models.hh @ 65a8b34

ESS_GUIESS_GUI_DocsESS_GUI_batch_fittingESS_GUI_bumps_abstractionESS_GUI_iss1116ESS_GUI_iss879ESS_GUI_iss959ESS_GUI_openclESS_GUI_orderingESS_GUI_sync_sascalccostrafo411magnetic_scattrelease-4.1.1release-4.1.2release-4.2.2release_4.0.1ticket-1009ticket-1094-headlessticket-1242-2d-resolutionticket-1243ticket-1249ticket885unittest-saveload

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1	/**
2	This software was developed by the University of Tennessee as part of the
3	Distributed Data Analysis of Neutron Scattering Experiments (DANSE)
4	project funded by the US National Science Foundation.
5
6	If you use DANSE applications to do scientific research that leads to
7	publication, we ask that you acknowledge the use of the software with the
8	following sentence:
9
10	"This work benefited from DANSE software developed under NSF award DMR-0520547."
11
12	copyright 2008, University of Tennessee
13	*/
14	#ifndef MODEL_CLASS_H
15	#define MODEL_CLASS_H
16
17	#include <vector>
18	#include "parameters.hh"
19	extern "C" {
20	#include "cylinder.h"
21	#include "parallelepiped.h"
22	#include "lamellarPS.h"
23	#include "lamellar.h"
24	#include "fuzzysphere.h"
25	}
26
27	using namespace std;
28
29	class CylinderModel{
30	public:
31	// Model parameters
32	Parameter radius;
33	Parameter scale;
34	Parameter length;
35	Parameter sldCyl;
36	Parameter sldSolv;
37	Parameter background;
38	Parameter cyl_theta;
39	Parameter cyl_phi;
40
41	// Constructor
42	CylinderModel();
43
44	// Operators to get I(Q)
45	double operator()(double q);
46	double operator()(double qx, double qy);
47	double calculate_ER();
48	double evaluate_rphi(double q, double phi);
49	};
50
51	class ParallelepipedModel{
52	public:
53	// TODO: add 2D
54	// Model parameters
55	Parameter scale;
56	Parameter short_a;
57	Parameter short_b;
58	Parameter long_c;
59	Parameter sldPipe;
60	Parameter sldSolv;
61	Parameter background;
62	Parameter parallel_theta;
63	Parameter parallel_phi;
64	Parameter parallel_psi;
65
66	// Constructor
67	ParallelepipedModel();
68
69	// Operators to get I(Q)
70	double operator()(double q);
71	double operator()(double qx, double qy);
72	double calculate_ER();
73	double evaluate_rphi(double q, double phi);
74	};
75
76
77	class OnionModel{
78	public:
79	// Model parameters
80	Parameter n_shells;
81	Parameter scale;
82	Parameter rad_core;
83	Parameter sld_core;
84	Parameter sld_solv;
85	Parameter background;
86
87	Parameter sld_out_shell1;
88	Parameter sld_out_shell2;
89	Parameter sld_out_shell3;
90	Parameter sld_out_shell4;
91	Parameter sld_out_shell5;
92	Parameter sld_out_shell6;
93	Parameter sld_out_shell7;
94	Parameter sld_out_shell8;
95	Parameter sld_out_shell9;
96	Parameter sld_out_shell10;
97
98	Parameter sld_in_shell1;
99	Parameter sld_in_shell2;
100	Parameter sld_in_shell3;
101	Parameter sld_in_shell4;
102	Parameter sld_in_shell5;
103	Parameter sld_in_shell6;
104	Parameter sld_in_shell7;
105	Parameter sld_in_shell8;
106	Parameter sld_in_shell9;
107	Parameter sld_in_shell10;
108
109	Parameter A_shell1;
110	Parameter A_shell2;
111	Parameter A_shell3;
112	Parameter A_shell4;
113	Parameter A_shell5;
114	Parameter A_shell6;
115	Parameter A_shell7;
116	Parameter A_shell8;
117	Parameter A_shell9;
118	Parameter A_shell10;
119
120	Parameter thick_shell1;
121	Parameter thick_shell2;
122	Parameter thick_shell3;
123	Parameter thick_shell4;
124	Parameter thick_shell5;
125	Parameter thick_shell6;
126	Parameter thick_shell7;
127	Parameter thick_shell8;
128	Parameter thick_shell9;
129	Parameter thick_shell10;
130
131	Parameter func_shell1;
132	Parameter func_shell2;
133	Parameter func_shell3;
134	Parameter func_shell4;
135	Parameter func_shell5;
136	Parameter func_shell6;
137	Parameter func_shell7;
