source: sasview/sansmodels/src/sans/models/c_models/CLamellarPSModel.cpp @ 7a69683

ESS_GUIESS_GUI_DocsESS_GUI_batch_fittingESS_GUI_bumps_abstractionESS_GUI_iss1116ESS_GUI_iss879ESS_GUI_iss959ESS_GUI_openclESS_GUI_orderingESS_GUI_sync_sascalccostrafo411magnetic_scattrelease-4.1.1release-4.1.2release-4.2.2release_4.0.1ticket-1009ticket-1094-headlessticket-1242-2d-resolutionticket-1243ticket-1249ticket885unittest-saveload
Last change on this file since 7a69683 was 27a0771, checked in by Gervaise Alina <gervyh@…>, 15 years ago

add more models
  • Property mode set to 100644
File size: 12.9 KB
Line 
1/**
2        This software was developed by the University of Tennessee as part of the
3        Distributed Data Analysis of Neutron Scattering Experiments (DANSE)
4        project funded by the US National Science Foundation.
5
6        If you use DANSE applications to do scientific research that leads to
7        publication, we ask that you acknowledge the use of the software with the
8        following sentence:
9
10        "This work benefited from DANSE software developed under NSF award DMR-0520547."
11
12        copyright 2008, University of Tennessee
13 */
14
15/** CLamellarPSModel
16 *
17 * C extension
18 *
19 * WARNING: THIS FILE WAS GENERATED BY WRAPPERGENERATOR.PY
20 *          DO NOT MODIFY THIS FILE, MODIFY lamellarPS.h
21 *          AND RE-RUN THE GENERATOR SCRIPT
22 *
23 */
24 
25extern "C" {
26#include <Python.h>
27#include "structmember.h"
28#include <stdio.h>
29#include <stdlib.h>
30#include <math.h>
31#include <time.h>
32#include "lamellarPS.h"
33}
34
35#include "models.hh"
36#include "dispersion_visitor.hh"
37
38/// Error object for raised exceptions
39static PyObject * CLamellarPSModelError = NULL;
40
41
42// Class definition
43typedef struct {
44    PyObject_HEAD
45    /// Parameters
46    PyObject * params;
47    /// Dispersion parameters
48    PyObject * dispersion;
49    /// Underlying model object
50    LamellarPSModel * model;
51    /// Log for unit testing
52    PyObject * log;
53} CLamellarPSModel;
54
55
56static void
57CLamellarPSModel_dealloc(CLamellarPSModel* self)
58{
59    self->ob_type->tp_free((PyObject*)self);
60   
61
62}
63
64static PyObject *
65CLamellarPSModel_new(PyTypeObject *type, PyObject *args, PyObject *kwds)
66{
67    CLamellarPSModel *self;
68   
69    self = (CLamellarPSModel *)type->tp_alloc(type, 0);
70   
71    return (PyObject *)self;
72}
73
74static int
75CLamellarPSModel_init(CLamellarPSModel *self, PyObject *args, PyObject *kwds)
76{
77    if (self != NULL) {
78       
79        // Create parameters
80        self->params = PyDict_New();
81        self->dispersion = PyDict_New();
82        self->model = new LamellarPSModel();
83       
84        // Initialize parameter dictionary
85        PyDict_SetItemString(self->params,"n_plates",Py_BuildValue("d",20.000000));
86        PyDict_SetItemString(self->params,"scale",Py_BuildValue("d",1.000000));
87        PyDict_SetItemString(self->params,"spacing",Py_BuildValue("d",400.000000));
88        PyDict_SetItemString(self->params,"caille",Py_BuildValue("d",0.100000));
89        PyDict_SetItemString(self->params,"background",Py_BuildValue("d",0.000000));
90        PyDict_SetItemString(self->params,"delta",Py_BuildValue("d",30.000000));
91        PyDict_SetItemString(self->params,"sigma",Py_BuildValue("d",0.150000));
92        PyDict_SetItemString(self->params,"contrast",Py_BuildValue("d",0.000005));
93        // Initialize dispersion / averaging parameter dict
94        DispersionVisitor* visitor = new DispersionVisitor();
95        PyObject * disp_dict;
96        disp_dict = PyDict_New();
97        self->model->delta.dispersion->accept_as_source(visitor, self->model->delta.dispersion, disp_dict);
98        PyDict_SetItemString(self->dispersion, "delta", disp_dict);
99
100
101         
102        // Create empty log
103        self->log = PyDict_New();
104       
105       
106
107    }
108    return 0;
109}
110
111static PyMemberDef CLamellarPSModel_members[] = {
112    {"params", T_OBJECT, offsetof(CLamellarPSModel, params), 0,
113     "Parameters"},
114        {"dispersion", T_OBJECT, offsetof(CLamellarPSModel, dispersion), 0,
115          "Dispersion parameters"},     
116    {"log", T_OBJECT, offsetof(CLamellarPSModel, log), 0,
117     "Log"},
118    {NULL}  /* Sentinel */
119};
120
121/** Read double from PyObject
122    @param p PyObject
123    @return double
124*/
125double CLamellarPSModel_readDouble(PyObject *p) {
126    if (PyFloat_Check(p)==1) {
127        return (double)(((PyFloatObject *)(p))->ob_fval);
128    } else if (PyInt_Check(p)==1) {
129        return (double)(((PyIntObject *)(p))->ob_ival);
