source: sasview/sansview/perspectives/fitting/fitpage.py @ 875f1a2

ESS_GUIESS_GUI_DocsESS_GUI_batch_fittingESS_GUI_bumps_abstractionESS_GUI_iss1116ESS_GUI_iss879ESS_GUI_iss959ESS_GUI_openclESS_GUI_orderingESS_GUI_sync_sascalccostrafo411magnetic_scattrelease-4.1.1release-4.1.2release-4.2.2release_4.0.1ticket-1009ticket-1094-headlessticket-1242-2d-resolutionticket-1243ticket-1249ticket885unittest-saveload
Last change on this file since 875f1a2 was 875f1a2, checked in by Jae Cho <jhjcho@…>, 15 years ago

fixed simple bug

  • Property mode set to 100644
File size: 44.9 KB
Line 
1import sys
2import wx
3import wx.lib.newevent
4import numpy
5import copy
6import math
7from sans.models.dispersion_models import ArrayDispersion, GaussianDispersion
8
9from sans.guicomm.events import StatusEvent   
10from sans.guiframe.utils import format_number,check_float
11
12## event to post model to fit to fitting plugins
13(ModelEventbox, EVT_MODEL_BOX) = wx.lib.newevent.NewEvent()
14
15## event to know the selected fit engine
16(FitterTypeEvent, EVT_FITTER_TYPE)   = wx.lib.newevent.NewEvent()
17_BOX_WIDTH = 80
18
19import basepage
20from basepage import BasicPage
21from basepage import PageInfoEvent
22
23
24class FitPage(BasicPage):
25    """
26        FitPanel class contains fields allowing to display results when
27        fitting  a model and one data
28        @note: For Fit to be performed the user should check at least one parameter
29        on fit Panel window.
30 
31    """
32    def __init__(self,parent, page_info):
33        BasicPage.__init__(self, parent, page_info)
34        """
35            Initialization of the Panel
36        """
37        ## fit page does not content npts txtcrtl
38        self.npts=None
39        ## if no dispersity parameters is avaible
40        self.text_disp_1=None
41        ## default fitengine type
42        self.engine_type = None
43        ## draw sizer
44        self._fill_datainfo_sizer()
45        self._fill_model_sizer( self.sizer1)
46        self._fill_range_sizer() 
47        self._on_select_model(event=None)
48   
49        ## to update the panel according to the fit engine type selected
50        self.Bind(EVT_FITTER_TYPE,self._on_engine_change)
51   
52   
53    def _on_engine_change(self, event):
54        """
55            get an event containing the current name of the fit engine type
56            @param event: FitterTypeEvent containing  the name of the current engine
57        """
58        self.engine_type = event.type
59         
60        if len(self.parameters)==0:
61            return
62        for item in self.parameters:
63            if event.type =="scipy":
64                item[5].SetValue("")
65                item[5].Hide()
66                item[6].SetValue("")
67                item[6].Hide()
68                self.text2_min.Hide()
69                self.text2_max.Hide()
70            else:
71                item[5].Show(True)
72                item[6].Show(True)
73                self.text2_min.Show(True)
74                self.text2_max.Show(True)
75               
76        self.sizer3.Layout()
77        self.SetScrollbars(20,20,200,100)
78       
79   
80    def _fill_range_sizer(self):
81        """
82            Fill the sizer containing the plotting range
83            add  access to npts
84        """
85        sizer_fit = wx.GridSizer(1, 1,0, 0)
86   
87        self.btFit = wx.Button(self,wx.NewId(),'Fit')
88        self.btFit.Bind(wx.EVT_BUTTON, self._onFit,id= self.btFit.GetId())
89        self.btFit.SetToolTipString("Perform fit.")
90     
91       
92        sizer_fit.Add((5,5),1, wx.LEFT|wx.EXPAND|wx.ADJUST_MINSIZE, 5)       
93        sizer_fit.Add(self.btFit,0, wx.LEFT|wx.EXPAND|wx.ADJUST_MINSIZE, 5) 
94       
95        sizer_smearer = wx.BoxSizer(wx.HORIZONTAL)
96        #Filling the sizer containing instruments smearing info.
97        self.disable_smearer = wx.RadioButton(self, -1, 'No', style=wx.RB_GROUP)
98        self.enable_smearer = wx.RadioButton(self, -1, 'Yes')
99        self.Bind(wx.EVT_RADIOBUTTON, self.onSmear, id=self.disable_smearer.GetId())
100        self.Bind(wx.EVT_RADIOBUTTON, self.onSmear, id=self.enable_smearer.GetId())
101       
102        sizer_smearer.Add(wx.StaticText(self,-1,'Instrument Smearing? '))
103        sizer_smearer.Add((10, 10))
104        sizer_smearer.Add( self.enable_smearer )
105        sizer_smearer.Add((10,10))
106        sizer_smearer.Add( self.disable_smearer )
107       
108        #Display Chi^2/dof
109        sizer_smearer.Add((70,10))
110        box_description= wx.StaticBox(self, -1,'Chi2/dof')
111        boxsizer1 = wx.StaticBoxSizer(box_description, wx.VERTICAL)
112        boxsizer1.SetMinSize((60,-1))
113        self.tcChi    =  wx.StaticText(self, -1, "-", style=wx.ALIGN_LEFT)       
114        boxsizer1.Add( self.tcChi )   
115        sizer_smearer.Add( boxsizer1 )
116               
117        #Set sizer for Fitting section
118        self._set_range_sizer( title="Fitting",
119                               object1=sizer_smearer, object= sizer_fit)
120 
121       
122    def _fill_datainfo_sizer(self):
123        """
124            fill sizer 0 with data info
125        """
126        self.sizer0.Clear(True)
127        ## no loaded data , don't fill the sizer
128        if self.data== None:
129            self.sizer0.Layout()
130            return
131       
132        box_description= wx.StaticBox(self, -1, 'Data')
133        boxsizer1 = wx.StaticBoxSizer(box_description, wx.VERTICAL)
134        #----------------------------------------------------------
135        sizer_data = wx.GridSizer(3, 3,5, 5)
136        #Filling the sizer containing data related fields
137        DataSource  =wx.StaticText(self, -1,str(self.data.name))
138
139        sizer_data.Add(wx.StaticText(self, -1, 'Source Name : '))
140        sizer_data.Add(DataSource )
141        sizer_data.Add( (0,5) )
142       
143        #---------sizer 2 draw--------------------------------
144        #set maximum range for x in linear scale
145        if not hasattr(self.data,"data"): #Display only for 1D data fit
146            # Minimum value of data   
147            #data_min = str(format_number(numpy.min(self.data.x)))
148            data_min = str((numpy.min(self.data.x)))
149            # Maximum value of data 
150#            data_max = str(format_number(numpy.max(self.data.x)))
151            data_max = str((numpy.max(self.data.x)))
152            text4_3 = wx.StaticText(self, -1, 'Total Q Range (1/A)',
153                                     style=wx.ALIGN_LEFT)
154            sizer_data.Add( text4_3 )
155            sizer_data.Add(wx.StaticText(self, -1, "Min : %s"%data_min))
156           
157            sizer_data.Add(wx.StaticText(self, -1, "Max : %s"%data_max))
158           
159        else:
160            radius_min= 0
161            x= numpy.max(self.data.xmin, self.data.xmax)
162            y= numpy.max(self.data.ymin, self.data.ymax)
163            radius_max = math.sqrt(x*x + y*y)
164           
165            #For qmin and qmax, do not use format_number.(If do, qmin and max could be different from what is in the data.)
