source: sasview/sansmodels/src/sans/models/test/utest_dispersity.py @ e71440c

ESS_GUIESS_GUI_DocsESS_GUI_batch_fittingESS_GUI_bumps_abstractionESS_GUI_iss1116ESS_GUI_iss879ESS_GUI_iss959ESS_GUI_openclESS_GUI_orderingESS_GUI_sync_sascalccostrafo411magnetic_scattrelease-4.1.1release-4.1.2release-4.2.2release_4.0.1ticket-1009ticket-1094-headlessticket-1242-2d-resolutionticket-1243ticket-1249ticket885unittest-saveload
Last change on this file since e71440c was 0f5bc9f, checked in by Mathieu Doucet <doucetm@…>, 16 years ago

Update of all C models to the new style of C++ models
  • Property mode set to 100644
File size: 16.1 KB
Line 
1"""
2    Unit tests for dispersion functionality of
3    C++ model classes
4"""
5
6import unittest, math, numpy
7
8class TestCylinder(unittest.TestCase):
9    """
10        Testing C++ Cylinder model
11    """
12    def setUp(self):
13        from sans.models.CylinderModel import CylinderModel
14        self.model= CylinderModel()
15       
16        self.model.setParam('scale', 1.0)
17        self.model.setParam('radius', 20.0)
18        self.model.setParam('length', 400.0)
19        self.model.setParam('contrast', 3.e-6)
20        self.model.setParam('background', 0.0)
21        self.model.setParam('cyl_theta', 0.0)
22        self.model.setParam('cyl_phi', 0.0)
23       
24    def test_simple(self):
25        self.assertAlmostEqual(self.model.run(0.001), 450.355, 3)
26        self.assertAlmostEqual(self.model.runXY([0.001,0.001]), 452.299, 3)
27       
28    def test_constant(self):
29        from sans.models.dispersion_models import DispersionModel
30        disp = DispersionModel()
31        self.model.setParam('scale', 10.0)
32        self.model.set_dispersion('radius', disp)
33        self.model.dispersion['radius']['width'] = 5.0
34        self.model.dispersion['radius']['npts'] = 100
35       
36        self.assertAlmostEqual(self.model.run(0.001), 4527.47250339, 3)
37        self.assertAlmostEqual(self.model.runXY([0.001, 0.001]), 4546.997777604715, 3)
38       
39    def test_gaussian(self):
40        from sans.models.dispersion_models import GaussianDispersion
41        disp = GaussianDispersion()
42        self.model.set_dispersion('radius', disp)
43        self.model.dispersion['radius']['width'] = 5.0
44        self.model.dispersion['radius']['npts'] = 100
45        self.model.setParam('scale', 10.0)
46       
47        self.assertAlmostEqual(self.model.run(0.001), 4723.32213339, 3)
48        self.assertAlmostEqual(self.model.runXY([0.001,0.001]), 4743.56, 2)
49       
50    def test_array(self):
51        """
52            Perform complete rotational average and
53            compare to 1D
54        """
55        from sans.models.dispersion_models import ArrayDispersion
56        disp_ph = ArrayDispersion()
57        disp_th = ArrayDispersion()
58       
59        values_ph = numpy.zeros(100)
60        values_th = numpy.zeros(100)
61        weights   = numpy.zeros(100)
62        for i in range(100):
63            values_ph[i]=(2.0*math.pi/99.0*i)
64            values_th[i]=(math.pi/99.0*i)
65            weights[i]=(1.0)
66       
67        disp_ph.set_weights(values_ph, weights)
68        disp_th.set_weights(values_th, weights)
69       
70        self.model.set_dispersion('cyl_theta', disp_th)
71        self.model.set_dispersion('cyl_phi', disp_ph)
72       
73        val_1d = self.model.run(math.sqrt(0.0002))
74        val_2d = self.model.runXY([0.01,0.01]) 
75       
76        self.assertTrue(math.fabs(val_1d-val_2d)/val_1d < 0.02)
77       
78class TestCoreShellCylinder(unittest.TestCase):
79    """
80        Testing C++ Cylinder model
81    """
82    def setUp(self):
83        from sans.models.CoreShellCylinderModel import CoreShellCylinderModel
84        self.model= CoreShellCylinderModel()
85       
86        self.model.setParam('scale', 1.0)
87        self.model.setParam('radius', 20.0)
88        self.model.setParam('thickness', 10.0)
89        self.model.setParam('length', 400.0)
90        self.model.setParam('core_sld', 1.e-6)
91        self.model.setParam('shell_sld', 4.e-6)
92        self.model.setParam('solvent_sld', 1.e-6)
93        self.model.setParam('background', 0.0)
94        self.model.setParam('axis_theta', 0.0)
95        self.model.setParam('axis_phi', 0.0)
96       
97    def test_simple(self):
98        """
99            Test simple 1D and 2D values
100            Numbers taken from model that passed validation, before
101            the update to C++ underlying class.
