source: sasview/sansview/perspectives/fitting/models.py @ 3d25331f

ESS_GUIESS_GUI_DocsESS_GUI_batch_fittingESS_GUI_bumps_abstractionESS_GUI_iss1116ESS_GUI_iss879ESS_GUI_iss959ESS_GUI_openclESS_GUI_orderingESS_GUI_sync_sascalccostrafo411magnetic_scattrelease-4.1.1release-4.1.2release-4.2.2release_4.0.1ticket-1009ticket-1094-headlessticket-1242-2d-resolutionticket-1243ticket-1249ticket885unittest-saveload
Last change on this file since 3d25331f was e7b1ccf, checked in by Gervaise Alina <gervyh@…>, 15 years ago

put the same width for txtcrtl

  • Property mode set to 100644
File size: 14.2 KB
Line 
1#TODO: add comments to document this module
2#TODO: clean-up the exception handling.
3
4#TODO: clean-up the FractalAbsModel and PowerLawAbsModel menu items. Those
5#      model definitions do not belong here. They belong with the rest of the
6#      models.
7
8import wx
9import wx.lib.newevent
10import imp
11import os,sys,math
12import os.path
13
14(ModelEvent, EVT_MODEL) = wx.lib.newevent.NewEvent()
15from sans.guicomm.events import StatusEvent 
16# Time is needed by the log method
17import time
18
19# Explicitly import from the pluginmodel module so that py2exe
20# places it in the distribution. The Model1DPlugin class is used
21# as the base class of plug-in models.
22from sans.models.pluginmodel import Model1DPlugin
23   
24def log(message):
25    out = open("plugins.log", 'a')
26    out.write("%10g%s\n" % (time.clock(), message))
27    out.close()
28
29def findModels():
30    log("looking for models in: %s/plugins" % os.getcwd())
31    if os.path.isdir('plugins'):
32        return _findModels('plugins')
33    return []
34   
35def _findModels(dir):
36    # List of plugin objects
37    plugins = []
38    # Go through files in plug-in directory
39    try:
40        list = os.listdir(dir)
41        for item in list:
42            toks = os.path.splitext(os.path.basename(item))
43            if toks[1]=='.py' and not toks[0]=='__init__':
44                name = toks[0]
45           
46                path = [os.path.abspath(dir)]
47                file = None
48                try:
49                    (file, path, info) = imp.find_module(name, path)
50                    module = imp.load_module( name, file, item, info )
51                    if hasattr(module, "Model"):
52                        try:
53                            plugins.append(module.Model)
54                        except:
55                            log("Error accessing Model in %s\n  %s" % (name, sys.exc_value))
56                except:
57                    log("Error accessing Model in %s\n  %s" % (name, sys.exc_value))
58                finally:
59             
60                    if not file==None:
61                        file.close()
62    except:
63        # Don't deal with bad plug-in imports. Just skip.
64        pass
65    return plugins
66
67class ModelList(object):
68    """
69        Contains dictionary of model and their type
70    """
71    def __init__(self):
72        self.mydict={}
73       
74    def set_list(self, name, mylist):
75        """
76            @param name: the type of the list
77            @param mylist: the list to add
78        """
79        if name not in self.mydict.keys():
80            self.mydict[name] = mylist
81           
82           
83    def get_list(self):
84        """
85         return all the list stored in a dictionary object
86        """
87        return self.mydict
88       
89class ModelManager:
90    ## external dict for models
91    model_combobox = ModelList()
92    ## Dictionary of form models
93    form_factor_dict = {}
94    ## dictionary of other
95    struct_factor_dict = {}
96    ##list of form factors
97    shape_list =[]
98    ## independent shape model list
99    shape_indep_list = []
100    ##list of structure factors
101    struct_list= []
102    ##list of model allowing multiplication
103    multiplication_factor=[]
104    ## list of added models
105    plugins=[]
106    ## Event owner (guiframe)
107    event_owner = None
108   
109    def _getModelList(self):
110        """
111            List of models we want to make available by default
112            for this application
113       
114            @return: the next free event ID following the new menu events
115        """
116        ## form factor
117        from sans.models.SphereModel import SphereModel
118        self.shape_list.append(SphereModel)
119        self.multiplication_factor.append(SphereModel)
120       
121        from sans.models.CylinderModel import CylinderModel
122        self.shape_list.append(CylinderModel)
123        self.multiplication_factor.append(CylinderModel)
124       
125        from sans.models.ParallelepipedModel import ParallelepipedModel
126        self.shape_list.append(ParallelepipedModel)
127        self.multiplication_factor.append(ParallelepipedModel)
128       
129        from sans.models.CoreShellModel import CoreShellModel
130        self.shape_list.append(CoreShellModel)
131       
132        from sans.models.CoreShellCylinderModel import CoreShellCylinderModel
133        self.shape_list.append(CoreShellCylinderModel)
134       
135        from sans.models.EllipticalCylinderModel import EllipticalCylinderModel