166            # Minimum value of data   
167            #data_min = str(format_number(radius_min))
168            data_min = str((radius_min))
169            # Maximum value of data 
170            #data_max = str(format_number(radius_max))
171            data_max = str((radius_max))
172            text4_3 = wx.StaticText(self, -1, 'Total Q Range (1/A)',
173                                     style=wx.ALIGN_LEFT)
174            sizer_data.Add( text4_3 )
175            sizer_data.Add(wx.StaticText(self, -1, "Min : %s"%data_min))
176            sizer_data.Add(wx.StaticText(self, -1, "Max : %s"%data_max))
177           
178        boxsizer1.Add(sizer_data)
179        #------------------------------------------------------------
180        self.sizer0.Add(boxsizer1,0, wx.EXPAND | wx.ALL, 10)
181        self.sizer0.Layout()
182       
183        self.qmin_x= data_min
184        self.qmax_x= data_max
185       
186       
187    def _fill_model_sizer(self, sizer):
188        """
189            fill sizer containing model info
190        """
191       
192        ## class base method  to add view 2d button   
193        self._set_model_sizer(sizer=sizer, title="Model",object=None )   
194       
195   
196    def _set_sizer_gaussian(self):
197        """
198            draw sizer with gaussian dispersity parameters
199        """
200        self.fittable_param=[]
201        self.fixed_param=[]
202        self.orientation_params_disp=[]
203       
204        self.sizer4_4.Clear(True)
205       
206        if self.model==None:
207            ##no model is selected
208            return
209        if not self.enable_disp.GetValue():
210            ## the user didn't select dispersity display
211            return 
212       
213        self._reset_dispersity()
214        # Create the dispersion objects
215        for item in self.model.dispersion.keys():
216            disp_model =  GaussianDispersion()
217            self._disp_obj_dict[item] = disp_model
218            self.model.set_dispersion(item, disp_model)
219
220        ix=0
221        iy=1
222        disp = wx.StaticText(self, -1, 'Names')
223        self.sizer4_4.Add(disp,( iy, ix),(1,1), 
224                           wx.LEFT|wx.EXPAND|wx.ADJUST_MINSIZE, 15)
225        ix += 1 
226        values = wx.StaticText(self, -1, 'Values')
227        self.sizer4_4.Add(values,( iy, ix),(1,1), wx.EXPAND|wx.ADJUST_MINSIZE, 0)
228        ix +=2 
229        self.text_disp_1 = wx.StaticText(self, -1, 'Errors')
230        self.sizer4_4.Add( self.text_disp_1,(iy, ix),(1,1),\
231                            wx.EXPAND|wx.ADJUST_MINSIZE, 0) 
232        self.text_disp_1.Hide()
233        ix += 1 
234        npts = wx.StaticText(self, -1, 'Npts')
235        self.sizer4_4.Add(npts,( iy, ix),(1,1), wx.EXPAND|wx.ADJUST_MINSIZE, 0)
236        ix += 1 
237        nsigmas = wx.StaticText(self, -1, 'Nsigmas')
238        self.sizer4_4.Add(nsigmas,( iy, ix),(1,1), wx.EXPAND|wx.ADJUST_MINSIZE, 0)
239       
240        for item in self.model.dispersion.keys():
241            if not item in self.model.orientation_params:
242                self.disp_cb_dict[item]= None
243                name1=item+".width"
244                name2=item+".npts"
245                name3=item+".nsigmas"
246                iy += 1
247                for p in self.model.dispersion[item].keys(): 
248       
249                    if p=="width":
250                        ix = 0
251                        cb = wx.CheckBox(self, -1, name1, (10, 10))
252                        wx.EVT_CHECKBOX(self, cb.GetId(), self.select_param)
253                        self.sizer4_4.Add( cb,( iy, ix),(1,1), 
254                                           wx.LEFT|wx.EXPAND|wx.ADJUST_MINSIZE, 15)
255                        ix = 1
256                        value= self.model.getParam(name1)
257                        ctl1 = wx.TextCtrl(self, -1, size=(_BOX_WIDTH,20),
258                                            style=wx.TE_PROCESS_ENTER)
259                        ctl1.SetValue(str (format_number(value)))
260                        ctl1.Bind(wx.EVT_SET_FOCUS, self.onSetFocus)
261                        ctl1.Bind(wx.EVT_KILL_FOCUS, self._onparamEnter)
262                        ctl1.Bind(wx.EVT_TEXT_ENTER,self._onparamEnter)
263                        self.sizer4_4.Add(ctl1, (iy,ix),(1,1),wx.EXPAND)
264                        ## text to show error sign
265                        ix = 2
266                        text2=wx.StaticText(self, -1, '+/-')
267                        self.sizer4_4.Add(text2,(iy, ix),(1,1),
268                                          wx.EXPAND|wx.ADJUST_MINSIZE, 0)
269                        text2.Hide() 
270                        ## txtcrtl to add error from fit
271                        ix = 3
272                        ctl2 = wx.TextCtrl(self, -1, size=(_BOX_WIDTH,20), style=wx.TE_PROCESS_ENTER)
273                        self.sizer4_4.Add(ctl2, (iy,ix),(1,1), wx.EXPAND|wx.ADJUST_MINSIZE, 0)
274                        ctl2.Hide()
275                        self.fittable_param.append([cb,name1,ctl1,text2,
276                                                    ctl2, None, None,None])
277                    elif p=="npts":
278                            ix = 4
279                            value= self.model.getParam(name2)
280                            Tctl = wx.TextCtrl(self, -1, size=(_BOX_WIDTH/2,20),
281                                                style=wx.TE_PROCESS_ENTER)
282                           
