source: sasview/sansmodels/src/sans/models/c_models/CFlexCylEllipXModel.cpp @ 2cef9d3

ESS_GUIESS_GUI_DocsESS_GUI_batch_fittingESS_GUI_bumps_abstractionESS_GUI_iss1116ESS_GUI_iss879ESS_GUI_iss959ESS_GUI_openclESS_GUI_orderingESS_GUI_sync_sascalccostrafo411magnetic_scattrelease-4.1.1release-4.1.2release-4.2.2release_4.0.1ticket-1009ticket-1094-headlessticket-1242-2d-resolutionticket-1243ticket-1249ticket885unittest-saveload
Last change on this file since 2cef9d3 was 0b082f3, checked in by Mathieu Doucet <doucetm@…>, 13 years ago

Re #7 Enable openmp for all models
  • Property mode set to 100644
File size: 24.1 KB
Line 
1/**
2        This software was developed by the University of Tennessee as part of the
3        Distributed Data Analysis of Neutron Scattering Experiments (DANSE)
4        project funded by the US National Science Foundation.
5
6        If you use DANSE applications to do scientific research that leads to
7        publication, we ask that you acknowledge the use of the software with the
8        following sentence:
9
10        "This work benefited from DANSE software developed under NSF award DMR-0520547."
11
12        copyright 2008, University of Tennessee
13 */
14
15/** CFlexCylEllipXModel
16 *
17 * C extension
18 *
19 * WARNING: THIS FILE WAS GENERATED BY WRAPPERGENERATOR.PY
20 *          DO NOT MODIFY THIS FILE, MODIFY flexcyl_ellipX.h
21 *          AND RE-RUN THE GENERATOR SCRIPT
22 *
23 */
24#define NO_IMPORT_ARRAY
25#define PY_ARRAY_UNIQUE_SYMBOL PyArray_API_sans
26 
27extern "C" {
28#include <Python.h>
29#include <arrayobject.h>
30#include "structmember.h"
31#include <stdio.h>
32#include <stdlib.h>
33#include <math.h>
34#include <time.h>
35#include "flexcyl_ellipX.h"
36}
37
38#include "models.hh"
39#include "dispersion_visitor.hh"
40
41/// Error object for raised exceptions
42static PyObject * CFlexCylEllipXModelError = NULL;
43
44
45// Class definition
46typedef struct {
47    PyObject_HEAD
48    /// Parameters
49    PyObject * params;
50    /// Dispersion parameters
51    PyObject * dispersion;
52    /// Underlying model object
53    FlexCylEllipXModel * model;
54    /// Log for unit testing
55    PyObject * log;
56} CFlexCylEllipXModel;
57
58
59static void
60CFlexCylEllipXModel_dealloc(CFlexCylEllipXModel* self)
61{
62    Py_DECREF(self->params);
63    Py_DECREF(self->dispersion);
64    Py_DECREF(self->log);
65    delete self->model;
66    self->ob_type->tp_free((PyObject*)self);
67   
68
69}
70
71static PyObject *
72CFlexCylEllipXModel_new(PyTypeObject *type, PyObject *args, PyObject *kwds)
73{
74    CFlexCylEllipXModel *self;
75   
76    self = (CFlexCylEllipXModel *)type->tp_alloc(type, 0);
77   
78    return (PyObject *)self;
79}
80
81static int
82CFlexCylEllipXModel_init(CFlexCylEllipXModel *self, PyObject *args, PyObject *kwds)
83{
84    if (self != NULL) {
85       
86        // Create parameters
87        self->params = PyDict_New();
88        self->dispersion = PyDict_New();
89        self->model = new FlexCylEllipXModel();
90       
91        // Initialize parameter dictionary
92        PyDict_SetItemString(self->params,"scale",Py_BuildValue("d",1.000000000000));
93        PyDict_SetItemString(self->params,"sldCyl",Py_BuildValue("d",0.000001000000));
94        PyDict_SetItemString(self->params,"axis_ratio",Py_BuildValue("d",1.500000000000));
95        PyDict_SetItemString(self->params,"length",Py_BuildValue("d",1000.000000000000));
96        PyDict_SetItemString(self->params,"radius",Py_BuildValue("d",20.000000000000));
97        PyDict_SetItemString(self->params,"background",Py_BuildValue("d",0.000100000000));
98        PyDict_SetItemString(self->params,"sldSolv",Py_BuildValue("d",0.000006300000));
99        PyDict_SetItemString(self->params,"kuhn_length",Py_BuildValue("d",100.000000000000));
100        // Initialize dispersion / averaging parameter dict
101        DispersionVisitor* visitor = new DispersionVisitor();
