source: sasview/sansmodels/src/sans/models/c_models/CTriaxialEllipsoidModel.cpp @ 04349fe

ESS_GUIESS_GUI_DocsESS_GUI_batch_fittingESS_GUI_bumps_abstractionESS_GUI_iss1116ESS_GUI_iss879ESS_GUI_iss959ESS_GUI_openclESS_GUI_orderingESS_GUI_sync_sascalccostrafo411magnetic_scattrelease-4.1.1release-4.1.2release-4.2.2release_4.0.1ticket-1009ticket-1094-headlessticket-1242-2d-resolutionticket-1243ticket-1249ticket885unittest-saveload
Last change on this file since 04349fe was c724ccd, checked in by Jae Cho <jhjcho@…>, 15 years ago

More models added and correction of Wrappergenerator on model parameter value precision

  • Property mode set to 100644
File size: 23.7 KB
RevLine 
[5068697]1/**
2        This software was developed by the University of Tennessee as part of the
3        Distributed Data Analysis of Neutron Scattering Experiments (DANSE)
4        project funded by the US National Science Foundation.
5
6        If you use DANSE applications to do scientific research that leads to
7        publication, we ask that you acknowledge the use of the software with the
8        following sentence:
9
10        "This work benefited from DANSE software developed under NSF award DMR-0520547."
11
12        copyright 2008, University of Tennessee
13 */
14
15/** CTriaxialEllipsoidModel
16 *
17 * C extension
18 *
19 * WARNING: THIS FILE WAS GENERATED BY WRAPPERGENERATOR.PY
20 *          DO NOT MODIFY THIS FILE, MODIFY triaxial_ellipsoid.h
21 *          AND RE-RUN THE GENERATOR SCRIPT
22 *
23 */
[9bd69098]24#define NO_IMPORT_ARRAY
25#define PY_ARRAY_UNIQUE_SYMBOL PyArray_API_sans
[5068697]26 
27extern "C" {
28#include <Python.h>
[9bd69098]29#include <arrayobject.h>
[5068697]30#include "structmember.h"
31#include <stdio.h>
32#include <stdlib.h>
33#include <math.h>
34#include <time.h>
35#include "triaxial_ellipsoid.h"
36}
37
38#include "models.hh"
39#include "dispersion_visitor.hh"
40
41/// Error object for raised exceptions
42static PyObject * CTriaxialEllipsoidModelError = NULL;
43
44
45// Class definition
46typedef struct {
47    PyObject_HEAD
48    /// Parameters
49    PyObject * params;
50    /// Dispersion parameters
51    PyObject * dispersion;
52    /// Underlying model object
53    TriaxialEllipsoidModel * model;
54    /// Log for unit testing
55    PyObject * log;
56} CTriaxialEllipsoidModel;
57
58
59static void
60CTriaxialEllipsoidModel_dealloc(CTriaxialEllipsoidModel* self)
61{
[71e2de7]62    Py_DECREF(self->params);
63    Py_DECREF(self->dispersion);
64    Py_DECREF(self->log);
65    delete self->model;
[5068697]66    self->ob_type->tp_free((PyObject*)self);
67   
68
69}
70
71static PyObject *
72CTriaxialEllipsoidModel_new(PyTypeObject *type, PyObject *args, PyObject *kwds)
73{
74    CTriaxialEllipsoidModel *self;
75   
76    self = (CTriaxialEllipsoidModel *)type->tp_alloc(type, 0);
77   
78    return (PyObject *)self;
79}
80
81static int
82CTriaxialEllipsoidModel_init(CTriaxialEllipsoidModel *self, PyObject *args, PyObject *kwds)
83{
84    if (self != NULL) {
85       
86        // Create parameters
87        self->params = PyDict_New();
88        self->dispersion = PyDict_New();
89        self->model = new TriaxialEllipsoidModel();
90       
91        // Initialize parameter dictionary
[c724ccd]92        PyDict_SetItemString(self->params,"scale",Py_BuildValue("d",1.00000000));
93        PyDict_SetItemString(self->params,"axis_psi",Py_BuildValue("d",0.00000000));
94        PyDict_SetItemString(self->params,"axis_theta",Py_BuildValue("d",1.00000000));
95        PyDict_SetItemString(self->params,"semi_axisA",Py_BuildValue("d",35.00000000));
96        PyDict_SetItemString(self->params,"semi_axisB",Py_BuildValue("d",100.00000000));
97        PyDict_SetItemString(self->params,"semi_axisC",Py_BuildValue("d",400.00000000));
98        PyDict_SetItemString(self->params,"axis_phi",Py_BuildValue("d",1.00000000));
99        PyDict_SetItemString(self->params,"background",Py_BuildValue("d",0.00000000));
100        PyDict_SetItemString(self->params,"contrast",Py_BuildValue("d",0.00000530));
[5068697]101        // Initialize dispersion / averaging parameter dict
102        DispersionVisitor* visitor = new DispersionVisitor();
103        PyObject * disp_dict;
104        disp_dict = PyDict_New();
105        self->model->axis_theta.dispersion->accept_as_source(visitor, self->model->axis_theta.dispersion, disp_dict);
106        PyDict_SetItemString(self->dispersion, "axis_theta", disp_dict);
107        disp_dict = PyDict_New();
108        self->model->axis_phi.dispersion->accept_as_source(visitor, self->model->axis_phi.dispersion, disp_dict);
109        PyDict_SetItemString(self->dispersion, "axis_phi", disp_dict);
[975ec8e]110        disp_dict = PyDict_New();
