source: sasview/setup.py @ 307fa4f

ESS_GUIESS_GUI_DocsESS_GUI_batch_fittingESS_GUI_bumps_abstractionESS_GUI_iss1116ESS_GUI_iss879ESS_GUI_iss959ESS_GUI_openclESS_GUI_orderingESS_GUI_sync_sascalccostrafo411magnetic_scattrelease-4.1.1release-4.1.2release-4.2.2release_4.0.1ticket-1009ticket-1094-headlessticket-1242-2d-resolutionticket-1243ticket-1249ticket885unittest-saveload
Last change on this file since 307fa4f was 307fa4f, checked in by ajj, 10 years ago

Updated setup.py to allow successful build on OS X 10.9 with clang without breaking other unix builds

  • Property mode set to 100644
File size: 14.2 KB
RevLine 
[d6bc28cf]1"""
[c329f4d]2    Setup for SasView
[d6bc28cf]3    #TODO: Add checks to see that all the dependencies are on the system
4"""
[8ab3302]5import sys
[d6bc28cf]6import os
[5980b1a]7from setuptools import setup, Extension
[2cef9d3]8from distutils.command.build_ext import build_ext
9
[e13ef7f]10try:
11    from numpy.distutils.misc_util import get_numpy_include_dirs
12    NUMPY_INC = get_numpy_include_dirs()[0]
13except:
[cb5fb4a]14    try:
[e13ef7f]15        import numpy
[8ab3302]16        NUMPY_INC = os.path.join(os.path.split(numpy.__file__)[0], 
17                                 "core","include")
[cb5fb4a]18    except:
[c329f4d]19        msg = "\nNumpy is needed to build SasView. "
[8ab3302]20        print msg, "Try easy_install numpy.\n  %s" % str(sys.exc_value)
[e13ef7f]21        sys.exit(0)
[d6bc28cf]22
[5548954]23# Manage version number ######################################
[a134fc6]24import sansview
25VERSION = sansview.__version__
[5548954]26##############################################################
27
[d6bc28cf]28package_dir = {}
29package_data = {}
30packages = []
31ext_modules = []
32
[8ab3302]33# Remove all files that should be updated by this setup
34# We do this here because application updates these files from .sansview
35# except when there is no such file
36# Todo : make this list generic
37plugin_model_list = ['polynominal5.py', 'sph_bessel_jn.py', 
38                     'sum_Ap1_1_Ap2.py', 'sum_p1_p2.py', 
[b30ed8f]39                     'testmodel_2.py', 'testmodel.py',
40                     'polynominal5.pyc', 'sph_bessel_jn.pyc', 
41                     'sum_Ap1_1_Ap2.pyc', 'sum_p1_p2.pyc', 
[eb32080e]42                     'testmodel_2.pyc', 'testmodel.pyc', 'plugins.log']
[c329f4d]43sans_dir = os.path.join(os.path.expanduser("~"),'.sasview')
[8ab3302]44if os.path.isdir(sans_dir):
[c329f4d]45    f_path = os.path.join(sans_dir, "sasview.log")
[e615a0d]46    if os.path.isfile(f_path):
47        os.remove(f_path)
[ea5fa58]48    f_path = os.path.join(sans_dir, "serialized_cat.p")
49    if os.path.isfile(f_path):
50        os.remove(f_path)
[e615a0d]51    f_path = os.path.join(sans_dir, 'config', "custom_config.py")
52    if os.path.isfile(f_path):
53        os.remove(f_path)
54    f_path = os.path.join(sans_dir, 'plugin_models')
55    if os.path.isdir(f_path):
[5980b1a]56        for f in os.listdir(f_path): 
57            if f in plugin_model_list:
58                file_path =  os.path.join(f_path, f)
[e615a0d]59                os.remove(file_path)
60                   
61# 'sys.maxsize' and 64bit: Not supported for python2.5
62is_64bits = False
63if sys.version_info >= (2, 6):
64    is_64bits = sys.maxsize > 2**32
65   
66   
[b30ed8f]67enable_openmp = True                   
[e79a467]68
[f468791]69if sys.platform =='darwin':
70    if not is_64bits:
71        # Disable OpenMP
72        enable_openmp = False
73    else:
74        # Newer versions of Darwin don't support openmp
75        try:
76            darwin_ver = int(os.uname()[2].split('.')[0])
77            if darwin_ver >= 12:
78                enable_openmp = False
79        except:
80            print "PROBLEM determining Darwin version"
[b30ed8f]81
82# Options to enable OpenMP
83copt =  {'msvc': ['/openmp'],
84         'mingw32' : ['-fopenmp'],
85         'unix' : ['-fopenmp']}
86lopt =  {'msvc': ['/MANIFEST'],
87         'mingw32' : ['-fopenmp'],
88         'unix' : ['-lgomp']}
[13f00a0]89
[ebdb833]90# Platform-specific link options
91platform_lopt = {'msvc' : ['/MANIFEST']}
[307fa4f]92platform_copt = {}
[b9c8fc5]93
94# Set copts to get compile working on OS X >= 10.9 using clang
95if sys.platform =='darwin':
96    try:
97        darwin_ver = int(os.uname()[2].split('.')[0])
