source: sasview/sansview/perspectives/fitting/models.py @ c8727c5

ESS_GUIESS_GUI_DocsESS_GUI_batch_fittingESS_GUI_bumps_abstractionESS_GUI_iss1116ESS_GUI_iss879ESS_GUI_iss959ESS_GUI_openclESS_GUI_orderingESS_GUI_sync_sascalccostrafo411magnetic_scattrelease-4.1.1release-4.1.2release-4.2.2release_4.0.1ticket-1009ticket-1094-headlessticket-1242-2d-resolutionticket-1243ticket-1249ticket885unittest-saveload
Last change on this file since c8727c5 was eddff027, checked in by Jae Cho <jhjcho@…>, 15 years ago

added coreshellellipsoidmodel
  • Property mode set to 100644
File size: 14.8 KB
Line 
1#TODO: add comments to document this module
2#TODO: clean-up the exception handling.
3
4#TODO: clean-up the FractalAbsModel and PowerLawAbsModel menu items. Those
5#      model definitions do not belong here. They belong with the rest of the
6#      models.
7
8import wx
9import wx.lib.newevent
10import imp
11import os,sys,math
12import os.path
13
14(ModelEvent, EVT_MODEL) = wx.lib.newevent.NewEvent()
15from sans.guicomm.events import StatusEvent 
16# Time is needed by the log method
17import time
18
19# Explicitly import from the pluginmodel module so that py2exe
20# places it in the distribution. The Model1DPlugin class is used
21# as the base class of plug-in models.
22from sans.models.pluginmodel import Model1DPlugin
23   
24def log(message):
25    out = open("plugins.log", 'a')
26    out.write("%10g:  %s\n" % (time.clock(), message))
27    out.close()
28
29def findModels():
30    log("looking for models in: %s/plugins" % os.getcwd())
31    if os.path.isdir('plugins'):
32        return _findModels('plugins')
33    return []
34   
35def _findModels(dir):
36    # List of plugin objects
37    plugins = []
38    # Go through files in plug-in directory
39    try:
40        list = os.listdir(dir)
41        for item in list:
42            toks = os.path.splitext(os.path.basename(item))
43            if toks[1]=='.py' and not toks[0]=='__init__':
44                name = toks[0]
45           
46                path = [os.path.abspath(dir)]
47                file = None
48                try:
49                    (file, path, info) = imp.find_module(name, path)
50                    module = imp.load_module( name, file, item, info )
51                    if hasattr(module, "Model"):
52                        try:
53                            plugins.append(module.Model)
54                        except:
55                            log("Error accessing Model in %s\n  %s" % (name, sys.exc_value))
56                except:
57                    log("Error accessing Model in %s\n  %s" % (name, sys.exc_value))
58                finally:
59             
60                    if not file==None:
61                        file.close()
62    except:
63        # Don't deal with bad plug-in imports. Just skip.
64        pass
65    return plugins
66
67class ModelList(object):
68    """
69        Contains dictionary of model and their type
70    """
71    def __init__(self):
72        self.mydict={}
73       
74    def set_list(self, name, mylist):
75        """
76            @param name: the type of the list
77            @param mylist: the list to add
78        """
79        if name not in self.mydict.keys():
80            self.mydict[name] = mylist
81           
82           
83    def get_list(self):
84        """
85         return all the list stored in a dictionary object
86        """
87        return self.mydict
88       
89class ModelManager:
90    ## external dict for models
91    model_combobox = ModelList()
92    ## Dictionary of form models
93    form_factor_dict = {}
94    ## dictionary of other
95    struct_factor_dict = {}
96    ##list of form factors
97    shape_list =[]
98    ## independent shape model list
99    shape_indep_list = []
100    ##list of structure factors
101    struct_list= []
102    ##list of model allowing multiplication
103    multiplication_factor=[]
104    ## list of added models
105    plugins=[]
106    ## Event owner (guiframe)
107    event_owner = None
108   
109    def _getModelList(self):
110        """
111            List of models we want to make available by default
112            for this application
113       
114            @return: the next free event ID following the new menu events
115        """
116        ## form factor
117        from sans.models.SphereModel import SphereModel
118        self.shape_list.append(SphereModel)
119        self.multiplication_factor.append(SphereModel)
120       
121        from sans.models.CoreShellModel import CoreShellModel
122        self.shape_list.append(CoreShellModel)
123       
124        from sans.models.MultiShellModel import MultiShellModel
125        self.shape_list.append(MultiShellModel)
126       
127        from sans.models.VesicleModel import VesicleModel
128        self.shape_list.append(VesicleModel)
129       
130        from sans.models.BinaryHSModel import BinaryHSModel
131        self.shape_list.append(BinaryHSModel)
132       
133        from sans.models.CylinderModel import CylinderModel
134        self.shape_list.append(CylinderModel)
135        self.multiplication_factor.append(CylinderModel)
136       
137        from sans.models.CoreShellCylinderModel import CoreShellCylinderModel
138        self.shape_list.append(CoreShellCylinderModel)
139       
140        from sans.models.HollowCylinderModel import HollowCylinderModel
141        self.shape_list.append(HollowCylinderModel)