102        PyObject * disp_dict;
103        disp_dict = PyDict_New();
104        self->model->length.dispersion->accept_as_source(visitor, self->model->length.dispersion, disp_dict);
105        PyDict_SetItemString(self->dispersion, "length", disp_dict);
106        disp_dict = PyDict_New();
107        self->model->kuhn_length.dispersion->accept_as_source(visitor, self->model->kuhn_length.dispersion, disp_dict);
108        PyDict_SetItemString(self->dispersion, "kuhn_length", disp_dict);
109        disp_dict = PyDict_New();
110        self->model->radius.dispersion->accept_as_source(visitor, self->model->radius.dispersion, disp_dict);
111        PyDict_SetItemString(self->dispersion, "radius", disp_dict);
112        disp_dict = PyDict_New();
113        self->model->axis_ratio.dispersion->accept_as_source(visitor, self->model->axis_ratio.dispersion, disp_dict);
114        PyDict_SetItemString(self->dispersion, "axis_ratio", disp_dict);
115
116
117         
118        // Create empty log
119        self->log = PyDict_New();
120       
121       
122
123    }
124    return 0;
125}
126
127static char name_params[] = "params";
128static char def_params[] = "Parameters";
129static char name_dispersion[] = "dispersion";
130static char def_dispersion[] = "Dispersion parameters";
131static char name_log[] = "log";
132static char def_log[] = "Log";
133
134static PyMemberDef CFlexCylEllipXModel_members[] = {
135    {name_params, T_OBJECT, offsetof(CFlexCylEllipXModel, params), 0, def_params},
136        {name_dispersion, T_OBJECT, offsetof(CFlexCylEllipXModel, dispersion), 0, def_dispersion},     
137    {name_log, T_OBJECT, offsetof(CFlexCylEllipXModel, log), 0, def_log},
138    {NULL}  /* Sentinel */
139};
140
141/** Read double from PyObject
142    @param p PyObject
143    @return double
144*/
145double CFlexCylEllipXModel_readDouble(PyObject *p) {
146    if (PyFloat_Check(p)==1) {
147        return (double)(((PyFloatObject *)(p))->ob_fval);
148    } else if (PyInt_Check(p)==1) {
149        return (double)(((PyIntObject *)(p))->ob_ival);
150    } else if (PyLong_Check(p)==1) {
151        return (double)PyLong_AsLong(p);
152    } else {
153        return 0.0;
154    }
155}
156/**
157 * Function to call to evaluate model
158 * @param args: input numpy array q[]
159 * @return: numpy array object
160 */
161 
162static PyObject *evaluateOneDim(FlexCylEllipXModel* model, PyArrayObject *q){
163    PyArrayObject *result;
164   
165    // Check validity of array q , q must be of dimension 1, an array of double
166    if (q->nd != 1 || q->descr->type_num != PyArray_DOUBLE)
167    {
168        //const char * message= "Invalid array: q->nd=%d,type_num=%d\n",q->nd,q->descr->type_num;
169        //PyErr_SetString(PyExc_ValueError , message);
170        return NULL;
171    }
172    result = (PyArrayObject *)PyArray_FromDims(q->nd, (int *)(q->dimensions), 
173                                                                                  PyArray_DOUBLE);
174        if (result == NULL) {
175        const char * message= "Could not create result ";
176        PyErr_SetString(PyExc_RuntimeError , message);
177                return NULL;
178        }
179#pragma omp parallel for
180         for (int i = 0; i < q->dimensions[0]; i++){
181      double q_value  = *(double *)(q->data + i*q->strides[0]);
182      double *result_value = (double *)(result->data + i*result->strides[0]);
183      *result_value =(*model)(q_value);
184        }
185    return PyArray_Return(result); 
186 }
187
188 /**
189 * Function to call to evaluate model
190 * @param args: input numpy array  [x[],y[]]
191 * @return: numpy array object
192 */
193 static PyObject * evaluateTwoDimXY( FlexCylEllipXModel* model, 
194                              PyArrayObject *x, PyArrayObject *y)
195 {
196    PyArrayObject *result;
197    int x_len, y_len, dims[1];