98        if darwin_ver >= 13:
99            platform_copt = {'unix' : ['-Wno-error=unused-command-line-argument-hard-error-in-future']}
100    except:
101        print "PROBLEM determining Darwin version"
102
[1829835]103
[ebdb833]104
[13f00a0]105class build_ext_subclass( build_ext ):
106    def build_extensions(self):
107        # Get 64-bitness
108        c = self.compiler.compiler_type
109        print "Compiling with %s (64bit=%s)" % (c, str(is_64bits))
110       
[ebdb833]111        # OpenMP build options
[b30ed8f]112        if enable_openmp:
[13f00a0]113            if copt.has_key(c):
[5980b1a]114                for e in self.extensions:
115                    e.extra_compile_args = copt[ c ]
[13f00a0]116            if lopt.has_key(c):
117                for e in self.extensions:
118                    e.extra_link_args = lopt[ c ]
119                   
[ebdb833]120        # Platform-specific build options
121        if platform_lopt.has_key(c):
122            for e in self.extensions:
123                e.extra_link_args = platform_lopt[ c ]
124
[1829835]125        if platform_copt.has_key(c):
126            for e in self.extensions:
127                e.extra_compile_args = platform_copt[ c ]
128
129
[13f00a0]130        build_ext.build_extensions(self)
[d6bc28cf]131
[5980b1a]132# sans module
133package_dir["sans"] = os.path.join("src", "sans")
134packages.append("sans")
[29e96f3]135
[d6bc28cf]136# sans.invariant
[3d24489]137package_dir["sans.invariant"] = os.path.join("src", "sans", "invariant")
138packages.extend(["sans.invariant"])
[d6bc28cf]139
140# sans.guiframe
[3d24489]141guiframe_path = os.path.join("src", "sans", "guiframe")
142package_dir["sans.guiframe"] = guiframe_path
143package_dir["sans.guiframe.local_perspectives"] = os.path.join(os.path.join(guiframe_path, "local_perspectives"))
144package_data["sans.guiframe"] = ['images/*', 'media/*']
145packages.extend(["sans.guiframe", "sans.guiframe.local_perspectives"])
[d6bc28cf]146# build local plugin
[5980b1a]147for d in os.listdir(os.path.join(guiframe_path, "local_perspectives")):
148    if d not in ['.svn','__init__.py', '__init__.pyc']:
149        package_name = "sans.guiframe.local_perspectives." + d
[3d24489]150        packages.append(package_name)
[5980b1a]151        package_dir[package_name] = os.path.join(guiframe_path, "local_perspectives", d)
[d6bc28cf]152
153# sans.dataloader
[3d24489]154package_dir["sans.dataloader"] = os.path.join("src", "sans", "dataloader")
[eda8972]155package_data["sans.dataloader.readers"] = ['defaults.xml','schema/*.xsd']
156packages.extend(["sans.dataloader","sans.dataloader.readers","sans.dataloader.readers.schema"])
[d6bc28cf]157
158# sans.calculator
[3d24489]159package_dir["sans.calculator"] =os.path.join("src", "sans", "calculator")
160packages.extend(["sans.calculator"])
[d6bc28cf]161   
162# sans.pr
[cb5fb4a]163numpy_incl_path = os.path.join(NUMPY_INC, "numpy")
[b8a8e4e]164srcdir  = os.path.join("src", "sans", "pr", "c_extensions")
[3d24489]165package_dir["sans.pr.core"] = srcdir
166package_dir["sans.pr"] = os.path.join("src","sans", "pr")
167packages.extend(["sans.pr","sans.pr.core"])
[d6bc28cf]168ext_modules.append( Extension("sans.pr.core.pr_inversion",
[3d24489]169                              sources = [os.path.join(srcdir, "Cinvertor.c"),
[29e96f3]170                                         os.path.join(srcdir, "invertor.c"),
171                                         ],
172                              include_dirs=[numpy_incl_path],
173                              ) )
[d6bc28cf]174       
175# sans.fit (park integration)
[3d24489]176package_dir["sans.fit"] = os.path.join("src", "sans", "fit")
177packages.append("sans.fit")
178
179# Perspectives
180package_dir["sans.perspectives"] = os.path.join("src", "sans", "perspectives")
181package_dir["sans.perspectives.pr"] = os.path.join("src", "sans", "perspectives", "pr")
182packages.extend(["sans.perspectives","sans.perspectives.pr"])
183package_data["sans.perspectives.pr"] = ['images/*']
184
185package_dir["sans.perspectives.invariant"] = os.path.join("src", "sans", "perspectives", "invariant")
186packages.extend(["sans.perspectives.invariant"])
187package_data['sans.perspectives.invariant'] = [os.path.join("media",'*')]
188
189package_dir["sans.perspectives.fitting"] = os.path.join("src", "sans", "perspectives", "fitting")