111        self->model->axis_psi.dispersion->accept_as_source(visitor, self->model->axis_psi.dispersion, disp_dict);
112        PyDict_SetItemString(self->dispersion, "axis_psi", disp_dict);
[5068697]113
114
115         
116        // Create empty log
117        self->log = PyDict_New();
118       
119       
120
121    }
122    return 0;
123}
124
125static PyMemberDef CTriaxialEllipsoidModel_members[] = {
126    {"params", T_OBJECT, offsetof(CTriaxialEllipsoidModel, params), 0,
127     "Parameters"},
128        {"dispersion", T_OBJECT, offsetof(CTriaxialEllipsoidModel, dispersion), 0,
129          "Dispersion parameters"},     
130    {"log", T_OBJECT, offsetof(CTriaxialEllipsoidModel, log), 0,
131     "Log"},
132    {NULL}  /* Sentinel */
133};
134
135/** Read double from PyObject
136    @param p PyObject
137    @return double
138*/
139double CTriaxialEllipsoidModel_readDouble(PyObject *p) {
140    if (PyFloat_Check(p)==1) {
141        return (double)(((PyFloatObject *)(p))->ob_fval);
142    } else if (PyInt_Check(p)==1) {
143        return (double)(((PyIntObject *)(p))->ob_ival);
144    } else if (PyLong_Check(p)==1) {
145        return (double)PyLong_AsLong(p);
146    } else {
147        return 0.0;
148    }
149}
[9bd69098]150/**
151 * Function to call to evaluate model
152 * @param args: input numpy array q[]
153 * @return: numpy array object
154 */
155 
156static PyObject *evaluateOneDim(TriaxialEllipsoidModel* model, PyArrayObject *q){
157    PyArrayObject *result;
158   
159    // Check validity of array q , q must be of dimension 1, an array of double
160    if (q->nd != 1 || q->descr->type_num != PyArray_DOUBLE)
161    {
162        //const char * message= "Invalid array: q->nd=%d,type_num=%d\n",q->nd,q->descr->type_num;
163        //PyErr_SetString(PyExc_ValueError , message);
164        return NULL;
165    }
166    result = (PyArrayObject *)PyArray_FromDims(q->nd, (int *)(q->dimensions), 
167                                                                                  PyArray_DOUBLE);
168        if (result == NULL) {
169        const char * message= "Could not create result ";
170        PyErr_SetString(PyExc_RuntimeError , message);
171                return NULL;
172        }
173         for (int i = 0; i < q->dimensions[0]; i++){
174      double q_value  = *(double *)(q->data + i*q->strides[0]);
175      double *result_value = (double *)(result->data + i*result->strides[0]);
176      *result_value =(*model)(q_value);
177        }
178    return PyArray_Return(result); 
179 }
[5068697]180
[9bd69098]181 /**
182 * Function to call to evaluate model
183 * @param args: input numpy array  [x[],y[]]
184 * @return: numpy array object
185 */
186 static PyObject * evaluateTwoDimXY( TriaxialEllipsoidModel* model, 
187                              PyArrayObject *x, PyArrayObject *y)
188 {
189    PyArrayObject *result;
[3080527]190    int i,j, x_len, y_len, dims[1];
[9bd69098]191    //check validity of input vectors
[3080527]192    if (x->nd != 1 || x->descr->type_num != PyArray_DOUBLE
193        || y->nd != 1 || y->descr->type_num != PyArray_DOUBLE
194        || y->dimensions[0] != x->dimensions[0]){
[9bd69098]195        const char * message= "evaluateTwoDimXY  expect 2 numpy arrays";
196        PyErr_SetString(PyExc_ValueError , message); 
197        return NULL;
198    }
199   
200        if (PyArray_Check(x) && PyArray_Check(y)) {
[a8d6888]201               
[3080527]202            x_len = dims[0]= x->dimensions[0];
[9ce41c6]203        y_len = dims[0]= y->dimensions[0];
[9bd69098]204           
205            // Make a new double matrix of same dims
[3080527]206        result=(PyArrayObject *) PyArray_FromDims(1,dims,NPY_DOUBLE);
[9bd69098]207        if (result == NULL){
208            const char * message= "Could not create result ";
209        PyErr_SetString(PyExc_RuntimeError , message);
210            return NULL;
211            }
212       
213        /* Do the calculation. */
[3080527]214        for ( i=0; i< x_len; i++) {
215            double x_value = *(double *)(x->data + i*x->strides[0]);
216                    double y_value = *(double *)(y->data + i*y->strides[0]);
217                        double *result_value = (double *)(result->data +
218                              i*result->strides[0]);
219                        *result_value = (*model)(x_value, y_value);
220        }           
[9bd69098]221        return PyArray_Return(result); 
222       
223        }else{
224                    PyErr_SetString(CTriaxialEllipsoidModelError, 
225                   "CTriaxialEllipsoidModel.evaluateTwoDimXY couldn't run.");
226                return NULL;
227                }       
228}
229/**