283                            Tctl.SetValue(str (format_number(value)))
284                            Tctl.Bind(wx.EVT_SET_FOCUS, self.onSetFocus)
285                            Tctl.Bind(wx.EVT_KILL_FOCUS, self._onparamEnter)
286                            Tctl.Bind(wx.EVT_TEXT_ENTER,self._onparamEnter)
287                            self.sizer4_4.Add(Tctl, (iy,ix),(1,1),
288                                               wx.EXPAND|wx.ADJUST_MINSIZE, 0)
289                            self.fixed_param.append([None,name2, Tctl,None,None,
290                                                      None, None,None])
291                    elif p=="nsigmas":
292                            ix = 5
293                            value= self.model.getParam(name3)
294                            Tctl = wx.TextCtrl(self, -1, size=(_BOX_WIDTH/2,20),
295                                                style=wx.TE_PROCESS_ENTER)
296                            Tctl.SetValue(str (format_number(value)))
297                            Tctl.Bind(wx.EVT_SET_FOCUS, self.onSetFocus)
298                            Tctl.Bind(wx.EVT_KILL_FOCUS, self._onparamEnter)
299                            Tctl.Bind(wx.EVT_TEXT_ENTER,self._onparamEnter)
300                            self.sizer4_4.Add(Tctl, (iy,ix),(1,1),
301                                               wx.EXPAND|wx.ADJUST_MINSIZE, 0)
302                            ix +=1
303                            self.sizer4_4.Add((20,20), (iy,ix),(1,1),
304                                               wx.EXPAND|wx.ADJUST_MINSIZE, 0)
305                           
306                            self.fixed_param.append([None,name3, Tctl
307                                                     ,None,None, None, None,None])
308        ix =0
309        iy +=1 
310        self.sizer4_4.Add((20,20),(iy,ix),(1,1), wx.LEFT|wx.EXPAND|wx.ADJUST_MINSIZE, 15) 
311        for item in self.model.dispersion.keys():
312            if  item in self.model.orientation_params:
313                self.disp_cb_dict[item]= None
314                name1=item+".width"
315                name2=item+".npts"
316                name3=item+".nsigmas"
317                iy += 1
318                for p in self.model.dispersion[item].keys(): 
319       
320                    if p=="width":
321                        ix = 0
322                        cb = wx.CheckBox(self, -1, name1, (10, 10))
323                        wx.EVT_CHECKBOX(self, cb.GetId(), self.select_param)
324                        self.sizer4_4.Add( cb,( iy, ix),(1,1), 
325                                           wx.LEFT|wx.EXPAND|wx.ADJUST_MINSIZE, 15)
326                        if self.data.__class__.__name__ =="Data2D":
327                            cb.Enable()
328                        else:
329                            cb.Disable()
330                        ix = 1
331                        value= self.model.getParam(name1)
332                        ctl1 = wx.TextCtrl(self, -1, size=(_BOX_WIDTH,20),
333                                            style=wx.TE_PROCESS_ENTER)
334                        ctl1.SetValue(str (format_number(value)))
335                        if self.data.__class__.__name__ =="Data2D":
336                            ctl1.Enable()
337                        else:
338                            ctl1.Disable()
339                        ctl1.Bind(wx.EVT_SET_FOCUS, self.onSetFocus)
340                        ctl1.Bind(wx.EVT_KILL_FOCUS, self._onparamEnter)
341                        ctl1.Bind(wx.EVT_TEXT_ENTER,self._onparamEnter)
342                        self.sizer4_4.Add(ctl1, (iy,ix),(1,1),wx.EXPAND)
343                        ## text to show error sign
344                        ix = 2
345                        text2=wx.StaticText(self, -1, '+/-')
346                        self.sizer4_4.Add(text2,(iy, ix),(1,1),
347                                          wx.EXPAND|wx.ADJUST_MINSIZE, 0)
348                        text2.Hide() 
349                        ## txtcrtl to add error from fit
350                        ix = 3
351                        ctl2 = wx.TextCtrl(self, -1, size=(_BOX_WIDTH,20), style=wx.TE_PROCESS_ENTER)
352                        self.sizer4_4.Add(ctl2, (iy,ix),(1,1), wx.EXPAND|wx.ADJUST_MINSIZE, 0)
353                        ctl2.Hide()
354                        if self.data.__class__.__name__ =="Data2D":
355                            ctl2.Enable()
356                        else:
357                            ctl2.Disable()
358                        self.fittable_param.append([cb,name1,ctl1,text2,
359                                                    ctl2, None, None,None])
360                        self.orientation_params_disp.append([cb,name1,ctl1,text2,
361                                                    ctl2, None, None,None])
362                    elif p=="npts":
363                            ix = 4
364                            value= self.model.getParam(name2)
365                            Tctl = wx.TextCtrl(self, -1, size=(_BOX_WIDTH/2,20),
366                                                style=wx.TE_PROCESS_ENTER)
367                           
368                            Tctl.SetValue(str (format_number(value)))
369                            if self.data.__class__.__name__ =="Data2D":
370                                Tctl.Enable()
371                            else:
372                                Tctl.Disable()