190package_dir["sans.perspectives.fitting.plugin_models"] = os.path.join("src", "sans", "perspectives", "fitting", "plugin_models")
191packages.extend(["sans.perspectives.fitting", 
192                 "sans.perspectives.fitting.plugin_models"])
[8ca5890]193package_data['sans.perspectives.fitting'] = ['media/*','plugin_models/*']
[3d24489]194
195packages.extend(["sans.perspectives", "sans.perspectives.calculator"])   
196package_data['sans.perspectives.calculator'] = ['images/*', 'media/*']
197   
[d6bc28cf]198# Data util
[76263a5]199package_dir["data_util"] = os.path.join("src", "sans", "data_util")
200packages.append("sans.data_util")
[d6bc28cf]201
202# Plottools
[f468791]203package_dir["sans.plottools"] = os.path.join("src", "sans", "plottools")
204packages.append("sans.plottools")
[d6bc28cf]205
206# Park 1.2.1
207package_dir["park"]="park-1.2.1/park"
208packages.extend(["park"])
209package_data["park"] = ['park-1.2.1/*.txt', 'park-1.2.1/park.epydoc']
210ext_modules.append( Extension("park._modeling",
[8ab3302]211                              sources = [ os.path.join("park-1.2.1", 
212                                                "park", "lib", "modeling.cc"),
213                                         os.path.join("park-1.2.1", 
214                                                "park", "lib", "resolution.c"),
[29e96f3]215                                         ],
216                              ) )
[d6bc28cf]217
218# Sans models
[b8a8e4e]219includedir  = os.path.join("src", "sans", "models", "include")
[79d5b6c]220igordir = os.path.join("src", "sans", "models", "c_extension", "libigor")
221cephes_dir = os.path.join("src", "sans", "models", "c_extension", "cephes")
222c_model_dir = os.path.join("src", "sans", "models", "c_extension", "c_models")
223smear_dir  = os.path.join("src", "sans", "models", "c_extension", "c_smearer")
224gen_dir  = os.path.join("src", "sans", "models", "c_extension", "c_gen")
225wrapper_dir  = os.path.join("src", "sans", "models", "c_extension", "python_wrapper", "generated")
[b8a8e4e]226model_dir = os.path.join("src", "sans","models")
[082c565]227
[78f74bd7]228if os.path.isdir(wrapper_dir):
229    for file in os.listdir(wrapper_dir): 
230        file_path =  os.path.join(wrapper_dir, file)
231        os.remove(file_path)
232else:
[0ba3b08]233    os.makedirs(wrapper_dir)
[79d5b6c]234sys.path.append(os.path.join("src", "sans", "models", "c_extension", "python_wrapper"))
[3d24489]235from wrapping import generate_wrappers
236generate_wrappers(header_dir = includedir, 
237                  output_dir = model_dir,
238                  c_wrapper_dir = wrapper_dir)
[2d1b700]239
[101065a]240IGNORED_FILES = [".svn"]
[9cde4cc]241if not os.name=='nt':
[2c63e80e]242    IGNORED_FILES.extend(["gamma_win.c","winFuncs.c"])
[9cde4cc]243
[d6bc28cf]244EXTENSIONS = [".c", ".cpp"]
245
246def append_file(file_list, dir_path):
247    """
248    Add sources file to sources
249    """
250    for f in os.listdir(dir_path):
251        if os.path.isfile(os.path.join(dir_path, f)):
252            _, ext = os.path.splitext(f)
253            if ext.lower() in EXTENSIONS and f not in IGNORED_FILES:
254                file_list.append(os.path.join(dir_path, f)) 
255        elif os.path.isdir(os.path.join(dir_path, f)) and \
256                not f.startswith("."):
257            sub_dir = os.path.join(dir_path, f)
258            for new_f in os.listdir(sub_dir):
259                if os.path.isfile(os.path.join(sub_dir, new_f)):
260                    _, ext = os.path.splitext(new_f)
261                    if ext.lower() in EXTENSIONS and\
262                         new_f not in IGNORED_FILES:
263                        file_list.append(os.path.join(sub_dir, new_f)) 
264       
265model_sources = []
266append_file(file_list=model_sources, dir_path=igordir)
267append_file(file_list=model_sources, dir_path=c_model_dir)
[67424cd]268append_file(file_list=model_sources, dir_path=wrapper_dir)
269
[d6bc28cf]270smear_sources = []
271append_file(file_list=smear_sources, dir_path=smear_dir)
272       
[5980b1a]273package_dir["sans.models"] = model_dir
274package_dir["sans.models.sans_extension"] = os.path.join("src", "sans", "models", "sans_extension")
275package_data['sans.models'] = [os.path.join('media', "*.*")]
