source: sasview/sansmodels/src/sans/models/c_models/CFCCrystalModel.cpp @ 0b082f3

ESS_GUIESS_GUI_DocsESS_GUI_batch_fittingESS_GUI_bumps_abstractionESS_GUI_iss1116ESS_GUI_iss879ESS_GUI_iss959ESS_GUI_openclESS_GUI_orderingESS_GUI_sync_sascalccostrafo411magnetic_scattrelease-4.1.1release-4.1.2release-4.2.2release_4.0.1ticket-1009ticket-1094-headlessticket-1242-2d-resolutionticket-1243ticket-1249ticket885unittest-saveload
Last change on this file since 0b082f3 was 0b082f3, checked in by Mathieu Doucet <doucetm@…>, 12 years ago

Re #7 Enable openmp for all models
  • Property mode set to 100644
File size: 24.3 KB
Line 
1/**
2        This software was developed by the University of Tennessee as part of the
3        Distributed Data Analysis of Neutron Scattering Experiments (DANSE)
4        project funded by the US National Science Foundation.
5
6        If you use DANSE applications to do scientific research that leads to
7        publication, we ask that you acknowledge the use of the software with the
8        following sentence:
9
10        "This work benefited from DANSE software developed under NSF award DMR-0520547."
11
12        copyright 2008, University of Tennessee
13 */
14
15/** CFCCrystalModel
16 *
17 * C extension
18 *
19 * WARNING: THIS FILE WAS GENERATED BY WRAPPERGENERATOR.PY
20 *          DO NOT MODIFY THIS FILE, MODIFY fcc.h
21 *          AND RE-RUN THE GENERATOR SCRIPT
22 *
23 */
24#define NO_IMPORT_ARRAY
25#define PY_ARRAY_UNIQUE_SYMBOL PyArray_API_sans
26 
27extern "C" {
28#include <Python.h>
29#include <arrayobject.h>
30#include "structmember.h"
31#include <stdio.h>
32#include <stdlib.h>
33#include <math.h>
34#include <time.h>
35#include "fcc.h"
36}
37
38#include "models.hh"
39#include "dispersion_visitor.hh"
40
41/// Error object for raised exceptions
42static PyObject * CFCCrystalModelError = NULL;
43
44
45// Class definition
46typedef struct {
47    PyObject_HEAD
48    /// Parameters
49    PyObject * params;
50    /// Dispersion parameters
51    PyObject * dispersion;
52    /// Underlying model object
53    FCCrystalModel * model;
54    /// Log for unit testing
55    PyObject * log;
56} CFCCrystalModel;
57
58
59static void
60CFCCrystalModel_dealloc(CFCCrystalModel* self)
61{
62    Py_DECREF(self->params);
63    Py_DECREF(self->dispersion);
64    Py_DECREF(self->log);
65    delete self->model;
66    self->ob_type->tp_free((PyObject*)self);
67   
68
69}
70
71static PyObject *
72CFCCrystalModel_new(PyTypeObject *type, PyObject *args, PyObject *kwds)
73{
74    CFCCrystalModel *self;
75   
76    self = (CFCCrystalModel *)type->tp_alloc(type, 0);
77   
78    return (PyObject *)self;
79}
80
81static int
82CFCCrystalModel_init(CFCCrystalModel *self, PyObject *args, PyObject *kwds)
83{
84    if (self != NULL) {
85       
86        // Create parameters
87        self->params = PyDict_New();
88        self->dispersion = PyDict_New();
89        self->model = new FCCrystalModel();
90       
91        // Initialize parameter dictionary
92        PyDict_SetItemString(self->params,"phi",Py_BuildValue("d",0.000000000000));
93        PyDict_SetItemString(self->params,"scale",Py_BuildValue("d",1.000000000000));
94        PyDict_SetItemString(self->params,"dnn",Py_BuildValue("d",220.000000000000));
95        PyDict_SetItemString(self->params,"sldSph",Py_BuildValue("d",0.000003000000));
96        PyDict_SetItemString(self->params,"d_factor",Py_BuildValue("d",0.060000000000));
97        PyDict_SetItemString(self->params,"psi",Py_BuildValue("d",0.000000000000));
98        PyDict_SetItemString(self->params,"radius",Py_BuildValue("d",40.000000000000));
99        PyDict_SetItemString(self->params,"background",Py_BuildValue("d",0.000000000000));
100        PyDict_SetItemString(self->params,"theta",Py_BuildValue("d",0.000000000000));
101        PyDict_SetItemString(self->params,"sldSolv",Py_BuildValue("d",0.000006300000));
102        // Initialize dispersion / averaging parameter dict
