source: sasview/sansview/perspectives/fitting/models.py @ cad821b

ESS_GUIESS_GUI_DocsESS_GUI_batch_fittingESS_GUI_bumps_abstractionESS_GUI_iss1116ESS_GUI_iss879ESS_GUI_iss959ESS_GUI_openclESS_GUI_orderingESS_GUI_sync_sascalccostrafo411magnetic_scattrelease-4.1.1release-4.1.2release-4.2.2release_4.0.1ticket-1009ticket-1094-headlessticket-1242-2d-resolutionticket-1243ticket-1249ticket885unittest-saveload
Last change on this file since cad821b was 1b001a7, checked in by Gervaise Alina <gervyh@…>, 15 years ago

using evalDistribution for plotting model
  • Property mode set to 100644
File size: 14.9 KB
Line 
1#TODO: add comments to document this module
2#TODO: clean-up the exception handling.
3
4#TODO: clean-up the FractalAbsModel and PowerLawAbsModel menu items. Those
5#      model definitions do not belong here. They belong with the rest of the
6#      models.
7
8import wx
9import wx.lib.newevent
10import imp
11import os,sys,math
12import os.path
13
14(ModelEvent, EVT_MODEL) = wx.lib.newevent.NewEvent()
15from sans.guicomm.events import StatusEvent 
16# Time is needed by the log method
17import time
18
19# Explicitly import from the pluginmodel module so that py2exe
20# places it in the distribution. The Model1DPlugin class is used
21# as the base class of plug-in models.
22from sans.models.pluginmodel import Model1DPlugin
23   
24def log(message):
25    out = open("plugins.log", 'a')
26    out.write("%10g:  %s\n" % (time.clock(), message))
27    out.close()
28
29def findModels():
30    log("looking for models in: %s/plugins" % os.getcwd())
31    if os.path.isdir('plugins'):
32        return _findModels('plugins')
33    return []
34   
35def _findModels(dir):
36    # List of plugin objects
37    plugins = []
38    # Go through files in plug-in directory
39    try:
40        list = os.listdir(dir)
41        for item in list:
42            toks = os.path.splitext(os.path.basename(item))
43            if toks[1]=='.py' and not toks[0]=='__init__':
44                name = toks[0]
45           
46                path = [os.path.abspath(dir)]
47                file = None
48                try:
49                    (file, path, info) = imp.find_module(name, path)
50                    module = imp.load_module( name, file, item, info )
51                    if hasattr(module, "Model"):
52                        try:
53                            plugins.append(module.Model)
54                        except:
55                            log("Error accessing Model in %s\n  %s" % (name, sys.exc_value))
56                except:
57                    log("Error accessing Model in %s\n  %s" % (name, sys.exc_value))
58                finally:
59             
60                    if not file==None:
61                        file.close()
62    except:
63        # Don't deal with bad plug-in imports. Just skip.
64        pass
65    return plugins
66
67class ModelList(object):
68    """
69        Contains dictionary of model and their type
70    """
71    def __init__(self):
72        self.mydict={}
73       
74    def set_list(self, name, mylist):
75        """
76            @param name: the type of the list
77            @param mylist: the list to add
78        """
79        if name not in self.mydict.keys():
80            self.mydict[name] = mylist
81           
82           
83    def get_list(self):
84        """
85         return all the list stored in a dictionary object
86        """
87        return self.mydict
88       
89class ModelManager:
90    ## external dict for models
91    model_combobox = ModelList()
92    ## Dictionary of form models
93    form_factor_dict = {}
94    ## dictionary of other
95    struct_factor_dict = {}
96    ##list of form factors
97    shape_list =[]
98    ## independent shape model list
99    shape_indep_list = []
100    ##list of structure factors
101    struct_list= []
102    ##list of model allowing multiplication
103    multiplication_factor=[]
104    ## list of added models
105    plugins=[]
106    ## Event owner (guiframe)
107    event_owner = None
108   
109    def _getModelList(self):
110        """
111            List of models we want to make available by default
112            for this application
113       
114            @return: the next free event ID following the new menu events
115        """
116        ## form factor
117        from sans.models.SphereModel import SphereModel
118        self.shape_list.append(SphereModel)
119        self.multiplication_factor.append(SphereModel)
120       
121        from sans.models.CylinderModel import CylinderModel
122        self.shape_list.append(CylinderModel)
123        self.multiplication_factor.append(CylinderModel)
124       
125        from sans.models.ParallelepipedModel import ParallelepipedModel
126        self.shape_list.append(ParallelepipedModel)
127       
128        from sans.models.CoreShellModel import CoreShellModel
129        self.shape_list.append(CoreShellModel)
130       
131        from sans.models.CoreShellCylinderModel import CoreShellCylinderModel
132        self.shape_list.append(CoreShellCylinderModel)
133       
134        from sans.models.MultiShellModel import MultiShellModel
135        self.shape_list.append(MultiShellModel)
136       
137        from sans.models.BinaryHSModel import BinaryHSModel
138        self.shape_list.append(BinaryHSModel)
139       
140        from sans.models.VesicleModel import VesicleModel
141        self.shape_list.append(VesicleModel)
142       
