source: sasview/sansview/perspectives/fitting/models.py @ bfe4644

ESS_GUIESS_GUI_DocsESS_GUI_batch_fittingESS_GUI_bumps_abstractionESS_GUI_iss1116ESS_GUI_iss879ESS_GUI_iss959ESS_GUI_openclESS_GUI_orderingESS_GUI_sync_sascalccostrafo411magnetic_scattrelease-4.1.1release-4.1.2release-4.2.2release_4.0.1ticket-1009ticket-1094-headlessticket-1242-2d-resolutionticket-1243ticket-1249ticket885unittest-saveload
Last change on this file since bfe4644 was bfe4644, checked in by Gervaise Alina <gervyh@…>, 15 years ago

add check for plugin model

  • Property mode set to 100644
File size: 17.5 KB
Line 
1#TODO: add comments to document this module
2#TODO: clean-up the exception handling.
3
4#TODO: clean-up the FractalAbsModel and PowerLawAbsModel menu items. Those
5#      model definitions do not belong here. They belong with the rest of the
6#      models.
7
8import wx
9import wx.lib.newevent
10import imp
11import os,sys,math
12import os.path
13from sans.models.pluginmodel import Model1DPlugin
14(ModelEvent, EVT_MODEL) = wx.lib.newevent.NewEvent()
15from sans.guicomm.events import StatusEvent 
16# Time is needed by the log method
17import time
18
19# Explicitly import from the pluginmodel module so that py2exe
20# places it in the distribution. The Model1DPlugin class is used
21# as the base class of plug-in models.
22from sans.models.pluginmodel import Model1DPlugin
23   
24def log(message):
25    out = open("plugins.log", 'a')
26    out.write("%10g%s\n" % (time.clock(), message))
27    out.close()
28
29def findModels():
30    log("looking for models in: %s/plugins" % os.getcwd())
31    if os.path.isdir('plugins'):
32        return _findModels('plugins')
33    return []
34   
35def _check_plugin(model, name):
36    """
37        Do some checking before model adding plugins in the list
38        @param model: class model to add into the plugin list
39        @param name:name of the module plugin
40        @return model: model if valid model or nothing if not valid
41    """
42    #Check is the plugin is of type Model1DPlugin
43    if not issubclass(model, Model1DPlugin):
44        msg= "Plugin %s must be of type Model1DPlugin \n"%str(name)
45        log(msg)
46        return 
47    if model.__name__!="Model":
48        msg= "Plugin %s class name must be Model \n"%str(name)
49        log(msg)
50        return 
51    try:
52        new_instance= model()
53    except:
54        msg="Plugin %s error in __init__ \n\t: %s %s\n"%(str(name),
55                                    str(sys.exc_type),sys.exc_value)
56        log(msg)
57        return
58   
59    new_instance= model() 
60    if hasattr(new_instance,"function"):
61        try:
62           value=new_instance.function()
63        except:
64           msg="Plugin %s: error writing function \n\t :%s %s\n "%(str(name),
65                                    str(sys.exc_type),sys.exc_value)
66           log(msg)
67           return
68    else:
69       msg="Plugin  %s needs a method called function \n"%str(name)
70       log(msg)
71       return 
72    return model
73 
74 
75def _findModels(dir):
76    # List of plugin objects
77    plugins = []
78    # Go through files in plug-in directory
79    try:
80        list = os.listdir(dir)
81        for item in list:
82            toks = os.path.splitext(os.path.basename(item))
83            if toks[1]=='.py' and not toks[0]=='__init__':
84                name = toks[0]
85           
86                path = [os.path.abspath(dir)]
87                file = None
88                try:
89                    (file, path, info) = imp.find_module(name, path)
90                    module = imp.load_module( name, file, item, info )
91                    if hasattr(module, "Model"):
92                        try:
93                            if _check_plugin(module.Model, name)!=None:
94                            #plugins.append(module.Model)
95                                plugins.append(module.Model)
96                        except:
97                            msg="Error accessing Model"
98                            msg+="in %s\n  %s %s\n" % (name,
99                                    str(sys.exc_type), sys.exc_value)
100                            log(msg)
101                except:
102                    msg="Error accessing Model"
103                    msg +=" in %s\n  %s %s \n" %(name,
104                                    str(sys.exc_type), sys.exc_value)
105                    log(msg)
106                finally:
107             
108                    if not file==None:
109                        file.close()
110    except:
111        # Don't deal with bad plug-in imports. Just skip.
