source: sasview/sansmodels/src/sans/models/c_models/COblateModel.cpp @ 5536035

ESS_GUIESS_GUI_DocsESS_GUI_batch_fittingESS_GUI_bumps_abstractionESS_GUI_iss1116ESS_GUI_iss879ESS_GUI_iss959ESS_GUI_openclESS_GUI_orderingESS_GUI_sync_sascalccostrafo411magnetic_scattrelease-4.1.1release-4.1.2release-4.2.2release_4.0.1ticket-1009ticket-1094-headlessticket-1242-2d-resolutionticket-1243ticket-1249ticket885unittest-saveload
Last change on this file since 5536035 was c724ccd, checked in by Jae Cho <jhjcho@…>, 15 years ago

More models added and correction of Wrappergenerator on model parameter value precision

  • Property mode set to 100644
File size: 24.6 KB
RevLine 
[9ce41c6]1/**
2        This software was developed by the University of Tennessee as part of the
3        Distributed Data Analysis of Neutron Scattering Experiments (DANSE)
4        project funded by the US National Science Foundation.
5
6        If you use DANSE applications to do scientific research that leads to
7        publication, we ask that you acknowledge the use of the software with the
8        following sentence:
9
10        "This work benefited from DANSE software developed under NSF award DMR-0520547."
11
12        copyright 2008, University of Tennessee
13 */
14
15/** COblateModel
16 *
17 * C extension
18 *
19 * WARNING: THIS FILE WAS GENERATED BY WRAPPERGENERATOR.PY
20 *          DO NOT MODIFY THIS FILE, MODIFY oblate.h
21 *          AND RE-RUN THE GENERATOR SCRIPT
22 *
23 */
24#define NO_IMPORT_ARRAY
25#define PY_ARRAY_UNIQUE_SYMBOL PyArray_API_sans
26 
27extern "C" {
28#include <Python.h>
29#include <arrayobject.h>
30#include "structmember.h"
31#include <stdio.h>
32#include <stdlib.h>
33#include <math.h>
34#include <time.h>
35#include "oblate.h"
36}
37
38#include "models.hh"
39#include "dispersion_visitor.hh"
40
41/// Error object for raised exceptions
42static PyObject * COblateModelError = NULL;
43
44
45// Class definition
46typedef struct {
47    PyObject_HEAD
48    /// Parameters
49    PyObject * params;
50    /// Dispersion parameters
51    PyObject * dispersion;
52    /// Underlying model object
53    OblateModel * model;
54    /// Log for unit testing
55    PyObject * log;
56} COblateModel;
57
58
59static void
60COblateModel_dealloc(COblateModel* self)
61{
[71e2de7]62    Py_DECREF(self->params);
63    Py_DECREF(self->dispersion);
64    Py_DECREF(self->log);
65    delete self->model;
[9ce41c6]66    self->ob_type->tp_free((PyObject*)self);
67   
68
69}
70
71static PyObject *
72COblateModel_new(PyTypeObject *type, PyObject *args, PyObject *kwds)
73{
74    COblateModel *self;
75   
76    self = (COblateModel *)type->tp_alloc(type, 0);
77   
78    return (PyObject *)self;
79}
80
81static int
82COblateModel_init(COblateModel *self, PyObject *args, PyObject *kwds)
83{
84    if (self != NULL) {
85       
86        // Create parameters
87        self->params = PyDict_New();
88        self->dispersion = PyDict_New();
89        self->model = new OblateModel();
90       
91        // Initialize parameter dictionary
[c724ccd]92        PyDict_SetItemString(self->params,"major_core",Py_BuildValue("d",200.00000000));
93        PyDict_SetItemString(self->params,"scale",Py_BuildValue("d",1.00000000));
94        PyDict_SetItemString(self->params,"minor_core",Py_BuildValue("d",20.00000000));
95        PyDict_SetItemString(self->params,"axis_theta",Py_BuildValue("d",1.00000000));
96        PyDict_SetItemString(self->params,"sld_solvent",Py_BuildValue("d",0.00000630));
97        PyDict_SetItemString(self->params,"axis_phi",Py_BuildValue("d",1.00000000));
98        PyDict_SetItemString(self->params,"background",Py_BuildValue("d",0.00100000));
99        PyDict_SetItemString(self->params,"major_shell",Py_BuildValue("d",250.00000000));
100        PyDict_SetItemString(self->params,"contrast",Py_BuildValue("d",0.00000100));
101        PyDict_SetItemString(self->params,"minor_shell",Py_BuildValue("d",30.00000000));
