f in plugin_model_list:
58                file_path =  os.path.join(f_path, f)
[e615a0d]59                os.remove(file_path)
60                   
61# 'sys.maxsize' and 64bit: Not supported for python2.5
62is_64bits = False
63if sys.version_info >= (2, 6):
64    is_64bits = sys.maxsize > 2**32
65   
66   
[b30ed8f]67enable_openmp = True                   
[e79a467]68
[f468791]69if sys.platform =='darwin':
70    if not is_64bits:
71        # Disable OpenMP
72        enable_openmp = False
73    else:
74        # Newer versions of Darwin don't support openmp
75        try:
76            darwin_ver = int(os.uname()[2].split('.')[0])
77            if darwin_ver >= 12:
78                enable_openmp = False
79        except:
80            print "PROBLEM determining Darwin version"
[b30ed8f]81
82# Options to enable OpenMP
83copt =  {'msvc': ['/openmp'],
84         'mingw32' : ['-fopenmp'],
85         'unix' : ['-fopenmp']}
86lopt =  {'msvc': ['/MANIFEST'],
87         'mingw32' : ['-fopenmp'],
88         'unix' : ['-lgomp']}
[13f00a0]89
[ebdb833]90# Platform-specific link options
91platform_lopt = {'msvc' : ['/MANIFEST']}
92
[13f00a0]93class build_ext_subclass( build_ext ):
94    def build_extensions(self):
95        # Get 64-bitness
96        c = self.compiler.compiler_type
97        print "Compiling with %s (64bit=%s)" % (c, str(is_64bits))
98       
[ebdb833]99        # OpenMP build options
[b30ed8f]100        if enable_openmp:
[13f00a0]101            if copt.has_key(c):
[5980b1a]102                for e in self.extensions:
103                    e.extra_compile_args = copt[ c ]
[13f00a0]104            if lopt.has_key(c):
105                for e in self.extensions:
106                    e.extra_link_args = lopt[ c ]
107                   
[ebdb833]108        # Platform-specific build options
109        if platform_lopt.has_key(c):
110            for e in self.extensions:
111                e.extra_link_args = platform_lopt[ c ]
112
[13f00a0]113        build_ext.build_extensions(self)
[d6bc28cf]114
[5980b1a]115# sans module
116package_dir["sans"] = os.path.join("src", "sans")
117packages.append("sans")
[29e96f3]118
[d6bc28cf]119# sans.invariant
[3d24489]120package_dir["sans.invariant"] = os.path.join("src", "sans", "invariant")
121packages.extend(["sans.invariant"])
[d6bc28cf]122
123# sans.guiframe
[3d24489]124guiframe_path = os.path.join("src", "sans", "guiframe")
125package_dir["sans.guiframe"] = guiframe_path
126package_dir["sans.guiframe.local_perspectives"] = os.path.join(os.path.join(guiframe_path, "local_perspectives"))
127package_data["sans.guiframe"] = ['images/*', 'media/*']
128packages.extend(["sans.guiframe", "sans.guiframe.local_perspectives"])
[d6bc28cf]129# build local plugin
[5980b1a]130for d in os.listdir(os.path.join(guiframe_path, "local_perspectives")):
131    if d not in ['.svn','__init__.py', '__init__.pyc']:
132        package_name = "sans.guiframe.local_perspectives." + d
[3d24489]133        packages.append(package_name)
[5980b1a]134        package_dir[package_name] = os.path.join(guiframe_path, "local_perspectives", d)
[d6bc28cf]135
136# sans.dataloader
[3d24489]137package_dir["sans.dataloader"] = os.path.join("src", "sans", "dataloader")
[eda8972]138package_data["sans.dataloader.readers"] = ['defaults.xml','schema/*.xsd']
139packages.extend(["sans.dataloader","sans.dataloader.readers","sans.dataloader.readers.schema"])
[d6bc28cf]140
141# sans.calculator
[3d24489]142package_dir["sans.calculator"] =os.path.join("src", "sans", "calculator")
143packages.extend(["sans.calculator"])
[d6bc28cf]144   
145# sans.pr
[cb5fb4a]146numpy_incl_path = os.path.join(NUMPY_INC, "numpy")
[b8a8e4e]147srcdir  = os.path.join("src", "sans", "pr", "c_extensions")
[3d24489]148package_dir["sans.pr.core"] = srcdir
149package_dir["sans.pr"] = os.path.join("src","sans", "pr")
150packages.extend(["sans.pr","sans.pr.core"])
[d6bc28cf]151ext_modules.append( Extension("sans.pr.core.pr_inversion",
[3d24489]152                              sources = [os.path.join(srcdir, "Cinvertor.c"),
[29e96f3]153                                         os.path.join(srcdir, "invertor.c"),
154                                         ],
155                              include_dirs=[numpy_incl_path],
156                              ) )
[d6bc28cf]157       
158# sans.fit (park integration)
[3d24489]159package_dir["sans.fit"] = os.path.join("src", "sans", "fit")
160packages.append("sans.fit")
161
162# Perspectives
163package_dir["sans.perspectives"] = os.path.join("src", "sans", "perspectives")
