source: sasview/sansmodels/src/sans/models/c_models/CHollowCylinderModel.cpp @ 5eb9154

ESS_GUIESS_GUI_DocsESS_GUI_batch_fittingESS_GUI_bumps_abstractionESS_GUI_iss1116ESS_GUI_iss879ESS_GUI_iss959ESS_GUI_openclESS_GUI_orderingESS_GUI_sync_sascalccostrafo411magnetic_scattrelease-4.1.1release-4.1.2release-4.2.2release_4.0.1ticket-1009ticket-1094-headlessticket-1242-2d-resolutionticket-1243ticket-1249ticket885unittest-saveload
Last change on this file since 5eb9154 was 5eb9154, checked in by Jae Cho <jhjcho@…>, 15 years ago

calculation of the effective radius are added
  • Property mode set to 100644
File size: 25.0 KB
Line 
1/**
2        This software was developed by the University of Tennessee as part of the
3        Distributed Data Analysis of Neutron Scattering Experiments (DANSE)
4        project funded by the US National Science Foundation.
5
6        If you use DANSE applications to do scientific research that leads to
7        publication, we ask that you acknowledge the use of the software with the
8        following sentence:
9
10        "This work benefited from DANSE software developed under NSF award DMR-0520547."
11
12        copyright 2008, University of Tennessee
13 */
14
15/** CHollowCylinderModel
16 *
17 * C extension
18 *
19 * WARNING: THIS FILE WAS GENERATED BY WRAPPERGENERATOR.PY
20 *          DO NOT MODIFY THIS FILE, MODIFY hollow_cylinder.h
21 *          AND RE-RUN THE GENERATOR SCRIPT
22 *
23 */
24#define NO_IMPORT_ARRAY
25#define PY_ARRAY_UNIQUE_SYMBOL PyArray_API_sans
26 
27extern "C" {
28#include <Python.h>
29#include <arrayobject.h>
30#include "structmember.h"
31#include <stdio.h>
32#include <stdlib.h>
33#include <math.h>
34#include <time.h>
35#include "hollow_cylinder.h"
36}
37
38#include "models.hh"
39#include "dispersion_visitor.hh"
40
41/// Error object for raised exceptions
42static PyObject * CHollowCylinderModelError = NULL;
43
44
45// Class definition
46typedef struct {
47    PyObject_HEAD
48    /// Parameters
49    PyObject * params;
50    /// Dispersion parameters
51    PyObject * dispersion;
52    /// Underlying model object
53    HollowCylinderModel * model;
54    /// Log for unit testing
55    PyObject * log;
56} CHollowCylinderModel;
57
58
59static void
60CHollowCylinderModel_dealloc(CHollowCylinderModel* self)
61{
62    self->ob_type->tp_free((PyObject*)self);
63   
64
65}
66
67static PyObject *
68CHollowCylinderModel_new(PyTypeObject *type, PyObject *args, PyObject *kwds)
69{
70    CHollowCylinderModel *self;
71   
72    self = (CHollowCylinderModel *)type->tp_alloc(type, 0);
73   
74    return (PyObject *)self;
75}
76
77static int
78CHollowCylinderModel_init(CHollowCylinderModel *self, PyObject *args, PyObject *kwds)
79{
80    if (self != NULL) {
81       
82        // Create parameters
83        self->params = PyDict_New();
84        self->dispersion = PyDict_New();
85        self->model = new HollowCylinderModel();
86       
87        // Initialize parameter dictionary
88        PyDict_SetItemString(self->params,"scale",Py_BuildValue("d",1.000000));
89        PyDict_SetItemString(self->params,"core_radius",Py_BuildValue("d",20.000000));
90        PyDict_SetItemString(self->params,"axis_theta",Py_BuildValue("d",1.570000));
91        PyDict_SetItemString(self->params,"length",Py_BuildValue("d",400.000000));
92        PyDict_SetItemString(self->params,"axis_phi",Py_BuildValue("d",0.000000));
93        PyDict_SetItemString(self->params,"radius",Py_BuildValue("d",30.000000));
94        PyDict_SetItemString(self->params,"background",Py_BuildValue("d",0.010000));
95        PyDict_SetItemString(self->params,"contrast",Py_BuildValue("d",0.000005));
96        // Initialize dispersion / averaging parameter dict
97        DispersionVisitor* visitor = new DispersionVisitor();
98        PyObject * disp_dict;
99        disp_dict = PyDict_New();
100        self->model->core_radius.dispersion->accept_as_source(visitor, self->model->core_radius.dispersion, disp_dict);
101        PyDict_SetItemString(self->dispersion, "core_radius", disp_dict);
102        disp_dict = PyDict_New();
103        self->model->radius.dispersion->accept_as_source(visitor, self->model->radius.dispersion, disp_dict);
104        PyDict_SetItemString(self->dispersion, "radius", disp_dict);
105        disp_dict = PyDict_New();
106        self->model->length.dispersion->accept_as_source(visitor, self->model->length.dispersion, disp_dict);
107        PyDict_SetItemString(self->dispersion, "length", disp_dict);
108        disp_dict = PyDict_New();
109        self->model->axis_theta.dispersion->accept_as_source(visitor, self->model->axis_theta.dispersion, disp_dict);
110        PyDict_SetItemString(self->dispersion, "axis_theta", disp_dict);
111        disp_dict = PyDict_New();
112        self->model->axis_phi.dispersion->accept_as_source(visitor, self->model->axis_phi.dispersion, disp_dict);