103        DispersionVisitor* visitor = new DispersionVisitor();
104        PyObject * disp_dict;
105        disp_dict = PyDict_New();
106        self->model->radius.dispersion->accept_as_source(visitor, self->model->radius.dispersion, disp_dict);
107        PyDict_SetItemString(self->dispersion, "radius", disp_dict);
108        disp_dict = PyDict_New();
109        self->model->phi.dispersion->accept_as_source(visitor, self->model->phi.dispersion, disp_dict);
110        PyDict_SetItemString(self->dispersion, "phi", disp_dict);
111        disp_dict = PyDict_New();
112        self->model->psi.dispersion->accept_as_source(visitor, self->model->psi.dispersion, disp_dict);
113        PyDict_SetItemString(self->dispersion, "psi", disp_dict);
114        disp_dict = PyDict_New();
115        self->model->theta.dispersion->accept_as_source(visitor, self->model->theta.dispersion, disp_dict);
116        PyDict_SetItemString(self->dispersion, "theta", disp_dict);
117
118
119         
120        // Create empty log
121        self->log = PyDict_New();
122       
123       
124
125    }
126    return 0;
127}
128
129static char name_params[] = "params";
130static char def_params[] = "Parameters";
131static char name_dispersion[] = "dispersion";
132static char def_dispersion[] = "Dispersion parameters";
133static char name_log[] = "log";
134static char def_log[] = "Log";
135
136static PyMemberDef CFCCrystalModel_members[] = {
137    {name_params, T_OBJECT, offsetof(CFCCrystalModel, params), 0, def_params},
138        {name_dispersion, T_OBJECT, offsetof(CFCCrystalModel, dispersion), 0, def_dispersion},     
139    {name_log, T_OBJECT, offsetof(CFCCrystalModel, log), 0, def_log},
140    {NULL}  /* Sentinel */
141};
142
143/** Read double from PyObject
144    @param p PyObject
145    @return double
146*/
147double CFCCrystalModel_readDouble(PyObject *p) {
148    if (PyFloat_Check(p)==1) {
149        return (double)(((PyFloatObject *)(p))->ob_fval);
150    } else if (PyInt_Check(p)==1) {
151        return (double)(((PyIntObject *)(p))->ob_ival);
152    } else if (PyLong_Check(p)==1) {
153        return (double)PyLong_AsLong(p);
154    } else {
155        return 0.0;
156    }
157}
158/**
159 * Function to call to evaluate model
160 * @param args: input numpy array q[]
161 * @return: numpy array object
162 */
163 
164static PyObject *evaluateOneDim(FCCrystalModel* model, PyArrayObject *q){
165    PyArrayObject *result;
166   
167    // Check validity of array q , q must be of dimension 1, an array of double
168    if (q->nd != 1 || q->descr->type_num != PyArray_DOUBLE)
169    {
170        //const char * message= "Invalid array: q->nd=%d,type_num=%d\n",q->nd,q->descr->type_num;
171        //PyErr_SetString(PyExc_ValueError , message);
172        return NULL;
173    }
174    result = (PyArrayObject *)PyArray_FromDims(q->nd, (int *)(q->dimensions), 
175                                                                                  PyArray_DOUBLE);
176        if (result == NULL) {
177        const char * message= "Could not create result ";
178        PyErr_SetString(PyExc_RuntimeError , message);
179                return NULL;
180        }
181#pragma omp parallel for
182         for (int i = 0; i < q->dimensions[0]; i++){
183      double q_value  = *(double *)(q->data + i*q->strides[0]);
184      double *result_value = (double *)(result->data + i*result->strides[0]);
185      *result_value =(*model)(q_value);
186        }
187    return PyArray_Return(result); 
188 }
189
190 /**
191 * Function to call to evaluate model
192 * @param args: input numpy array  [x[],y[]]
193 * @return: numpy array object
194 */
195 static PyObject * evaluateTwoDimXY( FCCrystalModel* model, 
196                              PyArrayObject *x, PyArrayObject *y)
197 {
198    PyArrayObject *result;
199    int x_len, y_len, dims[1];
200    //check validity of input vectors