142             
143        from sans.models.FlexibleCylinderModel import FlexibleCylinderModel
144        self.shape_list.append(FlexibleCylinderModel)
145       
146        from sans.models.StackedDisksModel import StackedDisksModel
147        self.shape_list.append(StackedDisksModel)
148       
149        from sans.models.ParallelepipedModel import ParallelepipedModel
150        self.shape_list.append(ParallelepipedModel)
151       
152        from sans.models.EllipticalCylinderModel import EllipticalCylinderModel
153        self.shape_list.append(EllipticalCylinderModel)
154       
155        from sans.models.EllipsoidModel import EllipsoidModel
156        self.shape_list.append(EllipsoidModel)
157        self.multiplication_factor.append(EllipsoidModel)
158     
159        from sans.models.CoreShellEllipsoidModel import CoreShellEllipsoidModel
160        self.shape_list.append(CoreShellEllipsoidModel)
161         
162        from sans.models.TriaxialEllipsoidModel import TriaxialEllipsoidModel
163        self.shape_list.append(TriaxialEllipsoidModel)
164       
165        from sans.models.LamellarModel import LamellarModel
166        self.shape_list.append(LamellarModel)
167       
168        from sans.models.LamellarFFHGModel import LamellarFFHGModel
169        self.shape_list.append(LamellarFFHGModel)
170       
171        from sans.models.LamellarPSModel import LamellarPSModel
172        self.shape_list.append(LamellarPSModel)
173     
174        from sans.models.LamellarPSHGModel import LamellarPSHGModel
175        self.shape_list.append(LamellarPSHGModel)
176     
177        ## Structure factor
178        from sans.models.SquareWellStructure import SquareWellStructure
179        self.struct_list.append(SquareWellStructure)
180       
181        from sans.models.HardsphereStructure import HardsphereStructure
182        self.struct_list.append(HardsphereStructure)
183         
184        from sans.models.StickyHSStructure import StickyHSStructure
185        self.struct_list.append(StickyHSStructure)
186       
187        from sans.models.HayterMSAStructure import HayterMSAStructure
188        self.struct_list.append(HayterMSAStructure)
189       
190       
191        ##shape-independent models
192        from sans.models.BEPolyelectrolyte import BEPolyelectrolyte
193        self.shape_indep_list.append(BEPolyelectrolyte )
194        self.form_factor_dict[str(wx.NewId())] =  [SphereModel]
195        from sans.models.DABModel import DABModel
196        self.shape_indep_list.append(DABModel )
197       
198        from sans.models.GuinierModel import GuinierModel
199        self.shape_indep_list.append(GuinierModel )
200       
201        from sans.models.DebyeModel import DebyeModel
202        self.shape_indep_list.append(DebyeModel )
203       
204        from sans.models.PorodModel import PorodModel
205        self.shape_indep_list.append(PorodModel )
206       
207        from sans.models.PeakGaussModel import PeakGaussModel
208        self.shape_indep_list.append(PeakGaussModel)
209       
210        from sans.models.PeakLorentzModel import PeakLorentzModel
211        self.shape_indep_list.append(PeakLorentzModel)
212       
213        from sans.models.FractalModel import FractalModel
214        class FractalAbsModel(FractalModel):
215            def _Fractal(self, x):
216                return FractalModel._Fractal(self, math.fabs(x))
217        self.shape_indep_list.append(FractalAbsModel)
218       
219        from sans.models.LorentzModel import LorentzModel
220        self.shape_indep_list.append( LorentzModel) 
221           
222        from sans.models.PowerLawModel import PowerLawModel
223        class PowerLawAbsModel(PowerLawModel):
224            def _PowerLaw(self, x):
225                try:
226                    return PowerLawModel._PowerLaw(self, math.fabs(x))
227                except:
228                    print sys.exc_value 
229        self.shape_indep_list.append( PowerLawAbsModel )
230        from sans.models.TeubnerStreyModel import TeubnerStreyModel
231        self.shape_indep_list.append(TeubnerStreyModel )
232       
233        from sans.models.LineModel import LineModel
234        self.shape_indep_list.append(LineModel)
235   
236        #Looking for plugins
237        self.plugins = findModels()
238       
239        return 0
240
241   
242    def populate_menu(self, modelmenu, event_owner):
243        """
244            Populate a menu with our models
245           
246            @param id: first menu event ID to use when binding the menu events
247            @param modelmenu: wx.Menu object to populate
248            @param event_owner: wx object to bind the menu events to
249            @return: the next free event ID following the new menu events
250        """
251        ## Fill model lists
252        self._getModelList()
253        ## store reference to model menu of guiframe
254        self.modelmenu = modelmenu
255        ## guiframe reference
256        self.event_owner = event_owner
257       
258       
259        shape_submenu = wx.Menu()
260        shape_indep_submenu = wx.Menu()
261        structure_factor = wx.Menu()
262        added_models = wx.Menu()
263        multip_models = wx.Menu()
264        ## create menu with shape
265        self._fill_simple_menu( menuinfo = ["Shapes",shape_submenu," simple shape"],
266                         list1 = self.shape_list )
267       
