source: sasview/sansmodels/test/utest_models.py @ 62ffd8d

ESS_GUIESS_GUI_DocsESS_GUI_batch_fittingESS_GUI_bumps_abstractionESS_GUI_iss1116ESS_GUI_iss879ESS_GUI_iss959ESS_GUI_openclESS_GUI_orderingESS_GUI_sync_sascalccostrafo411magnetic_scattrelease-4.1.1release-4.1.2release-4.2.2release_4.0.1ticket-1009ticket-1094-headlessticket-1242-2d-resolutionticket-1243ticket-1249ticket885unittest-saveload
Last change on this file since 62ffd8d was 18e250c, checked in by Gervaise Alina <gervyh@…>, 13 years ago

move test to sansmodels top level
  • Property mode set to 100644
File size: 8.4 KB
Line 
1"""
2    Unit tests for specific models
3    @author: Mathieu Doucet / UTK
4"""
5
6import unittest, time, math
7
8# Disable "missing docstring" complaint
9# pylint: disable-msg=C0111
10# Disable "too many methods" complaint
11# pylint: disable-msg=R0904
12# Disable "could be a function" complaint
13# pylint: disable-msg=R0201
14
15class TestSpherew(unittest.TestCase):
16    """ Unit tests for sphere model """
17   
18    def setUp(self):
19        from sans.models.CoreFourShellModel import CoreFourShellModel
20        from sans.models.CoreMultiShellModel import CoreMultiShellModel
21        self.comp = CoreMultiShellModel(4)
22       
23    def test1D(self):
24        """ Test 1D model for a sphere """
25        self.comp._set_dispersion()
26       
27class TestSphere(unittest.TestCase):
28    """ Unit tests for sphere model """
29   
30    def setUp(self):
31        from sans.models.SphereModel import SphereModel
32        self.comp = SphereModel()
33       
34    def test1D(self):
35        """ Test 1D model for a sphere """
36        self.assertAlmostEqual(self.comp.run(1.0), 5.6387e-5, 4)
37       
38    def test1D_2(self):
39        """ Test 2D model for a sphere """
40        self.assertAlmostEqual(self.comp.run([1.0, 1.3]), 5.6387e-5, 4)
41
42class TestCyl(unittest.TestCase):
43    """Unit tests for cylinder"""
44   
45    def setUp(self):
46
47        from sans.models.CylinderModel import CylinderModel
48        self.comp = CylinderModel()
49       
50    def test1D(self):
51        """ Test 1D model of a cylinder """ 
52        self.assertAlmostEqual(self.comp.run(0.2), 0.041761386790780453, 4)
53       
54    def testTime(self):
55        """ Time profiling """
56        self.comp.run(2.0)
57        t0 = time.clock()
58        self.assertTrue(time.clock()-t0<1e-5)
59     
60    def test2D(self):
61        """ Test 2D model of a cylinder """ 
62        self.comp.setParam('cyl_theta', 1*180/math.pi)
63        self.comp.setParam('cyl_phi', 1*180/math.pi)
64        self.assertAlmostEqual(self.comp.run([0.2, 2.5]), 
65                               0.038176446608393366, 4)
66       
67    def testIO(self):
68        from sans.models.ModelFactory import ModelFactory
69        from sans.models.ModelIO import ModelIO
70        factory = ModelFactory()
71        io = ModelIO(factory)
72        io.save(self.comp,"myModel.xml")
73        value = self.comp.run(1)
74        loaded = io.load("myModel.xml")
75        self.assertEqual(value, loaded.run(1))
76       
77    def testIO_add(self):
78        # version 0.5.0: No longer supported
79        return
80        from sans.models.ModelFactory import ModelFactory
81        from sans.models.ModelIO import ModelIO
82        factory = ModelFactory()
83        io = ModelIO(factory)
84        sph = factory.getModel("SphereModel")
85        cyl = factory.getModel("CylinderModel")
86        combo = sph - cyl
87        io.save(combo,"myModel.xml")
88        value = combo.run(1)
89        loaded = io.load("myModel.xml")
90        self.assertEqual(value, loaded.run(1))
91       
92    def testIO_add2(self):
93        # version 0.5.0: No longer supported
94        return
95        from sans.models.ModelFactory import ModelFactory
96        #from sans.models.ModelIO import ModelIO
97        factory = ModelFactory()
98        #io = ModelIO(factory)
99        sph = factory.getModel("SphereModel")
100        cyl = factory.getModel("CylinderModel")
101        sph2 = factory.getModel("SphereModel")
102        combo1 = cyl - sph
103        combo = combo1 / sph2
104        #combo1 = sph
105        #io.save(combo,"myModel.xml")
106        # Just check that we have some output
107        self.assertTrue(math.fabs(combo.run(1))>0)
108        #loaded = io.load("myModel.xml")
109        #self.assertEqual(value, loaded.run(1))
110       
111       
112     
113       
114class TestFactory(unittest.TestCase):
115    """Unit tests for Model Factory"""
116   
117    def setUp(self):
118        from sans.models.ModelFactory import ModelFactory
119        self.comp = ModelFactory().getModel('CylinderModel')
120       
121    def test1D(self):
122        """ Test 1D model of a cylinder """ 