138	Parameter func_shell8;
139	Parameter func_shell9;
140	Parameter func_shell10;
141
142	// Constructor
143	OnionModel();
144
145	// Operators to get I(Q)
146	double operator()(double q);
147	double operator()(double qx, double qy);
148	double calculate_ER();
149	double evaluate_rphi(double q, double phi);
150	};
151
152	class SphereModel{
153	public:
154	// Model parameters
155	Parameter radius;
156	Parameter scale;
157	Parameter sldSph;
158	Parameter sldSolv;
159	Parameter background;
160
161	// Constructor
162	SphereModel();
163
164	// Operators to get I(Q)
165	double operator()(double q);
166	double operator()(double qx, double qy);
167	double calculate_ER();
168	double evaluate_rphi(double q, double phi);
169	};
170
171
172	class FuzzySphereModel{
173	public:
174	// Model parameters
175	Parameter radius;
176	Parameter scale;
177	Parameter fuzziness;
178	Parameter sldSph;
179	Parameter sldSolv;
180	Parameter background;
181
182	// Constructor
183	FuzzySphereModel();
184
185	// Operators to get I(Q)
186	double operator()(double q);
187	double operator()(double qx, double qy);
188	double calculate_ER();
189	double evaluate_rphi(double q, double phi);
190	};
191
192	class HardsphereStructure{
193	public:
194	// Model parameters
195	Parameter effect_radius;
196	Parameter volfraction;
197
198	// Constructor
199	HardsphereStructure();
200
201	// Operators to get I(Q)
202	double operator()(double q);
203	double operator()(double qx, double qy);
204	double calculate_ER();
205	double evaluate_rphi(double q, double phi);
206	};
207
208	class StickyHSStructure{
209	public:
210	// Model parameters
211	Parameter effect_radius;
212	Parameter volfraction;
213	Parameter perturb;
214	Parameter stickiness;
215
216	// Constructor
217	StickyHSStructure();
218
219	// Operators to get I(Q)
220	double operator()(double q);
221	double operator()(double qx, double qy);
222	double calculate_ER();
223	double evaluate_rphi(double q, double phi);
224	};
225
226	class SquareWellStructure{
227	public:
228	// Model parameters
229	Parameter effect_radius;
230	Parameter volfraction;
231	Parameter welldepth;
232	Parameter wellwidth;
233
234	// Constructor
235	SquareWellStructure();
236
237	// Operators to get I(Q)
238	double operator()(double q);
239	double operator()(double qx, double qy);
240	double calculate_ER();
241	double evaluate_rphi(double q, double phi);
242	};
243
244	class HayterMSAStructure{
245	public:
246	// Model parameters
247	Parameter effect_radius;
248	Parameter charge;
249	Parameter volfraction;
250	Parameter temperature;
251	Parameter saltconc;
252	Parameter dielectconst;
253
254	// Constructor
255	HayterMSAStructure();
256
257	// Operators to get I(Q)
258	double operator()(double q);
259	double operator()(double qx, double qy);
260	double calculate_ER();
261	double evaluate_rphi(double q, double phi);
262	};
263
264	class DiamEllipFunc{
265	public:
266	// Model parameters
267	Parameter radius_a;
268	Parameter radius_b;
269
270	// Constructor
271	DiamEllipFunc();
272
273	// Operators to get I(Q)
274	double operator()(double q);
275	double operator()(double qx, double qy);
276	double calculate_ER();
277	double evaluate_rphi(double q, double phi);
278	};
279
280	class DiamCylFunc{
281	public:
282	// Model parameters
283	Parameter radius;
284	Parameter length;
285
286	// Constructor
287	DiamCylFunc();
288
289	// Operators to get I(Q)
290	double operator()(double q);
291	double operator()(double qx, double qy);
292	double calculate_ER();
293	double evaluate_rphi(double q, double phi);
294	};
295
296	class CoreShellModel{
297	public:
298	// Model parameters
299	Parameter radius;
300	Parameter scale;
301	Parameter thickness;
302	Parameter core_sld;
303	Parameter shell_sld;