102        """
103        self.assertAlmostEqual(self.model.run(0.001), 353.55013216754583, 3)
104        self.assertAlmostEqual(self.model.runXY([0.001,0.001]), 355.25355270620543, 3)
105       
106    def test_dispersion(self):
107        """
108            Test with dispersion
109        """
110        from sans.models.DisperseModel import DisperseModel
111        disp = DisperseModel(self.model, ['radius', 'thickness', 'length'], [5, 2, 50])
112        disp.setParam('n_pts', 10)
113        self.assertAlmostEqual(disp.run(0.001), 358.44062724936009, 3)
114        self.assertAlmostEqual(disp.runXY([0.001,0.001]), 360.22673635224584, 3)
115
116    def test_new_disp(self):
117        from sans.models.dispersion_models import GaussianDispersion
118        disp_rm = GaussianDispersion()
119        self.model.set_dispersion('radius', disp_rm)
120        self.model.dispersion['radius']['width'] = 5.0
121        self.model.dispersion['radius']['npts'] = 10
122
123        disp_rr = GaussianDispersion()
124        self.model.set_dispersion('thickness', disp_rr)
125        self.model.dispersion['thickness']['width'] = 2.
126        self.model.dispersion['thickness']['npts'] = 10
127
128        disp_len = GaussianDispersion()
129        self.model.set_dispersion('length', disp_len)
130        self.model.dispersion['length']['width'] = 50.0
131        self.model.dispersion['length']['npts'] = 10
132
133        self.assertAlmostEqual(self.model.run(0.001), 358.44062724936009, 3)
134        self.assertAlmostEqual(self.model.runXY([0.001,0.001]), 360.22673635224584, 3)
135       
136
137    def test_array(self):
138        """
139            Perform complete rotational average and
140            compare to 1D
141        """
142        from sans.models.dispersion_models import ArrayDispersion
143        disp_ph = ArrayDispersion()
144        disp_th = ArrayDispersion()
145       
146        values_ph = numpy.zeros(100)
147        values_th = numpy.zeros(100)
148        weights   = numpy.zeros(100)
149        for i in range(100):
150            values_ph[i]=(2.0*math.pi/99.0*i)
151            values_th[i]=(math.pi/99.0*i)
152            weights[i]=(1.0)
153       
154        disp_ph.set_weights(values_ph, weights)
155        disp_th.set_weights(values_th, weights)
156       
157        self.model.set_dispersion('axis_theta', disp_th)
158        self.model.set_dispersion('axis_phi', disp_ph)
159       
160        val_1d = self.model.run(math.sqrt(0.0002))
161        val_2d = self.model.runXY([0.01,0.01]) 
162       
163        self.assertTrue(math.fabs(val_1d-val_2d)/val_1d < 0.02)
164       
165       
166       
167class TestCoreShell(unittest.TestCase):
168    """
169        Testing C++ Cylinder model
170    """
171    def setUp(self):
172        from sans.models.CoreShellModel import CoreShellModel
173        self.model= CoreShellModel()
174       
175        self.model.setParam('scale', 1.0)
176        self.model.setParam('radius', 60.0)
177        self.model.setParam('thickness', 10.0)
178        self.model.setParam('core_sld', 1.e-6)
179        self.model.setParam('shell_sld', 2.e-6)
180        self.model.setParam('solvent_sld', 3.e-6)
181        self.model.setParam('background', 0.0)
182       
183    def test_simple(self):
184        """
185            Test simple 1D and 2D values
186            Numbers taken from model that passed validation, before
187            the update to C++ underlying class.
188        """
189        self.assertAlmostEqual(self.model.run(0.001), 381.27304697150055, 3)
190        self.assertAlmostEqual(self.model.runXY([0.001,0.001]), 380.93779156218682, 3)
191       
192    def test_dispersion(self):
193        """
194            Test with dispersion
195        """
196        from sans.models.DisperseModel import DisperseModel
197        disp = DisperseModel(self.model, ['radius', 'thickness'], [10, 2])
198        disp.setParam('n_pts', 10)
199        self.assertAlmostEqual(disp.run(0.001), 407.344127907553, 3)
200   
201    def test_new_disp(self):
202        from sans.models.dispersion_models import GaussianDispersion
203        disp_rm = GaussianDispersion()
204        self.model.set_dispersion('radius', disp_rm)
205        self.model.dispersion['radius']['width'] = 10.