201    if (x->nd != 1 || x->descr->type_num != PyArray_DOUBLE
202        || y->nd != 1 || y->descr->type_num != PyArray_DOUBLE
203        || y->dimensions[0] != x->dimensions[0]){
204        const char * message= "evaluateTwoDimXY  expect 2 numpy arrays";
205        PyErr_SetString(PyExc_ValueError , message); 
206        return NULL;
207    }
208   
209        if (PyArray_Check(x) && PyArray_Check(y)) {
210               
211            x_len = dims[0]= x->dimensions[0];
212        y_len = dims[0]= y->dimensions[0];
213           
214            // Make a new double matrix of same dims
215        result=(PyArrayObject *) PyArray_FromDims(1,dims,NPY_DOUBLE);
216        if (result == NULL){
217            const char * message= "Could not create result ";
218        PyErr_SetString(PyExc_RuntimeError , message);
219            return NULL;
220            }
221       
222        /* Do the calculation. */
223#pragma omp parallel for
224        for (int i=0; i< x_len; i++) {
225            double x_value = *(double *)(x->data + i*x->strides[0]);
226                    double y_value = *(double *)(y->data + i*y->strides[0]);
227                        double *result_value = (double *)(result->data +
228                              i*result->strides[0]);
229                        *result_value = (*model)(x_value, y_value);
230        }           
231        return PyArray_Return(result); 
232       
233        }else{
234                    PyErr_SetString(CFCCrystalModelError, 
235                   "CFCCrystalModel.evaluateTwoDimXY couldn't run.");
236                return NULL;
237                }       
238}
239/**
240 *  evalDistribution function evaluate a model function with input vector
241 *  @param args: input q as vector or [qx, qy] where qx, qy are vectors
242 *
243 */ 
244static PyObject * evalDistribution(CFCCrystalModel *self, PyObject *args){
245        PyObject *qx, *qy;
246        PyArrayObject * pars;
247        int npars ,mpars;
248       
249        // Get parameters
250       
251            // Reader parameter dictionary
252    self->model->phi = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "phi") );
253    self->model->scale = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "scale") );
254    self->model->dnn = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "dnn") );
255    self->model->sldSph = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "sldSph") );
256    self->model->d_factor = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "d_factor") );
257    self->model->psi = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "psi") );
258    self->model->radius = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "radius") );
259    self->model->background = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "background") );
260    self->model->theta = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "theta") );
261    self->model->sldSolv = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "sldSolv") );
262    // Read in dispersion parameters
263    PyObject* disp_dict;
264    DispersionVisitor* visitor = new DispersionVisitor();
265    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "radius");
266    self->model->radius.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->radius.dispersion, disp_dict);
267    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "phi");
268    self->model->phi.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->phi.dispersion, disp_dict);
269    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "psi");
270    self->model->psi.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->psi.dispersion, disp_dict);
271    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "theta");
272    self->model->theta.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->theta.dispersion, disp_dict);
273
274       
275        // Get input and determine whether we have to supply a 1D or 2D return value.
