source: sasview/sansview/perspectives/fitting/model_thread.py @ 904713c

ESS_GUIESS_GUI_DocsESS_GUI_batch_fittingESS_GUI_bumps_abstractionESS_GUI_iss1116ESS_GUI_iss879ESS_GUI_iss959ESS_GUI_openclESS_GUI_orderingESS_GUI_sync_sascalccostrafo411magnetic_scattrelease-4.1.1release-4.1.2release-4.2.2release_4.0.1ticket-1009ticket-1094-headlessticket-1242-2d-resolutionticket-1243ticket-1249ticket885unittest-saveload
Last change on this file since 904713c was 904713c, checked in by Mathieu Doucet <doucetm@…>, 15 years ago

Cleaned up obvious flaws: still needs work
  • Property mode set to 100644
File size: 9.8 KB
Line 
1import time
2from calcthread import CalcThread
3import sys
4import numpy
5
6class Calc2D_all(CalcThread):
7    """
8        Compute 2D model
9        This calculation assumes a 2-fold symmetry of the model
10        where points are computed for one half of the detector
11        and I(qx, qy) = I(-qx, -qy) is assumed.
12    """
13   
14    def __init__(self, x, y, model,
15                 completefn = None,
16                 updatefn   = None,
17                 yieldtime  = 0.01,
18                 worktime   = 0.01
19                 ):
20        CalcThread.__init__(self,completefn,
21                 updatefn,
22                 yieldtime,
23                 worktime)
24       
25        self.x = x
26        self.y = y
27        self.model = model
28        self.starttime = 0
29       
30    def compute(self):
31        x = self.x
32        y = self.y
33        output = numpy.zeros((len(x),len(y)))
34           
35        self.starttime = time.time()
36        lx = len(self.x)
37       
38        #for i_x in range(int(len(self.x)/2)):
39        for i_x in range(len(self.x)):
40            if i_x%2==1:
41                continue
42           
43            # Check whether we need to bail out
44            self.update(output=output)
45            self.isquit()
46               
47            for i_y in range(len(self.y)):
48                value = self.model.runXY([self.x[i_x], self.y[i_y]])
49                output[i_y][i_x] = value
50                #output[lx-i_y-1][lx-i_x-1] = value
51               
52        if lx%2==1:
53            i_x = int(len(self.x)/2)
54            for i_y in range(len(self.y)):
55                value = self.model.runXY([self.x[i_x], self.y[i_y]])
56                output[i_y][i_x] = value
57               
58        #for i_x in range(int(len(self.x)/2)):
59        for i_x in range(len(self.x)):
60            if not i_x%2==1:
61                continue
62
63            # Check whether we need to bail out
64            self.update(output=output)
65            self.isquit()
66           
67            for i_y in range(len(self.y)):
68                value = self.model.runXY([self.x[i_x], self.y[i_y]])
69                output[i_y][i_x] = value
70                #output[lx-i_y-1][lx-i_x-1] = value
71           
72        elapsed = time.time()-self.starttime
73        self.complete(output=output, elapsed=elapsed)
74
75
76class Calc2D(CalcThread):
77    """
78        Compute 2D model
79        This calculation assumes a 2-fold symmetry of the model
80        where points are computed for one half of the detector
81        and I(qx, qy) = I(-qx, -qy) is assumed.
82    """
83   
84    def __init__(self, x, y, data,model,qmin, qmax,qstep,
85                 completefn = None,
86                 updatefn   = None,
87                 yieldtime  = 0.01,
88                 worktime   = 0.01
89                 ):
90        CalcThread.__init__(self,completefn,
91                 updatefn,
92                 yieldtime,
93                 worktime)
94        self.qmin= qmin
95        self.qmax= qmax
96        self.qstep= qstep
97        self.x = x
98        self.y = y
99        self.data= data
100        ## the model on to calculate
101        self.model = model
102        self.starttime = 0 
103       
104    def compute(self):
105        """
106            Compute the data given a model function
107        """
108        x = self.x
109        y = self.y
110        output = numpy.zeros((len(x),len(y)))
111       
112        if self.qmin==None:
113            self.qmin = 0
114        if self.qmax== None:
115            if self.data ==None:
116                return
117            newx= math.pow(max(math.fabs(self.data.xmax),math.fabs(self.data.xmin)),2)
118            newy= math.pow(max(math.fabs(self.data.ymax),math.fabs(self.data.ymin)),2)
119            self.qmax=math.sqrt( newx + newy )
120       
121        self.starttime = time.time()
122       
123        lx = len(self.x)
124        for i_x in range(len(self.x)):
125            # Check whether we need to bail out
126            self.update(output=output )
127            self.isquit()
128       
129            for i_y in range(int(len(self.y))):
130                radius = self.x[i_x]*self.x[i_x]+self.y[i_y]*self.y[i_y]
131               
132                if  self.qmin <= radius or radius<= self.qmax:
133                    value = self.model.runXY( [self.x[i_x], self.y[i_y]] )
134                    output[i_x] [i_y]=value   
135                else:
136                     output[i_x] [i_y]=0   
137           
138        elapsed = time.time()-self.starttime
139        self.complete( image = output,
140                       data = self.data , 
141                       model = self.model,
142                       elapsed = elapsed,
143                       qmin = self.qmin,
144                       qmax =self.qmax,
145                       qstep = self.qstep )
146
147
148class Calc2D_4fold(CalcThread):
149    """
150        Compute 2D model
151        This calculation assumes a 4-fold symmetry of the model.
152        Really is the same calculation time since we have to
153        calculate points for 0<phi<pi anyway.