143        from sans.models.HollowCylinderModel import HollowCylinderModel
144        self.shape_list.append(HollowCylinderModel)
145       
146        from sans.models.EllipticalCylinderModel import EllipticalCylinderModel
147        self.shape_list.append(EllipticalCylinderModel)
148       
149        from sans.models.EllipsoidModel import EllipsoidModel
150        self.shape_list.append(EllipsoidModel)
151        self.multiplication_factor.append(EllipsoidModel)
152         
153        from sans.models.TriaxialEllipsoidModel import TriaxialEllipsoidModel
154        self.shape_list.append(TriaxialEllipsoidModel)
155       
156        from sans.models.FlexibleCylinderModel import FlexibleCylinderModel
157        self.shape_list.append(FlexibleCylinderModel)
158       
159        from sans.models.StackedDisksModel import StackedDisksModel
160        self.shape_list.append(StackedDisksModel)
161       
162        from sans.models.LamellarModel import LamellarModel
163        self.shape_list.append(LamellarModel)
164       
165        from sans.models.LamellarFFHGModel import LamellarFFHGModel
166        self.shape_list.append(LamellarFFHGModel)
167       
168        from sans.models.LamellarPSModel import LamellarPSModel
169        self.shape_list.append(LamellarPSModel)
170     
171        from sans.models.LamellarPSHGModel import LamellarPSHGModel
172        self.shape_list.append(LamellarPSHGModel)
173     
174        from sans.models.OblateModel import OblateModel
175        self.shape_list.append(OblateModel)
176       
177        from sans.models.ProlateModel import ProlateModel
178        self.shape_list.append(ProlateModel)
179     
180        ## Structure factor
181        from sans.models.SquareWellStructure import SquareWellStructure
182        self.struct_list.append(SquareWellStructure)
183       
184        from sans.models.HardsphereStructure import HardsphereStructure
185        self.struct_list.append(HardsphereStructure)
186         
187        from sans.models.StickyHSStructure import StickyHSStructure
188        self.struct_list.append(StickyHSStructure)
189       
190        from sans.models.HayterMSAStructure import HayterMSAStructure
191        self.struct_list.append(HayterMSAStructure)
192       
193       
194        ##shape-independent models
195        from sans.models.BEPolyelectrolyte import BEPolyelectrolyte
196        self.shape_indep_list.append(BEPolyelectrolyte )
197        self.form_factor_dict[str(wx.NewId())] =  [SphereModel]
198        from sans.models.DABModel import DABModel
199        self.shape_indep_list.append(DABModel )
200       
201        from sans.models.GuinierModel import GuinierModel
202        self.shape_indep_list.append(GuinierModel )
203       
204        from sans.models.DebyeModel import DebyeModel
205        self.shape_indep_list.append(DebyeModel )
206       
207        from sans.models.PorodModel import PorodModel
208        self.shape_indep_list.append(PorodModel )
209       
210        from sans.models.LineModel import LineModel
211        self.shape_indep_list.append(LineModel)
212       
213        from sans.models.PeakGaussModel import PeakGaussModel
214        self.shape_indep_list.append(PeakGaussModel)
215       
216        from sans.models.PeakLorentzModel import PeakLorentzModel
217        self.shape_indep_list.append(PeakLorentzModel)
218       
219        from sans.models.FractalModel import FractalModel
220        class FractalAbsModel(FractalModel):
221            def _Fractal(self, x):
222                return FractalModel._Fractal(self, math.fabs(x))
223        self.shape_indep_list.append(FractalAbsModel)
224       
225        from sans.models.LorentzModel import LorentzModel
226        self.shape_indep_list.append( LorentzModel) 
227           
228        from sans.models.PowerLawModel import PowerLawModel
229        class PowerLawAbsModel(PowerLawModel):
230            def _PowerLaw(self, x):
231                try:
232                    return PowerLawModel._PowerLaw(self, math.fabs(x))
233                except:
234                    print sys.exc_value 
235        self.shape_indep_list.append( PowerLawAbsModel )
236        from sans.models.TeubnerStreyModel import TeubnerStreyModel
237        self.shape_indep_list.append(TeubnerStreyModel )
238   
239        #Looking for plugins
240        self.plugins = findModels()
241       
242        return 0
243
244   
245    def populate_menu(self, modelmenu, event_owner):
246        """
247            Populate a menu with our models
248           
249            @param id: first menu event ID to use when binding the menu events
250            @param modelmenu: wx.Menu object to populate
251            @param event_owner: wx object to bind the menu events to
252            @return: the next free event ID following the new menu events
253        """
254        ## Fill model lists
255        self._getModelList()
256        ## store reference to model menu of guiframe
257        self.modelmenu = modelmenu
258        ## guiframe reference
259        self.event_owner = event_owner
260       
261       
262        shape_submenu = wx.Menu()
263        shape_indep_submenu = wx.Menu()
264        structure_factor = wx.Menu()
265        added_models = wx.Menu()
266        multip_models = wx.Menu()
267        ## create menu with shape
268        self._fill_simple_menu( menuinfo = ["Shapes",shape_submenu," simple shape"],
269                         list1 = self.shape_list )
270       