112        pass
113    return plugins
114
115class ModelList(object):
116    """
117        Contains dictionary of model and their type
118    """
119    def __init__(self):
120        self.mydict={}
121       
122    def set_list(self, name, mylist):
123        """
124            @param name: the type of the list
125            @param mylist: the list to add
126        """
127        if name not in self.mydict.keys():
128            self.mydict[name] = mylist
129           
130           
131    def get_list(self):
132        """
133         return all the list stored in a dictionary object
134        """
135        return self.mydict
136       
137class ModelManager:
138    ## external dict for models
139    model_combobox = ModelList()
140    ## Dictionary of form models
141    form_factor_dict = {}
142    ## dictionary of other
143    struct_factor_dict = {}
144    ##list of form factors
145    shape_list =[]
146    ## independent shape model list
147    shape_indep_list = []
148    ##list of structure factors
149    struct_list= []
150    ##list of model allowing multiplication
151    multiplication_factor=[]
152    ## list of added models
153    plugins=[]
154    ## Event owner (guiframe)
155    event_owner = None
156   
157    def _getModelList(self):
158        """
159            List of models we want to make available by default
160            for this application
161       
162            @return: the next free event ID following the new menu events
163        """
164        ## form factor
165        from sans.models.SphereModel import SphereModel
166        self.shape_list.append(SphereModel)
167        self.multiplication_factor.append(SphereModel)
168       
169        from sans.models.CoreShellModel import CoreShellModel
170        self.shape_list.append(CoreShellModel)
171        self.multiplication_factor.append(CoreShellModel)
172       
173        from sans.models.VesicleModel import VesicleModel
174        self.shape_list.append(VesicleModel)
175        self.multiplication_factor.append(VesicleModel)
176       
177        from sans.models.MultiShellModel import MultiShellModel
178        self.shape_list.append(MultiShellModel)
179        self.multiplication_factor.append(MultiShellModel)
180       
181        from sans.models.BinaryHSModel import BinaryHSModel
182        self.shape_list.append(BinaryHSModel)
183       
184        from sans.models.CylinderModel import CylinderModel
185        self.shape_list.append(CylinderModel)
186        self.multiplication_factor.append(CylinderModel)
187       
188        from sans.models.CoreShellCylinderModel import CoreShellCylinderModel
189        self.shape_list.append(CoreShellCylinderModel)
190        self.multiplication_factor.append(CoreShellCylinderModel)
191       
192        from sans.models.HollowCylinderModel import HollowCylinderModel
193        self.shape_list.append(HollowCylinderModel)
194        self.multiplication_factor.append(HollowCylinderModel)
195             
196        from sans.models.FlexibleCylinderModel import FlexibleCylinderModel
197        self.shape_list.append(FlexibleCylinderModel)
198
199       
200        from sans.models.StackedDisksModel import StackedDisksModel
201        self.shape_list.append(StackedDisksModel)
202        self.multiplication_factor.append(StackedDisksModel)
203       
204        from sans.models.ParallelepipedModel import ParallelepipedModel
205        self.shape_list.append(ParallelepipedModel)
206        self.multiplication_factor.append(ParallelepipedModel)
207       
208        from sans.models.EllipticalCylinderModel import EllipticalCylinderModel
209        self.shape_list.append(EllipticalCylinderModel)
210        self.multiplication_factor.append(EllipticalCylinderModel)
211               
212        from sans.models.EllipsoidModel import EllipsoidModel
213        self.shape_list.append(EllipsoidModel)
214        self.multiplication_factor.append(EllipsoidModel)
215     
216        from sans.models.CoreShellEllipsoidModel import CoreShellEllipsoidModel
217        self.shape_list.append(CoreShellEllipsoidModel)
218        self.multiplication_factor.append(CoreShellEllipsoidModel)
219         
220        from sans.models.TriaxialEllipsoidModel import TriaxialEllipsoidModel
221        self.shape_list.append(TriaxialEllipsoidModel)
222        self.multiplication_factor.append(TriaxialEllipsoidModel)
223       
224        from sans.models.LamellarModel import LamellarModel
225        self.shape_list.append(LamellarModel)
226       
227        from sans.models.LamellarFFHGModel import LamellarFFHGModel
228        self.shape_list.append(LamellarFFHGModel)
229       
230        from sans.models.LamellarPSModel import LamellarPSModel
231        self.shape_list.append(LamellarPSModel)
232     
233        from sans.models.LamellarPSHGModel import LamellarPSHGModel