[9ce41c6]102        // Initialize dispersion / averaging parameter dict
103        DispersionVisitor* visitor = new DispersionVisitor();
104        PyObject * disp_dict;
105        disp_dict = PyDict_New();
106        self->model->major_core.dispersion->accept_as_source(visitor, self->model->major_core.dispersion, disp_dict);
107        PyDict_SetItemString(self->dispersion, "major_core", disp_dict);
108        disp_dict = PyDict_New();
109        self->model->minor_core.dispersion->accept_as_source(visitor, self->model->minor_core.dispersion, disp_dict);
110        PyDict_SetItemString(self->dispersion, "minor_core", disp_dict);
111        disp_dict = PyDict_New();
112        self->model->major_shell.dispersion->accept_as_source(visitor, self->model->major_shell.dispersion, disp_dict);
113        PyDict_SetItemString(self->dispersion, "major_shell", disp_dict);
114        disp_dict = PyDict_New();
115        self->model->minor_shell.dispersion->accept_as_source(visitor, self->model->minor_shell.dispersion, disp_dict);
116        PyDict_SetItemString(self->dispersion, "minor_shell", disp_dict);
117
118
119         
120        // Create empty log
121        self->log = PyDict_New();
122       
123       
124
125    }
126    return 0;
127}
128
129static PyMemberDef COblateModel_members[] = {
130    {"params", T_OBJECT, offsetof(COblateModel, params), 0,
131     "Parameters"},
132        {"dispersion", T_OBJECT, offsetof(COblateModel, dispersion), 0,
133          "Dispersion parameters"},     
134    {"log", T_OBJECT, offsetof(COblateModel, log), 0,
135     "Log"},
136    {NULL}  /* Sentinel */
137};
138
139/** Read double from PyObject
140    @param p PyObject
141    @return double
142*/
143double COblateModel_readDouble(PyObject *p) {
144    if (PyFloat_Check(p)==1) {
145        return (double)(((PyFloatObject *)(p))->ob_fval);
146    } else if (PyInt_Check(p)==1) {
147        return (double)(((PyIntObject *)(p))->ob_ival);
148    } else if (PyLong_Check(p)==1) {
149        return (double)PyLong_AsLong(p);
150    } else {
151        return 0.0;
152    }
153}
154/**
155 * Function to call to evaluate model
156 * @param args: input numpy array q[]
157 * @return: numpy array object
158 */
159 
160static PyObject *evaluateOneDim(OblateModel* model, PyArrayObject *q){
161    PyArrayObject *result;
162   
163    // Check validity of array q , q must be of dimension 1, an array of double
164    if (q->nd != 1 || q->descr->type_num != PyArray_DOUBLE)
165    {
166        //const char * message= "Invalid array: q->nd=%d,type_num=%d\n",q->nd,q->descr->type_num;
167        //PyErr_SetString(PyExc_ValueError , message);
168        return NULL;
169    }
170    result = (PyArrayObject *)PyArray_FromDims(q->nd, (int *)(q->dimensions), 
171                                                                                  PyArray_DOUBLE);
172        if (result == NULL) {
173        const char * message= "Could not create result ";
174        PyErr_SetString(PyExc_RuntimeError , message);
175                return NULL;
176        }
177         for (int i = 0; i < q->dimensions[0]; i++){
178      double q_value  = *(double *)(q->data + i*q->strides[0]);
179      double *result_value = (double *)(result->data + i*result->strides[0]);
180      *result_value =(*model)(q_value);
181        }
182    return PyArray_Return(result); 
183 }
184
185 /**
186 * Function to call to evaluate model
187 * @param args: input numpy array  [x[],y[]]
188 * @return: numpy array object
189 */
190 static PyObject * evaluateTwoDimXY( OblateModel* model, 
191                              PyArrayObject *x, PyArrayObject *y)
192 {
193    PyArrayObject *result;
[3080527]194    int i,j, x_len, y_len, dims[1];
[9ce41c6]195    //check validity of input vectors
[3080527]196    if (x->nd != 1 || x->descr->type_num != PyArray_DOUBLE
197        || y->nd != 1 || y->descr->type_num != PyArray_DOUBLE
198        || y->dimensions[0] != x->dimensions[0]){
