source: sasview/sansmodels/src/sans/models/c_models/CDiamCylFunc.cpp @ e65050e

ESS_GUIESS_GUI_DocsESS_GUI_batch_fittingESS_GUI_bumps_abstractionESS_GUI_iss1116ESS_GUI_iss879ESS_GUI_iss959ESS_GUI_openclESS_GUI_orderingESS_GUI_sync_sascalccostrafo411magnetic_scattrelease-4.1.1release-4.1.2release-4.2.2release_4.0.1ticket-1009ticket-1094-headlessticket-1242-2d-resolutionticket-1243ticket-1249ticket885unittest-saveload
Last change on this file since e65050e was 63c2095, checked in by Jae Cho <jhjcho@…>, 16 years ago

Added 2nd virial coeff. functions
  • Property mode set to 100644
File size: 11.7 KB
Line 
1/**
2        This software was developed by the University of Tennessee as part of the
3        Distributed Data Analysis of Neutron Scattering Experiments (DANSE)
4        project funded by the US National Science Foundation.
5
6        If you use DANSE applications to do scientific research that leads to
7        publication, we ask that you acknowledge the use of the software with the
8        following sentence:
9
10        "This work benefited from DANSE software developed under NSF award DMR-0520547."
11
12        copyright 2008, University of Tennessee
13 */
14
15/** CDiamCylFunc
16 *
17 * C extension
18 *
19 * WARNING: THIS FILE WAS GENERATED BY WRAPPERGENERATOR.PY
20 *          DO NOT MODIFY THIS FILE, MODIFY DiamCyl.h
21 *          AND RE-RUN THE GENERATOR SCRIPT
22 *
23 */
24 
25extern "C" {
26#include <Python.h>
27#include "structmember.h"
28#include <stdio.h>
29#include <stdlib.h>
30#include <math.h>
31#include <time.h>
32#include "DiamCyl.h"
33}
34
35#include "models.hh"
36#include "dispersion_visitor.hh"
37
38/// Error object for raised exceptions
39static PyObject * CDiamCylFuncError = NULL;
40
41
42// Class definition
43typedef struct {
44    PyObject_HEAD
45    /// Parameters
46    PyObject * params;
47    /// Dispersion parameters
48    PyObject * dispersion;
49    /// Underlying model object
50    DiamCylFunc * model;
51    /// Log for unit testing
52    PyObject * log;
53} CDiamCylFunc;
54
55
56static void
57CDiamCylFunc_dealloc(CDiamCylFunc* self)
58{
59    self->ob_type->tp_free((PyObject*)self);
60   
61
62}
63
64static PyObject *
65CDiamCylFunc_new(PyTypeObject *type, PyObject *args, PyObject *kwds)
66{
67    CDiamCylFunc *self;
68   
69    self = (CDiamCylFunc *)type->tp_alloc(type, 0);
70   
71    return (PyObject *)self;
72}
73
74static int
75CDiamCylFunc_init(CDiamCylFunc *self, PyObject *args, PyObject *kwds)
76{
77    if (self != NULL) {
78       
79        // Create parameters
80        self->params = PyDict_New();
81        self->dispersion = PyDict_New();
82        self->model = new DiamCylFunc();
83       
84        // Initialize parameter dictionary
85        PyDict_SetItemString(self->params,"length",Py_BuildValue("d",400.000000));
86        PyDict_SetItemString(self->params,"radius",Py_BuildValue("d",20.000000));
87        // Initialize dispersion / averaging parameter dict
88        DispersionVisitor* visitor = new DispersionVisitor();
89        PyObject * disp_dict;
90        disp_dict = PyDict_New();
91        self->model->radius.dispersion->accept_as_source(visitor, self->model->radius.dispersion, disp_dict);
92        PyDict_SetItemString(self->dispersion, "radius", disp_dict);
93        disp_dict = PyDict_New();
94        self->model->length.dispersion->accept_as_source(visitor, self->model->length.dispersion, disp_dict);
95        PyDict_SetItemString(self->dispersion, "length", disp_dict);
96
97
98         
99        // Create empty log
100        self->log = PyDict_New();
101       
102       
103
104    }
105    return 0;
106}
107
108static PyMemberDef CDiamCylFunc_members[] = {
109    {"params", T_OBJECT, offsetof(CDiamCylFunc, params), 0,
110     "Parameters"},
111        {"dispersion", T_OBJECT, offsetof(CDiamCylFunc, dispersion), 0,
112          "Dispersion parameters"},     
113    {"log", T_OBJECT, offsetof(CDiamCylFunc, log), 0,
114     "Log"},
115    {NULL}  /* Sentinel */
116};
117
118/** Read double from PyObject
119    @param p PyObject
120    @return double
121*/
122double CDiamCylFunc_readDouble(PyObject *p) {
123    if (PyFloat_Check(p)==1) {
124        return (double)(((PyFloatObject *)(p))->ob_fval);
125    } else if (PyInt_Check(p)==1) {
126        return (double)(((PyIntObject *)(p))->ob_ival);
127    } else if (PyLong_Check(p)==1) {
128        return (double)PyLong_AsLong(p);
129    } else {
130        return 0.0;
131    }
132}
133
134
135/**
136 * Function to call to evaluate model
137 * @param args: input q or [q,phi]
138 * @return: function value
139 */
140static PyObject * run(CDiamCylFunc *self, PyObject *args) {
141        double q_value, phi_value;
142        PyObject* pars;
143        int npars;
144       
145        // Get parameters
146       
147            // Reader parameter dictionary
148    self->model->length = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "length") );
149    self->model->radius = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "radius") );
150    // Read in dispersion parameters
151    PyObject* disp_dict;
152    DispersionVisitor* visitor = new DispersionVisitor();
153    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "radius");
154    self->model->radius.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->radius.dispersion, disp_dict);
155    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "length");
156    self->model->length.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->length.dispersion, disp_dict);
157
158       
159        // Get input and determine whether we have to supply a 1D or 2D return value.