136        self.shape_list.append(EllipticalCylinderModel)
137       
138        from sans.models.EllipsoidModel import EllipsoidModel
139        self.shape_list.append(EllipsoidModel)
140        self.multiplication_factor.append(EllipsoidModel)
141         
142        from sans.models.TriaxialEllipsoidModel import TriaxialEllipsoidModel
143        self.shape_list.append(TriaxialEllipsoidModel)
144       
145        from sans.models.FlexibleCylinderModel import FlexibleCylinderModel
146        self.shape_list.append(FlexibleCylinderModel)
147       
148        from sans.models.StackedDisksModel import StackedDisksModel
149        self.shape_list.append(StackedDisksModel)
150       
151        from sans.models.LamellarModel import LamellarModel
152        self.shape_list.append(LamellarModel)
153       
154        from sans.models.LamellarFFHGModel import LamellarFFHGModel
155        self.shape_list.append(LamellarFFHGModel)
156       
157        from sans.models.LamellarPSModel import LamellarPSModel
158        self.shape_list.append(LamellarPSModel)
159     
160        from sans.models.LamellarPSHGModel import LamellarPSHGModel
161        self.shape_list.append(LamellarPSHGModel)
162     
163        from sans.models.OblateModel import OblateModel
164        self.shape_list.append(OblateModel)
165       
166        from sans.models.ProlateModel import ProlateModel
167        self.shape_list.append(ProlateModel)
168     
169        ## Structure factor
170        from sans.models.SquareWellStructure import SquareWellStructure
171        self.struct_list.append(SquareWellStructure)
172       
173        from sans.models.HardsphereStructure import HardsphereStructure
174        self.struct_list.append(HardsphereStructure)
175         
176        from sans.models.StickyHSStructure import StickyHSStructure
177        self.struct_list.append(StickyHSStructure)
178       
179        from sans.models.HayterMSAStructure import HayterMSAStructure
180        self.struct_list.append(HayterMSAStructure)
181       
182       
183        ##shape-independent models
184        from sans.models.BEPolyelectrolyte import BEPolyelectrolyte
185        self.shape_indep_list.append(BEPolyelectrolyte )
186        self.form_factor_dict[str(wx.NewId())] =  [SphereModel]
187        from sans.models.DABModel import DABModel
188        self.shape_indep_list.append(DABModel )
189       
190        from sans.models.GuinierModel import GuinierModel
191        self.shape_indep_list.append(GuinierModel )
192       
193        from sans.models.DebyeModel import DebyeModel
194        self.shape_indep_list.append(DebyeModel )
195       
196        from sans.models.PorodModel import PorodModel
197        self.shape_indep_list.append(PorodModel )
198       
199        from sans.models.LineModel import LineModel
200        self.shape_indep_list.append(LineModel)
201       
202        from sans.models.FractalModel import FractalModel
203        class FractalAbsModel(FractalModel):
204            def _Fractal(self, x):
205                return FractalModel._Fractal(self, math.fabs(x))
206        self.shape_indep_list.append(FractalAbsModel)
207       
208        from sans.models.LorentzModel import LorentzModel
209        self.shape_indep_list.append( LorentzModel) 
210           
211        from sans.models.PowerLawModel import PowerLawModel
212        class PowerLawAbsModel(PowerLawModel):
213            def _PowerLaw(self, x):
214                try:
215                    return PowerLawModel._PowerLaw(self, math.fabs(x))
216                except:
217                    print sys.exc_value 
218        self.shape_indep_list.append( PowerLawAbsModel )
219        from sans.models.TeubnerStreyModel import TeubnerStreyModel
220        self.shape_indep_list.append(TeubnerStreyModel )
221   
222        #Looking for plugins
223        self.plugins = findModels()
224       
225        return 0
226
227   
228    def populate_menu(self, modelmenu, event_owner):
229        """
230            Populate a menu with our models
231           
232            @param id: first menu event ID to use when binding the menu events
233            @param modelmenu: wx.Menu object to populate
234            @param event_owner: wx object to bind the menu events to
235            @return: the next free event ID following the new menu events
236        """
237        ## Fill model lists
238        self._getModelList()
239        ## store reference to model menu of guiframe
240        self.modelmenu = modelmenu
241        ## guiframe reference
242        self.event_owner = event_owner
243       
244       
245        shape_submenu = wx.Menu()
246        shape_indep_submenu = wx.Menu()
247        structure_factor = wx.Menu()
248        added_models = wx.Menu()
249        multip_models = wx.Menu()
250        ## create menu with shape
251        self._fill_simple_menu( menuinfo = ["Shapes",shape_submenu," simple shape"],
252                         list1 = self.shape_list )
253       
254        self._fill_simple_menu( menuinfo = ["Shape-Independent",shape_indep_submenu,
255                                    "List of shape-independent models"],
256                         list1 = self.shape_indep_list )
257       