230 *  evalDistribution function evaluate a model function with input vector
231 *  @param args: input q as vector or [qx, qy] where qx, qy are vectors
232 *
233 */ 
234static PyObject * evalDistribution(CTriaxialEllipsoidModel *self, PyObject *args){
235        PyObject *qx, *qy;
236        PyArrayObject * pars;
237        int npars ,mpars;
238       
239        // Get parameters
240       
241            // Reader parameter dictionary
242    self->model->scale = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "scale") );
[975ec8e]243    self->model->axis_psi = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "axis_psi") );
[9bd69098]244    self->model->axis_theta = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "axis_theta") );
245    self->model->semi_axisA = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "semi_axisA") );
246    self->model->semi_axisB = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "semi_axisB") );
247    self->model->semi_axisC = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "semi_axisC") );
248    self->model->axis_phi = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "axis_phi") );
249    self->model->background = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "background") );
250    self->model->contrast = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "contrast") );
251    // Read in dispersion parameters
252    PyObject* disp_dict;
253    DispersionVisitor* visitor = new DispersionVisitor();
254    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "axis_theta");
255    self->model->axis_theta.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->axis_theta.dispersion, disp_dict);
256    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "axis_phi");
257    self->model->axis_phi.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->axis_phi.dispersion, disp_dict);
[975ec8e]258    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "axis_psi");
259    self->model->axis_psi.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->axis_psi.dispersion, disp_dict);
[9bd69098]260
261       
262        // Get input and determine whether we have to supply a 1D or 2D return value.
263        if ( !PyArg_ParseTuple(args,"O",&pars) ) {
264            PyErr_SetString(CTriaxialEllipsoidModelError, 
265                "CTriaxialEllipsoidModel.evalDistribution expects a q value.");
266                return NULL;
267        }
268    // Check params
269       
270    if(PyArray_Check(pars)==1) {
271               
272            // Length of list should 1 or 2
273            npars = pars->nd; 
274            if(npars==1) {
275                // input is a numpy array
276                if (PyArray_Check(pars)) {
277                        return evaluateOneDim(self->model, (PyArrayObject*)pars); 
278                    }
279                }else{
280                    PyErr_SetString(CTriaxialEllipsoidModelError, 
281                   "CTriaxialEllipsoidModel.evalDistribution expect numpy array of one dimension.");
282                return NULL;
283                }
284    }else if( PyList_Check(pars)==1) {
285        // Length of list should be 2 for I(qx,qy)
286            mpars = PyList_GET_SIZE(pars); 
287            if(mpars!=2) {
288                PyErr_SetString(CTriaxialEllipsoidModelError, 
289                        "CTriaxialEllipsoidModel.evalDistribution expects a list of dimension 2.");
290                return NULL;
291            }
292             qx = PyList_GET_ITEM(pars,0);
293             qy = PyList_GET_ITEM(pars,1);
294             if (PyArray_Check(qx) && PyArray_Check(qy)) {
295                 return evaluateTwoDimXY(self->model, (PyArrayObject*)qx,
296                           (PyArrayObject*)qy);
297                 }else{
298                    PyErr_SetString(CTriaxialEllipsoidModelError, 
299                   "CTriaxialEllipsoidModel.evalDistribution expect 2 numpy arrays in list.");
300                return NULL;
301             }
302        }
[e0a8a3c]303        PyErr_SetString(CTriaxialEllipsoidModelError, 
304                   "CTriaxialEllipsoidModel.evalDistribution couln't be run.");
305        return NULL;
306       
[9bd69098]307}
[5068697]308
309/**
310 * Function to call to evaluate model
311 * @param args: input q or [q,phi]
312 * @return: function value
313 */
314static PyObject * run(CTriaxialEllipsoidModel *self, PyObject *args) {
315        double q_value, phi_value;
316        PyObject* pars;
317        int npars;
318       
319        // Get parameters
320       
321            // Reader parameter dictionary
322    self->model->scale = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "scale") );