234        self.shape_list.append(LamellarPSHGModel)
235     
236        ## Structure factor
237        from sans.models.SquareWellStructure import SquareWellStructure
238        self.struct_list.append(SquareWellStructure)
239       
240        from sans.models.HardsphereStructure import HardsphereStructure
241        self.struct_list.append(HardsphereStructure)
242         
243        from sans.models.StickyHSStructure import StickyHSStructure
244        self.struct_list.append(StickyHSStructure)
245       
246        from sans.models.HayterMSAStructure import HayterMSAStructure
247        self.struct_list.append(HayterMSAStructure)
248       
249       
250        ##shape-independent models
251        from sans.models.BEPolyelectrolyte import BEPolyelectrolyte
252        self.shape_indep_list.append(BEPolyelectrolyte )
253        self.form_factor_dict[str(wx.NewId())] =  [SphereModel]
254        from sans.models.DABModel import DABModel
255        self.shape_indep_list.append(DABModel )
256       
257        from sans.models.GuinierModel import GuinierModel
258        self.shape_indep_list.append(GuinierModel )
259       
260        from sans.models.DebyeModel import DebyeModel
261        self.shape_indep_list.append(DebyeModel )
262       
263        from sans.models.PorodModel import PorodModel
264        self.shape_indep_list.append(PorodModel )
265       
266        from sans.models.PeakGaussModel import PeakGaussModel
267        self.shape_indep_list.append(PeakGaussModel)
268       
269        from sans.models.PeakLorentzModel import PeakLorentzModel
270        self.shape_indep_list.append(PeakLorentzModel)
271       
272        from sans.models.FractalModel import FractalModel
273        class FractalAbsModel(FractalModel):
274            def _Fractal(self, x):
275                return FractalModel._Fractal(self, math.fabs(x))
276        self.shape_indep_list.append(FractalAbsModel)
277       
278        from sans.models.LorentzModel import LorentzModel
279        self.shape_indep_list.append( LorentzModel) 
280           
281        from sans.models.PowerLawModel import PowerLawModel
282        class PowerLawAbsModel(PowerLawModel):
283            def _PowerLaw(self, x):
284                try:
285                    return PowerLawModel._PowerLaw(self, math.fabs(x))
286                except:
287                    print sys.exc_value 
288        self.shape_indep_list.append( PowerLawAbsModel )
289        from sans.models.TeubnerStreyModel import TeubnerStreyModel
290        self.shape_indep_list.append(TeubnerStreyModel )
291       
292        from sans.models.LineModel import LineModel
293        self.shape_indep_list.append(LineModel)
294   
295        #Looking for plugins
296        self.plugins = findModels()
297       
298        return 0
299
300   
301    def populate_menu(self, modelmenu, event_owner):
302        """
303            Populate a menu with our models
304           
305            @param id: first menu event ID to use when binding the menu events
306            @param modelmenu: wx.Menu object to populate
307            @param event_owner: wx object to bind the menu events to
308            @return: the next free event ID following the new menu events
309        """
310        ## Fill model lists
311        self._getModelList()
312        ## store reference to model menu of guiframe
313        self.modelmenu = modelmenu
314        ## guiframe reference
315        self.event_owner = event_owner
316       
317       
318        shape_submenu = wx.Menu()
319        shape_indep_submenu = wx.Menu()
320        structure_factor = wx.Menu()
321        added_models = wx.Menu()
322        multip_models = wx.Menu()
323        ## create menu with shape
324        self._fill_simple_menu( menuinfo = ["Shapes",shape_submenu," simple shape"],
325                         list1 = self.shape_list )
326       
327        self._fill_simple_menu( menuinfo = ["Shape-Independent",shape_indep_submenu,
328                                    "List of shape-independent models"],
329                         list1 = self.shape_indep_list )
330       
331        self._fill_simple_menu( menuinfo= ["Structure Factors",structure_factor,
332                                          "List of Structure factors models" ],
333                                list1= self.struct_list )
334       
335        self._fill_plugin_menu( menuinfo = ["Customized Models", added_models,
336                                            "List of additional models"],
337                                 list1= self.plugins )
338       
339        self._fill_menu(menuinfo=["P(Q)*S(Q)",multip_models,
340                                  "mulplication of 2 models"],
341                                   list1 = self.multiplication_factor ,
342                                   list2 =  self.struct_list)
343       
344       
345        return 0
346   