113        PyDict_SetItemString(self->dispersion, "axis_phi", disp_dict);
114
115
116         
117        // Create empty log
118        self->log = PyDict_New();
119       
120       
121
122    }
123    return 0;
124}
125
126static PyMemberDef CHollowCylinderModel_members[] = {
127    {"params", T_OBJECT, offsetof(CHollowCylinderModel, params), 0,
128     "Parameters"},
129        {"dispersion", T_OBJECT, offsetof(CHollowCylinderModel, dispersion), 0,
130          "Dispersion parameters"},     
131    {"log", T_OBJECT, offsetof(CHollowCylinderModel, log), 0,
132     "Log"},
133    {NULL}  /* Sentinel */
134};
135
136/** Read double from PyObject
137    @param p PyObject
138    @return double
139*/
140double CHollowCylinderModel_readDouble(PyObject *p) {
141    if (PyFloat_Check(p)==1) {
142        return (double)(((PyFloatObject *)(p))->ob_fval);
143    } else if (PyInt_Check(p)==1) {
144        return (double)(((PyIntObject *)(p))->ob_ival);
145    } else if (PyLong_Check(p)==1) {
146        return (double)PyLong_AsLong(p);
147    } else {
148        return 0.0;
149    }
150}
151/**
152 * Function to call to evaluate model
153 * @param args: input numpy array q[]
154 * @return: numpy array object
155 */
156 
157static PyObject *evaluateOneDim(HollowCylinderModel* model, PyArrayObject *q){
158    PyArrayObject *result;
159   
160    // Check validity of array q , q must be of dimension 1, an array of double
161    if (q->nd != 1 || q->descr->type_num != PyArray_DOUBLE)
162    {
163        //const char * message= "Invalid array: q->nd=%d,type_num=%d\n",q->nd,q->descr->type_num;
164        //PyErr_SetString(PyExc_ValueError , message);
165        return NULL;
166    }
167    result = (PyArrayObject *)PyArray_FromDims(q->nd, (int *)(q->dimensions), 
168                                                                                  PyArray_DOUBLE);
169        if (result == NULL) {
170        const char * message= "Could not create result ";
171        PyErr_SetString(PyExc_RuntimeError , message);
172                return NULL;
173        }
174         for (int i = 0; i < q->dimensions[0]; i++){
175      double q_value  = *(double *)(q->data + i*q->strides[0]);
176      double *result_value = (double *)(result->data + i*result->strides[0]);
177      *result_value =(*model)(q_value);
178        }
179    return PyArray_Return(result); 
180 }
181
182 /**
183 * Function to call to evaluate model
184 * @param args: input numpy array  [x[],y[]]
185 * @return: numpy array object
186 */
187 static PyObject * evaluateTwoDimXY( HollowCylinderModel* model, 
188                              PyArrayObject *x, PyArrayObject *y)
189 {
190    PyArrayObject *result;
191    int i,j, x_len, y_len, dims[2];
192    //check validity of input vectors
193    if (x->nd != 2 || x->descr->type_num != PyArray_DOUBLE
194        || y->nd != 2 || y->descr->type_num != PyArray_DOUBLE
195        || y->dimensions[1] != x->dimensions[0]){
196        const char * message= "evaluateTwoDimXY  expect 2 numpy arrays";
197        PyErr_SetString(PyExc_ValueError , message); 
198        return NULL;
199    }
200   
201        if (PyArray_Check(x) && PyArray_Check(y)) {
202               
203            x_len = dims[1]= x->dimensions[0];
204        y_len = dims[0]= y->dimensions[1];
205           
206            // Make a new double matrix of same dims
207        result=(PyArrayObject *) PyArray_FromDims(2,dims,NPY_DOUBLE);
208        if (result == NULL){
209            const char * message= "Could not create result ";
210        PyErr_SetString(PyExc_RuntimeError , message);
211            return NULL;
212            }
213       
214        /* Do the calculation. */
215        for ( j=0; j< y_len; j++) {
216            for ( i=0; i< x_len; i++) {
217                double x_value = *(double *)(x->data + i*x->strides[0]);
218                    double y_value = *(double *)(y->data + j*y->strides[1]);
219                        double *result_value = (double *)(result->data +
220                              j*result->strides[0] + i*result->strides[1]);
221                        *result_value = (*model)(x_value, y_value);
222            }           
223        }
224        return PyArray_Return(result); 
225       
226        }else{
227                    PyErr_SetString(CHollowCylinderModelError, 
228                   "CHollowCylinderModel.evaluateTwoDimXY couldn't run.");
229                return NULL;
230                }       
231}
232/**
233 *  evalDistribution function evaluate a model function with input vector
234 *  @param args: input q as vector or [qx, qy] where qx, qy are vectors
235 *
236 */ 
237static PyObject * evalDistribution(CHollowCylinderModel *self, PyObject *args){
238        PyObject *qx, *qy;
239        PyArrayObject * pars;
240        int npars ,mpars;