373                            Tctl.Bind(wx.EVT_SET_FOCUS, self.onSetFocus)
374                            Tctl.Bind(wx.EVT_KILL_FOCUS, self._onparamEnter)
375                            Tctl.Bind(wx.EVT_TEXT_ENTER,self._onparamEnter)
376                            self.sizer4_4.Add(Tctl, (iy,ix),(1,1),
377                                               wx.EXPAND|wx.ADJUST_MINSIZE, 0)
378                            self.fixed_param.append([None,name2, Tctl,None,None,
379                                                      None, None,None])
380                            self.orientation_params_disp.append([None,name2, Tctl,None,None,
381                                                      None, None,None])
382                    elif p=="nsigmas":
383                            ix = 5
384                            value= self.model.getParam(name3)
385                            Tctl = wx.TextCtrl(self, -1, size=(_BOX_WIDTH/2,20),
386                                                style=wx.TE_PROCESS_ENTER)
387                            Tctl.SetValue(str (format_number(value)))
388                            if self.data.__class__.__name__ =="Data2D":
389                                Tctl.Enable()
390                            else:
391                                Tctl.Disable()
392                            Tctl.Bind(wx.EVT_SET_FOCUS, self.onSetFocus)
393                            Tctl.Bind(wx.EVT_KILL_FOCUS, self._onparamEnter)
394                            Tctl.Bind(wx.EVT_TEXT_ENTER,self._onparamEnter)
395                            self.sizer4_4.Add(Tctl, (iy,ix),(1,1),
396                                               wx.EXPAND|wx.ADJUST_MINSIZE, 0)
397                            ix +=1
398                            self.sizer4_4.Add((20,20), (iy,ix),(1,1),
399                                               wx.EXPAND|wx.ADJUST_MINSIZE, 0)
400                            self.fixed_param.append([None,name3, Tctl
401                                                     ,None,None, None, None,None])   
402                            self.orientation_params_disp.append([None,name3, Tctl
403                                                     ,None,None, None, None,None]) 
404                                 
405        wx.PostEvent(self.parent, StatusEvent(status=\
406                        " Selected Distribution: Gaussian"))   
407        ix =0
408        iy +=1 
409        self.sizer4_4.Add((20,20),(iy,ix),(1,1), wx.LEFT|wx.EXPAND|wx.ADJUST_MINSIZE, 15)       
410        self.sizer4_4.Layout()
411        self.sizer4.Layout()
412        self.SetScrollbars(20,20,200,100)
413     
414       
415    def _onFit(self, event):     
416        """
417            Allow to fit
418        """
419        #self.btFit.SetLabel("Stop")
420        from sans.guiframe.utils import check_value
421        flag = check_value( self.qmin, self.qmax) 
422       
423        if not flag:
424            msg= "Fitting range invalid"
425            wx.PostEvent(self.parent.parent, StatusEvent(status= msg ))
426            return 
427       
428        if len(self.param_toFit) <= 0:
429            msg= "Select at least one parameter to fit"
430            wx.PostEvent(self.parent.parent, StatusEvent(status= msg ))
431            return 
432       
433        self.qmin_x=float(self.qmin.GetValue())
434        self.qmax_x =float( self.qmax.GetValue())
435        self.manager._reset_schedule_problem( value=0)
436        self.manager.schedule_for_fit( value=1,page=self,fitproblem =None) 
437        self.manager.set_fit_range(page= self,qmin= self.qmin_x, qmax= self.qmax_x)
438        #single fit
439        self.manager.onFit()
440           
441        self.sizer5.Layout()
442        self.SetScrollbars(20,20,55,40)
443       
444       
445    def _on_select_model(self, event): 
446        """
447             call back for model selection
448        """   
449        self._on_select_model_helper() 
450        self.set_model_param_sizer(self.model)
451        try:
452            self.compute_chisqr()
453        except:
454            ## error occured on chisqr computation
455            pass
456        self.enable_disp.SetValue(False)
457        self.disable_disp.SetValue(True)
458        self._set_dipers_Param(event=None)
459       
460        evt = ModelEventbox(model=self.model)
461        wx.PostEvent(self.event_owner, evt)   
462       
463
464    def _onparamEnter(self,event):
465        """
466            when enter value on panel redraw model according to changed
467        """
468        tcrtl= event.GetEventObject()
469        if check_float(tcrtl):
470            self._onparamEnter_helper()
471            self.compute_chisqr()
472        else:
473            msg= "Cannot Plot :Must enter a number!!!  "
474            wx.PostEvent(self.parent.parent, StatusEvent(status = msg ))
475            return 
476       
477    def reset_page(self, state):
478        """
479            reset the state
480        """
481        self.reset_page_helper(state)
482        evt = ModelEventbox(model=self.model)
483        wx.PostEvent(self.event_owner, evt)   
484           
485           
486    def get_range(self):
487        """
488            return the fitting range
489        """
490        return float(self.qmin_x) , float(self.qmax_x)
491       
492    def get_param_list(self):
493        """
494            @return self.param_toFit: list containing  references to TextCtrl
495            checked.Theses TextCtrl will allow reference to parameters to fit.