276        if ( !PyArg_ParseTuple(args,"O",&pars) ) {
277            PyErr_SetString(CFCCrystalModelError, 
278                "CFCCrystalModel.evalDistribution expects a q value.");
279                return NULL;
280        }
281    // Check params
282       
283    if(PyArray_Check(pars)==1) {
284               
285            // Length of list should 1 or 2
286            npars = pars->nd; 
287            if(npars==1) {
288                // input is a numpy array
289                if (PyArray_Check(pars)) {
290                        return evaluateOneDim(self->model, (PyArrayObject*)pars); 
291                    }
292                }else{
293                    PyErr_SetString(CFCCrystalModelError, 
294                   "CFCCrystalModel.evalDistribution expect numpy array of one dimension.");
295                return NULL;
296                }
297    }else if( PyList_Check(pars)==1) {
298        // Length of list should be 2 for I(qx,qy)
299            mpars = PyList_GET_SIZE(pars); 
300            if(mpars!=2) {
301                PyErr_SetString(CFCCrystalModelError, 
302                        "CFCCrystalModel.evalDistribution expects a list of dimension 2.");
303                return NULL;
304            }
305             qx = PyList_GET_ITEM(pars,0);
306             qy = PyList_GET_ITEM(pars,1);
307             if (PyArray_Check(qx) && PyArray_Check(qy)) {
308                 return evaluateTwoDimXY(self->model, (PyArrayObject*)qx,
309                           (PyArrayObject*)qy);
310                 }else{
311                    PyErr_SetString(CFCCrystalModelError, 
312                   "CFCCrystalModel.evalDistribution expect 2 numpy arrays in list.");
313                return NULL;
314             }
315        }
316        PyErr_SetString(CFCCrystalModelError, 
317                   "CFCCrystalModel.evalDistribution couln't be run.");
318        return NULL;
319       
320}
321
322/**
323 * Function to call to evaluate model
324 * @param args: input q or [q,phi]
325 * @return: function value
326 */
327static PyObject * run(CFCCrystalModel *self, PyObject *args) {
328        double q_value, phi_value;
329        PyObject* pars;
330        int npars;
331       
332        // Get parameters
333       
334            // Reader parameter dictionary
335    self->model->phi = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "phi") );
336    self->model->scale = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "scale") );
337    self->model->dnn = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "dnn") );
338    self->model->sldSph = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "sldSph") );
339    self->model->d_factor = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "d_factor") );
340    self->model->psi = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "psi") );
341    self->model->radius = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "radius") );
342    self->model->background = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "background") );
343    self->model->theta = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "theta") );
344    self->model->sldSolv = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "sldSolv") );
345    // Read in dispersion parameters
346    PyObject* disp_dict;
347    DispersionVisitor* visitor = new DispersionVisitor();
348    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "radius");
349    self->model->radius.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->radius.dispersion, disp_dict);
350    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "phi");
351    self->model->phi.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->phi.dispersion, disp_dict);
352    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "psi");
353    self->model->psi.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->psi.dispersion, disp_dict);
354    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "theta");
355    self->model->theta.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->theta.dispersion, disp_dict);
356
357       
358        // Get input and determine whether we have to supply a 1D or 2D return value.
359        if ( !PyArg_ParseTuple(args,"O",&pars) ) {
360            PyErr_SetString(CFCCrystalModelError, 
361                "CFCCrystalModel.run expects a q value.");
362                return NULL;
363        }
364         
365        // Check params
366        if( PyList_Check(pars)==1) {
367               
368                // Length of list should be 2 for I(q,phi)
369            npars = PyList_GET_SIZE(pars); 
370            if(npars!=2) {
371                PyErr_SetString(CFCCrystalModelError, 
372                        "CFCCrystalModel.run expects a double or a list of dimension 2.");
373                return NULL;
374            }
375            // We have a vector q, get the q and phi values at which
376            // to evaluate I(q,phi)
377            q_value = CFCCrystalModel_readDouble(PyList_GET_ITEM(pars,0));
378            phi_value = CFCCrystalModel_readDouble(PyList_GET_ITEM(pars,1));
379            // Skip zero
380            if (q_value==0) {
381                return Py_BuildValue("d",0.0);
382            }
383                return Py_BuildValue("d",(*(self->model)).evaluate_rphi(q_value,phi_value));
384
385        } else {
386
387                // We have a scalar q, we will evaluate I(q)
388                q_value = CFCCrystalModel_readDouble(pars);             
389               