241       
242        // Get parameters
243       
244            // Reader parameter dictionary
245    self->model->scale = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "scale") );
246    self->model->core_radius = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "core_radius") );
247    self->model->axis_theta = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "axis_theta") );
248    self->model->length = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "length") );
249    self->model->axis_phi = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "axis_phi") );
250    self->model->radius = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "radius") );
251    self->model->background = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "background") );
252    self->model->contrast = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "contrast") );
253    // Read in dispersion parameters
254    PyObject* disp_dict;
255    DispersionVisitor* visitor = new DispersionVisitor();
256    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "core_radius");
257    self->model->core_radius.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->core_radius.dispersion, disp_dict);
258    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "radius");
259    self->model->radius.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->radius.dispersion, disp_dict);
260    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "length");
261    self->model->length.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->length.dispersion, disp_dict);
262    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "axis_theta");
263    self->model->axis_theta.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->axis_theta.dispersion, disp_dict);
264    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "axis_phi");
265    self->model->axis_phi.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->axis_phi.dispersion, disp_dict);
266
267       
268        // Get input and determine whether we have to supply a 1D or 2D return value.
269        if ( !PyArg_ParseTuple(args,"O",&pars) ) {
270            PyErr_SetString(CHollowCylinderModelError, 
271                "CHollowCylinderModel.evalDistribution expects a q value.");
272                return NULL;
273        }
274    // Check params
275       
276    if(PyArray_Check(pars)==1) {
277               
278            // Length of list should 1 or 2
279            npars = pars->nd; 
280            if(npars==1) {
281                // input is a numpy array
282                if (PyArray_Check(pars)) {
283                        return evaluateOneDim(self->model, (PyArrayObject*)pars); 
284                    }
285                }else{
286                    PyErr_SetString(CHollowCylinderModelError, 
287                   "CHollowCylinderModel.evalDistribution expect numpy array of one dimension.");
288                return NULL;
289                }
290    }else if( PyList_Check(pars)==1) {
291        // Length of list should be 2 for I(qx,qy)
292            mpars = PyList_GET_SIZE(pars); 
293            if(mpars!=2) {
294                PyErr_SetString(CHollowCylinderModelError, 
295                        "CHollowCylinderModel.evalDistribution expects a list of dimension 2.");
296                return NULL;
297            }
298             qx = PyList_GET_ITEM(pars,0);
299             qy = PyList_GET_ITEM(pars,1);
300             if (PyArray_Check(qx) && PyArray_Check(qy)) {
301                 return evaluateTwoDimXY(self->model, (PyArrayObject*)qx,
302                           (PyArrayObject*)qy);
303                 }else{
304                    PyErr_SetString(CHollowCylinderModelError, 
305                   "CHollowCylinderModel.evalDistribution expect 2 numpy arrays in list.");
306                return NULL;
307             }
308        }
309        PyErr_SetString(CHollowCylinderModelError, 
310                   "CHollowCylinderModel.evalDistribution couln't be run.");
311        return NULL;
312       
313}
314
315/**
316 * Function to call to evaluate model
317 * @param args: input q or [q,phi]
318 * @return: function value
319 */
320static PyObject * run(CHollowCylinderModel *self, PyObject *args) {
321        double q_value, phi_value;
322        PyObject* pars;
323        int npars;
324       
325        // Get parameters
326       
327            // Reader parameter dictionary
328    self->model->scale = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "scale") );
329    self->model->core_radius = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "core_radius") );
330    self->model->axis_theta = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "axis_theta") );
331    self->model->length = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "length") );