496            @raise: if return an empty list of parameter fit will nnote work
497            properly so raise ValueError,"missing parameter to fit"
498        """
499        if self.param_toFit !=[]:
500            return self.param_toFit
501        else:
502            raise ValueError,"missing parameter to fit"   
503     
504    def onsetValues(self,chisqr, out,cov):
505        """
506            Build the panel from the fit result
507            @param chisqr:Value of the goodness of fit metric
508            @param out:list of parameter with the best value found during fitting
509            @param cov:Covariance matrix
510       
511        """
512        self.tcChi.SetLabel(format_number(chisqr))
513        params = {}
514        is_modified = False
515        has_error = False
516        self.text2_3.Hide()
517        if self.text_disp_1 !=None:
518            self.text_disp_1.Hide()
519        #set the panel when fit result are float not list
520        if out.__class__==numpy.float64:
521            self.param_toFit[0][2].SetValue(format_number(out))
522            self.param_toFit[0][2].Refresh()
523           
524            self.param_toFit[0][4].Clear()
525            self.param_toFit[0][4].Hide()
526            if cov !=None :
527                self.text2_3.Show(True)
528                if self.text_disp_1 !=None:
529                    self.text_disp_1.Show(True)
530                if cov[0]==None: 
531                    self.param_toFit[0][3].Hide()
532                    self.param_toFit[0][4].Clear()
533                    self.param_toFit[0][4].Hide()
534                    self.param_toFit[0][4].Refresh()
535                else:
536                    self.param_toFit[0][3].Show(True)
537                    self.param_toFit[0][4].Clear()
538                    self.param_toFit[0][4].SetValue(format_number(cov[0]))
539                    self.param_toFit[0][4].Show(True)
540                    self.param_toFit[0][4].Refresh()
541        else:
542            i=0
543            j=0
544            #Set the panel when fit result are list
545            for item in self.param_toFit:
546                ## reset error value to initial state
547                item[4].Clear()
548                item[4].Hide()
549                item[4].Refresh()
550                if( out != None ) and len(out)<=len(self.param_toFit)and i < len(out):
551                    item[2].SetValue(format_number(self.model.getParam(item[1])))
552                    item[2].Refresh()
553                if(cov !=None)and len(cov)<=len(self.param_toFit)and i < len(cov):
554                    self.text2_3.Show(True) 
555                    if self.text_disp_1!=None:
556                        self.text_disp_1.Show(True)
557                    item[3].Show(True)
558                    item[4].Clear()
559                    for j in range(len(out)):
560                        if out[j]==self.model.getParam(item[1]):
561                            break
562                    ## unable to compare cov[j]==numpy.nan so switch to None
563                    if cov[j]==None:
564                        item[3].Hide()
565                        item[4].Refresh()
566                        item[4].Clear()
567                        item[4].Hide()
568                    else:
569                        item[4].SetValue(format_number(cov[j]))
570                        item[4].Refresh()
571                        item[4].Show(True)   
572                i+=1
573       
574        self.sizer3.Layout()
575        self.sizer4.Layout()
576        self.SetScrollbars(20,20,200,100)
577       
578       
579     
580    def onSmear(self, event):
581        """
582            Create a smear object that will change the way residuals
583            are compute when fitting
584        """
585        smear =None
586        msg=""
587        if self.enable_smearer.GetValue():
588            from DataLoader.qsmearing import smear_selection
589            smear = smear_selection( self.data )
590            if hasattr(self.data,"dxl"):
591                msg= ": Resolution smearing parameters"
592            if hasattr(self.data,"dxw"):
593                msg= ": Slit smearing parameters"
594            if smear ==None:
595                wx.PostEvent(self.manager.parent, StatusEvent(status=\
596                            "Data contains no smearing information"))
597            else:
598                wx.PostEvent(self.manager.parent, StatusEvent(status=\
599                            "Data contains smearing information %s"%msg))
600        ## set smearing value whether or not the data contain the smearing info
601        self.manager.set_smearer(smear, qmin= float(self.qmin_x),
602                                      qmax= float(self.qmax_x)) 
603        ##Calculate chi2
604        self.compute_chisqr() 
605        ## save the state enable smearing
606        self.save_current_state()
607       
608 
609    def compute_chisqr2D(self):
610        """
611            compute chi square given a model and data 2D and set the value
612            to the tcChi txtcrl
613        """
614        from sans.guiframe.utils import check_value
615        flag = check_value( self.qmin, self.qmax)
616        err_image = self.data.err_data
617        if err_image==[] or err_image==None:
618            err_image= numpy.zeros(len(self.data.x_bins),len(self.data.y_bins))
619                       
620        err_image[err_image==0]=1
621        res=[]
622        if flag== True:
623            try:
624                self.qmin_x = float(self.qmin.GetValue())
625                self.qmax_x = float(self.qmax.GetValue())
626                for i in range(len(self.data.x_bins)):
627                    for j in range(len(self.data.y_bins)):
628                        #Check the range containing data between self.qmin_x and self.qmax_x
629                        value =  math.pow(self.data.x_bins[i],2)+ math.pow(self.data.y_bins[j],2)
630                        if value >= math.pow(self.qmin_x,2) and value <= math.pow(self.qmax_x,2):
631                           
632                            temp = [self.data.x_bins[i],self.data.y_bins[j]]