[975ec8e]323    self->model->axis_psi = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "axis_psi") );
[5068697]324    self->model->axis_theta = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "axis_theta") );
325    self->model->semi_axisA = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "semi_axisA") );
326    self->model->semi_axisB = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "semi_axisB") );
327    self->model->semi_axisC = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "semi_axisC") );
328    self->model->axis_phi = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "axis_phi") );
329    self->model->background = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "background") );
330    self->model->contrast = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "contrast") );
331    // Read in dispersion parameters
332    PyObject* disp_dict;
333    DispersionVisitor* visitor = new DispersionVisitor();
334    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "axis_theta");
335    self->model->axis_theta.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->axis_theta.dispersion, disp_dict);
336    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "axis_phi");
337    self->model->axis_phi.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->axis_phi.dispersion, disp_dict);
[975ec8e]338    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "axis_psi");
339    self->model->axis_psi.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->axis_psi.dispersion, disp_dict);
[5068697]340
341       
342        // Get input and determine whether we have to supply a 1D or 2D return value.
343        if ( !PyArg_ParseTuple(args,"O",&pars) ) {
344            PyErr_SetString(CTriaxialEllipsoidModelError, 
345                "CTriaxialEllipsoidModel.run expects a q value.");
346                return NULL;
347        }
348         
349        // Check params
350        if( PyList_Check(pars)==1) {
351               
352                // Length of list should be 2 for I(q,phi)
353            npars = PyList_GET_SIZE(pars); 
354            if(npars!=2) {
355                PyErr_SetString(CTriaxialEllipsoidModelError, 
356                        "CTriaxialEllipsoidModel.run expects a double or a list of dimension 2.");
357                return NULL;
358            }
359            // We have a vector q, get the q and phi values at which
360            // to evaluate I(q,phi)
361            q_value = CTriaxialEllipsoidModel_readDouble(PyList_GET_ITEM(pars,0));
362            phi_value = CTriaxialEllipsoidModel_readDouble(PyList_GET_ITEM(pars,1));
363            // Skip zero
364            if (q_value==0) {
365                return Py_BuildValue("d",0.0);
366            }
367                return Py_BuildValue("d",(*(self->model)).evaluate_rphi(q_value,phi_value));
368
369        } else {
370
371                // We have a scalar q, we will evaluate I(q)
372                q_value = CTriaxialEllipsoidModel_readDouble(pars);             
373               
374                return Py_BuildValue("d",(*(self->model))(q_value));
375        }       
376}
[5eb9154]377/**
378 * Function to call to calculate_ER
379 * @return: effective radius value
380 */
381static PyObject * calculate_ER(CTriaxialEllipsoidModel *self) {
[5068697]382
[5eb9154]383        PyObject* pars;
384        int npars;
385       
386        // Get parameters
387       
388            // Reader parameter dictionary
389    self->model->scale = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "scale") );
390    self->model->axis_psi = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "axis_psi") );
391    self->model->axis_theta = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "axis_theta") );
392    self->model->semi_axisA = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "semi_axisA") );
393    self->model->semi_axisB = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "semi_axisB") );
394    self->model->semi_axisC = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "semi_axisC") );
395    self->model->axis_phi = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "axis_phi") );
396    self->model->background = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "background") );
397    self->model->contrast = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "contrast") );
398    // Read in dispersion parameters
399    PyObject* disp_dict;
400    DispersionVisitor* visitor = new DispersionVisitor();
401    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "axis_theta");
402    self->model->axis_theta.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->axis_theta.dispersion, disp_dict);
403    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "axis_phi");