332    self->model->axis_phi = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "axis_phi") );
333    self->model->radius = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "radius") );
334    self->model->background = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "background") );
335    self->model->contrast = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "contrast") );
336    // Read in dispersion parameters
337    PyObject* disp_dict;
338    DispersionVisitor* visitor = new DispersionVisitor();
339    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "core_radius");
340    self->model->core_radius.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->core_radius.dispersion, disp_dict);
341    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "radius");
342    self->model->radius.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->radius.dispersion, disp_dict);
343    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "length");
344    self->model->length.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->length.dispersion, disp_dict);
345    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "axis_theta");
346    self->model->axis_theta.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->axis_theta.dispersion, disp_dict);
347    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "axis_phi");
348    self->model->axis_phi.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->axis_phi.dispersion, disp_dict);
349
350       
351        // Get input and determine whether we have to supply a 1D or 2D return value.
352        if ( !PyArg_ParseTuple(args,"O",&pars) ) {
353            PyErr_SetString(CHollowCylinderModelError, 
354                "CHollowCylinderModel.run expects a q value.");
355                return NULL;
356        }
357         
358        // Check params
359        if( PyList_Check(pars)==1) {
360               
361                // Length of list should be 2 for I(q,phi)
362            npars = PyList_GET_SIZE(pars); 
363            if(npars!=2) {
364                PyErr_SetString(CHollowCylinderModelError, 
365                        "CHollowCylinderModel.run expects a double or a list of dimension 2.");
366                return NULL;
367            }
368            // We have a vector q, get the q and phi values at which
369            // to evaluate I(q,phi)
370            q_value = CHollowCylinderModel_readDouble(PyList_GET_ITEM(pars,0));
371            phi_value = CHollowCylinderModel_readDouble(PyList_GET_ITEM(pars,1));
372            // Skip zero
373            if (q_value==0) {
374                return Py_BuildValue("d",0.0);
375            }
376                return Py_BuildValue("d",(*(self->model)).evaluate_rphi(q_value,phi_value));
377
378        } else {
379
380                // We have a scalar q, we will evaluate I(q)
381                q_value = CHollowCylinderModel_readDouble(pars);               
382               
383                return Py_BuildValue("d",(*(self->model))(q_value));
384        }       
385}
386/**
387 * Function to call to calculate_ER
388 * @return: effective radius value
389 */
390static PyObject * calculate_ER(CHollowCylinderModel *self) {
391
392        PyObject* pars;
393        int npars;
394       
395        // Get parameters
396       
397            // Reader parameter dictionary
398    self->model->scale = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "scale") );
399    self->model->core_radius = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "core_radius") );
400    self->model->axis_theta = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "axis_theta") );
401    self->model->length = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "length") );
402    self->model->axis_phi = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "axis_phi") );
403    self->model->radius = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "radius") );
404    self->model->background = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "background") );
405    self->model->contrast = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "contrast") );
406    // Read in dispersion parameters
407    PyObject* disp_dict;
408    DispersionVisitor* visitor = new DispersionVisitor();
409    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "core_radius");
410    self->model->core_radius.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->core_radius.dispersion, disp_dict);
411    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "radius");
412    self->model->radius.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->radius.dispersion, disp_dict);
413    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "length");
414    self->model->length.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->length.dispersion, disp_dict);
415    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "axis_theta");