[9ce41c6]199        const char * message= "evaluateTwoDimXY  expect 2 numpy arrays";
200        PyErr_SetString(PyExc_ValueError , message); 
201        return NULL;
202    }
203   
204        if (PyArray_Check(x) && PyArray_Check(y)) {
205               
[3080527]206            x_len = dims[0]= x->dimensions[0];
[9ce41c6]207        y_len = dims[0]= y->dimensions[0];
208           
209            // Make a new double matrix of same dims
[3080527]210        result=(PyArrayObject *) PyArray_FromDims(1,dims,NPY_DOUBLE);
[9ce41c6]211        if (result == NULL){
212            const char * message= "Could not create result ";
213        PyErr_SetString(PyExc_RuntimeError , message);
214            return NULL;
215            }
216       
217        /* Do the calculation. */
[3080527]218        for ( i=0; i< x_len; i++) {
219            double x_value = *(double *)(x->data + i*x->strides[0]);
220                    double y_value = *(double *)(y->data + i*y->strides[0]);
221                        double *result_value = (double *)(result->data +
222                              i*result->strides[0]);
223                        *result_value = (*model)(x_value, y_value);
224        }           
[9ce41c6]225        return PyArray_Return(result); 
226       
227        }else{
228                    PyErr_SetString(COblateModelError, 
229                   "COblateModel.evaluateTwoDimXY couldn't run.");
230                return NULL;
231                }       
232}
233/**
234 *  evalDistribution function evaluate a model function with input vector
235 *  @param args: input q as vector or [qx, qy] where qx, qy are vectors
236 *
237 */ 
238static PyObject * evalDistribution(COblateModel *self, PyObject *args){
239        PyObject *qx, *qy;
240        PyArrayObject * pars;
241        int npars ,mpars;
242       
243        // Get parameters
244       
245            // Reader parameter dictionary
246    self->model->major_core = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "major_core") );
247    self->model->scale = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "scale") );
248    self->model->minor_core = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "minor_core") );
249    self->model->axis_theta = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "axis_theta") );
250    self->model->sld_solvent = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "sld_solvent") );
251    self->model->axis_phi = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "axis_phi") );
252    self->model->background = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "background") );
253    self->model->major_shell = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "major_shell") );
254    self->model->contrast = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "contrast") );
255    self->model->minor_shell = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "minor_shell") );
256    // Read in dispersion parameters
257    PyObject* disp_dict;
258    DispersionVisitor* visitor = new DispersionVisitor();
259    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "major_core");
260    self->model->major_core.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->major_core.dispersion, disp_dict);
261    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "minor_core");
262    self->model->minor_core.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->minor_core.dispersion, disp_dict);
263    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "major_shell");
264    self->model->major_shell.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->major_shell.dispersion, disp_dict);
265    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "minor_shell");
266    self->model->minor_shell.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->minor_shell.dispersion, disp_dict);
267
268       
269        // Get input and determine whether we have to supply a 1D or 2D return value.