198    //check validity of input vectors
199    if (x->nd != 1 || x->descr->type_num != PyArray_DOUBLE
200        || y->nd != 1 || y->descr->type_num != PyArray_DOUBLE
201        || y->dimensions[0] != x->dimensions[0]){
202        const char * message= "evaluateTwoDimXY  expect 2 numpy arrays";
203        PyErr_SetString(PyExc_ValueError , message); 
204        return NULL;
205    }
206   
207        if (PyArray_Check(x) && PyArray_Check(y)) {
208               
209            x_len = dims[0]= x->dimensions[0];
210        y_len = dims[0]= y->dimensions[0];
211           
212            // Make a new double matrix of same dims
213        result=(PyArrayObject *) PyArray_FromDims(1,dims,NPY_DOUBLE);
214        if (result == NULL){
215            const char * message= "Could not create result ";
216        PyErr_SetString(PyExc_RuntimeError , message);
217            return NULL;
218            }
219       
220        /* Do the calculation. */
221#pragma omp parallel for
222        for (int i=0; i< x_len; i++) {
223            double x_value = *(double *)(x->data + i*x->strides[0]);
224                    double y_value = *(double *)(y->data + i*y->strides[0]);
225                        double *result_value = (double *)(result->data +
226                              i*result->strides[0]);
227                        *result_value = (*model)(x_value, y_value);
228        }           
229        return PyArray_Return(result); 
230       
231        }else{
232                    PyErr_SetString(CFlexCylEllipXModelError, 
233                   "CFlexCylEllipXModel.evaluateTwoDimXY couldn't run.");
234                return NULL;
235                }       
236}
237/**
238 *  evalDistribution function evaluate a model function with input vector
239 *  @param args: input q as vector or [qx, qy] where qx, qy are vectors
240 *
241 */ 
242static PyObject * evalDistribution(CFlexCylEllipXModel *self, PyObject *args){
243        PyObject *qx, *qy;
244        PyArrayObject * pars;
245        int npars ,mpars;
246       
247        // Get parameters
248       
249            // Reader parameter dictionary
250    self->model->scale = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "scale") );
251    self->model->sldCyl = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "sldCyl") );
252    self->model->axis_ratio = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "axis_ratio") );
253    self->model->length = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "length") );
254    self->model->radius = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "radius") );
255    self->model->background = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "background") );
256    self->model->sldSolv = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "sldSolv") );
257    self->model->kuhn_length = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "kuhn_length") );
258    // Read in dispersion parameters
259    PyObject* disp_dict;
260    DispersionVisitor* visitor = new DispersionVisitor();
261    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "length");
262    self->model->length.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->length.dispersion, disp_dict);
263    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "kuhn_length");
264    self->model->kuhn_length.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->kuhn_length.dispersion, disp_dict);
265    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "radius");
266    self->model->radius.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->radius.dispersion, disp_dict);
267    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "axis_ratio");
268    self->model->axis_ratio.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->axis_ratio.dispersion, disp_dict);
269
270       
271        // Get input and determine whether we have to supply a 1D or 2D return value.
