source: sasview/sansview/perspectives/fitting/model_thread.py @ a6a7e8a

ESS_GUIESS_GUI_DocsESS_GUI_batch_fittingESS_GUI_bumps_abstractionESS_GUI_iss1116ESS_GUI_iss879ESS_GUI_iss959ESS_GUI_openclESS_GUI_orderingESS_GUI_sync_sascalccostrafo411magnetic_scattrelease-4.1.1release-4.1.2release-4.2.2release_4.0.1ticket-1009ticket-1094-headlessticket-1242-2d-resolutionticket-1243ticket-1249ticket885unittest-saveload
Last change on this file since a6a7e8a was f50330b7, checked in by Jae Cho <jhjcho@…>, 15 years ago

Reverted the previous code, but still cut off the output from smearer outside of the Qrange.
  • Property mode set to 100644
File size: 10.4 KB
Line 
1import time
2from data_util.calcthread import CalcThread
3import sys
4import numpy,math
5
6class Calc2D_all(CalcThread):
7    """
8        Compute 2D model
9        This calculation assumes a 2-fold symmetry of the model
10        where points are computed for one half of the detector
11        and I(qx, qy) = I(-qx, -qy) is assumed.
12    """
13   
14    def __init__(self, x, y, model,
15                 completefn = None,
16                 updatefn   = None,
17                 yieldtime  = 0.01,
18                 worktime   = 0.01
19                 ):
20        CalcThread.__init__(self,completefn,
21                 updatefn,
22                 yieldtime,
23                 worktime)
24       
25        self.x = x
26        self.y = y
27        self.model = model
28        self.starttime = 0
29       
30    def compute(self):
31        x = self.x
32        y = self.y
33        output = numpy.zeros((len(x),len(y)))
34           
35        self.starttime = time.time()
36        lx = len(self.x)
37       
38        #for i_x in range(int(len(self.x)/2)):
39        for i_x in range(len(self.x)):
40            if i_x%2==1:
41                continue
42           
43            # Check whether we need to bail out
44            self.update(output=output)
45            self.isquit()
46               
47            for i_y in range(len(self.y)):
48                value = self.model.runXY([self.x[i_x], self.y[i_y]])
49                output[i_y][i_x] = value
50                #output[lx-i_y-1][lx-i_x-1] = value
51               
52        if lx%2==1:
53            i_x = int(len(self.x)/2)
54            for i_y in range(len(self.y)):
55                value = self.model.runXY([self.x[i_x], self.y[i_y]])
56                output[i_y][i_x] = value
57               
58        #for i_x in range(int(len(self.x)/2)):
59        for i_x in range(len(self.x)):
60            if not i_x%2==1:
61                continue
62
63            # Check whether we need to bail out
64            self.update(output=output)
65            self.isquit()
66           
67            for i_y in range(len(self.y)):
68                value = self.model.runXY([self.x[i_x], self.y[i_y]])
69                output[i_y][i_x] = value
70                #output[lx-i_y-1][lx-i_x-1] = value
71           
72        elapsed = time.time()-self.starttime
73        self.complete(output=output, elapsed=elapsed)
74
75
76class Calc2D(CalcThread):
77    """
78        Compute 2D model
79        This calculation assumes a 2-fold symmetry of the model
80        where points are computed for one half of the detector
81        and I(qx, qy) = I(-qx, -qy) is assumed.
82    """
83   
84    def __init__(self, x, y, data,model,qmin, qmax,qstep,
85                 completefn = None,
86                 updatefn   = None,
87                 yieldtime  = 0.01,
88                 worktime   = 0.01
89                 ):
90        CalcThread.__init__(self,completefn,
91                 updatefn,
92                 yieldtime,
93                 worktime)
94        self.qmin= qmin
95        self.qmax= qmax
96        self.qstep= qstep
97        self.x = x
98        self.y = y
99        self.data= data
100        ## the model on to calculate
101        self.model = model
102        self.starttime = 0 
103       
104    def compute(self):
105        """
106            Compute the data given a model function
107        """
108     
109        output = numpy.zeros((len(self.x),len(self.y)))
110        if self.qmin==None:
111            self.qmin = 0
112        if self.qmax== None:
113            if self.data !=None:
114                newx= math.pow(max(math.fabs(self.data.xmax),math.fabs(self.data.xmin)),2)
115                newy= math.pow(max(math.fabs(self.data.ymax),math.fabs(self.data.ymin)),2)
116                self.qmax=math.sqrt( newx + newy )
117     
118       
119        self.starttime = time.time()
120        lx = len(self.x)
121        for i_x in range(len(self.x)):
122            # Check whether we need to bail out
123            self.update(output=output )
124            self.isquit()
125       
126            for i_y in range(int(len(self.y))):
127                radius = math.sqrt(self.x[i_x]*self.x[i_x]+self.y[i_y]*self.y[i_y])
128                ## for data ignore the qmax
129                if self.data == None:
130                    if  self.qmin <= radius :
131                        value = self.model.runXY( [self.x[i_x], self.y[i_y]] )
132                        output[i_y][i_x] =value   
133                    else:
134                        output[i_y][i_x] =0   
135                else: 
136                    if  self.qmin <= radius and radius<= self.qmax:
137                        value = self.model.runXY( [self.x[i_x], self.y[i_y]] )
138                        output[i_y][i_x] =value   
139                    else:
140                        output[i_y][i_x] =0   
141           
142        elapsed = time.time()-self.starttime
143        self.complete( image = output,
144                       data = self.data , 
145                       model = self.model,
146                       elapsed = elapsed,
147                       qmin = self.qmin,
148                       qmax =self.qmax,
149                       qstep = self.qstep )
150
151
152class Calc2D_4fold(CalcThread):
153    """
154        Compute 2D model
155        This calculation assumes a 4-fold symmetry of the model.
156        Really is the same calculation time since we have to
157        calculate points for 0<phi<pi anyway.