160        if ( !PyArg_ParseTuple(args,"O",&pars) ) {
161            PyErr_SetString(CDiamCylFuncError, 
162                "CDiamCylFunc.run expects a q value.");
163                return NULL;
164        }
165         
166        // Check params
167        if( PyList_Check(pars)==1) {
168               
169                // Length of list should be 2 for I(q,phi)
170            npars = PyList_GET_SIZE(pars); 
171            if(npars!=2) {
172                PyErr_SetString(CDiamCylFuncError, 
173                        "CDiamCylFunc.run expects a double or a list of dimension 2.");
174                return NULL;
175            }
176            // We have a vector q, get the q and phi values at which
177            // to evaluate I(q,phi)
178            q_value = CDiamCylFunc_readDouble(PyList_GET_ITEM(pars,0));
179            phi_value = CDiamCylFunc_readDouble(PyList_GET_ITEM(pars,1));
180            // Skip zero
181            if (q_value==0) {
182                return Py_BuildValue("d",0.0);
183            }
184                return Py_BuildValue("d",(*(self->model)).evaluate_rphi(q_value,phi_value));
185
186        } else {
187
188                // We have a scalar q, we will evaluate I(q)
189                q_value = CDiamCylFunc_readDouble(pars);               
190               
191                return Py_BuildValue("d",(*(self->model))(q_value));
192        }       
193}
194
195/**
196 * Function to call to evaluate model in cartesian coordinates
197 * @param args: input q or [qx, qy]]
198 * @return: function value
199 */
200static PyObject * runXY(CDiamCylFunc *self, PyObject *args) {
201        double qx_value, qy_value;
202        PyObject* pars;
203        int npars;
204       
205        // Get parameters
206       
207            // Reader parameter dictionary
208    self->model->length = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "length") );
209    self->model->radius = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "radius") );
210    // Read in dispersion parameters
211    PyObject* disp_dict;
212    DispersionVisitor* visitor = new DispersionVisitor();
213    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "radius");
214    self->model->radius.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->radius.dispersion, disp_dict);
215    disp_dict = PyDict_GetItemString(self->dispersion, "length");
216    self->model->length.dispersion->accept_as_destination(visitor, self->model->length.dispersion, disp_dict);
217
218       
219        // Get input and determine whether we have to supply a 1D or 2D return value.