276package_data['sans.models'] += [os.path.join('media','img', "*.*")]
277packages.extend(["sans.models","sans.models.sans_extension"])
278   
279smearer_sources = [os.path.join(smear_dir, "smearer.cpp"),
280                  os.path.join(smear_dir, "smearer_module.cpp")]
281geni_sources = [os.path.join(gen_dir, "sld2i_module.cpp")]
282if os.name=='nt':
283    smearer_sources.append(os.path.join(igordir, "winFuncs.c"))
284    geni_sources.append(os.path.join(igordir, "winFuncs.c"))
285ext_modules.extend( [ Extension("sans.models.sans_extension.c_models",
286                                sources=model_sources,                 
287                                include_dirs=[igordir, includedir, 
288                                              c_model_dir, numpy_incl_path, cephes_dir],
289                                ),       
290                    # Smearer extension
291                    Extension("sans.models.sans_extension.smearer",
292                              sources = smearer_sources,
293                              include_dirs=[igordir, 
294                                            smear_dir, numpy_incl_path],
295                              ),
296                   
297                    Extension("sans.models.sans_extension.smearer2d_helper",
298                              sources = [os.path.join(smear_dir, 
299                                                "smearer2d_helper_module.cpp"),
300                                         os.path.join(smear_dir, 
301                                                "smearer2d_helper.cpp"),],
302                              include_dirs=[smear_dir, numpy_incl_path],
303                              ),
304                   
305                    Extension("sans.models.sans_extension.sld2i",
306                              sources = [os.path.join(gen_dir, 
307                                                "sld2i_module.cpp"),
308                                         os.path.join(gen_dir, 
309                                                "sld2i.cpp"),
310                                         os.path.join(c_model_dir, 
311                                                "libfunc.c"),
312                                         os.path.join(c_model_dir, 
313                                                "librefl.c"),],
314                              include_dirs=[gen_dir, includedir, 
315                                            c_model_dir, numpy_incl_path],
316                              )
317                    ] )
318       
[c329f4d]319# SasView
[df7a7e3]320
[d6bc28cf]321package_dir["sans.sansview"] = "sansview"
[ea5fa58]322package_data['sans.sansview'] = ['images/*', 'media/*', 'test/*', 
323                                 'default_categories.p']
[d6bc28cf]324packages.append("sans.sansview")
325
[8ab3302]326#required = ['lxml>=2.2.2', 'numpy>=1.4.1', 'matplotlib>=0.99.1.1',
327#            'wxPython>=2.8.11', 'pil',
328#            'periodictable>=1.3.0', 'scipy>=0.7.2']
[6a84c0c]329required = ['lxml','periodictable>=1.3.1','pyparsing<2.0.0']
[213b445]330
[95fe70d]331if os.name=='nt':
[7a211030]332    required.extend(['html5lib', 'reportlab'])
[7f59928e]333else:
[202c1ef]334    required.extend(['pil'])
[30ad350]335   
[5980b1a]336# Set up SasView   
[d6bc28cf]337setup(
[c329f4d]338    name="sasview",
[5548954]339    version = VERSION,
[c329f4d]340    description = "SasView application",
[d6bc28cf]341    author = "University of Tennessee",
342    author_email = "sansdanse@gmail.com",
[5980b1a]343    url = "http://sasview.org",
[d6bc28cf]344    license = "PSF",
[c329f4d]345    keywords = "small-angle x-ray and neutron scattering analysis",
[d6bc28cf]346    download_url = "https://sourceforge.net/projects/sansviewproject/files/",
347    package_dir = package_dir,
348    packages = packages,
349    package_data = package_data,
350    ext_modules = ext_modules,
351    install_requires = required,
[60f7d19]352    zip_safe = False,
[a7b774d]353    entry_points = {
354                    'console_scripts':[
[9a3b713]355                                       "sasview = sans.sansview.sansview:run",
[a7b774d]356                                       ]
[13f00a0]357                    },
358    cmdclass = {'build_ext': build_ext_subclass }
[d113531]359    )   
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.