633                            error= err_image[j][i]
634                            chisqrji = (self.data.data[j][i]- self.model.runXY(temp ))/error
635                            #Vector containing residuals
636                            res.append( math.pow(chisqrji,2) )
637
638                # compute sum of residual
639                sum=0
640                for item in res:
641                    if numpy.isfinite(item):
642                        sum +=item
643                self.tcChi.SetLabel(format_number(math.fabs(sum/ len(res))))
644            except:
645                wx.PostEvent(self.parent.GrandParent, StatusEvent(status=\
646                            "Chisqr cannot be compute: %s"% sys.exc_value))
647                return
648   
649       
650    def compute_chisqr(self):
651        """
652            compute chi square given a model and data 1D and set the value
653            to the tcChi txtcrl
654        """
655        from sans.guiframe.utils import check_value
656        flag = check_value( self.qmin, self.qmax)
657       
658        if flag== True:
659            try:
660                if hasattr(self.data,"data"):
661                    self.compute_chisqr2D()
662                    return
663                else:
664                    self.qmin_x = float(self.qmin.GetValue())
665                    self.qmax_x = float(self.qmax.GetValue())
666                    # return residuals within self.qmin_x and self.qmax_x
667                    x,y = [numpy.asarray(v) for v in (self.data.x,self.data.y)]
668                   
669                    if self.data.dy==None:
670                        dy= numpy.zeros(len(y))
671                    else:
672                        dy= numpy.asarray(self.data.dy)
673                    dy[dy==0]=1
674                    if self.qmin_x==None and self.qmax_x==None: 
675                        fx =numpy.asarray([self.model.run(v) for v in x])
676                        temp=(y - fx)/dy
677                        res= temp*temp
678                    else:
679                        idx = (x>= self.qmin_x) & (x <=self.qmax_x)
680                        fx = numpy.asarray([self.model.run(item)for item in x[idx ]])
681                        temp=(y[idx] - fx)/dy[idx]
682                        res= temp*temp
683                    #sum of residuals
684                    sum=0
685                    for item in res:
686                        if numpy.isfinite(item):
687                            sum +=item
688                    self.tcChi.SetLabel(format_number(math.fabs(sum/ len(res))))
689            except:
690                wx.PostEvent(self.parent.GrandParent, StatusEvent(status=\
691                            "Chisqr cannot be compute: %s"% sys.exc_value))
692                return 
693           
694   
695    def select_all_param(self,event): 
696        """
697             set to true or false all checkBox given the main checkbox value cb1
698        """
699        self.param_toFit=[]
700       
701        if  self.parameters !=[]:
702            if  self.cb1.GetValue():
703                for item in self.parameters:
704                    item[0].SetValue(True)
705                    self.param_toFit.append(item )
706                if len(self.fittable_param)>0:
707                    for item in self.fittable_param:
708                        item[0].SetValue(True)
709                        self.param_toFit.append(item )
710            else:
711                for item in self.parameters:
712                    item[0].SetValue(False)
713                for item in self.fittable_param:
714                    item[0].SetValue(False)
715                self.param_toFit=[]
716               
717        self.save_current_state() 
718       
719               
720               
721    def select_param(self,event):
722        """
723            Select TextCtrl  checked for fitting purpose and stores them
724            in  self.param_toFit=[] list
725        """
726        self.param_toFit=[]
727        for item in self.parameters:
728            #Select parameters to fit for list of primary parameters
729            if item[0].GetValue():
730                if not (item in self.param_toFit):
731                    self.param_toFit.append(item ) 
732            else:
733                #remove parameters from the fitting list
734                if item in self.param_toFit:
735                    self.param_toFit.remove(item)
736        #Select parameters to fit for list of fittable parameters with dispersion         
737        for item in self.fittable_param:
738            if item[0].GetValue():
739                if not (item in self.param_toFit):
740                    self.param_toFit.append(item) 
741            else:
742                #remove parameters from the fitting list
743                if item in self.param_toFit:
744                    self.param_toFit.remove(item)           
745        #Set the value of checkbox that selected every checkbox or not           
746        if len(self.parameters)+len(self.fittable_param) ==len(self.param_toFit):
747            self.cb1.SetValue(True)
748        else:
749            self.cb1.SetValue(False)
750        ## save current state of the page
751        self.save_current_state()
752       
753   
754       
755    def set_model_param_sizer(self, model):
756        """
757            Build the panel from the model content
758            @param model: the model selected in combo box for fitting purpose
759        """
760        self.sizer3.Clear(True)
761        self.parameters = []
762        self.param_toFit=[]
763        self.fittable_param=[]
764        self.fixed_param=[]
765        self.orientation_params=[]
766        self.orientation_params_disp=[]
767       
768        if model ==None:
769            self.sizer3.Layout()
770            self.SetScrollbars(20,20,200,100)
771            return
772        ## the panel is drawn using the current value of the fit engine
773        if self.engine_type==None and self.manager !=None:
774            self.engine_type= self.manager._return_engine_type()
775           
776        box_description= wx.StaticBox(self, -1,str("Model Parameters"))