271        self._fill_simple_menu( menuinfo = ["Shape-Independent",shape_indep_submenu,
272                                    "List of shape-independent models"],
273                         list1 = self.shape_indep_list )
274       
275        self._fill_simple_menu( menuinfo= ["Structure Factors",structure_factor,
276                                          "List of Structure factors models" ],
277                                list1= self.struct_list )
278       
279        self._fill_simple_menu( menuinfo = ["Customized Models", added_models,
280                                            "List of additional models"],
281                                 list1= self.plugins )
282       
283        self._fill_menu(menuinfo=["P(Q)*S(Q)",multip_models,
284                                  "mulplication of 2 models"],
285                                   list1 = self.multiplication_factor ,
286                                   list2 =  self.struct_list)
287       
288       
289        return 0
290   
291    def _fill_simple_menu(self,menuinfo, list1):
292        """
293            Fill the menu with list item
294            @param modelmenu: the menu to fill
295            @param menuinfo: submenu item for the first column of this modelmenu
296                             with info.Should be a list :
297                             [name(string) , menu(wx.menu), help(string)]
298            @param list1: contains item (form factor )to fill modelmenu second column
299        """
300        if len(list1)>0:
301            self.model_combobox.set_list(menuinfo[0],list1)
302           
303            for item in list1:
304                try:
305                    id = wx.NewId() 
306                    struct_factor=item()
307                    struct_name = struct_factor.__class__.__name__
308                    if hasattr(struct_factor, "name"):
309                        struct_name = struct_factor.name
310                       
311                    menuinfo[1].Append(int(id),struct_name,struct_name)
312                    if not  item in self.struct_factor_dict.itervalues():
313                        self.struct_factor_dict[str(id)]= item
314                    wx.EVT_MENU(self.event_owner, int(id), self._on_model)
315                except:
316                    msg= "Error Occured: %s"%sys.exc_value
317                    wx.PostEvent(self.event_owner, StatusEvent(status=msg))
318               
319        id = wx.NewId()         
320        self.modelmenu.AppendMenu(id, menuinfo[0],menuinfo[1],menuinfo[2])
321       
322       
323       
324    def _fill_menu(self,menuinfo, list1,list2  ):
325        """
326            Fill the menu with list item
327            @param menuinfo: submenu item for the first column of this modelmenu
328                             with info.Should be a list :
329                             [name(string) , menu(wx.menu), help(string)]
330            @param list1: contains item (form factor )to fill modelmenu second column
331            @param list2: contains item (Structure factor )to fill modelmenu third column
332        """
333        if len(list1)>0:
334            self.model_combobox.set_list(menuinfo[0],list1)
335           
336            for item in list1:   
337                form_factor= item()
338                form_name = form_factor.__class__.__name__
339                if hasattr(form_factor, "name"):
340                    form_name = form_factor.name
341                ### store form factor to return to other users   
342                newmenu= wx.Menu()
343                if len(list2)>0:
344                    for model  in list2:
345                        id = wx.NewId()
346                        struct_factor = model()
347                        name = struct_factor.__class__.__name__
348                        if hasattr(struct_factor, "name"):
349                            name = struct_factor.name
350                        newmenu.Append(id,name, name)
351                        wx.EVT_MENU(self.event_owner, int(id), self._on_model)
352                        ## save form_fact and struct_fact
353                        self.form_factor_dict[int(id)] = [form_factor,struct_factor]
354                       
355                form_id= wx.NewId()   
356                menuinfo[1].AppendMenu(int(form_id), form_name,newmenu,menuinfo[2])
357        id=wx.NewId()
358        self.modelmenu.AppendMenu(id,menuinfo[0],menuinfo[1], menuinfo[2])
359       
360       
361       
362       
363    def _on_model(self, evt):
364        """
365            React to a model menu event
366            @param event: wx menu event
367        """
368        if int(evt.GetId()) in self.form_factor_dict.keys():
369            from sans.models.MultiplicationModel import MultiplicationModel
370            model1, model2 = self.form_factor_dict[int(evt.GetId())]
371            model = MultiplicationModel(model1, model2)
372               
373        else:
374            model= self.struct_factor_dict[str(evt.GetId())]()
375           
376        evt = ModelEvent( model= model )
377        wx.PostEvent(self.event_owner, evt)
378       
379    def get_model_list(self):   
380        """ @ return dictionary of models for fitpanel use """
381        self.model_combobox.set_list("multiplication", self.multiplication_factor)
382        return self.model_combobox
383   
384 
385       
386   
387   
388 
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.