1 | #if !defined(o_h) |
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2 | #define onion_h |
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3 | |
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4 | /** |
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5 | * Structure definition for sphere parameters |
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6 | */ |
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7 | //[PYTHONCLASS] = OnionModel |
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8 | //[DISP_PARAMS] = rad_core0, thick_shell1,thick_shell2,thick_shell3,thick_shell4, thick_shell5,thick_shell6,thick_shell7,thick_shell8,thick_shell9,thick_shell10 |
---|
9 | //[DESCRIPTION] =<text>Form factor of mutishells normalized by the volume. Here each shell is described |
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10 | // by an exponential function; |
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11 | // I) |
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12 | // For A_shell != 0, |
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13 | // f(r) = B*exp(A_shell*(r-r_in)/thick_shell)+C |
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14 | // where |
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15 | // B=(sld_out-sld_in)/(exp(A_shell)-1) |
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16 | // C=sld_in-B. |
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17 | // Note that in the above case, |
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18 | // the function becomes a linear function |
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19 | // as A_shell --> 0+ or 0-. |
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20 | // II) |
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21 | // For the exact point of A_shell == 0, |
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22 | // f(r) = sld_in ,i.e., it crosses over flat function |
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23 | // Note that the 'sld_out' becaomes NULL in this case. |
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24 | // |
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25 | // background:background, |
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26 | // rad_core0: radius of sphere(core) |
---|
27 | // thick_shell#:the thickness of the shell# |
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28 | // sld_core0: the SLD of the sphere |
---|
29 | // sld_solv: the SLD of the solvent |
---|
30 | // sld_shell: the SLD of the shell# |
---|
31 | // A_shell#: the coefficient in the exponential function |
---|
32 | // </text> |
---|
33 | //[FIXED]= <text>rad_core0.width;thick_shell1.width;thick_shell2.width;thick_shell3.width;thick_shell4.width;thick_shell5.width;thick_shell6.width;thick_shell7.width;thick_shell8.width;thick_shell9.width;thick_shell10.width</text> |
---|
34 | //[ORIENTATION_PARAMS]= <text> </text> |
---|
35 | |
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36 | typedef struct { |
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37 | /// number of shells |
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38 | // [DEFAULT]=n_shells=1 |
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39 | int n_shells; |
---|
40 | /// Scale factor |
---|
41 | // [DEFAULT]=scale= 1.0 |
---|
42 | double scale; |
---|
43 | /// Radius of sphere [A] |
---|
44 | // [DEFAULT]=rad_core0=200.0 [A] |
---|
45 | double rad_core0; |
---|
46 | /// sld_core [1/A^(2)] |
---|
47 | // [DEFAULT]=sld_core0= 1.0e-6 [1/A^(2)] |
---|
48 | double sld_core0; |
---|
49 | /// sld_solv [1/A^(2)] |
---|
50 | // [DEFAULT]=sld_solv= 6.4e-6 [1/A^(2)] |
---|
51 | double sld_solv; |
---|
52 | /// Incoherent Background [1/cm] |
---|
53 | // [DEFAULT]=background=0 [1/cm] |
---|
54 | double background; |
---|
55 | |
---|
56 | // [DEFAULT]=sld_out_shell1=2.0e-06 [1/A^(2)] |
---|
57 | double sld_out_shell1; |
---|
58 | // [DEFAULT]=sld_out_shell2=2.5e-06 [1/A^(2)] |
---|
59 | double sld_out_shell2; |
---|
60 | // [DEFAULT]=sld_out_shell3=3.0e-06 [1/A^(2)] |
---|
61 | double sld_out_shell3; |
---|
62 | // [DEFAULT]=sld_out_shell4=3.5e-06 [1/A^(2)] |
---|
63 | double sld_out_shell4; |
---|
64 | // [DEFAULT]=sld_out_shell5=4.0e-06 [1/A^(2)] |
---|
65 | double sld_out_shell5; |
---|
66 | // [DEFAULT]=sld_out_shell6=4.5e-06 [1/A^(2)] |
---|
67 | double sld_out_shell6; |
---|
