source: sasview/sansmodels/src/sans/models/c_extensions/CStackedDisksModel.c @ 1aaa579

ESS_GUIESS_GUI_DocsESS_GUI_batch_fittingESS_GUI_bumps_abstractionESS_GUI_iss1116ESS_GUI_iss879ESS_GUI_iss959ESS_GUI_openclESS_GUI_orderingESS_GUI_sync_sascalccostrafo411magnetic_scattrelease-4.1.1release-4.1.2release-4.2.2release_4.0.1ticket-1009ticket-1094-headlessticket-1242-2d-resolutionticket-1243ticket-1249ticket885unittest-saveload
Last change on this file since 1aaa579 was e0a8a3c, checked in by Gervaise Alina <gervyh@…>, 15 years ago

change the orientation of models
  • Property mode set to 100644
File size: 11.6 KB
RevLine 
[e0a8a3c]1/** CStackedDisksModel
2 *
3 * C extension
4 *
5 * WARNING: THIS FILE WAS GENERATED BY WRAPPERGENERATOR.PY
6 *          DO NOT MODIFY THIS FILE, MODIFY stacked_disks.h
7 *          AND RE-RUN THE GENERATOR SCRIPT
8 *
9 * @author   M.Doucet / UTK
10 */
11 
12#include <Python.h>
13#include "structmember.h"
14#include <stdio.h>
15#include <stdlib.h>
16#include <math.h>
17#include <time.h>
18
19#include "stacked_disks.h"
20
21/// Error object for raised exceptions
22static PyObject * CStackedDisksModelError = NULL;
23
24
25// Class definition
26typedef struct {
27    PyObject_HEAD
28    /// Parameters
29    PyObject * params;
30    /// Log for unit testing
31    PyObject * log;
32    /// Model parameters
33        StackedDisksParameters model_pars;
34} CStackedDisksModel;
35
36
37static void
38CStackedDisksModel_dealloc(CStackedDisksModel* self)
39{
40    self->ob_type->tp_free((PyObject*)self);
41   
42
43}
44
45static PyObject *
46CStackedDisksModel_new(PyTypeObject *type, PyObject *args, PyObject *kwds)
47{
48    CStackedDisksModel *self;
49   
50    self = (CStackedDisksModel *)type->tp_alloc(type, 0);
51   
52    return (PyObject *)self;
53}
54
55static int
56CStackedDisksModel_init(CStackedDisksModel *self, PyObject *args, PyObject *kwds)
57{
58    if (self != NULL) {
59       
60        // Create parameters
61        self->params = PyDict_New();
62       
63        // Initialize parameter dictionary
64        PyDict_SetItemString(self->params,"core_sld",Py_BuildValue("d",0.000004));
65        PyDict_SetItemString(self->params,"core_thick",Py_BuildValue("d",10.000000));
66        PyDict_SetItemString(self->params,"layer_thick",Py_BuildValue("d",15.000000));
67        PyDict_SetItemString(self->params,"axis_theta",Py_BuildValue("d",0.000000));
68        PyDict_SetItemString(self->params,"layer_sld",Py_BuildValue("d",-0.000000));
69        PyDict_SetItemString(self->params,"axis_phi",Py_BuildValue("d",0.000000));
70        PyDict_SetItemString(self->params,"solvent_sld",Py_BuildValue("d",0.000005));
71        PyDict_SetItemString(self->params,"scale",Py_BuildValue("d",0.010000));
72        PyDict_SetItemString(self->params,"radius",Py_BuildValue("d",3000.000000));
73        PyDict_SetItemString(self->params,"background",Py_BuildValue("d",0.001000));
74        PyDict_SetItemString(self->params,"sigma_d",Py_BuildValue("d",0.000000));
75        PyDict_SetItemString(self->params,"n_stacking",Py_BuildValue("d",1.000000));
76
77         
78        // Create empty log
79        self->log = PyDict_New();
80       
81       
82
83    }
84    return 0;
85}
86
87static PyMemberDef CStackedDisksModel_members[] = {
88    {"params", T_OBJECT, offsetof(CStackedDisksModel, params), 0,
89     "Parameters"},
90    {"log", T_OBJECT, offsetof(CStackedDisksModel, log), 0,
91     "Log"},
92    {NULL}  /* Sentinel */
93};
94
95/** Read double from PyObject
96    @param p PyObject
97    @return double
98*/
99double CStackedDisksModel_readDouble(PyObject *p) {
100    if (PyFloat_Check(p)==1) {
101        return (double)(((PyFloatObject *)(p))->ob_fval);
102    } else if (PyInt_Check(p)==1) {
103        return (double)(((PyIntObject *)(p))->ob_ival);
104    } else if (PyLong_Check(p)==1) {
105        return (double)PyLong_AsLong(p);
106    } else {
107        return 0.0;
108    }
109}
110
111
112/**
113 * Function to call to evaluate model
114 * @param args: input q or [q,phi]
115 * @return: function value
116 */
117static PyObject * run(CStackedDisksModel *self, PyObject *args) {
118        double q_value, phi_value;
119        PyObject* pars;
120        int npars;
121       
122        // Get parameters
123       
124        // Reader parameter dictionary
125    self->model_pars.core_sld = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "core_sld") );