206        self.model.dispersion['radius']['npts'] = 10
207
208        disp_rr = GaussianDispersion()
209        self.model.set_dispersion('thickness', disp_rr)
210        self.model.dispersion['thickness']['width'] = 2.
211        self.model.dispersion['thickness']['npts'] = 10
212
213
214        self.assertAlmostEqual(self.model.run(0.001), 407.344127907553, 3)
215
216       
217class TestEllipsoid(unittest.TestCase):
218    """
219        Testing C++ Cylinder model
220    """
221    def setUp(self):
222        from sans.models.EllipsoidModel import EllipsoidModel
223        self.model= EllipsoidModel()
224       
225        self.model.setParam('scale', 1.0)
226        self.model.setParam('radius_a', 20.0)
227        self.model.setParam('radius_b', 400.0)
228        self.model.setParam('contrast', 3.e-6)
229        self.model.setParam('background', 0.0)
230        self.model.setParam('axis_theta', 1.57)
231        self.model.setParam('axis_phi', 0.0)
232       
233    def test_simple(self):
234        """
235            Test simple 1D and 2D values
236            Numbers taken from model that passed validation, before
237            the update to C++ underlying class.
238        """
239        self.assertAlmostEqual(self.model.run(0.001), 11808.842896863147, 3)
240        self.assertAlmostEqual(self.model.runXY([0.001,0.001]), 11681.990374929677, 3)
241
242    def test_dispersion(self):
243        """
244            Test with dispersion
245        """
246        from sans.models.DisperseModel import DisperseModel
247        disp = DisperseModel(self.model, ['radius_a', 'radius_b'], [5, 50])
248        disp.setParam('n_pts', 10)
249        self.assertAlmostEqual(disp.run(0.001), 11948.72581312305, 3)
250        self.assertAlmostEqual(disp.runXY([0.001,0.001]), 11811.972359807551, 3)
251       
252    def test_new_disp(self):
253        from sans.models.dispersion_models import GaussianDispersion
254        disp_rm = GaussianDispersion()
255        self.model.set_dispersion('radius_a', disp_rm)
256        self.model.dispersion['radius_a']['width'] = 5.0
257        self.model.dispersion['radius_a']['npts'] = 10
258
259        disp_rr = GaussianDispersion()
260        self.model.set_dispersion('radius_b', disp_rr)
261        self.model.dispersion['radius_b']['width'] = 50.
262        self.model.dispersion['radius_b']['npts'] = 10
263
264
265        self.assertAlmostEqual(self.model.run(0.001), 11948.72581312305, 3)
266        self.assertAlmostEqual(self.model.runXY([0.001,0.001]), 11811.972359807551, 3)
267
268    def test_array(self):
269        """
270            Perform complete rotational average and
271            compare to 1D
272        """
273        from sans.models.dispersion_models import ArrayDispersion
274        disp_ph = ArrayDispersion()
275        disp_th = ArrayDispersion()
276       
277        values_ph = numpy.zeros(100)
278        values_th = numpy.zeros(100)
279        weights   = numpy.zeros(100)
280        for i in range(100):
281            values_ph[i]=(2.0*math.pi/99.0*i)
282            values_th[i]=(math.pi/99.0*i)
283            weights[i]=(1.0)
284       
285        disp_ph.set_weights(values_ph, weights)
286        disp_th.set_weights(values_th, weights)
287       
288        self.model.set_dispersion('axis_theta', disp_th)
289        self.model.set_dispersion('axis_phi', disp_ph)
290       
291        val_1d = self.model.run(math.sqrt(0.0002))
292        val_2d = self.model.runXY([0.01,0.01]) 
293       
294        self.assertTrue(math.fabs(val_1d-val_2d)/val_1d < 0.02)
295       
296       
297       
298class TestSphere(unittest.TestCase):
299    """
300        Testing C++ Cylinder model
301    """
302    def setUp(self):
303        from sans.models.SphereModel import SphereModel
304        self.model= SphereModel()
305       
306        self.model.setParam('scale', 1.0)
307        self.model.setParam('radius', 60.0)
308        self.model.setParam('contrast', 1)
309        self.model.setParam('background', 0.0)
310       
311    def test_simple(self):
312        """
313            Test simple 1D and 2D values
314            Numbers taken from model that passed validation, before
315            the update to C++ underlying class.
