source: sasview/sansmodels/src/sans/models/c_models/CTriaxialEllipsoidModel.cpp @ 7ef319e

ESS_GUIESS_GUI_DocsESS_GUI_batch_fittingESS_GUI_bumps_abstractionESS_GUI_iss1116ESS_GUI_iss879ESS_GUI_iss959ESS_GUI_openclESS_GUI_orderingESS_GUI_sync_sascalccostrafo411magnetic_scattrelease-4.1.1release-4.1.2release-4.2.2release_4.0.1ticket-1009ticket-1094-headlessticket-1242-2d-resolutionticket-1243ticket-1249ticket885unittest-saveload
Last change on this file since 7ef319e was 9ce41c6, checked in by Gervaise Alina <gervyh@…>, 15 years ago

wrote unittest for all model untested , haven' test critial point error handling
  • Property mode set to 100644
File size: 23.7 KB
Line 
1/**
2        This software was developed by the University of Tennessee as part of the
3        Distributed Data Analysis of Neutron Scattering Experiments (DANSE)
4        project funded by the US National Science Foundation.
5
6        If you use DANSE applications to do scientific research that leads to
7        publication, we ask that you acknowledge the use of the software with the
8        following sentence:
9
10        "This work benefited from DANSE software developed under NSF award DMR-0520547."
11
12        copyright 2008, University of Tennessee
13 */
14
15/** CTriaxialEllipsoidModel
16 *
17 * C extension
18 *
19 * WARNING: THIS FILE WAS GENERATED BY WRAPPERGENERATOR.PY
20 *          DO NOT MODIFY THIS FILE, MODIFY triaxial_ellipsoid.h
21 *          AND RE-RUN THE GENERATOR SCRIPT
22 *
23 */
24#define NO_IMPORT_ARRAY
25#define PY_ARRAY_UNIQUE_SYMBOL PyArray_API_sans
26 
27extern "C" {
28#include <Python.h>
29#include <arrayobject.h>
30#include "structmember.h"
31#include <stdio.h>
32#include <stdlib.h>
33#include <math.h>
34#include <time.h>
35#include "triaxial_ellipsoid.h"
36}
37
38#include "models.hh"
39#include "dispersion_visitor.hh"
40
41/// Error object for raised exceptions
42static PyObject * CTriaxialEllipsoidModelError = NULL;
43
44
45// Class definition
46typedef struct {
47    PyObject_HEAD
48    /// Parameters
49    PyObject * params;
50    /// Dispersion parameters
51    PyObject * dispersion;
52    /// Underlying model object
53    TriaxialEllipsoidModel * model;
54    /// Log for unit testing
55    PyObject * log;
56} CTriaxialEllipsoidModel;
57
58
59static void
60CTriaxialEllipsoidModel_dealloc(CTriaxialEllipsoidModel* self)
61{
62    self->ob_type->tp_free((PyObject*)self);
63   
64
65}
66
67static PyObject *
68CTriaxialEllipsoidModel_new(PyTypeObject *type, PyObject *args, PyObject *kwds)
69{
70    CTriaxialEllipsoidModel *self;
71   
72    self = (CTriaxialEllipsoidModel *)type->tp_alloc(type, 0);
73   
74    return (PyObject *)self;
75}
76
77static int
78CTriaxialEllipsoidModel_init(CTriaxialEllipsoidModel *self, PyObject *args, PyObject *kwds)
79{
80    if (self != NULL) {
81       
82        // Create parameters
83        self->params = PyDict_New();
84        self->dispersion = PyDict_New();
85        self->model = new TriaxialEllipsoidModel();
86       
87        // Initialize parameter dictionary
88        PyDict_SetItemString(self->params,"scale",Py_BuildValue("d",1.000000));
89        PyDict_SetItemString(self->params,"axis_psi",Py_BuildValue("d",0.000000));
90        PyDict_SetItemString(self->params,"axis_theta",Py_BuildValue("d",1.000000));
91        PyDict_SetItemString(self->params,"semi_axisA",Py_BuildValue("d",35.000000));
92        PyDict_SetItemString(self->params,"semi_axisB",Py_BuildValue("d",100.000000));
93        PyDict_SetItemString(self->params,"semi_axisC",Py_BuildValue("d",400.000000));
94        PyDict_SetItemString(self->params,"axis_phi",Py_BuildValue("d",1.000000));
95        PyDict_SetItemString(self->params,"background",Py_BuildValue("d",0.000000));
96        PyDict_SetItemString(self->params,"contrast",Py_BuildValue("d",0.000005));
97        // Initialize dispersion / averaging parameter dict
98        DispersionVisitor* visitor = new DispersionVisitor();
99        PyObject * disp_dict;
100        disp_dict = PyDict_New();
101        self->model->axis_theta.dispersion->accept_as_source(visitor, self->model->axis_theta.dispersion, disp_dict);
102        PyDict_SetItemString(self->dispersion, "axis_theta", disp_dict);
103        disp_dict = PyDict_New();
104        self->model->axis_phi.dispersion->accept_as_source(visitor, self->model->axis_phi.dispersion, disp_dict);
105        PyDict_SetItemString(self->dispersion, "axis_phi", disp_dict);
106        disp_dict = PyDict_New();
107        self->model->axis_psi.dispersion->accept_as_source(visitor, self->model->axis_psi.dispersion, disp_dict);