126    self->model_pars.core_thick = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "core_thick") );
127    self->model_pars.layer_thick = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "layer_thick") );
128    self->model_pars.axis_theta = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "axis_theta") );
129    self->model_pars.layer_sld = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "layer_sld") );
130    self->model_pars.axis_phi = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "axis_phi") );
131    self->model_pars.solvent_sld = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "solvent_sld") );
132    self->model_pars.scale = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "scale") );
133    self->model_pars.radius = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "radius") );
134    self->model_pars.background = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "background") );
135    self->model_pars.sigma_d = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "sigma_d") );
136    self->model_pars.n_stacking = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "n_stacking") );
137
138       
139        // Get input and determine whether we have to supply a 1D or 2D return value.
140        if ( !PyArg_ParseTuple(args,"O",&pars) ) {
141            PyErr_SetString(CStackedDisksModelError, 
142                "CStackedDisksModel.run expects a q value.");
143                return NULL;
144        }
145         
146        // Check params
147        if( PyList_Check(pars)==1) {
148               
149                // Length of list should be 2 for I(q,phi)
150            npars = PyList_GET_SIZE(pars); 
151            if(npars!=2) {
152                PyErr_SetString(CStackedDisksModelError, 
153                        "CStackedDisksModel.run expects a double or a list of dimension 2.");
154                return NULL;
155            }
156            // We have a vector q, get the q and phi values at which
157            // to evaluate I(q,phi)
158            q_value = CStackedDisksModel_readDouble(PyList_GET_ITEM(pars,0));
159            phi_value = CStackedDisksModel_readDouble(PyList_GET_ITEM(pars,1));
160            // Skip zero
161            if (q_value==0) {
162                return Py_BuildValue("d",0.0);
163            }
164                return Py_BuildValue("d",stacked_disks_analytical_2D(&(self->model_pars),q_value,phi_value));
165
166        } else {
167
168                // We have a scalar q, we will evaluate I(q)
169                q_value = CStackedDisksModel_readDouble(pars);         
170               
171                return Py_BuildValue("d",stacked_disks_analytical_1D(&(self->model_pars),q_value));
172        }       
173}
174
175/**
176 * Function to call to evaluate model in cartesian coordinates
177 * @param args: input q or [qx, qy]]
178 * @return: function value
179 */
180static PyObject * runXY(CStackedDisksModel *self, PyObject *args) {
181        double qx_value, qy_value;
182        PyObject* pars;
183        int npars;
184       
185        // Get parameters
186       
187        // Reader parameter dictionary
188    self->model_pars.core_sld = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "core_sld") );
189    self->model_pars.core_thick = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "core_thick") );
190    self->model_pars.layer_thick = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "layer_thick") );
191    self->model_pars.axis_theta = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "axis_theta") );
192    self->model_pars.layer_sld = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "layer_sld") );
193    self->model_pars.axis_phi = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "axis_phi") );
194    self->model_pars.solvent_sld = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "solvent_sld") );
195    self->model_pars.scale = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "scale") );
196    self->model_pars.radius = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "radius") );
197    self->model_pars.background = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "background") );
198    self->model_pars.sigma_d = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "sigma_d") );
199    self->model_pars.n_stacking = PyFloat_AsDouble( PyDict_GetItemString(self->params, "n_stacking") );
200
201       
202        // Get input and determine whether we have to supply a 1D or 2D return value.