268        self._fill_simple_menu( menuinfo = ["Shape-Independent",shape_indep_submenu,
269                                    "List of shape-independent models"],
270                         list1 = self.shape_indep_list )
271       
272        self._fill_simple_menu( menuinfo= ["Structure Factors",structure_factor,
273                                          "List of Structure factors models" ],
274                                list1= self.struct_list )
275       
276        self._fill_simple_menu( menuinfo = ["Customized Models", added_models,
277                                            "List of additional models"],
278                                 list1= self.plugins )
279       
280        self._fill_menu(menuinfo=["P(Q)*S(Q)",multip_models,
281                                  "mulplication of 2 models"],
282                                   list1 = self.multiplication_factor ,
283                                   list2 =  self.struct_list)
284       
285       
286        return 0
287   
288    def _fill_simple_menu(self,menuinfo, list1):
289        """
290            Fill the menu with list item
291            @param modelmenu: the menu to fill
292            @param menuinfo: submenu item for the first column of this modelmenu
293                             with info.Should be a list :
294                             [name(string) , menu(wx.menu), help(string)]
295            @param list1: contains item (form factor )to fill modelmenu second column
296        """
297        if len(list1)>0:
298            self.model_combobox.set_list(menuinfo[0],list1)
299           
300            for item in list1:
301                try:
302                    id = wx.NewId() 
303                    struct_factor=item()
304                    struct_name = struct_factor.__class__.__name__
305                    if hasattr(struct_factor, "name"):
306                        struct_name = struct_factor.name
307                       
308                    menuinfo[1].Append(int(id),struct_name,struct_name)
309                    if not  item in self.struct_factor_dict.itervalues():
310                        self.struct_factor_dict[str(id)]= item
311                    wx.EVT_MENU(self.event_owner, int(id), self._on_model)
312                except:
313                    msg= "Error Occured: %s"%sys.exc_value
314                    wx.PostEvent(self.event_owner, StatusEvent(status=msg))
315               
316        id = wx.NewId()         
317        self.modelmenu.AppendMenu(id, menuinfo[0],menuinfo[1],menuinfo[2])
318       
319       
320       
321    def _fill_menu(self,menuinfo, list1,list2  ):
322        """
323            Fill the menu with list item
324            @param menuinfo: submenu item for the first column of this modelmenu
325                             with info.Should be a list :
326                             [name(string) , menu(wx.menu), help(string)]
327            @param list1: contains item (form factor )to fill modelmenu second column
328            @param list2: contains item (Structure factor )to fill modelmenu third column
329        """
330        if len(list1)>0:
331            self.model_combobox.set_list(menuinfo[0],list1)
332           
333            for item in list1:   
334                form_factor= item()
335                form_name = form_factor.__class__.__name__
336                if hasattr(form_factor, "name"):
337                    form_name = form_factor.name
338                ### store form factor to return to other users   
339                newmenu= wx.Menu()
340                if len(list2)>0:
341                    for model  in list2:
342                        id = wx.NewId()
343                        struct_factor = model()
344                        name = struct_factor.__class__.__name__
345                        if hasattr(struct_factor, "name"):
346                            name = struct_factor.name
347                        newmenu.Append(id,name, name)
348                        wx.EVT_MENU(self.event_owner, int(id), self._on_model)
349                        ## save form_fact and struct_fact
350                        self.form_factor_dict[int(id)] = [form_factor,struct_factor]
351                       
352                form_id= wx.NewId()   
353                menuinfo[1].AppendMenu(int(form_id), form_name,newmenu,menuinfo[2])
354        id=wx.NewId()
355        self.modelmenu.AppendMenu(id,menuinfo[0],menuinfo[1], menuinfo[2])
356       
357       
358       
359       
360    def _on_model(self, evt):
361        """
362            React to a model menu event
363            @param event: wx menu event
364        """
365        if int(evt.GetId()) in self.form_factor_dict.keys():
366            from sans.models.MultiplicationModel import MultiplicationModel
367            model1, model2 = self.form_factor_dict[int(evt.GetId())]
368            model = MultiplicationModel(model1, model2)
369               
370        else:
371            model= self.struct_factor_dict[str(evt.GetId())]()
372           
373        evt = ModelEvent( model= model )
374        wx.PostEvent(self.event_owner, evt)
375       
376    def get_model_list(self):   
377        """ @ return dictionary of models for fitpanel use """
378        self.model_combobox.set_list("multiplication", self.multiplication_factor)
379        return self.model_combobox
380   
381 
382       
383   
384   
385 
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.