390                return Py_BuildValue("d",(*(self->model))(q_value));
391        }       
392}
393/**
394 * Function to call to calculate_ER
395 * @return: effective radius value
396 */
397static PyObject * calculate_ER(CFCCrystalModel *self) {
398
399        // Get parameters
400       
401            // Reader parameter dictionary
402    self->model->phi = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "phi") );
403    self->model->scale = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "scale") );
404    self->model->dnn = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "dnn") );
405    self->model->sldSph = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "sldSph") );
406    self->model->d_factor = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "d_factor") );
407    self->model->psi = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "psi") );
408    self->model->radius = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "radius") );
409    self->model->background = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "background") );
410    self->model->theta = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "theta") );
411    self->model->sldSolv = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "sldSolv") );
412    // Read in dispersion parameters
413    PyObject* disp_dict;
414    DispersionVisitor* visitor = new DispersionVisitor();
415    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "radius");
416    self->model->radius.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->radius.dispersion, disp_dict);
417    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "phi");
418    self->model->phi.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->phi.dispersion, disp_dict);
419    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "psi");
420    self->model->psi.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->psi.dispersion, disp_dict);
421    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "theta");
422    self->model->theta.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->theta.dispersion, disp_dict);
423
424               
425        return Py_BuildValue("d",(*(self->model)).calculate_ER());
426
427}
428/**
429 * Function to call to evaluate model in cartesian coordinates
430 * @param args: input q or [qx, qy]]
431 * @return: function value
432 */
433static PyObject * runXY(CFCCrystalModel *self, PyObject *args) {
434        double qx_value, qy_value;
435        PyObject* pars;
436        int npars;
437       
438        // Get parameters
439       
440            // Reader parameter dictionary
441    self->model->phi = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "phi") );
442    self->model->scale = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "scale") );
443    self->model->dnn = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "dnn") );
444    self->model->sldSph = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "sldSph") );
445    self->model->d_factor = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "d_factor") );
446    self->model->psi = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "psi") );
447    self->model->radius = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "radius") );
448    self->model->background = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "background") );
449    self->model->theta = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "theta") );
450    self->model->sldSolv = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "sldSolv") );
451    // Read in dispersion parameters
452    PyObject* disp_dict;
453    DispersionVisitor* visitor = new DispersionVisitor();
454    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "radius");
455    self->model->radius.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->radius.dispersion, disp_dict);
456    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "phi");
457    self->model->phi.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->phi.dispersion, disp_dict);
458    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "psi");
459    self->model->psi.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->psi.dispersion, disp_dict);
460    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "theta");
461    self->model->theta.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->theta.dispersion, disp_dict);
462
463       
464        // Get input and determine whether we have to supply a 1D or 2D return value.
465        if ( !PyArg_ParseTuple(args,"O",&pars) ) {
466            PyErr_SetString(CFCCrystalModelError, 
467                "CFCCrystalModel.run expects a q value.");
468                return NULL;
469        }
470         
471        // Check params
472        if( PyList_Check(pars)==1) {
473               
474                // Length of list should be 2 for I(qx, qy))
475            npars = PyList_GET_SIZE(pars); 
476            if(npars!=2) {
477                PyErr_SetString(CFCCrystalModelError, 
478                        "CFCCrystalModel.run expects a double or a list of dimension 2.");
479                return NULL;
480            }
481            // We have a vector q, get the qx and qy values at which
482            // to evaluate I(qx,qy)
483            qx_value = CFCCrystalModel_readDouble(PyList_GET_ITEM(pars,0));
484            qy_value = CFCCrystalModel_readDouble(PyList_GET_ITEM(pars,1));
485            return Py_BuildValue("d",(*(self->model))(qx_value,qy_value));
486
487        } else {
488
489                // We have a scalar q, we will evaluate I(q)