416    self->model->axis_theta.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->axis_theta.dispersion, disp_dict);
417    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "axis_phi");
418    self->model->axis_phi.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->axis_phi.dispersion, disp_dict);
419
420               
421        return Py_BuildValue("d",(*(self->model)).calculate_ER());
422
423}
424/**
425 * Function to call to evaluate model in cartesian coordinates
426 * @param args: input q or [qx, qy]]
427 * @return: function value
428 */
429static PyObject * runXY(CHollowCylinderModel *self, PyObject *args) {
430        double qx_value, qy_value;
431        PyObject* pars;
432        int npars;
433       
434        // Get parameters
435       
436            // Reader parameter dictionary
437    self->model->scale = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "scale") );
438    self->model->core_radius = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "core_radius") );
439    self->model->axis_theta = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "axis_theta") );
440    self->model->length = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "length") );
441    self->model->axis_phi = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "axis_phi") );
442    self->model->radius = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "radius") );
443    self->model->background = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "background") );
444    self->model->contrast = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "contrast") );
445    // Read in dispersion parameters
446    PyObject* disp_dict;
447    DispersionVisitor* visitor = new DispersionVisitor();
448    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "core_radius");
449    self->model->core_radius.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->core_radius.dispersion, disp_dict);
450    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "radius");
451    self->model->radius.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->radius.dispersion, disp_dict);
452    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "length");
453    self->model->length.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->length.dispersion, disp_dict);
454    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "axis_theta");
455    self->model->axis_theta.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->axis_theta.dispersion, disp_dict);
456    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "axis_phi");
457    self->model->axis_phi.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->axis_phi.dispersion, disp_dict);
458
459       
460        // Get input and determine whether we have to supply a 1D or 2D return value.
461        if ( !PyArg_ParseTuple(args,"O",&pars) ) {
462            PyErr_SetString(CHollowCylinderModelError, 
463                "CHollowCylinderModel.run expects a q value.");
464                return NULL;
465        }
466         
467        // Check params
468        if( PyList_Check(pars)==1) {
469               
470                // Length of list should be 2 for I(qx, qy))
471            npars = PyList_GET_SIZE(pars); 
472            if(npars!=2) {
473                PyErr_SetString(CHollowCylinderModelError, 
474                        "CHollowCylinderModel.run expects a double or a list of dimension 2.");
475                return NULL;
476            }
477            // We have a vector q, get the qx and qy values at which
478            // to evaluate I(qx,qy)
479            qx_value = CHollowCylinderModel_readDouble(PyList_GET_ITEM(pars,0));
480            qy_value = CHollowCylinderModel_readDouble(PyList_GET_ITEM(pars,1));
481            return Py_BuildValue("d",(*(self->model))(qx_value,qy_value));
482
483        } else {
484
485                // We have a scalar q, we will evaluate I(q)
486                qx_value = CHollowCylinderModel_readDouble(pars);               
487               
488                return Py_BuildValue("d",(*(self->model))(qx_value));
489        }       
490}
491
492static PyObject * reset(CHollowCylinderModel *self, PyObject *args) {
493   
494
495    return Py_BuildValue("d",0.0);
496}
497
498static PyObject * set_dispersion(CHollowCylinderModel *self, PyObject *args) {
499        PyObject * disp;
500        const char * par_name;
501
502        if ( !PyArg_ParseTuple(args,"sO", &par_name, &disp) ) {
503            PyErr_SetString(CHollowCylinderModelError,
504                "CHollowCylinderModel.set_dispersion expects a DispersionModel object.");
505                return NULL;
506        }
507        void *temp = PyCObject_AsVoidPtr(disp);
508        DispersionModel * dispersion = static_cast<DispersionModel *>(temp);
509
510
511        // Ugliness necessary to go from python to C