108        PyDict_SetItemString(self->dispersion, "axis_psi", disp_dict);
109
110
111         
112        // Create empty log
113        self->log = PyDict_New();
114       
115       
116
117    }
118    return 0;
119}
120
121static PyMemberDef CTriaxialEllipsoidModel_members[] = {
122    {"params", T_OBJECT, offsetof(CTriaxialEllipsoidModel, params), 0,
123     "Parameters"},
124        {"dispersion", T_OBJECT, offsetof(CTriaxialEllipsoidModel, dispersion), 0,
125          "Dispersion parameters"},     
126    {"log", T_OBJECT, offsetof(CTriaxialEllipsoidModel, log), 0,
127     "Log"},
128    {NULL}  /* Sentinel */
129};
130
131/** Read double from PyObject
132    @param p PyObject
133    @return double
134*/
135double CTriaxialEllipsoidModel_readDouble(PyObject *p) {
136    if (PyFloat_Check(p)==1) {
137        return (double)(((PyFloatObject *)(p))->ob_fval);
138    } else if (PyInt_Check(p)==1) {
139        return (double)(((PyIntObject *)(p))->ob_ival);
140    } else if (PyLong_Check(p)==1) {
141        return (double)PyLong_AsLong(p);
142    } else {
143        return 0.0;
144    }
145}
146/**
147 * Function to call to evaluate model
148 * @param args: input numpy array q[]
149 * @return: numpy array object
150 */
151 
152static PyObject *evaluateOneDim(TriaxialEllipsoidModel* model, PyArrayObject *q){
153    PyArrayObject *result;
154   
155    // Check validity of array q , q must be of dimension 1, an array of double
156    if (q->nd != 1 || q->descr->type_num != PyArray_DOUBLE)
157    {
158        //const char * message= "Invalid array: q->nd=%d,type_num=%d\n",q->nd,q->descr->type_num;
159        //PyErr_SetString(PyExc_ValueError , message);
160        return NULL;
161    }
162    result = (PyArrayObject *)PyArray_FromDims(q->nd, (int *)(q->dimensions), 
163                                                                                  PyArray_DOUBLE);
164        if (result == NULL) {
165        const char * message= "Could not create result ";
166        PyErr_SetString(PyExc_RuntimeError , message);
167                return NULL;
168        }
169         for (int i = 0; i < q->dimensions[0]; i++){
170      double q_value  = *(double *)(q->data + i*q->strides[0]);
171      double *result_value = (double *)(result->data + i*result->strides[0]);
172      *result_value =(*model)(q_value);
173        }
174    return PyArray_Return(result); 
175 }
176
177 /**
178 * Function to call to evaluate model
179 * @param args: input numpy array  [x[],y[]]
180 * @return: numpy array object
181 */
182 static PyObject * evaluateTwoDimXY( TriaxialEllipsoidModel* model, 
183                              PyArrayObject *x, PyArrayObject *y)
184 {
185    PyArrayObject *result;
186    int i,j, x_len, y_len, dims[2];
187    //check validity of input vectors
188    if (x->nd != 2 || x->descr->type_num != PyArray_DOUBLE
189        || y->nd != 2 || y->descr->type_num != PyArray_DOUBLE
190        || y->dimensions[1] != x->dimensions[0]){
191        const char * message= "evaluateTwoDimXY  expect 2 numpy arrays";
192        PyErr_SetString(PyExc_ValueError , message); 
193        return NULL;
194    }
195   
196        if (PyArray_Check(x) && PyArray_Check(y)) {
197               
198            x_len = dims[1]= x->dimensions[1];
199        y_len = dims[0]= y->dimensions[0];
200           
201            // Make a new double matrix of same dims
202        result=(PyArrayObject *) PyArray_FromDims(2,dims,NPY_DOUBLE);
203        if (result == NULL){
204            const char * message= "Could not create result ";
205        PyErr_SetString(PyExc_RuntimeError , message);
206            return NULL;
207            }
208       
209        /* Do the calculation. */
210        for ( j=0; j< y_len; j++) {
211            for ( i=0; i< x_len; i++) {
212                double x_value = *(double *)(x->data + i*x->strides[1]);
213                    double y_value = *(double *)(y->data + j*y->strides[0]);
214                        double *result_value = (double *)(result->data +
215                              j*result->strides[0] + i*result->strides[1]);
216                        *result_value = (*model)(x_value, y_value);
217            }           
218        }
219        return PyArray_Return(result); 
220       
221        }else{
222                    PyErr_SetString(CTriaxialEllipsoidModelError, 
223                   "CTriaxialEllipsoidModel.evaluateTwoDimXY couldn't run.");
224                return NULL;
225                }       
226}
227/**
228 *  evalDistribution function evaluate a model function with input vector
229 *  @param args: input q as vector or [qx, qy] where qx, qy are vectors