490                qx_value = CFCCrystalModel_readDouble(pars);           
491               
492                return Py_BuildValue("d",(*(self->model))(qx_value));
493        }       
494}
495
496static PyObject * reset(CFCCrystalModel *self, PyObject *args) {
497   
498
499    return Py_BuildValue("d",0.0);
500}
501
502static PyObject * set_dispersion(CFCCrystalModel *self, PyObject *args) {
503        PyObject * disp;
504        const char * par_name;
505
506        if ( !PyArg_ParseTuple(args,"sO", &par_name, &disp) ) {
507            PyErr_SetString(CFCCrystalModelError,
508                "CFCCrystalModel.set_dispersion expects a DispersionModel object.");
509                return NULL;
510        }
511        void *temp = PyCObject_AsVoidPtr(disp);
512        DispersionModel * dispersion = static_cast<DispersionModel *>(temp);
513
514
515        // Ugliness necessary to go from python to C
516            // TODO: refactor this
517    if (!strcmp(par_name, "radius")) {
518        self->model->radius.dispersion = dispersion;
519    } else    if (!strcmp(par_name, "phi")) {
520        self->model->phi.dispersion = dispersion;
521    } else    if (!strcmp(par_name, "psi")) {
522        self->model->psi.dispersion = dispersion;
523    } else    if (!strcmp(par_name, "theta")) {
524        self->model->theta.dispersion = dispersion;
525    } else {
526            PyErr_SetString(CFCCrystalModelError,
527                "CFCCrystalModel.set_dispersion expects a valid parameter name.");
528                return NULL;
529        }
530
531        DispersionVisitor* visitor = new DispersionVisitor();
532        PyObject * disp_dict = PyDict_New();
533        dispersion->accept_as_source(visitor, dispersion, disp_dict);
534        PyDict_SetItemString(self->dispersion, par_name, disp_dict);
535    return Py_BuildValue("i",1);
536}
537
538
539static PyMethodDef CFCCrystalModel_methods[] = {
540    {"run",      (PyCFunction)run     , METH_VARARGS,
541      "Evaluate the model at a given Q or Q, phi"},
542    {"runXY",      (PyCFunction)runXY     , METH_VARARGS,
543      "Evaluate the model at a given Q or Qx, Qy"},
544    {"calculate_ER",      (PyCFunction)calculate_ER     , METH_VARARGS,
545      "Evaluate the model at a given Q or Q, phi"},
546     
547    {"evalDistribution",  (PyCFunction)evalDistribution , METH_VARARGS,
548      "Evaluate the model at a given Q or Qx, Qy vector "},
549    {"reset",    (PyCFunction)reset   , METH_VARARGS,
550      "Reset pair correlation"},
551    {"set_dispersion",      (PyCFunction)set_dispersion     , METH_VARARGS,
552      "Set the dispersion model for a given parameter"},
553   {NULL}
554};
555
556static PyTypeObject CFCCrystalModelType = {
557    PyObject_HEAD_INIT(NULL)
558    0,                         /*ob_size*/
559    "CFCCrystalModel",             /*tp_name*/
560    sizeof(CFCCrystalModel),             /*tp_basicsize*/
561    0,                         /*tp_itemsize*/
562    (destructor)CFCCrystalModel_dealloc, /*tp_dealloc*/
563    0,                         /*tp_print*/
564    0,                         /*tp_getattr*/
565    0,                         /*tp_setattr*/
566    0,                         /*tp_compare*/
567    0,                         /*tp_repr*/
568    0,                         /*tp_as_number*/
569    0,                         /*tp_as_sequence*/
570    0,                         /*tp_as_mapping*/
571    0,                         /*tp_hash */
572    0,                         /*tp_call*/
573    0,                         /*tp_str*/
574    0,                         /*tp_getattro*/
575    0,                         /*tp_setattro*/
576    0,                         /*tp_as_buffer*/
577    Py_TPFLAGS_DEFAULT | Py_TPFLAGS_BASETYPE, /*tp_flags*/
578    "CFCCrystalModel objects",           /* tp_doc */
579    0,                         /* tp_traverse */
580    0,                         /* tp_clear */
581    0,                         /* tp_richcompare */
582    0,                         /* tp_weaklistoffset */
583    0,                         /* tp_iter */
584    0,                         /* tp_iternext */
585    CFCCrystalModel_methods,             /* tp_methods */
586    CFCCrystalModel_members,             /* tp_members */
587    0,                         /* tp_getset */
588    0,                         /* tp_base */
589    0,                         /* tp_dict */
590    0,                         /* tp_descr_get */
591    0,                         /* tp_descr_set */
592    0,                         /* tp_dictoffset */
593    (initproc)CFCCrystalModel_init,      /* tp_init */
594    0,                         /* tp_alloc */
595    CFCCrystalModel_new,                 /* tp_new */
596};
597
598
599//static PyMethodDef module_methods[] = {
600//    {NULL}
601//};
602
603/**
604 * Function used to add the model class to a module
605 * @param module: module to add the class to
606 */ 
607void addCFCCrystalModel(PyObject *module) {
608        PyObject *d;
609       
610    if (PyType_Ready(&CFCCrystalModelType) < 0)
611        return;
612
613    Py_INCREF(&CFCCrystalModelType);
614    PyModule_AddObject(module, "CFCCrystalModel", (PyObject *)&CFCCrystalModelType);
615   
616    d = PyModule_GetDict(module);
617    static char error_name[] = "CFCCrystalModel.error";
618    CFCCrystalModelError = PyErr_NewException(error_name, NULL, NULL);
619    PyDict_SetItemString(d, "CFCCrystalModelError", CFCCrystalModelError);
620}
621
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.