270        if ( !PyArg_ParseTuple(args,"O",&pars) ) {
271            PyErr_SetString(COblateModelError, 
272                "COblateModel.evalDistribution expects a q value.");
273                return NULL;
274        }
275    // Check params
276       
277    if(PyArray_Check(pars)==1) {
278               
279            // Length of list should 1 or 2
280            npars = pars->nd; 
281            if(npars==1) {
282                // input is a numpy array
283                if (PyArray_Check(pars)) {
284                        return evaluateOneDim(self->model, (PyArrayObject*)pars); 
285                    }
286                }else{
287                    PyErr_SetString(COblateModelError, 
288                   "COblateModel.evalDistribution expect numpy array of one dimension.");
289                return NULL;
290                }
291    }else if( PyList_Check(pars)==1) {
292        // Length of list should be 2 for I(qx,qy)
293            mpars = PyList_GET_SIZE(pars); 
294            if(mpars!=2) {
295                PyErr_SetString(COblateModelError, 
296                        "COblateModel.evalDistribution expects a list of dimension 2.");
297                return NULL;
298            }
299             qx = PyList_GET_ITEM(pars,0);
300             qy = PyList_GET_ITEM(pars,1);
301             if (PyArray_Check(qx) && PyArray_Check(qy)) {
302                 return evaluateTwoDimXY(self->model, (PyArrayObject*)qx,
303                           (PyArrayObject*)qy);
304                 }else{
305                    PyErr_SetString(COblateModelError, 
306                   "COblateModel.evalDistribution expect 2 numpy arrays in list.");
307                return NULL;
308             }
309        }
310        PyErr_SetString(COblateModelError, 
311                   "COblateModel.evalDistribution couln't be run.");
312        return NULL;
313       
314}
315
316/**
317 * Function to call to evaluate model
318 * @param args: input q or [q,phi]
319 * @return: function value
320 */
321static PyObject * run(COblateModel *self, PyObject *args) {
322        double q_value, phi_value;
323        PyObject* pars;
324        int npars;
325       
326        // Get parameters
327       
328            // Reader parameter dictionary
329    self->model->major_core = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "major_core") );
330    self->model->scale = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "scale") );
331    self->model->minor_core = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "minor_core") );
332    self->model->axis_theta = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "axis_theta") );
333    self->model->sld_solvent = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "sld_solvent") );
334    self->model->axis_phi = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "axis_phi") );
335    self->model->background = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "background") );
336    self->model->major_shell = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "major_shell") );
337    self->model->contrast = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "contrast") );
338    self->model->minor_shell = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "minor_shell") );
339    // Read in dispersion parameters
340    PyObject* disp_dict;
341    DispersionVisitor* visitor = new DispersionVisitor();
342    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "major_core");
343    self->model->major_core.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->major_core.dispersion, disp_dict);
344    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "minor_core");
345    self->model->minor_core.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->minor_core.dispersion, disp_dict);
346    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "major_shell");
347    self->model->major_shell.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->major_shell.dispersion, disp_dict);
348    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "minor_shell");
349    self->model->minor_shell.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->minor_shell.dispersion, disp_dict);
350
351       
352        // Get input and determine whether we have to supply a 1D or 2D return value.
353        if ( !PyArg_ParseTuple(args,"O",&pars) ) {
354            PyErr_SetString(COblateModelError, 
355                "COblateModel.run expects a q value.");
356                return NULL;
357        }
358         
359        // Check params
360        if( PyList_Check(pars)==1) {
361               
362                // Length of list should be 2 for I(q,phi)
363            npars = PyList_GET_SIZE(pars); 
364            if(npars!=2) {
365                PyErr_SetString(COblateModelError, 
366                        "COblateModel.run expects a double or a list of dimension 2.");
367                return NULL;
368            }
369            // We have a vector q, get the q and phi values at which
370            // to evaluate I(q,phi)
371            q_value = COblateModel_readDouble(PyList_GET_ITEM(pars,0));
372            phi_value = COblateModel_readDouble(PyList_GET_ITEM(pars,1));
373            // Skip zero
374            if (q_value==0) {
375                return Py_BuildValue("d",0.0);
376            }
377                return Py_BuildValue("d",(*(self->model)).evaluate_rphi(q_value,phi_value));
378
379        } else {
380
381                // We have a scalar q, we will evaluate I(q)
382                q_value = COblateModel_readDouble(pars);               
383               
384                return Py_BuildValue("d",(*(self->model))(q_value));