230 *
231 */ 
232static PyObject * evalDistribution(CTriaxialEllipsoidModel *self, PyObject *args){
233        PyObject *qx, *qy;
234        PyArrayObject * pars;
235        int npars ,mpars;
236       
237        // Get parameters
238       
239            // Reader parameter dictionary
240    self->model->scale = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "scale") );
241    self->model->axis_psi = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "axis_psi") );
242    self->model->axis_theta = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "axis_theta") );
243    self->model->semi_axisA = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "semi_axisA") );
244    self->model->semi_axisB = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "semi_axisB") );
245    self->model->semi_axisC = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "semi_axisC") );
246    self->model->axis_phi = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "axis_phi") );
247    self->model->background = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "background") );
248    self->model->contrast = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "contrast") );
249    // Read in dispersion parameters
250    PyObject* disp_dict;
251    DispersionVisitor* visitor = new DispersionVisitor();
252    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "axis_theta");
253    self->model->axis_theta.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->axis_theta.dispersion, disp_dict);
254    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "axis_phi");
255    self->model->axis_phi.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->axis_phi.dispersion, disp_dict);
256    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "axis_psi");
257    self->model->axis_psi.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->axis_psi.dispersion, disp_dict);
258
259       
260        // Get input and determine whether we have to supply a 1D or 2D return value.
261        if ( !PyArg_ParseTuple(args,"O",&pars) ) {
262            PyErr_SetString(CTriaxialEllipsoidModelError, 
263                "CTriaxialEllipsoidModel.evalDistribution expects a q value.");
264                return NULL;
265        }
266    // Check params
267       
268    if(PyArray_Check(pars)==1) {
269               
270            // Length of list should 1 or 2
271            npars = pars->nd; 
272            if(npars==1) {
273                // input is a numpy array
274                if (PyArray_Check(pars)) {
275                        return evaluateOneDim(self->model, (PyArrayObject*)pars); 
276                    }
277                }else{
278                    PyErr_SetString(CTriaxialEllipsoidModelError, 
279                   "CTriaxialEllipsoidModel.evalDistribution expect numpy array of one dimension.");
280                return NULL;
281                }
282    }else if( PyList_Check(pars)==1) {
283        // Length of list should be 2 for I(qx,qy)
284            mpars = PyList_GET_SIZE(pars); 
285            if(mpars!=2) {
286                PyErr_SetString(CTriaxialEllipsoidModelError, 
287                        "CTriaxialEllipsoidModel.evalDistribution expects a list of dimension 2.");
288                return NULL;
289            }
290             qx = PyList_GET_ITEM(pars,0);
291             qy = PyList_GET_ITEM(pars,1);
292             if (PyArray_Check(qx) && PyArray_Check(qy)) {
293                 return evaluateTwoDimXY(self->model, (PyArrayObject*)qx,
294                           (PyArrayObject*)qy);
295                 }else{
296                    PyErr_SetString(CTriaxialEllipsoidModelError, 
297                   "CTriaxialEllipsoidModel.evalDistribution expect 2 numpy arrays in list.");
298                return NULL;
299             }
300        }
301        PyErr_SetString(CTriaxialEllipsoidModelError, 
302                   "CTriaxialEllipsoidModel.evalDistribution couln't be run.");
303        return NULL;
304       
305}
306
307/**
308 * Function to call to evaluate model
309 * @param args: input q or [q,phi]
310 * @return: function value
311 */
312static PyObject * run(CTriaxialEllipsoidModel *self, PyObject *args) {
313        double q_value, phi_value;
314        PyObject* pars;
315        int npars;
316       
317        // Get parameters
318       
319            // Reader parameter dictionary
320    self->model->scale = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "scale") );
321    self->model->axis_psi = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "axis_psi") );