347    def _fill_plugin_menu(self,menuinfo, list1):
348        """
349            fill the plugin menu with costumized models
350        """
351        if len(list1)==0:
352            id = wx.NewId() 
353            msg= "No model available check plugins.log for errors to fix problem"
354            menuinfo[1].Append(int(id),"Empty",msg)
355        self._fill_simple_menu( menuinfo,list1)
356       
357       
358    def _fill_simple_menu(self,menuinfo, list1):
359        """
360            Fill the menu with list item
361            @param modelmenu: the menu to fill
362            @param menuinfo: submenu item for the first column of this modelmenu
363                             with info.Should be a list :
364                             [name(string) , menu(wx.menu), help(string)]
365            @param list1: contains item (form factor )to fill modelmenu second column
366        """
367        if len(list1)>0:
368            self.model_combobox.set_list(menuinfo[0],list1)
369           
370            for item in list1:
371                try:
372                    id = wx.NewId() 
373                    struct_factor=item()
374                    struct_name = struct_factor.__class__.__name__
375                    if hasattr(struct_factor, "name"):
376                        struct_name = struct_factor.name
377                       
378                    menuinfo[1].Append(int(id),struct_name,struct_name)
379                    if not  item in self.struct_factor_dict.itervalues():
380                        self.struct_factor_dict[str(id)]= item
381                    wx.EVT_MENU(self.event_owner, int(id), self._on_model)
382                except:
383                    msg= "Error Occured: %s"%sys.exc_value
384                    wx.PostEvent(self.event_owner, StatusEvent(status=msg))
385               
386        id = wx.NewId()         
387        self.modelmenu.AppendMenu(id, menuinfo[0],menuinfo[1],menuinfo[2])
388       
389       
390       
391    def _fill_menu(self,menuinfo, list1,list2  ):
392        """
393            Fill the menu with list item
394            @param menuinfo: submenu item for the first column of this modelmenu
395                             with info.Should be a list :
396                             [name(string) , menu(wx.menu), help(string)]
397            @param list1: contains item (form factor )to fill modelmenu second column
398            @param list2: contains item (Structure factor )to fill modelmenu third column
399        """
400        if len(list1)>0:
401            self.model_combobox.set_list(menuinfo[0],list1)
402           
403            for item in list1:   
404                form_factor= item()
405                form_name = form_factor.__class__.__name__
406                if hasattr(form_factor, "name"):
407                    form_name = form_factor.name
408                ### store form factor to return to other users   
409                newmenu= wx.Menu()
410                if len(list2)>0:
411                    for model  in list2:
412                        id = wx.NewId()
413                        struct_factor = model()
414                        name = struct_factor.__class__.__name__
415                        if hasattr(struct_factor, "name"):
416                            name = struct_factor.name
417                        newmenu.Append(id,name, name)
418                        wx.EVT_MENU(self.event_owner, int(id), self._on_model)
419                        ## save form_fact and struct_fact
420                        self.form_factor_dict[int(id)] = [form_factor,struct_factor]
421                       
422                form_id= wx.NewId()   
423                menuinfo[1].AppendMenu(int(form_id), form_name,newmenu,menuinfo[2])
424        id=wx.NewId()
425        self.modelmenu.AppendMenu(id,menuinfo[0],menuinfo[1], menuinfo[2])
426       
427       
428       
429       
430    def _on_model(self, evt):
431        """
432            React to a model menu event
433            @param event: wx menu event
434        """
435        if int(evt.GetId()) in self.form_factor_dict.keys():
436            from sans.models.MultiplicationModel import MultiplicationModel
437            model1, model2 = self.form_factor_dict[int(evt.GetId())]
438            model = MultiplicationModel(model1, model2)
439               
440        else:
441            model= self.struct_factor_dict[str(evt.GetId())]()
442           
443        evt = ModelEvent( model= model )
444        wx.PostEvent(self.event_owner, evt)
445       
446    def get_model_list(self):   
447        """ @ return dictionary of models for fitpanel use """
448        self.model_combobox.set_list("multiplication", self.multiplication_factor)
449        return self.model_combobox
450   
451 
452       
453   
454   
455 
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.