272        if ( !PyArg_ParseTuple(args,"O",&pars) ) {
273            PyErr_SetString(CFlexCylEllipXModelError, 
274                "CFlexCylEllipXModel.evalDistribution expects a q value.");
275                return NULL;
276        }
277    // Check params
278       
279    if(PyArray_Check(pars)==1) {
280               
281            // Length of list should 1 or 2
282            npars = pars->nd; 
283            if(npars==1) {
284                // input is a numpy array
285                if (PyArray_Check(pars)) {
286                        return evaluateOneDim(self->model, (PyArrayObject*)pars); 
287                    }
288                }else{
289                    PyErr_SetString(CFlexCylEllipXModelError, 
290                   "CFlexCylEllipXModel.evalDistribution expect numpy array of one dimension.");
291                return NULL;
292                }
293    }else if( PyList_Check(pars)==1) {
294        // Length of list should be 2 for I(qx,qy)
295            mpars = PyList_GET_SIZE(pars); 
296            if(mpars!=2) {
297                PyErr_SetString(CFlexCylEllipXModelError, 
298                        "CFlexCylEllipXModel.evalDistribution expects a list of dimension 2.");
299                return NULL;
300            }
301             qx = PyList_GET_ITEM(pars,0);
302             qy = PyList_GET_ITEM(pars,1);
303             if (PyArray_Check(qx) && PyArray_Check(qy)) {
304                 return evaluateTwoDimXY(self->model, (PyArrayObject*)qx,
305                           (PyArrayObject*)qy);
306                 }else{
307                    PyErr_SetString(CFlexCylEllipXModelError, 
308                   "CFlexCylEllipXModel.evalDistribution expect 2 numpy arrays in list.");
309                return NULL;
310             }
311        }
312        PyErr_SetString(CFlexCylEllipXModelError, 
313                   "CFlexCylEllipXModel.evalDistribution couln't be run.");
314        return NULL;
315       
316}
317
318/**
319 * Function to call to evaluate model
320 * @param args: input q or [q,phi]
321 * @return: function value
322 */
323static PyObject * run(CFlexCylEllipXModel *self, PyObject *args) {
324        double q_value, phi_value;
325        PyObject* pars;
326        int npars;
327       
328        // Get parameters
329       
330            // Reader parameter dictionary
331    self->model->scale = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "scale") );
332    self->model->sldCyl = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "sldCyl") );
333    self->model->axis_ratio = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "axis_ratio") );
334    self->model->length = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "length") );
335    self->model->radius = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "radius") );
336    self->model->background = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "background") );
337    self->model->sldSolv = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "sldSolv") );
338    self->model->kuhn_length = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "kuhn_length") );
339    // Read in dispersion parameters
340    PyObject* disp_dict;
341    DispersionVisitor* visitor = new DispersionVisitor();
342    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "length");
343    self->model->length.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->length.dispersion, disp_dict);
344    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "kuhn_length");
345    self->model->kuhn_length.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->kuhn_length.dispersion, disp_dict);
346    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "radius");
347    self->model->radius.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->radius.dispersion, disp_dict);
348    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "axis_ratio");
349    self->model->axis_ratio.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->axis_ratio.dispersion, disp_dict);
350
351       
352        // Get input and determine whether we have to supply a 1D or 2D return value.
353        if ( !PyArg_ParseTuple(args,"O",&pars) ) {
354            PyErr_SetString(CFlexCylEllipXModelError, 
355                "CFlexCylEllipXModel.run expects a q value.");
356                return NULL;
357        }
358         
359        // Check params
360        if( PyList_Check(pars)==1) {
361               
362                // Length of list should be 2 for I(q,phi)
363            npars = PyList_GET_SIZE(pars); 
364            if(npars!=2) {
365                PyErr_SetString(CFlexCylEllipXModelError, 
366                        "CFlexCylEllipXModel.run expects a double or a list of dimension 2.");
367                return NULL;
368            }
369            // We have a vector q, get the q and phi values at which
370            // to evaluate I(q,phi)
371            q_value = CFlexCylEllipXModel_readDouble(PyList_GET_ITEM(pars,0));
372            phi_value = CFlexCylEllipXModel_readDouble(PyList_GET_ITEM(pars,1));
373            // Skip zero
374            if (q_value==0) {
375                return Py_BuildValue("d",0.0);
376            }
377                return Py_BuildValue("d",(*(self->model)).evaluate_rphi(q_value,phi_value));
378
379        } else {
380
381                // We have a scalar q, we will evaluate I(q)
382                q_value = CFlexCylEllipXModel_readDouble(pars);         
383               
384                return Py_BuildValue("d",(*(self->model))(q_value));