123        self.assertAlmostEqual(self.comp.run(0.2), 0.041761386790780453, 4)
124       
125 
126class TestGaussian(unittest.TestCase):
127    """Unit tests for Gaussian function"""
128   
129    def setUp(self):
130        from sans.models.Gaussian import Gaussian
131        self.gauss= Gaussian()
132       
133    def test1D(self):
134        self.gauss.setParam('scale', 2.0)
135        self.gauss.setParam('center', 1.0)
136        self.gauss.setParam('sigma', 1.0)
137        self.assertEqual(self.gauss.run(1.0), 2.0)
138        value = math.exp(-0.5)
139        self.assertEqual(self.gauss.run(2.0), 2.0*value)
140       
141    def test2D(self):
142        self.gauss.setParam('scale', 2.0)
143        self.gauss.setParam('center', 1.0)
144        self.gauss.setParam('sigma', 1.0)
145        self.assertEqual(self.gauss.runXY([1.0,1.0]), 2.0*2.0)
146        value = math.exp(-0.5)
147        self.assertEqual(self.gauss.runXY([1.0,2.0]), 2.0*2.0*value)
148        self.assertEqual(self.gauss.runXY([2.0,2.0]), 2.0*2.0*value*value)
149       
150    def test2Dphi(self):
151        self.gauss.setParam('scale', 2.0)
152        self.gauss.setParam('center', 1.0)
153        self.gauss.setParam('sigma', 1.0)
154        value = math.exp(-0.5)
155        self.assertAlmostEqual(self.gauss.run([math.sqrt(8.0), math.pi/4.0]), 2.0*2.0*value*value, 5)
156       
157class TestLorentzian(unittest.TestCase):
158    """Unit tests for Lorentzian function"""
159   
160    def setUp(self):
161        from sans.models.Lorentzian import Lorentzian
162        self.lor= Lorentzian()
163       
164    def test1D(self):
165        self.lor.setParam('scale', 2.0)
166        self.lor.setParam('center', 1.0)
167        self.lor.setParam('gamma', 1.0)
168        self.assertEqual(self.lor.run(1.0), 4.0/math.pi)
169        value = 1/math.pi*0.5/(1+.25)
170        self.assertEqual(self.lor.run(2.0), 2.0*value)
171       
172    def test2D(self):
173        self.lor.setParam('scale', 0.5*math.pi)
174        self.lor.setParam('center', 1.0)
175        self.lor.setParam('gamma', 1.0)
176        self.assertEqual(self.lor.run(1.0), 1.0)
177        value = 0.25/(1+.25)
178        self.assertEqual(self.lor.runXY([1.0,2.0]), value)
179        self.assertEqual(self.lor.runXY([2.0,2.0]), value*value)
180       
181    def test2Dphi(self):
182        self.lor.setParam('scale', 0.5*math.pi)
183        self.lor.setParam('center', 1.0)
184        self.lor.setParam('gamma', 1.0)
185        self.assertEqual(self.lor.run(1.0), 1.0)
186        value = 0.25/(1+.25)
187        self.assertAlmostEqual(self.lor.run([math.sqrt(8.0), math.pi/4.0]), value*value, 5)
188       
189class TestSin(unittest.TestCase):
190    """Unit tests for Sin(x) function"""
191   
192    def setUp(self):
193        from sans.models.Sin import Sin
194        self.sin = Sin()
195
196    def test1D(self):
197        self.assertEqual(self.sin.run(1.13), math.sin(1.13))
198       
199    def test2D(self):
200        self.assertEqual(self.sin.run([1.13,0.56]), math.sin(1.13*math.cos(0.56))*math.sin(1.13*math.sin(0.56)))
201        self.assertEqual(self.sin.runXY([1.13,0.56]), math.sin(1.13)*math.sin(0.56))
202       
203class TestCos(unittest.TestCase):
204    """Unit tests for Cos(x) function"""
205   
206    def setUp(self):
207        from sans.models.Cos import Cos
208        self.cos = Cos()
209
210    def test1D(self):
211        self.assertEqual(self.cos.run(1.13), math.cos(1.13))
212       
213    def test2D(self):
214        self.assertEqual(self.cos.run([1.13,0.56]), math.cos(1.13*math.cos(0.56))*math.cos(1.13*math.sin(0.56)))
215        self.assertEqual(self.cos.runXY([1.13,0.56]), math.cos(1.13)*math.cos(0.56))
216       
217class TestConstant(unittest.TestCase):
218    """Unit tests for Cos(x) function"""
219   
220    def setUp(self):
221        from sans.models.Constant import Constant
222        self.const = Constant()
223        self.const.setParam('value',56.1)
224
225    def test1D(self):
226        self.assertEqual(self.const.run(1.13), 56.1)
227       
228    def test2D(self):
229        self.assertEqual(self.const.run([1.13,0.56]), 56.1)
230        self.assertEqual(self.const.runXY([1.13,0.56]), 56.1)
231       
232    def testFunction(self):
233        # version 0.5.0: No longer supported
234        return
235        from sans.models.Sin import Sin
236        s = Sin()
237        A = self.const
238        A.setParam('Value',1.5)
239        B = self.const.clone()
240        B.setParam('value',2.0)
241        C = self.const.clone()
242        C.setParam('value',3.0)
243       
244        f = A+B*s*s+C
245        answer = 1.5+2.0*math.sin(1.1)**2+3.0
246        self.assertEqual(f.run(1.1), answer)
247   
248       
249
250if __name__ == '__main__':
251    unittest.main()
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.