512            // TODO: refactor this
513    if (!strcmp(par_name, "core_radius")) {
514        self->model->core_radius.dispersion = dispersion;
515    } else    if (!strcmp(par_name, "radius")) {
516        self->model->radius.dispersion = dispersion;
517    } else    if (!strcmp(par_name, "length")) {
518        self->model->length.dispersion = dispersion;
519    } else    if (!strcmp(par_name, "axis_theta")) {
520        self->model->axis_theta.dispersion = dispersion;
521    } else    if (!strcmp(par_name, "axis_phi")) {
522        self->model->axis_phi.dispersion = dispersion;
523    } else {
524            PyErr_SetString(CHollowCylinderModelError,
525                "CHollowCylinderModel.set_dispersion expects a valid parameter name.");
526                return NULL;
527        }
528
529        DispersionVisitor* visitor = new DispersionVisitor();
530        PyObject * disp_dict = PyDict_New();
531        dispersion->accept_as_source(visitor, dispersion, disp_dict);
532        PyDict_SetItemString(self->dispersion, par_name, disp_dict);
533    return Py_BuildValue("i",1);
534}
535
536
537static PyMethodDef CHollowCylinderModel_methods[] = {
538    {"run",      (PyCFunction)run     , METH_VARARGS,
539      "Evaluate the model at a given Q or Q, phi"},
540    {"runXY",      (PyCFunction)runXY     , METH_VARARGS,
541      "Evaluate the model at a given Q or Qx, Qy"},
542    {"calculate_ER",      (PyCFunction)calculate_ER     , METH_VARARGS,
543      "Evaluate the model at a given Q or Q, phi"},
544     
545    {"evalDistribution",  (PyCFunction)evalDistribution , METH_VARARGS,
546      "Evaluate the model at a given Q or Qx, Qy vector "},
547    {"reset",    (PyCFunction)reset   , METH_VARARGS,
548      "Reset pair correlation"},
549    {"set_dispersion",      (PyCFunction)set_dispersion     , METH_VARARGS,
550      "Set the dispersion model for a given parameter"},
551   {NULL}
552};
553
554static PyTypeObject CHollowCylinderModelType = {
555    PyObject_HEAD_INIT(NULL)
556    0,                         /*ob_size*/
557    "CHollowCylinderModel",             /*tp_name*/
558    sizeof(CHollowCylinderModel),             /*tp_basicsize*/
559    0,                         /*tp_itemsize*/
560    (destructor)CHollowCylinderModel_dealloc, /*tp_dealloc*/
561    0,                         /*tp_print*/
562    0,                         /*tp_getattr*/
563    0,                         /*tp_setattr*/
564    0,                         /*tp_compare*/
565    0,                         /*tp_repr*/
566    0,                         /*tp_as_number*/
567    0,                         /*tp_as_sequence*/
568    0,                         /*tp_as_mapping*/
569    0,                         /*tp_hash */
570    0,                         /*tp_call*/
571    0,                         /*tp_str*/
572    0,                         /*tp_getattro*/
573    0,                         /*tp_setattro*/
574    0,                         /*tp_as_buffer*/
575    Py_TPFLAGS_DEFAULT | Py_TPFLAGS_BASETYPE, /*tp_flags*/
576    "CHollowCylinderModel objects",           /* tp_doc */
577    0,                         /* tp_traverse */
578    0,                         /* tp_clear */
579    0,                         /* tp_richcompare */
580    0,                         /* tp_weaklistoffset */
581    0,                         /* tp_iter */
582    0,                         /* tp_iternext */
583    CHollowCylinderModel_methods,             /* tp_methods */
584    CHollowCylinderModel_members,             /* tp_members */
585    0,                         /* tp_getset */
586    0,                         /* tp_base */
587    0,                         /* tp_dict */
588    0,                         /* tp_descr_get */
589    0,                         /* tp_descr_set */
590    0,                         /* tp_dictoffset */
591    (initproc)CHollowCylinderModel_init,      /* tp_init */
592    0,                         /* tp_alloc */
593    CHollowCylinderModel_new,                 /* tp_new */
594};
595
596
597//static PyMethodDef module_methods[] = {
598//    {NULL}
599//};
600
601/**
602 * Function used to add the model class to a module
603 * @param module: module to add the class to
604 */ 
605void addCHollowCylinderModel(PyObject *module) {
606        PyObject *d;
607       
608    if (PyType_Ready(&CHollowCylinderModelType) < 0)
609        return;
610
611    Py_INCREF(&CHollowCylinderModelType);
612    PyModule_AddObject(module, "CHollowCylinderModel", (PyObject *)&CHollowCylinderModelType);
613   
614    d = PyModule_GetDict(module);
615    CHollowCylinderModelError = PyErr_NewException("CHollowCylinderModel.error", NULL, NULL);
616    PyDict_SetItemString(d, "CHollowCylinderModelError", CHollowCylinderModelError);
617}
618
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.