203        if ( !PyArg_ParseTuple(args,"O",&pars) ) {
204            PyErr_SetString(CStackedDisksModelError, 
205                "CStackedDisksModel.run expects a q value.");
206                return NULL;
207        }
208         
209        // Check params
210        if( PyList_Check(pars)==1) {
211               
212                // Length of list should be 2 for I(qx, qy))
213            npars = PyList_GET_SIZE(pars); 
214            if(npars!=2) {
215                PyErr_SetString(CStackedDisksModelError, 
216                        "CStackedDisksModel.run expects a double or a list of dimension 2.");
217                return NULL;
218            }
219            // We have a vector q, get the qx and qy values at which
220            // to evaluate I(qx,qy)
221            qx_value = CStackedDisksModel_readDouble(PyList_GET_ITEM(pars,0));
222            qy_value = CStackedDisksModel_readDouble(PyList_GET_ITEM(pars,1));
223                return Py_BuildValue("d",stacked_disks_analytical_2DXY(&(self->model_pars),qx_value,qy_value));
224
225        } else {
226
227                // We have a scalar q, we will evaluate I(q)
228                qx_value = CStackedDisksModel_readDouble(pars);         
229               
230                return Py_BuildValue("d",stacked_disks_analytical_1D(&(self->model_pars),qx_value));
231        }       
232}
233
234static PyObject * reset(CStackedDisksModel *self, PyObject *args) {
235   
236
237    return Py_BuildValue("d",0.0);
238}
239
240
241static PyMethodDef CStackedDisksModel_methods[] = {
242    {"run",      (PyCFunction)run     , METH_VARARGS,
243      "Evaluate the model at a given Q or Q, phi"},
244    {"runXY",      (PyCFunction)runXY     , METH_VARARGS,
245      "Evaluate the model at a given Q or Qx, Qy"},
246    {"reset",    (PyCFunction)reset   , METH_VARARGS,
247      "Reset pair correlation"},
248    //{"numerical_1D",      (PyCFunction)numerical_1D     , METH_VARARGS,
249    //  "Evaluate the 1D model at a given Q"},
250   {NULL}
251};
252
253static PyTypeObject CStackedDisksModelType = {
254    PyObject_HEAD_INIT(NULL)
255    0,                         /*ob_size*/
256    "CStackedDisksModel",             /*tp_name*/
257    sizeof(CStackedDisksModel),             /*tp_basicsize*/
258    0,                         /*tp_itemsize*/
259    (destructor)CStackedDisksModel_dealloc, /*tp_dealloc*/
260    0,                         /*tp_print*/
261    0,                         /*tp_getattr*/
262    0,                         /*tp_setattr*/
263    0,                         /*tp_compare*/
264    0,                         /*tp_repr*/
265    0,                         /*tp_as_number*/
266    0,                         /*tp_as_sequence*/
267    0,                         /*tp_as_mapping*/
268    0,                         /*tp_hash */
269    0,                         /*tp_call*/
270    0,                         /*tp_str*/
271    0,                         /*tp_getattro*/
272    0,                         /*tp_setattro*/
273    0,                         /*tp_as_buffer*/
274    Py_TPFLAGS_DEFAULT | Py_TPFLAGS_BASETYPE, /*tp_flags*/
275    "CStackedDisksModel objects",           /* tp_doc */
276    0,                         /* tp_traverse */
277    0,                         /* tp_clear */
278    0,                         /* tp_richcompare */
279    0,                         /* tp_weaklistoffset */
280    0,                         /* tp_iter */
281    0,                         /* tp_iternext */
282    CStackedDisksModel_methods,             /* tp_methods */
283    CStackedDisksModel_members,             /* tp_members */
284    0,                         /* tp_getset */
285    0,                         /* tp_base */
286    0,                         /* tp_dict */
287    0,                         /* tp_descr_get */
288    0,                         /* tp_descr_set */
289    0,                         /* tp_dictoffset */
290    (initproc)CStackedDisksModel_init,      /* tp_init */
291    0,                         /* tp_alloc */
292    CStackedDisksModel_new,                 /* tp_new */
293};
294
295
296static PyMethodDef module_methods[] = {
297    {NULL} 
298};
299
300/**
301 * Function used to add the model class to a module
302 * @param module: module to add the class to
303 */ 
304void addCStackedDisksModel(PyObject *module) {
305        PyObject *d;
306       
307    if (PyType_Ready(&CStackedDisksModelType) < 0)
308        return;
309
310    Py_INCREF(&CStackedDisksModelType);
311    PyModule_AddObject(module, "CStackedDisksModel", (PyObject *)&CStackedDisksModelType);
312   
313    d = PyModule_GetDict(module);
314    CStackedDisksModelError = PyErr_NewException("CStackedDisksModel.error", NULL, NULL);
315    PyDict_SetItemString(d, "CStackedDisksModelError", CStackedDisksModelError);
316}
317
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.