220        if ( !PyArg_ParseTuple(args,"O",&pars) ) {
221            PyErr_SetString(CDiamCylFuncError, 
222                "CDiamCylFunc.run expects a q value.");
223                return NULL;
224        }
225         
226        // Check params
227        if( PyList_Check(pars)==1) {
228               
229                // Length of list should be 2 for I(qx, qy))
230            npars = PyList_GET_SIZE(pars); 
231            if(npars!=2) {
232                PyErr_SetString(CDiamCylFuncError, 
233                        "CDiamCylFunc.run expects a double or a list of dimension 2.");
234                return NULL;
235            }
236            // We have a vector q, get the qx and qy values at which
237            // to evaluate I(qx,qy)
238            qx_value = CDiamCylFunc_readDouble(PyList_GET_ITEM(pars,0));
239            qy_value = CDiamCylFunc_readDouble(PyList_GET_ITEM(pars,1));
240            return Py_BuildValue("d",(*(self->model))(qx_value,qy_value));
241
242        } else {
243
244                // We have a scalar q, we will evaluate I(q)
245                qx_value = CDiamCylFunc_readDouble(pars);               
246               
247                return Py_BuildValue("d",(*(self->model))(qx_value));
248        }       
249}
250
251static PyObject * reset(CDiamCylFunc *self, PyObject *args) {
252   
253
254    return Py_BuildValue("d",0.0);
255}
256
257static PyObject * set_dispersion(CDiamCylFunc *self, PyObject *args) {
258        PyObject * disp;
259        const char * par_name;
260
261        if ( !PyArg_ParseTuple(args,"sO", &par_name, &disp) ) {
262            PyErr_SetString(CDiamCylFuncError,
263                "CDiamCylFunc.set_dispersion expects a DispersionModel object.");
264                return NULL;
265        }
266        void *temp = PyCObject_AsVoidPtr(disp);
267        DispersionModel * dispersion = static_cast<DispersionModel *>(temp);
268
269
270        // Ugliness necessary to go from python to C
271            // TODO: refactor this
272    if (!strcmp(par_name, "radius")) {
273        self->model->radius.dispersion = dispersion;
274    } else    if (!strcmp(par_name, "length")) {
275        self->model->length.dispersion = dispersion;
276    } else {
277            PyErr_SetString(CDiamCylFuncError,
278                "CDiamCylFunc.set_dispersion expects a valid parameter name.");
279                return NULL;
280        }
281
282        DispersionVisitor* visitor = new DispersionVisitor();
283        PyObject * disp_dict = PyDict_New();
284        dispersion->accept_as_source(visitor, dispersion, disp_dict);
285        PyDict_SetItemString(self->dispersion, par_name, disp_dict);
286    return Py_BuildValue("i",1);
287}
288
289
290static PyMethodDef CDiamCylFunc_methods[] = {
291    {"run",      (PyCFunction)run     , METH_VARARGS,
292      "Evaluate the model at a given Q or Q, phi"},
293    {"runXY",      (PyCFunction)runXY     , METH_VARARGS,
294      "Evaluate the model at a given Q or Qx, Qy"},
295    {"reset",    (PyCFunction)reset   , METH_VARARGS,
296      "Reset pair correlation"},
297    {"set_dispersion",      (PyCFunction)set_dispersion     , METH_VARARGS,
298      "Set the dispersion model for a given parameter"},
299   {NULL}
300};
301
302static PyTypeObject CDiamCylFuncType = {
303    PyObject_HEAD_INIT(NULL)
304    0,                         /*ob_size*/
305    "CDiamCylFunc",             /*tp_name*/
306    sizeof(CDiamCylFunc),             /*tp_basicsize*/
307    0,                         /*tp_itemsize*/
308    (destructor)CDiamCylFunc_dealloc, /*tp_dealloc*/
309    0,                         /*tp_print*/
310    0,                         /*tp_getattr*/
311    0,                         /*tp_setattr*/
312    0,                         /*tp_compare*/
313    0,                         /*tp_repr*/
314    0,                         /*tp_as_number*/
315    0,                         /*tp_as_sequence*/
316    0,                         /*tp_as_mapping*/
317    0,                         /*tp_hash */
318    0,                         /*tp_call*/
319    0,                         /*tp_str*/
320    0,                         /*tp_getattro*/
321    0,                         /*tp_setattro*/
322    0,                         /*tp_as_buffer*/
323    Py_TPFLAGS_DEFAULT | Py_TPFLAGS_BASETYPE, /*tp_flags*/
324    "CDiamCylFunc objects",           /* tp_doc */
325    0,                         /* tp_traverse */
326    0,                         /* tp_clear */
327    0,                         /* tp_richcompare */
328    0,                         /* tp_weaklistoffset */
329    0,                         /* tp_iter */
330    0,                         /* tp_iternext */
331    CDiamCylFunc_methods,             /* tp_methods */
332    CDiamCylFunc_members,             /* tp_members */
333    0,                         /* tp_getset */
334    0,                         /* tp_base */
335    0,                         /* tp_dict */
336    0,                         /* tp_descr_get */
337    0,                         /* tp_descr_set */
338    0,                         /* tp_dictoffset */
339    (initproc)CDiamCylFunc_init,      /* tp_init */
340    0,                         /* tp_alloc */
341    CDiamCylFunc_new,                 /* tp_new */
342};
343
344
345static PyMethodDef module_methods[] = {
346    {NULL} 
347};
348
349/**
350 * Function used to add the model class to a module
351 * @param module: module to add the class to
352 */ 
353void addCDiamCylFunc(PyObject *module) {
354        PyObject *d;
355       
356    if (PyType_Ready(&CDiamCylFuncType) < 0)
357        return;
358
359    Py_INCREF(&CDiamCylFuncType);
360    PyModule_AddObject(module, "CDiamCylFunc", (PyObject *)&CDiamCylFuncType);
361   
362    d = PyModule_GetDict(module);
363    CDiamCylFuncError = PyErr_NewException("CDiamCylFunc.error", NULL, NULL);
364    PyDict_SetItemString(d, "CDiamCylFuncError", CDiamCylFuncError);
365}
366
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.