258        self._fill_simple_menu( menuinfo= ["Structure Factors",structure_factor,
259                                          "List of Structure factors models" ],
260                                list1= self.struct_list )
261       
262        self._fill_simple_menu( menuinfo = ["Customized Models", added_models,
263                                            "List of additional models"],
264                                 list1= self.plugins )
265       
266        self._fill_menu(menuinfo=["P(Q)*S(Q)",multip_models,
267                                  "mulplication of 2 models"],
268                                   list1 = self.multiplication_factor ,
269                                   list2 =  self.struct_list)
270       
271       
272        return 0
273   
274    def _fill_simple_menu(self,menuinfo, list1):
275        """
276            Fill the menu with list item
277            @param modelmenu: the menu to fill
278            @param menuinfo: submenu item for the first column of this modelmenu
279                             with info.Should be a list :
280                             [name(string) , menu(wx.menu), help(string)]
281            @param list1: contains item (form factor )to fill modelmenu second column
282        """
283        if len(list1)>0:
284            self.model_combobox.set_list(menuinfo[0],list1)
285           
286            for item in list1:
287                try:
288                    id = wx.NewId() 
289                    struct_factor=item()
290                    struct_name = struct_factor.__class__.__name__
291                    if hasattr(struct_factor, "name"):
292                        struct_name = struct_factor.name
293                       
294                    menuinfo[1].Append(int(id),struct_name,struct_name)
295                    if not  item in self.struct_factor_dict.itervalues():
296                        self.struct_factor_dict[str(id)]= item
297                    wx.EVT_MENU(self.event_owner, int(id), self._on_model)
298                except:
299                    msg= "Error Occured: %s"%sys.exc_value
300                    wx.PostEvent(self.event_owner, StatusEvent(status=msg))
301               
302        id = wx.NewId()         
303        self.modelmenu.AppendMenu(id, menuinfo[0],menuinfo[1],menuinfo[2])
304       
305       
306       
307    def _fill_menu(self,menuinfo, list1,list2  ):
308        """
309            Fill the menu with list item
310            @param menuinfo: submenu item for the first column of this modelmenu
311                             with info.Should be a list :
312                             [name(string) , menu(wx.menu), help(string)]
313            @param list1: contains item (form factor )to fill modelmenu second column
314            @param list2: contains item (Structure factor )to fill modelmenu third column
315        """
316        if len(list1)>0:
317            self.model_combobox.set_list(menuinfo[0],list1)
318           
319            for item in list1:   
320                form_factor= item()
321                form_name = form_factor.__class__.__name__
322                if hasattr(form_factor, "name"):
323                    form_name = form_factor.name
324                ### store form factor to return to other users   
325                newmenu= wx.Menu()
326                if len(list2)>0:
327                    for model  in list2:
328                        id = wx.NewId()
329                        struct_factor = model()
330                        name = struct_factor.__class__.__name__
331                        if hasattr(struct_factor, "name"):
332                            name = struct_factor.name
333                        newmenu.Append(id,name, name)
334                        wx.EVT_MENU(self.event_owner, int(id), self._on_model)
335                        ## save form_fact and struct_fact
336                        self.form_factor_dict[int(id)] = [form_factor,struct_factor]
337                       
338                form_id= wx.NewId()   
339                menuinfo[1].AppendMenu(int(form_id), form_name,newmenu,menuinfo[2])
340        id=wx.NewId()
341        self.modelmenu.AppendMenu(id,menuinfo[0],menuinfo[1], menuinfo[2])
342       
343       
344       
345       
346    def _on_model(self, evt):
347        """
348            React to a model menu event
349            @param event: wx menu event
350        """
351        if int(evt.GetId()) in self.form_factor_dict.keys():
352            from sans.models.MultiplicationModel import MultiplicationModel
353            model1, model2 = self.form_factor_dict[int(evt.GetId())]
354            model = MultiplicationModel(model1, model2)
355               
356        else:
357            model= self.struct_factor_dict[str(evt.GetId())]()
358           
359        evt = ModelEvent( model= model )
360        wx.PostEvent(self.event_owner, evt)
361       
362    def get_model_list(self):   
363        """ @ return dictionary of models for fitpanel use """
364        self.model_combobox.set_list("multiplication", self.multiplication_factor)
365        return self.model_combobox
366   
367 
368       
369   
370   
371 
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.