154    """
155   
156    def __init__(self, x, y, model,
157                 completefn = None,
158                 updatefn   = None,
159                 yieldtime  = 0.01,
160                 worktime   = 0.01
161                 ):
162        CalcThread.__init__(self,completefn,
163                 updatefn,
164                 yieldtime,
165                 worktime)
166        self.x = x
167        self.y = y
168        self.model = model
169        self.starttime = 0
170       
171    def compute(self):
172        x = self.x
173        y = self.y
174        output = numpy.zeros((len(x),len(y)))
175           
176        self.starttime = time.time()
177        lx = len(self.x)
178       
179        for i_x in range(int(len(self.x)/2)):
180            if i_x%2==1:
181                continue
182           
183            # Check whether we need to bail out
184            self.update(output=output)
185            self.isquit()
186               
187            for i_y in range(int(len(self.y)/2)):
188                value1 = self.model.runXY([self.x[i_x], self.y[i_y]])
189                value2 = self.model.runXY([self.x[i_x], self.y[lx-i_y-1]])
190                output[i_y][i_x] = value1 + value2
191                output[lx-i_y-1][lx-i_x-1] = value1 + value2
192                output[lx-i_y-1][i_x] = value1 + value2
193                output[i_y][lx-i_x-1] = value1 + value2
194               
195        if lx%2==1:
196            i_x = int(len(self.x)/2)
197            for i_y in range(int(len(self.y)/2)):
198                value1 = self.model.runXY([self.x[i_x], self.y[i_y]])
199                value2 = self.model.runXY([self.x[i_x], self.y[lx-i_y-1]])
200                output[i_y][i_x] = value1 + value2
201                output[lx-i_y-1][lx-i_x-1] = value1 + value2
202                output[lx-i_y-1][i_x] = value1 + value2
203                output[i_y][lx-i_x-1] = value1 + value2
204               
205        for i_x in range(int(len(self.x)/2)):
206            if not i_x%2==1:
207                continue
208
209            # Check whether we need to bail out
210            self.update(output=output)
211            self.isquit()
212           
213            for i_y in range(int(len(self.y)/2)):
214                value1 = self.model.runXY([self.x[i_x], self.y[i_y]])
215                value2 = self.model.runXY([self.x[i_x], self.y[lx-i_y-1]])
216                output[i_y][i_x] = value1 + value2
217                output[lx-i_y-1][lx-i_x-1] = value1 + value2
218                output[lx-i_y-1][i_x] = value1 + value2
219                output[i_y][lx-i_x-1] = value1 + value2
220           
221        elapsed = time.time()-self.starttime
222        self.complete(output=output, elapsed=elapsed)
223
224
225
226class Calc1D(CalcThread):
227    """Compute 1D data"""
228   
229    def __init__(self, x, model,
230                 data=None,
231                 qmin=None,
232                 qmax=None,
233                 smearer=None,
234                 completefn = None,
235                 updatefn   = None,
236                 yieldtime  = 0.01,
237                 worktime   = 0.01
238                 ):
239        CalcThread.__init__(self,completefn,
240                 updatefn,
241                 yieldtime,
242                 worktime)
243        self.x = x
244        self.data= data
245        self.qmin= qmin
246        self.qmax= qmax
247        self.model = model
248        self.smearer= smearer
249        self.starttime = 0
250       
251    def compute(self):
252        """
253            Compute model 1d value given qmin , qmax , x value
254        """
255        output = numpy.zeros(len(self.x))
256       
257        self.starttime = time.time()
258       
259        for i_x in range(len(self.x)):
260            self.update(x= self.x, output=output )
261            # Check whether we need to bail out
262            self.isquit()
263            if self.qmin <= self.x[i_x] and self.x[i_x] <= self.qmax:
264                value = self.model.run(self.x[i_x])
265                output[i_x] = value
266               
267        if self.smearer!=None:
268            output = self.smearer(output)
269           
270                     
271        elapsed = time.time()-self.starttime
272        self.complete(x= self.x, y= output, 
273                      elapsed=elapsed, model= self.model, data=self.data)
274       
275       
276
277class CalcCommandline:
278    def __init__(self, n=20000):
279        #print thread.get_ident()
280        from sans.models.CylinderModel import CylinderModel
281       
282        model = CylinderModel()
283       
284         
285        print model.runXY([0.01, 0.02])
286       
287        qmax = 0.01
288        qstep = 0.0001
289        self.done = False
290       
291        x = numpy.arange(-qmax, qmax+qstep*0.01, qstep)
292        y = numpy.arange(-qmax, qmax+qstep*0.01, qstep)
293   
294   
295        calc_thread_2D = Calc2D(x, y, None, model.clone(),-qmax, qmax,qstep,
296                                        completefn=self.complete,
297                                        updatefn=self.update ,
298                                        yieldtime=0.0)
299     
300        calc_thread_2D.queue()
301        calc_thread_2D.ready(2.5)
302       
303        while not self.done:
304            time.sleep(1)
305
306    def update(self,output):
307        print "update"
308
309    def complete(self, image, data, model, elapsed, qmin, qmax, qstep ):
310        print "complete"
311        self.done = True
312
313if __name__ == "__main__":
314    CalcCommandline()
315   
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.