164package_dir["sans.perspectives.pr"] = os.path.join("src", "sans", "perspectives", "pr")
165packages.extend(["sans.perspectives","sans.perspectives.pr"])
166package_data["sans.perspectives.pr"] = ['images/*']
167
168package_dir["sans.perspectives.invariant"] = os.path.join("src", "sans", "perspectives", "invariant")
169packages.extend(["sans.perspectives.invariant"])
170package_data['sans.perspectives.invariant'] = [os.path.join("media",'*')]
171
172package_dir["sans.perspectives.fitting"] = os.path.join("src", "sans", "perspectives", "fitting")
173package_dir["sans.perspectives.fitting.plugin_models"] = os.path.join("src", "sans", "perspectives", "fitting", "plugin_models")
174packages.extend(["sans.perspectives.fitting", 
175                 "sans.perspectives.fitting.plugin_models"])
[8ca5890]176package_data['sans.perspectives.fitting'] = ['media/*','plugin_models/*']
[3d24489]177
178packages.extend(["sans.perspectives", "sans.perspectives.calculator"])   
179package_data['sans.perspectives.calculator'] = ['images/*', 'media/*']
180   
[d6bc28cf]181# Data util
[76263a5]182package_dir["data_util"] = os.path.join("src", "sans", "data_util")
183packages.append("sans.data_util")
[d6bc28cf]184
185# Plottools
[f468791]186package_dir["sans.plottools"] = os.path.join("src", "sans", "plottools")
187packages.append("sans.plottools")
[d6bc28cf]188
189# Park 1.2.1
190package_dir["park"]="park-1.2.1/park"
191packages.extend(["park"])
192package_data["park"] = ['park-1.2.1/*.txt', 'park-1.2.1/park.epydoc']
193ext_modules.append( Extension("park._modeling",
[8ab3302]194                              sources = [ os.path.join("park-1.2.1", 
195                                                "park", "lib", "modeling.cc"),
196                                         os.path.join("park-1.2.1", 
197                                                "park", "lib", "resolution.c"),
[29e96f3]198                                         ],
199                              ) )
[d6bc28cf]200
201# Sans models
[b8a8e4e]202includedir  = os.path.join("src", "sans", "models", "include")
[79d5b6c]203igordir = os.path.join("src", "sans", "models", "c_extension", "libigor")
204cephes_dir = os.path.join("src", "sans", "models", "c_extension", "cephes")
205c_model_dir = os.path.join("src", "sans", "models", "c_extension", "c_models")
206smear_dir  = os.path.join("src", "sans", "models", "c_extension", "c_smearer")
207gen_dir  = os.path.join("src", "sans", "models", "c_extension", "c_gen")
208wrapper_dir  = os.path.join("src", "sans", "models", "c_extension", "python_wrapper", "generated")
[b8a8e4e]209model_dir = os.path.join("src", "sans","models")
[082c565]210
[78f74bd7]211if os.path.isdir(wrapper_dir):
212    for file in os.listdir(wrapper_dir): 
213        file_path =  os.path.join(wrapper_dir, file)
214        os.remove(file_path)
215else:
[0ba3b08]216    os.makedirs(wrapper_dir)
[79d5b6c]217sys.path.append(os.path.join("src", "sans", "models", "c_extension", "python_wrapper"))
[3d24489]218from wrapping import generate_wrappers
219generate_wrappers(header_dir = includedir, 
220                  output_dir = model_dir,
221                  c_wrapper_dir = wrapper_dir)
[2d1b700]222
[101065a]223IGNORED_FILES = [".svn"]
[9cde4cc]224if not os.name=='nt':
[2c63e80e]225    IGNORED_FILES.extend(["gamma_win.c","winFuncs.c"])
[9cde4cc]226
[d6bc28cf]227EXTENSIONS = [".c", ".cpp"]
228
229def append_file(file_list, dir_path):
230    """
231    Add sources file to sources
232    """
233    for f in os.listdir(dir_path):
234        if os.path.isfile(os.path.join(dir_path, f)):
235            _, ext = os.path.splitext(f)
236            if ext.lower() in EXTENSIONS and f not in IGNORED_FILES:
237                file_list.append(os.path.join(dir_path, f)) 
238        elif os.path.isdir(os.path.join(dir_path, f)) and \
239                not f.startswith("."):
240            sub_dir = os.path.join(dir_path, f)
241            for new_f in os.listdir(sub_dir):
242                if os.path.isfile(os.path.join(sub_dir, new_f)):
243                    _, ext = os.path.splitext(new_f)
244                    if ext.lower() in EXTENSIONS and\
245                         new_f not in IGNORED_FILES:
246                        file_list.append(os.path.join(sub_dir, new_f)) 
247       
248model_sources = []
249append_file(file_list=model_sources, dir_path=igordir)
250append_file(file_list=model_sources, dir_path=c_model_dir)
[67424cd]251append_file(file_list=model_sources, dir_path=wrapper_dir)
252
[d6bc28cf]253smear_sources = []
254append_file(file_list=smear_sources, dir_path=smear_dir)
255       