385        }       
386}
387/**
388 * Function to call to calculate_ER
389 * @return: effective radius value
390 */
391static PyObject * calculate_ER(COblateModel *self) {
392
393        PyObject* pars;
394        int npars;
395       
396        // Get parameters
397       
398            // Reader parameter dictionary
399    self->model->major_core = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "major_core") );
400    self->model->scale = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "scale") );
401    self->model->minor_core = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "minor_core") );
402    self->model->axis_theta = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "axis_theta") );
403    self->model->sld_solvent = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "sld_solvent") );
404    self->model->axis_phi = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "axis_phi") );
405    self->model->background = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "background") );
406    self->model->major_shell = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "major_shell") );
407    self->model->contrast = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "contrast") );
408    self->model->minor_shell = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "minor_shell") );
409    // Read in dispersion parameters
410    PyObject* disp_dict;
411    DispersionVisitor* visitor = new DispersionVisitor();
412    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "major_core");
413    self->model->major_core.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->major_core.dispersion, disp_dict);
414    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "minor_core");
415    self->model->minor_core.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->minor_core.dispersion, disp_dict);
416    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "major_shell");
417    self->model->major_shell.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->major_shell.dispersion, disp_dict);
418    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "minor_shell");
419    self->model->minor_shell.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->minor_shell.dispersion, disp_dict);
420
421               
422        return Py_BuildValue("d",(*(self->model)).calculate_ER());
423
424}
425/**
426 * Function to call to evaluate model in cartesian coordinates
427 * @param args: input q or [qx, qy]]
428 * @return: function value
429 */
430static PyObject * runXY(COblateModel *self, PyObject *args) {
431        double qx_value, qy_value;
432        PyObject* pars;
433        int npars;
434       
435        // Get parameters
436       
437            // Reader parameter dictionary
438    self->model->major_core = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "major_core") );
439    self->model->scale = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "scale") );
440    self->model->minor_core = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "minor_core") );
441    self->model->axis_theta = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "axis_theta") );
442    self->model->sld_solvent = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "sld_solvent") );
443    self->model->axis_phi = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "axis_phi") );
444    self->model->background = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "background") );
445    self->model->major_shell = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "major_shell") );
446    self->model->contrast = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "contrast") );
447    self->model->minor_shell = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "minor_shell") );
448    // Read in dispersion parameters
449    PyObject* disp_dict;
450    DispersionVisitor* visitor = new DispersionVisitor();
451    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "major_core");
452    self->model->major_core.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->major_core.dispersion, disp_dict);
453    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "minor_core");
454    self->model->minor_core.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->minor_core.dispersion, disp_dict);
455    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "major_shell");
456    self->model->major_shell.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->major_shell.dispersion, disp_dict);
457    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "minor_shell");
458    self->model->minor_shell.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->minor_shell.dispersion, disp_dict);
459
460       
461        // Get input and determine whether we have to supply a 1D or 2D return value.
462        if ( !PyArg_ParseTuple(args,"O",&pars) ) {
463            PyErr_SetString(COblateModelError, 
464                "COblateModel.run expects a q value.");
465                return NULL;
466        }
467         
468        // Check params
469        if( PyList_Check(pars)==1) {
470               
471                // Length of list should be 2 for I(qx, qy))
472            npars = PyList_GET_SIZE(pars); 
473            if(npars!=2) {
474                PyErr_SetString(COblateModelError, 
475                        "COblateModel.run expects a double or a list of dimension 2.");
476                return NULL;
477            }
478            // We have a vector q, get the qx and qy values at which
479            // to evaluate I(qx,qy)
480            qx_value = COblateModel_readDouble(PyList_GET_ITEM(pars,0));
481            qy_value = COblateModel_readDouble(PyList_GET_ITEM(pars,1));