385        }       
386}
387/**
388 * Function to call to calculate_ER
389 * @return: effective radius value
390 */
391static PyObject * calculate_ER(CFlexCylEllipXModel *self) {
392
393        // Get parameters
394       
395            // Reader parameter dictionary
396    self->model->scale = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "scale") );
397    self->model->sldCyl = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "sldCyl") );
398    self->model->axis_ratio = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "axis_ratio") );
399    self->model->length = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "length") );
400    self->model->radius = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "radius") );
401    self->model->background = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "background") );
402    self->model->sldSolv = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "sldSolv") );
403    self->model->kuhn_length = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "kuhn_length") );
404    // Read in dispersion parameters
405    PyObject* disp_dict;
406    DispersionVisitor* visitor = new DispersionVisitor();
407    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "length");
408    self->model->length.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->length.dispersion, disp_dict);
409    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "kuhn_length");
410    self->model->kuhn_length.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->kuhn_length.dispersion, disp_dict);
411    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "radius");
412    self->model->radius.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->radius.dispersion, disp_dict);
413    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "axis_ratio");
414    self->model->axis_ratio.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->axis_ratio.dispersion, disp_dict);
415
416               
417        return Py_BuildValue("d",(*(self->model)).calculate_ER());
418
419}
420/**
421 * Function to call to evaluate model in cartesian coordinates
422 * @param args: input q or [qx, qy]]
423 * @return: function value
424 */
425static PyObject * runXY(CFlexCylEllipXModel *self, PyObject *args) {
426        double qx_value, qy_value;
427        PyObject* pars;
428        int npars;
429       
430        // Get parameters
431       
432            // Reader parameter dictionary
433    self->model->scale = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "scale") );
434    self->model->sldCyl = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "sldCyl") );
435    self->model->axis_ratio = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "axis_ratio") );
436    self->model->length = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "length") );
437    self->model->radius = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "radius") );
438    self->model->background = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "background") );
439    self->model->sldSolv = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "sldSolv") );
440    self->model->kuhn_length = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "kuhn_length") );
441    // Read in dispersion parameters
442    PyObject* disp_dict;
443    DispersionVisitor* visitor = new DispersionVisitor();
444    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "length");
445    self->model->length.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->length.dispersion, disp_dict);
446    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "kuhn_length");
447    self->model->kuhn_length.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->kuhn_length.dispersion, disp_dict);
448    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "radius");
449    self->model->radius.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->radius.dispersion, disp_dict);
450    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "axis_ratio");
451    self->model->axis_ratio.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->axis_ratio.dispersion, disp_dict);
452
453       
454        // Get input and determine whether we have to supply a 1D or 2D return value.
455        if ( !PyArg_ParseTuple(args,"O",&pars) ) {
456            PyErr_SetString(CFlexCylEllipXModelError, 
457                "CFlexCylEllipXModel.run expects a q value.");
458                return NULL;
459        }
460         
461        // Check params
462        if( PyList_Check(pars)==1) {
463               
464                // Length of list should be 2 for I(qx, qy))
465            npars = PyList_GET_SIZE(pars); 
466            if(npars!=2) {
467                PyErr_SetString(CFlexCylEllipXModelError, 
468                        "CFlexCylEllipXModel.run expects a double or a list of dimension 2.");
469                return NULL;
470            }
471            // We have a vector q, get the qx and qy values at which
472            // to evaluate I(qx,qy)
473            qx_value = CFlexCylEllipXModel_readDouble(PyList_GET_ITEM(pars,0));
474            qy_value = CFlexCylEllipXModel_readDouble(PyList_GET_ITEM(pars,1));
475            return Py_BuildValue("d",(*(self->model))(qx_value,qy_value));
476
477        } else {
478
479                // We have a scalar q, we will evaluate I(q)
480                qx_value = CFlexCylEllipXModel_readDouble(pars);               
481               
482                return Py_BuildValue("d",(*(self->model))(qx_value));