322    self->model->axis_theta = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "axis_theta") );
323    self->model->semi_axisA = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "semi_axisA") );
324    self->model->semi_axisB = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "semi_axisB") );
325    self->model->semi_axisC = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "semi_axisC") );
326    self->model->axis_phi = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "axis_phi") );
327    self->model->background = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "background") );
328    self->model->contrast = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "contrast") );
329    // Read in dispersion parameters
330    PyObject* disp_dict;
331    DispersionVisitor* visitor = new DispersionVisitor();
332    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "axis_theta");
333    self->model->axis_theta.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->axis_theta.dispersion, disp_dict);
334    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "axis_phi");
335    self->model->axis_phi.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->axis_phi.dispersion, disp_dict);
336    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "axis_psi");
337    self->model->axis_psi.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->axis_psi.dispersion, disp_dict);
338
339       
340        // Get input and determine whether we have to supply a 1D or 2D return value.
341        if ( !PyArg_ParseTuple(args,"O",&pars) ) {
342            PyErr_SetString(CTriaxialEllipsoidModelError, 
343                "CTriaxialEllipsoidModel.run expects a q value.");
344                return NULL;
345        }
346         
347        // Check params
348        if( PyList_Check(pars)==1) {
349               
350                // Length of list should be 2 for I(q,phi)
351            npars = PyList_GET_SIZE(pars); 
352            if(npars!=2) {
353                PyErr_SetString(CTriaxialEllipsoidModelError, 
354                        "CTriaxialEllipsoidModel.run expects a double or a list of dimension 2.");
355                return NULL;
356            }
357            // We have a vector q, get the q and phi values at which
358            // to evaluate I(q,phi)
359            q_value = CTriaxialEllipsoidModel_readDouble(PyList_GET_ITEM(pars,0));
360            phi_value = CTriaxialEllipsoidModel_readDouble(PyList_GET_ITEM(pars,1));
361            // Skip zero
362            if (q_value==0) {
363                return Py_BuildValue("d",0.0);
364            }
365                return Py_BuildValue("d",(*(self->model)).evaluate_rphi(q_value,phi_value));
366
367        } else {
368
369                // We have a scalar q, we will evaluate I(q)
370                q_value = CTriaxialEllipsoidModel_readDouble(pars);             
371               
372                return Py_BuildValue("d",(*(self->model))(q_value));
373        }       
374}
375/**
376 * Function to call to calculate_ER
377 * @return: effective radius value
378 */
379static PyObject * calculate_ER(CTriaxialEllipsoidModel *self) {
380
381        PyObject* pars;
382        int npars;
383       
384        // Get parameters
385       
386            // Reader parameter dictionary
387    self->model->scale = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "scale") );
388    self->model->axis_psi = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "axis_psi") );
389    self->model->axis_theta = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "axis_theta") );
390    self->model->semi_axisA = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "semi_axisA") );
391    self->model->semi_axisB = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "semi_axisB") );
392    self->model->semi_axisC = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "semi_axisC") );
393    self->model->axis_phi = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "axis_phi") );
394    self->model->background = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "background") );
395    self->model->contrast = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "contrast") );
396    // Read in dispersion parameters
397    PyObject* disp_dict;
398    DispersionVisitor* visitor = new DispersionVisitor();
399    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "axis_theta");
400    self->model->axis_theta.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->axis_theta.dispersion, disp_dict);
401    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "axis_phi");