[5980b1a]256package_dir["sans.models"] = model_dir
257package_dir["sans.models.sans_extension"] = os.path.join("src", "sans", "models", "sans_extension")
258package_data['sans.models'] = [os.path.join('media', "*.*")]
259package_data['sans.models'] += [os.path.join('media','img', "*.*")]
260packages.extend(["sans.models","sans.models.sans_extension"])
261   
262smearer_sources = [os.path.join(smear_dir, "smearer.cpp"),
263                  os.path.join(smear_dir, "smearer_module.cpp")]
264geni_sources = [os.path.join(gen_dir, "sld2i_module.cpp")]
265if os.name=='nt':
266    smearer_sources.append(os.path.join(igordir, "winFuncs.c"))
267    geni_sources.append(os.path.join(igordir, "winFuncs.c"))
268ext_modules.extend( [ Extension("sans.models.sans_extension.c_models",
269                                sources=model_sources,                 
270                                include_dirs=[igordir, includedir, 
271                                              c_model_dir, numpy_incl_path, cephes_dir],
272                                ),       
273                    # Smearer extension
274                    Extension("sans.models.sans_extension.smearer",
275                              sources = smearer_sources,
276                              include_dirs=[igordir, 
277                                            smear_dir, numpy_incl_path],
278                              ),
279                   
280                    Extension("sans.models.sans_extension.smearer2d_helper",
281                              sources = [os.path.join(smear_dir, 
282                                                "smearer2d_helper_module.cpp"),
283                                         os.path.join(smear_dir, 
284                                                "smearer2d_helper.cpp"),],
285                              include_dirs=[smear_dir, numpy_incl_path],
286                              ),
287                   
288                    Extension("sans.models.sans_extension.sld2i",
289                              sources = [os.path.join(gen_dir, 
290                                                "sld2i_module.cpp"),
291                                         os.path.join(gen_dir, 
292                                                "sld2i.cpp"),
293                                         os.path.join(c_model_dir, 
294                                                "libfunc.c"),
295                                         os.path.join(c_model_dir, 
296                                                "librefl.c"),],
297                              include_dirs=[gen_dir, includedir, 
298                                            c_model_dir, numpy_incl_path],
299                              )
300                    ] )
301       
[c329f4d]302# SasView
[df7a7e3]303
[d6bc28cf]304package_dir["sans.sansview"] = "sansview"
[ea5fa58]305package_data['sans.sansview'] = ['images/*', 'media/*', 'test/*', 
306                                 'default_categories.p']
[d6bc28cf]307packages.append("sans.sansview")
308
[8ab3302]309#required = ['lxml>=2.2.2', 'numpy>=1.4.1', 'matplotlib>=0.99.1.1',
310#            'wxPython>=2.8.11', 'pil',
311#            'periodictable>=1.3.0', 'scipy>=0.7.2']
[6a84c0c]312required = ['lxml','periodictable>=1.3.1','pyparsing<2.0.0']
[213b445]313
[95fe70d]314if os.name=='nt':
[7a211030]315    required.extend(['html5lib', 'reportlab'])
[7f59928e]316else:
[202c1ef]317    required.extend(['pil'])
[30ad350]318   
[5980b1a]319# Set up SasView   
[d6bc28cf]320setup(
[c329f4d]321    name="sasview",
[5548954]322    version = VERSION,
[c329f4d]323    description = "SasView application",
[d6bc28cf]324    author = "University of Tennessee",
325    author_email = "sansdanse@gmail.com",
[5980b1a]326    url = "http://sasview.org",
[d6bc28cf]327    license = "PSF",
[c329f4d]328    keywords = "small-angle x-ray and neutron scattering analysis",
[d6bc28cf]329    download_url = "https://sourceforge.net/projects/sansviewproject/files/",
330    package_dir = package_dir,
331    packages = packages,
332    package_data = package_data,
333    ext_modules = ext_modules,
334    install_requires = required,
[60f7d19]335    zip_safe = False,
[a7b774d]336    entry_points = {
337                    'console_scripts':[
[9a3b713]338                                       "sasview = sans.sansview.sansview:run",
[a7b774d]339                                       ]
[13f00a0]340                    },
341    cmdclass = {'build_ext': build_ext_subclass }
[d113531]342    )   
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.