304	Parameter solvent_sld;
305	Parameter background;
306
307	// Constructor
308	CoreShellModel();
309
310	// Operators to get I(Q)
311	double operator()(double q);
312	double operator()(double qx, double qy);
313	double calculate_ER();
314	double evaluate_rphi(double q, double phi);
315	};
316
317	class CoreFourShellModel{
318	public:
319	// Model parameters
320	Parameter scale;
321	Parameter rad_core;
322	Parameter sld_core;
323	Parameter thick_shell1;
324	Parameter sld_shell1;
325	Parameter thick_shell2;
326	Parameter sld_shell2;
327	Parameter thick_shell3;
328	Parameter sld_shell3;
329	Parameter thick_shell4;
330	Parameter sld_shell4;
331	Parameter sld_solv;
332	Parameter background;
333
334	// Constructor
335	CoreFourShellModel();
336
337	// Operators to get I(Q)
338	double operator()(double q);
339	double operator()(double qx, double qy);
340	double calculate_ER();
341	double evaluate_rphi(double q, double phi);
342	};
343
344	class CoreShellCylinderModel{
345	public:
346	// Model parameters
347	Parameter radius;
348	Parameter scale;
349	Parameter thickness;
350	Parameter length;
351	Parameter core_sld;
352	Parameter shell_sld;
353	Parameter solvent_sld;
354	Parameter background;
355	Parameter axis_theta;
356	Parameter axis_phi;
357
358	// Constructor
359	CoreShellCylinderModel();
360
361	// Operators to get I(Q)
362	double operator()(double q);
363	double operator()(double qx, double qy);
364	double calculate_ER();
365	double evaluate_rphi(double q, double phi);
366	};
367
368	class EllipsoidModel{
369	public:
370	// Model parameters
371	Parameter radius_a;
372	Parameter scale;
373	Parameter radius_b;
374	Parameter sldEll;
375	Parameter sldSolv;
376	Parameter background;
377	Parameter axis_theta;
378	Parameter axis_phi;
379
380	// Constructor
381	EllipsoidModel();
382
383	// Operators to get I(Q)
384	double operator()(double q);
385	double operator()(double qx, double qy);
386	double calculate_ER();
387	double evaluate_rphi(double q, double phi);
388	};
389
390	class EllipticalCylinderModel{
391	public:
392	// Model parameters
393	Parameter r_minor;
394	Parameter scale;
395	Parameter r_ratio;
396	Parameter length;
397	Parameter sldCyl;
398	Parameter sldSolv;
399	Parameter background;
400	Parameter cyl_theta;
401	Parameter cyl_phi;
402	Parameter cyl_psi;
403
404	// Constructor
405	EllipticalCylinderModel();
406
407	// Operators to get I(Q)
408	double operator()(double q);
409	double operator()(double qx, double qy);
410	double calculate_ER();
411	double evaluate_rphi(double q, double phi);
412	};
413	class TriaxialEllipsoidModel{
414	public:
415	// Model parameters
416	Parameter scale;
417	Parameter semi_axisA;
418	Parameter semi_axisB;
419	Parameter semi_axisC;
420	Parameter sldEll;
421	Parameter sldSolv;
422	Parameter background;
423	Parameter axis_theta;
424	Parameter axis_phi;
425	Parameter axis_psi;
426
427	// Constructor
428	TriaxialEllipsoidModel();
429
430	// Operators to get I(Q)
431	double operator()(double q);
432	double operator()(double qx, double qy);
433	double calculate_ER();
434	double evaluate_rphi(double q, double phi);
435	};
436
437	class FlexibleCylinderModel{
438	public:
439	// Model parameters
440	Parameter scale;
441	Parameter length;
442	Parameter kuhn_length;
443	Parameter radius;
444	Parameter sldCyl;
445	Parameter sldSolv;
446	Parameter background;
447
448	// Constructor
449	FlexibleCylinderModel();
450
451	// Operators to get I(Q)
452	double operator()(double q);
453	double operator()(double qx, double qy);
454	double calculate_ER();
455	double evaluate_rphi(double q, double phi);
456	};
457
458	class FlexCylEllipXModel{
459	public:
460	// Model parameters
461	Parameter scale;
462	Parameter length;
463	Parameter kuhn_length;