402    self->model->axis_phi.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->axis_phi.dispersion, disp_dict);
403    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "axis_psi");
404    self->model->axis_psi.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->axis_psi.dispersion, disp_dict);
405
406               
407        return Py_BuildValue("d",(*(self->model)).calculate_ER());
408
409}
410/**
411 * Function to call to evaluate model in cartesian coordinates
412 * @param args: input q or [qx, qy]]
413 * @return: function value
414 */
415static PyObject * runXY(CTriaxialEllipsoidModel *self, PyObject *args) {
416        double qx_value, qy_value;
417        PyObject* pars;
418        int npars;
419       
420        // Get parameters
421       
422            // Reader parameter dictionary
423    self->model->scale = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "scale") );
424    self->model->axis_psi = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "axis_psi") );
425    self->model->axis_theta = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "axis_theta") );
426    self->model->semi_axisA = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "semi_axisA") );
427    self->model->semi_axisB = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "semi_axisB") );
428    self->model->semi_axisC = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "semi_axisC") );
429    self->model->axis_phi = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "axis_phi") );
430    self->model->background = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "background") );
431    self->model->contrast = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "contrast") );
432    // Read in dispersion parameters
433    PyObject* disp_dict;
434    DispersionVisitor* visitor = new DispersionVisitor();
435    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "axis_theta");
436    self->model->axis_theta.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->axis_theta.dispersion, disp_dict);
437    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "axis_phi");
438    self->model->axis_phi.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->axis_phi.dispersion, disp_dict);
439    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "axis_psi");
440    self->model->axis_psi.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->axis_psi.dispersion, disp_dict);
441
442       
443        // Get input and determine whether we have to supply a 1D or 2D return value.
444        if ( !PyArg_ParseTuple(args,"O",&pars) ) {
445            PyErr_SetString(CTriaxialEllipsoidModelError, 
446                "CTriaxialEllipsoidModel.run expects a q value.");
447                return NULL;
448        }
449         
450        // Check params
451        if( PyList_Check(pars)==1) {
452               
453                // Length of list should be 2 for I(qx, qy))
454            npars = PyList_GET_SIZE(pars); 
455            if(npars!=2) {
456                PyErr_SetString(CTriaxialEllipsoidModelError, 
457                        "CTriaxialEllipsoidModel.run expects a double or a list of dimension 2.");
458                return NULL;
459            }
460            // We have a vector q, get the qx and qy values at which
461            // to evaluate I(qx,qy)
462            qx_value = CTriaxialEllipsoidModel_readDouble(PyList_GET_ITEM(pars,0));
463            qy_value = CTriaxialEllipsoidModel_readDouble(PyList_GET_ITEM(pars,1));
464            return Py_BuildValue("d",(*(self->model))(qx_value,qy_value));
465
466        } else {
467
468                // We have a scalar q, we will evaluate I(q)
469                qx_value = CTriaxialEllipsoidModel_readDouble(pars);           
470               
471                return Py_BuildValue("d",(*(self->model))(qx_value));
472        }       
473}
474
475static PyObject * reset(CTriaxialEllipsoidModel *self, PyObject *args) {
476   
477
478    return Py_BuildValue("d",0.0);
479}
480
481static PyObject * set_dispersion(CTriaxialEllipsoidModel *self, PyObject *args) {
482        PyObject * disp;
483        const char * par_name;
484
485        if ( !PyArg_ParseTuple(args,"sO", &par_name, &disp) ) {
486            PyErr_SetString(CTriaxialEllipsoidModelError,
487                "CTriaxialEllipsoidModel.set_dispersion expects a DispersionModel object.");
488                return NULL;
489        }
490        void *temp = PyCObject_AsVoidPtr(disp);
491        DispersionModel * dispersion = static_cast<DispersionModel *>(temp);
492
493
494        // Ugliness necessary to go from python to C
495            // TODO: refactor this