777        boxsizer1 = wx.StaticBoxSizer(box_description, wx.VERTICAL)
778        sizer = wx.GridBagSizer(5,5)
779        ## save the current model
780        self.model = model
781           
782        keys = self.model.getParamList()
783        #list of dispersion paramaters
784        self.disp_list=self.model.getDispParamList()
785       
786        keys.sort()
787   
788        iy = 1
789        ix = 0
790        self.cb1 = wx.CheckBox(self, -1,"Select all", (10, 10))
791        wx.EVT_CHECKBOX(self, self.cb1.GetId(), self.select_all_param)
792        self.cb1.SetValue(False)
793       
794        sizer.Add(self.cb1,(iy, ix),(1,1),\
795                             wx.LEFT|wx.EXPAND|wx.ADJUST_MINSIZE, 15)
796        ix +=1
797        self.text2_2 = wx.StaticText(self, -1, 'Values')
798        sizer.Add(self.text2_2,(iy, ix),(1,1),\
799                            wx.EXPAND|wx.ADJUST_MINSIZE, 0)
800        ix +=2 
801        self.text2_3 = wx.StaticText(self, -1, 'Errors')
802        sizer.Add(self.text2_3,(iy, ix),(1,1),\
803                            wx.EXPAND|wx.ADJUST_MINSIZE, 0) 
804        self.text2_3.Hide()
805        ix +=1 
806        self.text2_min = wx.StaticText(self, -1, 'Min')
807        sizer.Add(self.text2_min,(iy, ix),(1,1),\
808                            wx.EXPAND|wx.ADJUST_MINSIZE, 0) 
809        self.text2_min.Hide()
810        ix +=1 
811        self.text2_max = wx.StaticText(self, -1, 'Max')
812        sizer.Add(self.text2_max,(iy, ix),(1,1),\
813                            wx.EXPAND|wx.ADJUST_MINSIZE, 0) 
814        self.text2_max.Hide()
815        ix += 1
816        self.text2_4 = wx.StaticText(self, -1, '[Units]')
817        sizer.Add(self.text2_4,(iy, ix),(1,1),\
818                            wx.EXPAND|wx.ADJUST_MINSIZE, 0) 
819        self.text2_4.Hide()
820        if self.engine_type=="park":
821            self.text2_max.Show(True)
822            self.text2_min.Show(True)
823
824        for item in keys:
825            if not item in self.disp_list and not item in self.model.orientation_params:
826                iy += 1
827                ix = 0
828                ## add parameters name with checkbox for selecting to fit
829                cb = wx.CheckBox(self, -1, item )
830                cb.SetValue(False)
831                wx.EVT_CHECKBOX(self, cb.GetId(), self.select_param)
832                sizer.Add( cb,( iy, ix),(1,1),
833                             wx.LEFT|wx.EXPAND|wx.ADJUST_MINSIZE, 15)
834                ## add parameter value
835                ix += 1
836                value= self.model.getParam(item)
837                ctl1 = wx.TextCtrl(self, -1, size=(_BOX_WIDTH,20),
838                                    style=wx.TE_PROCESS_ENTER)
839               
840                ctl1.SetValue(format_number(value))
841                ctl1.Bind(wx.EVT_SET_FOCUS, self.onSetFocus)
842                ctl1.Bind(wx.EVT_KILL_FOCUS, self._onparamEnter)
843                ctl1.Bind(wx.EVT_TEXT_ENTER,self._onparamEnter)
844                sizer.Add(ctl1, (iy,ix),(1,1), wx.EXPAND)
845                ## text to show error sign
846                ix += 1
847                text2=wx.StaticText(self, -1, '+/-')
848                sizer.Add(text2,(iy, ix),(1,1),\
849                                wx.EXPAND|wx.ADJUST_MINSIZE, 0) 
850                text2.Hide() 
851                ## txtcrtl to add error from fit
852                ix += 1
853                ctl2 = wx.TextCtrl(self, -1, size=(_BOX_WIDTH,20), style=wx.TE_PROCESS_ENTER)
854                sizer.Add(ctl2, (iy,ix),(1,1), wx.EXPAND|wx.ADJUST_MINSIZE, 0)
855                ctl2.Hide()
856               
857                param_min, param_max= self.model.details[item][1:]
858                ix += 1
859                ctl3 = wx.TextCtrl(self, -1, size=(_BOX_WIDTH/2,20), style=wx.TE_PROCESS_ENTER)
860                ctl3.SetValue(str(param_min))
861                ctl3.Bind(wx.EVT_SET_FOCUS, self.onSetFocus)
862                ctl3.Bind(wx.EVT_KILL_FOCUS, self._onparamEnter)
863                ctl3.Bind(wx.EVT_TEXT_ENTER,self._onparamEnter)
864                sizer.Add(ctl3, (iy,ix),(1,1), wx.EXPAND|wx.ADJUST_MINSIZE, 0)
865                ctl3.Hide()
866       
867                ix += 1
868                ctl4 = wx.TextCtrl(self, -1, size=(_BOX_WIDTH/2,20), style=wx.TE_PROCESS_ENTER)
869                ctl4.Bind(wx.EVT_SET_FOCUS, self.onSetFocus)
870                ctl4.Bind(wx.EVT_KILL_FOCUS, self._onparamEnter)
871                ctl4.Bind(wx.EVT_TEXT_ENTER,self._onparamEnter)
872                sizer.Add(ctl4, (iy,ix),(1,1), wx.EXPAND|wx.ADJUST_MINSIZE, 0)
873                ctl4.SetValue(str(param_max))
874                ctl4.Hide()
875               
876                if self.engine_type=="park":
877                    ctl3.Show(True)
878                    ctl4.Show(True)
879                   
880                ix +=1
881                # Units
882                try:
883                    units = wx.StaticText(self, -1, self.model.details[item][0], style=wx.ALIGN_LEFT)
884                except:
885                    units = wx.StaticText(self, -1, "", style=wx.ALIGN_LEFT)
886                sizer.Add(units, (iy,ix),(1,1),  wx.EXPAND|wx.ADJUST_MINSIZE, 0)
887               
888                ##[cb state, name, value, "+/-", error of fit, min, max , units]
889                self.parameters.append([cb,item, ctl1,
890                                        text2,ctl2, ctl3, ctl4,None])
891             
892        iy+=1
893        sizer.Add((10,10),(iy,ix),(1,1), wx.LEFT|wx.EXPAND|wx.ADJUST_MINSIZE, 15)
894        for item in self.model.orientation_params:
895            if not item in self.disp_list :
896                iy += 1
897                ix = 0
898                ## add parameters name with checkbox for selecting to fit
899                cb = wx.CheckBox(self, -1, item )
900                cb.SetValue(False)
901                wx.EVT_CHECKBOX(self, cb.GetId(), self.select_param)
902                if self.data.__class__.__name__ =="Data2D":
903                    cb.Enable()
904                else:
905                    cb.Disable()
906                sizer.Add( cb,( iy, ix),(1,1),