483        }       
484}
485
486static PyObject * reset(CFlexCylEllipXModel *self, PyObject *args) {
487   
488
489    return Py_BuildValue("d",0.0);
490}
491
492static PyObject * set_dispersion(CFlexCylEllipXModel *self, PyObject *args) {
493        PyObject * disp;
494        const char * par_name;
495
496        if ( !PyArg_ParseTuple(args,"sO", &par_name, &disp) ) {
497            PyErr_SetString(CFlexCylEllipXModelError,
498                "CFlexCylEllipXModel.set_dispersion expects a DispersionModel object.");
499                return NULL;
500        }
501        void *temp = PyCObject_AsVoidPtr(disp);
502        DispersionModel * dispersion = static_cast<DispersionModel *>(temp);
503
504
505        // Ugliness necessary to go from python to C
506            // TODO: refactor this
507    if (!strcmp(par_name, "length")) {
508        self->model->length.dispersion = dispersion;
509    } else    if (!strcmp(par_name, "kuhn_length")) {
510        self->model->kuhn_length.dispersion = dispersion;
511    } else    if (!strcmp(par_name, "radius")) {
512        self->model->radius.dispersion = dispersion;
513    } else    if (!strcmp(par_name, "axis_ratio")) {
514        self->model->axis_ratio.dispersion = dispersion;
515    } else {
516            PyErr_SetString(CFlexCylEllipXModelError,
517                "CFlexCylEllipXModel.set_dispersion expects a valid parameter name.");
518                return NULL;
519        }
520
521        DispersionVisitor* visitor = new DispersionVisitor();
522        PyObject * disp_dict = PyDict_New();
523        dispersion->accept_as_source(visitor, dispersion, disp_dict);
524        PyDict_SetItemString(self->dispersion, par_name, disp_dict);
525    return Py_BuildValue("i",1);
526}
527
528
529static PyMethodDef CFlexCylEllipXModel_methods[] = {
530    {"run",      (PyCFunction)run     , METH_VARARGS,
531      "Evaluate the model at a given Q or Q, phi"},
532    {"runXY",      (PyCFunction)runXY     , METH_VARARGS,
533      "Evaluate the model at a given Q or Qx, Qy"},
534    {"calculate_ER",      (PyCFunction)calculate_ER     , METH_VARARGS,
535      "Evaluate the model at a given Q or Q, phi"},
536     
537    {"evalDistribution",  (PyCFunction)evalDistribution , METH_VARARGS,
538      "Evaluate the model at a given Q or Qx, Qy vector "},
539    {"reset",    (PyCFunction)reset   , METH_VARARGS,
540      "Reset pair correlation"},
541    {"set_dispersion",      (PyCFunction)set_dispersion     , METH_VARARGS,
542      "Set the dispersion model for a given parameter"},
543   {NULL}
544};
545
546static PyTypeObject CFlexCylEllipXModelType = {
547    PyObject_HEAD_INIT(NULL)
548    0,                         /*ob_size*/
549    "CFlexCylEllipXModel",             /*tp_name*/
550    sizeof(CFlexCylEllipXModel),             /*tp_basicsize*/
551    0,                         /*tp_itemsize*/
552    (destructor)CFlexCylEllipXModel_dealloc, /*tp_dealloc*/
553    0,                         /*tp_print*/
554    0,                         /*tp_getattr*/
555    0,                         /*tp_setattr*/
556    0,                         /*tp_compare*/
557    0,                         /*tp_repr*/
558    0,                         /*tp_as_number*/
559    0,                         /*tp_as_sequence*/
560    0,                         /*tp_as_mapping*/
561    0,                         /*tp_hash */
562    0,                         /*tp_call*/
563    0,                         /*tp_str*/
564    0,                         /*tp_getattro*/
565    0,                         /*tp_setattro*/
566    0,                         /*tp_as_buffer*/
567    Py_TPFLAGS_DEFAULT | Py_TPFLAGS_BASETYPE, /*tp_flags*/
568    "CFlexCylEllipXModel objects",           /* tp_doc */
569    0,                         /* tp_traverse */
570    0,                         /* tp_clear */
571    0,                         /* tp_richcompare */
572    0,                         /* tp_weaklistoffset */
573    0,                         /* tp_iter */
574    0,                         /* tp_iternext */
575    CFlexCylEllipXModel_methods,             /* tp_methods */
576    CFlexCylEllipXModel_members,             /* tp_members */
577    0,                         /* tp_getset */
578    0,                         /* tp_base */
579    0,                         /* tp_dict */
580    0,                         /* tp_descr_get */
581    0,                         /* tp_descr_set */
582    0,                         /* tp_dictoffset */
583    (initproc)CFlexCylEllipXModel_init,      /* tp_init */
584    0,                         /* tp_alloc */
585    CFlexCylEllipXModel_new,                 /* tp_new */
586};
587
588
589//static PyMethodDef module_methods[] = {
590//    {NULL}
591//};
592
593/**
594 * Function used to add the model class to a module
595 * @param module: module to add the class to
596 */ 
597void addCFlexCylEllipXModel(PyObject *module) {
598        PyObject *d;
599       
600    if (PyType_Ready(&CFlexCylEllipXModelType) < 0)
601        return;
602
603    Py_INCREF(&CFlexCylEllipXModelType);
604    PyModule_AddObject(module, "CFlexCylEllipXModel", (PyObject *)&CFlexCylEllipXModelType);
605   
606    d = PyModule_GetDict(module);
607    static char error_name[] = "CFlexCylEllipXModel.error";
608    CFlexCylEllipXModelError = PyErr_NewException(error_name, NULL, NULL);
609    PyDict_SetItemString(d, "CFlexCylEllipXModelError", CFlexCylEllipXModelError);
610}
611
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.