496    if (!strcmp(par_name, "axis_theta")) {
497        self->model->axis_theta.dispersion = dispersion;
498    } else    if (!strcmp(par_name, "axis_phi")) {
499        self->model->axis_phi.dispersion = dispersion;
500    } else    if (!strcmp(par_name, "axis_psi")) {
501        self->model->axis_psi.dispersion = dispersion;
502    } else {
503            PyErr_SetString(CTriaxialEllipsoidModelError,
504                "CTriaxialEllipsoidModel.set_dispersion expects a valid parameter name.");
505                return NULL;
506        }
507
508        DispersionVisitor* visitor = new DispersionVisitor();
509        PyObject * disp_dict = PyDict_New();
510        dispersion->accept_as_source(visitor, dispersion, disp_dict);
511        PyDict_SetItemString(self->dispersion, par_name, disp_dict);
512    return Py_BuildValue("i",1);
513}
514
515
516static PyMethodDef CTriaxialEllipsoidModel_methods[] = {
517    {"run",      (PyCFunction)run     , METH_VARARGS,
518      "Evaluate the model at a given Q or Q, phi"},
519    {"runXY",      (PyCFunction)runXY     , METH_VARARGS,
520      "Evaluate the model at a given Q or Qx, Qy"},
521    {"calculate_ER",      (PyCFunction)calculate_ER     , METH_VARARGS,
522      "Evaluate the model at a given Q or Q, phi"},
523     
524    {"evalDistribution",  (PyCFunction)evalDistribution , METH_VARARGS,
525      "Evaluate the model at a given Q or Qx, Qy vector "},
526    {"reset",    (PyCFunction)reset   , METH_VARARGS,
527      "Reset pair correlation"},
528    {"set_dispersion",      (PyCFunction)set_dispersion     , METH_VARARGS,
529      "Set the dispersion model for a given parameter"},
530   {NULL}
531};
532
533static PyTypeObject CTriaxialEllipsoidModelType = {
534    PyObject_HEAD_INIT(NULL)
535    0,                         /*ob_size*/
536    "CTriaxialEllipsoidModel",             /*tp_name*/
537    sizeof(CTriaxialEllipsoidModel),             /*tp_basicsize*/
538    0,                         /*tp_itemsize*/
539    (destructor)CTriaxialEllipsoidModel_dealloc, /*tp_dealloc*/
540    0,                         /*tp_print*/
541    0,                         /*tp_getattr*/
542    0,                         /*tp_setattr*/
543    0,                         /*tp_compare*/
544    0,                         /*tp_repr*/
545    0,                         /*tp_as_number*/
546    0,                         /*tp_as_sequence*/
547    0,                         /*tp_as_mapping*/
548    0,                         /*tp_hash */
549    0,                         /*tp_call*/
550    0,                         /*tp_str*/
551    0,                         /*tp_getattro*/
552    0,                         /*tp_setattro*/
553    0,                         /*tp_as_buffer*/
554    Py_TPFLAGS_DEFAULT | Py_TPFLAGS_BASETYPE, /*tp_flags*/
555    "CTriaxialEllipsoidModel objects",           /* tp_doc */
556    0,                         /* tp_traverse */
557    0,                         /* tp_clear */
558    0,                         /* tp_richcompare */
559    0,                         /* tp_weaklistoffset */
560    0,                         /* tp_iter */
561    0,                         /* tp_iternext */
562    CTriaxialEllipsoidModel_methods,             /* tp_methods */
563    CTriaxialEllipsoidModel_members,             /* tp_members */
564    0,                         /* tp_getset */
565    0,                         /* tp_base */
566    0,                         /* tp_dict */
567    0,                         /* tp_descr_get */
568    0,                         /* tp_descr_set */
569    0,                         /* tp_dictoffset */
570    (initproc)CTriaxialEllipsoidModel_init,      /* tp_init */
571    0,                         /* tp_alloc */
572    CTriaxialEllipsoidModel_new,                 /* tp_new */
573};
574
575
576//static PyMethodDef module_methods[] = {
577//    {NULL}
578//};
579
580/**
581 * Function used to add the model class to a module
582 * @param module: module to add the class to
583 */ 
584void addCTriaxialEllipsoidModel(PyObject *module) {
585        PyObject *d;
586       
587    if (PyType_Ready(&CTriaxialEllipsoidModelType) < 0)
588        return;
589
590    Py_INCREF(&CTriaxialEllipsoidModelType);
591    PyModule_AddObject(module, "CTriaxialEllipsoidModel", (PyObject *)&CTriaxialEllipsoidModelType);
592   
593    d = PyModule_GetDict(module);
594    CTriaxialEllipsoidModelError = PyErr_NewException("CTriaxialEllipsoidModel.error", NULL, NULL);
595    PyDict_SetItemString(d, "CTriaxialEllipsoidModelError", CTriaxialEllipsoidModelError);
596}
597
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.