130    } else if (PyLong_Check(p)==1) {
131        return (double)PyLong_AsLong(p);
132    } else {
133        return 0.0;
134    }
135}
136
137
138/**
139 * Function to call to evaluate model
140 * @param args: input q or [q,phi]
141 * @return: function value
142 */
143static PyObject * run(CLamellarPSModel *self, PyObject *args) {
144        double q_value, phi_value;
145        PyObject* pars;
146        int npars;
147       
148        // Get parameters
149       
150            // Reader parameter dictionary
151    self->model->n_plates = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "n_plates") );
152    self->model->scale = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "scale") );
153    self->model->spacing = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "spacing") );
154    self->model->caille = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "caille") );
155    self->model->background = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "background") );
156    self->model->delta = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "delta") );
157    self->model->sigma = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "sigma") );
158    self->model->contrast = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "contrast") );
159    // Read in dispersion parameters
160    PyObject* disp_dict;
161    DispersionVisitor* visitor = new DispersionVisitor();
162    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "delta");
163    self->model->delta.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->delta.dispersion, disp_dict);
164
165       
166        // Get input and determine whether we have to supply a 1D or 2D return value.
167        if ( !PyArg_ParseTuple(args,"O",&pars) ) {
168            PyErr_SetString(CLamellarPSModelError, 
169                "CLamellarPSModel.run expects a q value.");
170                return NULL;
171        }
172         
173        // Check params
174        if( PyList_Check(pars)==1) {
175               
176                // Length of list should be 2 for I(q,phi)
177            npars = PyList_GET_SIZE(pars); 
178            if(npars!=2) {
179                PyErr_SetString(CLamellarPSModelError, 
180                        "CLamellarPSModel.run expects a double or a list of dimension 2.");
181                return NULL;
182            }
183            // We have a vector q, get the q and phi values at which
184            // to evaluate I(q,phi)
185            q_value = CLamellarPSModel_readDouble(PyList_GET_ITEM(pars,0));
186            phi_value = CLamellarPSModel_readDouble(PyList_GET_ITEM(pars,1));
187            // Skip zero
188            if (q_value==0) {
189                return Py_BuildValue("d",0.0);
190            }
191                return Py_BuildValue("d",(*(self->model)).evaluate_rphi(q_value,phi_value));
192
193        } else {
194
195                // We have a scalar q, we will evaluate I(q)
196                q_value = CLamellarPSModel_readDouble(pars);           
197               
198                return Py_BuildValue("d",(*(self->model))(q_value));
199        }       
200}
201
202/**
203 * Function to call to evaluate model in cartesian coordinates
204 * @param args: input q or [qx, qy]]
205 * @return: function value
206 */
207static PyObject * runXY(CLamellarPSModel *self, PyObject *args) {
208        double qx_value, qy_value;
209        PyObject* pars;
210        int npars;
211       
212        // Get parameters
213       
214            // Reader parameter dictionary
215    self->model->n_plates = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "n_plates") );
216    self->model->scale = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "scale") );
217    self->model->spacing = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "spacing") );
218    self->model->caille = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "caille") );
219    self->model->background = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "background") );
220    self->model->delta = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "delta") );
221    self->model->sigma = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "sigma") );
222    self->model->contrast = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "contrast") );
223    // Read in dispersion parameters
224    PyObject* disp_dict;
225    DispersionVisitor* visitor = new DispersionVisitor();
226    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "delta");
227    self->model->delta.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->delta.dispersion, disp_dict);
228
229       
230        // Get input and determine whether we have to supply a 1D or 2D return value.