464	Parameter radius;
465	Parameter axis_ratio;
466	Parameter sldCyl;
467	Parameter sldSolv;
468	Parameter background;
469
470	// Constructor
471	FlexCylEllipXModel();
472
473	// Operators to get I(Q)
474	double operator()(double q);
475	double operator()(double qx, double qy);
476	double calculate_ER();
477	double evaluate_rphi(double q, double phi);
478	};
479
480	class StackedDisksModel{
481	public:
482	// Model parameters
483	Parameter scale;
484	Parameter core_thick;
485	Parameter radius;
486	Parameter layer_thick;
487	Parameter core_sld;
488	Parameter layer_sld;
489	Parameter solvent_sld;
490	Parameter n_stacking;
491	Parameter sigma_d;
492	Parameter background;
493	Parameter axis_theta;
494	Parameter axis_phi;
495
496	// Constructor
497	StackedDisksModel();
498
499	// Operators to get I(Q)
500	double operator()(double q);
501	double operator()(double qx, double qy);
502	double calculate_ER();
503	double evaluate_rphi(double q, double phi);
504	};
505
506	class LamellarModel{
507	public:
508	// Model parameters
509	Parameter scale;
510	Parameter bi_thick;
511	Parameter sld_bi;
512	Parameter sld_sol;
513	Parameter background;
514
515	// Constructor
516	LamellarModel();
517
518	// Operators to get I(Q)
519	double operator()(double q);
520	double operator()(double qx, double qy);
521	double calculate_ER();
522	double evaluate_rphi(double q, double phi);
523
524	};
525
526	class LamellarFFHGModel{
527	public:
528	// Model parameters
529	Parameter scale;
530	Parameter t_length;
531	Parameter h_thickness;
532	Parameter sld_tail;
533	Parameter sld_head;
534	Parameter sld_solvent;
535	Parameter background;
536
537	// Constructor
538	LamellarFFHGModel();
539
540	// Operators to get I(Q)
541	double operator()(double q);
542	double operator()(double qx, double qy);
543	double calculate_ER();
544	double evaluate_rphi(double q, double phi);
545
546	};
547
548
549
550	class LamellarPSModel{
551	public:
552	// Model parameters
553	Parameter scale;
554	Parameter spacing;
555	Parameter delta;
556	Parameter sld_bi;
557	Parameter sld_sol;
558	Parameter n_plates;
559	Parameter caille;
560	Parameter background;
561
562	// Constructor
563	LamellarPSModel();
564
565	// Operators to get I(Q)
566	double operator()(double q);
567	double operator()(double qx, double qy);
568	double calculate_ER();
569	double evaluate_rphi(double q, double phi);
570	};
571
572	class LamellarPSHGModel{
573	public:
574	// Model parameters
575	Parameter scale;
576	Parameter spacing;
577	Parameter deltaT;
578	Parameter deltaH;
579	Parameter sld_tail;
580	Parameter sld_head;
581	Parameter sld_solvent;
582	Parameter n_plates;
583	Parameter caille;
584	Parameter background;
585
586	// Constructor
587	LamellarPSHGModel();
588
589	// Operators to get I(Q)
590	double operator()(double q);
591	double operator()(double qx, double qy);
592	double calculate_ER();
593	double evaluate_rphi(double q, double phi);
594	};
595
596	class CoreShellEllipsoidModel{
597	public:
598	// Model parameters
599	Parameter scale;
600	Parameter equat_core;
601	Parameter polar_core;
602	Parameter equat_shell;
603	Parameter polar_shell;
604	Parameter sld_core;
605	Parameter sld_shell;
606	Parameter sld_solvent;
607	Parameter background;
608	Parameter axis_theta;
609	Parameter axis_phi;
610
611	// Constructor
612	CoreShellEllipsoidModel();
613
614	// Operators to get I(Q)
615	double operator()(double q);
616	double operator()(double qx, double qy);
617	double calculate_ER();
618	double evaluate_rphi(double q, double phi);
619	};
620
621	class HollowCylinderModel{
622	public:
623	// Model parameters
624	Parameter scale;
625	Parameter core_radius;
626	Parameter radius;
627	Parameter length;
628	Parameter sldCyl;
629	Parameter sldSolv;
630	Parameter background;