907                             wx.LEFT|wx.EXPAND|wx.ADJUST_MINSIZE, 15)
908                ## add parameter value
909                ix += 1
910                value= self.model.getParam(item)
911                ctl1 = wx.TextCtrl(self, -1, size=(_BOX_WIDTH,20),
912                                    style=wx.TE_PROCESS_ENTER)
913               
914                ctl1.SetValue(format_number(value))
915                if self.data.__class__.__name__ =="Data2D":
916                    ctl1.Enable()
917                else:
918                    ctl1.Disable()
919                ctl1.Bind(wx.EVT_SET_FOCUS, self.onSetFocus)
920                ctl1.Bind(wx.EVT_KILL_FOCUS, self._onparamEnter)
921                ctl1.Bind(wx.EVT_TEXT_ENTER,self._onparamEnter)
922                sizer.Add(ctl1, (iy,ix),(1,1), wx.EXPAND)
923                ## text to show error sign
924                ix += 1
925                text2=wx.StaticText(self, -1, '+/-')
926                sizer.Add(text2,(iy, ix),(1,1),\
927                                wx.EXPAND|wx.ADJUST_MINSIZE, 0) 
928                text2.Hide() 
929                ## txtcrtl to add error from fit
930                ix += 1
931                ctl2 = wx.TextCtrl(self, -1, size=(_BOX_WIDTH,20), style=wx.TE_PROCESS_ENTER)
932                sizer.Add(ctl2, (iy,ix),(1,1), wx.EXPAND|wx.ADJUST_MINSIZE, 0)
933                ctl2.Hide()
934                if self.data.__class__.__name__ =="Data2D":
935                    ctl1.Enable()
936                else:
937                    ctl1.Disable()
938                param_min, param_max= self.model.details[item][1:]
939                ix += 1
940                ctl3 = wx.TextCtrl(self, -1, size=(_BOX_WIDTH/2,20), style=wx.TE_PROCESS_ENTER)
941                ctl3.SetValue(str(param_min))
942                ctl3.Bind(wx.EVT_SET_FOCUS, self.onSetFocus)
943                ctl3.Bind(wx.EVT_KILL_FOCUS, self._onparamEnter)
944                ctl3.Bind(wx.EVT_TEXT_ENTER,self._onparamEnter)
945                sizer.Add(ctl3, (iy,ix),(1,1), wx.EXPAND|wx.ADJUST_MINSIZE, 0)
946                ctl3.Hide()
947                if self.data.__class__.__name__ =="Data2D":
948                    ctl3.Enable()
949                else:
950                    ctl3.Disable()
951       
952                ix += 1
953                ctl4 = wx.TextCtrl(self, -1, size=(_BOX_WIDTH/2,20), style=wx.TE_PROCESS_ENTER)
954                ctl4.Bind(wx.EVT_SET_FOCUS, self.onSetFocus)
955                ctl4.Bind(wx.EVT_KILL_FOCUS, self._onparamEnter)
956                ctl4.Bind(wx.EVT_TEXT_ENTER,self._onparamEnter)
957                sizer.Add(ctl4, (iy,ix),(1,1), wx.EXPAND|wx.ADJUST_MINSIZE, 0)
958                ctl4.SetValue(str(param_max))
959                ctl4.Hide()
960                if self.data.__class__.__name__ =="Data2D":
961                    ctl4.Enable()
962                else:
963                    ctl4.Disable()
964                if self.engine_type=="park":
965                    ctl3.Show(True)
966                    ctl4.Show(True)
967                   
968                ix +=1
969                # Units
970                try:
971                    units = wx.StaticText(self, -1, self.model.details[item][0], style=wx.ALIGN_LEFT)
972                except:
973                    units = wx.StaticText(self, -1, "", style=wx.ALIGN_LEFT)
974                sizer.Add(units, (iy,ix),(1,1),  wx.EXPAND|wx.ADJUST_MINSIZE, 0)
975               
976                ##[cb state, name, value, "+/-", error of fit, min, max , units]
977                self.parameters.append([cb,item, ctl1,
978                                        text2,ctl2, ctl3, ctl4,None])
979                self.orientation_params.append([cb,item, ctl1,
980                                        text2,ctl2, ctl3, ctl4,None])
981             
982        iy+=1
983        sizer.Add((10,10),(iy,ix),(1,1), wx.LEFT|wx.EXPAND|wx.ADJUST_MINSIZE, 15)
984       
985        #Display units text on panel
986        for item in keys:   
987            if self.model.details[item][0]!='':
988                self.text2_4.Show()
989                break
990            else:
991                self.text2_4.Hide()
992   
993        boxsizer1.Add(sizer)
994       
995        self.sizer3.Add(boxsizer1,0, wx.EXPAND | wx.ALL, 10)
996        self.sizer3.Layout()
997        self.SetScrollbars(20,20,200,100)
998       
999   
1000           
1001       
1002class HelpWindow(wx.Frame):
1003    def __init__(self, parent, id, title):
1004        wx.Frame.__init__(self, parent, id, title, size=(570, 400))
1005       
1006        from sans.models.CylinderModel import CylinderModel
1007        model = CylinderModel()
1008       
1009        from danse.common.plottools.plottables import Data1D
1010        data= Data1D(x=[1,2], y=[3,4], dy=[0.1, 0,1])
1011   
1012        from fitpanel import PageInfo
1013        myinfo = PageInfo(self,  model, data=data )
1014       
1015        ## add data
1016       
1017        from models import ModelList
1018        mylist= ModelList()
1019
1020        from sans.models.SphereModel import SphereModel
1021        from sans.models.SquareWellStructure import SquareWellStructure
1022        from sans.models.DebyeModel import DebyeModel
1023        from sans.models.LineModel import LineModel
1024        name= "shapes"
1025        list1= [SphereModel]
1026        mylist.set_list( name, list1)
1027       
1028        name= "Shape-independent"
1029        list1= [DebyeModel]
1030        mylist.set_list( name, list1)
1031       
1032        name= "Structure Factors"
1033        list1= [SquareWellStructure]
1034        mylist.set_list( name, list1)
1035       
1036        name= "Added models"
1037        list1= [LineModel]
1038        mylist.set_list( name, list1)
1039       
1040        myinfo.model_list_box = mylist.get_list()
1041       
1042        self.page = FitPage(self, myinfo) 
1043       
1044       
1045       
1046        self.Centre()
1047        self.Show(True)
1048
1049
1050   
1051if __name__=="__main__":
1052    app = wx.App()
1053    HelpWindow(None, -1, 'HelpWindow')
1054    app.MainLoop()
1055               
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.