316        """
317        self.assertAlmostEqual(self.model.run(0.001), 90412744456148.094, 3)
318        self.assertAlmostEqual(self.model.runXY([0.001,0.001]), 90347660670656.391, 3)
319
320    def test_dispersion(self):
321        """
322            Test with dispersion
323        """
324        from sans.models.DisperseModel import DisperseModel
325        disp = DisperseModel(self.model, ['radius'], [10])
326        disp.setParam('n_pts', 10)
327        self.assertAlmostEqual(disp.run(0.001), 96795008379475.25, 3)
328       
329    def test_new_disp(self):
330        from sans.models.dispersion_models import GaussianDispersion
331        disp_rm = GaussianDispersion()
332        self.model.set_dispersion('radius', disp_rm)
333        self.model.dispersion['radius']['width'] = 10.0
334        self.model.dispersion['radius']['npts'] = 10
335
336        self.assertAlmostEqual(self.model.run(0.001), 96795008379475.25, 3)
337       
338       
339       
340class TestEllipticalCylinder(unittest.TestCase):
341    """
342        Testing C++ Cylinder model
343    """
344    def setUp(self):
345        from sans.models.EllipticalCylinderModel import EllipticalCylinderModel
346        self.model= EllipticalCylinderModel()
347       
348        self.model.setParam('scale', 1.0)
349        self.model.setParam('r_minor', 20.0)
350        self.model.setParam('r_ratio', 1.5)
351        self.model.setParam('length', 400.0)
352        self.model.setParam('contrast', 3.e-6)
353        self.model.setParam('background', 0.0)
354        self.model.setParam('cyl_theta', 1.57)
355        self.model.setParam('cyl_phi', 0.0)
356        self.model.setParam('cyl_psi', 0.0)
357       
358    def test_simple(self):
359        """
360            Test simple 1D and 2D values
361            Numbers taken from model that passed validation, before
362            the update to C++ underlying class.
363        """
364        self.assertAlmostEqual(self.model.run(0.001), 675.50440232504991, 3)
365        self.assertAlmostEqual(self.model.runXY([0.001,0.001]), 669.5173937622792, 3)
366       
367    def test_dispersion(self):
368        """
369            Test with dispersion
370        """
371        from sans.models.DisperseModel import DisperseModel
372        disp = DisperseModel(self.model, ['r_minor', 'r_ratio', 'length'], [5, 0.25, 50])
373        disp.setParam('n_pts', 10)
374        self.assertAlmostEqual(disp.run(0.001), 711.18048194151925, 3)
375        self.assertAlmostEqual(disp.runXY([0.001,0.001]), 704.63525988095705, 3)
376
377    def test_new_disp(self):
378        from sans.models.dispersion_models import GaussianDispersion
379        disp_rm = GaussianDispersion()
380        self.model.set_dispersion('r_minor', disp_rm)
381        self.model.dispersion['r_minor']['width'] = 5.0
382        self.model.dispersion['r_minor']['npts'] = 10
383
384        disp_rr = GaussianDispersion()
385        self.model.set_dispersion('r_ratio', disp_rr)
386        self.model.dispersion['r_ratio']['width'] = 0.25
387        self.model.dispersion['r_ratio']['npts'] = 10
388
389        disp_len = GaussianDispersion()
390        self.model.set_dispersion('length', disp_len)
391        self.model.dispersion['length']['width'] = 50.0
392        self.model.dispersion['length']['npts'] = 10
393
394        self.assertAlmostEqual(self.model.run(0.001), 711.18048194151925, 3)
395        self.assertAlmostEqual(self.model.runXY([0.001,0.001]), 704.63525988095705, 3)
396       
397
398    def test_array(self):
399        """
400            Perform complete rotational average and
401            compare to 1D
402        """
403        from sans.models.dispersion_models import ArrayDispersion
404        disp_ph = ArrayDispersion()
405        disp_th = ArrayDispersion()
406        disp_ps = ArrayDispersion()
407       
408        values_ph = numpy.zeros(100)
409        values_th = numpy.zeros(100)
410        values_ps = numpy.zeros(100)
411        weights   = numpy.zeros(100)
412        for i in range(100):
413            values_ps[i]=(2.0*math.pi/99.0*i)
414            values_ph[i]=(2.0*math.pi/99.0*i)
415            values_th[i]=(math.pi/99.0*i)
416            weights[i]=(1.0)
417       
418        disp_ph.set_weights(values_ph, weights)
419        disp_th.set_weights(values_th, weights)
420        disp_ps.set_weights(values_ps, weights)
421       
422        self.model.set_dispersion('cyl_theta', disp_th)
423        self.model.set_dispersion('cyl_phi', disp_ph)
424        self.model.set_dispersion('cyl_psi', disp_ps)
425       
426        val_1d = self.model.run(math.sqrt(0.0002))
427        val_2d = self.model.runXY([0.01,0.01]) 
428       
429        self.assertTrue(math.fabs(val_1d-val_2d)/val_1d < 0.02)
430       
431       
432 
433if __name__ == '__main__':
434    unittest.main()
435   
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.