482            return Py_BuildValue("d",(*(self->model))(qx_value,qy_value));
483
484        } else {
485
486                // We have a scalar q, we will evaluate I(q)
487                qx_value = COblateModel_readDouble(pars);               
488               
489                return Py_BuildValue("d",(*(self->model))(qx_value));
490        }       
491}
492
493static PyObject * reset(COblateModel *self, PyObject *args) {
494   
495
496    return Py_BuildValue("d",0.0);
497}
498
499static PyObject * set_dispersion(COblateModel *self, PyObject *args) {
500        PyObject * disp;
501        const char * par_name;
502
503        if ( !PyArg_ParseTuple(args,"sO", &par_name, &disp) ) {
504            PyErr_SetString(COblateModelError,
505                "COblateModel.set_dispersion expects a DispersionModel object.");
506                return NULL;
507        }
508        void *temp = PyCObject_AsVoidPtr(disp);
509        DispersionModel * dispersion = static_cast<DispersionModel *>(temp);
510
511
512        // Ugliness necessary to go from python to C
513            // TODO: refactor this
514    if (!strcmp(par_name, "major_core")) {
515        self->model->major_core.dispersion = dispersion;
516    } else    if (!strcmp(par_name, "minor_core")) {
517        self->model->minor_core.dispersion = dispersion;
518    } else    if (!strcmp(par_name, "major_shell")) {
519        self->model->major_shell.dispersion = dispersion;
520    } else    if (!strcmp(par_name, "minor_shell")) {
521        self->model->minor_shell.dispersion = dispersion;
522    } else {
523            PyErr_SetString(COblateModelError,
524                "COblateModel.set_dispersion expects a valid parameter name.");
525                return NULL;
526        }
527
528        DispersionVisitor* visitor = new DispersionVisitor();
529        PyObject * disp_dict = PyDict_New();
530        dispersion->accept_as_source(visitor, dispersion, disp_dict);
531        PyDict_SetItemString(self->dispersion, par_name, disp_dict);
532    return Py_BuildValue("i",1);
533}
534
535
536static PyMethodDef COblateModel_methods[] = {
537    {"run",      (PyCFunction)run     , METH_VARARGS,
538      "Evaluate the model at a given Q or Q, phi"},
539    {"runXY",      (PyCFunction)runXY     , METH_VARARGS,
540      "Evaluate the model at a given Q or Qx, Qy"},
541    {"calculate_ER",      (PyCFunction)calculate_ER     , METH_VARARGS,
542      "Evaluate the model at a given Q or Q, phi"},
543     
544    {"evalDistribution",  (PyCFunction)evalDistribution , METH_VARARGS,
545      "Evaluate the model at a given Q or Qx, Qy vector "},
546    {"reset",    (PyCFunction)reset   , METH_VARARGS,
547      "Reset pair correlation"},
548    {"set_dispersion",      (PyCFunction)set_dispersion     , METH_VARARGS,
549      "Set the dispersion model for a given parameter"},
550   {NULL}
551};
552
553static PyTypeObject COblateModelType = {
554    PyObject_HEAD_INIT(NULL)
555    0,                         /*ob_size*/
556    "COblateModel",             /*tp_name*/
557    sizeof(COblateModel),             /*tp_basicsize*/
558    0,                         /*tp_itemsize*/
559    (destructor)COblateModel_dealloc, /*tp_dealloc*/
560    0,                         /*tp_print*/
561    0,                         /*tp_getattr*/
562    0,                         /*tp_setattr*/
563    0,                         /*tp_compare*/
564    0,                         /*tp_repr*/
565    0,                         /*tp_as_number*/
566    0,                         /*tp_as_sequence*/
567    0,                         /*tp_as_mapping*/
568    0,                         /*tp_hash */
569    0,                         /*tp_call*/
570    0,                         /*tp_str*/
571    0,                         /*tp_getattro*/
572    0,                         /*tp_setattro*/
573    0,                         /*tp_as_buffer*/
574    Py_TPFLAGS_DEFAULT | Py_TPFLAGS_BASETYPE, /*tp_flags*/
575    "COblateModel objects",           /* tp_doc */
576    0,                         /* tp_traverse */
577    0,                         /* tp_clear */
578    0,                         /* tp_richcompare */
579    0,                         /* tp_weaklistoffset */
580    0,                         /* tp_iter */
581    0,                         /* tp_iternext */
582    COblateModel_methods,             /* tp_methods */
583    COblateModel_members,             /* tp_members */
584    0,                         /* tp_getset */
585    0,                         /* tp_base */
586    0,                         /* tp_dict */
587    0,                         /* tp_descr_get */
588    0,                         /* tp_descr_set */
589    0,                         /* tp_dictoffset */
590    (initproc)COblateModel_init,      /* tp_init */
591    0,                         /* tp_alloc */
592    COblateModel_new,                 /* tp_new */
593};
594
595
596//static PyMethodDef module_methods[] = {
597//    {NULL}
598//};
599
600/**
601 * Function used to add the model class to a module
602 * @param module: module to add the class to
603 */ 
604void addCOblateModel(PyObject *module) {
605        PyObject *d;
606       
607    if (PyType_Ready(&COblateModelType) < 0)
608        return;
609
610    Py_INCREF(&COblateModelType);
611    PyModule_AddObject(module, "COblateModel", (PyObject *)&COblateModelType);
612   
613    d = PyModule_GetDict(module);
614    COblateModelError = PyErr_NewException("COblateModel.error", NULL, NULL);
615    PyDict_SetItemString(d, "COblateModelError", COblateModelError);
616}
617
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.