631	Parameter axis_theta;
632	Parameter axis_phi;
633
634	//Constructor
635	HollowCylinderModel();
636
637	//Operators to get I(Q)
638	double operator()(double q);
639	double operator()(double qx , double qy);
640	double calculate_ER();
641	double evaluate_rphi(double q, double phi);
642	};
643
644	class MultiShellModel{
645	public:
646	// Model parameters
647	Parameter scale;
648	Parameter core_radius;
649	Parameter s_thickness;
650	Parameter w_thickness;
651	Parameter core_sld;
652	Parameter shell_sld;
653	Parameter n_pairs;
654	Parameter background;
655
656	//Constructor
657	MultiShellModel();
658
659	//Operators to get I(Q)
660	double operator()(double q);
661	double operator()(double qx , double qy);
662	double calculate_ER();
663	double evaluate_rphi(double q, double phi);
664	};
665
666	class VesicleModel{
667	public:
668	// Model parameters
669	Parameter scale;
670	Parameter radius;
671	Parameter thickness;
672	Parameter core_sld;
673	Parameter shell_sld;
674	Parameter background;
675
676	//Constructor
677	VesicleModel();
678
679	//Operators to get I(Q)
680	double operator()(double q);
681	double operator()(double qx , double qy);
682	double calculate_ER();
683	double evaluate_rphi(double q, double phi);
684	};
685
686	class BinaryHSModel{
687	public:
688	// Model parameters
689	Parameter l_radius;
690	Parameter s_radius;
691	Parameter vol_frac_ls;
692	Parameter vol_frac_ss;
693	Parameter ls_sld;
694	Parameter ss_sld;
695	Parameter solvent_sld;
696	Parameter background;
697
698	//Constructor
699	BinaryHSModel();
700
701	//Operators to get I(Q)
702	double operator()(double q);
703	double operator()(double qx , double qy);
704	double calculate_ER();
705	double evaluate_rphi(double q, double phi);
706	};
707
708	class BinaryHSPSF11Model{
709	public:
710	// Model parameters
711	Parameter l_radius;
712	Parameter s_radius;
713	Parameter vol_frac_ls;
714	Parameter vol_frac_ss;
715	Parameter ls_sld;
716	Parameter ss_sld;
717	Parameter solvent_sld;
718	Parameter background;
719
720	//Constructor
721	BinaryHSPSF11Model();
722
723	//Operators to get I(Q)
724	double operator()(double q);
725	double operator()(double qx , double qy);
726	double calculate_ER();
727	double evaluate_rphi(double q, double phi);
728	};
729
730	class Poly_GaussCoil{
731	public:
732	// Model parameters
733	Parameter rg;
734	Parameter scale;
735	Parameter poly_m;
736	Parameter background;
737
738	// Constructor
739	Poly_GaussCoil();
740
741	// Operators to get I(Q)
742	double operator()(double q);
743	double operator()(double qx, double qy);
744	double calculate_ER();
745	double evaluate_rphi(double q, double phi);
746	};
747
748	class FractalModel{
749	public:
750	// Model parameters
751	Parameter radius;
752	Parameter scale;
753	Parameter fractal_dim;
754	Parameter cor_length;
755	Parameter sldBlock;
756	Parameter sldSolv;
757	Parameter background;
758
759	// Constructor
760	FractalModel();
761
762	// Operators to get I(Q)
763	double operator()(double q);
764	double operator()(double qx, double qy);
765	double calculate_ER();
766	double evaluate_rphi(double q, double phi);
767	};
768
769	/***
770	class PolymerExclVolModel{
771	public:
772	// Model parameters
773	Parameter rg;
774	Parameter scale;
775	Parameter m;
776	Parameter background;
777
778	// Constructor
779	PolymerExclVolModel();
780
781	// Operators to get I(Q)
782	double operator()(double q);
783	double operator()(double qx, double qy);
784	double calculate_ER();
785	double evaluate_rphi(double q, double phi);
786	};
787	***/
788	#endif

Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.

SasView

source: sasview/sansmodels/src/sans/models/c_models/models.hh @ 65a8b34

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