404    self->model->axis_phi.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->axis_phi.dispersion, disp_dict);
405    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "axis_psi");
406    self->model->axis_psi.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->axis_psi.dispersion, disp_dict);
407
408               
409        return Py_BuildValue("d",(*(self->model)).calculate_ER());
410
411}
[5068697]412/**
413 * Function to call to evaluate model in cartesian coordinates
414 * @param args: input q or [qx, qy]]
415 * @return: function value
416 */
417static PyObject * runXY(CTriaxialEllipsoidModel *self, PyObject *args) {
418        double qx_value, qy_value;
419        PyObject* pars;
420        int npars;
421       
422        // Get parameters
423       
424            // Reader parameter dictionary
425    self->model->scale = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "scale") );
[975ec8e]426    self->model->axis_psi = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "axis_psi") );
[5068697]427    self->model->axis_theta = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "axis_theta") );
428    self->model->semi_axisA = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "semi_axisA") );
429    self->model->semi_axisB = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "semi_axisB") );
430    self->model->semi_axisC = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "semi_axisC") );
431    self->model->axis_phi = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "axis_phi") );
432    self->model->background = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "background") );
433    self->model->contrast = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "contrast") );
434    // Read in dispersion parameters
435    PyObject* disp_dict;
436    DispersionVisitor* visitor = new DispersionVisitor();
437    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "axis_theta");
438    self->model->axis_theta.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->axis_theta.dispersion, disp_dict);
439    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "axis_phi");
440    self->model->axis_phi.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->axis_phi.dispersion, disp_dict);
[975ec8e]441    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "axis_psi");
442    self->model->axis_psi.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->axis_psi.dispersion, disp_dict);
[5068697]443
444       
445        // Get input and determine whether we have to supply a 1D or 2D return value.
446        if ( !PyArg_ParseTuple(args,"O",&pars) ) {
447            PyErr_SetString(CTriaxialEllipsoidModelError, 
448                "CTriaxialEllipsoidModel.run expects a q value.");
449                return NULL;
450        }
451         
452        // Check params
453        if( PyList_Check(pars)==1) {
454               
455                // Length of list should be 2 for I(qx, qy))
456            npars = PyList_GET_SIZE(pars); 
457            if(npars!=2) {
458                PyErr_SetString(CTriaxialEllipsoidModelError, 
459                        "CTriaxialEllipsoidModel.run expects a double or a list of dimension 2.");
460                return NULL;
461            }
462            // We have a vector q, get the qx and qy values at which
463            // to evaluate I(qx,qy)
464            qx_value = CTriaxialEllipsoidModel_readDouble(PyList_GET_ITEM(pars,0));
465            qy_value = CTriaxialEllipsoidModel_readDouble(PyList_GET_ITEM(pars,1));
466            return Py_BuildValue("d",(*(self->model))(qx_value,qy_value));
467
468        } else {
469
470                // We have a scalar q, we will evaluate I(q)
471                qx_value = CTriaxialEllipsoidModel_readDouble(pars);           
472               
473                return Py_BuildValue("d",(*(self->model))(qx_value));
474        }       
475}
476
477static PyObject * reset(CTriaxialEllipsoidModel *self, PyObject *args) {
478   
479
480    return Py_BuildValue("d",0.0);
481}
482
483static PyObject * set_dispersion(CTriaxialEllipsoidModel *self, PyObject *args) {
484        PyObject * disp;
485        const char * par_name;
486
487        if ( !PyArg_ParseTuple(args,"sO", &par_name, &disp) ) {
488            PyErr_SetString(CTriaxialEllipsoidModelError,
489                "CTriaxialEllipsoidModel.set_dispersion expects a DispersionModel object.");
490                return NULL;
491        }
492        void *temp = PyCObject_AsVoidPtr(disp);
493        DispersionModel * dispersion = static_cast<DispersionModel *>(temp);
494
495
496        // Ugliness necessary to go from python to C
497            // TODO: refactor this