68 | // [DEFAULT]=sld_out_shell7=5.0e-06 [1/A^(2)] |
---|
69 | double sld_out_shell7; |
---|
70 | // [DEFAULT]=sld_out_shell8=5.5e-06 [1/A^(2)] |
---|
71 | double sld_out_shell8; |
---|
72 | // [DEFAULT]=sld_out_shell9=6.0e-06 [1/A^(2)] |
---|
73 | double sld_out_shell9; |
---|
74 | // [DEFAULT]=sld_out_shell10=6.2e-06 [1/A^(2)] |
---|
75 | double sld_out_shell10; |
---|
76 | |
---|
77 | // [DEFAULT]=sld_in_shell1=1.7e-06 [1/A^(2)] |
---|
78 | double sld_in_shell1; |
---|
79 | // [DEFAULT]=sld_in_shell2=2.2e-06 [1/A^(2)] |
---|
80 | double sld_in_shell2; |
---|
81 | // [DEFAULT]=sld_in_shell3=2.7e-06 [1/A^(2)] |
---|
82 | double sld_in_shell3; |
---|
83 | // [DEFAULT]=sld_in_shell4=3.2e-06 [1/A^(2)] |
---|
84 | double sld_in_shell4; |
---|
85 | // [DEFAULT]=sld_in_shell5=3.7e-06 [1/A^(2)] |
---|
86 | double sld_in_shell5; |
---|
87 | // [DEFAULT]=sld_in_shell6=4.2e-06 [1/A^(2)] |
---|
88 | double sld_in_shell6; |
---|
89 | // [DEFAULT]=sld_in_shell7=4.7e-06 [1/A^(2)] |
---|
90 | double sld_in_shell7; |
---|
91 | // [DEFAULT]=sld_in_shell8=5.2e-06 [1/A^(2)] |
---|
92 | double sld_in_shell8; |
---|
93 | // [DEFAULT]=sld_in_shell9=5.7e-06 [1/A^(2)] |
---|
94 | double sld_in_shell9; |
---|
95 | // [DEFAULT]=sld_in_shell10=6.0e-06 [1/A^(2)] |
---|
96 | double sld_in_shell10; |
---|
97 | |
---|
98 | // [DEFAULT]=A_shell1=1.0 |
---|
99 | double A_shell1; |
---|
100 | // [DEFAULT]=A_shell2=1.0 |
---|
101 | double A_shell2; |
---|
102 | // [DEFAULT]=A_shell3=1.0 |
---|
103 | double A_shell3; |
---|
104 | // [DEFAULT]=A_shell4=1.0 |
---|
105 | double A_shell4; |
---|
106 | // [DEFAULT]=A_shell5=1.0 |
---|
107 | double A_shell5; |
---|
108 | // [DEFAULT]=A_shell6=1.0 |
---|
109 | double A_shell6; |
---|
110 | // [DEFAULT]=A_shell7=1.0 |
---|
111 | double A_shell7; |
---|
112 | // [DEFAULT]=A_shell8=1.0 |
---|
113 | double A_shell8; |
---|
114 | // [DEFAULT]=A_shell9=1.0 |
---|
115 | double A_shell9; |
---|
116 | // [DEFAULT]=A_shell10=1.0 |
---|
117 | double A_shell10; |
---|
118 | |
---|
119 | // [DEFAULT]=thick_shell1=50.0 [A] |
---|
120 | double thick_shell1; |
---|
121 | // [DEFAULT]=thick_shell2=50.0 [A] |
---|
122 | double thick_shell2; |
---|
123 | // [DEFAULT]=thick_shell3=50.0 [A] |
---|
124 | double thick_shell3; |
---|
125 | // [DEFAULT]=thick_shell4=50.0 [A] |
---|
126 | double thick_shell4; |
---|
127 | // [DEFAULT]=thick_shell5=50.0 [A] |
---|
128 | double thick_shell5; |
---|
129 | // [DEFAULT]=thick_shell6=50.0 [A] |
---|
130 | double thick_shell6; |
---|
131 | // [DEFAULT]=thick_shell7=50.0 [A] |
---|
132 | double thick_shell7; |
---|
133 | // [DEFAULT]=thick_shell8=50.0 [A] |
---|
134 | double thick_shell8; |
---|
135 | // [DEFAULT]=thick_shell9=50.0 [A] |
---|
136 | double thick_shell9; |
---|
137 | // [DEFAULT]=thick_shell10=50.0 [A] |
---|
138 | double thick_shell10; |
---|
139 | |
---|
140 | // [DEFAULT]=func_shell1=2 |
---|
141 | int func_shell1; |
---|
142 | // [DEFAULT]=func_shell2=2 |
---|
143 | int func_shell2; |
---|
144 | // [DEFAULT]=func_shell3=2 |
---|
145 | int func_shell3; |
---|
146 | // [DEFAULT]=func_shell4=2 |
---|
147 | int func_shell4; |
---|
148 | // [DEFAULT]=func_shell5=2 |
---|
149 | int func_shell5; |
---|
150 | // [DEFAULT]=func_shell6=2 |
---|
151 | int func_shell6; |
---|
152 | // [DEFAULT]=func_shell7=2 |
---|
153 | int func_shell7; |
---|
154 | // [DEFAULT]=func_shell8=2 |
---|
155 | int func_shell8; |
---|
156 | // [DEFAULT]=func_shell9=2 |
---|
157 | int func_shell9; |
---|
158 | // [DEFAULT]=func_shell10=2 |
---|
159 | int func_shell10; |
---|
160 | } OnionParameters; |
---|
161 | |
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162 | double so_kernel(double dq[], double q); |
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163 | |
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164 | /// 1D scattering function |
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165 | double onion_analytical_1D(OnionParameters *pars, double q); |
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166 | |
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167 | /// 2D scattering function |
---|
168 | double onion_analytical_2D(OnionParameters *pars, double q, double phi); |
---|
169 | double onion_analytical_2DXY(OnionParameters *pars, double qx, double qy); |
---|
170 | |
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171 | #endif |
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