231        if ( !PyArg_ParseTuple(args,"O",&pars) ) {
232            PyErr_SetString(CLamellarPSModelError, 
233                "CLamellarPSModel.run expects a q value.");
234                return NULL;
235        }
236         
237        // Check params
238        if( PyList_Check(pars)==1) {
239               
240                // Length of list should be 2 for I(qx, qy))
241            npars = PyList_GET_SIZE(pars); 
242            if(npars!=2) {
243                PyErr_SetString(CLamellarPSModelError, 
244                        "CLamellarPSModel.run expects a double or a list of dimension 2.");
245                return NULL;
246            }
247            // We have a vector q, get the qx and qy values at which
248            // to evaluate I(qx,qy)
249            qx_value = CLamellarPSModel_readDouble(PyList_GET_ITEM(pars,0));
250            qy_value = CLamellarPSModel_readDouble(PyList_GET_ITEM(pars,1));
251            return Py_BuildValue("d",(*(self->model))(qx_value,qy_value));
252
253        } else {
254
255                // We have a scalar q, we will evaluate I(q)
256                qx_value = CLamellarPSModel_readDouble(pars);           
257               
258                return Py_BuildValue("d",(*(self->model))(qx_value));
259        }       
260}
261
262static PyObject * reset(CLamellarPSModel *self, PyObject *args) {
263   
264
265    return Py_BuildValue("d",0.0);
266}
267
268static PyObject * set_dispersion(CLamellarPSModel *self, PyObject *args) {
269        PyObject * disp;
270        const char * par_name;
271
272        if ( !PyArg_ParseTuple(args,"sO", &par_name, &disp) ) {
273            PyErr_SetString(CLamellarPSModelError,
274                "CLamellarPSModel.set_dispersion expects a DispersionModel object.");
275                return NULL;
276        }
277        void *temp = PyCObject_AsVoidPtr(disp);
278        DispersionModel * dispersion = static_cast<DispersionModel *>(temp);
279
280
281        // Ugliness necessary to go from python to C
282            // TODO: refactor this
283    if (!strcmp(par_name, "delta")) {
284        self->model->delta.dispersion = dispersion;
285    } else {
286            PyErr_SetString(CLamellarPSModelError,
287                "CLamellarPSModel.set_dispersion expects a valid parameter name.");
288                return NULL;
289        }
290
291        DispersionVisitor* visitor = new DispersionVisitor();
292        PyObject * disp_dict = PyDict_New();
293        dispersion->accept_as_source(visitor, dispersion, disp_dict);
294        PyDict_SetItemString(self->dispersion, par_name, disp_dict);
295    return Py_BuildValue("i",1);
296}
297
298
299static PyMethodDef CLamellarPSModel_methods[] = {
300    {"run",      (PyCFunction)run     , METH_VARARGS,
301      "Evaluate the model at a given Q or Q, phi"},
302    {"runXY",      (PyCFunction)runXY     , METH_VARARGS,
303      "Evaluate the model at a given Q or Qx, Qy"},
304    {"reset",    (PyCFunction)reset   , METH_VARARGS,
305      "Reset pair correlation"},
306    {"set_dispersion",      (PyCFunction)set_dispersion     , METH_VARARGS,
307      "Set the dispersion model for a given parameter"},
308   {NULL}
309};
310
311static PyTypeObject CLamellarPSModelType = {
312    PyObject_HEAD_INIT(NULL)
313    0,                         /*ob_size*/
314    "CLamellarPSModel",             /*tp_name*/
315    sizeof(CLamellarPSModel),             /*tp_basicsize*/
316    0,                         /*tp_itemsize*/
317    (destructor)CLamellarPSModel_dealloc, /*tp_dealloc*/
318    0,                         /*tp_print*/
319    0,                         /*tp_getattr*/
320    0,                         /*tp_setattr*/
321    0,                         /*tp_compare*/
322    0,                         /*tp_repr*/
323    0,                         /*tp_as_number*/
324    0,                         /*tp_as_sequence*/
325    0,                         /*tp_as_mapping*/
326    0,                         /*tp_hash */
327    0,                         /*tp_call*/
328    0,                         /*tp_str*/
329    0,                         /*tp_getattro*/
330    0,                         /*tp_setattro*/
331    0,                         /*tp_as_buffer*/
332    Py_TPFLAGS_DEFAULT | Py_TPFLAGS_BASETYPE, /*tp_flags*/
333    "CLamellarPSModel objects",           /* tp_doc */
334    0,                         /* tp_traverse */
335    0,                         /* tp_clear */
336    0,                         /* tp_richcompare */
337    0,                         /* tp_weaklistoffset */
338    0,                         /* tp_iter */
339    0,                         /* tp_iternext */
340    CLamellarPSModel_methods,             /* tp_methods */
341    CLamellarPSModel_members,             /* tp_members */
342    0,                         /* tp_getset */
343    0,                         /* tp_base */
344    0,                         /* tp_dict */
345    0,                         /* tp_descr_get */
346    0,                         /* tp_descr_set */
347    0,                         /* tp_dictoffset */
348    (initproc)CLamellarPSModel_init,      /* tp_init */
349    0,                         /* tp_alloc */
350    CLamellarPSModel_new,                 /* tp_new */
351};
352
353
354static PyMethodDef module_methods[] = {
355    {NULL} 
356};
357
358/**
359 * Function used to add the model class to a module
360 * @param module: module to add the class to
361 */ 
362void addCLamellarPSModel(PyObject *module) {
363        PyObject *d;
364       
365    if (PyType_Ready(&CLamellarPSModelType) < 0)
366        return;
367
368    Py_INCREF(&CLamellarPSModelType);
369    PyModule_AddObject(module, "CLamellarPSModel", (PyObject *)&CLamellarPSModelType);
370   
371    d = PyModule_GetDict(module);
372    CLamellarPSModelError = PyErr_NewException("CLamellarPSModel.error", NULL, NULL);
373    PyDict_SetItemString(d, "CLamellarPSModelError", CLamellarPSModelError);
374}
375
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.