498    if (!strcmp(par_name, "axis_theta")) {
499        self->model->axis_theta.dispersion = dispersion;
500    } else    if (!strcmp(par_name, "axis_phi")) {
501        self->model->axis_phi.dispersion = dispersion;
[975ec8e]502    } else    if (!strcmp(par_name, "axis_psi")) {
503        self->model->axis_psi.dispersion = dispersion;
[5068697]504    } else {
505            PyErr_SetString(CTriaxialEllipsoidModelError,
506                "CTriaxialEllipsoidModel.set_dispersion expects a valid parameter name.");
507                return NULL;
508        }
509
510        DispersionVisitor* visitor = new DispersionVisitor();
511        PyObject * disp_dict = PyDict_New();
512        dispersion->accept_as_source(visitor, dispersion, disp_dict);
513        PyDict_SetItemString(self->dispersion, par_name, disp_dict);
514    return Py_BuildValue("i",1);
515}
516
517
518static PyMethodDef CTriaxialEllipsoidModel_methods[] = {
519    {"run",      (PyCFunction)run     , METH_VARARGS,
520      "Evaluate the model at a given Q or Q, phi"},
521    {"runXY",      (PyCFunction)runXY     , METH_VARARGS,
522      "Evaluate the model at a given Q or Qx, Qy"},
[5eb9154]523    {"calculate_ER",      (PyCFunction)calculate_ER     , METH_VARARGS,
524      "Evaluate the model at a given Q or Q, phi"},
[9bd69098]525     
526    {"evalDistribution",  (PyCFunction)evalDistribution , METH_VARARGS,
527      "Evaluate the model at a given Q or Qx, Qy vector "},
[5068697]528    {"reset",    (PyCFunction)reset   , METH_VARARGS,
529      "Reset pair correlation"},
530    {"set_dispersion",      (PyCFunction)set_dispersion     , METH_VARARGS,
531      "Set the dispersion model for a given parameter"},
532   {NULL}
533};
534
535static PyTypeObject CTriaxialEllipsoidModelType = {
536    PyObject_HEAD_INIT(NULL)
537    0,                         /*ob_size*/
538    "CTriaxialEllipsoidModel",             /*tp_name*/
539    sizeof(CTriaxialEllipsoidModel),             /*tp_basicsize*/
540    0,                         /*tp_itemsize*/
541    (destructor)CTriaxialEllipsoidModel_dealloc, /*tp_dealloc*/
542    0,                         /*tp_print*/
543    0,                         /*tp_getattr*/
544    0,                         /*tp_setattr*/
545    0,                         /*tp_compare*/
546    0,                         /*tp_repr*/
547    0,                         /*tp_as_number*/
548    0,                         /*tp_as_sequence*/
549    0,                         /*tp_as_mapping*/
550    0,                         /*tp_hash */
551    0,                         /*tp_call*/
552    0,                         /*tp_str*/
553    0,                         /*tp_getattro*/
554    0,                         /*tp_setattro*/
555    0,                         /*tp_as_buffer*/
556    Py_TPFLAGS_DEFAULT | Py_TPFLAGS_BASETYPE, /*tp_flags*/
557    "CTriaxialEllipsoidModel objects",           /* tp_doc */
558    0,                         /* tp_traverse */
559    0,                         /* tp_clear */
560    0,                         /* tp_richcompare */
561    0,                         /* tp_weaklistoffset */
562    0,                         /* tp_iter */
563    0,                         /* tp_iternext */
564    CTriaxialEllipsoidModel_methods,             /* tp_methods */
565    CTriaxialEllipsoidModel_members,             /* tp_members */
566    0,                         /* tp_getset */
567    0,                         /* tp_base */
568    0,                         /* tp_dict */
569    0,                         /* tp_descr_get */
570    0,                         /* tp_descr_set */
571    0,                         /* tp_dictoffset */
572    (initproc)CTriaxialEllipsoidModel_init,      /* tp_init */
573    0,                         /* tp_alloc */
574    CTriaxialEllipsoidModel_new,                 /* tp_new */
575};
576
577
[9bd69098]578//static PyMethodDef module_methods[] = {
579//    {NULL}
580//};
[5068697]581
582/**
583 * Function used to add the model class to a module
584 * @param module: module to add the class to
585 */ 
586void addCTriaxialEllipsoidModel(PyObject *module) {
587        PyObject *d;
588       
589    if (PyType_Ready(&CTriaxialEllipsoidModelType) < 0)
590        return;
591
592    Py_INCREF(&CTriaxialEllipsoidModelType);
593    PyModule_AddObject(module, "CTriaxialEllipsoidModel", (PyObject *)&CTriaxialEllipsoidModelType);
594   
595    d = PyModule_GetDict(module);
596    CTriaxialEllipsoidModelError = PyErr_NewException("CTriaxialEllipsoidModel.error", NULL, NULL);
597    PyDict_SetItemString(d, "CTriaxialEllipsoidModelError", CTriaxialEllipsoidModelError);
598}
599
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.