158    """
159   
160    def __init__(self, x, y, model,
161                 completefn = None,
162                 updatefn   = None,
163                 yieldtime  = 0.01,
164                 worktime   = 0.01
165                 ):
166        CalcThread.__init__(self,completefn,
167                 updatefn,
168                 yieldtime,
169                 worktime)
170        self.x = x
171        self.y = y
172        self.model = model
173        self.starttime = 0
174       
175    def compute(self):
176        x = self.x
177        y = self.y
178        output = numpy.zeros((len(x),len(y)))
179           
180        self.starttime = time.time()
181        lx = len(self.x)
182       
183        for i_x in range(int(len(self.x)/2)):
184            if i_x%2==1:
185                continue
186           
187            # Check whether we need to bail out
188            self.update(output=output)
189            self.isquit()
190               
191            for i_y in range(int(len(self.y)/2)):
192                value1 = self.model.runXY([self.x[i_x], self.y[i_y]])
193                value2 = self.model.runXY([self.x[i_x], self.y[lx-i_y-1]])
194                output[i_y][i_x] = value1 + value2
195                output[lx-i_y-1][lx-i_x-1] = value1 + value2
196                output[lx-i_y-1][i_x] = value1 + value2
197                output[i_y][lx-i_x-1] = value1 + value2
198               
199        if lx%2==1:
200            i_x = int(len(self.x)/2)
201            for i_y in range(int(len(self.y)/2)):
202                value1 = self.model.runXY([self.x[i_x], self.y[i_y]])
203                value2 = self.model.runXY([self.x[i_x], self.y[lx-i_y-1]])
204                output[i_y][i_x] = value1 + value2
205                output[lx-i_y-1][lx-i_x-1] = value1 + value2
206                output[lx-i_y-1][i_x] = value1 + value2
207                output[i_y][lx-i_x-1] = value1 + value2
208               
209        for i_x in range(int(len(self.x)/2)):
210            if not i_x%2==1:
211                continue
212
213            # Check whether we need to bail out
214            self.update(output=output)
215            self.isquit()
216           
217            for i_y in range(int(len(self.y)/2)):
218                value1 = self.model.runXY([self.x[i_x], self.y[i_y]])
219                value2 = self.model.runXY([self.x[i_x], self.y[lx-i_y-1]])
220                output[i_y][i_x] = value1 + value2
221                output[lx-i_y-1][lx-i_x-1] = value1 + value2
222                output[lx-i_y-1][i_x] = value1 + value2
223                output[i_y][lx-i_x-1] = value1 + value2
224           
225        elapsed = time.time()-self.starttime
226        self.complete(output=output, elapsed=elapsed)
227
228
229
230class Calc1D(CalcThread):
231    """Compute 1D data"""
232   
233    def __init__(self, x, model,
234                 data=None,
235                 qmin=None,
236                 qmax=None,
237                 smearer=None,
238                 completefn = None,
239                 updatefn   = None,
240                 yieldtime  = 0.01,
241                 worktime   = 0.01
242                 ):
243        CalcThread.__init__(self,completefn,
244                 updatefn,
245                 yieldtime,
246                 worktime)
247        self.x = x
248        self.data= data
249        self.qmin= qmin
250        self.qmax= qmax
251        self.model = model
252        self.smearer= smearer
253        self.starttime = 0
254       
255    def compute(self):
256        """
257            Compute model 1d value given qmin , qmax , x value
258        """
259        output = numpy.zeros(len(self.x))
260       
261        self.starttime = time.time()
262       
263        for i_x in range(len(self.x)):
264            self.update(x= self.x, output=output )
265            # Check whether we need to bail out
266            self.isquit()
267            if self.qmin <= self.x[i_x] and self.x[i_x] <= self.qmax:
268                value = self.model.run(self.x[i_x])
269                output[i_x] = value
270
271        ##smearer the ouput of the plot   
272        if self.smearer!=None:
273            output = self.smearer(output) #Todo: Why always output[0]=0???
274       
275        ######Temp. FIX for Qrange w/ smear. #ToDo: Should not pass all the data to 'run' or 'smear'...
276        for i_x in range(len(self.x)):
277            if self.qmin > self.x[i_x] or self.x[i_x] > self.qmax:
278                output[i_x] = None
279               
280        elapsed = time.time()-self.starttime
281        self.complete(x= self.x, y= output, 
282                      elapsed=elapsed, model= self.model, data=self.data)
283       
284       
285
286class CalcCommandline:
287    def __init__(self, n=20000):
288        #print thread.get_ident()
289        from sans.models.CylinderModel import CylinderModel
290       
291        model = CylinderModel()
292       
293         
294        print model.runXY([0.01, 0.02])
295       
296        qmax = 0.01
297        qstep = 0.0001
298        self.done = False
299       
300        x = numpy.arange(-qmax, qmax+qstep*0.01, qstep)
301        y = numpy.arange(-qmax, qmax+qstep*0.01, qstep)
302   
303   
304        calc_thread_2D = Calc2D(x, y, None, model.clone(),-qmax, qmax,qstep,
305                                        completefn=self.complete,
306                                        updatefn=self.update ,
307                                        yieldtime=0.0)
308     
309        calc_thread_2D.queue()
310        calc_thread_2D.ready(2.5)
311       
312        while not self.done:
313            time.sleep(1)
314
315    def update(self,output):
316        print "update"
317
318    def complete(self, image, data, model, elapsed, qmin, qmax, qstep ):
319        print "complete"
320        self.done = True
321
322if __name__ == "__main__":
323    CalcCommandline()
324   
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.